利用SSR标记进行小麦品种鉴定和新品种保护研究
利用SSR标记进行小麦品种鉴定和新品种保护研究
山 东 农 业 科 学
Ｓ ａ ｄ ｎ ｒ ｕｔｒｌ ｃ ｎ ｅ ｈ ｎ ｏ ｇＡｇｉ ｌ ａ ｉ ｃｓ ｃ用 Ｓ Ｒ标记进行小麦品种鉴定和新品种保护研究 Ｓ
李汝玉 ， 李 群 ， 文 兰 ， 张 张 晗 ， 国 安 ， 东 建 宋 王
（ 山东 省 农 业 科 学 院作 物 研 究 所 ， 东 济 南 山 ２ ００ ） ５ １０
摘
要 ： 用 变 性 聚 丙烯 酰胺 电泳 结 合 银 染 技 术 ， 测 了 ８个 Ｓ Ｒ 位 点 在 ７ 利 检 Ｓ １份 中国 育 成 小 麦 品 种 （ ） 系
中 的 多态 性 ， 定 了 各 Ｓ Ｒ 位 点 上 等位 基 因 的 大 小 。 在 ７ 确 Ｓ １份 小 麦 品 种 （ ） ， 检 测 到 等 位 基 因 ７ 系 中 共 ５个 ， 每
Ａｐｐ ｉ ａ ｉ ｎ ｏ Ｓ Ｍ ａ ｋｅ ｓ ｔ ｄ ｎｔｆｃ ｔ０ ｌｃ ｔｏ ｆＳ Ｒ ｒ ｒ ｏ Ｉ ｅ ｉｉ ａ ｉ ｎ
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（ ｒ ｐＲ ｓａ ｃ ｎｔ ｕｅ Ｓ ａ ｄ ｎ ａ ｅ ｆ Ａｇ ｉｕ ｔｒ ｌ ｃ ｎ ｅ ， ｉａ ５ １ ０ Ｃ ｉ ） Ｃ ｏ ｅｅ ｒｈ Ｉ ｓ ｔ ｔ ， ｈ ｎ ｏ ｇＡｃ ｄ ｍｙ ｏ ｒ ｌｕ ａ ｉ ｃｓ Ｊ ｎ ￣ ２ ０ ０ ， ｈｎ ｉ ｃ Ｓ ｅ ｌ ａ
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利用SSR进行品种纯度鉴定的研究进展
利用优势 。 另外 ， 受到保护的品种未经授权单位许 可而 进 行 非 法 经 营 ， 害 了 品种 所 有 人 的利 益 ， 侵 这 种 情 况 下 ，迫 切 需 要 对产 生 纠纷 的 品种 做 出快 速
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关 键 词 ：Ｓ 品 种 ； 度 鉴 定 Ｓ Ｒ； 纯
中 图 分 类 号 ：３ ８ ￥ ３ 文 献 标 识 码 ： Ａ Ｄ Ｉ 码 ：０３ ６ ／ ｉ ｎ１０ — ５ ０２ １．４０ ３ Ｏ 编 １ ．９ ９ｊ ｓ ．０ ６ ６ ０ ． １０ ．１ ．ｓ ０
Ｒｅ ｅ ｒ ｈ ｏｇ ｅ ｓｏｎ Ｖａ ｉ ｔ ｓ ａ ｃ Ｐｒ ｒ ｓ ｒ ｅ ｙ Ｐｕｒｔ ｄｅ ｔｆｃ ｔｏｎ ｂ ｉｙ Ｉ ｎ ｉ ａ ｉ ｙ ＳＳＲ ｃ ｉ Ｔｅ ｈｎｏ ｏ ｙ ｌｇ
良种 是 农 业 生 产 发 展 的基 础 ，种 子 真 伪 和纯 度 鉴定 对 作 物 和蔬 菜生 产 具有 重 要 意 义 。郭健 等 …
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SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究 随着我国农业经济的发展和种子市场的逐步规范，种子的真假和纯度对种子生产具有越来越重要的影响。
下面是编辑老师为大家准备的SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究。
为了保护农民以及育种者的利益，发展快速、稳定、可靠的品种纯度鉴定方法具有重要的意义。
种子品种纯度鉴定主要包括品种真实性和品种纯度鉴定两个方面。
品种鉴定主要指对供检样品的真实性进行鉴定。
品种纯度就是对品种的一致性进行分析。
种子纯度是种子质量的核心指标，是衡量种子质量的主要标准，种子纯度的高低对农业生产的产量和品质有较大的影响，因此在种子生产、加工、贮藏和经营贸易中有重要的意义，历来受到种子管理部门、种子生产者和用种者的密切关注。
品种纯度检验的方法很多，有籽粒形态鉴定，幼苗鉴定，蛋白质电泳鉴定和田间小区种植鉴定等[1]，但这些方法均有不足之处。
籽粒形态鉴定可以鉴别性状差异明显的，但这种差异性状较少，准确性差;幼苗鉴定适用于性状表现差异较大的品种，能够鉴定的品种少;蛋白质电泳由于遗传种质资源的狭窄，品种间的差异越来越小，难以鉴定。
纯度鉴定最可靠的方法是田间小区种植鉴定，但是这种方法需要一个生长季节，时间较长，耗费较多的人力物力。
而且上述方法受人为因素的影响较大，导致检测结果产生误差。
为了克服这些缺陷，人们不断地探索新的方法。
随着科学技术的进步，分子生物技术逐渐应用于品种纯度的检验，以遗传物质DNA 为基础的分子标记技术也逐渐受到人们的亲睐。
DNA分子标记技术本质上是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段[2]，由于其快速、准确、可靠、不受环境因素的影响，越来越多地被应用到种子纯度检测中。
SSR是近年来发展起来的一种DNA分子遗传标记技术，是建立在PCR(Polymerase Chain Reaction)基础上的，在植物基因组中的应用非常活跃，已被广泛应用于基因定位，种子进化及遗传多样性的研究[3]。
SSR和ISSR分子标记及其在植物遗传育种研究中的应用
文章编号:1000-1573(2002)01-0090-05SSR 和ISSR 分子标记及其在植物遗传育种研究中的应用张立荣,徐大庆,刘大群(河北农业大学植保学院,河北保定071001)摘要:SSR(Si mple Seq uence Repeat)和ISSR (Inter-Si mple Seq uence Repeat)技术是在PCR 基础上发展起来的两种DNA 多态性检测技术,已开始应用于基因组研究的各个领域。
概述了SSR 、ISSR 反应的原理、特点,总结了其在植物亲缘关系和遗传多态性研究、DNA 指纹库的建立、遗传图谱的构建和基因定位及分子标记辅助育种等方面的应用,并肯定了SSR 、ISSR 在植物遗传育种领域的广阔应用前景。
