9群体遗传学

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第九章 群体遗传学

第九章 群体遗传学

选择。因q ≈ 1:
Δq ( XA) = S(p /3 + 2p /3 )= Sp 在一个遗传平衡群体中,因选择而被淘汰的XA将 由突变(v)补偿: v = Sp
突变率的公式:
v = sp = ½ S H
AD
u = sq2
AR
u = 1/3 sq
XR
v = sp
XD
2、选择压力的变化对遗传平衡的影响
q = R 1/2H
p (A)=D + 1/2H =0.03 + 1/2 × 0.296 = 0.178 q (a)=R + 1/2H=0.674 + 1/2 × 0.296 = 0.822
群体的遗传结构:群体基因库中基因的种类和频率以 及基因型的种类和频率。
群体遗传学(Population Genetics):应用数学和统 计学方法研究群体的遗传结构及其变化规律的学科 。 群体:指生活在某一地区的、能相互交配并产生具有 繁殖能力后代的个体群,也称为孟德尔式群体 (Mendelian population) 。 基因库(gene pool):一个群体所具有的全部遗传信 息或基因。
3. 通过χ2 检验来确定(对于存在较小差别的群体)。 采用HWE软件进行χ2 检验 没有显著差异,则群体达到遗传平衡
苯硫脲尝味
班1 班2 基因频率:
敏感型
中间型
味盲型
AA(D) Aa(H) aa(R) 3(10%) 26(86.7%) 1(3.3%) 2(6.3%) 25(78.1%) 5(15.6%)
XAXA p2
XaXa q2
1. 男性表型频率=男性相应的基因型频率=男性群 体基因频率 2. 女性纯合体的频率为男性相应表型频率的平方

群体遗传学

群体遗传学

一、突 变
二、选 择
主要是自然选择:是在自然条件下,留良汰劣的过程。指不同的遗传变异 体的差别生活能力和差别生殖力。可能对显性基因有利,也可能对隐性基 因有利。因此选择可使群体中某一基因的频率增加,而定向改变基因频 率,影响群体的基因平衡。 自然选择的本质:基因型差别复制,使带有某些基因型的个体比另一些具 有更多的后代。 (一)适合度(选择值、适应值、W) 指具有某一基因型的个体能成活,并繁殖后代的相对能力。用W表示,其 值 1—0之间 ,为方便起见,常用具有最高生殖效能的基因型的适合度定为 1,以未能交配或交配后未能产 生后代的基因型的适合度为零。 如AA的W=1,Aa=80,aa=20。
第十章群体遗传
第一节 第二节 第三节 群体中的遗传平衡 影响群体遗传平衡的因素 遗传负荷
前言
群体遗传学(又称遗传流行病学)是研究人类 致病基因在群体中分布、变化规律的科学。 总之,群体遗传学是研究基因在人群中的行为。 (1)怎样估计群体的基因频率和基因型频率? (2)哪些因素可影响基因频率? (3)突变和选择对维持基因频率有什么作用? (4)怎样增进我们子孙后代的遗传素质?
五、近亲婚配
1、常染色体基因:
A 1 A2 同 胞 兄 妹 间 婚 配
P1
A3A4 P2
A1A1 = (1/2)4 A2A2 = (1/2)4 A3A3 = (1/2)4 A4A4 = (1/2)4
B1
B2

S
F = 4 ×(1/2)4 = 1 / 4
一级亲属间的近婚系数为1/4
五、近亲婚配
的大小不能用自然选择来解释,A型人并不比其他血型的人有
更大的生存性,但是人类的不同种族里基因IA、IB、I是有差 异的。 东北人:B型多;四川人:O型多;爱斯基摩人:A型多;印帝 安人没有AB型。

