(完整版)生物信息学复习题百度文库合集
生物信息学复习题
生物信息学复习题生物信息学是一门结合生物学、计算机科学、信息学和数学的交叉学科，它利用计算机技术来处理和分析生物数据。
以下是一些生物信息学复习题，供同学们参考：1. 生物信息学的定义和应用领域- 生物信息学是如何定义的？- 生物信息学在哪些领域有应用？2. 基因组学基础- 什么是基因组学？- 基因组测序的基本原理是什么？3. 序列比对- 序列比对的目的是什么？- 简述局部比对和全局比对的区别。
4. BLAST算法- BLAST算法的原理是什么？- 如何使用BLAST进行序列相似性搜索？5. 基因表达数据分析- 基因表达数据有哪些类型？- 描述基因表达数据的预处理步骤。
6. 蛋白质结构预测- 蛋白质结构预测的重要性是什么？- 简述几种常见的蛋白质结构预测方法。
7. 系统生物学和网络分析- 系统生物学研究的是什么？- 网络分析在系统生物学中的应用。
8. 生物信息学中的数据库- 列举几个常见的生物信息学数据库。
- 解释数据库在生物信息学研究中的作用。
9. 生物信息学中的编程语言- 哪些编程语言在生物信息学中常用？- 简述Python在生物信息学中的应用。
10. 伦理和隐私问题- 在生物信息学研究中可能遇到哪些伦理问题？- 如何保护生物信息数据的隐私？11. 案例研究- 描述一个生物信息学在医学研究中的应用案例。
- 分析该案例中使用的方法和技术。
12. 未来趋势- 预测生物信息学未来的发展趋势。
- 讨论生物信息学如何影响未来的科学研究和医疗保健。
通过这些问题的复习，同学们可以更全面地了解生物信息学的基础概念、关键技术和应用领域。
希望这些复习题能够帮助同学们更好地准备考试和理解生物信息学的重要性。
生物信息考试题及答案
生物信息考试题及答案生物信息学是一门结合生物学、计算机科学、信息技术和数学的交叉学科，它利用计算机技术来分析和解释生物数据。
以下是一份生物信息学考试题及答案的示例。
生物信息学考试题一、选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学中，用于存储DNA序列的文件格式是：A. FASTAB. JPEGC. MP3D. DOCX2. 以下哪项不是生物信息学分析的基本步骤？A. 数据收集B. 数据预处理C. 数据解释D. 数据存储3. 在蛋白质序列分析中，BLAST工具用于：A. 序列比对B. 序列组装C. 序列克隆D. 序列合成4. 以下哪个数据库不是用于存储基因表达数据的？A. NCBIB. GEOC. PDBD. ArrayExpress5. 以下哪个算法不是用于基因预测的？A. GeneMarkB. BLASTC. GlimmerD. Fgenesh二、简答题（每题10分，共30分）6. 简述生物信息学在现代生物学研究中的重要性。
7. 解释什么是基因组学，并说明其在医学研究中的应用。
8. 描述序列比对的基本原理及其在生物信息学中的作用。
三、计算题（每题15分，共30分）9. 假设你有一个DNA序列，其组成为：ATCGTA。
请计算其互补序列。
10. 给定两个蛋白质序列，序列A：A-B-C-D-E，序列B：A-C-E-B-D。
请使用Needleman-Wunsch算法计算它们的全局比对得分。
四、论述题（每题20分，共20分）11. 论述生物信息学在新药开发中的作用及其面临的挑战。
答案一、选择题1. A2. C3. A4. C5. B二、简答题6. 生物信息学在现代生物学研究中的重要性体现在它能够处理和分析大量的生物数据，如基因组序列、蛋白质结构等，帮助科学家快速发现生物现象的规律，推动生物学的发展。
7. 基因组学是研究生物基因组的结构、功能和演化的科学。
在医学研究中，基因组学可以帮助我们了解疾病的遗传基础，为个性化医疗提供理论基础。
生物信息学复习题
名词解释1..生物信息学 :是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。
2.二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步的整理。
3.FASTA序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（>）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。
4.genbank序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。
该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释；第三部分是引文区，提供了这个记录的科学依据；第四部分是核苷酸序列本身，以“//”结尾。
5.Entrez检索系统：是NCBI开发的核心检索系统，集成了NCBI的各种数据库，具有的数据库多，使用方便，能够进行交叉索引等特点。
6.BLAST：基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列做相似性比较。
P947.查询序列（query sequence）：也称被检索序列，用来在数据库中检索并进行相似性比较的序列。
P988.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。
包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法。
P29 9.空位（gap）：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。
P2910.空位罚分：空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中的空位的引入不代表真正的进化事件，所以要对其进行罚分，空位罚分的多少直接影响对比的结果。
P3711.E值：衡量序列之间相似性是否显著的期望值。
生物信息学复习题
生物信息学复习题### 生物信息学复习题#### 一、选择题1. 生物信息学主要研究的是什么？A. 生物学数据的收集和存储B. 生物学数据的分析和解释C. 生物学实验的设计和执行D. 生物学仪器的操作和维护2. 下列哪一项不是生物信息学中常用的数据库？A. GenBankB. PDBC. PubMedD. Google Scholar3. 序列比对的目的是什么？A. 确定序列间的同源性B. 预测蛋白质的三维结构C. 鉴定基因的功能D. 计算基因的表达量#### 二、填空题1. 生物信息学中的BLAST工具主要用于__________。
2. 基因表达分析中常用的芯片技术包括__________和__________。
