磷酸化蛋白之western_blot检测操作细节和注意事项
免疫印迹实验注意事项
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免疫印迹实验注意事项一、实验概述免疫印迹(Western blot)是一种重要的蛋白质检测技术,在生物医学研究中被广泛应用。
该实验通过将蛋白质样品经电泳分离,并将其转移到膜上,最终使用特异性抗体探测目标蛋白质。
然而,为了确保实验结果的准确性和可靠性,实验过程中需要注意以下事项。
二、实验仪器和试剂准备在进行免疫印迹实验之前,需要准备合适的仪器和试剂。
以下是一些注意事项:1. 仪器准备•确保电泳仪、转印仪和成像仪等仪器的功能正常,并进行必要的校准和测试。
•清洁仪器,避免污染和干扰实验结果。
2. 试剂准备•使用优质的试剂,并根据说明书正确配制试剂溶液。
•为避免批次差异,建议每次实验使用同一批试剂。
•试剂保存在适当的温度和条件下,以保证其稳定性。
3. 溶液准备•使用无菌、纯净的水和试剂配制实验所需的溶液。
•确保溶液的 pH 值正确,并进行必要的调整。
•溶液保存在适当的温度和条件下,避免污染和变质。
三、实验操作注意事项在进行免疫印迹实验时,需要注意以下操作事项:1. 样品处理•样品的制备和处理应严格按照实验要求进行,以确保样品的完整性和稳定性。
•样品处理过程中应尽量避免使用可能影响蛋白质结构和功能的试剂和条件。
2. 蛋白质的电泳分离•样品电泳前,必须对电泳胶进行适当的处理和准备,确保其质量和性能。
•样品电泳条件的选择要考虑样品性质和目标蛋白质的分子量等因素。
•电泳过程中,要严格控制电流和电压,避免产生异常结果。
3. 转膜过程•使用合适的滤纸和膜材料,并按照正确的方法和条件进行转膜操作。
•转膜时间和电压的选择要根据蛋白质的分子量和转膜效率进行调整。
4. 抗体探测和成像•使用具有较高亲和力和特异性的抗体进行探测,以提高结果的准确性和可靠性。
•抗体的浓度和反应时间应根据需要进行调整,避免产生过度或不足的信号。
•成像过程中,要确保暗室环境的光线充足、胶片或成像仪的参数设置正确。
5. 数据分析和结果解读•在进行数据分析和结果解读时,应使用合适的软件和方法,确保结果的准确性和可靠性。
蛋白印迹——western-blot-实验流程及注意事项
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蛋白印迹——Western blot实验流程及注意事项各种凝胶电泳方法可以直接了解蛋白的某些性质如迁移率、电荷、大小、丰度以至蛋白的亲疏水性等。
此外,特异染色方法可用于识别不同种类的蛋白质。
Western blot技术大大扩展了凝胶电泳后识别和鉴定蛋白的可能性。
这一技术首先将电泳分离后的蛋白质条带或斑点从凝胶介质转移到固相支持膜上,然后用特异性配体进行检测。
特异性抗体和凝集素等已被广泛应用检测印迹膜上的蛋白。
印迹技术还常常作为电泳分离后用化学方法(如蛋白氨基端序列分析等)鉴定蛋白的一个重要步骤。
一、聚丙烯酰胺凝胶电泳(Polyacrylamide gel electrophoresis, PAGE或SDS-PAGE)聚丙烯酰胺凝胶电泳简称为PAGE(Polyacrylamide gel electrophoresis),是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的一种常用电泳技术。
聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺聚合而成,聚合过程由自由基催化完成。
催化聚合的常用方法有两种:化学聚合法和光聚合法。
化学聚合以过硫酸铵(AP)为催化剂,以四甲基乙二胺(TEMED)为加速剂。
在聚合过程中,TEMED催化过硫酸铵产生自由基,后者引发丙烯酰胺单体聚合,同时甲叉双丙烯酰胺与丙烯酰胺链间产生甲叉键交联,从而形成三维网状结构。
PAGE根据其有无浓缩效应,分为连续系统和不连续系统两大类,连续系统电泳体系中缓冲液pH值及凝胶浓度相同,带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷和分子筛效应。
不连续系统中由于缓冲液离子成分,pH,凝胶浓度及电位梯度的不连续性,带电颗粒在电场中泳动不仅有电荷效应,分子筛效应,还具有浓缩效应,因而其分离条带清晰度及分辨率均较前者佳。
不连续体系由电极缓冲液、浓缩胶及分离胶所组成。
浓缩胶是由AP催化聚合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为pH6.7的Tris-HCL。
分离胶是由AP催化聚合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为pH8.9 Tris-HCL。
磷酸化蛋白之westernblot检测操作细节和注意事项
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磷酸化蛋白之western blot检测操作细节和注意事项1.一定要在lysis buffer中加入蛋白酶抑制剂(配方见后页),还要加入一定量的磷酸酶抑制剂,否则即使band压出来也会很浅,结果也不可信。
2.加一抗后最好4度过夜,保证抗体有充分的结合时间。
因为磷酸化的蛋白只占总的蛋白量的极少部分。
4度也可使一抗重复使用多次(站长注:可加入防腐剂,如叠氮钠,Proclin TM 等,保存时间更长)。
毕竟磷酸化的抗体都挺贵的。
二抗则室温1小时即可。
3.磷酸化抗体的好坏是一个关键因素,所以要选择好的厂商。
个人认为,Cell signaling公司做的磷酸化抗体不错,尤其是MAPKs磷酸化抗体4.最好根据厂商的protocol来操作实验,这是实验成功的保证。
如Cell signaling会建议用含5%BSA的TBST稀释phospho-p38等抗体,效果不错,而不是用常见的含5%non-fat milk的TBST。
