第10章 动物基因工程
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200物遗传学
Northern杂交 Northern杂交
*
也称为Northern印迹( 也称为Northern印迹(Northern Blot),用以检 Northern印迹 Blot), ),用以检 测某一特定的RNA 通常是mRNA RNA( mRNA) 测某一特定的RNA(通常是mRNA)片段的存在 及表达量。 及表达量。 因与DNA的杂交( 因与DNA的杂交(Southern 杂交)相对应,故被 DNA的杂交 杂交)相对应, 趣称为Northern杂交。 Northern杂交 趣称为Northern杂交。
RNA来源: RNA来源:新鲜组织或细胞 来源
2008·秋
动物遗传学
DNA提取方法:常规苯酚-氯仿方法、 DNA提取方法:常规苯酚-氯仿方法、试剂盒 提取方法
方法; 方法;
RNA提取: RNA提取:所用器皿和试剂必需经高温灭菌 提取
或DEPC处理 DEPC处理
Genome DNA
Total RNA
20) Library)
含一种生物体的全部基因组DNA 含一种生物体的全部基因组DNA片。 DNA序列。 序列
动物遗传学
* *
2008·秋
第二节
基因体外重组技术
2008·秋
动物遗传学
1 重组质粒构建
载体是指携带靶DNA片段进入宿主细胞进行 是指携带靶DNA DNA片段进入宿主细胞进行
扩增和表达的工具。 扩增和表达的工具。
质粒是指一种存在于细胞内能独立复制的染色体外的 DNA。 DNA。
2008·秋
动物遗传学
2008·秋
动物遗传学
文 库 构 建
3 PCR
PCR,即聚合酶链式反应或多聚酶链反应 PCR,即聚合酶链式反应或多聚酶链反应 Reaction) (Polymerase Chain Reaction), 是一种对特定的 DNA片段在体外进行快速扩增的新方法 DNA片段在体外进行快速扩增的新方法。 片段在体外进行快速扩增的新方法。
2008·秋
动物遗传学
基因工程的基本操作
基因工程一般分为4个步骤: 基因工程一般分为4个步骤:
一、目的基因获取:取得符合人们要求的DNA片 DNA片 目的基因获取:取得符合人们要求的DNA 这种DNA片段被称为“目的基因” DNA片段被称为 段,这种DNA片段被称为“目的基因”; 基因体外重组: 二、基因体外重组:将目的基因与质粒或病毒 DNA连接成重组DNA; 连接成重组DNA DNA连接成重组DNA; 转化:把重组DNA引人某种细胞; DNA引人某种细胞 三、转化:把重组DNA引人某种细胞; 目的基因表达,获得有益性状或蛋白。 四、目的基因表达,获得有益性状或蛋白。
*
是southern于1975年创建用以鉴定DNA中某一 southern于1975年创建用以鉴定DNA中某一 年创建用以鉴定DNA 特定的基因片段的技术,也称为Southern 特定的基因片段的技术,也称为Southern 印迹( Blot)。 印迹(Southern Blot)。 通过标记的探针DNA与靶DNA结合, 通过标记的探针DNA与靶DNA结合,检测目的基 DNA与靶DNA结合 因的存在及大小。 因的存在及大小。
PCR反应条件优化: PCR反应条件优化: 反应条件优化 引物设计: 引物设计:
2008·秋
动物遗传学
PCR的类型 PCR的类型
㈠巢式PCR 巢式PCR ㈡多重PCR 多重PCR 不对称PCR ㈢不对称PCR 共享引物PCR ㈣共享引物PCR 锚定PCR ㈤锚定PCR 彩色PCR ㈥彩色PCR - - - - 2008·秋
Southern杂交 Southern杂交
2、核酸杂交技术
(基于碱基互补配对) 基于碱基互补配对)
2008·秋
Northern杂交 Northern杂交 原位杂交
动物遗传学
序 列 测 定
Sanger等 1977)发明的双脱氧链末端终止法。 Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法。
Southern杂交 Southern杂交
原位PCR ㈦原位PCR ㈧定量PCR 定量PCR 差异显示PCR ㈨差异显示PCR 重组PCR ㈩重组PCR (十一)RT十一)RT (十一)RT-PCR 十二)RAPD (十二)RAPD - - - - 动物遗传学
基本概念