群体遗传学PPT课件

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p2q2
Aa(2pq) 2p3q
4p2q2
2pq3
aa(q2) p2q2
2pq3
q4
子1代婚配类型和子2代基因型及其频率
子1代婚配类型
AA × AA AA × Aa Aa × Aa AA × aa Aa × aa aa × aa
婚配频率
p4 4p3q 4p2q2 2p2q2 4pq3
q4
子二代基因型及频率
f(LM)=p=D+1/2H=31.2%+1/2×51.5%=0.57 f(LN)=q=R+1/2H=17.3%+1/2×51.5%=0.43
f(LM)=p=(2330×2+3850)/ 7470×2 =2330/7470 (31.2%)+1/2×3850/7470 (51.5%)
9.1 群体与群体遗传 9.2 Hardy-Weinberg平衡定律 9.3 Hardy-Weinberg平衡定律的应用 9.4 影响Hardy-Weinberg平衡定律的因素
近婚系数(inbreeding coefficient,F):近亲婚配使子女 中得到一对纯合或等同基因的概率。
亲缘系数(coefficient of relationship):有共同祖先的 两个个体在某一位点上具有相同等位基因的概率。
1. 常染色体基因的近婚系数的估算
同胞兄妹的父亲某一基因座有 等位基因A1和A2,母亲的这个 基因座有等位基因A3和A4。他 们的子女中,A1A3,A1A4, A2A3,A2A4 各1/4 。这一对 子女如果近亲婚配,所生后代 中,形成A1A1、A2A2、A3A3、 A4A4的总概率即为其近婚系数。
p2: 基因型AA的频率D1 2pq:基因型Aa的频率H1 q2: 基因型aa的频率R1

群体遗传学

群体遗传学

1群体遗传学population genetics研究目标:探索群体的遗传组成以及引起群体遗传组成发生变化的动力。

研究范畴:所有决定群体的遗传组成及其随时间和空间的变化规律性问题。

群体中有一对等位基因A和a等位基因A的频率为A/(A+a),显性的通常用p表示p= A / (A+a)等位基因a的频率为a/(A+a),隐性的通常用q表示q= a / (A+a)p + q= (A+a) / (A+a)= 16例:一对等位基因A和a群体中存在的基因型有3种AA, Aa, aaAA的频率:AA /(AA+Aa+aa),用D(dominance)表示Aa的频率:Aa/(AA+Aa+aa),用H(heterozygote)表示aa的频率:aa/(AA+Aa+aa),用R(recessive)表示D + H + R = 18如何获取某个群体某个感兴趣基因其分布的信息呢?9如果我们可以得到某个基因座所存在的每种基因型的频率,就可以得到每种等位基因的基因频率。

比如当某一性状是共显性或不完全显性性状时,群体中每一表型的频率就是对应的基因型频率,进而可以得到基因频率。

1011对MN血型有人在一个地区调查747人M 血型基因型为MM 占31.2% D N 血型基因型为NN 占17.3% R MN血型基因型为MN 占51.5% H例:p = D + H/2q = R + H/2设M的基因频率为p,N的基因频率为q,p+q = 1p=(747×31.2%×2+747×51.5%)/747×2=0.312+0.515/2=0.57q=(747×17.3%×2+747×51.5%)/747×2=0.173+0.515/2=0.4312例:CCR5基因,编码细胞表面的细胞因子受体,可作为HIV病毒进入细胞的受体。

ΔCCR5基因,32bp的缺失突变,可引起编码蛋白的移码,从而使HIV病毒失去受体。

群体遗传学

群体遗传学
长子威廉(1839年生)无生育能力; 长女 安娜 (1841-1851) 次女 玛丽 (1842.9.23-10.16) 三女亨利埃塔(1843年生)无生育能力 次子乔治(1845年生)FRS 有神经质,4个孩子; 四女伊莉莎白(1847年生)终身未嫁 三子弗朗西斯(1848年生) FRS, 2个孩子; 四子伦纳德(1850年生)皇家地质学会主席,无孩子; 五子雷勒斯(1851年生) FRS, 剑桥市长,2个孩子; 六子小查理(1856年生)两岁时死亡。
2.2 Hardy-Weinberg定律的数学证明
举例:随机交配大群体常染色体等位基因A、a,
这是一个不平衡群体。三种基因型频率(原代):
AA
D0 0.18
Aa
H0 0.04
aa
R0 0.78
则基因频率:p0= D0+(1/2)H0=0.18+0.02=0.20
q0= R0+(1/2)H0=0.02+0.78=0.80
群体遗传学基础
1 基因频率与基因型频率 2 遗传平衡定律 3 影响基因频率与基因型频率的因素 4 遗传多样性 5 分子进化
1 基因频率与基因型频率
群体(population)
从遗传学意义上讲即孟德尔群体,指一群可以相 互交配而能够产生健全正常后代的个体,即一个 物种、一个亚种、一个品种或一个变种所有成员 的总和。
设“八黑”兔的比率为H,白化兔的比率为A由 此可见: H=q2+2qr ,A=r2 H+A= q2+2qr+r2=(q+r)2=(1-p)2
∴ 1-p=(H+A)1/2 p=1-(H+A)1/2 而A=r2 r=A1/2 q=1-p-r= (H+A)1/2 -A1/2

