pubmed数据库以及其检索字段和标识的相关介绍

pubmed数据库以及其检索字段和标识的相关介绍

pubmed数据库以及其检索字段和标识的相关介绍

这是我们为大家提供的一篇介绍pubmed数据库以及其检索字段和标识的文章,接下来就让我们一起来了解一下吧!

?Pubmed数据库是什幺呢?相信很多朋友对于Pubmed数据库并不了解,Pubmed数据库是一个是IT行业并不怎幺知名的数据库,但是在生物学领域是家喻户晓的数据库。

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?Pubmed数据库严格来说并不是一个单纯的数据库,它更像是一个搜索引擎,主要提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。它是以美国国立医学图书馆提供的数据作为依托,基于WEB的生物医学信息检索系统,免费为互联网用户提供生物学资讯和期刊论文等信息。其最大的优点是完全免费,界面汉化,支持中文查询,能将中文与mesh词自动匹配,可免费快速获得全文。

?PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务免费提供题录和文摘,可与提供原文的网址链接,提供检索词自动转换匹配,操作简便、快捷。

?Pubmed数据库常用的检索字段及其标识符其实也并不多,下面是常用的一些:

?AB 摘要AD 第一作者的研究机构和通讯地址ALL 除音译提名及出版国家之外的所有字段

?AU 作者

?CN 合作者

PubMed检索机制及规则

PubMed检索机制及规则 PubMed的检索功能非常强大,在检索中可实现检索词的自动转换、通配符的使用等功能,也可以进行强制性检索。 1 词汇的自动转换功能 在PubMed主页的检索提问框中输入检索词进行检索时,系统将按顺序自动使用如下3种索引,对检索词进行转换后再进行检索。 1.1 Mesh转换表(MeSH Translation Table) 包括MeSH词、参见词、副主题词、出版类型、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS)、补充概念(物质)名称表等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词(或其它词表中的词)和Text word词(题名词和文摘词),并用“OR”组配进行检索,同时停止使用其它的索引进行转换。有些词在转换后可能会出现3个词进行检索。例如:键入“blood",系统将其转换成"("blood"[MeSH Subheading] OR "blood"[MeSH Terms]) OR blood[Text Word]"后进行检索。 1.2 刊名转换表(Journal Tanslation Table) 包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其对应到相应的刊名进行检索。此外,该转换表能把键入的刊名全称转换为MEDLINE缩写后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine”,PubMed将其转换为“N Engl J Med”后进行检索。 1.3 著者索引(Author Index) 如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1-2个字母的短语,PubMed 即会自动查找著者索引。
如果仍然查不到相匹配的词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到为止。假如仍然不能找到匹配的词,系统将把各单词用“and”连接,在全部字段中进行查找。 要查看词汇的转换情况,可点击“Details”进行查看。 2 截词检索功能 PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如:键入“flavor*”,系统会找到那些前一部分是flavor 的单词(如flavored, flavorful, flavoring等),并对其分别进行检索。如果这类词少于600个,PubMed会逐个词检索,若超过600个(如:ca*),PubMed将显示警告信息,要求增加词汇的开头字母数量。截词功能只限于单词,对词组无效。如:“infection*”包括“infections”,但不包括“infection control”等。 注意:使用截词检索功能时,PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。 3 强制检索功能 如上所述,在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”,系统会用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索;但是,当键入的词语无匹配词时,PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程,若仍然没有匹配词,系统就将短语分解成单词,再用AND联在一起在全部字段中检索。很明显,这样检索的结果是不符合用户要求的。因此,PubMed允许使用双引号(“”)来强制系统进行短语检索。例如,在PubMed主页的检索提问框中键入“Single cell”,并用双引号引起来,然后点击“Go”,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。
使用双引号检索,会自动关闭词汇转换功能。