多重PCR: 多重PCR:是指在一个单一反应中同时扩增多个序列
的反应过程,能够节省时间和精力。 的反应过程,能够节省时间和精力。
编码的cDNA分子的克隆群 编码的cDNA分子的克隆群。 分子的克隆群。
cDNA是指以 cDNA是指以mRNA为模板,经反转录酶催化合成 是指以mRNA为模板 为模板, DNA,则此DNA序列与 DNA,则此DNA序列与mRNA互补,称为互补 序列与mRNA互补 互补, DNA或cDNA。 DNA或cDNA。 通常由RT-PCR获得 获得, 通常由RT-PCR获得,
锚定PCR 锚定PCR:使用一条锚定引物就一条特异性引物扩 PCR:
增已知一端序列的目的DNA 增已知一端序列的目的DNA。 DNA。
2008·秋
动物遗传学
巢式PCR 利用两套PCR引物对进行两轮PCR 巢式PCR:利用两套PCR引物对进行两轮PCR扩增反 PCR引物对进行两轮PCR扩增反
应组成,在第一轮扩增中, 应组成,在第一轮扩增中,外引物用以产生扩增产 此产物在在内引物的存在下进行第二轮扩增。 物,此产物在在内引物的存在下进行第二轮扩增。
动物基因工程,原称遗传工程,是应用DNA重组 原称遗传工程,是应用DNA DNA重组
技术,按照人们的意愿, 技术,按照人们的意愿,在基因水平上改变生物遗传 通过工程化为人类提供有用产品及服务的技术; 性,通过工程化为人类提供有用产品及服务的技术; 或指应用现代化的生物科学和遗传学技术, 或指应用现代化的生物科学和遗传学技术,对动物基 因进行操纵或改造的科学工程。 因进行操纵或改造的科学工程。 基因工程的核心技术是DNA的重组技术,还包括基因 基因工程的核心技术是DNA的重组技术,还包括基因 的表达技术,基因的突变技术,基因的导入技术等。
1)质粒图谱登记号:0052 质粒图谱登记号: 质粒图谱登记号 2)质粒名称:pBudCE4.1 质粒名称: 质粒名称 3)来源:Invitrogen 来源: 来源 4)用途:真核表达载体 用途: 用途 5) 详细资料 6)是否可以共享 是否可以共享 7)联系方式:PM 联系方式: 联系方式
定量PCR 定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR
终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR 终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR起始模板量 PCR过程的监测 PCR起始模板量 的定量。用于扩增已知一端序列的目的DNA 的定量。用于扩增已知一端序列的目的DNA
克隆(clone) 指含有单一的DNA重组体的无性繁殖系, DNA重组体的无性繁殖系 克隆(clone):指含有单一的DNA重组体的无性繁殖系,
或指将DNA 或指将DNA重组体引入宿主细胞建立无性繁殖系的过程 DNA重组体引入宿主细胞建立无性繁殖系的过程 (cloning)。 (cloning)。
基因克隆步骤: 获得待克隆的DNA片段(基因);2)目 DNA片段 );2) 基因克隆步骤:1) 获得待克隆的DNA片段(基因);2)目
*
由1985年穆里斯(K. Mullis)发明,他也因此获 1985年穆里斯 年穆里斯( Mullis)发明, 得了1993年的诺贝尔化学奖 年的诺贝尔化学奖。 得了1993年的诺贝尔化学奖。
*
2008·秋
动物遗传学
PCR的原理: PCR的原理: 的原理
体外DNA复制。 体外DNA复制。 复制
包括高温变性、低温退 包括高温变性、 火和中温延伸过程。 火和中温延伸过程。
/content/ 060125000010/01/text/pcr.htm
PCR反应五要素 PCR反应五要素
引物、 引物、酶、dNTP、模板和 2+ 、模板和Mg Taq DNA聚合酶 DNA聚合酶
1)来自水生栖热菌 Thermusaquaticus;2)良好的耐 ) 热性; ) 依赖性; ) 热性;3)Mg2+依赖性;4)无校正功能
第十章 动物基因工程
(Animal Genetic Engineering) Engineering)
2008·秋
动物遗传学
主要内容 第一节 第二节 第三节 第四节 第五节
2008·秋
目的基因的获取 基因体外重组 转基因 基因敲除与基因诊断 动物克隆技术
动物遗传学
什么是动物基因工程? 什么是动物基因工程?
