猪T细胞受体_链的基因结构及其多样性分析

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t细胞淋巴瘤tcrγ基因重排特征的分析及检测方法优化

Ｔ细胞淋巴瘤ＴＣＲＴ基Ｎ重排特征分析及检测方法的优化摘要研究背景与目的淋巴瘤在组织和细胞形态学方面与高度反应增生性淋巴组织的鉴别诊断十分困难，容易造成误诊。

淋巴瘤病理诊断是临床病理工作的难题之一。

目前国内主要依靠以形态学为主、免疫组化为辅的诊断手段。

随着分子生物学的发展，从基因水平研究和分析诊断疾病的技术不断出现并且日趋成熟，为淋巴瘤诊断提供了有效工具。

淋巴瘤是由单克隆淋巴细胞增生所致，而反应增生性淋巴组织则来自于多克隆淋巴细胞，这是二者的重要区别。

编码免疫球蛋白（Ｉｇ）或Ｔ细胞受体（ＴＣＲ）的基因经过重排以后，不同克隆之间的重排基因互不相同，因此，基因重排对淋巴瘤的诊断具有特异性价值。

以ＰＣＲ技术为基础的方法以其简便、高效、廉价及适用面广而在淋巴瘤基因重排研究方面越来越受重视。

但不同研究文献中所采用的引物、ＰＣＲ条件、ＰＣＲ产物检测方法等都不尽相同，结果也有差异。

因此，难以找到适于常规临床病理诊断之用的标准程序。

Ｊｕｒｋａｔ细胞是Ｔ细胞淋巴瘤基因重排研究中常用的阳性对照细胞，但有关Ｊｕｒｋａｔ细胞基因重排的详细情况也未见报道。

假基因是Ｉｇ和ＴＣＲ胚系ＤＮＡ中常见的基因，有关假基因参与重排的情况以及在设计引物方面是否应将假基因包括在内也未见有关研究报道。

本实验以ＴＣＲ基因重排为研究对象，通过优化引物选择、ＰＣＲ条件及ＰＣＲ产物的检测方法等，分析Ｔ细胞淋巴瘤基因重排检测的最佳方法。

同时，分析ＴＣＲ基因重排的特点，为进一步研究ＴＣＲ基因重排提供理论和技术支持。

方法１以ＴＣＲｙ基因重排为研究对象，选用通用引物ＴＶＧ、ＶｖＩ及ＴＣＲ７家族特异性引物为工具。

用正交设计实验优化ⅥＩ引物的ＰＣＲ条件。

另选一对ＴＣＲ［ｊ通用引物作为ＴＣＲｙ引物的补充和比较。

２利用ＰＣＲ和测序研究Ｊｕｒｋａｔ细胞基因重排情况，分析ＴＣＲ基因重排的基本特点。

３ＰＣＲ产物检测方法①利用ＴＣＲ通用引物检测淋巴瘤克隆性基因重排阳性率，分别用琼脂糖电泳和ＳＳＣＰ分析ＰＣＲ产物；②将ＰＣＲ产物分别进行直接测序和克隆后测序，分析ＴＣＲ基因重排的特点及探索测序方法在基因重排检测中的应用；⑧分析ＰＣＲ产物中ＤＮＡ的克隆数与ＳＳＣＰ中条带数目的关系。

tcrα基因结构

tcrα基因结构TCR α基因是编码T细胞受体的基因之一，它在免疫系统中起着重要的作用。

本文将介绍TCR α基因的结构以及其功能。

TCR α基因位于人类染色体14上，属于V(D)J基因家族。

该基因由多个基因片段组成，包括变异段（V）、多变区（D）、连接区（J）和常变区（C）等部分。

TCR α基因的结构与其他免疫受体基因相似，表现出高度多样性和可变性。

变异段（V）是TCR α基因中最多样化的部分，它包含多个基因片段，每个片段都可以在DNA重新排列时选择一个进行连接，从而产生不同的TCR α链变异体。

每个变异段都编码一个氨基酸序列的一部分，这些氨基酸序列随后组合成TCR α链的变异区域。

在人类中，有约70个V片段可供选择。

多变区（D）是TCR α基因的第二个片段，它在V和J之间，类似于变异段，多变区也参与产生TCR α链的变异性。

连接区（J）位于多变区之后，它也是由多个片段组成，C端连接着常变区。

常变区（C）是TCR α链的最后一个片段，它编码TCR α链的C 端。

TCR α链的结构是由这些片段的连接和组合而成的。

在T细胞发育的早期阶段，TCR α基因会发生基因重组，将这些片段重新排列连接，形成TCR α链的基因。

每个T细胞都会随机生成一个TCR α链，使得每个T细胞都有可能表达不同的TCR α链。

TCR α链与TCR β链共同组合形成完整的TCR受体。

TCR α链和TCR β链连接在一起，它们的胞内部分与胞外部分相连。

胞外部分是最为多样的部分，其中包含着TCR受体与抗原结合的区域。

当TCR受体与抗原结合时，它们会激活T细胞，并启动免疫应答。

TCR α基因的结构和多样性使得T细胞能够识别并应答不同种类的抗原。

通过重新排列和重组，每个T细胞都能够产生一种独特的TCR α链，从而扩展了T细胞的抗原特异性和功能多样性。

TCR α基因的多样性是人体免疫应答的重要基础，它使得T细胞能够应对各种病原体和异常细胞，对免疫系统的正常功能发挥至关重要的作用。

基因编辑技术在猪分子育种中的研究进展及发展趋势

基因编辑技术在猪分子育种中的研究进展及发展趋势目录一、内容概览 (2)二、基因编辑技术简介 (2)1. 基因编辑技术的定义 (3)2. 基因编辑技术的发展历程 (4)三、基因编辑技术在猪分子育种中的应用 (5)1. 提高猪的生长速度和饲料转化率 (6)2. 改善猪的肉质品质 (7)3. 抗病性转基因猪的培育 (9)4. 生物安全性和福利性方面的考虑 (9)四、基因编辑技术在猪分子育种中的研究进展 (11)1. 基因编辑技术的关键技术突破 (12)2. 基因编辑技术在猪育种中的应用案例 (13)3. 国内外研究进展和应用比较 (14)五、基因编辑技术在猪分子育种中的发展趋势 (15)1. 技术优化和创新 (16)2. 跨学科合作的加强 (17)3. 长期效益和可持续发展的探讨 (19)4. 道德和法律层面的挑战与对策 (20)六、结论 (22)一、内容概览本文档主要探讨基因编辑技术在猪分子育种中的研究进展及发展趋势。

文章首先概述当前猪分子育种的重要性，并介绍基因编辑技术的基本概念及其在农业领域中的应用。

将详细介绍基因编辑技术在猪分子育种中的研究现状，包括已有研究成果、技术应用中遇到的挑战及其解决方案。

在此基础上，文章进一步探讨基因编辑技术的发展趋势，预测未来基因编辑技术在猪分子育种中的应用前景，并讨论其对畜牧业乃至整个农业产业可能带来的变革。

文章还将强调在技术进步的同时，如何合理规范和利用基因编辑技术，确保其在猪分子育种中的可持续发展。

本概览旨在提供一个关于基因编辑技术在猪分子育种中研究进展及发展趋势的全面概述，为后续深入探讨和分析提供基础。

二、基因编辑技术简介基因编辑技术是一种通过对生物体的基因进行精确地添加、删除或替换等操作，从而实现对生物体特性的改变和优化的技术手段。

CRISPRCas9系统作为一种高效、简便的基因编辑工具，已经在多领域取得了重要突破，尤其在猪分子育种中展现出巨大的应用潜力。

TCR的研究分析报告

TCR的研究分析报告一、引言T细胞受体（TCR）是T细胞识别抗原并被激活的关键分子。

TCR在T 细胞的发育、活化、增殖和凋亡等过程中起着至关重要的作用。

对TCR进行深入研究，有助于我们更深入地理解T细胞的生物学特性，并对免疫疾病的治疗和预防提供理论支持。

二、TCR的结构与功能TCR是由α和β两条多肽链组成的复合体，其主要功能是识别并结合抗原提呈的肽段。

当TCR与抗原肽段结合后，可以触发一系列的信号转导通路，最终导致T细胞的活化、增殖和分化。

三、TCR的研究方法目前，用于研究TCR的主要方法包括：基因组学、蛋白质组学、结构生物学、生物信息学等。

通过这些方法，我们可以了解TCR的结构与功能，以及其在免疫应答中的作用。

四、研究分析通过对大量文献的梳理，我们发现TCR的研究主要集中在以下几个方面：1）TCR的结构与功能关系；2）TCR在免疫应答中的调控机制；3）TCR在免疫疾病中的作用；4）基于TCR的免疫疗法开发。

