双语分子生物学

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老阚班双语分子生物学
题型:填空、名解、选择、判断改错、简答、论述
一、绪论
1.molecular biology(分子生物学):分子生物学是研究核酸、蛋白质等所
有生物大分子的形态、结构特征及其重要性、规律性和相互关系的科学。

2.DNA发现者:James Watson and Francis Crick
DNA发现的实验:图1-1(P7)、图1-2(P8)
3.DNA全称——Deoxyribonucleic Acid
RNA全称——Ribonucleic Acid
4.分子生物学主要研究内容:
◆DNA重组技术
◆基因表达调控研究
◆生物大分子的结构功能研究—结构分子生物学
◆基因组、功能基因组与生物信息学研究
5.DNA recombinant technique(DNA重组技术):是20世纪70年代初
兴起的技术科学,目的是将不同DNA片段按照人们的设计定向连接起
来,在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达,产生影响受体细
胞的新的遗传性状
二、染色体与DNA
1.Nucleosome(核小体):核小体是染色体结构的基本单位、由H2A、H2B、
H3、H4各两个分子生成的八聚体和由大约200bp的DNA组成的。

八聚
体在中间,DNA分子盘绕在外,而H1则在核小体的外面。

每个核小体
只有一个H1。

2.C值反常现象(C-value paradox):C值往往与种系进化的复杂程度不一
致,某些低等生物却具有较大的C值。

3.关于DNA结构的词汇:double–helix(双螺旋)、base(碱基)
sugar-phosphate backbonts(糖-磷酸骨架)、base pairs(碱基对)
right/left-handed double-helix(右/左手双螺旋)
4.DNA类型:右手螺旋:A-DNA,B-DNA
左手螺旋:Z-DNA
5.组蛋白:Octameric core (H2A、H2B、H3、H4)+外围(H1)
6.真核生物重复序列类型:单拷贝、轻度(或低度)重复、中度重复、高
度重复(四个空)
不重复序列、中度重复序列、高度重复序列(三个空)
7.真核生物基因组的特征:
1)真核基因组庞大
2)存在大量的重复序列
3)大部分为非编码序列
4)转录产物为单顺反子
5)断裂基因,有内含子结构
6)存在大量的顺式作用原件
7)具有端粒结构
8)细胞器基因, 转录和翻译在时间和空间上是
不偶联的;
9)有假基因化现象
8.Z-DNA的特点:
1)left-handed double helix with a zig-zag conformation of the
backbone (less smooth than B-DNA)
2)Narrower, more elongated helix than A or B.
3)Only one groove is observed, resembling the minor groove
4) A high G-C content favours Z conformation.
5)Z-DNA formation occurs during transcription of genes, at
transcription start sites near promoters of actively transcribed.
6)Base pairs nearly perpendicular to helix axis
9.DNA复制所需要的元素(Requirements for DNA replication):
1.原料(Precursor):四种脱氧核苷三磷酸
(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)
2.模板(Template):以DNA的两条链为模板链,合成子
代DNA
3.引物(Primer):DNA的合成需要一段RNA链作为引物
4.酶:
a)引物合成酶(引发酶)(Primases)、
b)DNA聚合酶(DNA polymerase)
c)DNA连接酶(Ligases)
d)DNA 拓扑异构酶(DNA Topisomerase)
e)DNA 解螺旋酶/解链酶(DNA helicase)
10.复制的几种方式(Modes of DNA replication):
a)线性DNA双链的复制
b)环状DNA双链的复制:
1)Theta replication
2)Rolling Circle Replication
3) D loop
11.The steps of BER
a)Damaged base
b)DNA glycosylase recognize the damaged base
c)Remove the base by hydrolysis of the N-glycosidic bond
d)The AP endonuclease removes the AP site and neighboring
nucleotides
e)The gap is filled by DNA polymerase I and DNA ligase
12.转座子(transposon, Tn):是存在于染色体DNA上可自主复制和位移
的基因单位
13.转坐(transposition):DNA转座是由可移位因子介导的遗传物质重
排现象, 又称移位。

