Stata软件在医学研究中的应用
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
" ! 6 7
" 标准差 肝炎患者血清转铁蛋白 含 量 均 数 为 !5 6 8E X! N 为 #5 " " 7E X$ 问 患 者 和 正 常 人 转 铁 蛋 白 含 量 是 否 有 N 差异？差值的 $ 8F 可信区间是多少？ 每例均观 ! 医院肿瘤科 6 年来共治疗 乳 腺 癌 患 者 " 6 "例! 其中单纯手 术 治 疗 组 观 察 4 存活8 察满 8 年 ! 7例! ?例! 存活率为 M 联合治疗% 手 术 Y 术 后 化 疗& 组观察 ?5 $F # 存活 6 存活率 为 4 两组存活率有无差 7 ?例! $例! 65 #F ! 别？ 次" & 与心脏 6 某医院测定 " ! 名正常成 年 男 子 的 心 率 % E ) * & 的 数 据 见 表 "$ 问 心 率 左心 室 电 机 械 收 缩 时 间 % E . % 次" & 与心脏左心室电机械收缩时间 % & 是否相关! E ) * E . 如何根据心率估计收缩时间？ 表 $!" ! 名正常成年男子的心率与左心室电机械收缩时间
!& 分析方法 较 为 全 面 $ 实 用# 常 用 的 统 计 分 析 方 法% 均可用
配对!检验及! 检 验 用 命 令 + , 完 成’先 输 入 数 据# & & = . & 治疗前用 " 疗后用 " !检验命令及结果如下 ’ # 表示 # " 表示 ’
基本统计分 析 方 法 $ 方差分析和协方 % & ’ & ’实现 ’ 内容包括 " 差分析 $ 线性回归 $ 广义 线 性 模 型$ 药 代 动 力 学 统 计 方 法$ 生 存分 析 $ 时 间 序 列 分 析$ 交叉分组时间序列分析( ’ * = > < ) $ 流行病学统 计 方 法 $ 调 查 资 料 的 分 析$ 正态性检验及 + ’ & ’ 变量变换 $ 非参数方 法 $ 聚 类 分 析$ 因 子 分 析 和 质 量 控 制 等# % & ’ & ’软件还包 含 了 ! #世纪? #年代后期新发展起来的方 如广义估计方 程 ( $ 混 合 效 应 模 型$ 二 水 平 模 型$ 药 法# @ A A) 代动力学 $ 非线性回归 $ ; , ) . . , * 回归和负二项 回 归 等 现 代 医 学统计学方法 # 几乎涵盖了医学研究中所用的绝大多 数 统 计 分析方法 ’ 此外 # 用户可以根据自己的需要 # 借助 % & ’ & ’提供的开发 程序 # 开发 非 线 性 最 小 二 乘 估 计 $ 极 大 似 然 估 计$ B , , & . & 9 ’ < 估计 $ / , * & = C D ’ 9 > , 模拟或其他要求的程序等 ’ 实例 "下面通过几个实例介绍 % 65 & ’ & ’软件的特点 ’
如果 ! 只知道 :" 均 数 和 标 准 差! L 两 样 本 的 样 本 含 量" 而不知道 原 始 数 据 ! 也可用 # $ 命 令 进 行 成 组! 检 验 % & & = . & ) 命令 # $ 后 M 个数字依 次 是 & 均数和 & & = . & ) : 样 本 的 样 本 含 量" 标准差 ’ 均数和标准差 % L 样本的样本含量 " 5 & & = . & ) ""5 8 ! " #!#5 7 ! " 4" 6!"5 # 4 7 M!#5 7 ! ! " !" ( 结果略 ) $ 或# $ 命令进行可信区间的估 % & ’ & ’可以方便地用 # 0 ) 0 ) ) 计! 下面两个例子分别是率和事件数的可信区间估计 %
%& 例 %! 配对!检验 ’ 资料来源 " 文献 ! 例 75 ?6 ’
作者单位 " ! " # # ! $ 南京医科大学公共卫生学院 流 行 与 卫 生 统 计 学系
万方数据
,6 4 M,
