RAPD和SRAP分子标记在真姬菇菌种鉴定中的应用

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ISSR、RAPD和SRAP分子标记技术在姬松茸菌株鉴定上的应用比较

ＲＤ、４条ＩＳＡＰＳＲ和２对ＳＡＰ引物适合姬松茸菌株鉴定分析，３种标记方法均将１Ｒ６个菌株分为３大类群，
ＡＯｌ１ＡＯ３１类，Ａ００Ｏｌ＋和Ｏ１为０９单独为１，其余菌株为１。３种分子标记法对姬松茸菌株鉴别的结果存类类
ＡｂｔａｔｉｔｅｉｆｒｎｔａｎｆＡｇｒｃｓｂａｅｕｉｒｎｌｚｄｕｉｇＩＳｓｒｃ：ＳｘｅｎｄｆｅｅｔｓｒｉｓｏａｉｕｌｚｉＭｒｌｗｅｅａａｙｅｓｎＳＲ，ＲＡＰａｄＳｌＤｎＲＡＰＰＣＲ．ａｌｉａｉｎｕｉｇ８ＲＡＰｐｉｒ．４ＩＳｒｒｎＲＡＰｐｉｒｐｉｓｓｐｒｔｄｔｅｓｒｉｓｉｔｈｅｍｐｉｃｔｓｎｆｏＤｒｍｅｓＳＲｐｉｍｅｓａｄ２Ｓｒｍｅａｒｅａａｅｈｔａｎｎｏｔｒｅｇｏｐ．Ｏｎｆｔｅｃｎｉｔｄｏ０＋１ａｄＡ０１，ａｏｈｒＡ００ｒｕｓｅｏｈｍｏｓｓｅｆＡ０１１ｎ０３ｎｔｅ０９，ａｄｔｅｔｉｄｇｏｐｔｅｒｍａｎｅｓＴｈｎｈｈｒｒｕｈｅｉｄｒ．ｅ
在着一定差别。ＳＰ反应的遗传信息较丰富，比ＩＳＲＡＳＲ、ＲＡＤ检测到更大的遗传差异；ＲＡＤ引物扩增到的ＰＰ多态性条带数较多。

白玉菇的研究进展

白玉菇的研究进展许宏斌2010级生物技术，10171350106摘要: 综述了白玉菇种质资源、生物学特性、营养成分、栽培技术、保鲜技术等方面的研究进展，探讨了白玉菇研究与产业发展前景。

关键词: 白玉菇，资源，开发利用白玉菇又名白色蟹味菇、白色真姬菇、白玉蕈，在日本则称之为“御菇”或“御茸”，其菇体洁白如玉，质地细腻，口感特佳，是一种倍受国内外市场青睐的上乘山珍，是食用菌中的“金枝玉叶”( 陈成弟，2002) 。

白玉菇是真姬菇Hypsizygus marmoreus( Peck) H． E． Bigelow( 1976) 的白色品系，它的系统分类位置与真姬菇一样，被放在真菌界Fungi、担子菌门Basidiomycota、伞菌纲Agaricomycetes、伞菌目Agaricales、离褶伞科Lyophyllaceae、玉蕈属Hypsizigus(Kirk et al．，2008; http: / /www． indexfungorum．org) 中。

本文综述了中国白玉菇种质资源、生物学特性、营养成分、栽培技术、保鲜技术等方面的研究进展，探讨白玉菇研究与产业发展前景。

1 菌质资源白玉菇的子实体丛生，每丛15 ～ 50 株不等，少散生; 菌盖幼时半球形，白色，后渐平展; 盖面平滑，有2 ～ 3 圈斑纹，盖缘平或微下弯，稍波状，菌盖直径1． 5 ～ 2． 0 cm; 菌肉白色，质韧而脆，致密; 菌褶白色至浅黄色，弯生，有时略直生，密，不等长，离生; 菌柄中生，圆柱形，长3 ～ 12 cm; 担孢子无色，平滑，球形，孢子印白色( 卯晓岚，2000) 。