3. 在蛋白质结构预测中，同源建模依赖于__________数据库中的已知结构。
4. 转录组测序（RNA-Seq）可以用于研究__________和__________。
#### 三、简答题1. 描述基因组注释的一般流程。
2. 阐述生物信息学在药物设计中的应用。
3. 解释什么是系统发育树，并说明其在进化研究中的意义。
#### 四、计算题1. 给定一段DNA序列，计算其GC含量。
（示例序列：ATCGTACGTAGCTAGCTAG）2. 如果一个蛋白质序列的分子量为12345 Da，其氨基酸的平均分子量为110 Da，计算该蛋白质序列中氨基酸的数量。
#### 五、论述题1. 讨论生物信息学在个性化医疗中的作用和挑战。
2. 分析高通量测序技术对生物信息学领域的影响。
通过以上题目的复习，可以帮助学生掌握生物信息学的基础知识和技能，包括对生物数据的分析、解释和应用。
这些知识点不仅涵盖了生物信息学的基础理论，还涉及到实际应用，如药物设计、个性化医疗等，为学生提供了一个全面的复习框架。
《生物信息学》题集
《生物信息学》题集一、选择题（每题3分，共30分）1.生物信息学的主要研究对象是什么？A. 蛋白质结构B. 基因序列C. 生态系统D. 细胞代谢2.下列哪项技术不是生物信息学中常用的数据库技术？A. BLASTB. GenBankC. PubMedD. SWISS-PROT3.在生物信息学中，进行多序列比对时常用的软件是什么？A. MATLABB. ClustalWC. ExcelD. PowerPoint4.哪种算法常用于基因表达数据的聚类分析？A. K-meansB. DijkstraC. A*D. Floyd5.生物信息学中，下列哪项不是常用的序列分析技术？A. PCRB. 测序C. 质谱分析D. 芯片技术6.下列哪项不是生物信息学在医学领域的应用？A. 疾病诊断B. 药物设计C. 天气预报D. 个性化医疗7.下列哪项技术常用于生物大分子的结构预测？A. NMRB. X射线衍射C. 同源建模D. 质谱分析8.在生物信息学中，下列哪项不是基因注释的内容？A. 基因功能B. 基因表达水平C. 基因在染色体上的位置D. 基因的长度9.下列哪项技术不是高通量测序技术？A. Sanger测序B. Illumina测序C. 454测序D. SOLiD测序10.下列哪项不是生物信息学在农业领域的应用？A. 作物育种B. 病虫害防治C. 土壤成分分析D. 农产品品质改良二、填空题（每题2分，共20分）1.生物信息学是一门交叉学科，它主要涉及______、计算机科学和数学等领域。
2.在生物信息学中，______技术常用于基因序列的相似性搜索。
3.生物信息学在药物研发中的主要应用包括______和药物靶点的预测。
4.在基因表达数据分析中，______是一种常用的数据标准化方法。
5.生物信息学中，______技术常用于蛋白质结构的预测和分析。
6.在生物信息学数据库中，GenBank主要存储的是______数据。
生物信息学复习题已附答案
本卷的答案仅做参考，如有疑问欢迎提出。
后面的补充复习题要靠你们自己整理答案了。
生物信息学复习题一、填空题1、 识别基因主要有两个途径即2、 表达序列标签是从 mRNA 中生成的一些很短的序列（ 300-500bp ），它们代表在特定组织或发育阶段表达的基因。
3、 序列比对的基本思想，是找出 检测基因 和 目标序列 的相似性，就是通过在序列中插入 空位的方法使所比较的序列长度达到一致。
比对的数学模型大体分 为两类，分别— 和局部比对 。
4、 2-DE 的基本原理是根据蛋白质 和 分子量 不同，进行两次电泳将之分 离。
第一向是 等电聚焦分离 ,第 —S D S-P AGE 分离 o5、 蛋白质组研究的三大关键核心技术是 质谱鉴定技术 、 计算机图像数据处理与蛋白质数据库二、 判断题1、 生物体的结构和功能越复杂的种类就越多，所需要的基因也越多，是真核生物基因组的特点之一。
（对）2、 CDS 一定就是 ORF 。
（对）3、 两者之间有没有共同的祖先，可以通过序列的同源性来确定，如果两个基因或蛋白质有着几乎一样的序列，那么它们高度同源 ，就具有共同的祖先。
（错）4、 STS,是一段 200-300bp 的特定 DNA 序列，它的序列已知，并且在基因组中属于 单拷贝。
（对）5、 非编码 DNA 是“垃圾 DNA'，不具有任何的分析价值，对于细胞没有多大的作用。
（错）6、 基因树和物种树同属于系统树，它们之间可以等同。
（错）7、 基因的编码序列在 DNA 分子上是被不编码的序列隔开而不连续排列的。
&对任意一个 DNA 序列，在不知道哪一个碱基代表 CDS 的起始时，可用 获得6个潜在的蛋白质序列。
（对）9、 一个机体只有一个确定的基因组，但基因组内各个基因表达的条件和表达的程度随时间、空间和环境条件而不同。
（对）10、 外显子和内含子之间没有绝对的区分，一个基因的内含子可以是另一个基因的 外显子，同一个基因在不同的生理状况或生长发育的不同阶段，外显子组成也可以 不同。
生物信息学期末复习题与答案
一、单选题1、总的来说，位于染色体内超过( )个碱基的DNA，构成了人类基因组。
A.30000000000B.3000000000C.300000000D.30000000正确答案：B2、人类镰刀型红细胞贫血症是由于血红蛋白β链N端第6个氨基酸由谷氨酸突变为( )造成的。
A.苏氨酸B.缬氨酸C.赖氨酸D.谷氨酸正确答案：B3、RefSeq数据库是由哪个组织开发和维护的？( )A.NIGB.NCBIC.EMBLD.SIB正确答案：B4、Long non-coding RNA长链非编码RNA是长度大于( )个核苷酸的非编码RNA。
A.150B.250C.300D.200正确答案：D5、tBLASTx分析是用核酸序列检索核酸序列数据库，下列说法正确的是？（）A.核酸序列和核酸序列数据库都不需要翻译成蛋白质序列B.只有核酸序列数据库需要翻译成蛋白质序列C.只有核酸序列需要翻译成蛋白质序列D.核酸序列和核酸序列数据库都需要翻译成蛋白质序列正确答案：D6、要搜索编码蛋白质序列的核酸序列，适宜的分析方法是？（）A.BLASTxB.BLASTnC.tBLASTnD.BLASTp正确答案：A7、下列对于PCR引物修饰的说法正确的是？（）A.PCR引物的5’末端和3’末端均能进行修饰B.PCR引物的5’末端和3’末端均不能进行修饰C.只有PCR引物的5’末端能进行修饰D.只有PCR引物的3’末端能进行修饰正确答案：C8、下列哪个在线分析工具可以预测DNA的外显子-内含子？（）A.AugustusB.PLACEC.ORFfinderD.Entrez正确答案：A9、Smith-Waterman动态规划算法矩阵中的每个单元格有几条路径？（）A.1B.2C.3D.4正确答案：D10、下列关于Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法提出早晚的论述正确的是？（）A.Needleman-Wunsch算法提出时间较早B.不确定C.Smith-Waterman算法提出时间较早D.二者提出时间相当正确答案：A11、当分类单元至少为3时，下列对“有根树与无根树的数目”判断正确的是？（）A.有根树的数目要少于无根树的数目B.有根树的数目与无根树的数目一样多C.有根树的数目要多于无根树的数目D.二者数目无法判断正确答案：C12、下列哪种算法建树时，选择代价最小或者枝长最短的树？A.最大似然值法B.最大简约法C.邻接法D.UPGMA法正确答案：B二、多选题1、生物信息学是由( )等学科相互交叉而形成的一门新兴学科。