中华预防医学杂志 ! ! # # 6 年 $ 月第 6 ? 卷第 8 期 !D 1 ) *H; 9 = I/ = + % = & = E B = 9! # # 6!J , > 6 ?!K , 5 8 <
同时具有数 & ’ & ’软件是由 美 国 计 算 机 资 源 中 心 研 制 # !!% 据管理 $ 统计分析 $ 统计绘图 $ 矩阵运算和编程等功能 的 统 计
"# !& 分析 软 件 包 % # 适用于 ( $ ) * + , . / ’ 0 ) * & , . 1和 2 * ) 3操作
目前的最新版本是 45 系统 # #’ ( 程 序 容 量 较 小# 对计算机要求 "5 % & ’ & ’软件的 特 点 " ") 不高 # 适用面 广 # 操 作 简 单# 用 户 界 面 友 好 *( 数据管理功 !) 能强大 # 可以非常 方 便 地 在 各 软 件 之 间 交 换 数 据 *( 统计 6) 分析方法齐全 # 能 满 足 日 常 科 研 工 作 的 需 要 *( 计算结果 7) 输出形式简洁 # 与目 前 教 科 书 上 的 表 达 形 式 相 类 似 # 便于实 际工作者理解和在较短时间内掌握 *( 所绘统计图形非常 8) 精美 # 并可直接被图形处理软件 $ 图文并排软件 ( 如( ) 调 , 9 + 用 ’ 因此 # % & ’ & ’软件深受医学院校 学 生 和 临 床 医 生 的 青 睐 # 也是国际临床流行 病 学 网 络 推 荐 使 用 的 统 计 分 析 软 件 ’ 与 即输入一个命 % : %$ % ; % %软 件 不 同# % & ’ & ’软 件 是 命 令 式 的 # 计算机作一次运算 # 完成一项分析任务 ’ 令# !5 % & ’ & ’软件的主要统计分析方法 " % & ’ & ’中包含的统 计
!检验 ’
%& 例 &! 文献 ! 例 75 !检验 ’ 资料来源 " 46 ’
wk.baidu.com
命令与结果如下 "
+ , 完成 ’本例 # 将四格表的 7个数据按行输入 # 行间用 + , 隔 & ’ B ) "
! 开 ’逗号后加选择项0 # 分别指定输出 ! 检验结果和 1 )和 = 3 ’ 0 &
确切概率 ’% 划线部分为输入 # 下同) ’ & ’ & ’的命令如下( 输出结果简洁 # 明了 ’
结果中给出 了 直 线 回 归 方 程 及 其 方 差 分 析 " 回归系数 ( ) 及其假设检验和可信区间 " 决定系数 ( ) " 校 D , = O 5 P C . G ’ 9 = + Q 正决定 系 数 ( 等% 求 出 回 归 方 程 后! 可用 : + C % G ’ 9 = +) RP Q # $ 命令计 算 应 变 量 的 估 计 值 ! 用# 命令作散点 9 = + ) 0 & 9 ’ 1$ < N < 图或回归直线等 % 结果中给出了实际的观察数 ( ) 和期望事 = I = * & ., B . = 9 I = + ) " 件数 ( = I = * & .= 3 = 0 & = + > , C 9 ’ * T 的卡 方 0 1 ) !及其相应的概 < N 率( ) % ; 9 1 ) ! #0
测试题
对 " 某医生研究转铁蛋白对病 毒 性 肝 炎 诊 断 的 临 床 意 义 ! " ! 名正常人和 " 8 例病毒性肝炎患者血清转 铁 蛋 白 含 量 进行测量 ! 结果显示 ! " !名正常人的血清转铁蛋白含量 " 标 准 差 为 #5 " 均数为 !5 ? !E X! " #E X# " 8例病毒性 N N
万方数据
中华预防医学杂志 ! ! # # 6 年 $ 月第 6 ? 卷第 8 期 !D 1 ) *H; 9 = I/ = + % = & = E B = 9! # # 6!J , > 6 ?!K , 5 8 <
(6 4 ?(