关键词:SSR;ISSR;分子标记;遗传育种中图分类号:S 435 文献标识码:ASSR marker,ISSR marker and their applicationto plant genetics and breedingZHAN G L -i rong,XU Da -qing,LIU Da -qun(College of Plant Protection,Agricultural University of Hebei,Baoding 071001,China)Abstract:Simple sequence repeats (SSR)and Inter-simple sequence repeats (ISSR)are two kinds of DNA markers based on the polymerase chain reaction (PCR).They have been applied in many aspects of genome re -search.This paper has clarified the theories and characteristics of SSR as well as ISSR.The authers also sum -marized their applications in genetic polymorphisim and genetic relationship,establishment of DNA fingerprinting pool,construction of genetic map,gene localization and marker-aided selection.The two methods of DNA ec -ular marker open up broad prospec ts for the studies of plant genetics and breeding.Key words:SSR;ISSR;molecular marker;genetics breeding近年来,分子标记的研究与利用得到了迅速的发展。
醇溶蛋白法和SSR标记法检测小麦种子纯度的比较
写一篇醇溶蛋白法和SSR标记法检测小麦种子纯度的比较的
报告，600字
由于醇溶蛋白法和SSR标记法是常用的小麦种子纯度检测方法，本文对它们进行了比较。
醇溶蛋白法是一种可以用来检测小麦种子纯度的常用方法。
该方法在某种程度上可以反映小麦品种之间的遗传距离。
它基于醇溶抑制剂能够通过蛋白质降解抑制蛋白质的原理，利用各品种小麦蛋白质的稳定性差异，进行小麦品种鉴定或种类检测，纯度也可以检测出来。
该方法直接测定小麦种子中蛋白质的降解差异，可以比较具体细微，准确度也比较高，所以一般用于小麦品种纯度检测。
此外，SSR标记法也是常用的小麦种子纯度检测方法。
SSR标记法是另一种利用微卫星标记快速检测小麦品种鉴定和品种混合情况的技术。
首先根据种内染色体的显著性特征，筛选出不同的微卫星标记。
采用PCR并跟踪分子标记，从而研究小麦多样性，以及纯度的研究。
另外，SSR标记也可以检测小麦种子纯度，其准确度也很高。
综上所述，醇溶蛋白法和SSR标记法都是有效的检测小麦种子纯度的方法。
它们都具有较高的准确性和特异性，但醇溶蛋白法的抗性要高于SSR标记法。
因此，两种检测方法在小麦种子纯度检测中都十分有用。
利用分子标记辅助育种
利用分子标记辅助育种一、分子标记辅助育种概述分子标记辅助育种是现代生物技术与传统育种方法相结合的一种高效育种技术。
它利用分子标记与目标基因紧密连锁的特性，在作物育种过程中对目标基因进行追踪和选择，从而显著提高育种效率和准确性。
随着分子生物学技术的不断发展，分子标记辅助育种已成为作物遗传改良的重要手段，在农业生产中发挥着越来越重要的作用。
二、分子标记辅助育种的关键技术1. 分子标记类型- SSR标记（简单重复序列标记）：SSR标记具有多态性高、共显性遗传、重复性好等优点。
其核心是由1 - 6个核苷酸组成的简单重复序列，广泛分布于基因组中。
通过设计特异性引物对SSR区域进行扩增，根据扩增产物的长度多态性来检测个体间的差异。
例如，在水稻育种中，利用SSR 标记可以有效区分不同品种的水稻，为品种鉴定和纯度检测提供了可靠的方法。
- SNP标记（单核苷酸多态性标记）：SNP标记是基因组中单个核苷酸的变异，是最常见的遗传变异类型。
它具有数量多、分布广泛、检测通量高的特点。
SNP标记的检测方法包括基于PCR的方法、芯片技术和新一代测序技术等。
在玉米育种中，SNP标记已被广泛应用于全基因组关联分析（GWAS），用于挖掘与重要农艺性状相关的基因位点，为分子标记辅助选择提供了丰富的标记资源。
- AFLP标记（扩增片段长度多态性标记）：AFLP标记结合了RFLP（限制性片段长度多态性）和PCR技术的优点，具有较高的多态性检测效率。
其原理是通过对基因组DNA进行限制性内切酶酶切，然后连接特定的接头，再进行选择性扩增。
扩增产物通过电泳分离，根据片段长度多态性来分析遗传差异。
在小麦育种中，AFLP标记可用于构建遗传连锁图谱，定位控制小麦抗病性、品质等性状的基因。
2. 目标基因定位与克隆- 连锁分析：连锁分析是通过研究标记与目标基因在染色体上的连锁关系来定位目标基因的方法。
当标记与目标基因紧密连锁时，它们在遗传过程中倾向于一起传递。
SSR分子标记技术在草品种鉴定中的应用探讨
SSR分子标记技术在草品种鉴定中的应用探讨高 秋1 王 杰2 马金星1 孙 娟2（1农业部全国草业产品质量监督检验测试中心，北京 100125；2青岛农业大学，山东青岛 266109）摘要：SSR是一种用于植物品种鉴定的分子标记技术，随着草业的发展和草种市场的完善，SSR分子标记技术也逐渐应用于草品种鉴定中，在草种检验和草种市场监管中具有巨大的潜力。
本文综述了SSR分子标记技术原理及其在植物品种鉴定和建立植物品种指纹图谱库等方面的应用现状，并进一步对SSR在草品种鉴定领域应用中存在的问题及原因进行了分析与探讨。
关键词：SSR分子标记；指纹图谱；品种鉴定；草品种简单重复序列SSR（simple sequence repeat），又被称为微卫星DNA（microsatellite DNA），是指一类由1~5个核苷酸为重复单位构成的长达几十个核苷酸的串联重复序列[1]。
在人和动物中的微卫星重复基元主要是（AC）n，而在植物中最丰富的重复基元是（AT）n[2]。