5.抗体的稀释倍数也要适当。
不同厂商也会有不同要求。
6.研究完某一蛋白的磷酸化情况后最好也要研究一下该蛋白总的表达量。
如压完phospho-p38抗体后,我会把相同的membrane做strip后再压p38,然后再strip一次,再压内标acti n。
7.做磷酸化蛋白WB时,除了目标蛋白的band以外,往往会出现非特异性的band.磷酸化抗体不好的话,甚至会压出非特异性的band,而没有你想要的band,所以压片以后,你一定要根据markers比对一下,你压出的band分子量是否正确.我以前压WB时,压出了一条band,就以为是我想要的那条,然后还根据趋势推测可能的机制,走了不少怨枉路.还有一次,把markers 的分子量记错了,比对出来的结果当然也不对.8.磷酸化蛋白WB时backgroud也往往较深,所以压片时间要适当,不能太长或过短,太长则backgroud太深盖住想要的那条band,时间过短则可能没有band或者band太浅.9.磷酸化蛋白WB时,用TBST洗时也要注意一下,摇床的转速不要太快,洗的时间不要太长,孵育一抗和二抗之后分别洗5min 3次即可,宁愿background深一些,总比做不出来强得多.另外,洗的时候,最好不要把几张membrane叠在一起洗。
WesternBlot(WB)操作中需要注意事项与结果不理想可能的原因自查
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WesternBlot(WB)操作中需要注意事项与结果不理想可能的原因自查Western Blot(WB)操作中需要注意事项与结果不理想可能的原因自查第一部分 WB操作中需要注意事项一、蛋白样品的准备1、样品质量所抽取样品的蛋白含量,蛋白变性是否充分等等,还有,蛋白样品的PH值是否在7~8之间。
这会直接影响到样品浓缩的效果。
此外,蛋白样品是否降解、目的蛋白是否已抽取充分都会对最终结果的可靠性有影响。
2、细胞水平要做WB,多少细胞提的蛋白够做WB一般5×106就足够3、小分子量蛋白10KD需要的注意点1)可选择孔径0.22um的PVDF膜或者NC膜,转膜时间缩短,另外可采用Tricine-SDS-PAGE 体系2)也可以选择PSQ膜,同时缩短转移时间。
也可以将两张膜叠在一起,再转移。
其他按步骤即可4、大分子量蛋白200KD需要的注意点1)做200kd蛋白的WB时要注意,分离胶最好选择>7%的;剥胶时要小心2)转移时间需要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析)3)转膜液中甲醇含量可适当降低,推荐使用湿装转膜效率更高二、制胶1、凝胶质量不连续SDS-PAGE胶对凝胶的要求较高,分离胶的PH值应在8.8左右,而浓缩胶的PH应在6.8左右,最好不要差过0.5个PH单位,因为这个PH条件是保证电泳液中的甘氨酸不电离的必要条件,也是保证能充分压缩样品的前提。
因此,制备凝胶的时候所用Tris-HCl缓冲液的PH值是否稳定是很重要的。
2、在用ddH2O压分离胶的时候为什么经常存在中间凸的现象1)加水时不能对着胶冲,要沿着玻璃板缓慢流行2)加水满后一定要保证上方水平面是平齐的3)加胶要避免气泡,也要避免加胶太慢而提前凝固等现象4)有其他人的经验是用异丙醇封胶封胶后左右晃一下三、加样1、点样样品尽量不要与电泳液混合,这样能提高浓缩的效果,因为电泳液PH值为8.3,而样品为7.5,混合后会影响到样品的PH值,进而影响浓缩效果。
western blot检测蛋白质的表达实验的结论和注意事项
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Western blot检测蛋白质的表达实验的结论通常包括以下几个方面:
1. 蛋白质的表达水平:通过比较目标蛋白质与内参蛋白质的信号强度,可以得出目标蛋白质在样本中的表达水平。
2. 蛋白质的分子量:通过比较标准蛋白的分子量和目标蛋白质的分子量,可以确定目标蛋白质的分子量。
3. 蛋白质的特异性:通过比较阳性对照和阴性对照的信号强度,可以确定目标蛋白质的特异性。
在Western blot检测蛋白质的表达实验中,需要注意以下事项:
1. 样本制备:确保样本的质量和数量,避免样本降解或污染。
2. 抗体选择:选择特异性好、灵敏度高的抗体,避免出现非特异性反应。
3. 实验条件:保持实验条件的稳定和一致性,避免影响实验结果的可重复性。
4. 数据分析:对实验数据进行准确的分析和解释,避免误导实验结果。
总之,Western blot检测蛋白质的表达实验是一种常用的生物化学技术,可以用于研究蛋白质的表达、功能和相互作用等方面。
在实
验中需要注意细节和规范操作,以确保实验结果的准确性和可靠性。
试述western blot技术的原理、方法、注意事项及其在医学科研中的应用。
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试述western blot技术的原理、方法、注意事项及其在医学科研中的应用。
1. 引言1.1 概述Western blot技术是一种常用的分子生物学实验方法,用于检测、定量和分析特定蛋白质在复杂混合物中的表达和相互作用。
它具有高灵敏度、高特异性和较为准确的测量能力,因此在医学科研领域中得到广泛应用。
1.2 文章结构本文将详细介绍Western blot技术的原理、方法、注意事项以及在医学科研中的应用。
首先,我们将阐述免疫检测原理、蛋白质分离与转移原理以及免疫染色与检测原理,帮助读者全面了解该技术的基本原理。
其次,我们将描述样品制备与电泳条件设置、蛋白质转移与固定方法以及免疫染色及可视化方法,为读者提供详细的实验步骤。
随后,我们将介绍实验室操作要求及安全措施、样品处理和保存注意事项以及技术参数调整和结果解读注意事项,以保证实验的准确性和可重复性。