从上述例子可以看到 ! 命令容易 % & ’ & ’是一 个 非 常 友 好 " 掌握 " 结果便于解释的 小 巧 玲 珑 的统计分析软件 # 更详细的 内容可以在U * & = 9 * = &网上$ % & ’ & ’网站 -5 . & ’ & ’ 5 0 , E 和中文网 站% 医学统计之星 1 % & & & & ’ 浏览 # & & ’ . 5 M & , ! 6 5 0 , E E = + . & ’ & . & ’ 9 < < 参
%& 例 $! 四格表的检验 ’ 资料来源 " 文献 ! 例 45 46 ’ ! 列联表 的 ! 检 验# 似然比检验及确切概率可用命令
结果 中 输 出 了 各 组 治 疗 前 $ 治疗后及差值的均数 ( ) $ 标准差( ) $ 标准误( ) 及均数的 E = ’ * % & + 5A 9 9 5 % & + 5A 9 9 5 ’ 给 出 了 配 对 样 本 均 数 的 双 侧! 检 $ 8F 可信区间 ( $ 8F# $) 验和两个方向的单侧检验结果 # 一目了然 ’ 在& 加选择项 G # 表示进行成组比较的 & = . &命令后 # * ’ ) 9 <
*+ 例 ’! 率的可信区间 % 资料来源 & 文献 ! 例 ?5 86 %
*+ 例 *! 生存分析 % 资料来源 & 文献 7 例 45 !7 %
首先 用 # $ 命令定义时间变量( ) 和截尾变量 . & . = & & ) E = ( ) ’ 用# $ 命令作 S 0 = * . , 9 . & . ’ > ’ * C / = ) = 9生存曲线 % < 命令 # $ 后的两个数字分别是总例数和阳性数 % 0 ) )
中华预防医学杂志 ! # # # 6 年 $ 月第 6 ? 卷第 8 期 !D 1 ) *H; 9 = I/ = + % = & = E B = 9! # # 6#J , > 6 ?#K , 5 8 <
!6 4 8!
! 医学研究统计方法应用 !
第十七讲 !! " # " #软件在医学研究中的应用
陈峰
心率 ? M " M 6 M M M ? M 4 M $ ? # ? 8 ? $ 4 6 4 M $ 次& ’8 E ) * 收缩 7 # 86 $ 66 $ ?7 # #6 4 #6 4 66 ? M6 4 !6 4 46 M M6 ? #6 7 8 时间 $ ’ E .
考
文
献
% & ’ & ’9 = O = 9 = * 0 =/ ’ * G ’ > . = &V , 9?5 #$ I , > G E = ." C 7’ W % & ’ & ’; 9 = . . 5 " $ $ $5 " C M " # W 陈峰主编 5 现代医学 统 计 方 法 与 % 中国统计出 & ’ & ’ 应 用 5北 京 % 版社 ! " $ $ $5 " C 8 # W 杨 树 勤 主 编5 卫 生 统 计 学W 第 6 版W 北 京 % 人 民 卫 生 出 版 社! " $ $ 65 4 6! 6 !! M ?! ? "! $ 4 W 陈峰5 医 用 多 元 统 计 分 析 方 法 5北 京 % 中 国 统 计 出 版 社! ! # # "5 " 6 8 C " 7 7 W
*+ 例 (! 事件数的可信区间 % 资料来源 & 文献 ! 例 ?5 86 %
命令 # $ 后的两 个 数 字 分 别 是 观 察 单 位 数 和 事 件 发 生 0 ) ) 数 % 结果中给出 了 暴 露 单 位 数 ( ) " 均数( " 标 = 3 , . G 9 = E = ’ *) < 准 误( ) 及其按 ; % & + 5 A 9 9 5 , ) . . , * 分布计算的确切的 $ 8F# $%
*+ 例 )! 直线回归 % 资料来源 & 文献 ! 例 " #5 "6 %
$ ( 简 % & ’ & ’中的直线 回 归 及 多 元 回 归 是 用 命 令 # 9 = 9 = . . N ) 进行的 % 命令后第 " 个变量是应变量 ! 第 ! 个变 量 记为 9 = N 为自变量 % 用# $ 命 令 进 行 生 存 曲 线 的 比 较! 可以选用 . & .& = . & > , 9 ’ * T和 ) > 0 , * , 3选择项分别进行> , C 9 ’ * T检验和 N N ( ) > 0 , * , 3 检验等 %
