微生物的分类和鉴定

第二节 微生物在生物界的地位
在人类发现微生物并对它们进行较深入的研 究之前，只能把一切生物简单地分成似乎 截然不同的两大界——动物界和植物界； 从19世纪中期起，随着人们对微生物认识 的逐步深化，生物的分界就历经三界、四 界、五界甚至六界等过程，最后又提出了 一个崭新的“三域”学说。
生物的界级分类学说
★从两界系统经历过三界系统、四
界系统、五界系统甚至六界系统， 最后又有了三原界（或三总界） 系统。
★传统的、为多数学者所接受的是
1969年魏塔克（R.H.Whittaker） 在《Science》上提出的五界学说， 它以纵向显示从原核生物到真核 单细胞生物再到真核多细胞生物 的三大进化过程。
• 三域学说: 细菌域、古生菌域、真核生物域。 主要特点比较见表10-3。
菌株（strain）: 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的 纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的一组 纯种后代菌群）。因此，一种微生物的不同来源的纯培养物均可 称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。
例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株：
Escherichia coli B 和Escherichia coli K12
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第三节 各大类微生物的分类系统纲要
1 Bergey氏原核生物分类系统纲要 《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)
coli 可缩写成 E.coli
Staphylococcus aureus可缩写成 S. aureus
②三名法：用于对亚种的命名，这时在属和种名后加写一个
subsp.，然后再附上亚种名称（斜排体）。 如：
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
苏云金芽孢杆菌腊螟亚种
种(Species)：啤酒酵母
二、微生物的命名
微生物的名字有俗名和学名两种。如： 红色面包霉———粗糙脉孢霉
绿脓杆菌———铜绿假单胞菌 学名—是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国际委员 会拟定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外来词组成。 学名的命名有双名法和三名法两种。 ①双名法： 学名=属名+种名加词+（首次定名人）+现定名人+定名年份 必要，用斜 可省略，用 体表示 正体字 属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母大写， 表示微生物的主要特征，由微生物构造，形状或由科学家命名。 种名：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征， 如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等。
例：大肠埃希氏杆菌
Escherichia coli （Migula）Castellani et Chalmers 1919
金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884
华癸根瘤菌 Rhizobium huakuii，Chen 1991 Rhizobium huakuii
◆当泛指某一属微生物，而不特指该属中某一种（或未
定种名）时，可在属名后加sp.或ssp.（分别代表 species 缩写的单数和复数形式） 例如：Saccharomyces sp. 表示酵母菌属中的一个种。
◆菌株名称——在种名后面自行加上数字、地名或符号等，如： Bacillus subtilis AS1.389 AS=Academia Sinica
中国希瓦氏菌Shewanel lacinica sp.nov. （许玫 英等，微生物学报，2004，44(5):561-566）
以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是： 界(Kindom)：真菌界 门(Phyllum)：真菌门 纲(Class)：子囊菌纲 目(Order)：内孢霉目 科(Family)：内孢霉科 属(Genus)：酵母属
第十章 微生物的分类和鉴定
• 什么是微生物分类学
(microbialtaxonomy):
按照微生物的亲缘关系将 其安排成条理清楚的各种 分类单元和分类群的科学
微生物分类的目的
把各种微生物按照它 们的亲缘关系分群归 类，排成系统，以便 于人们对微生物进行 鉴定和交流
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生物界的分类
地球上的物种估计大约有150万，其中微生物 超过10万种，而且其数目还在不断增加。
第一节 通用分类单元
一、种以上的系统分类单元 界、门、纲、目、科、属、种
• 种是最基本的分类单位 • 每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、 亚科...
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界 门 纲 目 科 属
种
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种（species）：是一个基本分类单位；是一大群表型特征高度 相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株 的总称。
在生物进化历史过程中演化形 成生物种类和种群的多样性。
生物分类就是通过研究生物的系统发育及其进化 历史，揭示各类生物的多样性及其系统关系，编 制分类系统，还原生物的自然历史位置。
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★微生物分类学的三个任务：分类、鉴定及命名
☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不同的分类类群。 ☆鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的分类单元的过程。 ☆命名是根据国际命名法规给微生物分类单元以科学的名称。
★菌株的表示法：
★种是分类学上的基本单位，菌株是实际上应用的基本单位，因为同一菌
种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别！
新种（species nova，sp.nov或nov sp.）是指权威 性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离 并鉴定过的微生物。当发现在按《国际命名法规》 对它命名并在规定的学术刊物上发表时，应在其 学名后附上“sp.nov”符号。在新种发表前，其模 式菌株的培养物就应存放在一个永久性的可靠的 菌种保藏机构中，并允许研究人员取得该菌种。
Bacillus subtilis BF7658
Clostridium acetobutylicum ATCC824
丙酮丁醇梭菌 ATCC＝American Type Culture Collection美国模式菌种保藏中心
◆当文章中前面已出现过某学名时，后面的可将其属名缩写成1~3
个字母。
如：Escherichia