研究发现微卫星DNA 两侧的序列多为保守的单拷贝序列[2]，根据这个原理将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序，使用其互补序列设计位点专一的引物，以总基因组为模版进行PCR扩增。
由于核心序列串联重复数目不同，PCR产物扩增产物具有长度多态性。
将扩增产物经变型聚丙烯酰胺凝胶分离，用核酸银染、荧光技术或放射自显影进行检测，即得到SSR多态性图谱[3]。
SSR分子标记具有可区别纯/杂合位点、扩增位点多态性高、可检测位点遍布全基因组的特点，且该技术试验操作程序性强、扩增时DNA质量和数量要求低、结果稳定、专有引物设计便于实验室间交流。
鉴于以上特点，SSR分子标记技术被广泛应用于植物品种鉴定和植物品种指纹图谱构建等领域中。
1 种子品种鉴定方法种子品种鉴定在种子质量检测工作中被列为最重要的检测项目之一，检测内容是比对送验样品与所标示的种或品种是否相符。
近年来随着种子贸易市场的繁荣，种子交易量不断攀升，个别经营者为了追求经济效益罔顾种子质量和消费者的权益，使用假种子和劣基金项目：国家草品种审定区域试验通信作者：马金星种子进行掺杂使假，不仅给国家和消费者造成经济损失，还导致种子市场上品种混乱，真假难辨，真正的优良品种得不到有效保护，育种者的权益也得不到有效维护。
小麦种质系山农495的鉴定及其矮秆基因的SSR标记的开题报告
小麦种质系山农495的鉴定及其矮秆基因的SSR标
记的开题报告
一、研究背景及意义
小麦是全球重要粮食作物之一，其种质资源的丰富性和多样性对于小麦品种的改良具有重要意义。
山农495是一种新的小麦品种，具有矮秆、高产、抗倒伏等优点，在育种中有着广泛的应用价值。
然而目前对山农495的鉴定和矮秆基因缺乏深入研究，需要进行系统研究和探索。
二、研究目的
本研究旨在对小麦种质系山农495进行鉴定，并通过SSR标记探究其矮秆基因的遗传特征和遗传规律，从而为小麦品种的优化和改良提供理论依据和实践指导。
三、研究内容及方法
1.山农495的鉴定
根据小麦种质鉴定标准，对山农495的生长习性、植株性状、穗形特征、籽粒形态等进行观测和记录，同时借助分子标记技术进行分析和鉴定。
2.矮秆基因的SSR标记
通过对山农495与矮秆亲本、高秆亲本进行杂交后代的表型观测和分子标记技术的分析，筛选出与矮秆基因相关的SSR标记，并探究其在遗传传递中的遗传规律和特征。
四、预期结果及意义
通过对山农495的鉴定和矮秆基因的SSR标记分析，可以及时发现其生长特点和遗传规律，为小麦品种的选育提供理论基础和实践指导。
同时，可以拓展小麦种质资源的种类和数量，保护和利用小麦遗传资源，为保障粮食安全和农业可持续发展提供支持。
应用SSR分子标记分析小麦品种(系)的遗传重组
作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2013, 39(2): 238−248 /zwxb/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@本研究由国家科技支撑计划项目(2011BAD07B02), 河南省重大科技专项(111100110100)和国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2009AA101102)资助。
*通讯作者(Corresponding author): 茹振钢, E-mail: rzgh58@第一作者联系方式: E-mail: lxj227@Received(收稿日期): 2012-07-30; Accepted(接受日期): 2012-10-09; Published online(网络出版日期): 2012-12-11. URL: /kcms/detail/11.1809.S.20121211.1739.022.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2013.00238应用SSR 分子标记分析小麦品种(系)的遗传重组李小军 冯素伟 李 淦 董 娜 陈向东 宋 杰 茹振钢*河南科技学院小麦中心 / 河南省高校作物分子育种重点开放实验室, 河南新乡453003摘 要: 为了解小麦品种形成中亲本基因组的遗传重组和遗传保留区段的分布特点, 对周麦18和百农AK58及其衍生品系共23个材料进行了全基因组SSR 扫描分析。
遗传重组分析表明, 单交组合的平均重组数(12.3)低于回交组合(13.9); 染色体4A 、5A 、7A 、1B 、3B 、4B 、7B 、1D 、2D 、3D 、5D 、6D 和7D 重组发生较多, 其余染色体重组相对较少, 染色体的中间区段与远端区段重组数相当, 分别为6.1和6.0。
子代间基因组比较发现, 一些染色体区段成为重组的多发区, 如5D 的gwm358–wmc357、6D 的cfd49–barc196、7A 的wmc158–barc23和7B 的gwm274–gwm146区段, 分别有35、19、15和14次重组。
利用SSR标记进行中国小麦品种鉴定的研究
本研究 的主 要 目的是 对 一批 中 国 育 成 小 麦 品种 （ ） ＳＲ标记 的多态 性进行 分 析 ， 系 中 Ｓ 建立 这 些 品种在
一
小 麦 品种 鉴定 方法包 括实验 室鉴定 和 田间鉴定 两
种 。现 有 的小 麦 品种 室 内鉴定方 法 主要是 种子 醇溶 蛋 白电泳 法和麦 谷蛋 白高分 子量亚 基 电泳法 。由于蛋 白 质 是基 因 的产 物 ， 型 不 多 ， 类 多态 性 水 平 较低 ， 于小 对
高 为 ０ ８３９（ ｗ ７ ， 低 为 ０ ６５２（ｗ ８ ） 平 均 为 ． ７ ｇ ｍ １４） 最 ． ５ ｇ ｍ １６ ，
０７ ６８ ．９ 。仅 利 用 少数 几 对 高 ＰＣ值 的 Ｓ Ｒ 引 物 ， 够 将 全 部 Ｉ Ｓ 能
７ 份品种（ 区分 开， １ 系） 供试 材料 间至 少有 一对 等位基 因的差
异 。并 对 Ｓ Ｒ标 记 应 用 于 小 麦 品种 鉴 定 的 可行 性 进 行 了 讨论 。 Ｓ
关键词 ： 小麦 ；品种鉴定 ； Ｓ Ｓ Ｒ；等位基 因大小
中图 分 类 号 ： ｓ １． ５２ １ 文献标志码 ： Ａ