生物信息学考试试题
生物信息学考试试题一、选择题（每题 3 分，共 30 分）1、以下哪种不是常见的生物信息学数据库？（）A GenBankB SWISSPROTC PubMedD Baidu2、在 DNA 序列分析中，以下哪个不是用于序列比对的算法？（）A NeedlemanWunsch 算法B SmithWaterman 算法C BLAST 算法D Fourier 变换算法3、蛋白质结构预测的方法不包括（）A 同源建模B 从头预测C 折叠识别D 随机模拟4、以下哪种不是基因表达数据分析的常用方法？（）A 聚类分析B 主成分分析C 判别分析D 回归分析5、生物信息学中，用于预测蛋白质功能的方法有（）A 基于序列相似性B 基于结构相似性C 基于基因共表达D 以上都是6、在基因组学中，以下哪个不是测序技术？（）A Sanger 测序B 二代测序C 三代测序D 四代测序7、系统发生树构建的方法不包括（）A 距离法B 最大简约法C 最大似然法D 最小二乘法8、以下哪种不是生物信息学中常用的编程语言？（）A PythonB JavaC C+＋D Visual Basic9、以下哪个不是生物信息学在医学领域的应用？（）A 疾病诊断B 药物研发C 医疗美容D 个性化医疗10、生物信息学中，处理大规模数据常用的工具是（）A ExcelB R 语言C SPSSD Word二、填空题（每题 2 分，共 20 分）1、生物信息学是一门融合了生物学、计算机科学和（）的交叉学科。
2、常见的核酸序列格式有 FASTA 和（）。
3、蛋白质的二级结构包括α螺旋、β折叠和（）等。
4、基因芯片技术是一种（）分析技术。
5、序列比对的目的是寻找两个或多个序列之间的（）。
6、人类基因组计划的主要目标是测定人类基因组的（）序列。
7、生物信息学中的隐马尔可夫模型主要用于（）。
8、系统发生分析中，外群的作用是（）。
9、蛋白质相互作用网络分析有助于理解（）。
10、生物信息学数据库可以分为一级数据库和（）数据库。
《生物信息学》复习资料
Conting（叠连群）：又译作连续克隆系。
为搞清某段DNA的排列顺序而建立的一组克隆。
被克隆的DNA小片段有相互邻接并部分重叠的关系，从而可以完全覆盖该段DNA，一个这样的克隆群即为一个conting。
功能域：蛋白质中具有某种特定功能的部分，它在序列上未必是连续的。
某蛋白质中所有功能域组合起来决定着该蛋白质的全部功能。
基因组：某一物种的一套完整染色体组中的所有遗传物质。
其大小一般以其碱基对总数表示。
基因组学：从事基因组的序列测定和表征描述，以及基因活性与细胞功能关系的研究。
人类基因组计划：HGP主要目标：提供公开的完全的高质量的含有30亿bp的人类基因组全序列。
生物信息学：是分子生物学，信息技术与科学，物理学，数学等学科交叉，结合的产物。
其研究核心是基因组信息学及蛋白质组学。
序列标签位点：人类基因组中只出现一次的位置和序列已知的长度约为200~~500bp的特定DNA序列。
人工神经网络：是对人类大脑特性的一种描述。
简单地讲，它是一个数字模型，可以用电子线路来实现，也可以用计算机程序来模拟，是人工智能研究的一种方法。
一级数据库：数据库中的数据直接来源于试验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释。
二级数据库：根据生命科学不同研究领域的实际需要，对基因组图谱、核酸和蛋白质序列、蛋白质结构以及文献等数据进行分析、整理、归纳、注释，构建具有特殊生物学意义和专门用途的二次数据库。
直系同源：是指来自于不同物种的由垂直家系（物种形成）进化而来基因，并且典型的保留与原始基因有相同的功能旁系同源：指同一基因组（或同系物种的基因组）中，由于始祖基因的加倍而横向产生的几个同源基因，可能会进化出新的与原来有关的功能。
分子钟：某一种蛋白质在不同物种间的取代数与所研究的物种间的分歧时间接近正线性关系，从而将分子水平的这种恒速变异称为“分子钟”。
蛋白质组：由一个细胞或一个组织的基因所表达的全部相应的蛋白质数据库查询：指对序列，结构以及各种二次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找数据库搜索：是指通过特定的序列相似性比对算法，找出核酸或蛋白质序列数据库中与检测序列具有一定程度相似性的序列。
生物信息考试题及答案
生物信息考试题及答案一、选择题（每题2分，共20分）1. 基因组学研究的核心是（）。
A. 基因克隆B. 基因表达C. 基因组序列D. 基因功能答案：C2. 下列哪项不是生物信息学的主要研究内容？（）A. 基因组序列分析B. 蛋白质结构预测C. 植物分类学D. 基因表达分析答案：C3. 转录组学研究的是（）。
A. 基因组中的所有基因B. 特定细胞或组织中的所有RNA分子C. 特定细胞或组织中的所有蛋白质分子D. 特定细胞或组织中的所有DNA分子答案：B4. 下列哪个数据库主要用于存储蛋白质序列信息？（）A. GenBankB. PDBC. Swiss-ProtD. EMBL答案：C5. 以下哪个不是生物信息学中常用的序列比对工具？（）A. BLASTB. FASTAC. ClustalWD. PCR答案：D6. 以下哪个是用于蛋白质三维结构预测的软件？（）A. Swiss-ProtB. PDBC. MODELLERD. GenBank答案：C7. 以下哪个是用于基因表达分析的高通量技术？（）A. Sanger测序B. 微阵列C. PCRD. 质谱分析答案：B8. 下列哪个是用于基因组关联研究的统计方法？（）A. 聚类分析B. 系统发育分析C. 连锁不平衡分析D. 多态性分析答案：C9. 以下哪个是用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析的工具？（）A. STRINGB. BLASTC. ClustalWD. GenBank答案：A10. 下列哪个是用于生物信息学数据可视化的工具？（）A. R语言B. PythonC. CytoscapeD. Perl答案：C二、填空题（每题2分，共20分）1. 生物信息学是一门结合了__________、__________和__________的交叉学科。