PubMed检索原理及途径

PubMed检索原理及途径 1. 检索原理 PubMed具有自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)。对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。 2. 检索途径 ⑴基本检索 PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。 Limits:限定检索。PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。 History:检索历史。可自动将检索式及结果数量记录到History屏,结合#号进一步检索。#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。 例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献 步骤:PubMed主页→点击limits,限定时间2004;语种为English→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。 ⑵主题词检索 点击主页左侧栏MeSH Database,或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH, 即可进入MESH检索界面。 输入提问词,点击go。如不是MeSH词,系统则提供相关概念供选择。 选择出现的MeSH词,可察看下面对该MeSH词的注释。 点击该主题词进入副主题词选择,选中需要的副主题词,也可点击进行加权、不扩展检索。 然后从屏幕上方或下方的display行Send to框的下拉菜单中选择发送地方及组配方式,如要检索,发送到Search Box中,在Search Box中将显示检索表达式,可进行修改和继续添加。 最后点击Search PubMed进行检索。

PubMed使用手册

PubMed使用手册 【基本查询方法】 ?一个检索词: 一个单词:在文本框中输入检索词,按GO查询。 含两个单词以上的检索词:需要加双引号,注意是英文输入状态下的双引号。 如:"ultrasonic diagnosis"是正确的,“ultrasonic diagnosis” 是错误的 ?两个以上的检索词:可使用AND、OR 连接各检索词。 如:"three dimensional ultrasound" AND thyroid ?可以在“limit”菜单下限制文献出版的时间、语种等等。 【完全手册】 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping) 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。 (1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘

词)进行检索。例如:键入"Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 (2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE 形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为"MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如:在检索提问框中键入:"new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 (3)短语表(Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。 (4)著者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语,PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词,单个词会被联一起(用AND)在全部字段中检索。如:"single cell",系统就会自动将其分成两个词:"single"和"cell"检索,其检索表达式为:"single AND cell"。要查验检索词的转换情况,可点击"Details"键。 2.截词检索功能

PubMed数据库与EMBASE数据库的比较

PubMed数据库与Embase数据库的比较 PubMed是一个免费的搜索引擎,是NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它面向全世界免费提供最新的生物医学信息。每周5天更新数据,检索功能完善,使用方便。整合在NCBI的统一检索平台Entrez 上,与该平台其他数据库建立无缝链接,可实现跨库检索。PubMed 收录全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的文摘及题录数据,绝大部分可回溯至1948年,最早回溯至1865年。累积了1900多万条文献记录,部分文献可直接获取全文,包括:PubMed Central (PMC,收录期刊780余种):NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库、开放获取(Open Access,OA)期刊、部分出版商提供的免费文献,与出版商的电子期刊文献同步发布,标注为[Epub ahead of print](先于印刷版期刊发表的电子文献)或Epub。MEDLINE——自1949年至今数据1400万余条,内容每周更新一次,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和前临床科学等。In Process Citations ——1996年8月开始增加该数据库,只提供基本的引文信息和文摘,每天更新,经过标引以后进入MEDLINE,并从PreMEDLINE 中删除这些记录。Publisher Supplied Citation——接受出版商提供的文献数据,这种数据带有[MEDLINErecord in process]的说明。 Embase数据库全称Exceerpta Medica Database,由荷兰爱思唯尔公司出版,是印刷型检索工具Exceerpta Medica的电子版,也是最重要的生命科学文献书目型数据库之一。Embase收录从1974年以

PubMed检索完全讲解

PubMed检索完全攻略----好东西,吐血狂顶!2011-11-21 08:57阅读(4)转载 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医

pubmed数据库使用方法

pubmed数据库的使用方法 本文以 pubmed中的一篇文章 Inhibition of Notch pathway attenuates the progression of human immunodeficiency virus-associated nephropathy. 为例来说明pubmed数据库的使用方法。 在pubmed中检索到该篇文章后,网址是 https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html,/pubmed/23389453 在页面左侧稍微靠上的地方,显示有该文章所属的期刊名字,如下图所示: 上图中棕色横线标注处显示的就是收录该文章的期刊的名字(是缩写),鼠标移动到该缩写的期刊名字上后,会弹出提示框显示该期刊的全名。棕色横线标注处同行的后边是这篇文章在该期刊中是哪一年的哪一期以及该文章的doi编号等信息。双击棕色横线标注处的链接,将可以查看该期刊的更多详细信息。 页面的右上角有时候会显示出该篇文章的全文获取链接,如下图所示:

