中科院生物物理所 生物化学考博真题及答案
6个简答和2个论述题
CAS-ibp-2004
名词解释：
肽平面；肽键中的C—N键具有部分双键的特征，不能自由旋转，这些现象是因共振而产生的。其结果使肽键处在一个刚性的平面上，此平面被称为肽键平面(酰胺平面)。
磷酸戊糖途径；一个葡萄糖-6-磷酸经代谢产生NADPH和核糖-5-磷酸的途径。其过程可以分为两个阶段：①六碳糖（6-磷酸-葡萄糖）脱羧形成五碳糖（5-磷酸-核酮糖），并伴有NADPH+H+和CO2的生成；②5-磷酸-核酮糖通过异构化，转酮基，转醛基与糖酵解途径联系起来。
荧光共振能量转移（FRET）；当一个荧光分子（又称为供体分子）的荧光光谱与另一个荧光分子（又称为受体分子）的激发光谱相重叠时，供体荧光分子的激发能诱发受体分子发出荧光，同时供体荧光分子自身的荧光强度衰减。
简答：
1 “限制性内切酶是原核生物抵抗外界，免疫防御的一道防线”这句话如何理解。
定义：限制性核酸内切酶是可以识别特定的核苷酸序列，并在每条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键进行切割的一类酶，简称限制酶。
在20 世纪60 年代，人们就注意到DNA 在感染宿主后会被降解的现象，从而提出限制性切酶和限制酶的概念。1968 年，首次从E.coli K 中分离到限制酶，它有特定的识别位点但没有特定的切割位点，其中切割位点离识别位点达1000bp 以上。1970 年，美国约翰·霍布金斯大学的H. Smith 于偶然中发现，流感嗜血杆菌（Haemophilus influenzae）能迅速降解外源的噬菌体DNA ，其细胞提取液可降解E.coli DNA ，但不能降解自身DNA ，从而找到HindⅡ限制性内切酶。限制性核酸内切酶分布极广，几乎在所有细菌的属、种中都发现至少一种限制性内切酶，多者在一属中就有几十种，例如在嗜血杆菌属中（Haemophilus）现已发现的就有22种。限制作用实际就是限制酶降解外源DNA，维护宿主遗传稳定的保护机制。甲基化是常见的修饰作用，可使腺嘌呤A和胞嘧啶C甲基化而受到保护。通过甲基化作用达到识别自身遗传物质和外来遗传物质的目的。所以，能产生防御病毒侵染的限制酶的细菌，其自身的基因组中可能有该酶识别的序列，只是该识别序列或酶切位点被甲基化了。
2 限制性内切酶2的分类及特点？
限制性核酸内切酶（restriction endonucleases ），简称限制酶，是一类能识别和切割双链DNA 分子中的某些特定核苷酸序列的核酸水解酶，主要从细菌中分离得到。根据结构和功能特性，把限制酶分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型。Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化，又催化非甲基化的DNA的水解；而Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。III型限制性内切酶同时具有修饰及认知切割的作用。
3 原核表达载体，画图表示，指出各部分的功能。
原核表达载体指：能携带插入的外源核酸序列进入原核细胞中进行表达的载体。
原核表达载体调控原件：
启动子：是DNA链上一段能与RNA聚合酶结合并起始RNA合成的序列，它是基因表达不可缺少的重要调控序列。在转录起始点上游5～10 bp处，有一段由6～8个碱基组成，富含A 和T的区域，称为Pribnow 盒，又名TATA 盒或－10区。来源不同的启动子，Pribnow 盒的碱基顺序稍有变化。在距转录起始位点上游35 bp处，有一段由10 bp组成的区域，称为-35区。
SD序列：它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3～10 bp处的由3～9 bp组成的序列。这段序列富含嘌呤核苷酸，刚好与16S rRNA 3¢末端的富含嘧啶的序列互补，是核糖体RNA的识别与结合位点。
终止子：一个操纵子的3'末端往往有特定的核苷酸序列，且具有终止转录功能，这一序列称之为转录终止子，简称终止子(terminator)。
4 酵母表达载体，画图表示，指出各部分的功能。
载体基本信息
载体名称: pYES2-CT, pYES2/CT
质粒类型: 酿酒酵母表达载体
表达水平: 高拷贝
诱导方法: 半乳糖
启动子: GAL1
克隆方法: 多克隆位点，限制性内切酶
5 测序引物及序列: GAL1-F: AATATACCTCTATACTTTAACGTC
3 测序引物及序列: CYC1-R: GCGTGAATGTAAGCGTGAC
载体标签: C-His, C-V5
载体抗性: 氨苄青霉素
筛选标记: URA3报告基因
克隆菌株: TOP10, E.coli
表达菌株: INVSc1, Saccharomyces cerevisiae
备注: 酿酒酵母表达载体pYES2/CT含有URA3报告基因；GAL1启动子驱动目的基因高水
平表达；半乳糖诱导目基因表达，葡萄糖阻遏目的基因表达，二者起到分子开关作用。
组成型/诱导型: 诱导型
5 以lac为例说明操纵子。
操纵子（operon）：很多功能上相关的基因前后相连成串，由一个共同的控制区进行转录的控制，包括结构基因以及调节基因的整个DNA序列。
当在培养基中只有乳糖时由于乳糖的代谢产物异乳糖是lac操纵子的诱导物，它可以结合在阻遏蛋白的变构位点上，使构象发生改变，破坏了阻遏蛋白与操纵基因的亲和力，不能与操纵基因结合，于是RNA聚合酶结合于启动子，并顺利地通过操纵基因，进行结构基因的转录，产生大量分解乳糖的酶，这就是当大肠杆菌的培养基中只有乳糖时利用乳糖的原因。
6 判断PCR产物
1.琼脂糖凝胶电泳同时点分子量marker,根据marker条带判断产物分子量大小,从而大致判断是不是你要的
2.酶切已知你产物的序列,看上面有什么酶切位点,用一个酶或者两个酶切断,看与理论预测的条带数目和大小是否一致.一般检测有以上两步就行了,如果需要知道确切的需要进行3
3.测序连接到pMD-18t 载体上,转到大肠杆菌中.拿到公司去测序,测序结果通过gene bank 比对看与哪个基因一致,这种方法最准确
4.表达pcr产物连到真核或者原核表达载体上,适宜条件表达出来以后的蛋白做质谱分析,看与理论产物表达的蛋白是否有一致的片段。
7 真核表达调控
真核基因表达调控的特点：
真核基因表达调控的环节更多；基因表达是基因经过转录、翻译、产生有生物活性的蛋白质的整个过程。
真核基因的转录与染色质的结构变化相关；真核基因组DNA绝大部分都在细胞核内与组蛋白等结合成染色质，染色质的结构、染色质中NA和组蛋白的结构状态都影响转录。
真核基因表达以正性调控为主；真核RNA聚合酶对启动子的亲和力很低，基本上不依靠自身来起始转录，需要依赖多种激活蛋白的协同作用。真核基因调控中虽然也发现有负性调控
元件，但其存在并不普遍。
真核基因转录水平的调控：
顺式作用元件：一、启动子，真核同启动子间不像原核那样有明显共同一致的序列，而且单靠RNA聚合酶难以结合DNA而起动转录，而是需要多种蛋白质因子的相互协调作用，不同蛋白质因子又能与不同DNA序列相互作用，不同基因转录起始及其调控所需的蛋白因子也不完全相同，因而不同启动子序列也很不相同，要比原核更复杂、序列也更长。；二、增强子，增强子提高同一条DNA链上基因转录效率，可以远距离作用，通常可距离1－4kb、个别情况下离开所调控的基因30kb仍能发挥作用，而且在基因的上游或下游都能起作用。三、沉寂子，最早在酵母中发现，以后在T淋巴细胞的T抗原受体基因的转录和重排中证实这种负调控顺式元件的存在。
反式作用因子：以反式作用影响转录的因子可统称为转录因子(transcription factors, TF)，在真核细胞中RNA聚合酶通常不能单独发挥转录作用，而需要与其他转录因子共同协作。转录因子从功能上分析其结构可包含有不同区域，①DNA结合域(DNA binding domain)，多由60－100个氨基酸残基组织的几个亚区组成；②转录激活域(activating domain)，常由30－100氨基酸残基组成，这结构域有富含酸性氨基酸、富含谷氨酰胺、富含脯氨酸等不同种类，以酸性结构域最多见；③连接区，即连接上两个结构域的部分。常见DNA结合域：①螺旋-转角-螺旋及螺旋-环-螺旋，②锌指(zinc finger)，③碱性－亮氨酸拉链等。
8 如何设计引物将两个基因片段融合在一起？
9 化学合成的寡核酸片断在连接前为何5'端要磷酸化，磷酸化的方法？
DNA连接酶（DNA Ligase）也称DNA黏合酶，在分子生物学中扮演一个既特殊又关键的角色，那就是连接DNA链3‘-OH末端和，另一DNA链的5’-P末端，使二者生成磷酸二酯键，从而把两段相邻的DNA链连成完整的链。
5'端磷酸化：
T4 多聚核苷酸激酶(T4 Polynucleotide Kinase)该酶能够催化磷酸在ATP的γ-位和寡核苷酸链（双链或单链DNA或RNA）的5'-羟基末端的磷酸化，以便进行连接反应。它的缓冲液为:70 mM Tris-HCl (pH 7.6), 10 mM MgCl2 , 5 mM DTT,在液中加入终浓度为1 mM的ATP，37°C温育1 小时。
该酶在新鲜缓冲液中表现最适酶活力（在旧缓冲液中，由于DTT氧化而造成的实际DTT含量减少会降低酶活力）。
要提高5'平滑末端或5'凹陷末端的磷酸化效率，可在加T4多聚核苷酸激酶前，先将DNA溶液于70°C加热5分钟，然后冰上冷却，或者加入5% (W/V)的PEG-8,000。
由于T4多聚核苷酸激酶可被铵离子所抑制，所以磷酸化步骤前，DNA不要在含铵离子的溶液中沉淀。
FPLC
FPLC全称为快速蛋白液相色谱（Fast protein liquid chromatography），FPLC是专门用来分离
蛋白质、多肽及多核苷酸的系统，是HPLC近年来的一项重要革新，它不但保持了HPLC的快速、高分辨率等特性，而且还具有柱容量大、回收效率高及不易使生物大分子失活等特性。
原理与HPLC(高效液相色谱)相同：都是由经典的液体柱层析引入气相色谱理论，并且对相体进行了改革，配用高压输液泵，采用高灵敏检测器、梯度洗脱装置、自动收集装置和微机等发展起来的现代液相色谱。
特点：二者均具有快速、分辨率高、检测灵敏度高、分离效能高等特点，而且FPLC还具有柱容量大、回收效率高及不易使生物大分子失活等特性。
应用范围：HPLC可分析低分子量沸点样品；高沸点、中分子、高分子有机化合物（包括极性、非极性）；离子型无机化合物；热不稳定，具有生物活性的生物分子。FPLC是专门用来分离蛋白质、多肽及多核苷酸的系统，应用于蛋白、有机化合物的分离纯化，比HPLC操作过程简单，费时少，重复性好，但购买商品化...