09群体遗传

09群体遗传
第八章
群体遗传学
群体遗传学( population genetics) (流行遗传病学):
是研究群体遗传结构及变化规律的学
科,研究群体中基因分布、基因频率和
基因型频率维持及变化的科学。
第一节 群体的遗传平衡
群体(population): -----生活在某一地区、同一物种的个体 群。 基因库(gene pool ): -----一个群体所具有的全部遗传信息, 即全部基因。
q=0.01=1/100, 代入公式:n=1/qn-1/q=1/ 0.005 -1/ 0.01 , n=100代。 如果每世代以25年计算,则要经过2500年才
能使基因频率降低一半。
因此,选择压力的改变对隐性基因频率的变 化是很缓慢的。
2、选择压力放松 f=1 ; s=0 由于选择压力的降低使致病基因频率增高, 而导致遗传发病率增高。 AD病:f=1 ; s=0 , 若A是致死的,其发病率完全由突变v来维持。
这样,基因A最终会从群体中消失。这时如要
达到遗传平衡,就要靠基因a突变为基因A来 补偿。
其选择系数为S 选择的作用下,每一代中基因频率的改变为Sp
AD患者都是杂合体(H)=2pq
P的值很小,所以q=1
H=2p; p=1/2H
在一个遗传平衡的群体中,被淘汰的p必将由 突变率v来补偿,以维持平衡。 即v=Sp=S· 1/2H。
遗传平衡的群体中 (1-q)u = qv q=u/u+v 同理,p=v/u+v 中性突变(neutral mutaiton):这种突变 型既无害处亦无益处,选择性不显著. 如我国汉族人群中,对苯硫脲(PTC)缺 乏尝味能力的味盲(tt)的频率为9%,味盲 基因(t)的频率为0.03。

第九章群体遗传学-动物遗传学习题

第九章群体遗传学-动物遗传学习题

第九章群体遗传学-动物遗传学习题第九章群体遗传学(一) 名词解释:1.群体遗传学(population genetics):应用数学和统计学的方法,研究群体中基因频率和基因型频率,以及影响这些频率的选择效应、突变作用,研究迁移和遗传漂变等与遗传结构的关系及进化机制。

(研究一个群体内基因的传递情况,及基因频率改变的科学。

)2.基因库(gene pool):一个群体中全部个体所共有的全部基因。

(指一个群体所包含的基因总数)。

3.孟德尔群体:是在各个体间有相互交配关系的集合体。

必须全部能相互交配,而且留下建全的后代。

即“在个体间有相互交配的可能性,并随世代进行基因交换的有性繁殖群体”。

换句话说“具有共同的基因库并且是由有性交配的个体所组成的繁殖社会”。

4.基因频率:在一群体内不同基因所占比例。

(某一基因在群体的所有等位基因的总数中所占的频率或一群体内某特定基因座某一等位基因占该基因座等位基因总数的比率。

)5.基因型频率(genotypic frequency):在一个群体内不同基因型所占的比例。

6.迁移:个体从一个群体迁入另一个群体或从一个群体迁出,然后参与交配繁殖,导致群体间的基因流动。

7.遗传漂移(genetic drift):在一个小群体内,每代从基因库抽样形成下一代个体的配子时,会产生较大的抽样误差,这种误差引起群体等位基因频率的偶然变化,称遗传变。