在结构与功能关系方面，研究者们利用X射线晶体衍射和冷冻电镜等技术，解析了TCR的结构，并揭示了其与抗原肽段的结合模式。

这些发现有助于我们理解TCR的识别和结合抗原的机制，为基于TCR的药物设计和开发提供了理论基础。

在免疫应答的调控方面，研究者们通过基因敲除、转基因等技术，研究了TCR在T细胞活化、增殖、凋亡等过程中的作用。

这些研究揭示了TCR在免疫应答中的核心地位，以及其在调节免疫应答强度和持续时间方面的重要作用。

在免疫疾病中的作用方面，研究者们发现了一些与自身免疫性疾病、感染性疾病等相关的TCR突变。

这些发现为理解这些疾病的发病机制提供了新的视角，同时也为开发基于TCR的治疗方法提供了新的思路。

在基于TCR的免疫疗法开发方面，研究者们正在尝试利用TCR的特性，开发新的治疗方法。

例如，通过基因工程技术将TCR改造为能特异性识别肿瘤抗原的T细胞，用于治疗肿瘤；或者利用TCR的结构和功能特性，开发新的疫苗设计方法。

猪T细胞受体γ链基因的克隆及生物信息学分析

能奠定了基础。
［键词］猪Ｔ细胞受体链；因克隆；关基生物信息学；构预测结
［中图分类号］Ｑ８７
［文献标识码］Ａ
［文章编号］１０－０２２１） — ２７００９００（０００２－５ｏ２
ＣｌｎｎａｄｏｉｇｎＢｉｉｆｒａｉｎｏｎｏｍｔＡｎｌｓｓｆｏｃｎＴＣｅｌｏａｙｉｏＰｒｉｅｌＲｅｅｔｒｃｐｏ
ｓｕｔｒｎｕｃｉｎｏｏｃｎｅｌｒｃｐｏ．Ｍｅｈｄ＆Ｒｅｕｔ：ＢａｅｎｔｅｇｎｅｕｎｅｏＴＲ－／ｔｃｕｅａｄｆｎｔｆｐｒｉｅＴｃｌｅｅｔｒｒｏｔｏｓｓｌｓｓｄｏｈｅｅｓｑｅｃｆｐＣ￣ｆｏｔｅｅＢｎｄｔｂｓ，ｒｍＧｎａｋａａａｅｈｐＣＴＲ－ｇｎｗｓｌｎｄｙｅｅｓｔａｓｒｔｎ— ｏｙｒｓｃａｎｒａｔｎｆｏ７ｅｅａｃｏｅｂｒｖｒｅｒｎｃｐｉｉｏｐｌｍｅａｅｈｉｅｃｉｒｍｏ
ＧａｍｍａＣｈｉｎａｎＧｅｅ
ＬｎＳｅｇＡＮＧＹｏ苦ｘｉｎ，ＺＮＧＳｕｎ，ＪＨＧＺｉＺｏｇＩＷａ－ｈｎ，Ｆｎ＿ａｇＥｈａｇＩｈ— ｈｎ
ＫｅａｏａｏｙｏｔｒｎｒａａｉｌｇｆＧａｓｒｖｎｅＫｅａｏａｏｙｏｔｒａｕｌａｔｆＭｉ — ｙＬｂｒｔｒｆＶｅｅａｙＰｒｓｔｏｙｏｎｕＰｏｉｃ，ｉｏｙＬｂｒｔｒｆＶｅｅｎｒＰｂｉＨｅｌｏｎｉｙｃｈｉｔｆＡｇｉｕｔｒ，ＳａｅＫｅａｏａｏｆＶｅｅｎｒｉｌｇｃｌＢｏｏ，ＬｎｈｕＶｅｅｉａｓａｃｎｔｕｅｓｒｏｒｌｅｙｃｕｔｔｙＬｂｒｔｒｏｔｒａｙＥｔｏｉａｉｌｇｙｉｏｙａｚｏｔｒｒＲｅｅｒｈＩｓｉｔ，ｎｙｔ

猪肉质性状基因遗传标记的研究进展

目录1 猪肉质性状的主效基因 (1)1.1 猪氟烷基因 (1)1.2 猪酸肉基因 (1)1.3 单磷酸腺苷蛋白激酶γ3亚基基因 (2)2 猪肉质性状的主要候选基因 (2)2.1 脂肪酸结合蛋白基因 (3)2.2 激素敏感脂肪酶基因 (3)2.3 酯蛋白脂肪酶基因 (3)2.4 MyoD 基因家族 (3)2.5 钙蛋白酶抑制蛋白基因 (4)2.6 黑素皮质素受体 (4)2.7 肥胖基因 (4)2.8 肌生成抑制蛋白基因 (5)2.9 ACSL基因 (5)2.10 过氧化物酶体增殖物活化受体基因 (5)2.11编码腺苷－磷酸脱氨酶基因 (5)2.12 固醇调节元件结合蛋白1基因 (5)3 基因遗传标记的研究与应用策略 (6)3.1 候选基因分析( candidate genes approach) (6)3.2 标记辅助选择( marker assisted selection ，MAS) (6)3.3 标记辅助渗入( marker assisted introgression ，MAI) (7)4 结语与展望 (7)参考文献 (8)猪肉质性状基因遗传标记的研究进展随着人民生活水平的提高，消费者对于食品品质认识的提高促使肉品加工业和零售业更加重视肉品的质量。

分子生物学技术的发展也让研究者认识到基于DNA标识的选育是最有效的选育手段。

如果相应性状不能用一定的标记进行识别就得将动物养育到正常屠宰月龄屠宰后才能检测分析相应性状，费时费力且成本高。

如果发现某一DNA标记（如多态性）和目标性状有联系就可以对年幼的动物进行基因型研究而不必等到屠宰时，并且可以敲除对性状有害的基因改良品种性状。

分子标记选育技术要能够持续地用于动物育种必须在我们发现使用现有的标记已经不能满足要求的情况下能够发现新的标记。

经过长时间建立的数据库是发现新的标记和检测候选基因的宝贵资源。

因此与肉质相关基因的研究显得尤为重要。

近年来，采用分子生物学技术对影响猪肉质性状的主效基因、候选基因及QTL定位已取得迅猛发展，下面就有关猪肉质性状基因及QTL定位的研究进展作扼要概括。

猪FcγR ⅡB多种剪接异构体的基因克隆与序列分析

ｓｑｅｃｌｎｎａｎｌｚｄｗｉＡｅｕｎｅａｉｍｅｔｓａａｙｅｔＤＮＭＡｓｆｒａｋｇ．ｈｔｃｕｅｏｅｓｑｅｃｓｈｒｃｅｉｄｗｔＢｎｉｅｓｆａｅｇＷｈＮｏｔｅｐｃａｅＴｅｓｕｔｒｆｔｅｎｅＷａｃａａｔｒｅｉＣＳｏｌｏｗｒｗａｒｈｕｚｈｎｔ
ＡｇｉｕｔｒｌＵｎｖｒｉＺｈｎｚｏ５０２，ｉｒｃｌｕａｉｅｓｔｙ，ｅｇｈｕ４００Ｃｈｎａ
［ｂｔｃ］ＯｂｅｔｅＴｖｓｇｔｔｏｍｏｈｍｓｆｏｉｃＲＨＢｇｎｒｅｙ￣ｅｎｔｅｐｉｎ．ｔｏｓＲ－ＣａＡｓｒｔａｊｃｉ：ｏｉｅｔａｅｐｌｒｉｒｎＦ７ｅｅｔｂｔａｖｌｉＭｅｄ：ＴＰＲｗｓｖｎｉｅｈｙｐｓｏｐｃｅａｄｒｉｓｃｇｈ
ＣｏｉｇａｄａａｙｉｏｌｐｅｐｒｉｅＦＴ ⅡＢｔａｓｒｔａｉｎｓｌｎｎｎｎｌｓｆｓｍｕｔｌｏｃｃＲｉｎｒｎｃｉｒｔｐｖａ
ＺＡｉａ，ＨＮＧＹ— Ｎ删Ｘｉｏａ一，ＨＮＧＺｉＹａＤＵＮ－ｈｎ，ＨＮＧＪ— ｉＺＵｏｇＨｕ，Ｉ学ＡＣＩＺＡｈ— ｕｎ，ＡＥｒｅＺＡｉ，ＨＯＹｎ－ｉＸＡＺＸｎ，Ｕ
ｐｒｒｅｓｇａｐｉｏｐｍｅｅｉｅｃｏｄｇｔｔｑｅｃｆｕｈｈｄｐｒｎｃＲＩＢ（Ｑ２０４．ｕｌｔｅａｄａｉｃｅｏｍｄｕｉｒｆｒｒｄｓｎｄａｃｒｉｅｓｕｎｅｏｂｓｅｏｉＦ７Ｄ０６６）ＮｃｏｄｎｍｎａｉｆｎａｉｓｇｎｏｈｅｐｃｅＩｅｉｏｄ