文 章 编 号 ： １０ －７５ ２０ ）２０ ９ －６ ０ １ ０ （０ ８ ０ － １ ４ ０ ０
间鉴 定方 法是最 可靠 的鉴 定 方 法 。然 而 ， 田间鉴 定 方
共 选用 我 国小 麦 育 成 品 种 （ ） １份 ， 系 ７ 主要 为 ２ Ｏ 世纪 ５ Ｏ年代 至 ９ Ｏ年 代 选育 出 的品 种 ， 部分 为 不 同 大
时期生 产上 的主栽 品种 。从 地 域 上 看 ， 要来 自黄淮 主
麦这类 生产上 应用 的 品种 数 量很 大 的作 物 ， 内鉴定 室
SSR分子标记及其在农作物育种中的应用
Ｓ Ｒ分 子标 记及 其在 农 作 物 育种 中的应 用 Ｓ
汪 由 １吴 禹 １李 兆波 王 岩 ， ， ， ， 王光 霞
（． １ 辽宁省农业科学院 创新 中心 ， 沈阳 １０ ６ ；． １ １ １２沈阳市 东陵区白塔街道 办事处 ， 沈阳 １０ ６ ） １ １７ 摘要 ： 在概述简单重复序列 （ｓ ） ｓ Ｒ 标记 的发现过程 、 结构特征 、 理和方法 、 原 技术优缺点 的基础上 ， 详细介绍此技术在遗传多样性 、 Ｄ Ａ指纹库 、 Ｎ 遗传 图谱构建 和基 因定 位及分子标记辅助选择等研究上 的应用情 况 ， 分析 了 Ｓ Ｒ技术在农作物育种领域 的广阔 并 Ｓ
每个 反应 ）质 量低 ， Ｓ Ｒ标 记 的可 重 复性 好 ， 作 、 且 Ｓ 操 技术难 度低 ：在理 论上 ，Ｓ ＳＲ标记 是一 种单 一基 用 限 制
性 内切 酶或超 声波处 理获得 Ｄ Ａ片段 ． Ｎ 并将 Ｄ Ａ片 Ｎ
了一种 新 的分 子 标记 方法— —Ｓ Ｒ分子标 记 ［］ Ｓ 。
１２ Ｓ Ｒ标 记的 原理 和方 法 ． Ｓ
人 类遗 传 学家 Ｌｔ和 Ｌ ｔ ｉ ｔ ｕｙ在心 肌 肌动 蛋 白基 因 中发
现 了一 种 （ Ｇ） 核 苷 酸重 复 。 Ｔ ｎ二 首次 提 出了 “ 卫 星 微
收 稿 日期 ：０ ０ ０ — ４ ２ １— ９ ２
术 建立 的 Ｓ Ｒ引 物设 计技 术 。其 过程 为 ：以基 因组 Ｓ Ｄ Ａ为模 板 ．用 ５ 锚定 简并 Ｓ Ｒ引物 对其 扩增 ， Ｎ Ｓ 得
到 的产物 连进 Ｔ 载体 ． 一 然后 对 克隆直 接测 序 ， 据测 根
序结 果设计 引物 ［］ “。
应用前景 。
关键词 ： 传多样性 ； Ｎ 遗 Ｄ Ａ指纹库 ； 遗传图谱构建 ； 因定位 ； 基 分子标记辅助选择 中图分类号 ： ９ ３ Ｑ ４ 文献标识码 ： Ａ 文章编 号 ：６ ４ １６ （０ １ ２ ０ １ — ５ １７ — １ １ １ ） — ０ ７ ０ ２ ｏ
小麦主推品种‘百农207’和‘百旱207’表型比较与分子标记分析
小麦主推品种‘百农207’和‘百旱207’表型比较与分子标记分析徐鑫;付庆云;袁嘉微;孙京京;余海鋆;孙国鹏;李小军【期刊名称】《河北农业大学学报》【年(卷),期】2024(47)3【摘要】‘百农207’是目前黄淮南部麦区及河南省大面积种植的小麦品种。
本试验利用表型、品质性状及分布于小麦全基因组的SSR和STS分子标记对‘百农207’及其系选品种‘百旱207’进行比较分析,以期为小麦育种亲本选配及新品种培育提供参考。
分析结果表明,‘百农207’的株高(70.33 cm)显著低于‘百旱207’(79.17 cm);‘百农207’的穗粒数(49.88粒)、可育小穗数(21.50个)和总小穗数(23.67个)均高于‘百旱207’,但后者的千粒重(44.48 g)高于前者(37.24 g);‘百农207’的籽粒粗蛋白含量、湿面筋含量、淀粉含量、沉降值、出粉率及硬度指数均显著高于‘百旱207’。
分子标记检测结果表明,485对引物中仅有62(12.8%)对在‘百农207’和‘百旱207’间存在差异,其中基因组SSR、EST-SSR和STS引物分别有46、3和13对。
2个品种在D基因组的多态引物比例最高(21.3%),A和B基因组的多态引物比例基本一致(分别为11.5%和11.4%)。
进一步分析它们在7个部分同源群及染色体水平的遗传差异,发现二者在第1、3和5部分同源群多态引物比例相对较高,分别为16.0%、16.3%和16.9%,而二者在7D 染色体的遗传差异最大,多态引物比例达到50.0%。
‘百农207’和‘百旱207’差异的染色体位点可能与品种具有的优良特性密切相关。
【总页数】6页(P10-15)【作者】徐鑫;付庆云;袁嘉微;孙京京;余海鋆;孙国鹏;李小军【作者单位】新乡学院生物工程学院;河南科技学院农学院【正文语种】中文【中图分类】S512.11【相关文献】1.高产小麦新品种百农207及其姊妹系的基因组构成分析2.小麦品种百农207最佳种植密度与施肥量研究3.不同播期下小麦品种百农207越冬期生理生化特性4.干旱胁迫对小麦品种百农207叶片生理特性的影响5.小麦品种百农207超高产栽培技术示范因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
小麦品种纯度鉴定ssr分子标记法
小麦品种纯度鉴定ssr分子标记法
小麦品种纯度鉴定是指通过分子标记技术来确定小麦品种的纯度和遗传背景。
SSR（Simple Sequence Repeat）分子标记法是一种常用的分子标记技术，通过检测DNA中的微卫星序列来进行分析。
下面我会从多个角度来回答这个问题。
首先，SSR分子标记法的原理是利用PCR扩增技朧，通过特定引物扩增目标微卫星序列，然后利用聚丙烯酰胺凝胶电泳等方法对扩增产物进行分离和检测。
这种方法能够检测DNA序列中的微卫星重复序列，因为不同品种的小麦在微卫星序列上会存在差异，通过分析这些差异可以确定品种的纯度和遗传背景。
其次，利用SSR分子标记法进行小麦品种纯度鉴定的过程一般包括DNA提取、PCR扩增、电泳分离和数据分析等步骤。
首先是DNA 提取，从待测小麦品种的叶片或种子中提取DNA样品；然后是PCR 扩增，使用特定的微卫星引物对DNA样品进行PCR扩增，产生特定长度的DNA片段；接着是电泳分离，将PCR产物经过聚丙烯酰胺凝胶电泳，根据片段大小进行分离；最后是数据分析，根据电泳图谱分析PCR产物的特征，来确定小麦品种的纯度和遗传背景。
此外，SSR分子标记法在小麦品种纯度鉴定中具有高度的灵敏性和重复性，能够对小麦品种进行准确的鉴定和分类。