8.遗传平衡、基因平衡定律:在一个完全随机交配群体内,如果没有其他因素(如突变、选择、遗传漂移和迁移)干扰时,则基因频率和基因型频率常保持一定。

(二) 是非题:1.物种是指一群相互交配或可以相互交配的个体。

(+)2.孟德尔群体是遗传学上指由许多个体所组成的任意群体。

(-)3.在一个Mendel群体内,不管发生什么情况,基因频率和基因型频率在各代始终保持不变。

(+)4.选择不仅可以累积加强变异,而且还能创造变异。

(-)5.在一自由授粉的遗传平衡群体中,已找到纯合植株(dd)约占1%,该群体中含d的杂合体所占百分数为0.18。

群体遗传学

群体遗传学

核心问题
• 群体的基因频率如何变化?
• 决定因素有哪些?
• 这些因素又是怎样作用于群体并导
致群体基因频率发生变化的?
群体
一个物种生活在某一地区内的、能相互 杂交的个体群。
基因池(Gene pool):
一个群体中所有个体所共有的全部 遗传信息。
如何描述?
• 遗传结构:
指群体中各种基因的频率,以及
• 一次随机交配后所产生的子一代基因型 频率为:D1=p2=0.62=0.36; H1=2pq=2×0.6×0.4=0.48; R1=q2=0.42=0.16; • 子一代的基因频率同亲代相同: p1=D1+H1/2=0.36+0.48/2=0.6=p q1=R1+H1/2=0.16+0.48/2=0.4=q
• 常染色体,共显性等位基因
以M-N血型为例,我们在上海居民中抽样 调查了1788人的M-N血型,其中397人M型, 861人MN型,530人N型。据MN血型的遗传模式 可知,每个M型个体带有两个LM基因,每个 MN型个体带有一个LM基因和LN基因,每个N 型个体带有两个LN基因。 LM:p=(397×2+861)/(1788×2)=0.4628
选择
自然选择(natural selection)和 人工选择(artificial selection) 都是导致基因频率变化的重要因素, 就人而言,导致基因频率变化的主要 选择因素是自然选择。
自然选择——进化的推动力
• 自然选择是作用在不同的遗传变异 体的的生活力和繁殖力的差别,增 高或降低个体的适合度(fitness)。 • 适合度 是指一个个体能生存并 把基 因传给下一代的能力,可用在同一 环境下不同个体间的相对生育率来 衡量。

群体遗传学POPULATION GENETICS

群体遗传学POPULATION GENETICS

Her son, Grand Duke Alexis was affected with hemophilia
A well-documented case of consanguinity to retain power occurred in European Royal Families of many countries.
患者为aa,表型正常者为AA或Aa; 平衡时基因型频率分别为q2、p2、2pq。
根据Hardy-Weinberg定律,由隐性纯合子的基因 型频率可求得等位基因的基因频率。
q=√  ̄ q2 p=1-q
例:苯丙酮尿症(PKU)是常染色体隐性遗传病, 群体发病率为1/10000,求各等位基因频率。
解: ∵q2=1/10000 ∴q=1/100, p=1-q=99/100≈1 杂合子频率 2pq=2×1×1/100≈1/50
1 2- p

1 2
对一种罕见的XR病来说,男患者对女患者的比例为
q q2
=
1 q
一、群体中的遗传平衡
基因频率和基因型频率 遗传平衡定律 遗传平衡定律的应用
二、影响遗传平衡的因素
二、影响遗传平衡的因素
(一) 近亲结婚(consanguineous marriage) ——3-4代内具有共同祖先的个体之间婚配。
等位基因A频率 p= 2D+H
2D+H =
= D+½H
2D+2H+2R 2(D+H+R)
等位基因a频率 q= 2R+H = R+½H 2D+2H+2R
例:某群体中AA个体占50%,Aa个体占20%,aa 个体占30%,求该群体中A与a的基因频率。

医学遗传学9、群体遗传学

医学遗传学9、群体遗传学

医学遗传学9、群体遗传学第九章群体遗传学群体遗传学从群体(宏观)角度探讨基因的传递规律和变化规律。

主要研究群体的基因频率和基因型频率平衡和变化情况及其影响因素。

主要内容有:遗传平衡定律基因频率和突变率的计算影响遗传平衡的因素遗传负荷第一节群体的遗传平衡一、基因频率和基因型频率群体(population):是指生活在某一地区的能相互杂交的个体群。

基因库( gene pool):一个群体所具有的全部遗传信息。

基因频率:是指群体中某一基因在所有等位基因数量中所占的比例。

显性基因的频率为p,隐性基因的频率为q,p + q = 1 基因型频率:一对等位基因的不同基因型的个体所占的比例。

如等位基因A 和a ,群体中共有三种基因型个体:基因型AA Aa aa基因型频率D H RD + H + R = 1根据基因型频率计算基因频率:有人在某地区调查了MN血型的情况,10万人中,各种血型分布为:表现型M型N型MN型比例31.2%17.3%51.5%基因型NNMNM基因和N基因在此地区人群中的分布如何?二、遗传平衡定律1908年,Hardy和Weinberg 分别用数学方法探讨群体中基因频率变化,得出一致的结论:在一定的条件下,群体中的基因频率和基因型频率在世代传递中保持不变,这就是遗传平衡定律。