论述题：
1 质谱的原理及在分子生物学的应用？
原理：使试样中各组分电离生成不同荷质比的离子，经加速电场的作用，形成离子束，进入质量分析器，利用电场和磁场使发生相反的速度色散——离子束中速度较慢的离子通过电场后偏转大，速度快的偏转小；在磁场中离子发生角速度矢量相反的偏转，即速度慢的离子依然偏转大，速度快的偏转小；当两个场的偏转作用彼此补偿时，它们的轨道便相交于一点。与此同时，在磁场中还能发生质量的分离，这样就使具有同一质荷比而速度不同的离子聚焦在同一点上，不同质荷比的离子聚焦在不同的点上，将它们分别聚焦而得到质谱图，从而确定其质量。
分子生物学中的应用：一、质谱在核酸水平上检测疾病相关基因也是近年来的一个热点。基因变异导致的疾病往往会引起标志基因———SNP的改变, 质谱能够测定突变前后的SNP的分子量, 通过比较,推定其突变方式。Bunger等人[ 3] 的研究应用质谱分析鸟枪法处理后的SNP编码序列, 得到了与疾病相关的蛋白组学的正交分析数据。二、在蛋白质的研究方面, 质谱测定内容包括蛋白质的一级结构如分子量的测定、蛋白质组研究、肽指纹图谱测定、肽序列的测定、巯基和二硫键的定位、蛋白质翻译后的修饰等。
2 别构酶？
当某些化合物与酶分子中的别构部位可逆地结合后，酶分子的构象发生改变，使酶活性部位对底物的结合与催化作用受到影响，从而调节酶促反应速度及代谢过程，这种效应称为别构效应。具有别构效应的酶称为别构酶。
别构酶的反应初速度与底物浓度（V对[S]）的关系不服从米氏方程。而是呈现S形曲线。S 形曲线表明，酶分子上一个功能位点的活性影响另一个功能位点的活性，显示协同效应（cooperative effect ）, 当底物或效应物一旦与酶结合后，导致酶分子构象的改变，这种改变了的构象大大提高了酶对后续的底物分子的亲和力。结果底物浓度发生的微小变化，能导致酶促反应速度极大的改变。
天冬氨酸转氨甲酰酶（Aspartate transcarbamoylase ATCase）是了解最清楚的一个别构酶。它催化嘧啶核苷酸合成途径中的第一个中间物N –氨甲酰天冬氨酸的合成，ATCase受其代谢途径的终产物CTP （三磷酸胞苷）的别构抑制。
3 蛋白质结构的研究方法及新进展？
一级：
Edman降解法、（Edman degradation）：是测定蛋白质一级结构的方法，主要是从蛋白质或多肽氨基末端进行分析。由埃德曼（P．Edman）在上世纪50年代所创立。分为耦合、切割、萃取、转化、鉴定等几个步骤。首先在pH9.0的碱性环境下，将异硫氰酸苯酯(Ph—N=C=S，PITC)和蛋白质或多肽N端氨基酸耦合，形成苯氨基硫甲酰(PTC)衍生物；然后以三氟乙酸(TFA)处理耦合后产物，将多肽或蛋白的N一端第一个肽键选择性的切断，释放出该氨基酸残基的噻唑啉酮苯胺衍生物；随后萃取出释放的氨基酸衍生物并在强酸性条件下转化为稳定的乙内酰苯硫脲氨基酸(PTH-氨基酸)；最后以色谱法鉴定出降解下来的PTH-氨基酸种类，从而得到蛋白质或多肽N端序列信息。
质谱法、待测化合物分子吸收能量（在离子源的电离室中）后产生电离，生成分子离子，分子离子由于具有较高的能量，会进一步按化合物自身特有的碎裂规律分裂，生成一系列确定组成的碎片离子，将所有不同质量的离子和各离子的多少按质荷比记录下来，就得到一张质谱图。由于在相同实验条件下每种化合物都有其确定的质谱图，因此将所得谱图与已知谱图对照，就可确定待测化合物用电场和磁场将运动的离子（带电荷的原子、分子或分子碎片）按它们的质荷比分离后进行检测的方法。测出了离子的准确质量，就可以确定离子的化合物组成。
生物信息预测。
三级结构：
x射线衍射法、X射线晶体学是一门利用X射线来研究晶体中原子排列的学科。更准确地说，利用电子对X射线的散射作用，X射线晶体学可以获得晶体中电子密度的分布情况，再从中分析获得原子的位置信息，即晶体结构。X射线晶体学将X射线与晶体学联系在一起，从而可以对各类晶体结构进行研究，特别是蛋白质晶体结构。
核磁共振技术、核磁共振技术可以直接研究溶液和活细胞中相对分子质量较小(20，000 道尔顿以下)的蛋白质、核酸以及其它分子的结构，而不损伤细胞。与此同时，其可以解决蛋白质、DNA/RNA、碳水化合物的结构，可以鉴定动态特征。
三维电镜重构技术、电镜三维重构技术是电子显微术、电子衍射与计算机图像处理相结合而形成的适于分析难以形成三维晶体的膜蛋白等大的复合体三维结构的分析技术。
总结：X线晶体衍射是最经典的测定生物大分子结构的方法。蛋白质晶体衍射中最大的难点就在于蛋白质的结晶，也在一定程度上限制了它的发展。NMR技术后起之秀，相对于X-RAY 较为简单，近年来技术越发成熟，可测定蛋白质的分子量也在攀升，而且其分辨率也很高，三维电镜重构技术也是结构生物学研究中的一种较新的技术。技术难点在于算法。
荧光共振能量转移技术（FRET）：荧光能量共振转移是距离很近的两个荧光分子间产生的，一种能量转移现象。当供体荧光分子的发射光谱与受体荧光分子的吸收光谱重叠，并且两个分子的距离在10nm范围以内时，就会发生一种非放射性的能量转移，即FRET现象，使得
供体的荧光强度比它单独存在时要低的多（荧光猝灭），而受体发射的荧光却大大增强（敏化荧光）。
4 从生物样品中纯化蛋白，应注意些什么？
在进行任何一种蛋白质纯化的时候，都要时刻注意维护它的稳定性，保护它的活性，有一些通用的注意事项需要牢记，它们包括：
1、操作尽可能置于冰上或者在冷库内进行。
2、不要太稀，蛋白浓度维持在μg/mL～mg/mL。
3、合适的pH，除非是进行聚焦层析，所使用的缓冲溶液pH避免与pI相同，防止蛋白质的沉淀。
4、使用蛋白酶抑制剂，防止蛋白酶对目标蛋白的降解；在纯化细胞中的蛋白质时，加入DNA 酶，降解DNA，防止DNA对蛋白的污染。
5、避免样品反复冻融和剧烈搅动，以防蛋白质的变性。
6、缓冲溶液成分尽量模拟细胞内环境。
7、在缓冲溶液中加入0.1~1mmol/LDTT（二硫苏糖醇）(或β-巯基乙醇），防止蛋白质的氧化。
8、加1~10mmol/LEDTA金属螯合剂，防止重金属对目标蛋白的破坏。
9、使用灭菌溶液，防止微生物生长。
CAS-ibp-2008
名词解释：
染色质重塑: 染色质重塑复合物依靠水解ATP提供能量驱动核小体的置换或重新排列，而造成的染色质结构的改变。
同源蛋白：氨基酸序列具有明显的相似性,在不同生物体或同一机体内行使相同或相似功能的蛋白质。同源蛋白质具有物种差异性和共同的进化起源。
糖异生(gluconenogenesis)：非糖的前体物质如丙酮酸、甘油、乳酸和绝大多数氨基酸、三羧酸循环的中间代谢物等转变为葡萄糖和糖原的过程。主要在肝脏中进行，在肾脏也可进行。
酶竞争性抑制（competitive inhibition）：抑制剂和酶底物结构相似，可与底物竞争酶活性中心，从而抑制酶和底物结合成中间产物。
逆转座子(retrotransposons)：在基因组内存在着通过DNA转录为RNA后，再经逆转录成为cDNA并插入到基因组的新位点上的因子，被称为逆转座子。逆转座作用的关键酶为逆转录酶和整合酶。
亲和层析（affinity chromatography）：将具有特殊结构的亲和分子制成固相吸附剂放置在层析柱中，当要被分离的蛋白混合液通过层析柱时，与吸附剂具有亲和能力的蛋白质就会被吸附而滞留在层析柱中。那些没有亲和力的蛋白质由于不被吸附，直接流出，从而与被分离的蛋白质分开，然后选用适当的洗脱液，改变结合条件将被结合的蛋白质洗脱下来，这种分离纯化蛋白质的方法称为亲和层析。
简答及论述：
给出6中非编码RNA说明其作用。
非编码RNA（Non-coding RNA）是指不编码蛋白质的RNA。其中包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等
snRNA 是small nuclear RNA的简称，也称作小核RNA。其功能是与蛋白因子结合形成小核核糖蛋白颗粒（small nuclear ribonucleo-protein partcle，简称snRNPs），行使剪接mRNA的功能。snRNA 主要包括5 种：U1，U2，U4，U5 和U6。
snoRNA 是最早在核仁发现的小RNA，称作小核仁RNA，最初发现它们的生物功能是用来修饰rRNA的。
MicroRNA 是一类21~23 nt 的小RNA，其前体大概是70~100 nt 左右，形成标准的stem 结构，加工后成为21~23 nt 的单链RNA。microRNA 的作用机制是与mRNA 互补，让mRNA 沉默或者降解。
circularRNA：很多环状RNA是蛋白编码RNA经过不同方式剪接形成的非编码RNA，没有5’和3’端相对不被核酶剪切相对稳定。
siRNA：体内行驶RNAi功能的小分子。
tRNA，氨基酸的携带和rRNA蛋白质的合成等
蛋白质免疫沉淀和染色质免疫沉淀的原理及在网络调控中的作用。
蛋白质免疫沉淀原理（CO-IP）：免疫沉淀是利用抗体特异性反应纯化富集目的蛋白的一种方法。抗体与细胞裂解液或表达上清中相应的蛋白结合后，再与蛋白A/G（ProteinA/G）或二抗偶联的agarose或Sepharose珠子孵育，通过离心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗体-目的蛋白复合物，沉淀经过洗涤后，重悬于电泳上样缓冲液，煮沸5-10min，在高温及还原剂的作用下，抗原与抗体解离，离心收集上清，上清中包括抗体、目的蛋白和少量的杂蛋白。
染色质免疫沉淀的原理（Chip）：基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得蛋白质与DNA 相互作用的信息。它能真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白，是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的一种很好的方法。
RNA免疫共沉淀（RIP）：实验基本原理；1. 用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白。2. 防止非特异性的RNA的结合。3. 免疫沉淀把RNA结合蛋白及其结合的RNA一起分离出来。4.结合的RNA序列通过microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR 或高通量测序（RIP-Seq）方法来鉴定。
RNA-pull down：使用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。
给出5例绿色荧光蛋白在生物化学中的应用。
它之所以能够发光，是因在其包含238个氨基酸的序列中，第65至67个氨基酸(丝氨酸—酪氨酸—甘氨酸）残基，可自发地形成一种荧光发色团。
详述真核生物从转录到翻译后的基因表达调控。
转录前调节：染色体丢失,基因扩增,染色体DNA修饰和异染色质化,基因重排
转录水平：染色质活化,顺式作用元件与反式作用因子等
加工水平：hnRNA的加工形成成熟mRNA,如果是rRNA、tRNA及其他小分子RNA也有一些加工修饰
翻译水平：主要是mRNA稳定性调节
翻译后水平：涉及蛋白质的剪切和激活,蛋白质的修饰与加工折叠等
线粒体蛋白，膜蛋白，核蛋白和分泌蛋白是如何被运输至靶部位的。
从蛋白质分选的转运方式和机制来看，可将蛋白质转运分为4类：
