肿瘤分子诊断-科普版.ppt
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肿瘤分子检测基础
目目 录录
基因变异与肿瘤发生发展 肿瘤的分子诊断方法
分子检测在个体化治疗中的应用 肿瘤基因检测产品介绍
一、基因变异与肿瘤发生发展
基因变异与肿瘤发生 原癌基因和抑癌基因
肿瘤的分子诊断 液体活检技术
肿瘤发生发展
获得性DNA损伤因素 （环境因素）： 化学物 电离辐射 病毒
正 常 细 胞
分子检测--NGS
分子检测--NGS
NGS技术在肿瘤临床治疗种的工作流程
文库构建
上机测序
数据解读
生成报告
分子检测--NGS
NGS 在肿 瘤临 床和 科研 中的 应用
用于临床
基因检测
用于科研
恶性肿瘤，治 疗无效的患者
理念先进的患 者
少发癌肿、起 源未知的患者
Hotpspot检测 呈阴性的患者
科研需求
遗传性全癌种基因检测 BRCA1、BRCA2
血液 血液
林奇综合征（Lynch）：MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM；
家族性腺瘤性息肉病（FAP）：APC；
家族性幼年型息肉综合征：SMAD4, BMPR1A；
遗传性结直肠癌；
血液
Fra Baidu bibliotek
结 直 肠 癌 遗 传 易 感 基因筛 APC, ATM, AXIN2, BMPR1A, CDH1, CHEK2, EPCAM, GALNT12, MLH1,
分子检测--ddPCR技术
ddPCR技术在医学中的应用
? 痕量核酸检测
肿瘤突变，产前诊断，病原微生物检测等
? 基因表达分析
低丰度基因或单细胞表达分析，等位基因差异表达
? 拷贝数变异分析
拷贝数差异小的CNV分析，基因连锁分析
分子检测--液态活检
? CTC ? ctDNA ? 外泌体
ctDNA来源： 1、坏死的肿瘤细胞 2、凋亡的肿瘤细胞 3、肿瘤细胞分泌的外排物
原癌基因----驱动机 抑癌基因----刹车 DNA修复基因
肿瘤的分子诊断
器官水平
组织水平
细胞水平
分子水平
肿瘤体积
细胞类型
蛋白标记物
基因变化
分子检测技术
? DNA测序技术 一代（Sanger） 二代（Illumina） 三代（SMRT, Nanopore）
? 基因芯片 ? PCR
实时定量PCR，ddPCR ? 循环肿瘤DNA（ctDNA）
全
面
更
的
多
基
的
因
治
变
疗
异
方
信
案
息
全
个
变
性
的
化
基
系
因
统
变
治
异
疗
信
方
息
案
异 病 同 治 的 思 路
临 床
试 验 药 物 信 息
更
临
全
床
面
试
的
验
基
药
因
物
检
信
测
息
临
回
床
顾
数
性
据
研
库
究
分子检测--ddPCR技术
灵敏度高 1/10万
定性分析
间接定量分析 依赖Ct或Cq值，标准品
直接定量分析 无需标准品，绝对定量
肿瘤靶向治疗
肿瘤 发生 过程 中的 生理 活动 和相 应的 靶向 药物
临床常用靶向药物及相关基因
四、肿瘤个体化治疗标准化指南
? NCCN (National Comprehensive Cancer Network) ? FDA (Food and Drug Administration) ? NCI (National Cancer Institute) ? CAP (College of American Pathologists) ? ASCO (American Society of Clinical Oncology) ? WHO (World Health Organization)
应用场景
易感性评估和早期筛查
可预防 可早发现 有效治疗
?
世界卫生组织认为： 三分之一的癌症可以预防；三分之一的癌症可以早期发现并治愈；三分之一的癌症病人可以通过有效的
综合治疗而减轻痛苦，延长生命，提高生活质量，部分有望治愈。
遗传易感基因筛查
遗传性肿瘤全面版
女性乳腺癌 \卵巢癌 BRCA1/2 检测
DNA 修复成功
D N
体
DNA 细
A 修复失败 胞
损
基
伤
因
突
变
DNA修复有关基因 细胞生长或凋亡基因
活化促进生长的癌 基因
活化调节凋亡的基 因
灭活肿瘤抑制基因
凋亡失去
控制
恶
性
失去抑制
肿
生长产物
瘤
形
表达异常
成
的癌蛋白
肿瘤流行病学
? 肿瘤发生发展
肿瘤药物基因组
原癌基因和抑癌基因
? 基因变异在肿瘤发生发展中的作用
查
MLH3, MSH2, MSH6, MUTYH, PMS2, POLD1, POLE, PTEN, SMAD4,
STK11, TP53
分子分型与个体化治疗
分 子 分 型
个体化治疗是以每个患者的信息为基础决定治疗方针，从基因组成或表达变 化的差异来在合把适握的治时间疗效果或对毒合副适作的人用等应答使的用个合适性的，药对物 每个处患方者合进适的行剂最量适宜药物疗 法的治疗。
分子检测—ctDNA技术
ctDNA技术与NGS和ddPCR的结合
ctDNA+ddPCR ctDNA+NGS ctDNA+PCR+NGS
灵敏度 0.001%
高 高
未知变异 × √ √
价格 便宜
高 适中
三、 分子检测在肿瘤个体化治疗中的应用
