全血基因组DNA的提取

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经各种抗凝剂处理过的全血
新鲜全血的收集
(EDTA、柠檬酸或肝素)
全血DNA的提取
按试剂盒说明书操作。见后
提取DNA质量的初鉴
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ1、琼脂糖凝胶电泳初步鉴定; 2、测定DNA浓度及纯度;
A260/A280比值
全血DNA的提取
(1)
振荡混匀数秒
(2)
GenTLE Solution I 500ul 100ul混匀的全血
(三)常用提取方法: 有机溶剂抽提法(氯仿-异戊醇法) 盐析法(经典Miller盐析法) NaI法 ……
NaI法提取外周血白细胞DNA,提取的DNA可直接用于酶 切、PCR扩增、银染序列。通过本实验学习和掌握NaI法 提取DNA。
二、实验原理
从全血制备白细胞DNA,可用双蒸水溶胀红细胞及 白细胞膜,释放出血红蛋白及细胞核,使核酸处于 易提取状态,加NaI破核膜并使DNA从核蛋白中解 离,用氯仿/异戊醇抽提使蛋白质沉淀完全,DNA 存在于上层水相中,以异丙醇沉淀DNA,离心弃去 异丙醇,70%酒精干燥,即可获得白细胞DNA。
勿起泡。胶凝固后垂直取出梳子,
将制好的胶板置入电泳槽内,并加入
3.加样、电泳
电泳缓冲液。
凝胶电泳操作注意事项
1.缓冲系统:注意缓冲液的使用是否正确。 2.凝胶的制备:凝胶中所加缓冲液应与电泳槽中的相一
致,溶解的凝胶应及时倒入板中,避免倒入前凝固结块。
倒入板中的凝胶应避免出现气泡,影响电泳结果。 3.样品加入量:加样量的多少依据加样孔的大小及DNA 中片段的数量和大小而定,过多的量会造成加样孔超载, 从而导致拖尾和弥散,对于较大的DNA此现象更明显。
(7) 加入500ul GenTLE Solution Ⅲ 轻微振荡10s充分混合。
此时沉淀看不清。
室温12,000rpm离心5min
将上清转移至另一个新的离心管中
加入等体积(500ul)异丙醇,轻柔颠倒混匀。 4℃12,000rpm离心5min,小心去除上清,加入1ml的70%乙醇清洗沉淀, 再次4℃12,000rpm离心5min,小心去除上清并干燥沉淀。
最后得到纯化的核酸。
一、实验目的与意义
(一)目的:掌握全血DNA提取基本技能。
(二)意义:基因组DNA含有细胞中全部的遗传信息,
从全血中提取DNA是遗传性疾病、胎儿产前无创
伤诊断、肿瘤和传染性疾病等的早期确诊的重要 手段和技术,DNA提取的质量和产量直接影响PCR 扩增、分子克隆、限制性内切酶的酶切反应等试验 的成败。
提高分辨率。
五、实验结果
在凝胶成像系统中紫外灯观察拍照(戴手套操 作)。DNA存在处显出桔红色荧光条带(EB染 料呈现桔红色)。
Molecular Biology
谢谢!
分子生物学检验技术的应用
本学期实验内容
1
2
3
理论考试占70%,实验成绩占30%
实验一 全血基因组DNA的提取
基因组(Genome):细胞中一套完整单 倍体的遗传物质的总和。
原核生物基因组
病毒基因组
真核生物基因组
真核基因组DNA的分离纯化 (1)核酸包括DNA、RNA两种分子,在细胞中都 以与蛋白质结合的状态存在。
5. 电泳系统的变化会影响DNA的迁移,加入DNA标准参照 物进行判定是必要的。 6. DNA样品中盐浓度会影响DNA的迁移率,平行对照样品
应使用同样的缓冲条件以消除这种影响。
7. DNA迁移率取决于琼脂糖凝胶的浓度,迁移分子的形状 及大小。采用不同浓度的凝胶有可能分辨范围广泛的DNA 分子,制备琼脂糖凝胶可根据DNA分子的范围来决定凝胶 的浓度。小片段的DNA电泳应采用聚丙烯酰胺凝胶电泳以
破坏血细胞同时,与核酸形成电中性的复合体。
GenTLE solution Ⅱ: 复合体离心收集后清洗,洗涤作用。 GenTLE solution Ⅲ: 将DNA从核蛋白中解离出来。 异丙醇:将DNA沉淀回收。 70%酒精:利用DNA不溶于酒精的特性,去除DNA沉淀中 残留的盐类分子。
四、实验流程与要求
三、实验材料
1、高速离心机。 2、全血DNA提取试剂盒(TaKaRa宝生物工程公司) 试剂盒组成: GenTLE solution Ⅰ GenTLE solution Ⅱ GenTLE solution Ⅲ 3、异丙醇、70%乙醇。 1瓶 2瓶 1瓶
各试剂成分作用:
GenTLE solution Ⅰ:
Molecular Biology
分子生物学检验技术
研究对象
分子生物学
其表达产物蛋白质
DNA及RNA
分子水平
功能 探讨生命现象 遗传 关系、作用
以超乎想象的速度飞速发展,渗透到医学每一个领域。
与临床检验诊断学关系
使疾病诊断深入到基因水平
基因诊断
可以毫不夸张的说,如果没有分子生物学的应用,
人类探索生命活动的行为将会寸步难行。
(2)真核生物的染色体DNA为双链线性分子;
分离核酸注意事项:
(1)减少化学因素对核酸的降解。 (2)减少物理因素对核酸的降解。 (3)防止核酸的生物降解:
策略:新鲜生物组织或细胞样品。
核酸提取的主要步骤:
一般为破碎细胞,去除与核酸结合的蛋白质以及 多糖、脂类等生物大分子,去除其他不需要的核
酸分子,沉淀核酸以去除盐、有机溶剂等杂质,
(3)
室温放置10min以上
12,000rpm离心5min(20℃以上离心) (4) (6) 加入1ml GenTLE Solution Ⅱ 沿管内侧内壁加入到离心管中 轻柔颠倒离心管2-3次,室温
12,000rpm离心2min,去除上清。
(5)
小心去除管中液,枪头不 要碰到离心管内壁(防止 吸走沉淀物)
沉淀的溶解:加入30ul DH2O(或TE缓冲液)。
提取DNA质量的初鉴
琼脂糖凝胶电泳
0.3g琼脂糖+30ml 0.5×TBE缓冲液, 加热至完全溶化且摇匀,温度适宜时 加入荧光染料。 将样品梳插于内槽,并将制胶槽平放
1.制备琼脂糖凝胶
2.胶板的制备
在桌上,将冷却至60度的琼脂糖凝胶 缓缓倒入槽内,使其形成均一胶面,
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