通过对小麦品种进行SSR分子标记分析，可以帮助农业科研人员和育种者确定小麦品种的亲缘关系、纯度和遗传特征，为小麦品种改良和种质资源保护提供重要依据。
综上所述，SSR分子标记法在小麦品种纯度鉴定中发挥着重要作用，通过对小麦品种的DNA序列进行分析，可以准确地确定其纯度和遗传背景，为小麦育种和种质资源管理提供科学依据。
利用SSR分子标记构建小麦遗传图谱
利用SSR分子标记构建小麦遗传图谱张帆;臧明丽【摘要】通过对小麦品种"明优633"和"A14"杂交所得142个F2群体进行SSR标记分析,应用Icimapping软件和SSR分子标记技术构建了遗传图谱,共用了126个标记,遗传连锁图总长度为1773.2cm,平均每条染色体连锁图长84.44cm,标记间平均遗传距离为14.07cm,标记图谱覆盖小麦21条染色体,为小麦重要农艺性状QTL打下基础,并为分子标记辅助育种提供可用的分子标记.【期刊名称】《南方农机》【年(卷),期】2017(048)016【总页数】3页(P1-3)【关键词】小麦;SSR标记;连锁图谱【作者】张帆;臧明丽【作者单位】信阳学院,河南信阳 464000;信阳学院,河南信阳 464000【正文语种】中文【中图分类】S512.1小麦遗传图谱的构建是进行染色体分析和表型性状基因定位的基础[1]。
传统的连锁图谱大多是依据形态，生理生化等标记来进行绘制的，然而这些标记数量较少，图谱覆盖率低。
随着近些年分子标记的开发应用，遗传图谱的绘制也随着迅速发展，现在RFLP遗传图谱在各作物中基本绘制完成。
遗传连锁图可以为小麦重要农艺性状QTL打下基础，并为分子标记辅助育种提供可用的分子标记。
目前被广泛开发和利用的分子标记主要有：SSR技术、SNP技术、RFLP技术、RAPD技术、AFLP技术、EST技术等。
文章使用的SSR技术即简单序列重复技术，被认为是RFLP之后第二代分子标记，具有比RFLP高很多的多态性。
与其它几种技术相比其对DNA纯度要求不高，且实验的重复性和稳定性很高[2]，SSR分子标记在染色体中随机分布，所以被广泛应用在小麦的分子育种中[3]。
另外，也可以应用于基因定位及克隆、亲缘分析、品种鉴定和进化研究等领域[4]。
小麦是全球第三大粮食作物，虽然已报道了很多小麦的分子标记，但是与农艺性状相关的很多是非功能标记。
小麦品种纯度鉴定ssr分子标记法
小麦品种纯度鉴定ssr分子标记法
小麦品种纯度鉴定是指通过分子标记技术对小麦品种的遗传纯
度进行鉴定。
SSR（Simple Sequence Repeat）分子标记法是一种常
用的分子标记技朮，也称为微卫星分子标记。
下面我将从几个方面
来详细介绍小麦品种纯度鉴定SSR分子标记法。
首先，SSR分子标记法的原理是利用DNA序列中的微卫星序列
进行分子标记。
微卫星是DNA序列中短重复的核苷酸序列，它们在
基因组中存在广泛且具有高度多态性。
通过PCR扩增和电泳分析，
可以检测微卫星位点的多态性，从而对不同小麦品种进行鉴定。
其次，小麦品种纯度鉴定SSR分子标记法的步骤包括DNA提取、PCR扩增、电泳分析和数据解读。
首先是DNA提取，从不同小麦品
种的叶片或种子中提取DNA样品；然后进行PCR扩增，利用特定的
微卫星引物对DNA进行扩增，得到特定微卫星位点的DNA片段；接
下来是电泳分析，将PCR产物进行电泳分离，根据片段大小进行鉴定；最后是数据解读，根据电泳图谱分析不同小麦品种的微卫星位
点多态性，从而判断它们的遗传纯度。
另外，SSR分子标记法具有高度多态性、重复性强、稳定可靠
等特点，可以对小麦品种进行高效的鉴定。
通过分析不同小麦品种
的微卫星位点多态性，可以快速、准确地鉴定小麦品种的遗传纯度，为小麦育种和品种纯度管理提供重要的技术支持。
综上所述，小麦品种纯度鉴定SSR分子标记法是一种有效的分
子标记技朮，通过对小麦品种的微卫星位点多态性进行分析，可以
实现对小麦品种遗传纯度的准确鉴定，为小麦育种和种质资源管理
提供重要的技术手段。
82份春小麦种质资源遗传多样性的SSR分析
82份春小麦种质资源遗传多样性的SSR分析王小国;梁红艳;张薇【摘要】利用41对SSR引物对82份春小麦种质资源进行遗传多样性分析.供试引物的平均等位位点数为10.93个,引物多样性指数(Hj)变异为0.251 2～2.995 8,多态性信息量(PIC)为0.676 534～0.950 860;选用Xgwm、DP、Wmc和Xbarc 4个系列的SSR引物,不同类型SSR引物的多态信息含量、多样性指数、平均等位位点数间有较大差异.表明,选用合适的引物类型,对遗传多样性研究有重要的意义；在遗传距离0.39处,供试材料通过SSR标记聚类分析可被分成7个大类19个亚类.【期刊名称】《西北农业学报》【年(卷),期】2013(022)001【总页数】7页(P34-40)【关键词】春小麦;遗传多样性;SSR【作者】王小国;梁红艳;张薇【作者单位】石河子大学农学院,新疆石河子832003;三门峡职业技术学院生化工程系,河南三门峡472000;三门峡职业技术学院生化工程系,河南三门峡472000;石河子大学农学院,新疆石河子832003【正文语种】中文【中图分类】S512.1+2小麦是世界上最主要的粮食作物之一，小麦优良品种的选育与推广对农业生产作用巨大。
同时，也因采用相同的骨干亲本而使其遗传基础日趋单一化，因此充分了解小麦育成品种的遗传变异程度，即进行小麦遗传多样性研究，对于拓宽小麦新品种遗传基础，改良小麦品质有着重要意义。
SSR标记技术用于遗传多样性分析有很多独特的优点［1－4］。
近年来，中国学者对不同地区小麦种质资源进行SSR遗传多样性分析。
魏育明等［5］对四川小麦地方品种和主栽品种SSR多态性进行了比较，耿惠敏等［6］利用小麦基因组的43个SSR标记对40个河南省审定的小麦品种进行遗传多样性研究，徐如虹等［7］采用微卫星分子标记对贵州省30个小麦品系的遗传多样性进行研究，但未见对新疆春小麦进行SSR遗传多样性分析的报道。
利用SSR标记区别小麦品种种子混杂和SSR位点不纯的研究
分 子植 物 育 种 ，０ ６年 ， ４卷 ， ４期 ， ５ ３５ ９页 ２０ 第 第 第 １— １
Ｍ ｏｌｃ ａ ａ ｅ ｄｉ ， ０６， ｅ ｕｌｒＰｌｎｔＢｒ ｅ ｎｇ ２０ Ｖｏ１ Ｎ ｏ４， ３ ． ４， ． ５１ —５１ ９
