推荐一个强大的文章示意图绘制工具
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推荐⼀个强⼤的⽂章⽰意图绘制⼯具在⼤⽜的⽂章中经常会看到⼀些展⽰实验流程、基因互作模型、信号通路等的⽰意图,⽐如下⾯的这些。
(Frontiers in Microbiology, 2015)
(Nature Protocols, 2013)
(Nature, 2016)
在之前的⽂章《如何⽤PPT绘制通路⽰意图?》已介绍过⽤⼏何图形绘制⽰意图,可有的童鞋问啦,我想展⽰⽐如神经细胞、细胞器、核酸链、⼩⿏类似这样复杂的图形怎么办?必须要精通Ai(Illustrator)、cdr(CorelDRAW)这样的平⾯设计软件吗?
这⾥给⼤家推荐⼀个软件ChemDraw,它是⼀个化学结构式绘制软件,还可以绘制3D的分⼦模型(如下图)。
我在之前的⽂章《分⼦化学结构式的绘制》有提到过。
它的“主业”是画各种的结构式,我们这⾥仅仅⽤到它⾼质量的⽮量图形模板。
下⾯演⽰如何画上⾯⽰例中的⼀些图形。
⾸先,通过View菜单显⽰Biopolymer 和BioDraw两个⼯具条,如下。
利⽤Biopolymer⼯具可以画核酸和蛋⽩序列,如下图。
⽽BioDraw可以画⼀些⽣物元件,⽐如双螺旋、抗体、跨膜结构、细胞膜等等,如下图。
长按有⿊三⾓的图标,会显⽰更多同类型的元件。
每个元件都可以旋转缩放、重新着⾊,⽅法如下图。
另⼀种画⽰意图⽅法是利⽤模板。
长按“图章”按钮,你会看到⾮常丰富的图形和化学结构式模板,如下图,⽤这些图形基本上就可以快速画出上⽂第1个例⼦中的图形元件。
当然你也可以通过File\Save As把图形元件保存成svg、eps格式的⽮量图(如下图),在Ai软件中进⾏更复杂的⽰意图绘制。
软件下载地址(可试⽤半个⽉):/,软件还是很贵的,你可以通过这个⽹址看下它的价格
(/),贵的东西⼀般都是好东西!
但如果你只是想画个图,其实半个⽉的试⽤时间⾜够;如果你想⼀直⽤下去,这⾥推荐⼤家使⽤ChemDraw的在线版本。
⼯具⽹址:
https://chemdrawdirect.perkinelmer.cloud/js/sample/index.html
⼯具的界⾯还是⽐较简洁的,因为是在线版本,所以它的模板更新更及时,⽐本地版的似乎要丰富,如下图。
在线版本的使⽤⽅法和本地版的软件基本⼀致,不过保存图⽚的⽅法⽐较特殊,这⾥介绍⼀下。
我这⾥简单的画了⼀个注射器和⼩⿏(做了组合),然后点击Structure菜单下的Get SVG,如下图。
在弹出的窗⼝中CTRL+A全选代码,然后复制粘贴到⽂本编辑器(如记事本、notepad等)中,另存为⽂件名为“*.svg”的⽂件即可。
SVG格式的⽮量图可以⽤Ai、cdr等软件打开(如下图),以及做进⼀步的编辑,⽐如放⼤缩⼩、颜⾊调整等等。
今天的内容就到这⾥啦,ChemDraw的功能⾮常强⼤,⼤家赶快去探索吧~
参考⽂献
Song C, Zhang S,Huang H. Choosing a suitable method for the identification of replicationorigins in microbial genomes[J]. Frontiers in Microbiology, 2015, 6:1049.
Ran F A, Hsu P D,Wright J, et al. Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system[J]. Nature Protocols, 2013, 8(11):2281-2308.
Kranz L M, Diken M,Haas H, et al. Systemic RNA delivery to dendritic cells exploits antiviral defence for cancer immunotherapy[J]. Nature,
2016,534(7607):396-401.。