最后,在医学科研领域中的应用方面,我们将以蛋白质表达水平检测、蛋白质亚细胞定位分析以及蛋白质相互作用和功能分析为例,展示Western blot技术在疾病诊断和药物研发等方面的重要应用。
1.3 目的本文的目的是为读者提供对Western blot技术全面了解,并指导其在医学科研中正确应用该技术。
通过详细介绍该技术的原理、方法和注意事项,读者将能够准确地进行实验操作并正确解读结果,同时也能够认识到其在医学科研中的重要性和广泛应用价值。
2. Western blot技术原理2.1 免疫检测原理Western blot技术是一种常用于检测特定蛋白质的免疫学方法。
它基于抗原与抗体的特异性结合关系,通过将蛋白质溶液经过电泳分离、转移到固体载体上,并使用特异性抗体识别目标蛋白质,从而实现对目标蛋白质的定性和定量检测。
在Western blot中,首先需要将待检测的蛋白样品进行SDS-PAGE电泳分离。
然后,通过将蛋白质转移到聚丙烯酰胺凝胶或其他固体载体上,在固相载体上形成一个被称为“Western blotting”的蛋白质模式。
western blot检测蛋白质的表达实验的结论和注意事项
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western blot检测蛋白质的表达实验的结论和注意事项Western blot(免疫印迹)是一种常用的实验技术,用于检测蛋白质的表达水平和鉴定特定的蛋白质。
下面将分别介绍Western blot的实验结论和注意事项。
实验结论:通过Western blot实验可以得出以下结论:1. 确定蛋白质的表达水平:Western blot可以定量检测特定蛋白质在样本中的表达水平,比如癌细胞中的肿瘤抑制因子的表达水平是否下调,通过和对照组的比较可以得出结论。
2. 确定蛋白质的鉴定:Western blot可以用于鉴定特定蛋白质的存在与否,通过与已知目标蛋白的分子量进行比较,可以确定其身份。
3. 确定蛋白质的修饰状态:一些蛋白质在翻译后会发生修饰,如磷酸化、糖基化等,这些修饰状态可能会影响蛋白质的功能。
通过Western blot可以检测修饰状态,并进一步探究其功能。
注意事项:在进行Western blot实验时,有一些注意事项需要遵守,以保证实验的准确性和可靠性:1. 样品制备:样品的制备至关重要,要确保样品蛋白质的完整性和稳定性。
使用磷酸化酶抑制剂、蛋白酶抑制剂等,避免蛋白质在制备过程中被降解。
2. 蛋白质的分离:Western blot一般需要将蛋白质进行SDS-PAGE电泳,要注意合理选择电泳条件和胶液浓度,以达到最佳的蛋白质分离效果。
同时还需要确保样品装载均匀,可与内参蛋白进行标准化。
3. 转膜条件:Western blot的关键步骤是将分离的蛋白质迁移到聚丙烯酰胺薄膜。
转膜条件包括电流、时间和转膜缓冲液的配方,需要根据蛋白质的大小和性质进行优化,以确保迁移的效率和完整性。
4. 主抗体选择:选择适当的主抗体对目标蛋白进行检测,主抗体的产地、克隆型和浓度都会影响实验结果。
需要进行充分的文献调研和优化,以保证实验的准确性和特异性。
5. 二级抗体选择:Western blot实验中一般需要使用带有酶标记物(如HRP)的二级抗体来检测主抗体与蛋白质结合情况。
westernblot实验步骤
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westernblot实验步骤Western blot实验是一种常用的免疫学检测方法,适用于分析特定蛋白质的存在量、大小和结构等。
下面将介绍Western blot实验的主要步骤,以及注意事项。
1. SDS-PAGE凝胶电泳Western blot实验首先需要进行SDS-PAGE凝胶电泳。
SDS-PAGE (Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)是一种分离蛋白质的方法,可以根据蛋白质的大小将其分离离子定位在凝胶中相应的位置。
在SDS-PAGE中,蛋白质会被特定化学物质SDS (十二烷基硫酸钠)包裹,其带负电荷的端口相互排斥,并使蛋白质在电场中沿着凝胶运行,根据大小排序在不同位置。
2.转移蛋白质到膜上SDS-PAGE电泳完毕后,需要将蛋白质迁移到聚丙烯腈或硝酸纤维素膜上。
转移可以采用湿式或半干燥式方法,膜的种类和转移缓冲液的浓度、pH值等因素都会影响转移效果。
3.蛋白质与抗体结合膜上的蛋白质需要与浓度足够的抗体进行结合,使其出现颜色。
抗体可以是多克隆或单克隆抗体,通常由动物免疫学制备而成。
在结合抗体之前,膜需要被阻断,以避免非特异性的背景信号。
4.识别蛋白质识别特定蛋白质需要使用标记有酶、荧光体或放射同位素等的二抗或底物。
蛋白质与特定抗体形成复合物后,可以使用二抗结合在蛋白质与一抗之间。
底物是标记于蛋白质特定抗体上的酶,在底物的作用下,可生成可见信号,如液态手套(ECL)。
注意事项:1.蛋白质的提取和纯化,提取方式会影响到实验结果,选择适当的提取方法是十分重要的。
2.涉及到蛋白质电泳和转移过程,准确控制电泳时间和电压,转移条件、时间以及温度都会影响转移效果和转移后的后续步骤。
3.在结合抗体前,必须阻断膜上的未被结合的蛋白质,减小背景信号。
通常使用酵素或乳清蛋白等物质进行阻断,以避免非特异性结合。
4.选择合适的底物,控制反应条件,避免过度堆积或实验时间不够导致底物显色偏低。
蛋白质免疫印迹(WesternBlot,WB)实验方法原理步骤及注意事项
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蛋⽩质免疫印迹(WesternBlot,WB)实验⽅法原理步骤及注意事项实验⽅法原理Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋⽩质转移到膜上,然后利⽤抗体进⾏检测的⽅法。