如果一个群体达到了这种状态,就是一个遗传平衡群体, 否则就是一个遗传不平衡群体, 这种群体只需随机婚配一代后就可达到平衡。

一定条件是:①群体很大;②随机婚配;③无自然选择;④无突变;⑤无大规模的迁移。

举例说明遗传平衡定律假设:某一群体有100万人口,考虑某一对等位基因A和a:基因型AA Aa aa 个体数60万20万基因型频率D = 0.6H = 0.2R = 0.2A基因的频率p= D + 1/2 H= 0.6 + 0.2/2 = 0.7 a基因的频率q=R + 1/2H= 0.2 + 0.2/2= 0.3从上表中得出子1代的基因型频率为:子1代基因型频率D(AA)H(Aa)R(aa)0.490.420.09p1= D+1/2 H = 0.49+0.42/2 = 0.7q 1= R+1/2 H = 0.09+0.42/2 = 0.3子2代基因型频率亲代基因型频率0.60.20.20.490.420.09(p+q)(p+q) = (p+q)2 = p 2+2pq+q2p 2+2pq+q 2 = 1 为遗传平衡公式,p 2、2pq 、q 2 分别是平衡状态时AA 、Aa 、aa 的频率;p 22pq q2平衡状态时的频率: D H R任何状态时的频率:∵p+q=1∴(p+q)2 = p 2+2pq+q 2 = 1AA Aa aa两性配子随机结合,其频率为:三、遗传平衡定律的应用(一)遗传平衡群体的判定(1)应用遗传平衡定律进行判断:通过给出的基因型频率先计算基因频率或配子频率,两性配子随机结合,得出下一代的基因型频率,然后进行比较,不变,就是遗传平衡群体;有变化,就是不平衡群体。

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qa
pA
p2 AA pq Aa
qa
pq Aa q2 aa
子代: AA p2 , Aa 2pq, aa q2, 与亲代完全一样
群体达到平衡时,基因频率与基因型 频率的关系是:
P= p2 H= 2pq 只适用于平衡群体 Q = q2 平衡公式: p2+2pq+q2=1
例:AA:0.6,Aa:0.4, aa:0 产生配子的频率: A:p=0.6 + 1/2 0.4=0.8 a:q=1/2 0.4=0.2 为不平衡群体
0.001 0.0001 9000 18005 90023 900230
选择的效果与被选择基因的初始频率及选择系数有关
(3) 对显性表型不利的选择
AA
初始频率 p2
适合度
1-s
选择后频率 p2(1-s)
M血型的概率:0.62=0.36
2.复等位基因的遗传平衡
设:某一人群的ABO血型三种基因 频率分别为: IA = p
IB = q i=r 在自由婚配的情况下,后代基因型频 率、血型频率为:
♀♂ p (IA)
p(IA) p2 (IA IA)
A
q( IB) p q( IA IB)
AB
r( i) p r( IAi) A
p=P+1/2H q=Q+1/2H 并且:
适用于任何群体
p+q=1
P+H+Q=1
二、Hardy-Weinberg定律
由英国数学家Hardy,G. H和德国医学家 Weinberg,W于1908年分别提出。
在一个无限大的可随机交配的群体中,如果 没有任何形式的突变、自然选择、迁移、遗传漂 变的干扰,则群体中各基因频率和基因型频率世 代相传保持不变。 若不平衡,随机交配一代即 可达到平衡。

医学遗传学:第九章 群体遗传学

医学遗传学:第九章  群体遗传学

群体遗传学 免疫遗传学 药物遗传学 肿瘤遗传学 发育遗传学
从不同角度研究人类遗传与疾病的关系。
群体是指生活在某一地区的、能相互 杂交的个体群。这样的群体也叫孟德尔 式群体.
群体遗传学
(population genetics)
群体遗传学是研究群体的遗传结构及其演变规律 的遗传学分支学科。它是运用数学和统计学方法研究 群体的基因频率,基因型频率以及影响这些频率的因 素与遗传结构的关系。
5
6
2/3×1/2=1/3。
另外,假设已知这种遗传病在群体中的发病率也
为1/10 000,根据Hardy-Weinberg定律,可得群体 中携带者的频率=1/50。
Hardy-Weinberg 定律的应用
随机婚配时,夫妇双方同携带者的概率 =1/3×1/50,其子女的发病风险 =1/3×1/50×1/4=1/600。 如果Ⅲ5与其姑表妹Ⅲ6近亲婚配,他们所生子女 的发病风险=(1/3)2×1/4=1/36,比随机婚配 时的发病风险提高了约17倍。
基因型频率
A = p2+2pr
B = q2+2qr
AB = 2pq
O = r2
基因型频率
A = p2+2pr
基因频率 r= √r2 = √O
B = q2+2qr
AB = 2pq
O = r2
p=1-q-r=1-(q+r)=1- √(q+r)2 =1- √ q2+2qr+ r2=1- √ B+ O q=1-p-r=1-(p+r)=1- √(p+r) 2
如果是遗传平衡的群体, 它应当符合:p2+2pq+q2=1, p2=0.49 2pq=0.42 q2=0.09 即 0.49+0.42+0.09=1