答案：生物学、计算机科学、信息技术2. 基因组学中的“组”指的是__________的集合。
答案：基因3. 转录组学研究的RNA分子包括__________、__________和__________。
生物信息学复习要点
如对您有帮助，欢迎下载支持，谢谢！如对您有帮助，欢迎下载支持，谢谢！一、名词解释（每小题3分，共30分）分）1.1. 生物信息学生物信息学2.2. 数据库技术数据库技术3.3. 数据仓库数据仓库4.4.EST5.5. 概念性翻译概念性翻译6.6. 同源性同源性7.7. 单系类群单系类群8.8. 全局排列全局排列9.9. 基因作图基因作图1010．直系同源体簇．直系同源体簇．直系同源体簇二、填空题（每空1分，共10分）分）1． 生物信息学主要研究的两种信息载体是生物信息学主要研究的两种信息载体是和 。
2． 国际上的三大核苷酸序列数据库分别是 、和 。
3． 数据挖掘的三大技术支柱是数据挖掘的三大技术支柱是、 和 。
4． 相同类型核苷酸的替换称为 ，不同类型核苷酸的替换称为 。
三、单项选择题（每小题1分，共10分）分）1.1. 在对模式生物进行全基因组的测定中，作为真菌模式生物的是在对模式生物进行全基因组的测定中，作为真菌模式生物的是。
A 、大肠杆菌、大肠杆菌B 、青霉菌、青霉菌C 、酵母菌、酵母菌D 、线虫、线虫2．NCBI 成立于成立于。
A 、1988年B 、1989年C 、1990年D 、1992年3．根据数据库管理系统所支持的基本数据模型的不同，可以将数据库分为五类，其中第二代数据库是代数据库是。
A 、层次数据库、层次数据库B 、网状数据库、网状数据库C 、关系数据库、关系数据库D 、分布式数据库、分布式数据库4．在向GenBank 投送序列的工具中，投送序列的工具中， 是标准的序列投送工具。
是标准的序列投送工具。
A 、Cn3DB 、tb12asnC 、BankItD 、Sequin5. 目前最为常用和注释最全的蛋白质序列数据库是目前最为常用和注释最全的蛋白质序列数据库是。
A 、Identify B 、OWLC 、PIRD 、SWISS-PROT6. 下列选项中根据蛋白质三维折叠模式和进化关系划分的结构分类数据库是下列选项中根据蛋白质三维折叠模式和进化关系划分的结构分类数据库是。
生物信息学课程复习题（南医大）
⽣物信息学课程复习题（南医⼤）⽣物信息学课程习题第⼀章绪论⼀、填空1、在年，美国国会批准启动⼈类基因组计划，拟⽤年时间测定⼈类全部条染⾊体上共个碱基序列的测定。
2、是遗传信息的携带者。
3、蛋⽩质三维结构测定主要⽅法有和。
4、理想的抗⽣素靶标应为微⽣物细胞所必须，在病原体中⾼度，且在⼈体中或与⼈类基因有。
5、下图例举了⼀个计算机辅助药物设计的实例，从a图中我们得到了配体上R基团附近的受体上有和残基，具有性，因此可以将R基团设计为性基团，如图b中所⽰的基团，使得抑制活性⽐改造前提⾼了近5000倍。
⼆、名词HGP（human genome project），EST（expressed sequence tag）, SNP（single nucleotide polymorphism）,⽣物信息学（Bioinformatics），药物基因组学（Pharmacogenomics），intron，“Junk DNA”，⽐较基因组学，蛋⽩质组学，分⼦进化树（evolutionary tree），基因组，基因组药物三、简答1、简述⽣物信息学在药物研究开发领域的应⽤可体现在哪些⽅⾯？2、如何利⽤基因组信息寻找新的药物作⽤靶标？3、如何利⽤⼈类基因组信息实现个性化治疗，其基于的原理是什么？4、试叙述基因芯⽚⽤于疾病诊断的原理，并说明其优缺点。
5、最近甲型流感流⾏，请设计甲型流感的分⼦诊断⽅法，说明其原理。
第⼆、三章数据库⼀、单选题1、以下数据库不能⽤于检索核酸序列的是（ B ）A. GenBankB. PDBC. EMBLD.DDBJ2、蛋⽩质结构数据常保存为下⾯哪⼀种格式为后缀的⽂件（）A. PDBB. txtC. SeqD. mdb3、下列格式属于FASTA格式的是（）A. >seq1B.C. ATGCCATAD. > ATGCCATAATGCCATA ATGCCATA⼆、填空题1、阅读以下数据格式，写出以下标注的含义：LOCUS是，DEFINITION是，ACCESSION是，VERSION是，SOURCE是在论⽂中使⽤了NCBI数据库中的该序列，应标注该序列的编号，应填。
生物信息学复习题
生物信息学复习题生物信息学复习题生物信息学是一门研究生物学数据的收集、存储、管理和分析的学科。
它利用计算机科学和统计学的方法来解决生物学中的问题。
在这篇文章中，我将提供一些生物信息学的复习题，帮助大家巩固对这门学科的理解。
1. 什么是基因组学？基因组学是研究生物体基因组的学科。
它涉及到对基因组的序列、结构和功能的研究。
基因组学的发展使得我们能够更好地理解基因组的组成和功能，从而有助于解决生物学中的一些重要问题。
2. 什么是DNA序列？DNA序列是指DNA分子中碱基的顺序。
DNA序列的研究可以帮助我们了解基因组的组成和功能。
通过对DNA序列的分析，我们可以识别基因、预测蛋白质编码区域，并研究基因组的演化等。
3. 什么是蛋白质序列？蛋白质序列是指蛋白质分子中氨基酸的顺序。
蛋白质序列的研究可以帮助我们了解蛋白质的结构和功能。
通过对蛋白质序列的分析，我们可以预测蛋白质的结构、功能和相互作用等。
4. 什么是序列比对？序列比对是指将两个或多个序列进行比较，找出它们之间的相似性和差异性。
序列比对可以通过比较序列中的碱基或氨基酸的顺序来进行。
序列比对的结果可以帮助我们了解序列的进化关系，预测序列的功能以及发现新的序列。
5. 什么是基因表达谱？基因表达谱是指在特定条件下，基因在细胞或组织中的表达水平。
基因表达谱的研究可以帮助我们了解基因的功能以及基因在生物体中的调控机制。
通过对基因表达谱的分析，我们可以发现与特定生理过程或疾病相关的基因。
6. 什么是蛋白质结构预测？蛋白质结构预测是指根据蛋白质的氨基酸序列，预测蛋白质的三维结构。
蛋白质结构预测的研究可以帮助我们了解蛋白质的功能和相互作用。
通过蛋白质结构预测，我们可以预测蛋白质的功能、鉴定药物靶点以及设计新的蛋白质。
7. 什么是基因组注释？基因组注释是指对基因组中的基因和非编码区域进行功能和结构的描述。
基因组注释的研究可以帮助我们了解基因组的组成和功能。
通过基因组注释，我们可以识别基因、预测蛋白质编码区域，并研究基因组的演化等。
生物信息学复习题百度文库合集
