远程控制服务器

远程控制服务器

1. Putty (2)

1.1 Putty简介 (2)

1.2 Putty下载 (2)

1.3 Putty安装与使用 (2)

2. WinSCP (4)

2.1 WinSCP简介 (4)

2.2 WinSCP下载 (4)

2.3 WinSCP安装与使用 (4)

3. 常用Unix/Linux命令 (5)

生物信息计算或数据处理经常需要通过Windows终端远程控制Linux或Unix服务器，最常用的两种软件是Putty和WinSCP，前者用于执行Linux或Unix 命令，后者用于上传或下载文件。

1. Putty

1.1 Putty简介

Putty不仅免费，而且在Windows系统下运行非常稳定。它提供5种连接方式连接到Linux服务器：Raw、Telnet、Rlogin、SSH（默认）和Serial。推荐使用SSH连接方式。

1.2 Putty下载

Putty可以到它的官网下载：/~sgtatham/putty/download.html。

1.3 Putty安装与使用

Putty是一个独立的可执行文件，无需安装。

运行Putty，在打开的主界面中提供3个信息：服务器的IP地址、端口（Port），和连接方式（Connection type）。本例中IP地址是“192.168.1.105”，端口是22（默认），连接方式是SSH。点击Open登录服务器（如下图）。

在打开的窗口中输入用户名“gaoshan”与密码“000000”，回车后即可登录服务器，在光标提示（如下图绿色部分）下输入Linux命令。

2. WinSCP

2.1 WinSCP简介

WinSCP的优势是可以通过鼠标操作进行文件传输，避免记忆复杂的命令行。它提供三种文件传输方适：传统的FTP传输、SCP（Secure Copy Protocol）和SFTP （SSH File Transfer Protocol）。WinSCP默认使用SFTP协议进行连接，通过该连接的通信内容全部是经过加密的，其不足之处在于在保证了安全的同时，也降低了传输速度。

2.2 WinSCP下载

WinSCP可以到它的官网下载：/eng/download.php。

2.3 WinSCP安装与使用

WinSCP安装如下：首先，双击WinSCP安装程序（以winscp554setup版本为例），安装语言选择英文，然后选择安装方式为“Typical installation”，用户界面类型为“Commander”（如下图）。

在“Commander”模式下，可以在一个窗口中同时显示本地目录（面板左侧）和服务器上的目录（面板右侧），方便了文件的拖拽（见下图）

3. 常用Unix/Linux命令

文本过滤类

grep

作用字符串查找

语法格式grep [可选参数]

常用参数-E 将查找模式解释成扩展的正则表达式。

-F 将查找模式解释成单纯的字符串。

-b或--byte-offset

在输出的每一行前面显示包含匹配字符串的

行在文件中的位置，用字节偏移量来表示。

-c或--count 只显示文件中包含匹配字符串的行的总数。

-f

FILE从文件FILE中获取模式，每行一个。空

文件不含模式，因此不做匹配。

-i 匹配比较时不区分字母的大小写。

-r

以递归方式查询目录下的所有子目录中的文

件。

-n

在输出包含匹配模式的行之前，加上该行的行

号（文件首行的行号为1）。

-v 反向选择，只显示不包含匹配字符串的文本行。-x 只显示整个行都严格匹配的行。

说明grep指令用于查找内容包含指定的范本样式的文件，如果发现某文件的内容符合所指定的模式，grep指令会把含有范本样式