1、蛋白质的跨膜转运（transmembrane transport）：主要是指在细胞质基质中合成的蛋白质转运到内质网、线粒体、质粒（包括叶绿体）和过氧化物酶体等细胞器，但进入内质网与线粒体、叶绿体和过氧化物酶体等细胞器的机制又有所不同。与分泌蛋白N端信号肽引导序列定位于内质网不同，进入线粒体、叶绿体和过氧化氢酶体等细胞器的蛋白质分选是一个多步过程，需要多个不同的寻靶序列，定位到叶绿体的前体蛋白N端具有40~50个氨基酸组成的转运肽，用以指引多肽定位到叶绿体并进一步穿透叶绿体膜进入基质中。转运到线粒体和过氧化物酶体的蛋白与此类似，但靠的是不同的引导序列，线粒体蛋白N端的导肽或过氧化物酶体蛋白C端的内在引导信号。至于这些细胞器蛋白最终是定位在不同的膜上还是不同的基质空间，除与N端不同转运肽相关外，还需要其他空间定位信号序列参与决定。此外，通过翻译后转运途径进入线粒体、叶绿体和过氧化物酶体等细胞器的蛋白质，也必须在分子伴侣的帮助下解折叠或维持非折叠状态，这有利于通过膜上的输入装置。蛋白质输入这些细胞器通常是需要能量的过程。
2膜泡运输（vesicular transport）：蛋白质通过不同类型的转运小泡从糙面内质网合成部位转运至高尔基体，进而分选转运至细胞的不同部位，其中涉及各种不同的运输小泡的定向转运，以及膜泡出芽与融合的过程。
3、选择性的门控转运（gated transport）：在细胞质基质中合成的蛋白质通过核孔复合体选择性地完成核输入（核输入）或丛细胞核返回细胞质（核输出），参见核孔复合体的选择性运输。
4、细胞质基质中的蛋白质转运：上述几种分选类型也涉及蛋白质在细胞基质中的转运，这一过程显然与细胞骨架系统密切相关，但由于细胞质基质的结构并不清楚，因此对其中的蛋白质转运特别是伴随信号转导途径中的蛋白质分子的转运方式了解很少。
CAS-ibp-2010
名词解释：
mitochondrion，是一种存在于大多数细胞中的由两层膜包被的细胞器，是细胞中制造能量的
结构，是细胞进行有氧呼吸的主要场所，其直径在0.5到1.0微米左右。
端粒（Telomeres），存在于真核细胞线状染色体末端的一小段高度重复DNA序列和蛋白质构成的染色体末端结构，DNA分子每次分裂复制端粒就缩短一点，端粒其长度反映细胞复制史及复制潜能，被称作细胞寿命的“有丝分裂钟”。
iPS；用病毒载体将四个转录因子（Oct4, Sox2, Klf4 和c-Myc）的组合转入分化的体细胞中，使其重编程而得到的类似胚胎干细胞和胚胎APSC多能细胞的一种细胞类型。
stem cell, 早期胚胎（原肠胚期之前）或原始性腺中分离出来的一类细胞，它具有体外培养无限增殖、自我更新和多向分化的特性。它可以诱导成为外胚层、中胚层及内胚层三种胚层的细胞组织
表观遗传：表观遗传学即研究没有DNA 序列变化的、可遗传的基因表达改变。表观遗传现象包括DNA甲基化、RNA干扰、组蛋白修饰和染色质重塑等。
糖胺聚糖（glycosaminoglycan），曾称粘多糖，由含己糖醛酸（角质素除外）和己糖胺成分的重复复合单位构成不分支的长链聚合物。主要存在于高等动物结缔组织中，植物中也有发现。
简答及论述题：
癌细胞的基本特征
癌细胞是由正常细胞转化而来，它除了仍具有来源细胞的某些特性（如上皮癌仍可合成角质蛋白）外，还表现出癌细胞独具的特性。
⑴无限增殖；在适宜条件下，癌细胞能无限增殖，成为“不死”的永生细胞。
⑵接触抑制现象丧失；正常细胞生长相互接触后，其运动和分裂活动都要停顿下来。在体外培养条件下则表现为细胞贴壁生长汇合成单层后即停止生长。癌细胞则不同，其分裂和增殖并不因细胞相互接触而终止，在体外培养时细胞可堆累成立体细胞群，故癌细胞接触对癌细胞的增殖无抑制作用。
⑶癌细胞间粘着性减弱；癌细胞与其同源正常组织相比，细胞间的粘着性降低，故癌细胞在体内容易分散和转移。
⑷易于被凝集素凝集；与正常细胞相比，癌细胞更容易被凝集素所凝集，故引起癌细胞凝集所需的凝集素浓度要比正常细胞的低得多。
⑸粘壁性下降；在体外培养中，细胞贴壁生长，这与细胞分泌葡糖胺聚糖粘性物质有关。葡糖胺聚糖是构成细胞外基质的主要成分，可形成水合凝胶。癌细胞合成葡糖胺聚糖减少，导致细胞粘壁性能下降。
⑹细胞骨架结构紊乱；癌细胞中微管变短，排列紊乱，微丝亦发生结构异常。
⑺产生新的膜抗原；癌细胞丢失了质膜上的主要组织相容性抗原，而出现了一些新的相关性膜抗原。这些新的膜抗原是由正常细胞表面的糖蛋白修饰而成。同时由于表面蛋白质运动增强，使表面蛋白更易被相应抗体所凝集。
⑻对生长因子需要量降低；正常细胞在体外一般要在含有10%以上的血清的培养液中才能生长，血清中含有一些细胞生长所需要的生长因子，如表皮生长因子(PGF)、血小板衍生生长因子(PGDF)、胰岛素等。而转化细胞却能在血清浓度很低的培养液中生长，对生长因子的需
求量大大降低。
（9）线粒体功能障碍；即使在氧供应充分的条件下也主要是糖酵解途径获取能量。与三个糖酵解关键酶（己糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶）活性增加和同工酶谱的改变，以及糖原异生关键酶活性降低有关。
（10）可移植性；正常细胞移植到宿主体内后，由于免疫反应而被排斥，多不易存活。但是肿瘤细胞具有可移植性，如人的肿瘤细胞可移植到鼠类体内，形成移植瘤。
RTK信号通路
RTKs (receptor tyrosine kinase, RTKs)：是最大的一类酶联受体，它既是受体，又是酶，能够同配体结合，并将靶蛋白的酪氨酸残基磷酸化。所有的RTKs都是由三个部分组成的：含有配体结合位点的细胞外结构域、单次跨膜的疏水α螺旋区、含有酪氨酸蛋白激酶（RTK）活性的细胞内结构域。
RTK-Ras信号通路是这类受体所介导的重要信号通路，具有广泛的功能，包括调解细胞的增值与分化，促进细胞存活，以及细胞代谢过程中的调节与校正作用。RTK-Ras信号通路的基本模式是：配体→RTK→接头蛋白→GRF→Ras→Raf（MAPKKK）→MAPKKK→MAPK→进入细胞核→其他激酶或基因调控蛋白（转录因子）的磷酸化修饰。
脂筏模型
什么是干细胞和多能干细胞，各有什么特点？
蛋白质运输的类型
研究一个基因的功能
已知一个基因在一个信号通路中，怎么确定该基因的位置？
①先通过激活或抑制目的基因/通路（可以通过药物或者转染表达/干扰质粒等），WB检测下游关键蛋白的表达水平是否有所变化后，确定有作用的通路后再进一步细做、铺开
②做knock-out和过度表达，然后看其他基因和产物的变化，推出上下游
N-连接寡糖和O-连接寡糖有什么区别，N-连蛋白和O-连蛋白分别是怎么生成的？
N-连接寡糖：结合在糖蛋白的天冬酰胺侧链氨基上的分支寡糖链
O-连接寡糖：结合在糖蛋白的丝氨酸或苏氨酸羟基侧链上的寡糖链。
N-连蛋白：末端葡萄糖胺的糖环C1原子与多肽链上天冬酰胺侧链氨基上的-NH2氮原子共价链接。
O-连蛋白：末端乳糖胺的糖环C1原子与多肽链上丝氨酸或苏氨酸羟基侧链上的-OH氧原子共价链接。
蛋白质翻译后的修饰机制
(1)N—端修饰原核生物修饰时是由肽甲酰基酶除去甲酰基，多数情况甲硫氨酸也被氨肽酶除去，真核生物中甲硫氨酸则全部被切除。
(2)多肽链的水解切除水解切除其中多余的肽段，使之折叠成为有活性的酶或蛋白质。如酶原激活
(3)氨基酸侧链的修饰氨基酸侧链的修饰包括羟化、羧化、甲基化及二硫链的形成等。
(4)糖基化修饰糖蛋白是细胞蛋白质组成的重要成分。它是在翻译后的肽链上以共价键与单糖或寡聚糖连接而成。糖基化是在酶催化下进行的。
高能磷酸化合物有哪几种？
高能磷酸化合物是指水解时释放的能量在20.92kJ/mol以上的磷酸化合物。机体内有许多磷酸化合物如ATP，1,3—二磷酸甘油酸，氨甲酰磷酸，磷酸烯醇式丙酮酸，磷酸肌酸，磷酸精氨酸等，它们的高能磷酸键断裂时，可释放出大量的自由能，这类化合物称为高能磷酸化合物。
从化学结构上含高能磷酸键的化合物分为：1、磷酸酐（P-O），如焦磷酸，核苷酸；2、羧酸和磷酸合成的混合酸酐（P-O），如乙酰磷酸，1，3-二磷酸甘油酸，氨基酰-AMP；3、烯醇磷酸，如磷酸烯醇式丙酮酸；4、磷氨酸衍生物（R-NH-PO3H2），如磷酸肌酸
ATP酶的种类有哪几种（P,V,F型）
四种类型的运输ATPase
编辑
①P型离子泵（P-type ion pump)，或称P型ATPase。此类运输泵运输时需要磷酸化（P是phosphorylation的缩写），包括Na+-K+泵、Ca2+离子泵。
②V型泵（V-type pump），或称V型ATPase，主要位于小泡的膜上（V代表vacuole或vesicle），如溶酶体膜中的H+泵，运输时需要ATP供能，但不需要磷酸化。
③F型泵（F-type pump），或称F型ATPase。这种泵主要存在于细菌质膜、线粒体膜和叶绿体的膜中，它们在能量转换中起重要作用，是氧化磷酸化或光合磷酸化偶联因子（F即factor 的缩写）。F型泵工作时不会消耗ATP，而是将ADP转化成ATP，但是它们在一定的条件下也会具有ATPase的活性。
④ABC运输蛋白（ATP-binding cassette transportor），这是一大类以ATP供能的运输蛋白，已发现了100多种，存在范围很广，包括细菌和人。
CAS-ibp-2011
名词解释：
简答：
1、生物膜的基本成分，每种成分又分为哪几类
膜脂；构成膜的脂类有磷脂、胆固醇和糖脂,其中以磷脂为最多.这三种脂类都是双亲媒性分子,即它们都是由一个亲水的极性头部和一个疏水的非极性尾部组成.由于膜脂的这一结构特点,它们在水溶液中能自动聚拢形成脂双分子层,其游离端往往有自动闭合的趋势,形成一种自我封闭而稳定的中空结构,称脂质体.
a磷脂真核细胞膜中的磷脂主要有卵磷脂（磷脂酰胆碱）、脑磷脂（磷脂酰乙醇胺）、磷脂酰丝氨酸、鞘磷脂合磷脂酰肌醇.
b 胆固醇是细胞膜内的中性脂类. 在膜中,胆固醇分子散布在磷脂分子之间,其极性的羟基头部紧靠磷脂的极性头部,将固醇环固定在近磷脂头部的碳氢链上,其余部分分离.这种排列方式对膜的稳定性十分重要.
c糖脂是含一个或几个糖基的脂类, 动物细胞膜中的糖脂主要是鞘氨醇的衍生物,结构与鞘磷脂相似,只是其头部以糖基替代了磷脂酰碱基.脑苷脂是最简单的糖脂,只含一个糖基（半乳糖或葡萄糖）.在所有细胞中,糖脂均位于膜的非胞质面单层,并将糖基暴露在细胞表面,其作用可能是作为某些大分子的受体,与细胞识别及信息传导有关
膜蛋白；生物膜所含的蛋白叫膜蛋白,是生物膜功能的主要承担者.根据蛋白分离的难易及在膜中分布的位置,膜蛋白基本可分为两大类：外在膜蛋白和内在膜蛋白
a外在膜蛋白约占膜蛋白的20％～30％,分布在膜的内外表面,主要在内表面,为水溶性蛋白,它通过离子键、；氢键与膜脂分子的极性头部相结合,或通过与内在蛋白的相互作用,间接与膜结合。
b内在蛋白约占膜蛋白的70％～80％,是双亲媒性分子,可不同程度的嵌入脂双层分子中.有的贯穿整个脂双层,两端暴露于膜的内外表面,这种类型的膜蛋白又称跨膜蛋白.内在膜蛋白露出膜外的部分含较多的极性氨基酸,属亲水性,与磷脂分子的亲水头部邻近；嵌入脂双层内部的膜蛋白由一些非极性的氨基酸组成,与脂质分子的疏水尾部相互结合,因此与膜结合非常紧密
膜糖；糖蛋白、糖脂细胞膜糖类主要是一些寡糖链和多糖链，它们都以共价键的形式和膜脂质或蛋白质结合，形成糖脂和糖蛋白；这些糖链绝大多数是裸露在膜的外面（非细胞质）一侧的。（多糖-蛋白质复合物，细胞外壳cell coat）单糖排序上的特异性作为细胞或蛋白质的“标志、天线”
膜的流动性
生物膜的流动性是膜脂与膜蛋白处于不断的运动状态,它是保证正常膜功能的重要条件.在生理状态下,生物膜既不是晶态,也不是液态,而是液晶态,即介于晶态与液态之间的过渡状态.在这种状态下,其既具有液态分子的流动性,又具有固态分子的有序排列.当温度下降至某一点时,液晶态转变为晶态；若温度上升,则晶态又可溶解为液晶态.这种状态的相互转化称为相变,引起相变的温度称相变温度.在相变温度以上,液晶态的膜脂总是处于可流动状态.膜脂分子
有以下几种运动方式：①侧向移动；②旋转运动；③左右摆动；④翻转运动.膜蛋白分子的运动形式有侧向运动和旋转运动二种.