tcr测试方法

tcr测试方法TCR测试方法TCR（T-cell receptor）测试方法是一种用于研究和分析T细胞受体的技术。

T细胞受体是T细胞表面的一种蛋白质，它在机体的免疫应答中起着重要的作用。

TCR测试方法通过分析T细胞受体的结构和功能，可以帮助科研人员深入了解T细胞的免疫应答机制，以及相关疾病的发生和发展过程。

一、TCR测试的原理TCR测试方法主要包括克隆、测序和功能分析等步骤。

首先，科研人员从体内或外源性样本中获取T细胞，然后通过克隆技术将T细胞分离为单个细胞。

接下来，利用PCR（聚合酶链反应）技术扩增T细胞受体基因的DNA片段，并进行测序分析。

通过测序数据，可以确定T细胞受体的基因序列和变异情况。

最后，科研人员可以利用功能分析方法，如细胞培养和功能实验，评估T细胞受体的功能和效应。

二、TCR测试的应用领域TCR测试方法在免疫学、肿瘤学和传染病学等领域具有广泛的应用价值。

在免疫学研究中，科研人员可以利用TCR测试方法深入研究T细胞的抗原识别和免疫应答机制，从而揭示免疫系统的调控机制和疾病发生的原因。

在肿瘤学领域，TCR测试方法可以用于研究肿瘤免疫逃逸机制，并开发新的免疫治疗策略。

此外，TCR测试方法还可以用于传染病的诊断和治疗，如艾滋病和乙肝等病毒感染。

三、TCR测试的优势和挑战与传统的免疫学方法相比，TCR测试方法具有一些明显的优势。

首先，TCR测试方法可以通过高通量测序技术，同时分析大量的T细胞受体序列，从而获得更全面和准确的信息。

其次，TCR测试方法可以直接从体内样本中获取T细胞，并进行分析，避免了对动物模型的依赖。

然而，TCR测试方法也面临一些挑战。

例如，T细胞受体的高度多样性和变异性使得数据分析变得复杂，需要开发适用的分析工具和算法。

此外，TCR测试方法在样本处理、数据分析和结果解释等方面也存在一定的技术难题。

四、TCR测试在个体化医疗中的应用个体化医疗是近年来兴起的一种医疗模式，旨在根据个体的基因组信息和疾病特征，为患者提供定制化的治疗方案。

动物遗传学习题

《动物遗传学》复习思考题单项选择1．下列关于平衡群体内（一对常染色体基因仅三种基因型时）基因型频率表达正确的是（ B ）。

A. D=0 H=0.6 R=0.2B. D=0.25 H=0.75 R=0C. D=0.3 H=0.1 R=0.7D. D=0.20 H=0.42 R=0.352．（ B ）是酵母人工染色体的英文简写。

（第11章，P298）A.YCAB. YACC.PCRD.SV403．连锁互换遗传中干涉率加并发系数等于（ A ）。

（第5章，131）A. 1B. 10C. 100D. 以上都不对4．编码主要组织相容性系统的基因群称为（ B ）。

（第8章，P212）A.MHSB.MHCC. mHSD. mHC5．下面的（ D ）可以导致氨基酸的替换。

（第4章，P109）A.无义突变B. 缺失C.单体D.错义突变6．编码次要组织相容性系统的基因群称为（ D ）。

（第8章，P212）A.MHSB.MHCC. mHSD. mHC7．真核生物中（ C ）是蛋白质合成装配的场所。

（第2章，P15）A.模板链B.线粒体C.核糖体D.中心体8．编码次要组织相容性系统的基因群称为（ D ）。

（第8章，P212）A.MHSB.MHCC. mHSD. mHC9．猪的阴囊疝遗传表现就是（ C ）作用。

（第5章，P123）A.互补B.上位C.重迭D.返祖10.巴氏小体是一个失活的（ B ）染色体。

（第10章，P266）A.ZB.XC.WD.Y11．羊角的遗传方式属于（ C ）遗传。

A.常染色体B.伴性C.从性D.无法确定12. DNA复制的延伸过程就是（ C ）的前移过程。

（第3章，P41）A.5’→3’B.3’→ 5’C.复制叉D.前导链13. 小麦的粒色是一数量性状，若受R1和R2两对基因控制，R1R1R2R2×r1r1r2r2的F2代群体中，粒色类似F1的个体出现的可能机率是（ C ）。

A.1/16B.4/16C.6/16D.8/1614．一般来讲，没有特别说明时，控制伴性性状的基因位于（ A ）。

家猪遗传学体系构建

家猪遗传学体系构建一、简介家猪（学名：Sus scrofa domesticus）是经过人类长期驯化的一种动物，在人类社会中被广泛饲养，为重要的畜牧业和经济动物。

家猪的遗传学体系构建是一个重要的研究领域，通过对家猪基因组的分析和研究，可以更好地理解家猪的遗传特性，为家猪的遗传改良、疾病防治等工作提供科学依据。

二、家猪的遗传学特点1.基因组结构：家猪的基因组包含38对染色体，其中包含大量的遗传信息。

通过对家猪基因组的测序和分析，可以揭示家猪的遗传特点和进化历史。

2.遗传多样性：家猪在长期的人类驯化过程中，经历了人工选择和人为干预，导致家猪的遗传多样性逐渐丧失。

因此，保护和利用家猪的遗传资源成为当前遗传学研究的重要课题。

3.遗传性状：家猪的遗传性状包括生长性能、肉质品质、疾病抗性等，这些性状对于家猪的育种和生产具有重要意义。

三、建立家猪的遗传学体系1.家猪基因组测序：通过对家猪基因组进行测序和分析，可以全面了解家猪的遗传信息和基因组结构，为后续研究奠定基础。

2.家猪遗传地图构建：建立家猪的遗传地图，揭示不同基因的位置和遗传距离，为家猪遗传育种提供参考依据。

3.家猪遗传图谱绘制：通过对家猪遗传图谱的绘制，可以了解家猪的遗传多样性、遗传结构和亲缘关系，为家猪资源保护和利用提供科学指导。

四、家猪遗传改良1.选择育种：通过对家猪遗传性状的分析和评价，选育出适应生产需要的优良品种，提高家猪的生产性能和经济效益。

2.遗传改良技术：利用现代生物技术手段，如基因编辑、克隆等技术，对家猪的遗传特性进行改良，提高其抗病能力、生长速度和肉质品质。

3.繁殖管理：通过优化繁殖管理措施，促进家猪的遗传传递，保持良好的遗传特性和遗传稳定性。

五、家猪遗传疾病防治1.遗传疾病筛查：通过对家猪的遗传疾病进行筛查和检测，及时发现和排除患病个体，减少遗传疾病的传播和影响。

2.遗传疾病防控技术：利用遗传学知识和技术手段，研发和应用遗传疾病的防控技术，减少疾病对家猪生产的影响。

上海市某腹泻猪群猪流行性腹泻病毒检测及全基因序列分析

·研究论文·Chinese Journal of Animal Infectious Diseases中国动物传染病学报上海市某腹泻猪群猪流行性腹泻病毒检测及全基因序列分析摘要：猪流行性腹泻（PED ）是由猪流行性腹泻病毒（PEDV ）感染引起的仔猪严重腹泻性疾病，传播快，发病急，死亡率高，给我国养猪业造成巨大损失。

2021年10月上海某猪场产房仔猪发生腹泻，发病率为30%~50%，死亡率为20%~30%，猪群之前进行过疫苗免疫。

粪便样本经猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV ）、猪轮状病毒（RV ）荧光RT-PCR 检测，结果显示：PEDV 检测为阳性，TGEV 和RV 检测均为阴性。

经全基因测序后进行系统进化分析，结果显示：全基因序列属于G Ⅱ-c 亚群，S 基因序列属于G Ⅱ-b 亚群，与目前的经典疫苗株CV777和变异株AJ1102相比，CV777的全基因和S 基因都属于G Ⅰ-b 群，AJ1102的全基因和S 基因都属于G Ⅱ-b 亚群，研究结果表明新基因型的PEDV 已在上海地区流行，而传统疫苗株无法提供好的免疫效果，提示新的防控策略的制定和有针对性的疫苗的生产和使用，对于预防PEDV 感染和流行有重要意义。

