PCR方法在性病检测中的应用
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4 .扩增产物的灭活:工作前后或发现污染可 能时应及进行消毒清洁和紫外线灭活DNA。其 次对扩增产物用酶灭活,光化学灭活,稀盐酸 浸泡等处理清洁实验室及废弃物,力求减少污 染。
性病是一个特殊的医学领域,是社会性很 强的一组传染病,患者具有特殊的社会背 景和心理状态。性病诊断及到个人声誉、 夫妻感情和家庭和睦,因此性病诊断应该 十分慎重。性病实验方法的选择和实验结 果,对临床诊断有着十分重要的作用,否 则将导致误诊误治,甚至乱诊乱治。近几 年来,国内由于某种商业行为造成滥用 PCR对性病诊断的教训,是值得深思的。
由于PCR等对基因检测的高敏感性,近 几年来,国内外的实践说明,实验过程 中的带转污染造成的假阳性率甚高,临 床标本的成分或在标本采集、运送和处 理过程中介入外源性干扰物抑制了扩增 所造成的假阴性也是常见的,因此实验 条件要求十分严格,需在以下几个方面 不断完善和控制:
1 .实验室设置:应有 3~4 间严格封闭独立的 PCR 前区、 PCR 后区和检测区,各区内衣、物 和实验用具等互不交换;日常工作流程:工作 人员先后顺序由前区进入后区,再进入检测区, 不能逆转,检测区DNA污染最严重,应尽量远 离的两区。试剂制备和标本处理应在生物安全 箱(超净台)内进行。
现将国内外基因检测在性传播疾病实 验诊断的进展情况介绍如下:
PCR的基本原理是在模板DNA、引物和4种脱氧核 糖核苷酸存在的条件下依赖于DNA聚合酶的酶促 合成反应。PCR技术的特异性取决于引物和模板 DNA结合的特异性。反应分三步:
①变性(denaturation),通过加热使DNA双螺旋的 氢 键 断 裂 , 双 链 解 离 形 成 单 链 DNA 。 ② 退 火 ( annealling ) , 当温度突然降低时由于模板分子 结构较引物复杂的多,而且反应体系中引物DNA量 大大多于模板DNA,使引物和其互补的模板在局部 形成杂交链,而模板DNA双链之间互补的机会较少。 ③延伸( extension ),在 DNA 聚合酶、4 种脱氧糖 核苷三磷酸底物及 Mg++ 存在的条件下,5’→3’的聚 合酶催化以引物为起始点的DNA链延伸反应,以上 三步为一个循环,每一个循环为下一循环的模板。 数小时之后,介于两个引物之间的特异性DNA片段 得到了大量复制,数量可达2×106拷贝。
PCR法用于临床诊断的瑕瑜互见。它的优点敏感性 高,不需放射性核素标记,以检测不能培养的病原 体。但是,它所需的仪器设备和试剂在一般实验室 尚不能配备。更重要的是,实验过程中有可能因外 界污染而出现假阳性结果。因此,严格无菌操作、 选用高纯度试剂及设制对照是保证试验成功的必要 条件。
1.沙发衣原体的PCR检测 PCR法诊断泌尿生殖道沙眼衣原体感染的敏感性高 ,有时在细胞培养阴性者也能检测出沙眼衣原体感 染。在一项比较研究中,PCR、培养和Gen-probe 的敏感性分别是95%、86%和65%。另一项研究中 PCR特异性达到100%。一种PCR(以不同的质粒 DNA顺序为引物)证实,说明可能并非是PCR的 假阳性结果。然而,也有报告由于累积性污染而造 成PCR阳性,或因标本中含有抑制衣原体生长的物 质或衣原体失活而致培养假阴性。因此,PCR的结 果还应该结合临床病史和治疗情况进行分析,必要 时重复取材或在另一部位取材作试验。
2 .各种类型标本的采集、储存、运送以 及实验前的妥善处理,以减少污染、排除 抑制剂和干扰物,必须不断探讨。
3 .实验过程需有严格的质量控制与对照:通 常需设置阳性对照(低水平阳性对照),阴性 对照(不含靶核酸),所有反应试验,应每15 个反应管设一个阴性对照;扩增和抑制物对照, 双份标本,其中一份加入靶DNA和引物;内对 照:同源内对照,异源内对照。
1996年底,在广东召开的全国性病学术交流会上, 有关专家强烈呼吁:在目前条件下,不要滥用 PCR作性病诊断,并规定不准用PCR实验结果报 病。1998年4月15日卫生部卫医发[1998]第9号文 件,发出,《关于暂停临床基因扩增(PCR)检 验的通知》,明确规定“各医疗机构不得使用未 经正式批准的试剂且不得以任何形式向患者收取 费用”。目前多数医疗单位已停用PCR检查性病, 并正探索按国际NCCLS分子诊断方法使用规则进 行PCR质量控制,完善实验条件,提高准确性。
PCR法还可用于检测其他类型的沙眼衣原体感染。 如沙眼,用直接免疫荧光法检查一组儿童,阳性率 为 22%,而 PCR 为 48% 。也有报道用 PCR 法检测精 液、Байду номын сангаас性附睾炎或Reiter病中的沙眼衣原体感染。 沙 眼 衣 原 体 PCR 法 已 有 商 品 化 试 剂 盒 ( Amplicor,Roche Molecular Syetems)。此法扩增位 于衣原体隐蔽性质粒中的 DNA 序列,扩增片段大 不上为207个碱基对。这个试剂盒检测泌尿生殖道 沙眼衣原体感染的敏感性达78.8%/~98.6%,特异性 达99.7%~100%。
PCR方法在性病检测中的应用
性病实验室涉及许多学科:主 要技术为:1.镜检 NG,滴虫等 2.培养 NG UU 3. 血清学 SY 4. 酶免疫学检查 CT HSV HIV 5. 分子诊断技术 各种性病病原 体
利用基因检测方法对各种传染病进行病原学诊 断,是近年来的主要进展之一。它的优点是极 大地提高了检测的敏感性。比如,在检测标本 中只有一个基因拷贝存在时也可以用聚合酶链 反应(PCR)或连接酥链反应(LCR)检测出 来。其次,分子生物学方法可以诊断那些培养 困难的病原微生物,如HPV感染。此外,它还 可以用来进行流行病学,发病机理及药物治病 监测的研究等。
4.HPV感染的PCR检测 PCR检测HPV感染具有快速、方便、高度敏感和高 度特异的优点。它的敏感性比现有的诊断方法要高 1000倍。采用通引物可以一次检测多种型别的 HPV 。而选择特定型别的特异部位合成引物,扩增后可 直接区分型别或亚型。它在诊断HPV感染和致癌研 究中有着广阔的应用前景。