ｗ ｄａｒｌ ｉｅ ｎｉ ｅ ｗ ｈ ｎ ｍｅ ａ ｙＳ Ｒ ｍａｋ ｒ． ｅｒｌ ａ （） ｅ ｅａ Ｓ Ｒ ｌｃ ｓｏ ｌ ｅ ｅｔ ｒ ａ ｅ ｏｄｆ ｒ ｔ ｔ ｏｐ ｅｏ ｎ Ｓ ｒ ｅｓＴ ｅｉｔ ｔ １ Ｓ ｖｒｌ Ｓ ｉｈ ｕｄ ｓ ｄ ｏ ｔ ｅ ａ ｔ ｂ ｈ ｏ ｓｈ ， ｏ ｂｔ ｅ ｗ ｅ ｅｔ ｇ ｅ ｕｉ ｏ ｓｅ ｉ ｗ ｅ ｔ（）ｆ ｅ ｅａ Ｓ Ｒｌｃ ｏ ａ ｉ ｖｄ ｌ ｅ ｆ ｅｔ ｏ ｔｅ ｅｔｄ ｕｔ ｈ ｎｔ ｉ ｔ ｐ ｒ ｆ ｅｄ ｎ ｈ ａ．２ Ｉｓｖｒｌ Ｓ ｏ ｉ ｆ ｎ ｉ ｕ ａ ｄ ｅ ｎ ｆ ｍ ｈ ｔｓ ｌ・ ｓ ｈ ｎ ｙ ｔ ｓ ｎ ｄ ａ ｒ ｉ ｒ ｒ ｉ ｅｃ ｉ Ｖ ， ｅ ｄｖｄ ａ ｉｃ ｎｉｅｅ ｒａｉｏ ｓ ｌ ｔ ３ Ａ ｅ ｉ ｎ ｔ ｇｆｒ ｉｏ ｓ ｄｖｄ ｌ ｔｅｏ ｅ — ｒ ｈ ｉ ａ Ｓｔ ｉｉ ｕ ｌｓ ｏ ｓ ｒｄ ｓ ａｒｇｎ ｕ ａ ．（） ｆ ｒ ｌ ａｉ ｍｇｎ ｕ ｉｉ ｕ ｓｈ ｔ ｒ ｎ ｄ ａｆ ｐｎ ｔ ｅ ｍｉ ｎ ａ ｎ ｉ ａ ， ｈ ｉ ｎ
在 检测 小麦 种 子纯度 时 ， 需要 注 意区 别种 子混 杂和 Ｓ Ｒ位 点不纯 ， Ｓ 以免将 Ｓ Ｒ位 点不纯 造 成 的株 间 带型 差 Ｓ
异 误认 为 是种子 混 杂 ， 原则 是 ：１必 须进 行 多个 Ｓ Ｒ位 点 的检测 ； ） 单株 的多个 Ｓ Ｒ位 点 的带 型与 被 其 （） Ｓ （ 某 ２ Ｓ
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收稿日期:2007-05-16作者简介:李汝玉(1966-),男,研究员,主要从事新品种保护测试研究。
山东农业科学Shandong Agr icultural Sciences 2007年 第6期利用SSR 标记进行小麦品种鉴定和新品种保护研究李汝玉,李 群,张文兰,张 晗,宋国安,王东建(山东省农业科学院作物研究所,山东济南 250100)摘 要:利用变性聚丙烯酰胺电泳结合银染技术,检测了8个SSR 位点在71份中国育成小麦品种(系)中的多态性,确定了各SSR 位点上等位基因的大小。
在71份小麦品种(系)中,共检测到等位基因75个,每对引物检测到的等位基因个数最少为6个(gw m186),最多为15个(g wm174),平均9 4个。
P IC 值最高为0 8739(gw m174),最低为0 6552(gw m186),平均为0 7968。
利用少数几对高P IC 值的SSR 引物,能够将全部71份品种(系)区分开来,供试材料间至少有一对等位基因存在差异。
对SSR 标记应用于小麦品种鉴定和品种保护的可行性进行了讨论。
关键词:小麦;SSR 标记;品种鉴定;新品种保护中图分类号:S512 1+1;Q789 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2007)06-0014-04Application of SSR Markers to Identificationand Protection of Wheat VarietyLI Ru yu,LI Q un,ZH ANG Wen lan,ZH ANG H an,SONG Guo an,WANG Dong jian(Cr op Res ear ch I nstitute ,S hand ong A cademy of A gr icultur al S ciences ,J inan 250100,China)Abstract In this study ,the diversity and size of allele at 8SSR loci am ong 71Chinese w inter w heat cultivars (lines)w ere determined using denaturing PAGE and silver staining 75alleles in total w ere detected,ranging from 6(g w m186)to 15(gw m174)per primer w ith the average of 9 4 The PIC values of the SSR loci varied from the lo w est o f 0 6552(gw m186)to the highest of 0 8739(gw m174)and averaged 0 7968 Genotypes of each variety consisting of allele sizes at 8SSR loci w ere established All the 71cultivars (lines)could be uniquely identified and distinguished from each other using the 8SSR markers,and there w ere at least one allele different fr om each other SSR markers ar e especially suitable for identifying w heat cultivars (lines)developed thro ug h conventional hy brid ization breeding m ethodsKey word Wheat;SSR Variety identification;New v ariety pro tection 我国于1999年开始实行植物新品种保护制度,是国际植物新品种保护联盟(U POV)成员国。
根据 国际植物新品种保护公约 和我国 植物新品种保护条例 的要求,申请获得品种权的前提之一是必须具备特异性(Distinctness)、一致性(U nifo rmity)和稳定性(Stability)。
其中最重要的是特异性,即申请品种必须明显不同于同一物种内所有已知品种。