在宏观形态特征上，白玉菇与真姬菇的主要区别是白玉菇通体白色而真姬菇菌盖则呈深褐色( 暴增海，2007) 。

白玉菇种质的优劣直接关系到白玉菇产品的产量与质量，对白玉菇种质的鉴定尤为重要。

李翠翠对12 个真姬菇菌株进行鉴定，发现RAPD 技术、SRAP 技术均适用于真姬菇种内鉴定，3个白玉菇菌株亲缘关系较近，聚为一类( 李翠翠等，2009) 。

SRAP标记技术在植物基因分型中的应用

SRAP标记技术在植物基因分型中的应用随着生物技术的逐渐发展，人们对植物基因分型的需求也越来越高，因为植物基因分型可以让我们更好地研究和利用植物的遗传资源。

在这方面，SRAP标记技术是一种非常有效的方法，下面我将围绕这个主题展开讨论。

什么是SRAP标记技术SRAP是Sequenced-Related Amplified Polymorphism的缩写，即序列相关扩增多态性。

这种技术是利用PCR扩增DNA的方法，通过引物在基因组DNA的不同区域进行扩增，得到具有多态性的DNA条带。

与AFLP和RAPD等分子标记技术相比，SRAP标记技术具有高效、快速、经济和重复性好等特点，在植物研究和品种鉴定中应用广泛。

SRAP标记技术的优点1. 高效：SRAP标记技术擅长鉴定植物种内和种间遗传变异，能够在一次PCR 反应中产生多个多态性DNAband。

2. 经济： SRAP标记技术是一种低成本的分子标记技术，通常只需要一对引物就可得到可重复结果。

3. 重复性好：SRAP标记技术产生的结果很稳定，扩增的带谱重复性好，可重复性高，因此可用于不同实验室和不同时期的研究。

4. 可靠性强：SRAP标记技术可靠性高，主要是因为其引物是针对连续序列扩增出来的，提高了扩增和分析的精度和准确性。

SRAP标记技术的应用1. 植物种质资源鉴定：SRAP技术能够在拟南芥、水稻、玉米、葡萄等植物种质资源鉴定中快速可靠地检测到基因组水平的单倍型多样性和分子附属变异，有助于提高种质资源的利用价值和保存。

2. 植物遗传进化研究：SRAP标记技术可以通过研究不同地理分布区域的植物DNA序列变异情况，了解植物种群的时空演化、适应性进化、基因流动和遗传多样性等，为保护和利用自然资源提供有力的分子生态学依据。

3. 植物杂交种鉴定：SRAP技术也被广泛应用于植物杂交种的筛选，由于其具有高效、准确、经济等特点，可用于不同植物之间的杂交亲缘关系鉴定和分子标记辅助育种。

分子标记SRAP实验报告

分子标记SRAP实验报告1. 引言分子标记是现代生物技术研究中的关键方法之一。

它可以通过扩增特定的DNA 序列，从而在种群遗传学、进化生物学、基因定位等方面提供有力的支持。

SRAP （Sequence Related Amplified Polymorphism）是一种新颖的分子标记技术，通过对相邻序列的扩增产物进行光谱分析，实现对DNA的多态性研究。

本实验旨在探究SRAP技术的可行性和应用价值。

2. 材料与方法2.1 实验材料- 植物样本：从绿色植物中收集新鲜叶片样本，保持样本的完整性和活性。

- 试剂：Tris-HCl缓冲液、EDTA、SDS、DTT、RNA酶A、异丙醇、等温酶I、DNA聚合酶、dNTP作为PCR反应的试剂。

- 仪器设备：离心机、PCR仪、凝胶电泳装置。

2.2 实验步骤1. DNA提取：将植物样本加入到400 μl Tris-HCl缓冲液中，加入100 μl 2% CTAB和10 μl 20 mg/ml RNA酶A，反复翻转均匀混合。