关键词：猪流行性腹泻病毒；系统进化；S 基因中图分类号：S852.65文献标志码：A文章编号：1674-6422（2024）01-0175-07Detection and Complete Genomic Sequence Analysis of Porcine Epidemic DiarrheaVirus from a Diarrheal Pig Herd in ShanghaiKANG Longshan 1,2, YU Huiru 2, YANG Dequan 2, LI Xin 2, SHEN Haixiao 2, YANG Xianchao 2,WANG Jian 2, XU Lina 1, GE Feifei 2(1. College of Life Science and Food Engineering, Hebei University of Engineering, Handan 056009, China; 2. Shanghai Animal DiseasePrevention and Control Center, Shanghai 201103, China)收稿日期：2021-12-07基金项目：上海市科委自然科学基金（2021（04713））作者简介：康龙山，男，硕士,主要从事动物疫病分子流行病学研究与疫苗研制通信作者：葛菲菲，E-mail：*********************Abstract: Porcine epidemic diarrhea (PED) is a serious diarrheal disease of piglets caused by Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) infection. In October 2021, diarrhea occurred in piglets in the delivery room of a pig farm in Shanghai with the incidence rate of 30%-50% and mortality rate of 20%-30%. The pig herds had been vaccinated before. Fecal samples were examined by real-time RT-PCR for Porcine epidemic diarrhea virus, Transmissible gastroenteritis virus (TGEV), and Porcine rotavirus (RV). The results showed positive for PEDV and negative for TGEV and RV . Phylogenetic analysis of the whole genomic sequence showed that it belonged to the GII-c subgroup and the S gene sequence belonged to the GII-b subgroup. As a comparison, the whole genome and S gene of CV777 belonged to the GI-a subgroup, and the whole genome and S gene of AJ1102 belonged to the GII-b subgroup. These results showed that a new genotype of PEDV had been prevalent in Shanghai and commercial vaccine strains did not provide complete protection due to genetic variation. Key words: Porcine epidemic diarrhea virus; phylogenetic analysis; genome; S gene2024,32(1):175-181康龙山1,2，于慧茹2，杨德全2，李鑫2，沈海潇2，杨显超2，王建2，徐丽娜1，葛菲菲2（1.河北工程大学生命科学与食品工程学院，邯郸056009；2.上海市动物疫病预防控制中心，上海201103）· 176 ·中国动物传染病学报2024年2月猪流行性腹泻（Porcine epidemic diarrhea, PED）是由猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV）引起的一种急性接触性传染病，主要引起仔猪发病，感染部位在小肠。

T细胞结构讲解

CDR区功能与结构
1. CDR区的功能特征
CDR区是TCR中与抗原结合相关的部位，它包括CDR1、CDR2和CDR3三个区域。其中，CDR3是最为可变的区域，也是最为重要的抗原结合区域。CDR区的主要功能是识别和结合抗原，从而触发T细胞免疫反应。
2. CDR区的结构特征
CDR区的结构与其功能密切相关。它通常由多个α-螺旋和β-折叠片段构成，具有高度可变性和特异性。CDR3区的结构通常较为复杂，其长度和氨基酸序列常常不同，因此具有较高的结构多样性和抗原特异性。
TCR基因重排及CDR3序列多样性
需要探讨的问题可以包括：
1. T细胞克隆的多样性：由于TCR基因的随机重排，T细胞克隆在表位结合特异性上表现出极高的多样性。同时，由于其他影响因素，如T细胞接触到的抗原种类和数量、T细胞发育过程中多能性失活等，T细胞克隆也呈现出一定的选择性和限制性。
2. CDR3序列的结构和功能：CDR3是TCR中最变异、最特异的一段区域，也是T细胞特异性检测的主要依据之一。CDR3序列的长度、氨基酸组成和空间构型均对TCR的特异性和亲和力产生影响，同时是T细胞抗原特异性识别和细胞信号转导的重要结构。
小胖作品
TCR修饰及功能调节
1.信号肽修饰：TCR的信号肽是TCR主链的一部分，通过翻译后修饰可影响TCR信号传导，如糖基化、磷酸化等。
2.附加分子修饰：TCR与细胞内和细胞外信号通路中的多种分子相互作用，这些附加分子的修饰可影响TCR功能的转换和信号传递。如糖基化修饰、脂肪酰化修饰、磷酸化修饰等。
3.分子控制：分子控制通过分子内和分子间作用的方式调节TCR的结构和功能。通过分子控制，可以使TCR的结构更加适合于与抗原结合。如糖基化、磷酸化等。
4.信号通路：TCR的信号通路是调节T细胞活化和免疫应答的重要机制。信号通路中包含的蛋白质、酶和信号介质等被严密调控，因此对TCR功能的调节具有重要作用。如钙离子通路、PI3K-Akt通路等。

猪的参考基因组-概述说明以及解释

猪的参考基因组-概述说明以及解释1.引言1.1 概述概述部分的内容应该主要介绍猪的参考基因组的背景和意义，涵盖猪基因组研究的重要性以及对于猪类进化和优良性状选育的意义。

猪是人类重要的畜牧动物之一，具有重要的经济和科学研究价值。

研究猪的基因组是深入了解猪的遗传特征、分子机制及其与人类疾病之间关联的重要途径。

猪的参考基因组是指经过测序和组装后得到的一组基因组序列，它是研究猪的遗传特征、功能基因及其表达调控的基准。

参考基因组是研究基因组结构和功能的核心工具之一。

猪的参考基因组的完成对于猪基因组研究具有重要意义。

首先，猪的参考基因组可以为研究猪的基因组结构、功能和进化提供重要参考和支持，加深我们对猪基因组的认识。

其次，猪的参考基因组可以为猪的遗传改良和优良性状选育提供依据。

通过对猪的基因组进行研究，可以挖掘出与猪育种相关的基因和遗传变异，为猪的选育和提高生产力提供科学依据。

此外，猪作为人类的重要食物来源之一，研究猪的基因组还可以为改进猪的肉质品质和生产性能提供理论基础。

随着高通量测序技术的发展和降低成本，猪的参考基因组研究已经取得了显著进展。

然而，猪基因组研究仍然面临一些挑战，例如基因组组装的精度和完整性、基因功能的解读、整合和应用等方面。

未来，我们需要进一步提高猪的参考基因组的质量和完整性，加强研究基因组与性状之间的关联，探索更多的研究方法和技术手段，为研究猪的基因组提供更广阔的视野和研究空间。

综上所述，猪的参考基因组的研究具有重要的科学和实践意义。

深入了解猪基因组可以为猪的遗传改良和选育提供科学依据，进一步提高猪的生产性能和经济效益。

猪基因组研究的发展前景广阔，但同时也面临一系列的挑战和未来发展方向，需要通过持续的努力和创新来推动研究的进展。

最后，猪的参考基因组的完善将为人类对于猪类生物学特性和基因功能的理解提供重要基础，促进畜牧业的可持续发展和人类健康的改善。

1.2 文章结构文章结构部分的内容可以包括以下内容：文章结构部分旨在介绍本文的整体结构和各个章节的内容安排。

基于转录组学探究猪基因表达特征及其调控网络

基于转录组学探究猪基因表达特征及其调控网络基于转录组学探究猪基因表达特征及其调控网络转录组学是一种研究细胞或组织中所有基因表达情况的技术，通过对RNA分子的高通量测序，可以全面地了解基因表达的特征，并揭示基因间相互调控的网络关系。

猪是一种重要的经济动物，研究其基因表达特征及其调控网络对于改良猪的性状以及解析通过基因调控达到的外显性特征起着重要的作用。

首先，猪的基因表达特征具有一定的组织特异性。

不同组织中基因的表达量和差异表达基因的种类都会有所不同。

通过转录组学的方法，可以发现一些特定组织中高表达的基因，从而揭示这些基因对于组织功能的重要性。

例如，猪心脏中高表达的基因与心脏肌肉的收缩和舒张密切相关。

其次，猪的基因表达特征在发育过程中也会发生变化。

转录组学的研究揭示了胚胎发育过程中基因表达的动态变化，从受精卵到胚胎发育各个阶段，不同基因的表达水平也会发生变化。

这些变化反映了基因在胚胎发育过程中的调控网络，同时也为研究胚胎发育提供了重要的基础数据。

另外，猪基因表达特征与疾病发生发展密切相关。

一些疾病状态下，特定基因的表达会发生变化，通过转录组学的研究可以揭示这些变化，并寻找潜在的疾病标志物。

例如，通过对猪肺炎病毒感染猪的肺部组织进行转录组学研究，可以发现一些潜在的抗病基因以及病毒与宿主细胞间的相互作用机制。

研究猪的基因表达特征及其调控网络对于改良猪的性状具有重要意义。

传统的繁育方法很难直接选育出具有优良性状的猪，而研究基因表达特征及其调控网络可以从遗传水平揭示出与性状相关的基因，并利用这些基因进行定向的育种。

例如，通过研究肌肉组织中表达丰度较高的基因，可以找到控制瘦肉率的基因，进而通过基因编辑技术进行精确改良。

总之，基于转录组学的研究可以深入了解猪的基因表达特征及其调控网络，揭示基因间的相互作用以及对猪性状的影响，并为研究猪的生理过程、疾病发生机制以及育种提供重要的参考。

未来随着技术的不断发展，转录组学的应用将会更加广泛，为猪的研究和应用提供更多的可能性综上所述，转录组学的研究对于深入了解猪的基因表达特征及其调控网络具有重要意义。