生物信息学，一、名词解释：1、生物信息学：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用；以数学为基础，应用计算机技术，研究生物学数据的科学。
2、相似性（similarity）：两个序列（核酸、蛋白质）间的相关性。
3、同源性（homology）：生物进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。
4、同一性（identity）：两个序列（核酸、蛋白质）间未发生变异序列的关系。
5、序列比对（alignment）：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列。
6、生物数据库检索（database query，数据库查询）：对序列、结构以及各种二次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找。
7、生物数据库搜索（database search)：通过特定序列相似性比对算法，找出核酸或蛋白质序列数据库中与待检序列具有一定程度相似性的序列。
二、简答题：1、分子生物学的三大核心数据库是什么？它们各有何特点？GenBank核酸序列数据库；SWISS-PROT蛋白质序列数据库；PDB生物大分子结构数据库；2、简述生物信息学的发生和发展。
20世纪50年代，生物信息学开始孕育；20世纪60年代，生物分子信息在概念上将计算生物学和计算机科学联系起来；20世纪70年代，生物信息学的真正开端；20世纪70年代到80年代初期，出现了一系列著名的序列比较方法和生物信息分析方；20世纪80年代以后，出现一批生物信息服务机构和生物信息数据库；20世纪90年代后，HGP促进生物信息学的迅速发展。
3、生物信息学的主要方法和技术是什么？数学统计方法；动态规划方法；机器学习与模式识别技术；数据库技术及数据挖掘；人工神经网络技术；专家系统；分子模型化技术；量子力学和分子力学计算；生物分子的计算机模拟；因特网（Internet）技术4、常见的DNA测序方法有哪些？各有何技术特点和优缺点？Maxam-Gilbert DNA化学降解法：优点：可测完全未知序列及CG富含区；缺点：操作繁琐；Sanger双脱氧链终止法：优点：简便，可测较长片段；缺点：需已知部分序列或加接头；焦磷酸测序：优点：廉价、高通量；缺点：一次测序片段短。
生物信息学考试试题
生物信息学考试试题1. 选择题1. DNA序列中哪种碱基与腺嘌呤形成碱基对？A. 腺嘌呤B. 胸腺嘧啶C. 钝甲嘧啶D. 尿嘧啶2. 下列哪种不属于生物信息学中常用的序列比对软件？A. BLASTB. ClustalWC. PhotoshopD. MEGA3. 在生物信息学中，什么是基因组装？A. 把基因组序列和蛋白质序列对应起来B. 把已知的DNA序列分析并组装成完整的基因组C. 把DNA序列和RNA序列对比分析D. 把基因组序列转录为RNA序列4. 下列哪个软件主要用于预测DNA序列中的基因结构？A. BLASTB. ClustalWC. FGENESD. MEGA5. 在生物信息学中，什么是密码子？A. DNA序列中的重复单元B. 氨基酸序列C. tRNA分子上的核苷酸组合D. mRNA上的三联体核苷酸序列2. 简答题1. 请简要解释生物信息学在基因组学中的应用。
2. 什么是序列比对？序列比对的意义是什么？3. 解释基因组装和基因注释在生物信息学中的作用。
4. 生物信息学中常用的两种序列分析方法分别是什么？简要描述它们的原理。
5. 请简要介绍生物信息学在进化比较基因组学中的应用。
3. 计算题1. 给定以下两条序列，求它们的相似度：序列1: ATCGTCCGATT序列2: ATCGACCGTTA2. 已知一个DNA序列长度为1000bp，其中AT含量为60%，求该序列中GC含量百分比。
4. 应用题1. 请利用BLAST软件对一组已知DNA序列进行序列比对，并解释结果。
2. 请使用ClustalW对两个已知蛋白质序列进行多序列比对，并分析比对结果。
3. 选取一个基因组装软件，对一个已知基因组序列进行装配，并解释装配结果。
以上是生物信息学考试试题，希望您认真作答，祝您考试顺利！。
(完整word版)生物信息学_复习题及答案(打印)
一、名词解释：1.生物信息学：研究大量生物数据复杂关系的学科，其特征是多学科交叉，以互联网为媒介，数据库为载体。
利用数学知识建立各种数学模型; 利用计算机为工具对实验所得大量生物学数据进行储存、检索、处理及分析，并以生物学知识对结果进行解释。
2.二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步的整理。
3.FASTA序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（>）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。
4.genbank序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。
该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释；第三部分是引文区，提供了这个记录的科学依据；第四部分是核苷酸序列本身，以“//”结尾。
5.Entrez检索系统：是NCBI开发的核心检索系统，集成了NCBI的各种数据库，具有链接的数据库多，使用方便，能够进行交叉索引等特点。
6.BLAST：基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列做相似性比较。
P947.查询序列（query sequence）：也称被检索序列，用来在数据库中检索并进行相似性比较的序列。
P988.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。
包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法。
P299.空位（gap）：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。
P2910.空位罚分：空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中的空位的引入不代表真正的进化事件，所以要对其进行罚分，空位罚分的多少直接影响对比的结果。
生物信息学题库--精校+整理
生物信息学题库一、名词解释1.生物信息学:生物分子信息的获取、存贮、分析和利用;以数学为基础, 应用计算机技术, 研究生物学数据的科学。
2.相似性(similarity):相似性是指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相同DNA 碱基或氨基酸残基顺序所占比例的高低。