在65C水浴中孵育35分钟，加入1 ml 等温酶I和20 μl 10% SDS，并在37C水浴中孵育30分钟。

加入50 μl DTT，轻轻倒放翻转均匀后，在65C水浴中孵育30分钟。

加入500 μl 24:1等温酶I: P/C（φ=1）混合液，轻轻倒置混合。

沉淀离心，上清液移至新离心管，并加入等体积的异丙醇，轻轻翻转混合。

2. PCR扩增：将DNA样品加入PCR反应管中，配制成PCR反应液。

设置合适的PCR反应条件，进行PCR扩增。

3. 凝胶电泳：制备1%琼脂糖凝胶，并将PCR产物和DNA分子量标记物一同加入凝胶槽中。

进行电泳，观察扩增片段的大小和形态。

4. 光谱分析：将电泳结果照相，并进行光谱分析。

记录每个扩增片段的出现频率和多态性信息。

3. 结果与讨论通过以上步骤，我们成功获取了植物样本的DNA，并进行了SRAP-PCR扩增。

在凝胶电泳结果中，观察到了多个扩增片段，且大小和形态各异。

RAPD技术在中药材鉴定中的应用

第 17 卷第 1 期 2001 年 3 月
综述
广东药学院学报
A CAD EM IC JO U RN AL O F GU A N GD ON G CO LLEGE OF PHAR M ACY
Vol. 17 No. 1
M ar. 2001
RAPD 技术在中药材鉴定中的应用
王阳顺* 综述罗集鹏审校 ( 广东药学院术是一种 DNA 分子标记技术, 自 90 年代问世以来, 人们即把它试用于中药材的鉴定, 并在该领域取得可喜的研究进展。本文就 RAPD 技术的基本原理以及它应当用于中药格鉴定的优缺点、注意事项、目前国内外研究动态、可能发展前景等方面作了较详细的阐述。关键词 RAPD 技术; 中药材; 鉴定中图号 R282. 5 文章编号: 1006-8783( 2001) 01- 0019- 03 文献标识码: A
RA PD 即随机扩增的多态性 DNA ( R andom amplified polymorphic DNA ) , 是美国的 Williams 与 Welsh 两个研究小组于 1990 年同时提出的一种 DN A 分子标记技术。Williams 等[ 1] 称之为 RA PD, Welsh 等[ 2] 称之为 A p- PCR ( Arbitarily primed PCR) 。RAPD 技术建立在 PCR( poly merase chain r eaction) 技术基础上, 它是以任意顺序列的寡核苷酸单链 ( 通常为 10 个碱基,A p- PCR 则为 20~ 30 个碱基。) 为引物, 对所研究的基因组 DNA 进行随机扩增。RA PD 所用的一系列引物的 DN A 序列各不相同, 但对于任一引物, 它同基因组 DNA 序列有特定的结合位点。这些特定的结合位点在基因组某些区域内的分布如符合 PCR 扩增的反应条件, 即在一定范围内模板 DNA 上有与引物互补的反相重复序列时, 就可扩增出此范围的 DNA 片段。在不同物种基因组 DNA 中, 这种反相重复序列的数目和间隔的长短不同, 就可导致这些特定的结合位点分布发生相应的变化, 而使 P CR 扩增产物增加、减少或发生分子量的变化。通过对 P CR 产物的检测( 扩增产物以琼脂糖凝胶电泳分离, EB 染色,紫外灯下测视, 拍照。) 和比较, 即可识别这些物种基因组 DNA 的扩增多态性片段。Williams[ 1] 等已用实验证明这种短的随机引物可用于扩增从低等到高等各种生物的基因组 DNA, 并已证明这种多态性是按孟德尔方式遗传的, 因而可以用此作遗传标记, 研究物种的亲缘关系。

RAPD和SSR

RAPD 标记技术。

为了克服RFLP 技术上的缺点,Williams等于1990 年建立了随机扩增多态DNA (Randomamplified polymorphic DNA ,RAPD) 技术,由于其独特的检测DNA 多态性的方式使得RAPD 技术很快渗透于基因研究的各个领域。

RAPD 是建立于PCR 基础之上的分子标记技术,基本原理是利用一个随机引物(8～10 个碱基) 通过PCR 反应非定点地扩增DNA 片段,然后用凝胶电泳分离扩增片段来进行DNA 多态性研究。

对任一特定引物而言,它在基因组DNA 序列上有其特定的结合位点,一旦基因组在这些区域发生DNA 片段插入、缺失或碱基突变,就可能导致这些特定结合位点的分布发生变化,从而导致扩增产物的数量和大小发生改变,表现出多态性。

优点：与RFLP 相比,RAPD 技术简单,检测速度快,DNA 用量少,实验设备简单,不需DNA 探针,设计引物也不需要预先克隆标记或进行序列分析,不依赖于种属特异性和基因组的结构,合成一套引物可以用于不同生物基因组分析,用一个引物就可扩增出许多片段,而且不需要同位素,安全性好。