膜的不对称性
以脂双层分子的疏水端为界,生物膜可分为近胞质面和非胞质面内外两层,生物膜内外二层的结构和功能有很大差异,这种差异称为生物膜的不对称性.
膜脂分布的不对称主要体现在膜内外两层脂质成分明显不同.如磷脂中的磷脂酰胆碱和鞘磷脂多分布在膜的外层,而磷脂酰乙醇胺、磷脂酰丝氨酸和磷脂酰肌醇多分布在膜的内层,其中磷脂酰乙醇胺和磷脂酰丝氨酸的头部基团均带负电,致使生物膜内侧的负电荷大于外侧.膜蛋白分布的不对称主要体现在三个方面：①即使是膜内在蛋白都贯穿膜全层,但其亲水端的长度和氨基酸的种类与顺序也不同；②外在蛋白分布在膜的内外表面的定位也是不对称的,如具有酶活性的膜蛋白Mg2＋-ATP酶、5'核苷酸酶、磷酸二酯酶等均分布在膜的外表面,而腺苷酸环化酶分布在膜的内表面；③含低聚糖的糖蛋白,其糖基部分布在非胞质面
2、信号肽的含义，作用，怎样起作用的
定义：分泌蛋白新生肽链N端的一段20～30氨基酸残基组成的肽段。有指导新合成多肽链跨膜转移（定位）的N-末端的氨基酸序列（有时不一定在N端）。
作用：当信号肽序列合成后，被信号识别颗粒(SRP)所识别，蛋白质合成暂停或减缓，信号识别颗粒将核糖体携带至内质网上，蛋白质合成重新开始。在信号肽的引导下，新合成的蛋白质进入内质网腔．而信号肽序列则在信号肽酶的作用下被切除
机制：信号肽假说认为，编码分泌蛋白的mRNA在翻译时首先合成的是N 末端带有疏水氨基酸残基的信号肽，信号肽翻译后被SRP（信号识别颗粒）识别，然后SRP和其受体结合，核糖体结合到膜上被内质网膜上的受体识别并与之相结合。SRP受体在蛋白质转运中的作用是短暂的。当SRP和信号肽结合时，它阻止了翻译。蛋白合成停止。当SRP与其受体结合时，SRP释放出信号肽，然后核糖体和膜上的其它成分（尚未鉴别出）结合，此时翻译得到恢复。信号肽经由膜中蛋白质形成的孔道到达内质网内腔，随即被位于腔表面的信号肽酶水解，由于它的引导，新生的多肽就能够通过内质网膜进入腔内，最终被分泌到胞外。翻译结束后，核糖体亚基解聚、孔道消失，内质网膜又恢复原先的脂双层结构。
3、体外蛋白相互作用的方法有那些，列举3中常用的方法，简述其原理
Far-western：在传统的western blotting中，凝胶电泳被用来从样品中分离蛋白质，然后这些蛋白质在blotting过程中被转移到膜上。目标蛋白在western blot中被抗体探针识别。far-western blotting用非抗体蛋白（探针）来检测目标蛋白，通过这种方式，与探针结合的蛋白质就被检测出来了。探针蛋白经常通过一种表达克隆载体在大肠杆菌中被生产出来。
GST-Pulldown：将靶蛋白-GST（Glutathione-S-transferase谷胱苷肽巯基转移酶）融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上,作为与目的蛋白亲和的支撑物,充当一种“诱饵蛋白”,目的蛋
白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”(目的蛋白),洗脱结合物后通过SDS-PAGE 电泳分析,从而证实两种蛋白间的相互作用或筛选相应的目的蛋白。GST：谷胱甘肽巯基转移酶(glutathione S-transferase)。
蛋白质芯片技术：将一个蛋白芯片与荧光标记的探针蛋白孵育，洗脱非特异性结合的蛋白，可以通过扫描芯片上的荧光点来检测稳定的相互作用的蛋白点。
免疫共沉淀技术：首先把把靶蛋白的抗体通过亲和反应链接到固体基质上，再将可能与靶蛋白相互作用的待筛选蛋白加入反应体系中，用低离心力沉淀或微膜过滤法在固体基质和抗体的共同作用下将蛋白复合物沉淀到试管的底部或微膜上，那么待筛选蛋白通过靶蛋白与抗体和固体基质相互作用被分离出来。
4、现代结构生物学中三种最重要的研究方法是什么，各有什么优缺点
结构生物学主要是用物理的手段,用X-射线晶体学,核磁共振波谱学,电镜技术等物理学技术来研究生物大分子的功能和结构。
X射线晶体衍射。
X射线晶体学：是一门利用X射线来研究晶体中原子排列的学科。更准确地说，利用电子对X射线的散射作用，X射线晶体学可以获得晶体中电子密度的分布情况，再从中分析获得原子的位置信息，即晶体结构。晶体中含有数量巨大的方位相同的分子，X射线对这些分子的衍射叠加在一起就能够产生足以被探测的信号。
X射线晶体结构测定优点：分辨率高；不损伤样品；无污染；相对快捷；能得到晶体完整性的大量信息。
X射线晶体结构测定存在问题：晶体构象是静态的，不能测定不稳定的过渡态的构象；很多蛋白质很难结晶，或者很难得到用于结构分析的足够大的单晶（瓶颈）；X射线晶体衍射的工作流程较长。
核磁共振
核磁共振主要是由原子核的自旋运动引起的。不同的原子核，自旋运动的情况不同，它们可以用核的自旋量子数I来表示。自旋量子数与原子的质量数和原子序数之间存在一定的关系。用核磁方法研究蛋白质结构的主要优点在于：蛋白质处于溶液状态；适合研究蛋白质-蛋白质，蛋白质-核酸，蛋白质-配基相互作用；可研究蛋白质分子内部运动；可研究膜蛋白。缺点在于。缺点在于：受分子量限制，需要标记。
三维电镜重构基本原理基于中央截面定理：三维物体沿电子束方向投影的傅立叶变换物体的完备投影与物体的三维结构是等价的。不用结晶是该方法的最大优点，而且对于研究传统方法不易研究的大分子复合物像核糖体有很大优势。
电镜三维重构技术是电子显微术、电子衍射与计算机图像处理相结合而形成的适于分析难以形成三维晶体的膜蛋白等大的复合体三维结构的分析技术。
X 射线晶体学、核磁共振波谱学、电子显微三维重构（亦称电镜三维重构）是结构生物学的三大研究手段，具有不同的优势。核磁共振波谱学可以获得蛋白质在溶液中的三维结构，能够分析蛋白质的动态变化，但是研究对象的分子量通常难以超过20 kD。X 射线晶体学
通常可以获得生物大分子原子分辨率的三维结构，但对于分子量较大、较复杂的生物复合分子体系，其晶体难以获得，结构解析难度也较大。当研究对象的尺度越来越大的时候，电子显微三维重构技术，特别是低温电子显微三维重构技术，就显示出其重要的作用，利用该技术我们可以获得分子量巨大（200 kD 以上）的超分子复合体系的纳米分辨率三维结构，弥补晶体学和核磁共振分析技术的不足，架起从蛋白质、蛋白质复合体、超分子复合体系到亚细胞系统的三维结构研究的桥梁。
5、一个嗜热菌中的一个蛋白的最适温度为65度，等电点5作用，ph小于5时易沉淀，分子量为30kd，有histag，已在大肠杆菌里过表达，设计实验得到纯度高且单分散的蛋白质1yPpsO
混合蛋白质提取：将重组表达质粒的菌体诱导后离心沉淀，用Buffer重悬超声波裂解，4℃14 000 g×30 min，取上清液。
等电点沉淀：用酸性缓冲液调节总蛋白提取液PH值略小于5，等电点沉淀。
SDS分离纯化（30KD）：胶回收纯化。
层析：将结合hisTag抗体的琼脂充分悬起，平衡至室温，装入层析柱中。缓冲液平衡后样品液过柱，洗去未结合蛋白。
6、染色质的基本成分是什么，核小体怎样装配成染色体的。
染色质的基本成分：①组蛋白和非组蛋白，②基因组DNA
组蛋白：有六种类型：H1、H2A、H2B、H3、H4及古细菌组蛋白，它们富含带正电荷的碱性氨基酸。从整体来说，组蛋白在进化过程中保守性很强。其中H1变化较大，H3和H4变化最小但修饰最普遍。
非组蛋白：高速泳动蛋白，DNA结合蛋白（主要是一些与DNA复制或转录有关的酶或调节物质）等。
基因组DNA：单拷贝基因（蛋白质编码基因），中度重复序列（rRNA，tRNA，组蛋白等编码基因），高度重复序列（卫星DNA，不转录）。
染色体装配：
①DNA（2nm）—7x—核小体（10nm）—6x—螺线管（30nm）—40x—超螺线管（0.4um）—5x—染色单体
②DNA————核小体————螺线管————袢环结构————染色单体
论述题：
1、给出一段204bp的目的片段，标出了所有的酶切位点，另有一个图为pet15b的多克隆位点图，以及酶切位点，让你把这段基因克隆到pet15b载体，并到有表达的设计和详细过程
（引物设计，PCR，酶切，链接，转化，诱导表达等等过程）（20分）
pet15b载体基本信息
别名: pET15b, pet 15b
质粒类型: 大肠杆菌蛋白表达
表达水平: 高
克隆方法: 多克隆位点，限制性内切酶
载体大小: 5708bp
5' 测序引物: T7
5' 测序引物序列: 5'-TAATACGACTCACTATAGGG-3'
载体标签: N-His, N-thrombin
载体抗性: Ampicillin
备注:
Hosts: E.coli. Related vectors: pBR322.