1、应用场景 2、遗传性肿瘤筛查 3、分子分型与个体化治疗 4、肿瘤靶向治疗
目目 录录
基因变异与肿瘤发生发展 肿瘤的分子诊断方法
分子检测在个体化治疗中的应用 肿瘤基因检测产品介绍
一、基因变异与肿瘤发生发展
基因变异与肿瘤发生 原癌基因和抑癌基因
肿瘤的分子诊断 液体活检技术
肿瘤发生发展
获得性DNA损伤因素 （环境因素）： 化学物 电离辐射 病毒
正 常 细 胞
分子检测--NGS
分子检测--NGS
NGS技术在肿瘤临床治疗种的工作流程
文库构建
上机测序
数据解读
生成报告
分子检测--NGS
NGS 在肿 瘤临 床和 科研 中的 应用
用于临床
基因检测
用于科研
恶性肿瘤，治 疗无效的患者
理念先进的患 者
少发癌肿、起 源未知的患者
Hotpspot检测 呈阴性的患者
科研需求
遗传性全癌种基因检测 BRCA1、BRCA2
血液 血液
林奇综合征（Lynch）：MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM；
家族性腺瘤性息肉病（FAP）：APC；
家族性幼年型息肉综合征：SMAD4, BMPR1A；
遗传性结直肠癌；
血液
Fra Baidu bibliotek
结 直 肠 癌 遗 传 易 感 基因筛 APC, ATM, AXIN2, BMPR1A, CDH1, CHEK2, EPCAM, GALNT12, MLH1,
分子检测--ddPCR技术
ddPCR技术在医学中的应用
? 痕量核酸检测
肿瘤突变，产前诊断，病原微生物检测等
? 基因表达分析
低丰度基因或单细胞表达分析，等位基因差异表达
? 拷贝数变异分析
拷贝数差异小的CNV分析，基因连锁分析
分子检测--液态活检
? CTC ? ctDNA ? 外泌体
ctDNA来源： 1、坏死的肿瘤细胞 2、凋亡的肿瘤细胞 3、肿瘤细胞分泌的外排物
原癌基因----驱动机 抑癌基因----刹车 DNA修复基因
肿瘤的分子诊断
器官水平
组织水平
细胞水平
分子水平
肿瘤体积
细胞类型
蛋白标记物
基因变化
分子检测技术
? DNA测序技术 一代（Sanger） 二代（Illumina） 三代（SMRT, Nanopore）
? 基因芯片 ? PCR
实时定量PCR，ddPCR ? 循环肿瘤DNA（ctDNA）
全
面
更
的
多
基
的
因
治
变
疗
异
方
信
案
息
全
个
变
性
的
化
基
系
因
统
变
治
异
疗
信
方
息
案
异 病 同 治 的 思 路
临 床
试 验 药 物 信 息
更
临
全
床
面
试
的
验
基
药
因
物
检
信
测
息
临
回
床
顾
数
性
据
研
库
究
分子检测--ddPCR技术
灵敏度高 1/10万
定性分析
间接定量分析 依赖Ct或Cq值，标准品
直接定量分析 无需标准品，绝对定量
肿瘤靶向治疗
肿瘤 发生 过程 中的 生理 活动 和相 应的 靶向 药物
临床常用靶向药物及相关基因
四、肿瘤个体化治疗标准化指南
? NCCN (National Comprehensive Cancer Network) ? FDA (Food and Drug Administration) ? NCI (National Cancer Institute) ? CAP (College of American Pathologists) ? ASCO (American Society of Clinical Oncology) ? WHO (World Health Organization)
应用场景
易感性评估和早期筛查
可预防 可早发现 有效治疗
?
世界卫生组织认为： 三分之一的癌症可以预防；三分之一的癌症可以早期发现并治愈；三分之一的癌症病人可以通过有效的
综合治疗而减轻痛苦，延长生命，提高生活质量，部分有望治愈。
遗传易感基因筛查
遗传性肿瘤全面版
女性乳腺癌 \卵巢癌 BRCA1/2 检测
DNA 修复成功
D N
体
DNA 细
A 修复失败 胞
损
基
伤
因
突
变
DNA修复有关基因 细胞生长或凋亡基因
活化促进生长的癌 基因
活化调节凋亡的基 因
灭活肿瘤抑制基因
凋亡失去
控制
恶
性
失去抑制
肿
生长产物
瘤
形
表达异常
成
的癌蛋白
肿瘤流行病学
? 肿瘤发生发展
肿瘤药物基因组
原癌基因和抑癌基因
? 基因变异在肿瘤发生发展中的作用
查
MLH3, MSH2, MSH6, MUTYH, PMS2, POLD1, POLE, PTEN, SMAD4,
STK11, TP53
分子分型与个体化治疗
分 子 分 型
个体化治疗是以每个患者的信息为基础决定治疗方针，从基因组成或表达变 化的差异来在合把适握的治时间疗效果或对毒合副适作的人用等应答使的用个合适性的，药对物 每个处患方者合进适的行剂最量适宜药物疗 法的治疗。
分子检测—ctDNA技术
ctDNA技术与NGS和ddPCR的结合
ctDNA+ddPCR ctDNA+NGS ctDNA+PCR+NGS
灵敏度 0.001%
高 高
未知变异 × √ √
价格 便宜
高 适中
三、 分子检测在肿瘤个体化治疗中的应用
1、应用场景 2、遗传性肿瘤筛查 3、分子分型与个体化治疗 4、肿瘤靶向治疗