缺点：当然,RAPD 技术受许多因素影响,实验的稳定性和重复性差,首先是显性遗传,不能识别杂合子位点,这使得遗传分析相对复杂 ,在基因定位、作连锁遗传图时,会因显性遮盖作用而使计算位点间遗传距离的准确性属特异性和基因组的结构,合成一套引物可以用于不同生物基因组分析,用一个引物就可扩增出许多片段,而且不需要同位素,安全性好。

当然,RAPD 技术受许多因素影响,实验的稳定性和重复性差,首先是显性遗传,不能识别杂合子位点,这使得遗传分析相对复杂 ,在基因定位、作连锁遗传图时,会因显性遮盖作用而使计算位点间遗传距离的准确性下降;其次,RAPD 对反应条件相当敏感,包括模板浓度、Mg2 +浓度,所以实验的重复性差。

SSR 标记技术。

在真核生物基因组中存在许多非编码的重复序列,如重复单位长度在15～65 个核苷酸的小卫星DNA(Minisatellite DNA) ,重复单位长度在2～6 个核苷酸的微卫星DNA (Microsatellite DNA) 。

分子生态学课程论文：分子标记在食用菌研究中的应用

分子标记在食用菌研究中的应用摘要：分子标记技术的应用日趋广泛, 在食用菌研究中具有重要的利用价值。

本文对DNA 分子标记RAPD、SRAP、ISSR、SCAR等方法的原理、特点和其在食用菌遗传多样性鉴定方面的研究进展进行了重点阐述。

关键词：RAPD、SRAP、ISSR、SCAR、食用菌分子标记的概念有广义和狭义之分。

广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。

狭义的分子标记仅仅是指DNA标记，是能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段，是DNA水平遗传多态性的直接反映，一般所称的分子标记即被界定在此范围之内[1]。

与遗传标记的其他三种类型——形态学标记、生物化学标记、细胞学标记相比，DNA 分子标记具有其独特的优越性，它是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传变异的直接的反映，并不受生物生长发育环境和基因表达与否的影响。

大多数分子标记为共显性，对隐性性状的选择十分便利；基因组DNA变异极其丰富，分子标记的数量几乎是无限的；遗传稳定，对生物体的影响表现为中性，不影响目标性状的表达，与不良性状无连锁；检测手段简便。

这些特性为生物标记的广泛应用性奠定了基础[2-3]。

随着分子生物学的发展，DNA分子标记技术已有数十种，广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。

而DNA分子标记技术在食用菌研究中，主要应用于遗传育种、菌种的分类与鉴定、物种亲缘关系的鉴别、遗传多样性分析、基因定位和克隆等研究中。

本文综述了几种DNA分子标记的原理、特点及其在食用菌研究中的应用。

1 随机扩增多态DNA（RAPD）RAPD（Random Amplified Polymorphic DNA，即随机扩增多态DNA）是1990 年由Willams[4]和Welsh[5]两个研究小组几乎同时建立和发展的一种可对整个未知序列的基因组进行多态性分析的分子遗传标记技术。

分子标记在药用植物资源鉴定中的应用

论文成绩学年论文2014 — 2015年度学年论文题目：分子标记在药用植物资源鉴定中的应用学生姓名：***学号： ********** 系部：生命科学专业：生物科学指导教师：***2014年9月25日分子标记在药用植物资源鉴定中的应用郭孟齐 1212402006摘要：目前在研究药用植物资源鉴定的技术手段中，分子标记技术应用的愈来愈多。

而分子标记又分为很多种技术，如RFLP、RAPD、SRAP、AFLP等。

本文就这几种分子技术在药用植物资源鉴定中的应用进行了探讨，发现RAPD技术占有独特的优势，而RFLP、AFLP等技术由于种种因素的限制，应用的范围很有限，SRAP技术作为一种新型的分子标记技术，正在药用植物资源鉴定中发挥着越来越重要的作用。

关键词：分子标记，药用植物，鉴定Application of molecular markers in identificating medicinal plant resourcesAbstract:At present ,in the technology of identificating medicinal plant resources , applicating of molecular marker technology is becoming more and more popular. Molecular marker is divided into many kinds of technologies, such as RFLP, RAPD, SRAP, AFLP etc. In this paper, application of this technology in the identification of several molecular medicinal plant resources are discussed.And it found that RAPD technology occupies a unique advantage while RFLP, AFLP and other technical are limited due to various factors. SRAP technology as a new molecular marker technique is playing a more and more important role in medicinal plant resources of identification.Key Words: Molecular markers, Medicinal plant,Identification我国的药用作物种类繁多，目前知道的有一万多种，分布区域也十分广泛【1】。