产品目录号: 69661-3
稳定性: 瞬时表达Transient
组成型: 组成型Constitutive
病毒/非病毒: 非病毒
2、给出一个3肽，让你标出其中的肽键，肽平面，二面角？a螺旋和b折叠的结构特点？给出一个拉氏构象图，让你标出a螺旋和b折叠的分布位置？（20分）
绕Cα-N键轴旋转的二面角（C-N-Cα-C）称为φ，绕Cα-C键轴旋转的二面角（N-Cα-C-N）称为ψ，这样多肽链主链的各种可能构象都可用φ和ψ这两个二面角或扭角来描述。
α螺旋是一种最常见的二级结构，最先由Linus Pauling和Robert Corey于1951年提出，其主要内容是：
①肽链骨架围绕一个轴以螺旋的方式伸展；
②螺旋形成是自发的，肽链骨架上由n位氨基酸残基上的-C=O与n+4位残基上的-NH之间形成的氢键起着稳定的作用；被氢键封闭的环含有13个原子，因此α螺旋也称为3.6/13螺旋；
③每隔3.6个残基，螺旋上升一圈；每一个氨基酸残基环绕螺旋轴100°，螺距为0.54nm，即每个氨基酸残基沿轴上升0.15nm；螺旋的半径是0.23nm；Φ角和Ψ角分别为-57°和-48°；
④α螺旋有左手和右手之分，但蛋白质中的α螺旋主要是右手螺旋；
⑤氨基酸残基的R基团位于螺旋的外侧，并不参与螺旋的形成，但其大小、形状和带电状态却能影响螺旋的形成和稳定。
-折叠结构：是一种由伸展的多肽链（称之b链）组成的二级结构。b-折叠又分为平行式（所有肽链的N端都在同一方向）和反平行式（肽链N端一反一正）。在a-螺旋中，每一个氨基酸残基绕轴上升0.15nm，但在b-构象中，每个残基大约占0.32～0.34nm，羰基氧和酰胺氢之间的氢键起着稳定b-折叠结构的作用。
CAS-ibp-2012
名词解释：
简答及论述题：
1. 四种蛋白质相互作用的方法及原理
噬菌体展示技术（phage display）：其基本原理是：将编码多肽的外源DNA片段与噬菌体表面蛋白的编码基因融合后，以融合蛋白的形式呈现在噬菌体的表面，被展示的多肽或蛋白可保持相对的空间结构和生物活性，展示在噬菌体的表面。导入了各种各样外源基因的一群噬菌体，就构成一个展示各种各样外源肽的噬菌体展示库。当用一个蛋白质去筛查一个噬菌体展示库时，就会选择性地同与其有相互作用的某个外源肽相结合，从而分离出展示库里的某个特定的噬菌体，研究该噬菌体所含外源基因的生物学功能。
酵母双杂交系统（yeast two-hybrid）：双杂交系统的建立得力于对真核生物调控转录起始过程的认识。细胞起始基因转录需要有反式转录激活因子的参与。80年代的工作表明，转录激活因子在结构上是组件式的（modular），即这些因子往往由两个或两个以上相互独立的结构域构成，其中有DNA结合结构域（DNA binding domain，简称为BD）和转录激活结构域（activation domain，简称为AD），它们是转录激活因子发挥功能所必需的。单独的BD虽然能和启动子结合，但是不能激活转录。而不同转录激活因子的BD和AD形成的杂合蛋白仍然具有正常的激活转录的功能。如酵母细胞的Gal4蛋白的BD与大肠杆菌的一个酸性激活结构域B42融合得到的杂合蛋白仍然可结合到Gal4结合位点并激活转录。在酵母双杂交系统中，“诱饵”蛋白X克隆至DNA-BD载体中，表达DNA-BD/X融合蛋白；待测试蛋白Y克隆至AD载体中，表达AD/Y融合蛋白。一旦X与Y蛋白间有相互作用，则DNA-BD和AD也随之被牵拉靠近，恢复行使功能，激活报告重组体中LacZ和HIS3基因的表达。
荧光能量共振转移(F?rster resonance energy transfer,)：荧光能量共振转移是距离很近的两个荧光分子间产生的一种能量转移现象。当供体荧光分子的发射光谱与受体荧光分子的吸收光谱重叠，并且两个分子的距离在10nm范围以内时，就会发生一种非放射性的能量转移，即FRET现象，使得供体的荧光强度比它单独存在时要低的多（荧光猝灭），而受体发射的荧光却大大增强（敏化荧光）。在生命科学领域，FRET技术是检测活体中生物大分子纳米级距离和纳米级距离变化的有力工具，可用于检测某一细胞中两个蛋白质分子是否存在直接的相互作用。
蛋白质交联技术（Crosslinking）：大多数蛋白质-蛋白质结合相互作用是瞬时的，蛋白质交联剂通过交联可以稳定或永久连接相互作用复合物中的成分，从而有助于鉴别这些瞬时接触。一旦相互作用的成分被共价偶联，可以使用其他步骤（例如细胞裂解，亲和纯化和电泳）来制备分析样品，同时可维持最初的相互作用复合物。
2. RNA编辑及其生物学意义
RNA编辑是基因转录后在mRNA中插入、缺失或核苷酸的替换而改变DNA模板来源的遗传信息，翻译出多种氨基酸序列不同的蛋白质，
意义：
A 改变和补充遗传信息；
B RNA的编辑能增加基因产物的多样性；
中科院生物物理所2011-2016年细胞生物学考博真题
目录 2011生物物理所秋季博士入学考试真题 (2) 2012生物物理所秋季博士入学考试真题 (3) 2013生物物理所秋季博士入学考试真题 (4) 2014生物物理所秋季博士入学考试真题 (5) 2015年生物物理所秋季博士入学考试真题 (6) 2016生物物理所秋季博士入学考试真题 (7)
简答题：8分/题 1.IPS 2.脂筏模型 3.细胞自噬 4.核糖体功能 5.端粒酶功能 论述题：20分/题 1.你实验室的现有结果表面A蛋白的量升高将导致B蛋白功能增加，如果你接下来以此 作为博士课题，你怎样开展后续工作。 2.囊跑运输的作用于调控？ 3.写出你所知道的肿瘤发生和表观遗传的关系？
简答题 1.细胞器的结构和其功能的联系？ 2.胚胎干细胞的特性及其功能？ 3.蛋白质翻译后修饰的作用？ 4.细胞骨架的主动调节机理？ 5.细胞与细胞间是如何联系的？ 6.为什么核膜在细胞周期中要崩解？ 论述题 1.细胞衰老机制及你认为该如何研究？ 2.给你一个新基因如何研究它的功能，用到什么技术？ 3.控制细胞大小的重要性以及控制细胞大小的机制？ 4.生化是工具，遗传是基础，细胞是主人，发育是未来。你怎么看这句话？
简答题 1.蛋白质分选的机制？ 2.细胞间连接的类型及功能？ 3.钙稳态及其维持机制？ 4.细胞凋亡的检测方法有哪些？ 5.细胞自噬？ 论述题:10分/题 1.什么是细胞周期？说明各个时期的复制、转录、翻译的变化。 2.以表观遗传学的角度谈谈你对细胞分化的认识。 3.如何设计实验来研究线粒体膜定位蛋白的功能。 4.谈谈你对细胞核重新编程的认识（2012年诺贝尔生理或医学奖）。
中国科学院力学研究所岗位管理实施办法
中国科学院力学研究所岗位管理实施办法 （力发人教字〔2007〕134号） 第一章总则 第一条根据中国科学院《关于印发〈中国科学院岗位管理实施办法〉的通知》（科发人教字〔2007〕207号）的有关规定，为实现我所人力资源管理的科学化、规范化、制度化，结合我所科技发展的规划，制定本办法。 第二条围绕我所科技发展规划的要求，遵循按需设岗、职数控制、结构合理、动态优化、管理规范的原则，按照院核定的岗位总量和结构比例科学设置各类岗位。 第三条本办法适用于我所在岗人员。所级领导干部按照干部人事管理权限的有关规定执行。 第二章岗位类别与岗位等级 第四条我所设置创新岗位和项目聘用两种岗位，分别包括科技、支撑和管理三类岗位。 第五条科技岗位是指各实验室（研究部）从事基础研究和战略高技术研究工作，具有相应专业技术水平和能力要求的工作岗位。我所科技岗位包括自然科学研究系列、工程技术系列专业技术岗位。 科技岗位执行自然科学研究系列或工程技术系列，等级设置按照《中国科学院岗位管理实施办法》规定（见附表1）。 第六条支撑岗位是指为我所科技工作提供技术支撑和辅助性工作的岗位，主要设置在实验平台技术支撑、实验室（研究部）学术与行政助理、网络与图书信息保障、学会期刊出版等岗位。 支撑岗位主要执行专业技术系列中的工程技术系列、实验技术系列、图书资料和出版系列等专业技术岗位，也包括工勤技能系列岗位。 对兼有管理职责要求的支撑岗位，确因工作需要，也可执行职员系列。 支撑岗位的等级设置按照《中国科学院岗位管理实施办法》规定（见附
表1）。 第七条管理岗位是指职能部门承担领导职责或管理职责的工作岗位。管理岗位主要执行职员系列，等级设置按照《中国科学院岗位管理实施办法》规定（见附表1）。 对兼有专业技术职责要求的科技管理岗位，根据工作需要，可设置为相应的专业技术岗位。会计、审计等国家有职业资格要求的岗位，设置相应的专业技术岗位。 第八条项目聘用岗位系列的设置与等级同上述创新岗位，但原则上，不设置正高级专业技术岗位和五级及以上职员岗位。 第三章岗位结构比例 第九条创新岗位中科技、支撑与管理三类岗位的宏观结构比例为70%、20%、10%。 第十条创新科技岗位(含执行专业技术系列的管理岗位)中，高级科技岗位(专业技术一至七级岗位)的比例占科技岗位总数的70％，正高级岗位(专业技术一至四级岗位)不超过高级科技岗位总数的40％。其中：正高级科技岗位中，专业技术一级岗位为国家专设的特级岗位，由国家实行总量控制和管理，专业技术二级、三级、四级岗位之间的宏观结构比例为2:4:4； 副高级科技岗位中，专业技术五级、六级、七级岗位之间的结构比例为3:4:3； 中级科技岗位中，专业技术八级、九级、十级岗位之间的结构比例为4:4:2； 初级科技岗位中，专业技术十一级、十二级岗位之间的结构比例为8:2。 第十一条创新支撑岗位中，高级支撑岗位(专业技术三至七级岗位)不超过支撑岗位总数的50％，正高级支撑岗位(专业技术三至四级岗位)不超
中国科学院大气物理研究所党委
中国科学院大气物理研究所党委 关于开展深入学习实践科学发展观活动的 实施方案 根据《中共中央关于在全党开展深入学习实践科学发展观活动的意见》的安排和部署，按照《中国科学院党组关于开展深入学习实践科学发展观活动的实施方案》的要求，结合大气物理所的工作重点和实际情况，所党委对开展深入学习实践科学发展观活动（以下简称“学习实践活动”）提出如下实施方案： 一、深刻领会开展学习实践活动的重大意义 开展学习实践活动，是党的十七大做出的战略决策。全所党员、干部一定要深刻认识开展学习实践活动的重大意义，切实把思想统一到中央的决策部署上来，扎扎实实地搞好这次学习实践活动。 （一）开展学习实践活动是坚持用马克思主义中国化最新成果武装全党的重大举措。科学发展观作为中国特色社会主义理论体系的重要组成部分，是我国经济社会发展的重要指导方针，是发展中国特色社会主义必须坚持和贯彻的重大战略思想。开展深入学习实践科学发展观活动，就是要在世情、国情、党情发生深
刻变化的条件下，更好地用马克思主义中国化最新成果武装和统一全党思想，不断提高全体党员、干部特别是领导干部运用科学理论分析和解决实际问题的能力，是“三个代表”重要思想学习教育活动和保持共产党员先进性教育活动的继续和深化。 （二）开展学习实践活动是推动经济社会又好又快发展的迫切需要。发展是科学发展观的第一要义。同时发展必须是以人为本、全面协调可持续的科学发展。当前，我国发展呈现出一系列新的阶段特征，科学发展观能否全面贯彻落实，越来越成为经济社会能否又好又快发展的关键。开展深入学习实践科学发展观活动，是党中央根据我国改革发展处于关键阶段的实际，为夺取全面建设小康社会新胜利而做出的重大战略决策。 （三）开展学习实践活动是提高党的执政能力、保持和发展党的先进性的必然要求。世情、国情、党情发生的深刻变化，使我们党提高执政能力、保持和发展党的先进性既面对许多新情况新考验，又面临许多新任务新要求。开展深入学习实践科学发展观活动，有利于把提高党的执政能力、保持和发展党的先进性，体现到领导科学发展、促进社会和谐上来，有利于按照科学发展观的要求加强和改进党的自身建设，充分发挥各级党组织的战斗
中科院力学所科技成果——高速列车系列技术
中科院力学所科技成果——高速列车系列技术2008年科技部与原铁道部签订了两部联合行动计划即《中国高速列车自主创新行动计划》，启动了国家支撑计划重大项目“高速列车关键技术研究及装备研制”，目标是研制最高运行时速380公里的新一代高速列车。在此背景下，初步形成了目前的高速列车空气动力学科研团队。 团队核心成员主要围绕高速列车气动性能和气动噪声评估、气动优化设计、动模型气动实验技术、列车结构静/动强度评估和设计、气动对车辆运行安全性和舒适性影响等开展研究。涉及空气动力学、结构动力学、车辆动力学、噪声工程、实验技术等多学科系统耦合问题。该团队参与了我国已研制和在研的所有高速列车气动性能评估和气动定型设计，具有较强的团队精神、科研攻关能力，对我国高速列车设计技术提升和高铁产业的发展起到了不可替代的作用。 技术介绍及特点 在国家科技支撑计划重大项目“中国高速列车关键技术研究及装备研制”的资助下，中国科学院力学研究所高速列车团队形成了较完备的高速列车空气动力学设计技术。建立了优化设计方法和动模型实验平台，形成了我国高速列车空气动力学研究体系。其主要特点有： 1、基于压缩空气加速、磁涡流非接触制动、实验快速恢复等发明技术，研制了世界上规模最大、实验速度最高的双向运行高速列车动模型实验平台。同时，研制了具有弹性隔振支撑、加减速段限位和实验段自动切换的车载六分量测力天平，填补了动模型气动力测量的