对已知表达蛋⽩,可⽤相应抗体作为⼀抗进⾏检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。
与Southern或Northern杂交⽅法类似,但Western Blot采⽤的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋⽩质,“探针”是抗体,“显⾊”⽤标记的⼆抗。
经过PAGE分离的蛋⽩质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以⾮共价键形式吸附蛋⽩质,且能保持电泳分离的多肽类型及其⽣物学活性不变。
以固相载体上的蛋⽩质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第⼆抗体起反应,经过底物显⾊或放射⾃显影以检测电泳分离的特异性⽬的基因表达的蛋⽩成分。
该技术也⼴泛应⽤于检测蛋⽩⽔平的表达。
实验材料蛋⽩质样品试剂、试剂盒丙烯酰胺SDS Tris-HClβ-巯基⼄醇ddH2O⽢氨酸Tris甲醇PBSNaClKClNa2HPO4KH2PO4ddH2O考马斯亮兰⼄酸脱脂奶粉硫酸镍胺H2O2DAB试剂盒仪器、耗材电泳仪电泳槽离⼼机离⼼管硝酸纤维素膜匀浆器剪⼑移液枪刮棒实验步骤⼀、试剂准备1. SDS-PAGE试剂:见聚丙烯酰胺凝胶电泳实验。
2. 匀浆缓冲液:1.0 M Tris-HCl(pH 6.8) 1.0 ml;10%SDS 6.0 ml;β-巯基⼄醇 0.2 ml;ddH2O 2.8 ml。
3. 转膜缓冲液:⽢氨酸 2.9 g;Tris 5.8 g;SDS 0.37 g;甲醇200 ml;加ddH2O定容⾄1000 ml。
4. 0.01 M PBS(pH7.4):NaCl 8.0 g;KCl 0.2 g;Na2HPO4 1.44 g;KH2PO4 0.24 g;加ddH2O⾄1000 ml。
5. 膜染⾊液:考马斯亮兰 0.2 g;甲醇80 ml;⼄酸2 ml;ddH2O118 ml。
western blot技术的原理方法注意事项
![western blot技术的原理方法注意事项](https://img.taocdn.com/s3/m/43817977b80d6c85ec3a87c24028915f804d8486.png)
western blot技术的原理方法注意事项一、原理Westernblot是一种常用的蛋白质检测技术,其基本原理是蛋白质的印迹技术,即把蛋白质从复杂的样品中分离出来,并转移到固相支持物上,再与特异性抗体结合,通过显色或电子显微镜观察鉴定蛋白质的表达和分布情况。
二、方法1.样品处理:首先,需要将蛋白质样品进行提取、分离和纯化。
根据样品性质,可以采用不同的提取方法,如细胞裂解液、组织匀浆液等。
2.凝胶电泳:将分离纯化的蛋白质样品转移到分离胶中,通过电泳将不同分子量的蛋白质分离。
3.免疫反应:将膜上的蛋白质与特异性抗体结合,形成抗原-抗体复合物。
4.显色反应:通过化学反应,使抗原-抗体复合物显色,便于观察和拍照。
5.电子显微镜观察:对于较小的样品,可以采用电子显微镜对蛋白质进行观察和定量分析。
三、注意事项1.样品处理:提取的蛋白质样品应尽可能保持完整性和纯度,避免在提取、分离和转移过程中发生变性或降解。
2.凝胶电泳:分离胶的选择应根据待测蛋白质的分子量大小进行,以确保蛋白质能够完全分离。
同时,应注意电泳过程中的电压、电流和时间等参数,避免过度电泳导致蛋白质失活或降解。
3.免疫反应:应注意抗体滴度的选择,确保抗体能够充分识别目标蛋白质。
同时,应避免使用过期或质量不佳的抗体。
4.显色反应:应注意显色试剂盒的质量和操作步骤,确保显色反应充分且颜色易于观察。
同时,应注意显色颜色的稳定性,避免因颜色不稳定影响结果判断。
5.电子显微镜观察:应注意电子显微镜的操作步骤和设备维护,确保电子显微镜能够正确成像。
同时,应注意样品的制备和处理,确保样品能够被电子显微镜准确观察。
6.实验条件:实验过程中应注意调整实验条件,如孵育时间、洗膜次数、抗体稀释度等,以确保实验结果的准确性和可靠性。
7.重复性:在进行Westernblot实验时,应注意重复性实验的开展,以减少实验误差和提高实验结果的可靠性。
总之,Westernblot技术虽然复杂,但只要掌握了其原理和方法,并注意以上注意事项,就能够获得准确可靠的结果。
western_blot-注意事项+takara
![western_blot-注意事项+takara](https://img.taocdn.com/s3/m/586f2652e45c3b3567ec8b1c.png)
现。如果没有蓝光出现,说明底物或HRP标识抗体已经劣化。
·注意装有试剂的瓶子不要出现污染。保存的底物试剂与其他试剂混合,也有可能导致底物劣化。
进行了stripping和reprobing
·进行stripping时,有可能导致目的蛋白剥落或变性。优化洗膜方法。 ·只在必要时进行reprobing。 ·尽量避免在同一张膜上进行重新标记。
Western Blotting实验操作手册
③ 封闭
1.0 hr以上 or 过夜
为了防止蛋白检测用抗体非特异性 与膜结合,对未结合蛋白的膜区域 进行封闭很重要。
洗涤
根据需要
Western Blotting操作过程中需洗膜,洗 膜可除去未反应的试剂,抑制背景。
④ 一抗反应
1.0 hr以上 or 过夜
反应方法 减少失败的最好方法是将高度稀释的低浓度抗体溶液添加到托盘中,放入膜后,4℃ 缓慢摇动过夜反应、如果抗体使用量有限制建议使用杂交袋,使用杂交袋时要确保不 能有气泡。
⑤ 二抗反应时的注意事项
二抗的选择 可从不同宿主获得的二抗,如果背景较高,使用另一种宿主的二抗可减少背景。还销 售宿主以外的对动物种属来源血清蛋白进行吸收操作的抗体。确认动物种属后根据检 测方法选择合适的抗体。 一般使用HRP(辣根过氧化物酶)标记的二抗进行化学发光检测的方法。其它还有 使用AP(碱性磷酸酶)标记抗体(对发光物质进行检测)、荧光物质及放射性同位 素标记的二抗。