群体遗传学知识点归纳

群体遗传学知识点归纳

群体遗传学知识点归纳I.群体基本概念群体:同一物种生活在某一地区内的、能够相互交配的个体群群体遗传学:研究群体中基因的分布及逐代传递中维持和改变基因频率、基因型频率的因素基因库(gene pool):一个群体所具有的全部遗传信息基因频率:某一等位基因占该基因座位全部等位基因的比率基因型频率:某一基因型的所有个体在所研究群体中所占的比例,由基因型频率推算等位基因频率。

群体的遗传结构:基因库中各种基因的频率,以及由不同交配类型所带来的各种基因型在数量上的分布观察基因型:携带相同罕见基因型个体的表型有何不同基因型对应于某种表型:疾病状态、治疗效应、不利事件的可能性群体遗传学调查的核心问题:群体的基因频率为何变化,决定因素有哪些,这些因素怎样作用于群体并导致群体基因频率发生变化。

II.Hardy- Weinberg遗传平衡定律1.Hardy- Weinberg遗传平衡定律·符合条件:大群体;随即婚配;无自然选择;无新生突变;无大规模迁移。

(实际不存在)·群体中的基因频率和基因型频率在世代传递中保持不变·数学表达式: (p q)2,即 p2(AA) 2pq(Aa) q2(aa)=1各类基因型频率推广式:(p1 p2 p3 …… pn)2基因的遗传机制本身并不影响群体中遗传变异保持的平衡机制,奠定现代群体遗传学最重要的理论基础2.Hardy- Weinberg定律的理解·基因型频率是随着基因频率的变化而变化的,群体平衡的标志是基因型频率保持不变基因频率变化了,基因型频率一定会随之变化μ基因频率不变,基因型频率也可能变化μ基因型频率若保持不变,基因频率一定不会变化·如果一个群体的基因频率和基因型频率在世代间保持不变,这个群体就被称为平衡群体。

·虽然显性基因的作用可以掩盖隐性基因的作用,但是隐性变异不会因此而逐渐消失·基因多态性:人类基因组广泛多态性使不同基因座等位基因存在多种组合,导致群体的高度遗传多样性和个体的遗传独特性。

9-群体遗传学

9-群体遗传学

2 群体样本的检验:对抽样调查的结果进行 检验,评估所调查的群体是否符合HardyWeinberg定律,评估群体调查资料的可靠 性。由于在实际中“理想群体”不存在,
所 以在应用群体调查资料之前,需要先检验 对象群体是否是统计学意义的HardyWeinberg平衡群体。
群体的Hardy-Weinberg平衡检验方法主要 用吻合度法。吻合度检验是运用检验来衡 量基因型数目的观察值与该位点上全部基 因型频率分布在符合Hardy-Weinberg平衡 时的期望值之间的吻合程度。
110为Xga(-),占36.9%,
男性:Xga=0.631 Xg=0.369
女性291 260为Xga(+),占89.3%; 31为Xga(-),占10.7%,
女性: Xg=√0.107=0.327 Xga=1-0.327=0.673
(二) 利用X2检验MN血型基因的HardyWeinberg平衡 检测了1788人的群体, M型:397人;MN型:861人;N型为530人 求得:M的基因频率为0.4628
3 适合度与选择系数 1)适合度(fitness):在一定环境条件下,某基因 型个体与其他基因型个体相比能够生存并留下 子裔的能力,又称适合值(adaptive value)。* 2) 相对生育率:一般将正常的纯合个体的适合 度定为1,为生育率正常,其它基因型与之比较 的相对值为相对生育率 (relative fertility) 。
侏儒(软骨发育不全) 108人(患者) 生育 27个孩子 457个正常同胞 生育 582个孩子, 侏儒的相对生育率: 相对生育率=(27/108)/(582/457)=0.196
3)选择系数 (selective coefficient S)
指在选择作用下适合度降低的程度。
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这说明:在没有选择作用的情况下,群体的基因频率完全由 u和v决定,即群体遗传平衡是由等位基因双向突变维持的。
如果:


