中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A..

中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范

(版本 2004 A)

SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM

（Version 2004 A）

目录

一、软件系统的功能简介：

二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出

三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答

一．简介

1．版本介绍：

本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。

2．系统运行环境要求：

(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。

(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768

二．安装方法

点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。

图 1

三．功能

本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）

图2

图3

图4 系统主界面

系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。

1 文件打开

绘图区

文

件

信息

区

（1）打开文件（全谱导入）（图5）：

图5

本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。建议采用通用的AIA（*.cdf）格式文件导入。注意AIA（*.cdf）文件中应包含样本图谱的峰面积信息，在色谱工作站导出AIA（*.cdf）文件前应现进行积分。否则导出的AIA（*.cdf）文件可能因不包含峰面积信息而无法导入。为了方便用户的使用，附录中给出了主要色谱工作站的（AGILENT，W ATERS，和SHIMADZU）AIA(*.cdf)数据格式的文件导出介绍。

文本文件（*.txt）的导入需要采用特殊的格式，可以参考本系统导出的文本文件格式。Scp(*.Scp，即Standard Chromatographic Project的简写)是本系统为生成的对照图谱的导入提供的一种特殊的文件格式。

（2）导出文件（保存图谱）

本系统支持将导入的图谱数据文件以文本文件（*.txt）导出保存（图6）。

图6

（3）导出图象

将导入绘制的色谱图谱可以图象形式存放，文件格式为*.bmp（图7）。

图7

（4）图谱删除

本系统提供谱图删除功能（图8）。可以选中某一图谱删除（“删除当前图谱”功能），也可将导入的图谱全部删除（“清除所有图谱数据”）。在文件信息区选中某一样本图谱，然后在文件菜单栏中点击“删除当前图谱”，即可将选中的样本图谱删除。若点击“清除所有图谱数据”，所有样本图谱全部删除。

图8

2 数据库功能：

数据库管理包括药材信息建档（图9）、制剂信息建档（图10）和参照图谱建档功能（图11），便于用户信息管理。

图9 图10

图11

3 谱图处理：

（1）数据剪切

数据剪切功能可使用户选择一定时间范围内的色谱数据进行匹配。

点击“谱图处理”中的“数据剪切”功能，系统会提示用户是否需要恢复原始数据，点击确定后进入“数据剪切”功能对话框，如图（12）：

图12 数据剪切功能对话框

通过该对话框用户可以剪切样本图谱起始阶段的溶剂峰，也可剪切样本图谱尾部阶段的“杂峰”。在对话框中输入剪切溶剂峰的“终止时间”（系统默认为5分钟）和尾部剪切的“起始时间”（系统默认为60分钟），可以将所有样本在剪切溶剂峰的“终止时间”前和尾部剪切的“起始时间”后的图谱数据剪切掉。

（2）放大和缩小

本系统提供了两种图谱放大和缩小功能。一种为“信号放大一倍和缩小一倍”（图13），另一种为信号的直接拖放放大。这里只介绍“信号放大一倍和缩小一倍”功能。

“信号放大一倍和缩小一倍功能”使得当前显示图谱的沿y轴方向成比例放大和缩小一倍，便于用户观察图谱信号的整体概貌和细节部分。连续点击“信号放大一倍”两次，即将原始图谱沿y 轴方向放大四倍。

图13 谱图处理包含的功能

（3）色谱峰匹配

色谱峰匹配包括指定参照峰，指定基准峰和自动匹配。下面逐一介绍：

•指定参照图谱：用户可以任意选择一条色谱图谱作为指定参照图谱。点击“谱图处理”→“色谱峰匹配”中的“指定参照图谱”，弹出如图14所示的对话框，选择参照图谱编号“确定“后即可将该编号对应的图谱指定为参照图谱。图谱颜色变为红色，以区别于其他图谱。

在此对话框中还提供了“对照图谱的生成方法”和“时间窗宽度”的参数设置。“对照图谱的生成方法”（详见“3 谱图处理中（4）生成对照图谱、单独显示对照图谱及导出对照图谱”），这里只介绍“时间窗宽度”的参数设置。时间窗宽度是指相对于参照图谱峰位置的可选保留时间范围，其单位根据横坐标轴的单位而定（这里是分钟）。时间窗宽度越大，可选的时间范围就越大。在色谱峰匹配时，选择一个合适的时间窗宽度是非常重要的。一般情况下，时间窗宽度在较小范围内变化（如0.1-0.5），自动匹配结果变化较大。时间窗宽度在较大范围内变化（如0.5-1.5），自动匹配结果比较稳定。建议：先在一定范围内逐渐增加时间窗宽度（如0.1-1.0），然后观察匹配结果（可以通过相似度的计算结果确定）。若时间窗宽度增加到一定数值后，匹配结果比较稳定（相似度计算结果稳定），这时对应的时间窗宽度参数较为适合。

图14 参数设置对话框

•多点校正（即设置匹配点或设置Mark峰）：

系统支持“多点校正”功能。点击“谱图处理”→“色谱峰匹配”中的“多点校正”（或直接点击状态栏中的“多点校正”按钮），系统进入“多点校正”模式，这时鼠标变成“＋”。

用户根据需要直接在图谱上设置匹配点（匹配点数不限，设置后的匹配点为红色点表示，详见图36和37）进行多点校正。若设置结果不满意，可以再次点击设置的匹配点即可取消已设置