" 标准差 肝炎患者血清转铁蛋白 含 量 均 数 为 !5 6 8E X! N 为 #5 " " 7E X$ 问 患 者 和 正 常 人 转 铁 蛋 白 含 量 是 否 有 N 差异？差值的 $ 8F 可信区间是多少？ 每例均观 ! 医院肿瘤科 6 年来共治疗 乳 腺 癌 患 者 " 6 "例! 其中单纯手 术 治 疗 组 观 察 4 存活8 察满 8 年 ! 7例! ?例! 存活率为 M 联合治疗% 手 术 Y 术 后 化 疗& 组观察 ?5 $F # 存活 6 存活率 为 4 两组存活率有无差 7 ?例! $例! 65 #F ! 别？ 次" & 与心脏 6 某医院测定 " ! 名正常成 年 男 子 的 心 率 % E ) * & 的 数 据 见 表 "$ 问 心 率 左心 室 电 机 械 收 缩 时 间 % E . % 次" & 与心脏左心室电机械收缩时间 % & 是否相关! E ) * E . 如何根据心率估计收缩时间？ 表 $!" ! 名正常成年男子的心率与左心室电机械收缩时间
!& 分析方法 较 为 全 面 $ 实 用# 常 用 的 统 计 分 析 方 法% 均可用
配对!检验及! 检 验 用 命 令 + , 完 成’先 输 入 数 据# & & = . & 治疗前用 " 疗后用 " !检验命令及结果如下 ’ # 表示 # " 表示 ’
基本统计分 析 方 法 $ 方差分析和协方 % & ’ & ’实现 ’ 内容包括 " 差分析 $ 线性回归 $ 广义 线 性 模 型$ 药 代 动 力 学 统 计 方 法$ 生 存分 析 $ 时 间 序 列 分 析$ 交叉分组时间序列分析( ’ * = > < ) $ 流行病学统 计 方 法 $ 调 查 资 料 的 分 析$ 正态性检验及 + ’ & ’ 变量变换 $ 非参数方 法 $ 聚 类 分 析$ 因 子 分 析 和 质 量 控 制 等# % & ’ & ’软件还包 含 了 ! #世纪? #年代后期新发展起来的方 如广义估计方 程 ( $ 混 合 效 应 模 型$ 二 水 平 模 型$ 药 法# @ A A) 代动力学 $ 非线性回归 $ ; , ) . . , * 回归和负二项 回 归 等 现 代 医 学统计学方法 # 几乎涵盖了医学研究中所用的绝大多 数 统 计 分析方法 ’ 此外 # 用户可以根据自己的需要 # 借助 % & ’ & ’提供的开发 程序 # 开发 非 线 性 最 小 二 乘 估 计 $ 极 大 似 然 估 计$ B , , & . & 9 ’ < 估计 $ / , * & = C D ’ 9 > , 模拟或其他要求的程序等 ’ 实例 "下面通过几个实例介绍 % 65 & ’ & ’软件的特点 ’
如果 ! 只知道 :" 均 数 和 标 准 差! L 两 样 本 的 样 本 含 量" 而不知道 原 始 数 据 ! 也可用 # $ 命 令 进 行 成 组! 检 验 % & & = . & ) 命令 # $ 后 M 个数字依 次 是 & 均数和 & & = . & ) : 样 本 的 样 本 含 量" 标准差 ’ 均数和标准差 % L 样本的样本含量 " 5 & & = . & ) ""5 8 ! " #!#5 7 ! " 4" 6!"5 # 4 7 M!#5 7 ! ! " !" ( 结果略 ) $ 或# $ 命令进行可信区间的估 % & ’ & ’可以方便地用 # 0 ) 0 ) ) 计! 下面两个例子分别是率和事件数的可信区间估计 %
%& 例 %! 配对!检验 ’ 资料来源 " 文献 ! 例 75 ?6 ’
作者单位 " ! " # # ! $ 南京医科大学公共卫生学院 流 行 与 卫 生 统 计 学系
万方数据
,6 4 M,
中华预防医学杂志 ! ! # # 6 年 $ 月第 6 ? 卷第 8 期 !D 1 ) *H; 9 = I/ = + % = & = E B = 9! # # 6!J , > 6 ?!K , 5 8 <