【操作流程】
①
②
③
④
⑤
⑥
一
二
电
转
封
抗
抗
生化实验九 Western_blot的原理、操作
![生化实验九 Western_blot的原理、操作](https://img.taocdn.com/s3/m/d1c3766111661ed9ad51f01dc281e53a59025115.png)
实验九 Western blot的原理、操作及注意事项原理:通过电泳区分不同的组分,并转移至固相支持物,通过特异性试剂(抗体)作为探针,对靶物质进行检测,蛋白质的Western印迹技术结合了凝胶电泳的高分辨率和固相免疫测定的特异敏感等多种特点,可检测到低至1~5ng(最低可到10-100pg)中等大小的靶蛋白。
一、抗原的选择和制备A:样品的制备1 组织:组织的处理方法:组织洗涤后加入3倍体积预冷的PBS,0℃研磨,加入5×STOP buffer,180W,6mins,0℃超声波破碎,5000rpm,5mins 离心,取上清。
加入β-ME(9.5ml加入0.5ml),溴酚蓝(9.5ml加入0.5ml)煮沸10min,分装后于-20℃保存,用时取出,直接溶解上样。
2 细胞:细胞的处理方法:离心收集细胞或者直接往细胞培养瓶内加入5×STOP buffer,收集,180W,6mins,0℃超声波破碎,5000rpm,5mins 离心,取上清。
加入β-ME(9.5ml加入0.5ml),溴酚蓝(9.5ml加入0.5ml)煮沸10min,分装后于-20℃保存,用时取出,直接溶解上样。
3 分泌蛋白的提取(特例):直接收集分泌液,加入β-ME、溴酚蓝制样。
二、SDS-聚丙烯酸胺凝胶电泳(SDS-PAGE)A:实际操作1.做胶前的准备1)检查是否有足够的、干净的 spacer、comb 和架子。
2)检查是否有新鲜的,足量10%APS,没有立刻重配。
3)按将要检测的抗体对应的原始抗原的分子量大小,计算出胶的浓度,并算出分离胶各组分的用量。
2.制胶,电泳1)装好架子。
2)按照下面配方配制分离胶。
(单位:ml,Total: 8ml)在胶上面加入一层蒸馏水,促进胶更好的凝集。
3)4)待胶凝集好后,上样,电泳。
上层胶用60-80V电压,当样品至分离胶时,用100-120V 电压。
一般电泳时间在1.5小时左右。
磷酸化蛋白做wb与普通的wb区别
![磷酸化蛋白做wb与普通的wb区别](https://img.taocdn.com/s3/m/94803a16ac02de80d4d8d15abe23482fb5da0240.png)
磷酸化蛋白做wb与普通的wb区别
蛋白质印迹(Western blot,WB)是细胞和分子生物学中使用的一项重要技术。
通过使用蛋白质印迹,研究人员能够从细胞中提取的蛋白质的复杂混合物中鉴定特定的蛋白质。
该技术通过三个步骤来完成此任务:(1)按大小分离,(2)转移到固体载体以及(3)使用适当的一抗和二抗标记目标蛋白以可视化。
与普通蛋白进行WB不同,磷酸化蛋白做WB还需要以下注意几点:
1.为避免磷酸化蛋白发生脱磷酸化,取样过程要迅速,最好在冰上操作,保证样品不变质;
2.在蛋白提取过程中加入磷酸酶抑制剂和蛋白酶抑制剂;
3.适当提高磷酸化蛋白的上样量;
4.若蛋白磷酸化位点为酪氨酸残基,还需要加入1umol的原钒酸钠,且上样前不能煮沸;(5)适当提高磷酸化抗体的浓度;
(6)在封闭过程中采用专用的脱脂奶粉,可保护野生型蛋白底物处于非磷酸化状态,也维护了磷酸化蛋白的磷酸化状态。
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Pull-down靶蛋白质谱鉴定。
western检测磷酸化蛋白实验步骤
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跑磷酸化蛋白的注意事项
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跑磷酸化蛋白的注意事项跑磷酸化蛋白是一类具有磷酸化修饰的蛋白质,在细胞信号传导、基因转录和细胞增殖等生物学过程中起着重要作用。
跑磷酸化蛋白的研究对于深入了解细胞的生理和病理过程具有重要意义。
然而,在进行跑磷酸化蛋白的相关研究时,有一些注意事项需要我们注意。
要准备好适当的实验材料和设备。
跑磷酸化蛋白的研究通常需要提取细胞蛋白,并使用电泳技术进行分离。
因此,我们需要准备好细胞培养物、细胞裂解液、电泳胶和电泳仪等实验材料和设备。
确保这些材料和设备的质量和适用性,以保证实验的准确性和可靠性。
要选择合适的实验方法和技术。
跑磷酸化蛋白的检测通常采用免疫印迹法,即Western blotting。
在进行Western blotting实验时,我们需要对跑磷酸化蛋白和非磷酸化蛋白进行区分。
这需要选择合适的抗体,如抗体可以特异性地与磷酸化蛋白结合,并进行检测。
此外,在Western blotting实验中,还需要注意蛋白质的迁移速度和转印效率,以保证实验结果的准确性。
第三,要注意实验条件的控制。
在进行跑磷酸化蛋白的实验时,需要严格控制实验条件,以避免误差的产生。
比如,要控制细胞的培养条件,如温度、湿度和CO2浓度等。
此外,还要注意细胞的采集和处理方式,以保证实验结果的可靠性。
同时,在进行Western blotting实验时,要注意电泳条件的控制,如电压、电流和电泳时间等,以避免蛋白质的降解和损失。
第四,要进行数据分析和结果解释。
在获得实验数据后,我们需要对数据进行分析和统计,以获得可靠的结果。
常用的数据分析方法包括图像分析软件和统计学方法等。
此外,在解释实验结果时,要注意对实验结果的客观性和科学性,避免主观臆断和错误推测。
要进行相关文献的查阅和总结。
跑磷酸化蛋白的研究是一个前沿的领域,有许多相关的文献和研究成果可供参考。
在进行跑磷酸化蛋白的实验前,要对相关的文献进行查阅,了解最新的研究进展和方法。