2008·秋
动物遗传学
4 基因克隆
基因克隆(gene cloning):或分子克隆,又称为重 cloning) 或分子克隆, 基因克隆(
DNA分 组DNA技术,是应用酶学方法,在体外将不同来源的DNA分 DNA技术,是应用酶学方法,在体外将不同来源的DNA 技术 子通过酶切、连接等操作重新组装成杂合分子, 子通过酶切、连接等操作重新组装成杂合分子,并使之在适当 的宿主细胞中进行扩增,形成大量的子代DNA分子的过程。 DNA分子的过程 的宿主细胞中进行扩增,形成大量的子代DNA分子的过程。
2008·秋
动物遗传学
第一节
目的基因获取
2008·秋
动物遗传学
1 基因组DNA及总RNA的提取 基因组DNA及总RNA DNA及总RNA的提取
动物DNA的来源 动物DNA的来源(核、线粒体DNA) 线粒体DNA)
1. 血液、毛发、皮屑(口腔上皮细胞)、精液、化石 血液、毛发、皮屑(口腔上皮细胞)、精液、 )、精液 及耳朵等活体组织; 及耳朵等活体组织; 2. 固定和包埋的组织标本:脱蜡、蛋白酶K消化 固定和包埋的组织标本:脱蜡、蛋白酶K
差别显示PCR:是根据绝大多数真核细胞 差别显示PCR:
mRNA3’端具有的多聚腺苷酸尾(polyA)结构, mRNA3’端具有的多聚腺苷酸尾(polyA)结构,因此 可用含oligo dT) oligo( 可用含oligo(dT)的寡聚核苷酸为引物将不同的 mRNA反转录成cDNA。 反转录成cDNA mRNA反转录成cDNA。
*
2008·秋
动物遗传学
原位杂交
* 细胞或染色体的原位杂交,用于基因定位。 细胞或染色体的原位杂交,用于基因定位。 * 细菌菌落的原位杂交:筛选阳性克隆。 细菌菌落的原位杂交:筛选阳性克隆。
2008·秋
动物遗传学
Western(印迹 Western(印迹)杂交 印迹)
*
蛋白质水平上的杂交技术,又称为免疫印迹, 蛋白质水平上的杂交技术,又称为免疫印迹,即 检测蛋白质与标记的特定蛋白抗体结合, 检测蛋白质与标记的特定蛋白抗体结合,经 放射自显影显示条带, 放射自显影显示条带,根据条带密度确定蛋 白质表达量。 白质表达量。 DNA、RNA水平上的Southern杂交 Northern杂 水平上的Southern杂交、 与DNA、RNA水平上的Southern杂交、Northern杂 交相对应,称为Western杂交。 Western杂交 交相对应,称为Western杂交。 常结合Northern印迹技术,检测基因表达调控。 Northern印迹技术 常结合Northern印迹技术,检测基因表达调控。
的基因与载体在体外连接;3)重组DNA分子导入宿主细胞;4) 重组DNA分子导入宿主细胞; DNA分子导入宿主细胞 的基因与载体在体外连接; 筛选、鉴定阳性重组子; 重组子的扩增与/或表达。 筛选、鉴定阳性重组子;5)重组子的扩增与/或表达。
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动物遗传学
5 核酸分子鉴定
1、PCR结合测序: PCR结合测序
Northern杂交 Northern杂交
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也称为Northern印迹( 也称为Northern印迹(Northern Blot),用以检 Northern印迹 Blot), ),用以检 测某一特定的RNA 通常是mRNA RNA( mRNA) 测某一特定的RNA(通常是mRNA)片段的存在 及表达量。 及表达量。 因与DNA的杂交( 因与DNA的杂交(Southern 杂交)相对应,故被 DNA的杂交 杂交)相对应, 趣称为Northern杂交。 Northern杂交 趣称为Northern杂交。
RNA来源: RNA来源:新鲜组织或细胞 来源
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动物遗传学
DNA提取方法:常规苯酚-氯仿方法、 DNA提取方法:常规苯酚-氯仿方法、试剂盒 提取方法
方法; 方法;
RNA提取: RNA提取:所用器皿和试剂必需经高温灭菌 提取
或DEPC处理 DEPC处理
Genome DNA
Total RNA
20) Library)