u(A→a)=1×10-6,
v(a→A)=5×10-7 那么,达到平衡时, q=u/(u+v) =1×10-6/(1×10-6+5×10-7)=0.67, p= 1-q = 0.33 这表明:在两种突变频率的影响下,群体中 p(A)为0.33,q(a)为0.67。
基因 频率
A p a q AA D
基因型
Aa H aa R
p (A) = D + (1/2)H
q (a) = R + (1/2)H
这种计算基因频率的方法仅适用于共显性遗传和不完全显 性遗传,即能区分出杂合子的表型的情况。
例如:在一个1000人的中,MN血型调查 资料如下:
血型 M MN N
基因型 LMLM LMLN LNLN
三、群体的遗传组成(Genetic constitute of Population)
各种基因在群体的分布或所占的比例,称为群体的遗传组成 由于同一物种内不同群体间的遗传变异主要在于基因频率的差 异, 所以,基因频率是群体遗传组成的基本标志。
四、基因型频率和基因频率
基因型频率(Genotype frequency) 指特定基因型的个体在群体中所占的比率。 基因频率 (Allele frequency ) 指某一基因在群体出现的频率,即一种等位基因占该座位 全部等位基因的比率。 同一位点的全部等位基因的频率之和为1。
此群体显然没有达到遗传平衡状态。
LNLN :0.7
精 p0(M) 卵 p0(M)0.2 子 q0(N)0.8 0.2
子 ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ0(N) 0.8
p12(MM) 0.04 p1q1(MN)0.16
p1q1(MN)0.16 q12(NN) 0.64
p12(LM LM)+2p1q1 (LMLN )+q12(LNLN) =0.04 +0.32 +0.64 =1
这说明,一代以后,基因型频率发生了变化,达到了遗传平衡。
三、遗传平衡定律的应用
对于遗传平衡的群体,可根据遗传平衡定律的数 学表达式计算有显隐性区分的等位基因的频率。 依据遗传平衡定律计算基因频率的前提是将所研
究的人类群体近似认为达到了遗传平衡状态。
(一)AD病:
患者绝大多数是杂合子,纯合子患者罕见,可以忽略不计。 患病杂合子的频率H=2pq,由于q值很大,近于1,故H≈2p, p=1/2 H。因此,如果知道了发病率(H),就可求出致病基 因频率。 例如,已知并指症的发病率(H)为1/2000, p=(1/2)×H =(1/2)×1/2000=0.000025
P2(IAIA)+2pr(IAi)+q2(IBIB)+2qr(IBi)+r2(ii) +2pq(IAIB)=1
遗传不平衡的群体,只要符合Mardy-weinberg定律的 条件,只需经过1代,就可达到遗传平衡。 例如:在MN血型的调查群体中,
LMLM :0.1 LMLN :0.2 p(LM)=0.2 q(LN)=0.8
(二)AR病
已知白化病群体发病率为1/10000, 即:q2(aa)=1/10000, 那么,致病基因a频率 q=0.01; 正常基因A频率 p=1-0.01=0.99; 携带者(Aa)的频率2pq=2×0.01×0.99≈0.02。 这说明携带者的频率是患者的200倍, 也就是说,致病基因绝大多数存在于杂合子中。
2
Aa(2pq) AA×AA(2p3q) Aa×Aa(4p2q2) aa×Aa(2pq3)
aa(q ) AA×aa(p2q2) Aa×aa(2p3q) aa×aa(q4)
2
将子1代的婚配组合归纳,共有6种婚配类型;不同 的婚配类型的子2代中各种基因型的频率不同:
不同婚配类型的子 2 代基因型频率 子1 代 婚配类型 AA×AA AA×Aa Aa×Aa AA×aa Aa×aa aa×aa 婚配频率 p
基因频率的计算
基因型 AA Aa aa 合计 基因型数量 600 200 200 1000 基因型频率 0.60(D) 0.20(H) 0.20(R) 1.0
p(A)= (600×2+200)/1000×2 = [(600×2)/1000×2] + [ 200/1000×2] = D + (1/2)H q (a) = (200×2+200)/1000×2 = [(200×2)/1000×2] + [ 200/1000×2] = R + (1/2)H
(一).适合度
选择主要是通过增加和减少个体的适合度来影响基 因平衡。或者说,当一个群体的不同个体的适合度不同 时,选择就会发生作用。 大多数情况下,选择的作用是减少个体的适合度, 适合度为0时,个体被淘汰。通常所说的“被选择”即指 被淘汰。 适合度(fitness,f) 是指在特定的环境中,某一基 因型的个体能够生存并把他的基因传给下一代的能力, 通常用同一环境中不同个体间的相对生育率来衡量。
Aa:2p3q+2p2q2+2p2q2+2pq3 =2pq(p2+2pq+q2)= 2pq
aa:p2q2+2pq3+q4 =q2(p2+2pq+q2)=q2 即:p2(AA)+2pq(Aa)+q2(aa)=1
计算结果表明:
子2代基因型频率与子1代基因型频率完全相同,如果连 算推算后代基因频率,结果都将一致。即,就这对基因(A、 a)而言,群体中各基因型频率保持不变,每代都是 p2+2pq+q2 ,达到了平衡。 也就是说,当各基因型频率符合数学表达式 p2(AA)+2pq(Aa)+q2(aa)=1时,该群体就达到了遗传平衡。
突变和选择是影响遗传平衡的最重要因素。
一、基因突变(Gene Mutation)
基因突变是群体发生变异的根源。基因突变对于群体遗 传组成的改变有两个重要的作用: 突变本身改变了基因频率 突变为选择提供了材料。
在某一世代,基因的一个等位基因突变为另一等位基因 的频率称为突变率( mutation rate)。基因突变率通常很低, 一般用每代每一百万个基因中发生突变的次数(n)来表示, 即n×10-6/(基因· 代)。 基因突变是双向的,包括正向突变和回复突变。 回复突变率通常只有正向突变率的1/10。
2.XD病 :
女患者:XAXA(p2)、XAXa (2pq) 男患者:XAY (p) 男性发病率与女性发病率的比:
p p 1 1 1 1 ----=----- = ---- = --- = --≈ -- 2pq+p2 p(2q+p) 2(1-p)+p 2-2p+p 2-p 2
已知遗传性肾炎男性发病率为1/10000, 即:p=1/10000, 女性发病率:2pq+p2 =2×1/10000=2/10000。
A
(q)
卵 A(p) 子 a(q)
AA (p2) Aa (pq)
Aa (pq) aa (q2)
p2(AA)+2pq(Aa)+q2(aa)=1
子1代群体不同基因型个体间随机婚配,各 种婚配类型及其频率 :
表 13-3 子 1 代随机婚配的组合方式 男性群体 女 AA(p2) 性 Aa(2pq) 群 aa(q2) 体 AA(p ) AA×AA(p4) Aa×AA(2p3q) aa×Aa(p2q2)
4
子 2 代基因型频率 AA p
4
Aa - 2p3q 2pq
2 2
aa - - pq - 2pq3 q
4 2 2
4p3q 4p q
2 2
2p3 q pq - - -
2 2
2 p2q2 4pq3 q
4
2 p 2 q2 2pq3 -
计算子2代基因型频率: AA:p4+2p3q+p2q2
=p2(p2+2pq+q2)= p2