利用猪全基因组CRISPR敲除文库筛选PDCoV感染相关的宿主因子

2、细胞因子和炎症相关基因：如IL-1β、IL-6、TNF-α等； 3、病毒受体相关基因：如APN、CD163等；
4、细胞凋亡相关基因：如CASP3、CASP8等；
5、免疫应答相关基因：如IFN-γ、 MHC-II等。
实验分析
对于上述筛选出的宿主因子，我们可以分别从以下几个方面进行讨论：
1、肠道黏膜屏障相关基因：PDCoV主要通过肠道感染，而claudin和 occludin等基因编码的蛋白是构成肠道黏膜屏障的关键成分。因此，这些基因的表达变化可能影响肠道黏膜对PDCoV的抵御能力。
方法介绍
1、构建猪全基因组CRISPR敲除首先，我们通过基因组学研究，确定了猪基因组中的所有编码基因。然后，利用CRISPR-Cas9技术，针对每个编码基因设计相应的sgRN主因子
将构建好的猪全基因组CRISPR敲除接种于猪肠道上皮细胞系，并在病毒感染后观察细胞病变。通过比较敲除基因组和未敲除基因组的细胞病变情况，初步筛选出与PDCoV感染相关的宿主因子。利用猪全基因组CRISPR敲除筛选PDCoV感染相关的宿主因子
01 引言
03 实验结果 05 参考内容
目录
02 方法介绍 04 实验分析
引言
PDCoV是一种引起仔猪腹泻的冠状病毒，严重影响了养猪业的经济效益。为了更好地了解PDCoV的感染机制，寻找有效的防控措施，本次演示利用猪全基因组CRISPR敲除，筛选与PDCoV感染相关的宿主因子。
首先，利用高通量测序技术对猪基因组进行单基因敲除性。
2、病毒抗性关键宿主因子的筛选
将构建好的CRISPR/Cas9敲除分别转染至猪细胞系，随后用病毒对转染后的细胞系进行攻毒。通过观察不同敲除克隆对病毒感染的反应，筛选出具有显著抗性的关键宿主因子。