在上图的棕色横线标注处,有时可以看到一个矩形的图标,那就是该篇文献的全文下载链接。点击该链接将来到收录该文章全文的期刊或者数据库的该篇文章的网络下载页面,例如该篇文献的网络下载页面如下图所示:

上图红色链接标注处出现了一个登陆框,要求进行登陆,这表明你没有下载该篇文献的权限。上图中绿色横线标注处是当你有此篇文献下载权限时,点击下载文献全文的位置。没有该篇文献全文下载权限的话,是无法下载到此文献的,如果您是通过seek68数字图书馆提供的pubmed入口来到此页面,则有很大机会直接就具有该篇文献的下载权限,如下图所示:

Pubmed检索攻略

PUBMED简介 一、何为PUBMED? PUBMED是美国国立卫生研究所(NIH)下属美国国立医学图书馆(NLM)开发的因特网检索系统,建立在国立生物医学信息中心(NCBI)平台上。PUBMED主要提供基于WEB的MEDLINE数据库检索服务,其中包括医学文献的定购、全文在线阅读的链接、专家信息的查询、期刊检索以及相关书籍的链接等。 二、PUBMED与图书馆光盘版本的MEDLINE有何不同? PUBMED与光盘版本MEDLINE的不同之处在于:由于互联网的及时性,PUBMED的更新速度快于光盘版,光盘版本的更新周期是3个月,而PUBMED的更新周期是1天,PUBMED包含了一些尚未收录入光盘版MEDLINE的最新文献信息,因此PUBMED享有PRE-MEDLINE的美誉。 三、如何进入PUBMED检索系统? 在浏览器地址栏中输入网址:https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html,/pubmed/ 四、PUBMED主页的基本组成? PUBMED的检索系统大致由三个板块组成:页面上方的检索框和功能按钮(Limit、Preview/Index、History、Clipboard、Details)。在检索框"for"后面的空格中输入需要查询的关键词,点击"go"会出现相关的文献。每个功能按钮的具体功能下面会逐项介绍。左面的导航条指向PUBMED的一些其它功能板块,如MeSH Browser、Journal Browser等。剩下的右下方大片空间便是显示检索结果的空间。

五、PUBMED的主要功能按钮组成? PUBMED的主要功能按钮有五种:Limit按钮、Preview/Index按钮、History按钮、Clipboard按钮和Details按钮。 六、LIMIT 按钮的主要功能? 当点击Limit按钮,将出现以下界面: 各下拉框的基本作用如下: All Field:下拉可选择搜索的范围,如作者名、关键词等 Publication Types:下拉可选择所查文献的类型,如临床试验、荟萃分析等 Ages:下拉可选择所查文献研究对象的不同年龄组 Entrez Date:下拉可选择所查文献距离现在不同时间范围 Publication Date:下拉可选择限定所查文献发表日期 Language:下拉可选择所查文献的语种 Human or Animal:下拉可选择所查文献的研究对象:人或动物 Subset:下拉选择不同的医学网络系统,可查询特殊领域的文献AIDS, TOXICITY 七、Preview/Index按钮的功能? 点击Preview按钮,可以预览检索的结果,此预览功能使我们浏览结果前,先知道查询的结果数量,从而可估计是否有必要进一步修改检索式以缩小或扩大检索范围,避免每次因传输大量的无用数据而浪费时间。 Index按钮的功能则使我们在输入一个检索词之后知道这个检索词将导出多少篇文献,同时其特有的允