此外,还要对实验结果进行总结和归纳,以便于进一步的研究和应用。
Western blot 实验技巧精要
![Western blot 实验技巧精要](https://img.taocdn.com/s3/m/abb764d02cc58bd63186bdf6.png)
Western blot 实验技巧精要Western blot 方法在SCI 文章中出现的频率非常高,漂亮的WB 电泳图可以给文章增色不少。
但是WB 实验的步骤琐碎,细节颇多,要想得到令人满意的结果还是需要花费很多时间和精力去摸索实验技巧的。
一、样品准备部分我们不应该太过重视WB 电泳部分的操作技巧,样品准备才是整个WB 实验中最重要的一个环节(没有之一)。
否则WB 电泳技术再高也无法得到好的结果。
小编认为以下3 点值得大家重点关注:1. 注意孵育、终止时间如果想得到漂亮的梯度条带,无论是不同处理时间的样品,还是不同给药浓度的样品,在处理过程中都一定要严格按照设计的时间来孵育和终止,尤其是对于磷酸化蛋白,哪怕1 秒也不要提前或耽搁。
2. 抑制蛋白降解这是样品制备中最需要注意的部分。
抑制样品蛋白降解的方法主要有两种:(1) 使用蛋白酶抑制剂罗氏公司(Roche)的蛋白酶抑制剂Cocktail 片剂,效果不错。
再与PMSF 共同使用,可以很好地抑制蛋白降解。
(2) 全程低温操作提前预冷PBS、裂解液甚至枪头等,从收集细胞开始一直到煮样的全过程都应该尽可能的保持在冰上操作。
除了使用冰盒,大多数操作都是在4℃冷房中进行的,虽然有点麻烦和辛苦,但是效果非常好。
3. 裂解液用量将收集好的细胞加入裂解液进行裂解在操作上是非常简单的,所以这一步的重要性很容易被大家忽视。
裂解液的用量直接决定了细胞裂解程度以及裂解后的蛋白浓度。
如果加入的裂解液不足,蛋白浓度太高,会造成与上样缓冲液反应不充分,电泳后会出现多条条带,条带形状也不好。
做磷酸化蛋白检测时为了在每个胶孔中尽可能多上样,所以用体积较少的裂解液制备了浓度很高的蛋白,结果就得不偿失了(见下图)。
这种情况的补救方法是给样品继续补加上样缓冲液,煮样,再跑胶。
直接给已经煮过样的样品补加上样缓冲液再煮样,跑胶后的效果也会好很多(见下图)。
如果加入的裂解液过多,蛋白浓度太低,会导致在胶孔中的上样量不足,条带不清晰。
实验记录-Western-Blot之蛋白的提取与定量
![实验记录-Western-Blot之蛋白的提取与定量](https://img.taocdn.com/s3/m/8ecadd8ac0c708a1284ac850ad02de80d5d80658.png)
细胞蛋白的提取与测定一、蛋白提取原理: 蛋白质是一切生命活动的承担者, 为了研究及探索蛋白质的功能、特异性蛋白表达水平、翻译后修饰(甲基化磷酸化等)、蛋白-蛋白或蛋白-核酸之间相互作用的研究, 进一步阐明众多疾病的机制, 同时为疾病治疗提供理论依据, 因此需要提取目的蛋白, 由于蛋白质种类繁多, 结构复杂, 需要通过一些步骤使细胞裂解、杂志去除、蛋白纯化来得到目的蛋白。
贴壁细胞蛋白的提取: (所有操作均在冰上进行)准备相应数量的EP管标记后放放冰上备用裂解液制备: 每1ml蛋白裂解液(RIPA)加入10ul蛋白酶抑制剂(如PMSF保护蛋白, 使其免于被蛋白酶降解), 配好后冰上备用;2.此处以6孔板为例, 吸掉培养基后每孔加入1-2ml冰PBS溶液, 清洗 2-3次, 吸净残余BPS(如果有残留的话有可能使提取的蛋白稀释);3.加入适当体积的裂解液, 让裂解液与细胞充分混匀, 冰上裂解30min;4.裂解完成后, 用细胞刮刀将细胞刮下, 将细胞及裂解液吸入离心管, 放离心机4℃12000rpm 离心30min(离心机提前预冷), 上清即为蛋白溶液, 细胞碎片沉降于底部;5.蛋白提取完成后a.可放置于-20℃保存(长期保存放于-80℃);b.可取出部分进行BCA 定量分析;c.做western blot, 需要对蛋白进行变性处理后储存于-20℃或-80℃的冰箱中保存(根据蛋白变性条件不同有所不同, 例如在100℃的高温下水浴锅煮5-10分钟)。
二、组织中总蛋白的提取:1.将已称重的冷冻组织(约50g)放入预冷好的研钵中, 用研杵快速研磨组织, (有的需要加入液氮), 直至组织被研磨成匀浆(无明显颗粒);2.裂解液制备: 取250ulRIPA裂解液+2.5ul 100mmol/L蛋白酶抑制剂+2.5ul蛋白酶抑制剂复合物Cocktail(多种小分子组成的抑制剂混合物能更好的保护蛋白不被蛋白酶降解);3.取适量研磨的匀浆放入离心管, 加入配好的裂解液, 冰上孵育40min;4.离心: 4℃ 12000rpm 离心15min 保留上清;5.将蛋白溶液防止于-20℃保存(长期保存放于-80℃)。
磷酸化蛋白wb注意事项
![磷酸化蛋白wb注意事项](https://img.taocdn.com/s3/m/1bd97075302b3169a45177232f60ddccda38e66b.png)
磷酸化蛋白wb注意事项
磷酸化蛋白wb是一种非常有用的工具,用于分析细胞内某些蛋白
质的磷酸化状态。
它可以帮助研究者精确地识别重要的信号传导分子,从而揭示关键细胞过程和内部信号转导途径。
在进行磷酸化蛋白wb时,需要清楚了解一些注意事项,以保证实验数据准确可靠。
首先,应使用足够高纯度的样本来执行该实验,可以使用具有不
同形态(即,悬浮液,胶体或固体)的样本,但是在使用悬浮液的情
况下,有必要对样本中的粒子进行快速离心,以提高实验数据的准确性。
其次,应确保使用高纯度的磷酸化混合物,该混合物由4-磷酸乙
酰腺苷(ATP)和含磷酰肼(γ-38P)的混合物组成,并配备适当的离
子交换剂,以防止样本中质量水平较低的蛋白质的形成。
此外,在运行磷酸化蛋白wb实验时,实验室应该确保正确使用抗体,例如anti-phosphorylated protein antibody,保护样本中的每
个蛋白质,以及避免外源抗体的污染。
