市级医院临床科研资源共享平台项目
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上海市级医院临床科研资源共享平台建设项目共享情况
临床遗传学平台
项目批准号: SHDC12007701
项目名称:以芯片比较基因组杂交(aCGH)技术为核心的多功能临床分子遗传学和分子病理学共享平台
平台建设单位:上海市儿童医院
项目负责人:方秉华包黎明曾凡一
联系地址:上海市北京西路1400弄24号邮政编码:200040
联系人:李嫔任兆瑞
平台介绍:
上海市儿童医院拥有上海交通大学基础博士点,临床硕士培养点和博士后流动站,是上海交通大学《遗传学》国家重点学科和上海市重点学科的领衔和主持单位。
医院所属的在遗传病的防治领域作出了许多在国内外颇具影响力的贡献,特别是在遗传病的诊断和治疗以及新生儿筛查和遗传咨询等方面形成了鲜明的特色和优势,是我国第一个获得美国国立卫生研究院科学基金的单位。在常见遗传病如地中海贫血、血友病、杜氏肌营养不良、苯丙酮尿症、亨廷顿舞蹈症、先天性肾上腺皮质增生症、性分化异常等的基因诊断和产前诊断方面处于国际先进水平。最近,与国外公司合作共同研发MLPA-微阵列芯片技术,并与国内多家单位合作和共享运用该技术对200多例DMD和染色体异常病人进行了准确的基因诊断,达到国际领先,相关论文已在国际着名杂志《Human Mutation》发表。在基因治疗方面,应用反义核酸结合RNA干扰技术在细胞和模型小鼠中对 地中海贫血进行基因治疗获得成功,该成果获得上海市科技进步一等奖(2003年),相关论文已被国际着名杂志《Hum Mol Genet》和《Haemalologica》接受发表。
医院拥有一批在医学遗传学领域作出杰出贡献的专家、教授,国家“973”项目首席科学家,中青年学术带头人和业务骨干,形成了实力强大的学术梯队。
在技术方法上,采用美国Perkin Elmer公司的Spectral Genomics aCGH芯片及分析软件,冰岛Nimble GenSystems提供染色体断裂位点分析所需的高分辨率芯片和分析软件。aCGH 分子病理项目中样本处理和全基因扩增法,将试用已商品化的试剂盒。芯片生物信息数据的分析将聘请美国辛辛那提儿童医学中心生物信息中心主任徐燕教授担任指导。
表1-1 临床遗传学平台可供共享的设备
表1-2 临床遗传学平台可供共享的技术项目及收费价格
临床药理学平台
项目批准号: SHDC12007702
项目名称:临床药理学科研共享平台
平台建设单位:曙光医院
项目负责人:蒋健马越鸣
联系地址:上海市普安路185号邮政编码:200021
联系人:高月球
电子信箱:
平台介绍:
曙光医院为卫生部首批中药临床药理基地,2006年通过了SFDA专家组的现场检查,至今承担了卫生部或国家食品药品监督管理局下达的新药临床试验任务200多项。
医院下设的临床药理科由药物临床研究评价研究室,I期临床试验研究室,药物代谢动力学实验室和数据管理中心组成。是国家(教育部)重点学科中医内科学、国家(教育部)重点学科中药学、国家(教育部)省部共建实验室、上海市优势学科中医内科学、上海市浦东新区新药临床试验研究平台的重要组成部分。医院与中科院药物研究所药物代谢研究中心、上海中医药大学GLP实验室、上海中医药大学临床药理研究中心有良好的合作关系,具备开展药物代谢研究的软硬件条件和技术支撑。
建在浦东张江的I期病房符合国际一流标准,至今已完成I期药物临床试验36项,药代实验室已经具备血药浓度检测方法确证及检测等基本技术,完成药代和生物等效性试验31项。医院承担的援非项目盐酸阿莫地喹生物等效性试验,是中国第一个接受WHO委托并监察的I期临床试验项目,已经通过WHO的验收。
表2-1 临床药理学平台可供共享的设备