基因片段扫描检测T细胞受体多样性运用于益艾康胶囊治疗艾滋病的效果观察

3.1.3㊀祛风解表肾络虚损,易感风邪,临床可见恶风㊁颜面水肿㊁肢节酸楚㊁咽痛等,常用蝉蜕㊁僵蚕祛风解表㊂蝉蜕,味甘㊁咸,性凉,归肺㊁肝经,具有宣散风热㊁透疹利咽㊁退翳明目㊁祛风止痉的功效㊂‘医学入门“载其主风邪头眩,皮肤瘙痒,小儿惊痫㊁夜啼㊁癫病,杀疳虫㊂李时珍云: 蝉,主疗一切风热之证,古人用身,后人用蜕㊂大抵治脏腑经络,当用蝉身;治皮肤疮疡风热,当用蝉蜕㊂ ‘得配本草“载: 多服泄元气㊂僵蚕,味辛㊁咸,性平,归肝㊁肺㊁胃经,具有祛风止痉㊁化痰散结㊁解毒利咽的功效㊂‘玉楸药解“载其可活络通经,驱风开痹㊂药理学研究[11]表明,僵蚕具有抗凝㊁降糖㊁降脂㊁抗癌等作用㊂3.1.4㊀收敛固涩肾脏亏虚,失于固摄,精微外泄,临床多用牡蛎㊁桑螵蛸收敛固涩㊂牡蛎,味咸,性微寒,归肝㊁肾经,具有平肝潜阳㊁重镇安神㊁软坚散结㊁收敛固涩的功效,煅用可增强其收涩之效㊂‘本草备要“载其为肝㊁肾血分药㊂‘海药本草“载其主男子遗精,虚劳乏损,补肾正气㊂桑螵蛸,味甘㊁咸,性平,归肝㊁肾㊁膀胱经,具有固精缩尿㊁补肾助阳的功效㊂‘绍兴本草“载其可养阴滋肾,固精㊂‘药性论“载其主男子肾衰漏精,精自出,患虚冷者能止㊂3.2㊀虫类药的运用原则糖尿病肾病的病情缠绵,病机复杂,而虫类药药性猛烈,善走窜通达,临证遣方用药当注意以下几点:①注重药物配伍㊂气虚甚者,配伍黄芪㊁党参㊁白术㊁山药等;阴虚甚者,配伍黄精㊁枸杞子等;阳虚甚者,配伍菟丝子㊁淫羊藿㊁杜仲㊁肉桂等;湿甚者,配伍茯苓㊁苍术㊁泽泻㊁玉米须㊁车前子等;热甚者,配伍生地黄㊁牡丹皮㊁黄连等;浊毒甚者,配伍土茯苓㊁积雪草等㊂②注意药物用量㊂应从小剂量用起,循序渐进,正气极虚者忌用攻伐之品㊂③时时顾护脾胃㊂④严格炮制,降低毒性㊂⑤防治过敏反应㊂4㊀小㊀结糖尿病肾病患者肾络受损,正虚邪实,而虫类药善攻窜通达,能活血通络㊁补益肾虚㊁祛风解表㊁收敛固涩,使邪实散㊁正气充,故临床疗效显著㊂目前,关于虫类药治疗糖尿病肾病的研究较少,但其在治疗中的优势是不可替代的㊂针对虫类药治疗糖尿病肾病的实验研究及临床多中心㊁随机对照㊁大样本研究还有很大的探索空间,系统深入地探讨虫类药的药理作用㊁作用机制㊁减毒方法等可为糖尿病肾病的治疗拓宽思路㊂参考文献:[1]陈玉强,汪年松.糖尿病肾病的诊治现状[J].中国临床医生杂志,2020,48(5):508-511.[2]生生,李敬林,依秋霞,等.毒损肾络致糖尿病肾病的发病机制浅析[J].辽宁中医杂志,2015,42(5):957-958.[3]孟薇.张仲景活血通络法研究[D].哈尔滨:黑龙江中医药大学,2015.[4]陈旭,贾波.叶天士虫药搜络飞者升,地行者降治法探析[J].中医杂志,2019,60(1):85-87.[5]朱泓,孙伟.朱良春治疗肾病常用药对拾贝[J].江苏中医药,2015,47(6):9-12.[6]潘莉,杨洪娟,鲁琴,等.通络法在膜性肾病中的应用[J].中华中医药杂志,2018,33(9):3833-3835. [7]李璐,王永香,王秀海,等.地龙及其复方治疗糖尿病肾病的机制研究进展[J].中国实验方剂学杂志,2017,23(7):227-234.[8]吴福林,董庆海,王涵,等.中药全蝎研究进展[J].辽宁中医药大学学报,2018,20(12):108-111.[9]李琳,邓晓明,王淑玲.水蛭对糖尿病肾病大鼠尿白蛋白影响的机制研究[J].四川中医,2012,30(9):48-49. [10]吴孟华,黄勇,徐浩坤,等.鹿胶的本草考证[J].中国中药杂志,2020,5(5):1188-1193.[11]田蜜,陈芳,余坊.僵蚕的研究进展[J].中医药导报, 2015,21(15):101-104.收稿日期:2020-06-15;修回日期:2020-10-19(编辑㊀陶㊀珠)文章编号:1001-6910(2021)02-0012-06㊃临床研究㊃基因片段扫描检测T细胞受体多样性运用于益艾康胶囊治疗艾滋病的效果观察∗李㊀杰,桑㊀锋,邓博文,岳静宇,李㊀强,郭会军(河南中医药大学第一附属医院艾滋病临床研究中心河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,河南郑州450000)摘要㊀目的:利用基因片段扫描建立检测T细胞受体(T cell receptor,TCR)β链多样性的方法,并探讨运用其观察益艾康胶囊治疗艾滋病疗效的效果㊂方法:①收集17例健康者外周血液样本,提取基因组DNA,设计多重荧光引物,采用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)分别扩增TCRβ链互补决定区3(CDR3)的2个V-J重组区和1个D-J重组区,以分子量内标(Liz-500)为标准品,利用毛细管电泳技术使用一代测序仪进行基因片段扫描,最后通过GeneMapper ID-X数据分析软件,根据荧光信号差异识别PCR产物,并对数据进行自动分析㊂②从样本储存库中筛选40例HIV/AIDS患者在益艾康胶囊治疗前及治疗1年时的血液样本,采用上述方法检测TCRβ链CDR3重组区多样性,从峰形㊁目标区域曲线下面积㊁离散度等方面评估其变化情况㊂结果:①Liz-500可在分子量50~500bp之间扫描出15条标记片段,用以判定目标片段长度㊂样本DNA完整,可检测出300bp以上扩增峰㊂②健康对照组TCRβ链A/B/C管(其中A/B管为V-J区,C管为D-J区)峰形均呈现类似钟形的正态分布;③TCR β链C管益艾康胶囊治疗前㊁后曲线下面积差异有统计学意义(P<0.05),即益艾康胶囊治疗后HIV/AIDS患者TCRβ链D-J区基因重组多样性较治疗前有所增加;④治疗前㊁后TCRβ链各管离散度均大于健康对照组(P<0.05)㊂结论:采用基因片段扫描检测T淋巴受体多样性,可以从不同角度分析益艾康胶囊对艾滋病的治疗效果,进而反映机体免疫系统状态㊂关键词:艾滋病;益艾康胶囊;基因片段扫描;T淋巴受体;多样性中图分类号:R512.91㊀㊀文献标志码:Adoi:10.3969/j.issn.1001-6910.2021.02.05㊀㊀人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)主要侵犯人体CD4+T细胞,破坏机体免疫系统,在此过程中T细胞受体(T cell receptor, TCR)多样性同样遭到破坏㊂中药具有多系统㊁多环节㊁多靶点调控的特点,在防治复杂㊁慢性疾病方面具有独特优势㊂益艾康胶囊(由人参㊁黄芪㊁白术㊁茯苓㊁当归㊁川芎㊁白芍㊁黄芩等组成)是一种通过调节免疫治疗艾滋病的中药制剂,可以稳定和提高HIV患者CD4+T细胞数量[1],但对TCR多样性有无影响尚不完全清楚㊂TCR多样性能够反映机体免疫系统状态,近年来对其的检测逐渐被运用于淋巴瘤的诊断[2],但其在艾滋病研究中的运用,目前国内报道较少㊂常用的TCR多样性检测方法是聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR),其原理是利用免疫球蛋白或TCR基因重排过程中V-D-J 区互相靠拢的特征,设计通用引物在一定范围内扩增出特征性基因片段[3]㊂基因片段扫描是一种比较精确的片段分析技术,将PCR产物进行毛细管电泳扫描识别不同荧光信号,通过数据分析软件,对数据进行自动分析㊂它不仅能自动显示出扩增产物的清晰峰形,还能得到各产物片段大小和强度的具体数值,且能够从峰形㊁曲线下面积㊁离散度等方面较为全面地评估TCR多样性变化情况㊂本研究将TCRβ链的互补决定区3(complementarity-determi-ning region3,CDR3)基因多样性检测运用于益艾康胶囊治疗艾滋病的临床观察中,探讨该方法运用的可行性㊁局限性等问题㊂1㊀材料与方法1.1㊀样㊀本从河南中医药大学第一附属医院艾滋病临床研究中心样本储存库保存的河南省中医药治疗艾滋病试点项目样本中,选取40例益艾康胶囊治疗HIV/ AIDS1年的全血样本作为益艾康胶囊组;另外采集17例健康者(均签署知情同意书)血液样本作为健康对照组㊂1.2㊀试剂与仪器血液基因组DNA提取试剂盒(规格50T,批号27121)㊁PCR预混液(无染料,2ˑTaq MasterMix,规格5mL,批号150911),均为北京康为世纪生物科技有限公司产品;去离子甲酰胺(Hi-Di,规格5mL,批号81234347)㊁分子量内标(Liz-500,规格500as-say,批号1212339)㊁液体分离胶(Pop-7,规格5mL,批号1612138)㊁电泳缓冲液(10ˑ,规格25mL,批号1606477),均为Applied Biosystems公司产品㊂C1000touch PCR仪,Bio-Rad公司产品;3130XL测序仪,Applied Biosystems公司产品㊂1.3㊀方㊀法1.3.1㊀全血基因组DNA提取①取1mL全血放入1.5mL EP管中,加入400μL裂解液1涡旋15s后,8000r/min离心1min,弃上清液,重复1次;加入1mL裂解液2,上下翻转,涡旋后8000r/min离心1min,弃上清液,重复1次㊂②加入蛋白酶K10μL,反复吹打,再加入320μL消化液,58ħ水浴中消化15min㊂③加入110μL纯化液, 15000r/min离心1min,吸出上清液,放入加有1mL 无水乙醇离心管中,上下翻转可见絮状DNA析出㊂④将液体转入离心柱中,8000r/min离心1min,弃滤液㊂⑤加入200μL体积分数为700mL/L乙醇于滤柱内,8000r/min离心1min,弃滤液㊂⑥将离心柱放入洁净EP管中,加入100μL水,静置10min后8000r/min离心1min,-20ħ保存备用㊂1.3.2㊀设计合成荧光引物与PCR引物组合见表1㊂反向引物均用FAM标记,由生工生物技术公司合成㊂混合引物时每条引物终浓度为10nmol/L㊂PCR反应体系50μL,包括:2ˑPCR Mix(无染料)25μL,上游引物2μL,下游引物2μL,模版30ng,补水至50μL㊂反应条件:96ħ预变性10min,94ħ变性30s,60ħ退火30s,72ħ延伸30s,40个循环,72ħ延伸10min㊂表1㊀引物组合信息检测对象引物管名称引物组合方式产物大小/bp TCRβ(V-J)TCR A管23V+9J240~285TCR B管23V+4J240~285TCRβ(D-J)TCR C管D1+D2+13J170~210,285~325 1.3.3㊀TCRβ链基因重排检测2μL PCR扩增产物溶于8μL Hi-Di,加入96孔裙边板中,每孔加入0.5μL Liz-500,95ħ孵育2min,-20ħ冷却后上机检测,采用Pop-7液体胶,50cm毛细管在3130XL测序仪上进行毛细管电泳,选择片段分析模块收集数据㊂1.3.4㊀扫描数据分析采用GeneMapper ID-X软件进行片段扫描数据分析,以目标片段区域的曲线下面积和㊁扩增峰离散度及峰形图谱等指标表示TCR种类和数量,分析TCRβ链可变区CDR3V㊁D㊁J区基因重组变化㊂1.3.5㊀数据分析与处理采用GeneMapper