同时具有数 & ’ & ’软件是由 美 国 计 算 机 资 源 中 心 研 制 # !!% 据管理 $ 统计分析 $ 统计绘图 $ 矩阵运算和编程等功能 的 统 计
"# !& 分析 软 件 包 % # 适用于 ( $ ) * + , . / ’ 0 ) * & , . 1和 2 * ) 3操作
目前的最新版本是 45 系统 # #’ ( 程 序 容 量 较 小# 对计算机要求 "5 % & ’ & ’软件的 特 点 " ") 不高 # 适用面 广 # 操 作 简 单# 用 户 界 面 友 好 *( 数据管理功 !) 能强大 # 可以非常 方 便 地 在 各 软 件 之 间 交 换 数 据 *( 统计 6) 分析方法齐全 # 能 满 足 日 常 科 研 工 作 的 需 要 *( 计算结果 7) 输出形式简洁 # 与目 前 教 科 书 上 的 表 达 形 式 相 类 似 # 便于实 际工作者理解和在较短时间内掌握 *( 所绘统计图形非常 8) 精美 # 并可直接被图形处理软件 $ 图文并排软件 ( 如( ) 调 , 9 + 用 ’ 因此 # % & ’ & ’软件深受医学院校 学 生 和 临 床 医 生 的 青 睐 # 也是国际临床流行 病 学 网 络 推 荐 使 用 的 统 计 分 析 软 件 ’ 与 即输入一个命 % : %$ % ; % %软 件 不 同# % & ’ & ’软 件 是 命 令 式 的 # 计算机作一次运算 # 完成一项分析任务 ’ 令# !5 % & ’ & ’软件的主要统计分析方法 " % & ’ & ’中包含的统 计
!检验 ’
%& 例 &! 文献 ! 例 75 !检验 ’ 资料来源 " 46 ’
wk.baidu.com
命令与结果如下 "
+ , 完成 ’本例 # 将四格表的 7个数据按行输入 # 行间用 + , 隔 & ’ B ) "
! 开 ’逗号后加选择项0 # 分别指定输出 ! 检验结果和 1 )和 = 3 ’ 0 &
确切概率 ’% 划线部分为输入 # 下同) ’ & ’ & ’的命令如下( 输出结果简洁 # 明了 ’
结果中给出 了 直 线 回 归 方 程 及 其 方 差 分 析 " 回归系数 ( ) 及其假设检验和可信区间 " 决定系数 ( ) " 校 D , = O 5 P C . G ’ 9 = + Q 正决定 系 数 ( 等% 求 出 回 归 方 程 后! 可用 : + C % G ’ 9 = +) RP Q # $ 命令计 算 应 变 量 的 估 计 值 ! 用# 命令作散点 9 = + ) 0 & 9 ’ 1$ < N < 图或回归直线等 % 结果中给出了实际的观察数 ( ) 和期望事 = I = * & ., B . = 9 I = + ) " 件数 ( = I = * & .= 3 = 0 & = + > , C 9 ’ * T 的卡 方 0 1 ) !及其相应的概 < N 率( ) % ; 9 1 ) ! #0
测试题
对 " 某医生研究转铁蛋白对病 毒 性 肝 炎 诊 断 的 临 床 意 义 ! " ! 名正常人和 " 8 例病毒性肝炎患者血清转 铁 蛋 白 含 量 进行测量 ! 结果显示 ! " !名正常人的血清转铁蛋白含量 " 标 准 差 为 #5 " 均数为 !5 ? !E X! " #E X# " 8例病毒性 N N
万方数据
中华预防医学杂志 ! ! # # 6 年 $ 月第 6 ? 卷第 8 期 !D 1 ) *H; 9 = I/ = + % = & = E B = 9! # # 6!J , > 6 ?!K , 5 8 <
(6 4 ?(
从上述例子可以看到 ! 命令容易 % & ’ & ’是一 个 非 常 友 好 " 掌握 " 结果便于解释的 小 巧 玲 珑 的统计分析软件 # 更详细的 内容可以在U * & = 9 * = &网上$ % & ’ & ’网站 -5 . & ’ & ’ 5 0 , E 和中文网 站% 医学统计之星 1 % & & & & ’ 浏览 # & & ’ . 5 M & , ! 6 5 0 , E E = + . & ’ & . & ’ 9 < < 参