含一种生物体的全部基因组DNA 含一种生物体的全部基因组DNA片。 DNA序列。 序列
动物遗传学
* *
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第二节
基因体外重组技术
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动物遗传学
1 重组质粒构建
载体是指携带靶DNA片段进入宿主细胞进行 是指携带靶DNA DNA片段进入宿主细胞进行
扩增和表达的工具。 扩增和表达的工具。
质粒是指一种存在于细胞内能独立复制的染色体外的 DNA。 DNA。
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动物遗传学
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动物遗传学
文 库 构 建
3 PCR
PCR,即聚合酶链式反应或多聚酶链反应 PCR,即聚合酶链式反应或多聚酶链反应 Reaction) (Polymerase Chain Reaction), 是一种对特定的 DNA片段在体外进行快速扩增的新方法 DNA片段在体外进行快速扩增的新方法。 片段在体外进行快速扩增的新方法。
2008·秋
动物遗传学
基因工程的基本操作
基因工程一般分为4个步骤: 基因工程一般分为4个步骤:
一、目的基因获取:取得符合人们要求的DNA片 DNA片 目的基因获取:取得符合人们要求的DNA 这种DNA片段被称为“目的基因” DNA片段被称为 段,这种DNA片段被称为“目的基因”; 基因体外重组: 二、基因体外重组:将目的基因与质粒或病毒 DNA连接成重组DNA; 连接成重组DNA DNA连接成重组DNA; 转化:把重组DNA引人某种细胞; DNA引人某种细胞 三、转化:把重组DNA引人某种细胞; 目的基因表达,获得有益性状或蛋白。 四、目的基因表达,获得有益性状或蛋白。
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是southern于1975年创建用以鉴定DNA中某一 southern于1975年创建用以鉴定DNA中某一 年创建用以鉴定DNA 特定的基因片段的技术,也称为Southern 特定的基因片段的技术,也称为Southern 印迹( Blot)。 印迹(Southern Blot)。 通过标记的探针DNA与靶DNA结合, 通过标记的探针DNA与靶DNA结合,检测目的基 DNA与靶DNA结合 因的存在及大小。 因的存在及大小。
PCR反应条件优化: PCR反应条件优化: 反应条件优化 引物设计: 引物设计:
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动物遗传学
PCR的类型 PCR的类型
㈠巢式PCR 巢式PCR ㈡多重PCR 多重PCR 不对称PCR ㈢不对称PCR 共享引物PCR ㈣共享引物PCR 锚定PCR ㈤锚定PCR 彩色PCR ㈥彩色PCR - - - - 2008·秋
Southern杂交 Southern杂交
2、核酸杂交技术
(基于碱基互补配对) 基于碱基互补配对)
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Northern杂交 Northern杂交 原位杂交
动物遗传学
序 列 测 定
Sanger等 1977)发明的双脱氧链末端终止法。 Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法。
Southern杂交 Southern杂交
原位PCR ㈦原位PCR ㈧定量PCR 定量PCR 差异显示PCR ㈨差异显示PCR 重组PCR ㈩重组PCR (十一)RT十一)RT (十一)RT-PCR 十二)RAPD (十二)RAPD - - - - 动物遗传学
基本概念
多重PCR: 多重PCR:是指在一个单一反应中同时扩增多个序列
的反应过程,能够节省时间和精力。 的反应过程,能够节省时间和精力。
编码的cDNA分子的克隆群 编码的cDNA分子的克隆群。 分子的克隆群。