ID-X软件用于收集数据,计算HIV/AIDS患者目标区域曲线下面积总和作为TCRβ链基因重排多样性指标分析益艾康胶囊治疗前㊁后变化情况㊂因为TCR多样性个体间差异较大,所以健康对照组与HIV/AIDS患者组之间的比较不能单纯采用曲线下面积和㊂本研究采用健康者及HIV/AIDS患者目标区域片段四分位间距(P75-P25)表示片段分布的离散率(由于原始数据数量级较大,分析时则同比例缩小),以离散率代表多样性,分别用以比较HIV/AIDS患者治疗前㊁后与健康者的离散率差异,进而反映多样性差异㊂1.4㊀统计学方法采用SPSS19.0统计分析软件处理㊂符合正态分布的计量资料以均数(x)ʃ标准差(s)表示,两组间比较采用配对t检验或独立样本t检验,多组间比较采用单因素方差分析,组间比较采用Tukey s-b法或Dunnettᶄs T3法;非正态分布的计量资料以M (P25,P75)表示,多组间比较采用Kruskal-Wallis检验,组间比较采用Mann-Whitney U法㊂检验水准α=0.05㊂2㊀结㊀果2.1㊀基因组DNA质量分析以Liz-500作为分子量标志物,通过毛细管电泳在分子量50~500bp之间扫描出15条分离清晰的固定分子量标记片段,用以判定目标片段大小㊂样本DNA均可检测出300bp以上扩增峰,说明DNA 较为完整,可以满足检测需要㊂空白对照无扩增峰,表明实验过程中无外源性核酸污染㊂见图1㊂图1㊀Liz-500分子量内标物扫描图谱及内标曲线2.2㊀健康对照组TCRβ链基因重排多样性扫描峰形图谱X轴代表各目的片段扩增产物大小(bp),Y轴代表目标片段相对荧光信号强度;TCRβ链各管分别在其目标区域出现一系列扩增峰,呈现类似钟形的正态分布㊂见图2㊂图2㊀健康对照组荧光扫描结果2.3㊀HIV /AIDS 患者组治疗前后TCR β链曲线下面积对比益艾康胶囊治疗前后TCR β链A 管和B 管曲线下面积对比,差异无统计学意义(P >0.05);TCR β链C 管治疗前后的曲线下面积对比,差异有统计学意义(P <0.05)㊂结果表明,治疗后αβT 细胞TCR β链D -J 区基因重排片段种类和数量有所增加,多样性得到改善㊂见表2㊁图3㊂表2㊀HIV /AIDS 患者组治疗前后TCR β链曲线下面积对比㊀n =40,x ʃs样本治疗前治疗后A 管43.89ʃ11.9239.91ʃ11.20∗B 管33.33ʃ14.3337.93ʃ11.45∗C 管35.63ʃ9.3059.70ʃ11.32∗∗㊀注:与同管治疗前对比,∗P >0.05,∗∗P <0.05㊂图3㊀益艾康胶囊治疗前后TCR β链多样性增加图谱2.4㊀两组治疗前后TCR β链离散度对比见表3㊂HIV /AIDS 患者治疗前后TCR β链各管分别与健康对照组对比,离散度差异均有统计学意义(P <0.05),显示健康者PCR 产物目的片段离散度较小,相比之下更接近正态分布㊂A 管和B 管同管治疗前后对比,差异无统计学意义(P >0.05);C 管治疗前后对比,差异有统计学意义(P <0.05)㊂表3㊀两组治疗前后TCR β离散度对比㊀x ʃs组㊀别例数时间A 管B 管C 管HIV /AIDS 患者组40治疗前 4.04ʃ1.68## 3.40ʃ1.83## 1.26ʃ0.52##治疗后4.20ʃ1.71∗## 3.49ʃ1.41∗##1.90ʃ0.89∗∗##健康对照组171.52ʃ0.52㊀1.02ʃ0.68㊀0.48ʃ0.11㊀㊀注:与同管治疗前对比,∗P >0.05,∗∗P <0.05;与健康对照组对比,##P <0.05㊂3㊀讨㊀论近年来,T 细胞受体V 区基因重排多样性检测被越来越多地运用于肿瘤特别是淋巴瘤等疾病的研究中[4-5]㊂TCR 是T 细胞特异性识别抗原的受体㊂在同一个体内,TCR 组成多样性极为丰富的TCR 库,赋予个体对环境中各种各样的病原体(抗原)进行识别和应答的巨大潜力㊂T 细胞受体库是由V 基因片段末端㊁D 基因片段㊁J 基因片段前端及连接时插入的核苷酸序列等一系列基因片段重排共同组成[6-7],因此,通过测定特定基因重排片段出现的频率可以反映特定T 细胞克隆扩增的程度,从而反映T 细胞免疫系统状态;此外,分析不同时间点TCR 多样性变化情况可以动态了解整体T 细胞免疫变化情况㊂根据所含肽链不同可将TCR 分为TCR αβ和TCR γδ两种类型㊂正常人体内95%为TCR αβ,少数为TCR γδ㊂本研究主要针对αβT 细胞中长链TCR β链基因重排多样性进行检测,建立检测方法,分析HIV /AIDS 患者在益艾康胶囊治疗前后的TCR 变化情况,为临床疗效观察提供依据㊂健康者在没有外来抗原特异性刺激的情况下,机体αβT 细胞受体基因片断处于随机重排状态,细胞受体表现为多克隆性,其基因片段扫描后呈现典型的钟形高斯分布特征,从而保障机体具有识别外界多样性抗原的能力[8]㊂如果机体发生严重病毒性感染或罹患T 细胞淋巴瘤等,机体免疫系统呈现动员激活状态,TCR 基因会出现寡克隆或单克隆重组表达,其TCR 多样性出现损害,进而导致其他病原体机会性感染的增加㊂自河南省中医药治疗艾滋病试点项目开展以来,益艾康胶囊被广泛用于HIV /AIDS 患者的治疗㊂十余年的临床实践证实,其能够改善HIV /AIDS 患者的临床症状和体征,提高患者生存质量,降低病死率[9-11]㊂虽然益艾康胶囊有较好的疗效,但其作用机制不甚明了,影响了该药的推广,因此探索其作用机制有重要作用㊂本研究中,从曲线下面积来看,TCR β链A 管和B 管治疗前后差异无统计学意义,即TCR β链V -J 重组区治疗前后差别不大;TCR β链C 管治疗前后有统计学差异,表明TCR β链D -J 区治疗后基因重排情况与治疗前不同,多样性得到改善㊂就片段离散度分析结果来看,HIV /AIDS 患者相比健康者离散度大,正态性不优于健康者㊂治疗后TCR β链C 管离散度与治疗前有所增大(P <0.05)㊂结合治疗前后曲线下面积总和比较分析可知,虽然治疗后TCR β链D -J 区基因重排多样性得到改善,但其离散度比治疗前大,可能是主峰位置偏移所致㊂TCR β链基因重排多样性可以作为一种新的检测手段用于益艾康胶囊治疗HIV /AIDS 患者的临床疗效观察㊂但是,TCR 影响因素较多,年龄㊁所处地区㊁心理状态等均可能对机体免疫功能产生影响,而排除此类因素较为困难,因此,将其在HIV 感染患者与健康者之间进行比较有一定的局限性,但跟踪随访同一位患者进行比较较为可行㊂同时,基于HIV 感染后机体的免疫重建机制,TCR 多样性变化观察可能是一个长期的过程㊂另外,分析该指标与T 细胞亚群检测和病毒载量的相关性还需进一步探讨㊂参考文献:[1]郭娅娅,徐立然,吴少天,等.中医药辨治艾滋病的临床研究概况[J].广州中医药大学学报,2020,37(1):190-194.[2]陆晨,刘凯,岳华.T 细胞受体基因与疾病研究概况及进展[J].医学综述,2011,17(3):333-335.[3]张静,张太明,杨飞,等.毛细管电泳-基因扫描分析在淋巴瘤T 细胞受体基因重排检测中的应用[J].中华病理学杂志,2013,42(9):615-617.[4]MENGQI DONG,PATRICIO ARTUSA,STEPHANIE A KEL-LY,et al.Alterations in the thymic selection threshold skew the self-reactivity of the TCR repertoire in neonates[J].J Im-munol,2017,199(3):965-973.[5]GUOBING CHEN,XINBO YANG,ANNETTE KO,et al .Se-quence and structural analyses reveal distinct and highly di-verse human CD8+TCR repertoires to immunodominant viral antigens[J].Cell 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[10]李发枝,徐立然,张明利,等.益艾康胶囊与辨证论治相结合治疗艾滋病患者885例临床观察[J].中医杂志, 2010,51(9):808-810.[11]徐立然,李发枝,何英,等.益艾康胶囊治疗HIV/AIDS 患者60个月CD4+T细胞计数和病毒载量临床观察[J].中国艾滋病性病,2010,16(3):231-233.通信作者:郭会军,主任医师,河南中医药大学第一附属医院,河南省郑州市金水区人民路19号,450000,guo.6268505@ ∗基金项目:河南省科技攻关项目(202102310503,202102310178, 182102310312);河南省中医药防治艾滋病专项课题(2019AZB005,2019AZB008);河南省高等学校重点科研项目(18A360013);河南中医药大学科研苗圃工程项目(MP2017-25);河南省中医管理局国家中医临床研究基地专项课题(2017JDZX041);河南中医药大学特色学科中医学学科建设项目(STS-ZYX-2017019);国家科技重大专项(2017ZX10205502002, 2017ZX10205502003);河南省中医药科学研究专项课题(20-21ZYZD03)收稿日期:2020-08-01;修回日期:2020-11-02(编辑㊀陶㊀珠)文章编号:1001-6910(2021)02-0017-04㊃临床研究㊃德生丹联合戊酸雌二醇片/雌二醇环丙孕酮片治疗肾虚肝郁型卵巢早衰38例∗罗盼盼1,门㊀波2(1.河南中医药大学2018级硕士研究生,河南郑州450046;2.河南省中医院,河南郑州450002)摘要㊀目的:观察德生丹联合戊酸雌二醇片/雌二醇环丙孕酮片治疗肾虚肝郁型卵巢早衰的临床疗效㊂方法:选择河南省中医院生殖中心门诊就诊的肾虚肝郁型卵巢早衰患者76例,按1ʒ1的比例随机分为两组㊂对照组给予戊酸雌二醇片/雌二醇环丙孕酮片,从月经第5天开始,每晚1片,连服21d,治疗3个月㊂治疗组在对照组治疗基础上给予德生丹(当归㊁益母草㊁川芎㊁盐菟丝子㊁丹参㊁炒白芍㊁熟地黄㊁陈皮㊁木香㊁砂仁㊁醋北柴胡㊁桑寄生㊁桑葚㊁续断㊁黄芪),1d1剂,早晚各200mL水煎服㊂两组均连续治疗3个月,并于治疗结束后6个月进行随访判定疗效㊂结果:治疗组痊愈14例,有效20例,无效4例,有效率为89.47%(34/38);对照组痊愈8例,有效19例,无效11例,有效率为71.05%(27/38)㊂两组对比,差异有统计学意义(P<0.05)㊂在中医证候积分㊁激素分泌㊁子宫内膜厚度方面,治疗组治疗后改善均优于对照组(P<0.05或P<0.01)㊂结论:德生丹联合戊酸雌二醇片/雌二醇环丙孕酮片治疗肾虚肝郁型卵巢早衰疗效确切㊂关键词:卵巢早衰;肾虚肝郁证;德生丹;戊酸雌二醇环丙孕酮片;疗效观察中图分类号:R711.75㊀㊀文献标志码:Adoi:10.3969/j.issn.1001-6910.2021.02.06㊀㊀卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)是指女性在小于40岁时因卵巢功能的衰退而出现提前衰老㊁继发性闭经㊁不孕等,常伴有促卵泡生成激素(FSH)>40IU/L及雌二醇(E2)<73.2pmol/L㊂临床表现伴有不同程度的潮热㊁盗汗㊁烦躁㊁性交困难㊁性欲下降等绝经前后症状及生殖功能下降等,使女性心理及生理发生较大的改变,严重降低女性生活质量,影响家庭和谐[1]㊂根据其临床症状,将其归属于中医学闭经不孕年未老而经水断等范畴㊂POF是由多种病因导致的卵巢内卵泡质量下降而引发的卵巢储备功能衰竭,作为一种异源性疾病,其具体发病机制尚不明确㊂目前,中医学对POF的治疗主要从肾虚肝郁㊁肝肾阴虚㊁肾阳亏虚㊁肾虚血瘀等证型进行辨证论治,临床效果显著㊂由。