此外,在磷酸化蛋白wb实验中,实验人员应确保使用正确的缓冲液,例如50mM tris-HCl,pH7.5,以及各种酶或其他添加剂,以防止
特定反应体系中出现不期望的反应产物或不一致的反应结果。
最后,在磷酸化蛋白wb实验中,应确保控制非特异抗体反应,以
避免样本和抗体之间的冲击,并保持正确的比例和时间,以便获得有
效和有意义的实验结果。
western blot检测蛋白质的表达实验的结论和注意事项
![western blot检测蛋白质的表达实验的结论和注意事项](https://img.taocdn.com/s3/m/41c4a68aa0c7aa00b52acfc789eb172dec639950.png)
western blot检测蛋白质的表达实验的结论和注意事项西方博(Western blot) 是一种常用的蛋白质检测技术,通过将蛋白质样品经过电泳分离并转移到膜上,再使用特异性抗体检测蛋白质的表达水平。
以下是西方博检测蛋白质表达实验的结论和注意事项。
结论:1. 蛋白质的分子量:西方博通过与已知分子量的标准品比较,可以确定待测蛋白质的精确分子量。
根据蛋白质在凝胶上的迁移距离,可以使用特定的分子量标准品绘制标准曲线,并在曲线上确定待测蛋白质的分子量。
2. 蛋白质的表达水平:西方博使用特异性抗体来检测特定蛋白质的表达水平。
利用特异性抗体与目标蛋白质的特定区域结合,然后使用辅助抗体标记抗体,并通过光学或化学方法检测抗体标记物的表达水平。
比较待测蛋白质与内参蛋白质的表达水平可以确定其相对表达量。
注意事项:1. 样品的提取和准备:蛋白质的准备和提取是西方博实验的首要步骤。
样品应该被充分破碎,并使用适当的提取缓冲液来维持蛋白质的稳定性。
注意,使用不同类型的组织或细胞时,提取条件和方法可能有所不同。
2. 蛋白质的电泳分离:西方博通常使用SDS-PAGE (聚丙烯酰胺凝胶电泳) 来进行蛋白质的分离。
凝胶的浓度和隔离电泳条件应选择适当,以分离不同分子量的蛋白质。
3. 转膜:将电泳分离的蛋白质转移到膜上是西方博的关键步骤之一。
选用合适的膜(如聚偏氟乙烯或硝酸纤维素膜),并选择适当的电泳缓冲液进行转膜。
确保蛋白质能够均匀地转移到膜上。
4. 抗体的选择和试验条件:特异性抗体的选择和充分优化是确保实验准确性的关键因素。
保证抗体的特异性和亲和性,并验证抗体的工作浓度。
此外,充分优化抗体和探针的试验条件,包括反应温度、时间和抗体浓度等。
5. 成像和分析:西方博实验完成后,使用适当的成像方法(如化学发光或荧光成像)检测抗体标记物的表达水平。
使用适当的成像系统记录图像,确保信号处于线性范围内。
使用图像分析软件进行定量分析,比较待测蛋白质与内参蛋白质的表达水平。
蛋白质免疫印迹(WesternBlot)实验步骤和原理及注意事项
![蛋白质免疫印迹(WesternBlot)实验步骤和原理及注意事项](https://img.taocdn.com/s3/m/c77d1f1f6d85ec3a87c24028915f804d2b16870e.png)
蛋⽩质免疫印迹(WesternBlot)实验步骤和原理及注意事项蛋⽩质免疫印迹(Western Blot )实验步骤和原理及注意事项1.收集蛋⽩样品(Protein sample preparation)可以使⽤适当的裂解液。
收集完蛋⽩样品后,为确保每个蛋⽩样品的上样量⼀致,需要测定每个蛋⽩样品的蛋⽩浓度。
根据所使⽤的裂解液的不同,需要采⽤适当的蛋⽩浓度测定⽅法。
因为不同的蛋⽩浓度测定⽅法对于⼀些去垢剂和还原剂等的兼容性差别很⼤。
BCA法。
2. 电泳(Electrophoresis)(1) SDS-PAGE凝胶配制(2) 样品处理在收集的蛋⽩样品中加⼊适量浓缩的SDS-PAGE蛋⽩上样缓冲液。
例如2X或5X的SDS-PAGE蛋⽩上样缓冲液。
使⽤5X的SDS-PAGE蛋⽩上样缓冲液可以减⼩上样体积,在相同体积的上样孔内可以上样更多的蛋⽩样品。
100℃或沸⽔浴加热3-5分钟,以充分变性蛋⽩(根据蛋⽩分⼦的⼤⼩,煮沸时间可适当变化,⼀般不低于5min。
煮沸只是变性蛋⽩,⽽不是分解,⼀般加了抑制酶不会分解。
煮沸对于SDS-PAGE凝胶电泳是必须的,只有煮沸,才能消除蛋⽩质的⽴体⼆级结构,伸展为⼀维线性结构,所以⼀般来讲⼆聚体都会解体,才能完全按照分⼦量跑电泳,加的蛋⽩Marker才有指⽰分⼦量的意义。
蛋⽩样品变性后与SDS充分结合,SDS使每个氨基酸带相同的电荷,使整个蛋⽩呈线性结构. 抗体因为要是线性表位结合的,100度煮10min 后13000,离⼼5分钟,取上清电泳,因为沉淀会导致拖尾.也可以取上清到另⼀管,4度可以放⼀周备再次电泳)。
(3)电泳i.清洗玻璃板:⼀只⼿扣紧玻璃板,另⼀只⼿蘸点洗⾐粉轻轻擦洗。
两⾯都擦洗过后⽤⾃来⽔冲,再⽤蒸馏⽔冲洗⼲净后⽴在筐⾥晾⼲。
ii.灌胶与上样(1)玻璃板对齐后放⼊夹中卡紧。
然后垂直卡在架⼦上准备灌胶。
(操作时要使两玻璃对齐,以免漏胶。
)(2)配10%分离胶,加⼊TEMED后⽴即摇匀即可灌胶。
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磷酸化蛋白之western blot检测操作细节和注意事项
1.一定要在lysis buffer中加入蛋白酶抑制剂(配方见后页),还要加入一定量的磷酸酶抑制
剂,否则即使band压出来也会很浅,结果也不可信。
2.加一抗后最好4度过夜,保证抗体有充分的结合时间。
因为磷酸化的蛋白只占总的蛋白量
的极少部分。
4度也可使一抗重复使用多次(站长注:可加入防腐剂,如叠氮钠,Proclin TM 等,保存时间更长)。
毕竟磷酸化的抗体都挺贵的。
二抗则室温1小时即可。
3.磷酸化抗体的好坏是一个关键因素,所以要选择好的厂商。
个人认为,Cell signaling公司
做的磷酸化抗体不错,尤其是MAPKs磷酸化抗体
4.最好根据厂商的protocol来操作实验,这是实验成功的保证。
如Cell signaling会建议用