表2-2 临床药理学平台可供共享的技术项目及收费价格
*为方法确证费用
病原学平台
项目批准号: SHDC12007703
项目名称:病原微生物与传染病防治临床科研资源共享平台
平台建设单位:公共卫生临床中心
项目负责人:袁正宏
联系地址:金山区漕廊公路2901号邮政编码:201508
联系人:胡芸文
电子信箱:
平台介绍:
上海市公共卫生临床中心作为市政府2004年重大建设项目一号工程,建设目标是加强本市的公共卫生体系建设和传染病的临床诊治,构筑起一个可供国内外开放交流合作的公共卫生科研平台,为提升上海的公共卫生医疗与教学科研能力发挥作用。
下属科研中心设有6个实验平台,分别为:分子生物学平台、药代动力学和蛋白质组学平台、免疫学平台、细胞生物学平台、高致病性病原微生物研究平台、实验动物平台。采用科学研究与临床医技一体化的管理模式,两者互为补充、相互促进、资源共享、共同提高。采用灵活多样的政策吸引国内外专家利用技术和设备平台共同开展传染性、感染性疾病病原学,病毒分离,免疫与病理,药物筛选与疫苗,临床诊断、治疗和预防等方面的研究,逐步建立“以我为主,广泛合作”的国际合作新模式。
通过多种形式的国内外合作交流,科研共享平台将发展成为集传染病实验室诊断、科学研究、平台服务和人才培训为一体的设备精良、技术先进、运转高效的开放式现代化实验室平台。在传染病病原学和生物学特性、发病机制、诊断方法与技术、疫苗研究等方面形成特色,全面提高检验、检测及科研能力,为疾病预防控制、治疗、公共卫生监督、预防医学研究及突发事件应急处置等提供实验技术支持。通过国际合作,科研共享平台力争成为世界卫生组织西亚太区传染病与公共卫生研究合作中心之一,努力成为在国际相关领域有重要影响的传染病与公共卫生研究平台。
表3-1 病原学平台可供共享的设备
表3-2 病原学平台可供共享的技术项目及收费价格
基因组学平台
项目批准号: SHDC12007704
项目名称:肿瘤功能基因组学和分子形态科研资源共享平台建设
平台建设单位:第一人民医院
项目负责人:彭志海、黄倩
联系地址:上海市武进路85号邮政编码:200080
联系人:李啸华
平台介绍:
上海市第一人民医院建有博士后、博士、硕士研究生培养站、点分别为12、19和29个。
医院长期致力于胃肠道肿瘤、肝脏移植和腹部大脏器联合移植的临床和基础研究。从1999年起,着眼于肿瘤功能基因组学研究,对中国人群在全基因组水平筛选胃肠道肿瘤相关基因,同时探索新的肿瘤标记物。已完成散发性结直肠癌、散发性胃癌全基因组杂合缺失扫描、精细定位研究,以及散发性结直肠癌基因芯片扫描、候选基因筛选工作,目前正在对筛选基因开展全面验证工作,同时对胃癌开展基因芯片扫描,候选相关基因筛选工作。相关工作已连续获得“863”重点项目子项目、3项国家自然科学基金、上海市百人计划一期、二期项目、上海市科委重点项目、上海市医学领军人才、上海市自然科学基金等国家市级项目资助。并获2006年上海市科技进步奖一等奖等一系列奖项,同时部分科研成果被《Clinical Cancer Research》等SCI期刊收录。
目前已建立Western blot、real-time PCR、 MSP、Pyrosequencing技术、逆转录PCR、基因转染、动物实验、流式细胞技术等技术平台,熟练应用Applied Biosystems 3730、3130基因分析仪、PyroMark ID定量遗传分析系统、Eppendorf real-time PCR系统等大型仪器设备,并形成一支具有良好团队精神和较强科研攻关能力的人才梯队。
与上海交通大学Bio-X生命科学研究中心、卫生部纳米生物技术重点实验室、卫生部肝胆肠外科研究中心、中南大学生物医学工程研究院、Texas大学MD Anderson癌症研究中心等国内外知名研究机构开展多年的合作,共同完成多项课题。