cDNA是指以 cDNA是指以mRNA为模板,经反转录酶催化合成 是指以mRNA为模板 为模板, DNA,则此DNA序列与 DNA,则此DNA序列与mRNA互补,称为互补 序列与mRNA互补 互补, DNA或cDNA。 DNA或cDNA。 通常由RT-PCR获得 获得, 通常由RT-PCR获得,
锚定PCR 锚定PCR:使用一条锚定引物就一条特异性引物扩 PCR:
增已知一端序列的目的DNA 增已知一端序列的目的DNA。 DNA。
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巢式PCR 利用两套PCR引物对进行两轮PCR 巢式PCR:利用两套PCR引物对进行两轮PCR扩增反 PCR引物对进行两轮PCR扩增反
应组成,在第一轮扩增中, 应组成,在第一轮扩增中,外引物用以产生扩增产 此产物在在内引物的存在下进行第二轮扩增。 物,此产物在在内引物的存在下进行第二轮扩增。
动物基因工程,原称遗传工程,是应用DNA重组 原称遗传工程,是应用DNA DNA重组
技术,按照人们的意愿, 技术,按照人们的意愿,在基因水平上改变生物遗传 通过工程化为人类提供有用产品及服务的技术; 性,通过工程化为人类提供有用产品及服务的技术; 或指应用现代化的生物科学和遗传学技术, 或指应用现代化的生物科学和遗传学技术,对动物基 因进行操纵或改造的科学工程。 因进行操纵或改造的科学工程。 基因工程的核心技术是DNA的重组技术,还包括基因 基因工程的核心技术是DNA的重组技术,还包括基因 的表达技术,基因的突变技术,基因的导入技术等。
1)质粒图谱登记号:0052 质粒图谱登记号: 质粒图谱登记号 2)质粒名称:pBudCE4.1 质粒名称: 质粒名称 3)来源:Invitrogen 来源: 来源 4)用途:真核表达载体 用途: 用途 5) 详细资料 6)是否可以共享 是否可以共享 7)联系方式:PM 联系方式: 联系方式
定量PCR 定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR
终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR 终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR起始模板量 PCR过程的监测 PCR起始模板量 的定量。用于扩增已知一端序列的目的DNA 的定量。用于扩增已知一端序列的目的DNA
克隆(clone) 指含有单一的DNA重组体的无性繁殖系, DNA重组体的无性繁殖系 克隆(clone):指含有单一的DNA重组体的无性繁殖系,
或指将DNA 或指将DNA重组体引入宿主细胞建立无性繁殖系的过程 DNA重组体引入宿主细胞建立无性繁殖系的过程 (cloning)。 (cloning)。
基因克隆步骤: 获得待克隆的DNA片段(基因);2)目 DNA片段 );2) 基因克隆步骤:1) 获得待克隆的DNA片段(基因);2)目
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由1985年穆里斯(K. Mullis)发明,他也因此获 1985年穆里斯 年穆里斯( Mullis)发明, 得了1993年的诺贝尔化学奖 年的诺贝尔化学奖。 得了1993年的诺贝尔化学奖。
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2008·秋
动物遗传学
PCR的原理: PCR的原理: 的原理
体外DNA复制。 体外DNA复制。 复制
包括高温变性、低温退 包括高温变性、 火和中温延伸过程。 火和中温延伸过程。
/content/ 060125000010/01/text/pcr.htm
PCR反应五要素 PCR反应五要素
引物、 引物、酶、dNTP、模板和 2+ 、模板和Mg Taq DNA聚合酶 DNA聚合酶
1)来自水生栖热菌 Thermusaquaticus;2)良好的耐 ) 热性; ) 依赖性; ) 热性;3)Mg2+依赖性;4)无校正功能
第十章 动物基因工程
(Animal Genetic Engineering) Engineering)
2008·秋
动物遗传学
主要内容 第一节 第二节 第三节 第四节 第五节
2008·秋
目的基因的获取 基因体外重组 转基因 基因敲除与基因诊断 动物克隆技术
动物遗传学
什么是动物基因工程? 什么是动物基因工程?
