真核生物三类启动子
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
真核生物启动子有三类,分别由RNA 聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。
类别Ⅰ(class Ⅰ)启动子:
只控制rRNA 前体基因的转录,转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA 。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成:
核心启动子(core promoter
):位于转录起点附近,从-45至+20;
上游控制元件(upstream control element ,UCE ):位于-180至-107;
RNA 聚合酶Ⅰ对其转录需要2种因子参与:
UBF1:一条M 为97000的多肽链,结合在上述两部分的富含GC 区;
1个TBP ,即TATA 结合蛋白(TATA-binding protein ,TBP );
SL1:一个四聚体蛋白,含有 3个不同的转录辅助因子TAF Ⅰ;
在SL1因子介导下RNA 聚合酶Ⅰ结合在转录起点上并开始转录。
类别Ⅱ(class Ⅱ)启动子:
类别Ⅱ启动子涉及众多编码蛋白质的基因表达的控制。
该类启动子包含4类控制元件:
基本启动子(basal promoter ):序列为中心在-25至-30左右的7 bp 保守区,TATAAAA/T ,
称为TATA 框或Goldberg-Hogness 框。与RNA 聚合酶的定
位有关,DNA 双链在此解开并决定转录的起点位置。失去
TATA 框,转录将在许多位点上开始。 起始子(initiator ):转录起点位置处的一保守序列,共有序列为:P y P y ANT(A)P y P y
P y 为嘧啶碱(C 或T ),N 为任意碱基,A 为转录的起点。DNA 在此
解开并起始转录。
上游元件(upstream factor ):普遍存在的上游元件有CAAT 框、GC 框和八聚体(octamer )
框等。CAAT 框的共有序列是GCCAATCT ,GC 框的共有序
列为GGGCGG 和CCGCCC ,八聚体框含有8bp ,共有序列
为ATGCAAAT ;
应答元件(response element ):诱导调节产生的转录激活因子与靶基因上的应答元件结合。
如热休克效应元件HSE 的共有序列是
CNNGAANNTCCNNG ,可被热休克因子HSF 识别和作用;
血清效应元件SRE 的共有序列CCATATTAGG ,可被血清效
应因子SRF 识别和作用。
+1
参与RNA聚合酶Ⅱ转录起始的各类因子数目很大,可分为3类:
通用因子(general factor):作用于基本启动子上的辅助因子称为通用(转录)因子(GTF),
或基本转录因子(basal transcription),为任何细胞类别Ⅱ启动
子起始转录所必需,以TFⅡⅩ来表示,其中Ⅹ按发现先后次序
用英文字母定名,如TFⅡA、TFⅡD、TFⅡH。
上游因子(upstream factor):或转录辅助因子(transcription ancillary factor),是指识别上
游元件的转录因子。
可诱导因子(inducible factor):在真核生物中,与细胞类型和发育阶段相关的基因表达,
主要通过转录因子的重新合成来进行调节的,是长期的过
程。对外界刺激的快速反应则主要通过转录激活物
(transcription activator)的可诱导调节。这些诱导的转录
激活因子与靶基因上所谓应答元件相结合。
类别Ⅲ(class Ⅲ)启动子:
类别Ⅲ启动子为RNA聚合酶Ⅲ所识别,他涉及一些小分子RNA的转录。
RNA聚合酶Ⅲ的启动子有3种类型结构:
类型1基因内启动子:如5S rRNA基因的启动子,位于转录起点下游,即在基因内部,是
下游启动子,有两个框架序列,被3种辅助因子所识别。5S rRNA
基因的启动子包括框架A(box A)、中间元件(intermediate element)
和框架C(box C)3个元件组成。TFⅢA结合在框架A上,然后
促使TFⅢC结合,后者结合导致TFⅢB结合到转录起点附近,并
引导RNA聚合酶Ⅲ结合在起点上。TFⅢB使RNA聚合酶Ⅲ正确定
位,起“定位因子”(positioning factor)作用。
类型2基因内启动子:如tRNA基因的启动子,有两个控制元件,分别为框架A和框架B。
TFⅢC结合框架B,其结合区域包括框架A和框架B,然后导致TF
ⅢB结合到转录起点附近,并引导RNA聚合酶Ⅲ结合在起点上。上游启动子:如snRNA基因的启动子,位于转录起点上游。有3个上游元件:OCT(八聚体基序octamer motif)、PSE(邻近序列元件proximal sequence element)、
TATA元件。在RNA聚合酶Ⅲ的上游启动子中,只有靠近起点存在TATA元
件,就能起始转录。然而PSE和OCT元件的存在将会增加转录效率。