二、选择(selection)
选择:基因型的差别导致生存能力和生育能力的差别, 选择就是保留有利基因型的个体、淘汰不利基因型的个体。经 过选择,群体中适应性强的基因型个体增加,不适应的个体逐 渐减少乃至消失。
选择包括自然选择(natural selection)和人工选择 (artificial selection),选择是导致基因频率变化的重要 因素。 在人类,导致基因频率变化的主要选择因素是自然选择。
群体遗传学
Population Genetics
群体遗传学 (population genetics)
研究群体的遗传组成及其变化规律的学科。 即:研究群体中基因的分布、基因频率和基因型 频率的维持和变化的科学。 在医学领域,群体遗传学是要探讨遗传病的 发病频率、遗传方式、致病基因频率及其变化的 规律,以了解遗传病在群体中的发生和分布的规 律,为预防、监测和治疗遗传病提供重要的信息 和措施。因此又称之为:
在等位基因A(p)和a(q)中, 设A→a的突变率为μ,a→A的回复突变率为ν, 每一代中:A→a比率为pμ=(1-q)μ a→A比率为qν 若(1-q)μ>qν,则q增加; 若(1-q)μ<qν,则p增加; 若(1-q)μ=qν,则p、q保持不变,群体达到遗传平衡。 在遗传平衡时: (1-q)μ=qν 化简: μ-qμ=qν μ=qv+qu =q(u+v) q= μ/(u+ν), p= v/(u+v)
(p+q)2=
p2(AA)+2pq(Aa)+q2(aa)=1 达到遗传平衡时:
D = p2
H = 2pq R = q2
如果某一位点有3个等位基因,将有6种不同的基因 型,达到遗传平衡时各基因型的频率应为:
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