%& 例 $! 四格表的检验 ’ 资料来源 " 文献 ! 例 45 46 ’ ! 列联表 的 ! 检 验# 似然比检验及确切概率可用命令
结果 中 输 出 了 各 组 治 疗 前 $ 治疗后及差值的均数 ( ) $ 标准差( ) $ 标准误( ) 及均数的 E = ’ * % & + 5A 9 9 5 % & + 5A 9 9 5 ’ 给 出 了 配 对 样 本 均 数 的 双 侧! 检 $ 8F 可信区间 ( $ 8F# $) 验和两个方向的单侧检验结果 # 一目了然 ’ 在& 加选择项 G # 表示进行成组比较的 & = . &命令后 # * ’ ) 9 <
*+ 例 ’! 率的可信区间 % 资料来源 & 文献 ! 例 ?5 86 %
*+ 例 *! 生存分析 % 资料来源 & 文献 7 例 45 !7 %
首先 用 # $ 命令定义时间变量( ) 和截尾变量 . & . = & & ) E = ( ) ’ 用# $ 命令作 S 0 = * . , 9 . & . ’ > ’ * C / = ) = 9生存曲线 % < 命令 # $ 后的两个数字分别是总例数和阳性数 % 0 ) )
中华预防医学杂志 ! # # # 6 年 $ 月第 6 ? 卷第 8 期 !D 1 ) *H; 9 = I/ = + % = & = E B = 9! # # 6#J , > 6 ?#K , 5 8 <
!6 4 8!
! 医学研究统计方法应用 !
第十七讲 !! " # " #软件在医学研究中的应用
陈峰
心率 ? M " M 6 M M M ? M 4 M $ ? # ? 8 ? $ 4 6 4 M $ 次& ’8 E ) * 收缩 7 # 86 $ 66 $ ?7 # #6 4 #6 4 66 ? M6 4 !6 4 46 M M6 ? #6 7 8 时间 $ ’ E .
考
文
献
% & ’ & ’9 = O = 9 = * 0 =/ ’ * G ’ > . = &V , 9?5 #$ I , > G E = ." C 7’ W % & ’ & ’; 9 = . . 5 " $ $ $5 " C M " # W 陈峰主编 5 现代医学 统 计 方 法 与 % 中国统计出 & ’ & ’ 应 用 5北 京 % 版社 ! " $ $ $5 " C 8 # W 杨 树 勤 主 编5 卫 生 统 计 学W 第 6 版W 北 京 % 人 民 卫 生 出 版 社! " $ $ 65 4 6! 6 !! M ?! ? "! $ 4 W 陈峰5 医 用 多 元 统 计 分 析 方 法 5北 京 % 中 国 统 计 出 版 社! ! # # "5 " 6 8 C " 7 7 W
*+ 例 (! 事件数的可信区间 % 资料来源 & 文献 ! 例 ?5 86 %
命令 # $ 后的两 个 数 字 分 别 是 观 察 单 位 数 和 事 件 发 生 0 ) ) 数 % 结果中给出 了 暴 露 单 位 数 ( ) " 均数( " 标 = 3 , . G 9 = E = ’ *) < 准 误( ) 及其按 ; % & + 5 A 9 9 5 , ) . . , * 分布计算的确切的 $ 8F# $%
*+ 例 )! 直线回归 % 资料来源 & 文献 ! 例 " #5 "6 %
$ ( 简 % & ’ & ’中的直线 回 归 及 多 元 回 归 是 用 命 令 # 9 = 9 = . . N ) 进行的 % 命令后第 " 个变量是应变量 ! 第 ! 个变 量 记为 9 = N 为自变量 % 用# $ 命 令 进 行 生 存 曲 线 的 比 较! 可以选用 . & .& = . & > , 9 ’ * T和 ) > 0 , * , 3选择项分别进行> , C 9 ’ * T检验和 N N ( ) > 0 , * , 3 检验等 %