主流数据库进行检索
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肿瘤的发生与RAS 基因关系
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一.根据本课题要求,检索胃肿瘤的发病率与RAS基因表达缺失关系的文献。
胃肿瘤发病的原因有很多,如环境因素,遗传因素,幽门螺杆菌等都能导致胃肿瘤的发生。研究表明,RAS家族基因在胃癌组织中存在较高的表达缺失,其中抑癌基因RASSF1A 在正常组织中广泛表达, 但在人类肿瘤发生时RASSF1A 基因经常失活,在胃癌高危人群及可疑胃癌患者胃黏膜活检标本中存在表达缺失,因此有望作为胃癌早期检测的标志物。ras基因首先在Harvery鼠肉瘤病毒(Ha2MSV)和Kirsten鼠肉瘤病毒(Ki2MSV)的子代基因中被发现,在这种子代病毒中发现含有来源于宿主细胞的基因组的新基因序列,此后人们将这种宿主细胞基因称为ras 基因.1982年Weinberg和Barbacid首先从人膀胱癌细胞系中分离出一种转化基因,可使NIH3T3细胞发生恶性转化,而从正常人组织中提取的DNA则无此种作用.随后,Santos与Parada发现上述转化基因并非新型基因,而是Harvery鼠肉瘤病毒ras基因的人类同源基因,命名为H2ras.同年,Krontiris在人肺癌细胞中发现Kirsten鼠肉瘤病毒基因的同系物,称为K2ras.另一种相似的基因是在人神经母细胞瘤DNA感染NIH3T3细胞时发现的与ras类似的基因,称为N2ras,此种基因和病毒无关. ras基因激活构成癌基因,其表达产物Ras蛋白发生构型改变,功能也随之改变,与GDP的结合能力减弱,和GTP结合后不需外界生长信号的刺激便自身活化.此时Ras蛋白内在的GTP酶活性降低,或影响了GAP的活性,使Ras蛋白和GTP解离减少,失去了GTP与GDP的有节制的调节,活化状态的Ras蛋白持续地激活PLC产生第二信使,造成细胞不可控制地增殖,恶变.同时细胞凋亡减少,细胞间接触抑制增强也加速了这一过程.
研究人员Cong 对160 例患有萎缩性胃炎的患者进行随访,发现14.4% (23/160)的病人有K-ms 的突变,其中萎缩性胃炎不伴有肠化生的病人其突变率为19.4% (6/25),提示K- ras 基因的突变可能是胃癌发生的早期事件。经 3 年的随访发现,最初无K - ras 突变的患者只有14. 6%发展为肠化生或由伴有的小肠型肠化生发展为结肠型肠化生;而最初有K - ras 突变的患者39.1%病变进一步发展。同时发现,K - ras 基因第12 位密码子C-T 颠换(GGT-TGT)的患者,有19.4% (5/17)病变发展,而同一位置有C-A 转换(CCT-ACT)的患者,60.0% (3/5)病变发展,说明K-ms 突变的位置不同其预后也不同。我国学者的研究表明在胃癌中存在H - ras 基因第12 位的点突变。同时在早期癌和癌前病变(肠化生、异型增生)组织中也检测到H - ras 基因第12 位的点突变。上述结果说明,H- ras 墓因的变异可能受环境和地域的影响。Teh 发现,正常十二指肠黏膜中存在P21 蛋白的过表达,而肠化生、异型增生、肠型胃癌等胃黏膜组织学上或多或少具有肠型上皮的特点。由此认为P21 蛋白的过表达反映了具有肠
型上皮分化特征的细胞和组织的存在,是胃黏膜柱状上皮向肠上皮分化的结果,可以作为监测胃黏膜病变发生的一个早期标志。
二.根据本课题要求,本次检索设定年限为2001-2011。检索的文献包括综述,实验研究,临床研究等多种形式。本次检索文献主要目的是详细了解ras基因家族在胃肿瘤发病中作用机制及表达水平等的研究进展,以及从前人的研究中学习方法、经验及教训,从而更好的为自己的研究课题做准备。
三.本次检索主要利用PubMed,CNKI,EBSCO,CBMdisc数据库进行检索。
(一)PubMed检索过程:
1、利用百度翻译工具,“胃肿瘤”、“RAS基因”翻译
2、打开pubmed主页,选择mesh,分别检索“stomach neoplasms”、“Ras gene”
3、在选择MESH中的mesh词
检索结果
4、将结果进行and 运算
5.结果如下
6.在limits限定年份
7.结果如下
Pubmed检索系统使用方便,操作简单,使用过程中不需返回初始界面便可进行新的检索,每一个检索界面里均有检索提问输入框,可随时输入检索提问或修正检索提问。由以上截图可以看出利用pubmed检索结果是53篇相关文献。本次检索主要应用了pubmed数据库的限定检索方式,采用查mesh词表的方法获得主题词,并且运用布尔逻辑运算。操作步骤简单明了。由于运用主题词搭配副主题词的方法进行检索,大大的提高了检索的查准率。通过阅读相应文献的摘要,发现检索的文章与本人的课题相关度比较密切。另外,pubmed的检索结果输出功能包括显示、存盘、打印、订购文献全文,应用非常方便。Pubmed的核心主题是医学,并且是免费的检索引擎,对于一个医学研究生,我认为它是最简单有效的外文数据库之一。(二)利用EBSCO检索步骤
1、进入EBSCO的MEDLINE检索页面利用PUBMED中的mesh词进行检索
2、选择检索结果,进行检索
3、从检索历史记录中,将两个结果进行AND 运算
4.限定检索年限
5.最终结果
EBSCOhost代理的数据库保罗万象,涵盖的范围很大,有综合学科,商管财经,生物医学,法律等期刊的全文数据库。与pubmed相比文献的内容和数量更加丰富。EBSCOhost提供的检索方式为基本检索和高级检索两种。由以上截图看出,本次检索运用了MEDLINE检索页面,采取基本检索的方式,利用主题字段进行检索。然后对检索结果进行布尔逻辑运算,最终结果是52篇相关文献。
(三)CBMdisc检索步骤
1、查找“胃肿瘤”及“ras基因”的主题词
2、将检索结果进行and 运算