品种的特异性测试目前主要采用形态学鉴定方法,在作物田间生长不同阶段,通过对大量形态学性状进行调查统计,鉴别鉴定不同品种。
该方法存在下列不足:首先,鉴定周期长,费用高,一般需要两个生长季节;其次,形态学方法所调查性状大多属数量性状,由微效多基因控制,容易受环境影响;第三,由于现代育种中新品种多由数量有限的一些优良品种作亲本杂交育成,新品种遗传基础狭窄,品种之间的形态学差异越来越小,造成可供品种鉴定利用的形态性状不足,增加了品种鉴定的困难。
SSR 分子标记的一个重要潜在应用领域是品种鉴定和品种产权保护。
在小麦方面,Plasch14ke等[1]利用23个SSR可以将除一对姊妹系以外的40份小麦品种(主要为亲缘关系较近的欧洲小麦品种)区分开。
H uang等[2]发现,利用24个SSR标记可以区分来自68个国家的998份六倍体小麦材料。
关于利用SSR标记鉴定中国小麦品种的研究很少。
高睦枪等[3]利用53对SSR引物对全国1999~2000年北方冬麦区及黄淮冬麦区观察谱中选出的48个新品种(系)进行了遗传差异研究,发现利用5个多态性高的SSR标记可以将48个小麦新品种(系)鉴定开。
目前,国际上利用SSR标记进行品种鉴定和品种产权保护的工作正在进入实用阶段[4,5]。
为便于品种间的比较,要求测试数据易于保存、处理和交流。
利用SSR标记多态性高的特点,确定品种在一组SSR位点上的等位基因大小,建立一类作物所有已知品种的SSR基因型数据库。
通过比较申请品种和已知品种在这些位点上的基因型的差异,即能够鉴定申请品种的特异性。
目前国内尚未有这方面的研究报道。
本研究的主要目的是对一批中国育成小麦品种(系)中SSR标记的多态性进行研究,对SSR 分子标记技术应用于中国小麦品种鉴定和品种权保护的可行性作出评价。
1 材料与方法1 1 小麦品种(系)共选用我国育成小麦品种(系)71份,主要为我国20世纪50年代至90年代间选育出的品种,其中大部分品种为不同时期生产上的主栽品种。
从地域上看,主要来自黄淮冬麦区,以山东省选育的品种(系)为主,部分来自北方冬麦区。
所有供试材料由山东省农业科学院作物研究所小麦种质资源库提供。
供试材料详见表1。
1 2 引物根据有关文献[1,6]选择了gw m46、g wm174、gw m186、gw m325、gw m577、gw m099、g w m437和gw m443共8对多态性强的小麦SSR位点引物,由宝生物工程(大连)公司按提供的引物序列合成。
1 3 SSR位点等位基因大小计算DNA提取、PCR扩增、变性胶电泳、银染和SSR位点等位基因大小计算等同李汝玉等[7]的方法。
1 4 多态性信息量的计算按照Anderson等[8]的方法。
同一SSR引物扩增出几个片段且位点个数不明的情况,仍作为一个位点计算PIC值,无效等位基因(null allele)作为一个等位基因计算PIC值。
1 5 品种间SSR基因型的比较利用微软Access2000软件,以参试品种为记录,以各SSR位点的等位基因大小为字段构建一个数据库表,对字段进行排序。
2 结果与分析2 1 等位基因大小估算结果和不同SSR位点的多态性本研究利用8对引物对71份小麦品种(系)进行了扩增,依据拟合的分子量标准DNA多项式曲线方程[14],对供试材料8个SSR位点上的扩增片段(等位基因)大小进行了估算。
结果列于表1。
gw m46、g w m099、g w m186、gw m325和gw m443对所有品种均能扩增,估算了这些位点上71份品种(系)的等位基因大小。
g wm437、gw m577分别有26个和18个品种无预期大小扩增产物,重复实验仍无法扩增,视为 无效等位基因(null allele) ;g w m174有9个品种扩增产物极弱,无法确定片段大小。
部分引物(g w m46、gw m099、g w m186、gw m437)同时扩增出两个大小不同的等位基因。
gw m174同时扩增出三个等位基因,本研究只估算了其中最小的一个。
在gw m174和gw m443两个位点上,分别只对63份和60份品种进行了等位基因大小估算。
在71份品种(系)中,利用8对引物共检测到等位基因75个(gw m174按1个位点计算),每对引物扩增出的等位基因的个数最少为6个(gw m186),最多为15个(g w m174),平均每对引物为9 4个(表2)。
为衡量不同引物的品种鉴别力,计算了8对引物的PIC值,结果如表2所示。
在本研究的8对引物中,以gw m174的PIC值最高,为0 8739;其次为gw m437,为0 8419;最低的为g wm186, PIC值为0 6552。
8对引物的平均PIC值为0 7968。
2 2 品种鉴定利用微软Access2000软件,以8个SSR位点的等位基因大小为字段,71个小麦品种(系)为记录建立了一张数据库表。
对数据库表中的字段,即71份品种(系)在8个位点上的等位基因大小进行了升序排列(排序结果略)。
结果表明,7115份品种(系)没有任何两个品种在8个位点上的等位基因大小完全一致。
蚂蚱麦和碧蚂4号、济南16和鲁麦5号两对品种分别在一个位点上有差异(表3)。
表1 71份供试小麦品种(系)及其在8个SSR位点上的等位基因大小(b p)品种编号品种名称SSR位点gwm186gwm577gw m46gwm325gwm437gwm099gwm174gwm4431兰考906-4124nul l*202140nul110182134 2宝麦3号122null*193144104110174128 3莱州953124133202136118110192132 4莱州137122133195/171136102110192122 592-4002-6124133200146null*110200122 6济南16124133171144null*110174124 7济南17122151169140132/10136/110-**122 8稳千1号124165171142null*136/114206128 9935031124135202148102110200130 10956(6)161124165171144null*110174126 11丰优3号122133169144null*110202124 