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦 注:在本文中的叙述中,所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来,如以基因治疗为主题词检索,在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。 PubMed简介 PubMed是由隶属于美国国家卫生部(NIH, National Institues of Health)的国家医学图书馆(NLM, Nationa Library of Medicine)下属的国家生物技术信息中心(NCBI, National Center for Biotechnology Information)提供,可通过NCBI网站的Entrez检索系统(Entrez retrieval system)进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。此外,PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务,与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据,提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA 与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统,可检索NCBI网站的主要数据库,如PubMed,核酸与蛋白序列,基因组序列,蛋白结构,OMIM等等。PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库,此外,它还针对网上资源,提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源,如核酸蛋白序列、OMIM入口等,以及其它生命科学数据库。其文献内容的提供方式,由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。如果该出版商有网站,则NCBI会提供相应的网络出口。MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。 PubMed服务内容概括 基于互联网WWW的MEDLINE及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。 提供MEDLINE、PreMEDLINE与其他相关数据库接入服务,如NCBI的其它数据库DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线,及NCBI外的其它数据库。 提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 随着国内互联网的普及,网络已逐步地成为一名医务工作者获取多种信息的有效渠道。网络已成为医学研究者追踪国际研究进展,了解世界先进水平的一个重要手段。 传统的医学文献检索(MEDLINE)尽管在本地局域网提供的情况下,具有高速的特点。但与互联网

Pubmed全攻略使用教程

PubMed检索系统简介 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science 或Nature)上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping) 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。 (1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词(题名词和文摘词)进行检索。例如:键入“Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 (2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN 号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 (3)短语表(Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。 (4)著者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语,PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词,单个词会被联一起(用AND)在全部字段中检索。 如:"single cell",系统就会自动将其分成两个词:“single“和“cell”检索,其检索表达式为:“single AND cell”。要查验检索词的转换情况,可点击“Details”键。

PubMed数据库

PubMed数据库 一.检索Genbacev O 等撰写的关于“胎盘氧张与胎儿生长的关系”的文章。要求写出:①第一篇文章的原文出处,②第一篇原文后附第一篇参考文献中的第一作者的姓名。操作步骤:1.在地址栏中输入https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html,/pubmed,进入PubMed 2.在检索栏中输入 placenta growth oxygen genbacev o,点击Go 3.点击题录中作者姓名如: Genbacev O,得到文摘,点击出处下方免费获取全文(free text article)红色按钮。 4.在原文最后找到Reference(参考文献),得到第一篇作者姓名。 二.用MeSH Database 检索肾衰竭饮食疗法的文献。要求:第一作者Rao M的工作单位及E-mail 地址。操作步骤: 1.进入PubMed主页,点击主页左侧中MeSH Database,进入MeSH Database网页 2.在检索栏中输入renal failure, 点击Go 3.在主题词注释页中,点击kidney failure。

4. 选副主题词(subheadings) 中的diet therapy (饮食疗法),选择send to下的Search Box with AND。 5.在返回结果页的检索框中"Kidney Failure/diet therapy"[MESH]后输入Rao M,点击PubMed Search。 三.查找Challis DE作为第一作者发表于Pediatric Research 2000,47(3):309-15上的论文, 并写出其他合著者。操作步骤: 1. 进入PubMed主页,在主页的左侧栏中点击Single Citation Matcher。 2. 按要求输入著者、刊名、卷、年等信息,点击search 按钮。 基因序列获取与同源性对比 一.用NCBI查找人类抗癌基因(human antioncogene)的核酸序列报告,要求:写出序列号和 碱基数,并拷贝原序列(Origen)。操作步骤: 1.进入https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html,/entrez,选择Nucleotide 核酸序列库 2.输入human antioncogene 点击Go