14.Genetic effects of transposition:
i.插入突变
ii.新基因的产生
iii.染色体畸变
iv.生物进化
三、转录
1.Promoter(启动子):与基因表达启动相关的顺式作用原件,是结构基因
的重要成份。

它是一段位于转录起始位点的5端上游区大约100-200bp
以内具有独立功能的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA
准确地相结合并具有转录起始的特异性。

2.启动子基本结构:transcription unit、upstream、downstream、5’-UTR
(5’-untranslated region)、3’-UTR (3’-untranslated region)
3.RNA转录大致过程:
a)Template recognition;
b)Initiation;
c)Elongation;
d)Termination.
4. E. coli RNA polymerase :
a)The core enzyme has four polypeptide subunits: alpha (α ), beta
(β), beta' (β '), and omega ( ω ) in the stoichiometry α 2ββ '
ω.
b)The RNA polymerase holoenzyme contains an additional
subunit - sigma (σ).
5.Stages of transcription initiation in prokaryotes:
1)DNA binding
2)Promoter search
3)Formation of a closed promoter compolex
4)Forming the open promoter complex
5)Incorporating the first few nucleotides
6)Promoter clearance
6.Please describe the comparison of prokaryotic and eukaryotic mRNA.
答:(1)真核生物5’端有帽子结构,大部分成熟的mRNA还同时具有3’
多聚A尾巴,原核一般没有。

(2)原核的mRNA可以编码几个多肽,真核只能编码一个,原核生物以多顺反子的形式存在,真核以单顺反子形式存在。

(3)原核生物以AUG作为起始密码,有的以GUG,UUG作为起始密码,真核几乎永远以AUG作为起始密码。

(4)原核生物mRNA半衰期短,真核生物的mRNA半衰期长。

四、翻译
1.Codon:mRNA的碱基顺序中,每三个相邻的碱基序列决定一个氨基酸,
这三个碱基称为一个密码子或三联体遗传密码。

2.遗传密码的性质:连续性、简并性、通用性与特殊性、密码子与反密码
子的相互作用。

3.tRNA二级结构:受体臂、TψC臂、反密码子臂、D臂
三级结构:L(倒L)型
4. E.coli 30S 亚基: 16S rRNA + 21 Pr.
50S 亚基:5S、23S rRNA+36 Pr.
5.真核40S 亚基:18S rRNA + 30 Pr.
60S 亚基:5S、5.8S、28S RNA + 40 Pr.
6.leucine zipper: 指DNA结构域中含有一段约30个氨基酸组成的核心序列。

N-端富含碱性氨基酸,形成DNA结合面,其中每隔6个氨基酸残基有规
律地出现1个Leu残基。

这段序列在形成两性α-螺旋后,螺旋的一侧以
带电荷的氨基酸残基(如Arg、Asp)为主,具有亲水性;螺旋的另一侧
是排列成行的Leu,具疏水性,即为leucine zipper区。

两个具有亮氨酸拉
链区的反式作用因子以疏水力相互作用形成亮氨酸拉链。

7.Homeodomain : 又称同源结构域, 指DNA 结构域中含有一段相同的保守
序列,由60个氨基酸组成的螺旋-转折-螺旋(helix-turn-helix)结构的区域.
8.Housekeeping gene and luxury gene
housekeeping gene是以维持细胞正常结构、基本生命活动所需的蛋白质
的编码基因
时态基因又叫奢侈(luxury gene)基因,指只在发育一定时期才能表达
的一些特异性表达的基因.
9.Zine finger motif:是许多转录因子所共有的DNA结合结构域,具有很强
的保守性。

在DNA结构域中含有较多的Cys和His的区域,借肽链的弯
曲使2个Cys和2个His与一个锌离子,或4个Cys与一个锌离子络合成
的一个形似指状的三级结构。

10.Molecular chaperone: 是指一类在序列上没有相关性但有共同功能的保
守性蛋白质,它们能在细胞内帮助其它多肽进行正确的折叠、组装、运
转和降解。