技术空白。利用该平台，已为我国多种高速列车研制提供了气动实验支撑数据。 2、发展了多目标优化设计方法，构建了高速列车气动优化设计平台。以气动阻力、尾车升力和远场气动噪声为设计目标，通过优化，得到了性能更优的标准动车组气动方案。大西线线路考核试验表明，中国标准动车组具有更加优良的气动性能。 3、本项目发展的高速列车气动优化设计技术，已用于我国CRH380系列、中国标准动车组、更高速度等级高速列车、城际列车等研制，为中国高速铁路发展做出了突出贡献。参与“京沪高速铁路工程”项目获2015年国家科学技术进步特等奖。主持“高速列车空气动力学优化设计及评估技术”项目分别获2016年中国力学科技进步一等奖和2014年第五届中国侨界创新成果贡献奖。参与“设计时速380公里高速动车组技术研发及应用”项目获2012年铁道科技进步特等奖。 应用领域 1、高速列车的气动特性评估 2、高速列车动模型试验 3、高速列车外形优化设计 技术成熟度及应用案例 1、CRH380系列高速列车气动定型设计 针对新一代CRH380A高速列车研制，完成了多种头型方案无横风和不同强度横风运行场景下的气动性能和气动噪声评估；完成了单
中国科学院大气物理研究所
中国科学院大气物理研究所 中国科学院大气物理研究所简介 大气物理研究所前身是1928年成立的原中央研究院气象研究所。现有职工325人，其中科技人员251人，有中国科学院院士7人，研究员46人，副研究员和高级工程师86人，中级科技人员108人。大气所是博士、硕士学位授予单位和博士后流动站建站单位。是中国科学院博士生重点培养基地，国家毕业生就业重点保证单位。现有在学博士生211人，硕士生105人，博士后18人。 大气物理研究所主要研究大气中各种运动和物理化学过程的基本规律及其与周围环境的相互作用，特别是研究在青藏高原、热带太平洋和我国复杂陆面作用下的东亚天气气候和环境的变化机理、预测理论及其探测方法，以建立东亚气候系统和季风环境系统的理论体系及遥感观测体系，发展新的探测和试验手段，为天气、气候和环境的监测、预测和控制提供理论和方法。四个优势创新研究领域是：气候系统动力学和预测理论研究、大气环境和人类生存环境变化动力学和预测理论研究、中层大气与遥感理论和技术研究、中小尺度天气系统与灾害研究。 大气物理研究所拥有的科研部门包括：大气科学和地球流体力学数值模拟国家重点实验室、大气边界层物理与大气化学国家重点实验室、中国科学院东亚区域气候-环境重点实验室、中层大气遥感与探测开放实验室、云降水物理与强风暴实验室、国际气候与环境科学中心、竺可桢--南森国际研究中心、灾害性气候研究与预测中心、中国生态系统研究络大气分中心、季风系统研究中心。另外还设有信息科学中心。 2005年，大气物理所知识创新工程全面推进阶段工作进展顺利，科研工作取得若干重要进展，气候数值模式、模拟及气候可预报性研究项目荣获2005年度国家自然科学二等奖；获得湖北省科技进步一等奖1项，中国人民解放军科学技术进步二等奖1项，中国气象局气象科技奖成果应用奖一等奖 1项，国家教育部科学技术进步二等奖1项。共发表科技论文469篇，其中ScI收录论文126篇，申报专利5项。队伍建设和人才培养工作成效显著，叶笃正荣获国家科学技术最高奖，并作为第一主持人荣获国家科学技术进步二等奖；吕达仁当选为中国科学院院士。一批科研和管理人员以及研究生获得了各类奖项，取得佳绩。制度化、民主化、科学化三化建设继续向前推进。 2005年，申请获得973项目北方干旱化与人类适应1项、973课题2项、863专题3项；获得国家自然科学基金各类项目29项，包括4个重点基金、面上基金23项，杰出A和杰出B各1项；获院方向性项目3项，课题1项。还获
中国科学院流固耦合系统力学重点实验室
中国科学院流固耦合系统力学 重点实验室 Key Laboratory for Mechanics in Fluid Solid Coupling Systems Institute of Mechanics, Chinese Academy of Sciences 季报 2019年第1期（总第17期） 目录 中科院流固耦合系统力学重点实验室现场评估工作顺利完成 (2) 中科院流固耦合系统力学重点实验室召开2019年室务会 (3) 中国航空学会空气动力学分会飞行载荷专业工作会在扬州召开 (6) 圆柱阵列波浪力幅值的波动现象和预报公式 (8) 轻质金属点阵圆柱壳结构制备与力学性能研究进展 (9) 力学所提出一种大幅提升3D打印点阵结构力学性能的新方法 (11) 雾化稠油掺稀降粘技术研究进展 (12) 南海天然气水合物试采安全评价研究进展 (14) 油气水多相流量计研究进展 (15) 空化致板间液滴界面稳定性研究获得多个奖项 (16) 空泡与柔性膜的流固耦合研究获得2019度中国力学大会优秀墙报奖. 18
中科院流固耦合系统力学重点实验室现场评估工作顺利完成 7月15日，中科院前沿科学与教育局、中科院重点实验室现场评估专家组一行14人莅临中科院力学所，对依托力学所建设的流固耦合系统力学重点实验室进行现场评估。专家组组长顾逸东院士主持了评估会议并宣布了现场评估的议程安排。力学所所长秦伟，党委书记、副所长刘桂菊，副所长魏宇杰，副所长尹明及流固耦合系统力学重点实验室学术委员会主任、实验室主任参加会议。 实验室主任黄晨光做实验室主任工作报告，围绕发展定位与研究方向、科研任务与代表性成果、队伍建设与人才培养、开放交流与运行管理等方面，向专家组汇报了评估期内的发展成果和工作成效。杨国伟研究员、王展研究员分别做“高速列车气动设计与流固耦合动力学特性研究”和“极端海洋环境及其与工程结构的流固耦合理论”代表性成果报告。专家组肯定了实验室取得的成绩以及工作亮点，并就汇报和自评估报告中的存疑事项进行了交流。 现场评估专家组还查看了高速列车动模型试验平台、海洋流固土耦合实验室、多相流体力学实验室、冲击与耦合效应实验室的科研仪器建设、大型科研仪器设备使用共享等情况，同时，参观了实验室的展板窗口。在此基础上，专家组召开会议，根据现场考核情况对实验室进行打分，并初步形成了评估意见。 经过努力，实验室顺利完成了此次中科院重点实验室现场评估工作，并在评估中充分展现了自身的优势和特色，最终取得良好的评估成绩。 在国家科技创新基地优化整合的背景下，实验室将积极适应新形势和新要求，进一步加强实验室建设和运行管理工作，全面提升科研平台建设水平和运行效率，为加快科技创新提供良好的条件支撑。 （流固耦合系统力学重点实验室供稿）
中国科学院力学研究所研发成功等离子体生活垃圾气化发电技术
中国科学院力学研究所研发成功等离子体生活垃圾气化发电技术 我国生活垃圾处理方式主要是填埋和焚烧。填埋不仅侵占大量土地，还污染地下水，是不得已而为之的选择。尽管如此，对于土地资源紧张的地区已没有多少场地可供填埋使用。焚烧法虽然减容比高，并能回收能量，但却因二噁英等污染问题遭到公众强烈反对，急需发展新一代的绿色环保、节能降耗的替代焚烧技术。 等离子体是物质第四态，具有许多异于固态、液态和气态的独特的物理化学性质，如温度和能量密度都很高、可导电和发光、化学性质活泼并能加强化学反应等，环保性能优良。通过电弧放电产生高达7000 C的等离子体，将垃圾加热至很高的温度，从而迅速有效地摧毁废物。可燃的有机成分充分裂解气化，转化成可燃性气体，可以用于能源回收，一般称为“合成气”（主要成分是CO+H ）。不可 2 燃的无机成分经等离子体高温处理后成为无害的渣体。 采用等离子体处理垃圾是目前减容效果最显著、无害化最彻底、资源化程度最高的绿色环保技术。与焚烧法相比，等离子体技术最突出的优点有： （1）处理温度高：有害物质摧毁更彻底，二噁英前驱体被彻底破坏分解； （2）可采用还原性气氛或部分氧化性气氛，采用电能作为外加热源，二次污染物排放比焚烧低2-3个数量级，裂解底渣是无害的； （3）合成气流量约为焚烧烟气量的5-10%，易于净化，后处理设备尺寸大大减小，节约了投资成本； （4）能源回收效率高，将筛上物制成合成气，后续利用气体发动机发电，发电效率可高达39%，而焚烧法采用蒸汽轮机，发电效率很难超过22%； （5）等离子体系统可快速启动与停机，等离子体核心工艺灵活，可根据不同的处理目的搭配不同的配套系统； （6）整套设备紧凑，占地小，经济效益好。
全国研究所代码 (标准)
研究所代码 代码研究所 80005 中国科学院武汉岩土力学研究所 80007 中国科学院力学研究所 80008 中国科学院物理研究所 80009 中国科学院高能物理研究所 80010 中国科学院声学研究所 80012 中国科学院理论物理研究所 80014 中国科学院上海原子核研究所 80017 中国科学院近代物理研究所 80018 中国科学院国家天文台南京天文光学技术研究所80019 中国科学院国家天文台长春人造卫星观测站80020 中国科学院武汉物理与数学研究所 80021 中国科学院紫金山天文台 80022 中国科学院上海天文台 80023 中国科学院云南天文台 80024 中国科学院国家授时中心 80025 中国科学院国家天文台 80026 中国科学院声学研究所东海研究站 80027 中国科学院渗流流体力学研究所 80028 中国科学院新疆理化技术研究所 80029 中国科学院自然科学史研究所 80030 中国科学院理化技术研究所 80032 中国科学院化学研究所 80033 中国科学院广州化学研究所 80035 中国科学院上海有机化学研究所 80036 中国科学院成都有机化学研究所 80037 中国科学院长春应用化学研究所 80038 中国科学院大连化学物理研究所 80039 中国科学院兰州化学物理研究所 80040 中国科学院上海硅酸盐研究所 80041 中国科学院过程工程研究所 80042 中国科学院生态环境研究中心 80043 中国科学院山西煤炭化学研究所 80045 中国科学院福建物质结构研究所 80046 中国科学院青海盐湖研究所 80053 中国科学院兰州地质研究所 80054 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所 80055 中国科学院南京地质古生物研究所 80057 中国科学院测量与地球物理研究所 80058 中国科学院大气物理研究所 80060 中国科学院地理科学与资源研究所 80061 中国科学院南京地理与湖泊研究所
中科院力学所科技成果——利科岩土工程分析软件
中科院力学所科技成果——利科岩土工程分析软件技术介绍及特点 利科（LinkFEA）岩土工程分析软件是针对水利水电工程的渗流、堤坝的应力变形与结构安全性和边坡的稳定性计算分析而自主开发的有限元软件系统。包括渗流计算模块LinkFEA-Seepage、渗流与应力耦合计算模块LinkFEA-Stress和基于有限元应力计算结果的边坡稳定分析模块LinkFEA-Slope三部分。该软件用Fortran语言开发，经历了近20年的水利水电工程分析应用与软件改进扩展，具有计算收敛性好、计算结果可靠等优点。能进行复杂工况下的地下水三维渗流计算、堤坝三维渗流与应力变形耦合计算、堤坝与边坡二维稳定计算。 应用领域 大渡河瀑布沟水电站
澜沧江如美水电站 主要应用于水利水电工程的渗流分析、堆石坝的应力变形与结构安全性分析和边坡稳定分析。近20年来，已经在大渡河瀑布沟、大渡河长河坝、大渡河双江口、澜沧江如美4个里程碑级水电站工程和雅鲁藏布江加查、澜沧江黄登、大渡河硬梁包、黑水河毛尔盖、拉萨河扎雪、象泉河阿青、三岔河引子渡等10多个水电站工程设计的关键问题研究中应用。现正在用于澜沧江如美、金沙江拉哇和雅鲁藏布江米林等超大水电站的设计研究中。该软件也曾应用于上海洋山港码头的研究和部分工程的地下水环境评价分析。 技术成熟度及应用案例 LinkFEA软件的核心计算功能经过若干考题考核，在水利水电行业有近20年的应用，在水电站渗流控制、堆石坝结构设计和边坡稳定评价与边坡工程设计中，其计算分析成果，已经作为工程设计的依据，得到水电行业设计与审查部门的认可。依据工程分析的需要，软件的功能还在不断得到扩充。但软件本身在友好交互界面、建模和后