3.同源性(homology):生物进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。
4.BLAST(Basic Local Alignment Search Tool):基本局部比对搜索工具, 用于相似性搜索的工具, 对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列做相似性比较。
5.HMM隐马尔可夫模型:是蛋白质结构域家族序列的一种严格的统计模型, 包括序列的匹配, 插入和缺失状态, 并根据每种状态的概率分布和状态间的相互转换来生成蛋白质序列。
6.一级数据库:一级数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据, 只经过简单的归类整理和注释(投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白质序列提交到相应的数据库中)7、二级数据库:对原始生物分子数据进行整理、分类的结果, 是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定的应用目标而建立的。
8、GenBank: 是具有目录和生物学注释的核酸序列综合公共数据库, 由NCBI构建和维护。
9、EMBL: EMBL 实验室: 欧洲分子生物学实验室。
EMBL 数据库: 是非盈利性学术组织 EMBL 建立的综合性数据库, EMBL 核酸数据库是欧洲最重要的核酸序列数据库, 它定期地与美国的GenBank、日本的 DDBJ 数据库中的数据进行交换, 并同步更新。
10、DDBJ: 日本核酸序列数据库, 是亚洲唯一的核酸序列数据库。
11.Entrez:是由 NCBI 主持的一个数据库检索系统, 它包括核酸, 蛋白以及 Medline 文摘数据库, 在这三个数据库中建立了非常完善的联系。
12.SRS(sequence retrieval system):序列查询系统, 是 EBI 提供的多数据库查询工具之一。
生物信息学期末复习题
9)预测基因的一般步骤是什么？答案：⑴获取DNA目标序列⑵查找ORF并将目标序列翻译成蛋白质序列，利用相应工具查找ORF并将DNA序列翻译成蛋白质序列⑶在数据库中进行序列搜索，利用BLAST进行ORF核苷酸序列和ORF翻译的蛋白质序列搜索⑷进行目标序列与搜索得到的相似序列的全局对比⑸查找基因家族进行多序列比对，获得比对区段的基因家族信息⑹查找目标序列中的特定模序，分别在Prosite、BLOCK、Motif数据库中进行profile、模块（block）、模序（motif）检索⑺预测目标序列蛋白质结构，利用PredictProtein（EMBL）、NNPREDICT等预测目标序列的蛋白质二级结构。
15)在基因组序列分析方面，科学家关注哪些信息？答案：就人类基因组而言，编码区域在人类基因组所占的比例不超过3%。其余97%是非编码序列。对于非编码序列，人们了解得比较少，尚不清楚其含义或功能。然而，非编码区域对于生命活动具有重要的意义。这部分序列主要包括内含子、简单重复序列、移动元件（mobile element）及其遗留物、伪基因（pseudo gene）等。
3)简要介绍FASTA序列格式答案：FASTA格式，又叫Pearson格式，是最简单的，使用最多的格式。它的基本形式分为三个部分：⑴第一行：大于号（﹥）表示一个新的序列文件的开始，为标记符。后面可以加上文字说明，gi号，GenBank检索号，LOCUS名称等信息。⑵第二行：序列本身，为DNA的标准符号，通常大小写均可。⑶结束：无特殊标志，但建议多留一个空行，以便将序列和其他内容区分开。
16)为什么要进行序列片段组装？在进行序列片段组装时会遇到哪些问题？答案：大规模基因组测序得到待测序列的一系列序列片段，这些序列片段覆盖待测序列，序列片段之间也存在着相互覆盖或者重叠。遇到的问题：碱基标识错误；不知道片段的方向；存在重复区域；缺少覆盖。
生物信息学试题及答案
生物信息学试题及答案一、单项选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学的主要研究对象是（）。
A. 生物数据B. 生物实验C. 生物模型D. 生物技术答案：A2. 下列哪项不是生物信息学中的常用数据库（）。
A. GenBankB. Swiss-ProtC. PubMedD. Google Scholar答案：D3. 蛋白质序列比对的主要目的是（）。
A. 确定蛋白质的三维结构B. 预测蛋白质的功能C. 比较蛋白质的氨基酸序列D. 计算蛋白质的分子量答案：B4. 在生物信息学中，以下哪种算法不是用于序列比对的（）。
A. BLASTB. FASTAC. Smith-WatermanD. Hidden Markov Model答案：D5. 下列哪种生物信息学工具主要用于基因表达分析（）。
A. ClustalWB. Primer3C. R语言D. PDB答案：C6. 以下哪种技术不是用于蛋白质结构预测的（）。
A. 同源建模B. 从头预测C. 序列比对D. 折叠识别答案：C7. 以下哪种生物信息学工具主要用于基因组注释（）。
A. BLASTC. GATKD. Primer3答案：B8. 在生物信息学中，以下哪种方法不用于基因表达数据的聚类分析（）。
A. K-meansB. Hierarchical clusteringC. Principal component analysisD. Multiple sequence alignment答案：D9. 下列哪种生物信息学工具主要用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析（）。
A. STRINGB. BLASTD. Primer3答案：A10. 在生物信息学中，以下哪种数据库不包含蛋白质结构信息（）。
A. PDBB. UniProtC. RCSBD. GenBank答案：D二、多项选择题（每题3分，共15分）11. 生物信息学中常用的序列比对工具包括（）。
A. BLASTB. FASTAC. ClustalWD. Pfam答案：ABC12. 以下哪些是生物信息学中常用的基因表达分析软件（）。
中科院生物信息学复习题
1.什么是生物信息学，如何理解其含义？答：生物信息学有三个方面的含义：1)生物信息学是一个学科领域，包含着基因组信息的获取、处理、存储、分配、分析和解释的所有方面。
2)生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头，破译隐藏在DNA序列中的遗传语言，特别是非编码区的实质；同时在发现了新基因信息之后进行蛋白质空间结构模拟和预测；其本质是识别基因信号。