含5%BSA的TBST稀释phospho-p38等抗体,效果不错,而不是用常见的含5%non-fat milk的TBST。
5.抗体的稀释倍数也要适当。
不同厂商也会有不同要求。
6.研究完某一蛋白的磷酸化情况后最好也要研究一下该蛋白总的表达量。
如压完phospho-p
38抗体后,我会把相同的membrane做strip后再压p38,然后再strip一次,再压内标acti n。
7.做磷酸化蛋白WB时,除了目标蛋白的band以外,往往会出现非特异性的band.磷酸化抗体
不好的话,甚至会压出非特异性的band,而没有你想要的band,所以压片以后,你一定要根据markers比对一下,你压出的band分子量是否正确.我以前压WB时,压出了一条band,就以为是我想要的那条,然后还根据趋势推测可能的机制,走了不少怨枉路.还有一次,把markers 的分子量记错了,比对出来的结果当然也不对.
8.磷酸化蛋白WB时backgroud也往往较深,所以压片时间要适当,不能太长或过短,太长则b
ackgroud太深盖住想要的那条band,时间过短则可能没有band或者band太浅.
9.磷酸化蛋白WB时,用TBST洗时也要注意一下,摇床的转速不要太快,洗的时间不要太长,孵
育一抗和二抗之后分别洗5min 3次即可,宁愿background深一些,总比做不出来强得多.另外,洗的时候,最好不要把几张membrane叠在一起洗。
10.正如第5点所说的,"研究完某一蛋白的磷酸化情况后最好也要研究一下该蛋白总的表达量
“。
这有两种方法,一是:相同的sample在不同的well中上样两次(可在相同的gel上,也可在不同的gel),其一压磷酸化蛋白,另一压该蛋白总的表达量(包括磷酸化和未磷酸化的该蛋白),甚至还可跑另一个gel,压内标。
但是本人不建议如此做,因为这样比较时误差还是较大的。
因此,比较公认的,本人也建议如此的方法,即:将原先结合上的磷酸化抗体及二抗用strip solution洗去,
11.方法如下:50度水浴30min后,用TBST洗5分钟,3次即可去除已孵育结合的抗体。
许多
人会建议55度水浴30min。
Strip solution是用来去除已结合的抗体,但也会去除部分的蛋白,导致蛋白信号变弱。
我本人经实验发现水浴时有时温度不稳定,温度定为55度时往往其温度容易超过,导致较多的蛋白也被去除,故建议温度设为50度30min,既能有效去除已结合的抗体,又比55度更能保护蛋白.
12.Strip时一定要注意:membrane一定要完全泡在strip solution中(可用较硬的塑料膜封
好),然后要完全浸入水中,使受热均匀。
这一点很重要,要不然,随后压出来的总蛋白也好,内标也好就会不均一,无法进行比较。
我曾将同一张membrane用我提供的方法strip 了3次,分别压不同的抗体(因为有时候蛋白分子量很接近),效果都不错。
文中用到的液体配制方法:
注意事项:
Na3VO4要活化
Activation of Sodium OrthoVanadate
(1). Make Sodium orthovanadate to 200mM in ddH2O.
用ddH2O配制200mM浓度的原矾酸钠(100ml ddH2O中加入3.68克)
(2). Adjust pH to 10.0 with 1M NaOH or 1M HCl (the starting pH varies depending on t he lot of the chemical). At pH 10.0 the solution is yellow.
用1M NaOH 或1M HCl调整pH值至10.0,此时溶液呈黄色。
(3). Boil the solution until it turns colorless (about 10 mins).
煮沸直到溶液变为无色。
(4). Allow solution to cool to room temperature.
冷却至室温.
(5). Readjust pH to 10.0 and repeat steps 3 & 4 until the solution remains colorless an
d th
e pH stabilizes at 10.0. Store in aliquots at -20 o C.
重复3-4步,直到变为无色且pH值稳定至10.0,分装保存在-20 o C。
NOTE: Activation depolymerizes the vanadate, converting it to a more potent
inhibitor of protein tyrosine phosphatases. See: Gordon J. Methods Enzymol. 1991, 201:4 77-82.
●原作中关于钒酸钠贮存液浓度是1M,按照上述活化流程,在此改为200mM,因此配制1
00ml总裂解液时其体积加至0.5ml,以保证终浓度的不变
●配方配的是100ml 细胞裂解液,但各个成分的体积加起来,会发现total=102.1ml,那是因为
这些成分加在一起后总体积会缩小的.
Stripping Solution(Stripping Buffer,膜再生液)
100mM 2-mercaptoethanol (stock 14.335M, 取697.6ul)
2% SDS (stock 10%, 取20ml)
62.5mM Tris (pH6.7)(stock 1M, 取6.25ml)
加水至100ml
方法:准备一硬塑料盒,倒入strip solution,将膜完全浸泡,55度水浴30min后,用TBST洗5分钟,3次即可去除已孵育结合的抗体
另外一个Stripping buffer的配方:
10ml 2M Glycine pH 2.2
1ml 10% SDS
1ml Twen 20
室温strip 1h
洗完后用PBS wash 2 timesx10mins。