8.基因组医学的实验应用及展望
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杂合子筛查/携带者筛查（heterozygote screening） 自身不发病、可能会传给下一代
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
The 1000 genome project（国际千人基因组计划） 探索人类健康和疾病的遗传多样性
通过NGS鉴定疾病致病基因
1.连锁分析 基于家系的研究方法，通过研究遗传标记来确定其与疾病基因的连锁关系。 可以定位疾病基因的染色体位置
2.关联分析 基于群体的研究方法，通过比较人群中患者与正常个体之间的一个或一组特异的等位基因频率的差异，以便寻 找复杂疾病的基因而非孟德尔遗传病的基因。 可以确定与疾病相关联的等位基因 1.病例-对照研究（case-control studies）2.cross-sectional or cohort studies（现状研究或队列研究）
Pathogenic variants（病理性变异）/mutant 1.Missense mutation 2.Nonsense mutation：提前终止nonsense-mediated mRNA decay (NMD)：并非所有的无义突变都能产生NMD 3.Mutation affect splicing：外显子跳读 4.Frameshifts mutation移码突变 5.Pathogenic microsatellite variants—Dynamic mutations动态突变
多态性和遗传性变异在人类和医学遗传学中的应用 1.连锁分析 2.产前DNA诊断、血库和移植组织的配型 3.法医鉴定 4.确定复杂疾病的易感性或抵抗风险、药物基因组学—个性化医疗
人与人的不同 SNP：非常好的遗传标记，遗传非常稳定，符合孟德尔遗传，自然突变率极低——GWAS
Microsatellite Polymorphism（微卫星多态性） STRP (Short Tandem Repeat Polymorphisms): 短串联重复序列多态性。是以2,3,4个（如 TGTGTG、CAACAACAA、 AAATAAATAAAT ）核苷酸为单元重复的DNA片段，一般重复一次至数十次。 应用：DNA指纹
3.基因组测序
用于疾病致病基因鉴定的有用数据库 1.OMIM 2.ClinGen 3.ClinVar 4.HGMD
Genome-Wide Association Studies （GWAS, 全基因组关联研究） 从人类全基因组范围内的DNA序列变异（即SNP）中，筛检出那些与疾病性状关联的SNP
HapMap（单体型图）：GWAS的基础 MAF：一个SNP在群体中所出现的最小频率≥5%
Genetic Screening in Populations (群体遗传筛查) 遗传筛查是在群体水平上进行的筛 查，即从某个人群中鉴定出某种遗传病易感性增高的个体的方法。
Personalized Health Care 个性化医疗是指以个体的基因组信息为基础，结合蛋白质组、代谢组等 相关信息，为患者制定最佳的治疗方案， 以取得最佳治疗效果和最小不 良反应的个人定制式医疗实践。
八、基因组医学的实验应用及展望
人类基因组计划（human genome project，HGP）
人类基因变异（human genetic variants） Wild-type Variant：遗传性变异 Mutant：往往是病理性的
基因多态性（genetic polymorphism） 群体中某个基因座存在2个或多个 等位基因形式而造成的同种DNA分子的多样性，是单一基因座等位基因变异性 在群体水平的体现
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
The 1000 genome project（国际千人基因组计划） 探索人类健康和疾病的遗传多样性
通过NGS鉴定疾病致病基因
1.连锁分析 基于家系的研究方法，通过研究遗传标记来确定其与疾病基因的连锁关系。 可以定位疾病基因的染色体位置
2.关联分析 基于群体的研究方法，通过比较人群中患者与正常个体之间的一个或一组特异的等位基因频率的差异，以便寻 找复杂疾病的基因而非孟德尔遗传病的基因。 可以确定与疾病相关联的等位基因 1.病例-对照研究（case-control studies）2.cross-sectional or cohort studies（现状研究或队列研究）
Pathogenic variants（病理性变异）/mutant 1.Missense mutation 2.Nonsense mutation：提前终止nonsense-mediated mRNA decay (NMD)：并非所有的无义突变都能产生NMD 3.Mutation affect splicing：外显子跳读 4.Frameshifts mutation移码突变 5.Pathogenic microsatellite variants—Dynamic mutations动态突变
多态性和遗传性变异在人类和医学遗传学中的应用 1.连锁分析 2.产前DNA诊断、血库和移植组织的配型 3.法医鉴定 4.确定复杂疾病的易感性或抵抗风险、药物基因组学—个性化医疗
人与人的不同 SNP：非常好的遗传标记，遗传非常稳定，符合孟德尔遗传，自然突变率极低——GWAS
Microsatellite Polymorphism（微卫星多态性） STRP (Short Tandem Repeat Polymorphisms): 短串联重复序列多态性。是以2,3,4个（如 TGTGTG、CAACAACAA、 AAATAAATAAAT ）核苷酸为单元重复的DNA片段，一般重复一次至数十次。 应用：DNA指纹
3.基因组测序
用于疾病致病基因鉴定的有用数据库 1.OMIM 2.ClinGen 3.ClinVar 4.HGMD
Genome-Wide Association Studies （GWAS, 全基因组关联研究） 从人类全基因组范围内的DNA序列变异（即SNP）中，筛检出那些与疾病性状关联的SNP
HapMap（单体型图）：GWAS的基础 MAF：一个SNP在群体中所出现的最小频率≥5%
Genetic Screening in Populations (群体遗传筛查) 遗传筛查是在群体水平上进行的筛 查，即从某个人群中鉴定出某种遗传病易感性增高的个体的方法。
Personalized Health Care 个性化医疗是指以个体的基因组信息为基础，结合蛋白质组、代谢组等 相关信息，为患者制定最佳的治疗方案， 以取得最佳治疗效果和最小不 良反应的个人定制式医疗实践。
八、基因组医学的实验应用及展望
人类基因组计划（human genome project，HGP）
人类基因变异（human genetic variants） Wild-type Variant：遗传性变异 Mutant：往往是病理性的
基因多态性（genetic polymorphism） 群体中某个基因座存在2个或多个 等位基因形式而造成的同种DNA分子的多样性，是单一基因座等位基因变异性 在群体水平的体现