2008·秋
动物遗传学
4 基因克隆
基因克隆(gene cloning):或分子克隆,又称为重 cloning) 或分子克隆, 基因克隆(
DNA分 组DNA技术,是应用酶学方法,在体外将不同来源的DNA分 DNA技术,是应用酶学方法,在体外将不同来源的DNA 技术 子通过酶切、连接等操作重新组装成杂合分子, 子通过酶切、连接等操作重新组装成杂合分子,并使之在适当 的宿主细胞中进行扩增,形成大量的子代DNA分子的过程。 DNA分子的过程 的宿主细胞中进行扩增,形成大量的子代DNA分子的过程。
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动物遗传学
第一节
目的基因获取
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动物遗传学
1 基因组DNA及总RNA的提取 基因组DNA及总RNA DNA及总RNA的提取
动物DNA的来源 动物DNA的来源(核、线粒体DNA) 线粒体DNA)
1. 血液、毛发、皮屑(口腔上皮细胞)、精液、化石 血液、毛发、皮屑(口腔上皮细胞)、精液、 )、精液 及耳朵等活体组织; 及耳朵等活体组织; 2. 固定和包埋的组织标本:脱蜡、蛋白酶K消化 固定和包埋的组织标本:脱蜡、蛋白酶K
差别显示PCR:是根据绝大多数真核细胞 差别显示PCR:
mRNA3’端具有的多聚腺苷酸尾(polyA)结构, mRNA3’端具有的多聚腺苷酸尾(polyA)结构,因此 可用含oligo dT) oligo( 可用含oligo(dT)的寡聚核苷酸为引物将不同的 mRNA反转录成cDNA。 反转录成cDNA mRNA反转录成cDNA。
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动物遗传学
原位杂交
* 细胞或染色体的原位杂交,用于基因定位。 细胞或染色体的原位杂交,用于基因定位。 * 细菌菌落的原位杂交:筛选阳性克隆。 细菌菌落的原位杂交:筛选阳性克隆。
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动物遗传学
Western(印迹 Western(印迹)杂交 印迹)
*
蛋白质水平上的杂交技术,又称为免疫印迹, 蛋白质水平上的杂交技术,又称为免疫印迹,即 检测蛋白质与标记的特定蛋白抗体结合, 检测蛋白质与标记的特定蛋白抗体结合,经 放射自显影显示条带, 放射自显影显示条带,根据条带密度确定蛋 白质表达量。 白质表达量。 DNA、RNA水平上的Southern杂交 Northern杂 水平上的Southern杂交、 与DNA、RNA水平上的Southern杂交、Northern杂 交相对应,称为Western杂交。 Western杂交 交相对应,称为Western杂交。 常结合Northern印迹技术,检测基因表达调控。 Northern印迹技术 常结合Northern印迹技术,检测基因表达调控。
的基因与载体在体外连接;3)重组DNA分子导入宿主细胞;4) 重组DNA分子导入宿主细胞; DNA分子导入宿主细胞 的基因与载体在体外连接; 筛选、鉴定阳性重组子; 重组子的扩增与/或表达。 筛选、鉴定阳性重组子;5)重组子的扩增与/或表达。
2008·秋
动物遗传学
5 核酸分子鉴定
1、PCR结合测序: PCR结合测序