PubMed数据库如何获取全文

PubMed数据库如何获取全文 当很多人开始了解PubMed,并且逐渐得心应手的时候,都会面临一个棘手的问题,即如何获取全文?的确,PubMed真正向公众(public)免费开放的只是摘要部分,而绝大部分文章都没有全文提供。当然,最省事最直截了当的做法是在PubMed上花钱购买,但一篇文章动辄十几甚至几十美金,使很多医学工作者只好望而却步。其实,只要我们掌握一些技巧,还是有可能获得一些文章的全文的。笔者查阅文献数年,为获取全文也做了不懈努力,积累了一些经验供大家参考。一、PubMed PubMed上约有5%的文献是可以免费看到全文的,通常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小标记。你只要点击这个图标,系统就自动链接入该文献的全文。但有两点值得注意的是,第一,很多时候,这个图标在PubMed处于显示简要(summary)状态下并不出现,而只有在选择显示摘要(abstract)时才出现。因此,如果你不只是泛泛浏览,而希望看到全文的话,我强烈建议你在display下拉菜单中选择摘要(abstract)状态。第二,有些时候,小图标上仅标着Full Text,而并没有Free字样,但仍然可以链接入全文,你不妨试一试。二、免费提供全文的期刊天下没有免费的午餐,这句老话也不一定正确。有些期刊就提供全文免费检索。比如著名的美国Science(科学)杂志,以前国内很多高校、研究所的资料室都流传着Science杂志的影印本,印刷质量低劣,而且有盗版之嫌。后来Science的老板充分理解到中国的国情,干脆顺手做个人情,就与中国有关方面达成协议,使在中国大陆的读者都可以在网上免费看到Science的全文。方法如下:(1)先登录Science网址:http://https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html, 。注意,不是https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html,,否则你得不到全文。(2)点击中间那个SEARCH按钮,就进入查询页了。你可以选择简单检索还是复杂检索。(3)输入您要找的关键词(不一定是MESH标准主题词),再点击search 就可以了。(4)找出文章后,点击标题后的Full Text,就可以浏览原文了。除了Science,其他一些期刊如美国科学院院报(PNAS),Genetics等都可以在网上获取全文,甚至能够下载文献的pdf格式,这样就和真正在期刊上的排版形式一模一样了。一般而言,那些相应期刊的网址是以org为域名的,往往提供免费的全文。例如上面提到的两家期刊的网址就分别是:https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html, ;https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html, 。这里,我特别推荐一个提供免费全文的网站High Wire Press。该网站号称拥有地球上最大最全的免费的科学文献全文数据库。输入网址http://https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html,/即可登录该网站,首页即列出几个生物医学相关栏目,包括:1、生命科学(包含:生物化学,细胞和分子生物学/ 微生物学与病毒学/ 免疫与免疫学/ 神经科学与神经生物学/ 生理学/ 植物学/ 其他生命科学/)2、医学(包含:心血管医学/ 临床医学/ 精神病学与心理学/ 医学研究/)3、自然科学以及其他科学栏目。你可以在这些栏目中选择自己需要的期刊。然后,你需要重点看一下该期刊后面的的说明信息,尤其是提供免费全文的方式,如free ISSUES是在多长时间内可以享受免费索取原文,从5年到一个月不等。而free TRIAL 是在限定时间内,可以免费提供原文。至于free SITE 则是可以完全免费获取全文的站点。当然,你也可以在检索框内输入关键字,然后点击首页右上方的Search all journals ,你就可以在所有的224种期刊里查找文献了。不过由于所检索到的结果仅仅局限于这200多种期刊,因此你一定要记住绝对不能用此网站来代替PubMed,来了解所研究课题的最新进展。我个人的建议是,先在PubMed上检索,而仅以High Wire Press作为获取全文的一个途径而已。三、利用一些高校图书馆网站国内一些高等院校,尤其是一些名牌高校的图书馆经常和国外一些大的出版商签订协议,支付不菲的费用,从而可以检索并看到所有由这些出版商出版的期刊的全文。你可以就近到这些高校的图书馆的电子检索厅去检索,或者链接到大学图书馆的网站(如复旦大学图书馆的网址是https://www.360docs.net/doc/9c9238206.html,),然后通过该网站的链接进入相应的检索系统。可惜的是,从公众网到教育网之间的传输效率

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