SRAP 分子标记及其应用

SRAP分子标记及其应用张安世,邢智峰,刘永英,张为民(焦作师范高等专科学校生物系,河南焦作454001)摘要相关序列多态性(SRAP)是近年来发展起来的一种新型分子标记系统,具有简便、稳定、中等产率、高共显性、易于测序等优点。

它利用独特的引物设计对O RF s进行扩增,正、反引物分别与外显子和内含子(或启动子)区域配对,因不同物种、不同个体的内含子、启动子与间隔区长度不等而产生多态性。

SRA P-P CR扩增程序采用复性变温法,前5个循环复性温度为35℃,后35个循环为50℃。

目前SRA P已在植物图谱构建、遗传多样性评价、基因定位和比较基因组学等方面成功应用。

关键词SRA P;分子标记;O R F s;P CR中图分类号Q75文献标识码 A 文章编号0517-6611(2007)09-02562-021974年G rod z ik er创立了RF LP技术,B o ts te in等[1]首先利用此项技术于1980年构建了人类遗传连锁图谱,从此开创了分子标记技术的新纪元。

目前,已经建立的DN A分子标记技术有十多种,常用的有限制性片断长度多态性(R FL P)、随机扩增多态性(RA PD)、内部简单重复序列(IS SR)、扩增片断长度多态性(AF LP)、微卫星DN A又称简单重复序列(S SR)、简单序列长度多态性(S S LP)、酶切扩增多态性序列(CA P S)、单核苷酸多态性(SN P)、相关序列扩增多态性(S RA P)等,它们已在动、植物和微生物等学科中得到了广泛的应用,并取得了令人瞩目的进展。

其中SRA P是一种基于PCR的新型标记,由美国加州大学作物系L i等[2]于2001年在研究芸薹作物时开发出来的。

它独特的引物设计使其可检测基因的可阅读框(OR F)区域,是一种无需任何序列信息即可直接PCR 扩增的新型分子标记技术,它既克服了RA PD重复性差的缺点,又克服了A FL P技术复杂、成本昂贵的缺点,以其操作简便迅速、成本低、可靠性好、重复性高、易于测序等特点迅速被各国分子生物学家所接受。

SRAP、ISSR和RAPD分子标记技术在银耳菌株鉴别上的应用

ＳＲＡＰ、ＩＳＳＲ和ＲＡＰＤ分子标记技术在银耳菌株鉴别上的应用选用4个银耳（TremellafuciformisBerk.）菌株T6、T7、T8和T9，应用SRAP、ISSR和RAPD标记法探讨分子标记技术在银耳菌株鉴定上的适用性。

结果表明，实验范围内12对SRAP引物，10条ISSR引物，8条RAPD引物适合银耳菌株鉴定分析。

3种标记法的鉴别结果一致,都将4个银耳菌株分成3组，T6，T8，T7和T9。

分析结果比较表明，RAPD引物扩增到的多态性条带最多，4个银耳菌株遗传相似性平均值为81.34％。

SRAP标记反映的遗传信息最丰富，遗传相似性平均值为68.98%。

ISSR所反映的遗传信息介于前两种标记之间，遗传相似性平均值为77.48%。

SRAP；ISSR；RAPD；银耳S567.34ADNA分子标记技术是基于生物个体间或种群间基因组DNA某一片段的不同而反映生物个体或种群间的差异，被广泛应用于遗传多样性分析,系统发育分析，遗传图谱构建，基因定位及克隆，分离菌株的鉴定等方面［1］。

20世纪80年代出现的限制性长度多样性（RFLP）和90年代出现的随机扩增多态性DNA（RAPD），已广泛应用到香菇（Lentinulaedodes）［2］、草菇（V olvariellavolvacea）［3］、木耳（Auriculariaauricula）［4-6］、金针菇（Flammulinavelutipes）［7］、侧耳属（Pleurotus）菌种［8，9］、（松口蘑Tricholomamatsutake）［10］、双孢蘑菇（Agaricusbisporus）、大肥菇（Agaricusbitorquis）［11］和灵芝（Ganodermalucidum）［12］等食用菌遗传多样性、菌株鉴别和育种研究中。