中国科学院理化技术研究所科研物资采购管理暂行办法
中国科学院理化技术研究所 科研物资采购管理暂行办法 为规范理化所科研物资采购管理，严格执行国家相关法规和管理制度，根据财政部和中国科学院有关事业单位国有资产管理实施办法以及政府采购的相关规定，结合我所实际情况特制订《理化所科研物资采购管理暂行办法》。 一、科研物资采购范围 科研物资采购范围包括科研材料与科研设备等。 科研材料主要指用于科研活动直接需要和间接需要的不纳入固定资产管理的各类物资； 科研设备包括整机设备、自行研制设备、委托加工设备等。 二、科研物资采购经费 科研物资采购经费包括课题项目经费、所公用经费以及研究所其它经费等。 三、科研物资采购流程 科研物资采购流程包括采购计划报批、确定采购方案、实施采购、验收入库等环节。 1．采购计划报批：
凡属政府采购范围内的科研物资，采购部门须在采购计划报批之前，根据上级部门的统一要求提前跨年度申报预算（具体申报时间以所资产办下发通知为准）。 采购3万元（含）以上科研物资，采购部门须填报《理化所科研物资采购审批表》（附件1）。其中主管业务部门须依据项目任务书或科研活动的需要对物资采购申请进行严格把关。 其中对于采购金额在50万元（含）以上的进口设备，采购部门实施采购前，还需通过资产办组织所外专家进行评审，并上报财政部审批。 2．确定采购方案： 采购部门在完成《理化所科研物资采购审批表》逐级审批后，即可进入采购方案的论证阶段。须组建采购小组，由采购小组组织并通过调研和论证等方式确定采购方案，填报《理化所科研物资采购方案论证报告》（附件2）。 对于单项或批量采购金额一次性在50万元（含）以上的科研物资，须执行政府采购相关规定。 对于单项或批量采购金额一次性在120万元（含）以上的科研物资，须采用公开招标方式（由资产办组织实施），附招投标过程相关文件与材料。 对于委托加工与研制的科研物资，附选定供货商的资质证明等（有效期限内的营业执照、生产许可证复印件）。
国内研究所排名
国内研究所排名.txt两个人吵架，先说对不起的人，并不是认输了，并不是原谅了。他只是比对方更珍惜这份感情。0201 理论经济学 37 87802 黑龙江省社会科学院 64 0202 应用经济学 69 87802 黑龙江省社会科学院 62 0302 政治学 35 87902 上海国际问题研究所 67 87802 黑龙江省社会科学院 64 0303 社会学 31 87802 黑龙江省社会科学院 64 0403 体育学 27 84601 国家体育总局体育科学研究所 71 0504 艺术学 39 84201 中国艺术研究院 77 84202 中国电影艺术研究中心 65 0601 历史学 39 87802 黑龙江省社会科学院 64 0701 数学 62 80002 中国科学院数学与系统科学研究院 94 0702 物理学 57 80008 中国科学院物理研究所 95 82801 中国原子能科学研究院 70 0703 化学 51 80032 中国科学院化学研究所 96 0704 天文学 11 80025 中国科学院国家天文台 80 80022 中国科学院上海天文台 78 0705 地理学 26 80076 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所 86 0706 大气科学 8 80058 中国科学院大气物理研究所 84 85101 中国气象科学研究院 71 0707 海洋科学 12 85301 国家海洋局第一海洋研究所 74 85303 国家海洋局第三海洋研究所 68 0710 生物学 64 80100 中国科学院上海生命科学研究院 81 80103 中国科学院动物研究所 77 0712 科学技术史 10 80029 中国科学院自然科学史研究所 77 0801 力学 42 80007 中国科学院力学研究所 88 0802 机械工程 73 80139 中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 70 83303 煤炭科学研究总院（上海分院） 64 83801 铁道部科学研究院 63 0803 光学工程 28 80139 中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 85 80142 中国科学院西安光学精密机械研究所 85 0804 仪器科学与技术 27 82932 中国航空研究院（304 研究所） 68 0805 材料科学与工程 72 80144 中国科学院金属研究所 92 82913 中国航空研究院（621 研究所） 75 83801 铁道部科学研究院 64 0808 电气工程 26 80148 中国科学院电工研究所 78 83801 铁道部科学研究院 64 0810 信息与通信工程 42 83000 中国电子科技集团公司电子科学研究院 78 0812 计算机科学与技术 71 83801 铁道部科学研究院 63 0815 水利工程 20 82306 南京水利科学研究院 72 0816 测绘科学与技术 11 86001 中国测绘科学研究院 72 0817 化学工程与技术 41 83310 煤炭科学研究总院（北京煤化所） 64 0818 地质资源与地质工程 20 83306 煤炭科学研究总院（西安分院） 67 0819 矿业工程 15 83311 煤炭科学研究总院（北京开采所） 71 83304 煤炭科学研究总院（抚顺分院） 67
中科院生物物理所2011-2016年生物化学考博真题
目录 2011生物物理所秋季入学考博真题 (2) 2012生物物理所秋季入学考博真题 (3) 2013生物物理所秋季入学考博真题 (4) 2014生物物理所秋季入学考博真题 (5) 2015生物物理所秋季入学考博真题 (6) 2016生物物理所秋季入学考博真题 (7)
简答题：10分/题 1.生物膜的基本成分，每种成分又分为哪几类？ 2.信号肽的含义，作用？以及整么起作用的？ 3.体外蛋白质的相互作用方法有哪些，举出3例说明其原理？ 4.现代结构生物学中三种最重要的研究方法是什么？个有什么优缺点？ 5.一个嗜热菌中的一个蛋白的最适温度为65度，等电点5作用，ph小于5时易沉淀， 分子量为30kd，有histag，已在大肠杆菌里过表达，设计实验得到纯度高且单分散的蛋白质。 6.染色质的基本成分是什么，核小体怎样组装成染色体的？ 论述题 1.给出一段204bp的目的片段，标出了所有的酶切位点，另有一个图为pet15b的多克隆 位点图，以及酶切位点，让你把这段基因克隆到pet15b载体，并到有表达的设计和详细过程（引物设计，PCR，酶切，链接，转化，诱导表达等等过程）（20分） 2.2、给出一个3肽，让你标出其中的肽键，肽平面，二面角？a螺旋和b折叠的结构特 点？给出一个拉氏构象图，让你标出a螺旋和b折叠的分布位置？（20分）
简答题 1.四种蛋白质相互作用的方法及原理 2.RNA编辑及其生物学意义 3.蛋白纯化方法和原理 4.表观遗传学及其生物学意义 5.双链DNA断裂的修复方式 6.蛋白质的共价修饰及功能 论述题 1.重组蛋白表达系统及其优缺点（真核及原核） 2.转录因子与启动子结合区域的判定
中科院所有研究所
北京市 数学与系统科学研究院 力学研究所 物理研究所 高能物理研究所 声学研究所 理论物理研究所 国家天文台 渗流流体力学研究所 自然科学史研究所 理化技术研究所 化学研究所 过程工程研究所 生态环境研究中心 古脊椎动物与古人类研究所大气物理研究所 地理科学与资源研究所 遥感应用研究所 空间科学与应用研究中心 对地观测与数字地球科学中心地质与地球物理研究所 数学科学学院 物理学院 化学与化工学院 地球科学学院 资源与环境学院 生命科学学院 计算机与控制学院 管理学院 人文学院
外语系 工程管理与信息技术学院 材料科学与光电技术学院 电子电气与通信工程学院 华大教育中心 动物研究所 植物研究所 生物物理研究所 微生物研究所 遗传与发育生物学研究所 心理研究所 计算技术研究所 工程热物理研究所 半导体研究所 电子学研究所 自动化研究所 电工研究所 软件研究所 国家科学图书馆 微电子研究所 计算机网络信息中心 科技政策与管理科学研究所 北京基因组研究所 青藏高原研究所 光电研究院 国家纳米科学中心 信息工程研究所 空间应用工程与技术中心（筹）天津市 天津工业生物技术研究所
河北省 渗流流体力学研究所 遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心山西省 山西煤炭化学研究所 辽宁省 大连化学物理研究所 沈阳应用生态研究所 沈阳计算技术研究所 金属研究所 沈阳自动化研究所 吉林省 长春人造卫星观测站 长春应用化学研究所 东北地理与农业生态研究所 长春光学精密机械与物理研究所 上海市 上海应用物理研究所 上海天文台 声学研究所东海研究站 上海有机化学研究所 上海硅酸盐研究所 上海生命科学研究院 上海药物研究所 上海微系统与信息技术研究所 上海光学精密机械研究所 上海技术物理研究所 上海巴斯德研究所
第六届国际流体力学会议简介 - 中国科学院力学研究所机构
第41卷第5期力学进展Vol.41No.5 2011年9月25日ADVANCES IN MECHANICS Sep.25,2011 第六届国际流体力学会议简介 李家春1符松2詹杰民3 1中国科学院力学研究所,北京100190 2清华大学航天航空学院,北京100084 3中山大学应用力学与工程系,广州510275 由中国力学学会主办,中山大学承办的第六届国际流体力学会议(The6th International Con-ference on Fluid Mechanics,ICFM6)于2011年6月30～7月3日在广州举行.来自中国、挪威、俄罗斯、日本、美国、英国等19个国家的近200名代表参加了会议.参会嘉宾有我国流体力学专家周恒院士、李家春院士、符松教授、佘振苏教授、林建忠教授、沈清教授、刘桦教授、曹志先教授、香港的W.Shyy教授及流体力学专业委员会诸委员,还有来自日本的M.Yamamoto教授、挪威的John Grue教授、俄罗斯的V.V.Kozlov教授、A. A.Maslov教授、美国的E.S.Oran教授、英国的N.D.Sandham教授等等. 6月30日,国际流体力学会议科学委员会主席周恒院士主持并召开了会议的科学委员会、学术委员会联合会议,就第六届国际流体力学会议的学术质量以及如何办好第七届国际流体力学会议的若干问题进行了讨论.大会开幕式在7月1日上午举行,清华大学符松教授主持,会议主席李家春院士致开幕辞.李院士代表会议组织者向与会代表表示欢迎.在回顾过去ICFM系列会议对促进我国流体力学发展的历史贡献时,他向会议的奠基人以及老一代的流体力学家表达了深深的敬意.展望未来,他指出当前流体力学在传统和交叉前沿领域发展迅速,必将在空天海洋、能源环境、人类健康、材料信息工程的应用中发挥重要作用.随后,中山大学校长助理魏明海教授、美国著名流体力学专家、ASME代表T.E.Tezduyar教授、上海大学常务副校长王宽城基金会代表周哲玮教授分别发表了热情洋溢的讲话,并预祝大会圆满成功.会议期间,中国科学院院士、中山大学校长许宁生教授专程看望了与会专家和嘉宾,并与大家进行了交流. 会议围绕流动转捩与湍流、空气动力学、水动力学、工业及环境流体力学、生物力学、磁流体动力学和化学流体力学、多相流及多孔介质中的流动、微流体力学等8个主题,组织了4场大会学术报告和15场分会学术交流,交流充分,讨论异彩纷呈.来自全球19个国家和地区,150多位代表做了精彩的报告.会议就多相流体动力学及其在航天器的应用、条带破裂与壁湍流、内波破碎与强底部流动、高速边界层的流动控制、流动分离泡的物理机理、反应流的随机性与动力学、含沙水流多尺度运动理论及其应用、降落伞群的流体结构相互作用模拟等邀请了国内外著名学者作了8个大会报告和12个邀请报告.这8个大会邀请报告为： (1)香港科技大学W.Shyy教授的“Multiphase ?uid dynamics for spacecraft applications”. (2)美国海军计算物理与流体力学实验室E. S.Oran教授的“Stochasticity and dynamics of high-speed reactive?ows”. (3)俄罗斯Khristianovich理论与应用力学研究所A.A.Maslov教授的“High speed boundary layer stability and control”. (4)美国莱斯大学T. E.Tezduyar教授的“Fluid-structure interaction modeling of ringsail parachute clusters”. (5)挪威奥斯陆大学John Grue教授的“Inter-nal wave induced breaking and strong bottom cur-rents”. (6)日本东京都大学M.Asai的“Streak break-