猪的参考基因组

猪的参考基因组全文共四篇示例，供读者参考第一篇示例：猪(Pig)是一种重要的家畜动物，为人类提供了丰富的肉类食品。

猪的参考基因组是为研究猪的遗传背景和生物学特性提供重要参考的基因组图谱。

在过去的几十年里，随着生物技术的不断发展，人们对猪的基因组进行了深入研究，为猪的育种和疾病抗性等方面提供了重要的支持。

目前，猪的参考基因组已经被完整测序并进行了详细注释。

该基因组包含了猪所有的DNA序列信息，可以为科研人员提供猪的基因位置、结构和功能等重要信息。

通过对猪的参考基因组的研究，我们可以更好地了解猪的遗传变异、基因调控等生物学特性。

猪的基因组大小约为2.7亿个碱基对，包含了大约22,000个基因。

与人类的基因组相比，猪的基因组结构相对较为简单，但也包含了大量的重要基因。

猪的基因组被分为不同的染色体，共有38对，其中包括18对大小不等的配对染色体和1对性染色体。

猪的参考基因组的研究对猪的遗传改良和育种具有重要意义。

通过对猪的基因组进行分析，科研人员可以挖掘猪的潜在遗传资源，发现重要的基因突变和功能基因等。

这有助于提高猪的生长速度、肉质品质和疾病抗性等方面的性状。

猪的参考基因组也为疾病防控和疾病研究提供了重要支持。

猪是一种重要的生物医学模型动物，具有与人类相似的生理和疾病特征。

通过对猪的基因组进行研究，可以更好地了解猪的疾病易感性和免疫调节机制，为疾病预防和治疗提供重要线索。

猪的参考基因组是研究猪的遗传背景和生物学特性的重要工具，对于猪的遗传改良、育种、疾病防控和人类疾病研究都具有重要意义。

随着生物技术的不断发展，我们相信对猪的基因组研究将不断深入，为猪的健康和生产提供更好的支持。

【2000字到此结束】。

第二篇示例：猪是重要的养殖动物，不仅提供了丰富的肉类资源，还具有重要的科研和医学价值。

猪的参考基因组研究为我们深入了解猪的遗传特性和生物学功能提供了重要的基础。

本文将介绍猪的参考基因组研究的意义、方法以及取得的成果。

猪泛基因组

猪泛基因组概述猪作为一种重要的农业动物，其基因组研究对于改良猪的生产性能、抗病性以及适应环境的能力具有重要意义。

猪泛基因组（Swine Pan-Genome）是指对于猪物种中多个个体的基因组序列进行比较和分析，以揭示其基因组的多样性和变异情况。

通过研究猪泛基因组，可以深入了解猪的遗传多样性，为猪的遗传改良和疾病防控提供理论依据。

猪泛基因组的研究方法猪泛基因组的研究主要依赖于高通量测序技术，如全基因组测序（Whole Genome Sequencing，WGS）、转录组测序（RNA-Seq）以及基因组重测序（Re-sequencing）等。

这些技术可以获得猪个体的基因组序列信息，并通过比对和注释等分析方法，进一步研究猪的基因组结构和功能。

猪泛基因组的多样性通过对多个猪个体的基因组序列进行比较和分析，我们可以发现猪泛基因组存在着丰富的多样性。

猪的泛基因组包括了核心基因组（Core Genome）和可变基因组（Variable Genome）两部分。

核心基因组是指在所有猪个体中都存在的基因，它们通常与猪的基本生物学功能和生理过程相关。

可变基因组则是指在不同猪个体中存在差异的基因，这些基因可能与猪的品种特性、疾病抗性以及适应环境等方面有关。

猪泛基因组的应用猪泛基因组的研究对于猪的遗传改良和疾病防控具有重要意义。

通过比较不同猪个体的基因组序列，可以发现一些与生产性能、肉质品质、疾病抗性等相关的基因。

这些基因可以作为遗传标记，用于辅助猪的选育工作。

同时，猪泛基因组的研究还可以揭示猪的基因组适应性进化过程，为研究猪的进化历史和亲缘关系提供重要线索。

猪泛基因组的挑战和展望猪泛基因组的研究虽然取得了一定的进展，但仍然面临一些挑战。

首先，猪的基因组大小较大，分析和处理基因组数据的时间和计算资源较多。

其次，猪的基因组结构复杂，存在大量的DNA序列重复和基因家族，增加了基因组注释和比对的难度。

此外，猪的基因组序列还存在一些盲区和难以解读的区域，需要进一步完善和改进测序和分析方法。

tcrα基因结构

tcrα基因结构
TCRα基因是编码T细胞受体α链的基因，它位于人类17号
染色体上。

其结构包括一段可变区（V区）、一段多样性区
（D区）、一个连接区（J区）和一个常规区（C区）。

V区是最变异的部分，包含了多个V基因。

D区和J区也存在
多个基因供选择。

这些区域在基因重排过程中，会随机组合成TCRα基因的可变区(SeqV)。

连接区(Joining region, SeqJ)位于V区和C区之间，它连接了
V区和C区。

C区是编码常规段的基因，确定了TCRα链的结
构和功能。

不同的组合方式可以产生不同结构和功能的TCRα链，这样T细胞就能识别和应对多样性的抗原。

总的来说，TCRα基因的结构包括了V区、D区、J区和C区，这些区域在基因重排过程中组合形成不同结构和功能的TCRα链。

2023届山东省普通高中学业水平等级考试抢分生物密卷(含答案解析)

2023届山东省普通高中学业水平等级考试抢分生物密卷学校:___________姓名：___________班级：___________考号：___________一、单选题1．在植物细胞工程的技术中，无需激素调节的是（）A．组织培养中促使细胞脱分化B．制备原生质体C．组织培养中促使细胞再分化D．促使融合细胞形成愈伤组织2．有关记忆细胞的叙述中，不正确的是（）A．受同一抗原刺激后，迅速产生大量的抗体B．受同一抗原刺激后，,迅速形成大量浆细胞C．受同一抗原刺激后，迅速形成大量效应T细胞D．是由B细胞或T细胞分化形成的3．下列有关高中生物学史的叙述，错误的是A．拜尔的实验证明，胚芽鞘的弯曲生长，是由于尖端产生的生长素在其下部分布不均匀造成B．欧文顿对植物细胞的通透性进行实验，最终认为膜是由脂质构成的C．摩尔根利用了假说演绎的科学研究方法，最终证明基因在染色体上D．克劳德摸索出采用不同的转速对破碎的细胞进行离心的方法，将细胞内的不同组分分开4．我们的生活离不开微生物。

醋酸杆菌可酿醋，毛霉可制作腐乳，酵母菌可酿酒。

下列有关三种微生物的叙述中正确的是（）A．三者都可在细胞质基质和细胞膜上进行有氧呼吸B．三者都能发生基因突变、基因重组和染色体变异C．三者都可通过孢子生殖进行无性繁殖D．三者在发酵过程中所需的最适温度有一定差异5．下列关于微生物培养及利用的叙述，错误的是（）A．配制培养基时应根据微生物的种类调整培养基的pH，培养霉菌应调至酸性B．利用尿素固体培养基可迅速杀死其他微生物，而保留利用尿素的微生物C．酵母菌不能直接利用糯米淀粉发酵得到糯米酒D．醋酸菌是一种嗜热菌，般在30—35℃条件下培养6．如图中，a、b、c表示一条染色体上相邻的3个基因，m、n为基因间的间隔序列，下列相关叙述，正确的是（）A．该染色体上的三个基因一定控制生物的三种性状B．m、n片段中碱基对发生变化会导致基因突变C．若a中有一个碱基对被替换，其控制合成的肽链可能不变D．a、b、c均可在细胞核中复制及表达7．新冠肺炎疫情期间，武汉市“方舱医院”内医护人员与患者共同锻炼身体，如打太极、做五禽戏、跳广场舞等。

猪T细胞受体_链的基因结构及其多样性分析

t细胞淋巴瘤tcrγ基因重排特征的分析及检测方法优化

tcrα基因结构

基因编辑技术在猪分子育种中的研究进展及发展趋势

TCR的研究分析报告

猪T细胞受体γ链基因的克隆及生物信息学分析

猪肉质性状基因遗传标记的研究进展

猪FcγR ⅡB多种剪接异构体的基因克隆与序列分析

tcr测试方法

动物遗传学习题

家猪 遗传学体系构建

上海市某腹泻猪群猪流行性腹泻病毒检测及全基因序列分析

T细胞结构讲解

猪的参考基因组-概述说明以及解释

基于转录组学探究猪基因表达特征及其调控网络

利用猪全基因组CRISPR敲除文库筛选PDCoV感染相关的宿主因子

基因片段扫描检测T细胞受体多样性运用于益艾康胶囊治疗艾滋病的效果观察

猪的参考基因组

猪泛基因组

tcrα基因结构

2023届山东省普通高中学业水平等级考试抢分生物密卷(含答案解析)

家猪遗传学体系构建