3)生物信息学的研究目标是揭示“基因组信息结构的复杂性及遗传语言的根本规律”。
它是当今自然科学和技术科学领域中“基因组、“信息结构”和“复杂性”这三个重大科学问题的有机结合。
怎样理解生物信息学：生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头，找到基因组序列中代表蛋白质和RNA基因的编码区；同时阐明基因组中大量存在的非编码区的信息实质，破译隐藏在DNA 序列中的遗传语言规律：在此基础上，归纳、整理与基因组遗传信息释放及其调控相关的转录谱和蛋白谱数据，从而认识代谢、发育、分化、进化的规律。
其还利用基因组中编码区信息进行蛋白空间结构模拟和蛋白功能预测，并将此类信息与生物体和生命过程中的生理生化信息结合，阐明其分子机制，最终进行蛋白、核酸分子设计、药物设计、个体化医疗保健设计。
2.如何利用数据库信息发现新基因，基本原理？答：利用数据库资源发现新基因，根据数据源不同，可分2种不同的查找方式：1)从大规模基因组测序得到的数据出发，经过基因识别发现新基因：利用大规模拼接好的基因组，使用不同数据方法，进行标识查找，并将找到的可能的新基因同数据库中已有的基因对比，从而确定是否为新基因。
可分为：①基于信号，如剪切位点、序列中的启动子与终止子等。
②基于组分，即基因家族、特殊序列间比较，Complexity analysis，Neural Network2)利用EST数据库发现新基因和新SNPs：数据来源于大量的序列小片段，EST较短，故关键在正确拼接。
方法有基因组序列比对、拼接、组装法等。
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生物信息学，一、名词解释：1、生物信息学：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用；以数学为基础，应用计算机技术，研究生物学数据的科学。
2、相似性（similarity）：两个序列（核酸、蛋白质）间的相关性。
3、同源性（homology）：生物进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。
4、同一性（identity）：两个序列（核酸、蛋白质）间未发生变异序列的关系。
5、序列比对（alignment）：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列。
6、生物数据库检索（database query，数据库查询）：对序列、结构以及各种二次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找。
7、生物数据库搜索（database search)：通过特定序列相似性比对算法，找出核酸或蛋白质序列数据库中与待检序列具有一定程度相似性的序列。
二、简答题：1、分子生物学的三大核心数据库是什么？它们各有何特点？GenBank核酸序列数据库；SWISS-PROT蛋白质序列数据库；PDB生物大分子结构数据库；2、简述生物信息学的发生和发展。
20世纪50年代，生物信息学开始孕育；20世纪60年代，生物分子信息在概念上将计算生物学和计算机科学联系起来；20世纪70年代，生物信息学的真正开端；20世纪70年代到80年代初期，出现了一系列著名的序列比较方法和生物信息分析方；20世纪80年代以后，出现一批生物信息服务机构和生物信息数据库；20世纪90年代后，HGP促进生物信息学的迅速发展。
3、生物信息学的主要方法和技术是什么？数学统计方法；动态规划方法；机器学习与模式识别技术；数据库技术及数据挖掘；人工神经网络技术；专家系统；分子模型化技术；量子力学和分子力学计算；生物分子的计算机模拟；因特网（Internet）技术4、常见的DNA测序方法有哪些？各有何技术特点和优缺点？Maxam-Gilbert DNA化学降解法：优点：可测完全未知序列及CG富含区；缺点：操作繁琐；Sanger双脱氧链终止法：优点：简便，可测较长片段；缺点：需已知部分序列或加接头；焦磷酸测序：优点：廉价、高通量；缺点：一次测序片段短。
5、分子生物学数据库有哪些类型？各有何特点？基因组数据库：基因组测序核酸序列数据库：核酸序列测定一次数据库：蛋白质序列数据库：蛋白质序列测定。
生物大分子(蛋白质)三维结构数据库：X-衍射和核磁共振特点：数量少，容量大，更新快二次数据库：上述四类数据库和文献资料为基础构建特点：数量多，容量小，更新慢6、简述NCBI Entrez系统的功能。
高级检索系统；查找核酸、蛋白、文献、结构、基因组序列、大分子三维结构、突变数据、探针序列、单核苷酸多态性等数据。
7、简述NCBI BLAST的功能和种类。
序列相似性比对工具；对核酸：普通blastn，对高度相似序列megablast；对蛋白质：普通blastp，对保守域rpsblast；对人工翻译序列：核酸翻译序列对蛋白质序列blastx，蛋白质对翻译序列tblastn，核酸翻译序列对翻译序列tblastx；其它：基因组blast，基因表达序列搜索GEO blast，序列两两比对……三、论述题：1、什么是生物信息学？生物信息学有哪些主要应用领域？生物分子信息的获取、存贮、分析和利用；以数学为基础，应用计算机技术，研究生物学数据的科学。
生物分子数据的收集与管理；数据库搜索及序列比较；基因组序列分析；基因表达数据的分析与处理；蛋白质结构预测。
2、生物信息学在医药领域有什么应用？辅助诊断（遗传病，HLA分型）；研究药物作用机制，辅助新药物开发和制造。
3、人类基因组计划中主要使用的那些生物信息学手段？它们对人类基因组计划发挥了哪些重大作用？单一测序结果判读；contig和chromosome拼接；识别基因区及其调控区；寻找基因相互作用的时空关系；4、试述蛋白质二级结构预测的主要策略和方法。
策略：目标：判断每一段中心的残基是否处于a螺旋、b折叠、b转角（或其它状态）之一的二级结构态，即三态。
a、理论分析法（从头计算法）：通过理论计算（分子力学、分子动力学等）进行结构预测。
优点：不需要经验数据，由一级结构推测高级结构缺点：天然和未折叠蛋白间能级差很小 (kcal/mol)；蛋白质可能的构想空间庞大，针对蛋白质折叠的计算量巨大；计算模型中力场参数不准确。
b、统计方法：对已知结构的蛋白质进行统计分析，建立序列到结构的映射模型，进而根据映射模型对未知结构的蛋白质直接从氨基酸预测结构。
c经验性方法：根据一定序列形成一定结构的倾向进行结构预测。
通过对已知结构的蛋白质进行统计分析，发现各种氨基酸形成不同二级结构的倾向，从而形成一系列关于二级结构预测的规律。
d结构规律提取方法：从蛋白质结构数据库中提取关于蛋白质结构形成的一般性规律，指导建立未知结构的蛋白质模型。