12科星1号124null*202144null*110192124 13川麦27122145171148null*120196132 14鲁麦23122151171140null*136/114174132 15鲁麦14122155195144null*110196122 16山农461122null*193/167136null*110190-** 17莱农9214122155195146122110196120 18D9401122155171138122110196-** 1995(5)5159122133193146122110186130 20烟优361122null*195146null*108-**124 21远丰898122163171138null*110198124 22抗虫1号122163171148122130/108196124 23徐9855122null*171148110110202132 24山农863122155171142null*128192124 25河农859130null*171148122110192120 26偃展1号122135171144null*136/110194128 27中优16130135195144null*110-**132 28周麦13130163171144null*138/114208132 29鲁麦1号122133171144null*110182-** 30鲁麦2号122135200138null*110196120 31鲁麦3号122155169142null*140176-** 32鲁麦4号124null*200/171142null*110-**132 33鲁麦5号124133171144null*138/114174124 34鲁麦6号122133169142104136/110180130 35鲁麦7号124null*202142118110-**124 36鲁麦8号124133202144108132174128 37鲁麦9号124155200138118108188120 38京双10号124137202138104132/114176126 39济南13124null*200148132110176120 40济南14124155169138132110198128 41丰抗10号138/122151202138118/110112194126 42丰抗13号122133200138110122176128 43小偃5号122null*171138102112194134 44泰山4号130171171148102114196132 45丰抗11号140151200138102138192126 46京双1号140151195146110/102138192130 47蚂蚱麦122133169138102110174132续表1品种编号品种名称SSR位点gwm186gwm577gw m46gwm325gwm437gwm099gwm174gwm443 48泰山2号130155202138132/102138/11419213249泰山1号122133/155202136122/10211019613250碧蚂4号12213316913810211019413251碧蚂1号142155200144122/10211019213452小偃6号122null*171138102112-**13253京双9号138151195146110/102140/11019413054冀麦26号122155204142102110-**13255冀麦21号124133198144102110-**12456丰抗8号13815120213810213819212857农大129138133202148122/10411017612658农大235138151202144122/10211417613059农大19813815120013810411417613260丰抗9号138151200142116/102142/11019212861矮孟牛II型142null*200/171146116/10212019412462济旱044122null*204/16914410211019213263泰安836214122155169138132/10411020213264绵P8-351130null*171146null*110-**12265鲁原151122null*202136118/10411019213066临汾10号122null*200146104138-**-**67汝阳瞎半吨124null*198144104108-**12468山农PH82 2 2122null*171138122/10211020813069鲁麦10号122151169148122/102130/112196-**70临汾12122151195138120/104108192-**71山农14427124163171138120/104132174-**注:*表示无效等位基因;**表示扩增不好或未估算等位基因大小表2 不同gw m引物的多态性和PIC值引物gwm186gwm577gwm46gwm174gwm325gwm099gwm437gw m443品种(系)个数7171716071717163等位基因个数61091571198 PIC0 65520 81820 82520 87390 81170 71360 84190 8375 表3 71个小麦品种(系)中SSR基因型最相近的两对品种品种编号品种名称gwm186gwm577gw m46gwm325gwm437gwm099gwm174gwm443 47蚂蚱麦122133169138102110174132 50碧蚂4号1221331691381021101941326济南16124133171144null110174124 33鲁麦5号124133171144null138/114174124 为了进一步研究SSR分子标记的品种鉴别能力,只选用已得到71份品种(系)完整数据的5对引物(gw m46、gw m099、g w m186、g wm325、gw m437)的等位基因数据构建了一张数据库表,进行升序处理后,得到排序结果(未列出)。