可分为热休克蛋白家族和伴侣素。

11.增强子的特点(The features of enhancers):
a)增强效应明显
b)增强效应与其位置和取向无关
c)大多为重复序列
d)有严密的组织和细胞特异性
e)没有基因专一性
f)大多受外部信号的调控
大题:
一、什么是分子标记?分子标记有什么特点?举出一例你所熟悉的的分子标记,论述它的原理、操作步骤及特点?
1.广义的分子标记(molecular marker)是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。

蛋白质标记包括种子贮藏蛋白和同工酶(指由一个以上基因位点编码的酶的不同分子形式)及等位酶(指由同一基因位点的不同等位基因编码的酶的不同分子形式)。

狭义的分子标记概念只是指DNA标记,而这个界定现在被广泛采纳:能反映生物个体或种群间基因组中某种差异特征的DNA片段,它直接反映基因组DNA间的差异。

2.特点:(1)直接以DNA的形式表现,在生物体的各个组织、各个发育阶段均可检测到,不
受季节、环境限制,不存在表达与否等问题;
(2)数量极多,遍布整个基因组,可检测座位几乎无限;
(3)多态性高,自然界存在许多等位变异,无须人为创造;
3.以RFLP为例:该技术由Grodzicker等于1974年创立。

特定生物类型的基因组DNA经某一种限制性内切酶完全酶解后,会产生分子量不同的同源等位片段,或称限制性等位片段。

RFLP标记技术的基本原理就是通过电泳的方法分离和检测这些片段。

凡是可以引起酶解位点变异的突变,如点突变(新产生和去除酶切位点)和一段DNA的重新组织(如插入和缺失造成酶切位点间的长度发生变化)等均可导致限制性等位片段的变化,从而产生RFLP。

基本步骤:(1)DNA提取;
(2)用DNA限制性内切酶消化;
(3)凝胶电泳分离限制性片段;
(4)将这些片段按原来的顺序和位置转移到易操作的滤膜上;
(5)用放射性同位素或非放射性物质标记的DNA作探针与膜上的
DNA杂交(称Southern杂交);
(6)放射性自显影或酶学检测显示出不同材料对该探针的限制性酶
切片段多态性。

RFLP标记的主要特点有:
(1)遍布于整个基因组,数量几乎是无限的;
(2)无表型效应,不受发育阶段及器官特异性限制;
(3)共显性,可区分纯合子和杂合子;
(4)结果稳定、可靠;
(5)DNA需要量大,检测技术繁杂,难以用于大规模的育种实践中。

二、以大肠杆菌色氨酸操纵子为例说明衰减子调控机制:
1.衰减子序列本身并不能实现衰减作用,而必须通过对前导序列上14个氨基酸的前导肽(leader peptide)的翻译才能实现.因此衰减作用的实质是以翻译手段控制基因的转录.
2.转录进行到前导区第90碱基处时,转录暂停,直到核糖体翻译前导肽.然后RNA聚合酶释放出来并移向弱化子位点.当它到达弱化子区时,决定是否继续转录的二级结构已经形成.
3.色氨酸操纵子前导肽中含有色氨酸密码子,当细胞中有色氨酸存在时,核糖体能够顺利地翻译出整个前导肽而在终止密码子UGA处停下来,这时核糖体占据了(1)区和(2)区的一部分,阻碍了(2)区和(3)区之间的配对,因而(3)区和(4)区配对,主生了终止子的发夹结构,于是实现转录的终止
4.当细胞内色氨酸缺乏时,核糖体停顿在两个色氨酸密码子上,这时核糖体占据了(1)区,而留下完整的(2)区以便与转录出的或即将转录出来的(3)区形成二级结构,这样(4)区转录出来后仍然是单链状态,不能形成带有发夹结构的终止子,于是转录继续进行下去.
还有几个类似于选择题(都是很简单的!)没有打上去,请见谅!。

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