e同源模型化方法：通过同源序列分析或模式匹配，预测蛋白质的空间结构或结构单元。
方法：1、Chou-Fasman方法；（基于单个氨基酸残基统计的经验参数方法，由Chou 和Fasman在20世纪70年代提出来。
通过统计分析，获得每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子，进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。
）2 GOR方法；（是一种基于信息论和贝叶斯统计学的方法GOR将蛋白质序列当作一连串的信息值来处理；GOR方法不仅考虑被预测位置本身氨基酸残基种类的影响，而且考虑相邻残基种类对该位置构象的影响）3、基于氨基酸疏水性的方法；4、最邻近方法；5、人工神经网络方法；6、综合方法：7、利用进化信息预测蛋白质的二级结构。
1. 生物信息学：1）生物信息学包含了生物信息的获取、处理、分析、和解释等在内的一门交叉学科；2）它综合运用了数学、计算机学和生物学的各种工具来进行研究；3）目的在于阐明大量生物学数据所包含的生物学意义。
2. BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）直译：基本局部排比搜索工具意译：基于局部序列排比的常用数据库搜索工具含义：蛋白质和核酸序列数据库搜索软件系统及相关数据库3. PSI-BLAST：是一种迭代的搜索方法，可以提高BLAST和FASTA的相似序列发现率。
4. 一致序列：这些序列是指把多序列联配的信息压缩至单条序列，主要的缺点是除了在特定位置最常见的残基之外，它们不能表示任何概率信息。
5. HMM 隐马尔可夫模型：一种统计模型，它考虑有关匹配、错配和间隔的所有可能的组合来生成一组序列排列。
（课件定义）是蛋白质结构域家族序列的一种严格的统计模型，包括序列的匹配，插入和缺失状态，并根据每种状态的概率分布和状态间的相互转换来生成蛋白质序列。
6. 信息位点：由位点产生的突变数目把其中的一课树与其他树区分开的位点。
7. 非信息位点：对于最大简约法来说没有意义的点。
8. 标度树：分支长度与相邻节点对的差异程度成正比的树。
9. 非标度树：只表示亲缘关系无差异程度信息。
10. 有根树：单一的节点能指派为共同的祖先，从祖先节点只有唯一的路径历经进化到达其他任何节点。
11. 无根树：只表明节点间的关系，无进化发生方向的信息，通过引入外群或外部参考物种，可以在无根树中指派根节点。
12. 注释：指从原始序列数据中获得有用的生物学信息。
这主要是指在基因组DNA中寻找基因和其他功能元件（结构注释），并给出这些序列的功能（功能注释）。
13. 聚类分析：一种通过将相似的数据划分到特定的组中以简化大规模数据集的方法。
14. 无监督分析法：这种方法没有内建的分类标准，组的数目和类型只决定于所使用的算法和数据本身的分析方法。
15. 有监督分析法：这种方法引入某些形式的分类系统，从而将表达模式分配到一个或多个预定义的类目中。
16. 微阵列芯片：将探针有规律地排列固定于载体上，与标记荧光分子的样品进行杂交，通过扫描仪扫描对荧光信号的强度进行检测，从而迅速得出所要的信息。
17. 虚拟消化：是基于已知蛋白序列和切断酶的特异性的情况下进行的理论酶切（课件定义）。
是在已知蛋白质序列和蛋白外切酶之类切断试剂的已知特异性的基础上，由计算机进行的一种理论上的蛋白裂解反应。
18. 质谱(MS)是一种准确测定真空中离子的分子质量/电荷比(m/z)的方法，从而使分子质量的准确确定成为可能。
质谱分析的两个工具19. 分子途径是指一组连续起作用以达到共同目标的蛋白质。
20. 虚拟细胞：一种建模手段，把细胞定义为许多结构，分子，反应和物质流的集合体。
21. 先导化合物：是指具有一定药理活性的、可通过结构改造来优化其药理特性而可能导致药物发现的特殊化合物。
就是利用计算机在含有大量化合物三维结构的数据库中，搜索能与生物大分子靶点匹配的化合物，或者搜索能与结合药效团相符的化合物，又称原型物，简称先导物，是通过各种途径或方法得到的具有生物活性的化学结构22. 权重矩阵（序列轮廓）：它们表示完全结构域序列，多序列联配中每个位点的氨基酸都有分值，并且特定位置插入或缺失的可能性均有一定的衡量方法（课件定义）。
基础上针对特定的应用目标而建立的数据库。
23. 系统发育学（phylogenetic）：确定生物体间进化关系的科学分支。
24. 系统生物学（systems biology）：是研究一个生物系统中所有组分成分（基因、mRNA、蛋白质等）的构成以及在特定条件下这些组分间的相互关系，并分析生物系统在一定时间内的动力学过程25. 蛋白质组（proteome）：是指一个基因组、一种生物或一个细胞/组织的基因组所表达的全套蛋白质。
26. ESI电喷雾离子化：一种适合大分子如蛋白质离子化没有明显降解的质谱技术。
二.填空题1. 常用的三种序列格式：NBRF/PIR,FASTA和GDE2. 初级序列数据库：GenBank，EMBL和DDBJ3. 蛋白质序列数据库：SWISS-PROT和TrEMBL4. 提供蛋白质功能注释信息的数据库：KEGG（京都基因和基因组百科全书）和PIR（蛋白质信息资源）5. 目前由NCBI维护的大型文献资源是PubMed6. 数据库常用的数据检索工具：Entrez，SRS，DBGET7. 常用的序列搜索方法：FASTA和BLAST8. 高分值局部联配的BLAST参数是HSPs（高分值片段对），E（期望值）9. 多序列联配的常用软件：Clustal10. 蛋白质结构域家族的数据库有：Pfam，SMART11. 系统发育学的研究方法有：表现型分类法，遗传分类法和进化分类法12. 系统发育树的构建方法：距离矩阵法，最大简约法和最大似然法13. 常用系统发育分析软件：PHYLIP14. 检测系统发育树可靠性的技术：bootstrapping和Jack-knifing15. 原核生物和真核生物基因组中的注释所涉及的问题是不同的16.检测原核生物ORF的程序：NCBI ORF finder17. 测试基因预测程序正确预测基因的能力的项目是GASP（基因预测评估项目）18. 二级结构的三种状态：α螺旋，β折叠和β转角19. 用于蛋白质二级结构预测的基本神经网络模型为三层的前馈网络，包括输入层，隐含层和输出层20. 通过比较建模预测蛋白质结构的软件有SWISS-PDBVIEWER（SWISS—MODEL网站）21. 蛋白质质谱数据搜索工具：SEQUEST22. 分子途径最广泛数据库：KEGG23.聚类分析方法，分为有监督学习方法，无监督学习方法24. 质谱的两个数据库搜索工具：SEQEST和Lutkefish三.问答题1. FASTA序列格式第一行以“>”开头但并没有指明是蛋白质还是核酸序列。