中科院各大研究所
中国科学院数学与系统科学研究院 *中国科学院数学研究所 *中国科学院应用数学研究所 *中国科学院系统科学研究所 *中国科学院计算数学与科学工程计算研究所 中国科学院物理研究所 中国科学院理论物理研究所 中国科学院高能物理研究所 中国科学院力学研究所 中国科学院声学研究所 中国科学院理化技术研究所 中国科学院化学研究所 中国科学院生态环境研究中心 中国科学院过程工程研究所 中国科学院地理科学与资源研究所 中国科学院国家天文台 *中国科学院云南天文台 *中国科学院乌鲁木齐天文工作站 *中国科学院长春人造卫星观测站 *中国科学院南京天文光学技术研究所 中国科学院遥感应用研究所 中国科学院地质与地球物理研究所 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所 中国科学院大气物理研究所 中国科学院植物研究所 中国科学院动物研究所 中国科学院心理研究所 中国科学院微生物研究所 中国科学院生物物理研究所 中国科学院遗传与发育生物学研究所 *中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心（原中国科学院石家庄农业资源研究所） 中国科学院计算技术研究所 中国科学院软件研究所 中国科学院半导体研究所 中国科学院微电子研究所 中国科学院电子学研究所 中国科学院自动化研究所 中国科学院电工研究所 中国科学院工程热物理研究所 中国科学院空间科学与应用研究中心 中国科学院自然科学史研究所 中国科学院科技政策与管理科学研究所
中国科学院光电研究院 北京基因组研究所 中国科学院青藏高原研究所 国家纳米科学中心 院直属事业单位（京外） 中国科学院山西煤炭化学研究所 中国科学院沈阳分院 中国科学院大连化学物理研究所 中国科学院金属研究所 中国科学院沈阳应用生态研究所 中国科学院沈阳自动化研究所 中国科学院海洋研究所 青岛生物能源与过程研究所(筹) 烟台海岸带可持续发展研究所（筹） 中国科学院长春分院 中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 中国科学院长春应用化学研究所 中国科学院东北地理与农业生态研究所 *中国科学院东北地理与农业生态研究所农业技术中心（原中国科学院黑龙江农业现代化研究所） 中国科学院上海分院 中国科学院上海微系统与信息技术研究所 中国科学院上海技术物理研究所 中国科学院上海光学精密机械研究所 中国科学院上海硅酸盐研究所 中国科学院上海有机化学研究所 中国科学院上海应用物理研究所（原子核研究所） 中国科学院上海天文台 中国科学院上海生命科学院 *生物化学与细胞生物学研究所 *神经科学研究所 *药物研究所 *植物生理生态研究所 *国家基因研究中心 *健康科学研究中心 *中国科学院上海生命科学信息中心 *营养科学研究所 *中国科学院上海生物工程研究中心 中国科学院上海巴斯德研究所（筹） 中国科学院福建物质结构研究所 中国科学院城市环境研究所 中国科学院宁波材料技术与工程研究所(筹) 中国科学院南京分院
国内主要科研院所简介及研究方向20111017
1 北京科技大学 北京科技大学现有1个国家科学中心（国家材料服役安全科学中心）(筹建中)，2个国家重点（专业）实验室，2个国家工程（技术）研究中心，2个国家科技基础条件平台，21个省、部级重点实验室、工程研究中心。特别是2007年，学校作为唯一一所教育部直属高校牵头承担了国家重大科技基础设施项目——重大工程材料服役安全研究评价设施，并负责筹建国家材料服役安全科学中心。主要研究机构： 新金属材料国家重点实验室 主要的研究方向和侧重点： 新金属结构材料：主要研究方向为高性能结构金属间化合物、块体非晶及亚稳材料。 新金属功能材料：主要研究方向为稀土永磁材料、磁致伸缩材料、光电薄膜材料、纳米功能材料与器件、自旋电子材料。 新一代基础金属材料：主要研究方向为亚微米纳米复相钢、连铸连轧工艺控制技术、塑性加工过程模拟仿真、板成形理论与技术；第四代单晶高温合金、新一代钴基高温合金、金属材料的各向异性、金属及复合材料半固态加工、飞秒激光加工技术。 材料制备新技术与新工艺：主要研究方向为先进金属材料制备、成形和加工过程中组织性能精确控制技术；材料制备、成形与加工技术中关键工艺参数与材料结构组成、性能之间的内在关系；工艺过程的模拟与实验分析。主要研究内容：1.喷射成形制备应用基础研究及新材料开发2. 冷喷沉积成形技术应用基础研究3. 高性能纳米晶材料与纳米涂层制备技术研究4. 金属燃烧现象及耐热耐蚀材料研究5. 铝、镁合金的先进制备成形技术研究与应用。 材料的计算机模拟与辅助设计：主要研究方向包括金属凝固过程计算模拟研究金属凝固过程中的传热、传质以及组织演化规律；材料与工艺的计算机辅助优化设计；显微组织及其演变过程的定量表征、建模与控制；高性能钢铁材料、粉末高温合金、生物医用材料的应用基础研究。 高效轧制国家工程研究中心 主要侧重于研究碳钢和有色金属热连轧电气控制系统，棒线材、型钢生产线
中国科学院大气物理研究所
中国科学院大气物理研究所 2006年博士生入学试题 《大气化学》(满分100) 一、解释下列各对名词（每组２分，共计４０分） １）干沉降和湿沉降２）光学等效直径和空气动力学等效直径３）气溶胶及 PM 10、PM 2.5 ４）热化学平衡和光化学平衡５）原生粒子和次生粒子６）元素 和同位素７）细粒子和硫酸盐８）反应物和前体物９）自由基和链式反应１０）化学反应速率常数和平衡常数１１）雾和光化学烟雾１２）粒子数浓度和质量浓度13）pH 值和酸雨14）光化学反应和量子效率１５）温室气体和温室效应１６）人工降雨和凝结核１７）爱根核和云１８）酸雨和酸沉降１９）大气寿命和半衰期２０）均相化学反应和非均相化学反应 二、简答题（每题10分，共计20分） 1.写出《京都议定书》明确要求发达国家减少排放的6种（类）人造物质名称和 分子式，并从它们大气化学降解速率和过成的角度说明必须减少向大气排放这些物质的原因。（10分） 2.N 2 O是一种重要的温室气体，主要从土壤排放到大气，消耗于平流层。当前国 际上测量土壤N 2 O排放普遍使用的方法是用一定体积的箱子罩在一定面积的土壤 上，通过测量箱内N 2 O浓度随时间的变化率，从而计算其界面交换通量（单位时 间单位面积的质量）。设在两地分别测量土壤N 2 O的排放，采样箱参数和测定值如下表，请问A、B哪个排放通量大？(提示：使用理想气体状态方程，0 ℃＝273.5 K ) （10分） （t0浓度是指开始罩箱时的N2O浓度；t1是指开始罩箱后的t1时刻N2O浓度） 三、述题（40分，每题２０分） 1.目前城市大气中两种最重要的O 3前体物是VOC和NOx（NO+NO 2 ），下图显示的是 第1页共2页
中国科学院力学研究所质量管理体系程序文件.
中国科学院力学研究所质量管理体系程序文件 监视和测量装置控制程序 IMECH-CX-14 版本：00 修改次数：0 编制：2005年6月1日 审核：2006年4月1日 批准：2006年4月10日
2006年4月10日发布2006年4月17日实施
1目的 对用于证实产品和过程符合规定要求的监视和测量装置进行控制，确保监视和测量结果的有效性。 2范围 本程序适用于本所对产品和过程进行监视和测量用的装置、软件等质量控制。 3定义 3.1 监视和测量装置 指能用以直接或间接为实现测量过程所必需的测量仪器、软件、标准物质或辅助设备。 3.2 专用测试装置 我所用于测量工程系统的技术性能指标、评定其质量性能、对被测量的对象进行定量确定或定性区别而专门研制或购置的非通用测试装置。 3.3 检定 为评定计量器具的测量性能、确定其是否合格所进行的全部工作。 3.4 校准 在规定的条件下，为确定测量装置测量系统所指示的量值,或实物量具或标准物质所代表的量值,与对应的由标准所复现的量值之间关系的一组操作。 4职责
4.1 科技处统一管理全所各种监视和测量装置，保证在用监视和测量装置的准确度满足本所产品的规定要求，负责组织并按规定的检定周期进行检定和校准。 4.2 课题组负责送检。 5程序 5.1监视、测量仪器的采购和验收。 5.1.2 课题组根据项目研究过程、产品生产中确定的要求，选择有质量保证能力的生产厂家，采购有CMC标志的计量器具。 5.1.3 新购置的监视、测量仪器执行《力学研究所仪器设备采购管理办法》和《力学研究所小型仪器设备和器材管理办法》。经检定（校准）合格后方可办理登记、建帐、编号、确定检定（校准）周期等手续；不合格的监视、测量仪器，课题组及时返修或退货索赔。 5.2监视、测量装置的检定与管理 5.2.1 监视、测量装置的管理 a) 科技处负责全所监视和测量装置的管理，建立总台账并组织制定周期检定计划； b) 课题组负责测量装置的送检、使用和保管，并建立测量装置的分台账。 5.2.2 监视、测量装置的分类 监视和测量装置分为强制管理（A类）、非强制管理（B类）、一般管理（C类）和封存管理（D类）。 A类：强制检定的工作计量器具，受检率应达100％。
中科院各研究所排名 国家自然科学基金
注：引用请说明来自生物统计家园网 机构数量数量排名经费/万元经费排名中国科学院合肥物质科学研究院136169022中国科学院上海生命科学研究院124210997.21中国科学院长春应用化学研究所8735318.6610中国科学院植物研究所86462885中国科学院化学研究所8556292.54中国科学院地理科学与资源研究所8165729.87中国科学院高能物理研究所8175418.39中国科学院大气物理研究所818431714中国科学院大连化学物理研究所779453513中国科学院地质与地球物理研究所76106673.33中国科学院生态环境研究中心751162846中国科学院动物研究所7112517111中国科学院物理研究所68135602.18中国科学院生物物理研究所67143614.520中国科学院海洋研究所6215386215中国科学院微生物研究所6216370918中国科学院国家天文台6117378517中国科学院深圳先进技术研究院6118232237中国科学院自动化研究所6019342422中国科学院南海海洋研究所5920350521中国科学院半导体研究所5621456412中国科学院过程工程研究所56223241.126中国科学院大学55233837.216中国科学院数学与系统科学研究院54243282.125中国科学院寒区旱区环境与工程研究所5125286630中国科学院遗传与发育生物学研究所4826334823中国科学院沈阳应用生态研究所48273307.324中国科学院上海药物研究所48282657.531中国科学院金属研究所4729322827中国科学院力学研究所4730297629中国科学院昆明植物研究所4531249232中国科学院福建物质结构研究所4432246234中国科学院上海硅酸盐研究所44332405.335中国科学院兰州化学物理研究所4434196944中国科学院广州地球化学研究所4335369419中国科学院上海有机化学研究所4236305528中国科学院东北地理与农业生态研究所42372491.433中国科学院上海应用物理研究所4238236836中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究3939195546中国科学院上海光学精密机械研究所38402055.539中国科学院宁波材料技术与工程研究所3741174252中国科学院遥感与数字地球研究所3742163258中国科学院华南植物园34431703.554中国科学院地球化学研究所3344204840中国科学院南京土壤研究所3345165356中国科学院长春光学精密机械与物理研究3346151759中国科学院南京地理与湖泊研究所3247182648中国科学院武汉物理与数学研究所3248180149中国科学院昆明动物研究所3149200243中国科学院计算技术研究所3150186247