1993年，PARAN和MICHELMORE将RAPD标记转化为SCAR标记更有效地进行菌株区分。

吴学谦等［13］由RAPD开发出SCAR标记对香菇菌株进行快速鉴定，获得了所试菌株特异SCAR标记。

几种森林大型真菌纯培养菌种的RAPD及ITS分子标记鉴定

（．ＺｅａｇＦｒｔｃｄｍＨｎｚｏ１０３．ＬｈｉｄｂｕｇｌｅｓａｈａｄＤｖｌｍｎＣｒｒＬｈｉ２００１ｈｎｏｓ）Ａａｅｙｉｆｅｒａｇｈｕ３０２；２ｉｕＥｉｅＦｎａＲａｅｒｎｅｏｅｔｅｔｉｕ３３０）ｓｌｃｅｐｒｅｓ
ｓｕｙ．Ｔｅｅｍｉｅｗｅｔｅｈｓｌｔｓｆｏｔｓｅｉｏａｉｎｗｅｅｔｅｒｏｕｅｃｌｒｓｏｏ，ＲＡＰｌｃｌｒｍａｋｒｗａｔｄｏｄｔｒｎｈａｈｒｔｅｉｏａｅｍｉｕｓｌｔｒｈｉｗｎｐｒｕｔｅｒｎｔｒｓｏｕＤｍｏｅｕａｒｅｓ
ｕｅｏａａｙｅｔｅｇｎｔｅａｉｎｈｐｍｏｇ５ｆｉｂｄｅｎｈｉｏｓｌｔｓｎｈｉｅｅｃｓｏｈｅｕｎｅｆＩＳｓｄｔｎｌｓｈｅｅｉｒｌｔｓｉｓａｎｕｔｏｉｓａｄｔｅｒｗｎｉａｅ，ａｄｔｅｄｆｒｎｅｆｔｅｓｑｅｃｓｏＴｃｏｉｏｆ
李海波吴学谦
（．江省林业科学研究院１浙
魏海龙
付立忠
吴庆其
杭州３０２；．１０３２浙江益圣菌物发展有限公司丽水３３０）２００
摘要：以采自野外的４对外生菌根菌和１对木腐菌的子实体及其各自的组织分离菌株作为研究材料，用运

利用RAPD、SSR及ISSR鉴定西葫芦种质资源亲缘关系的研究的开题报告

利用RAPD、SSR及ISSR鉴定西葫芦种质资源亲缘关系的研究的开题报告一、研究背景西葫芦属于葫芦科，是我国的重要蔬菜之一。

其果实肉质肥厚、口感鲜美，含有多种维生素和矿物质，是消费者较为喜爱的蔬菜之一。

因此，其品种选育及种质资源的鉴定和利用，对于推动我国蔬菜产业的发展和提高蔬菜品质具有重要意义。

RAPD、SSR和ISSR是基于DNA分子的PCR技术，可以用来快速识别遗传多样性和亲缘关系。

这些技术已广泛应用于植物遗传研究中。

二、研究目的本研究旨在利用RAPD、SSR和ISSR技术对不同西葫芦种质资源的遗传多样性和亲缘关系进行分析，为西葫芦种质资源的鉴定和选育提供信息基础。

三、研究内容1. 收集西葫芦种质资源，并进行形态特征分析。

2. 设计RAPD、SSR和ISSR引物，并进行PCR扩增。

3. 对扩增产物进行聚合物酶链式反应 (PCR) 产物的多态性分析。

4. 利用聚类分析等统计方法对不同种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。

四、研究意义通过RAPD、SSR和ISSR技术鉴定西葫芦种质资源的亲缘关系，可以深入了解西葫芦的遗传背景，为种质资源的收集、保护、利用和管理提供依据。

同时，也可为西葫芦的品种改良和选育提供参考，加快新品种的推广和应用。

五、研究方法1. 材料：收集不同种类的西葫芦种质资源；2. 方法：通过形态特征、RAPD、SSR和ISSR技术对不同种质资源进行分析。

六、研究进度安排1. 前期调研和文献阅读：1个月。

2. 西葫芦种质资源的收集和形态特征分析：2个月。

3. RAPD、SSR及ISSR引物的设计和PCR扩增：3个月。

4. PCR产物的多态性分析及聚类分析：2个月。

5. 结论与论文撰写：1个月。

七、预期结果通过研究RAPD、SSR和ISSR在西葫芦遗传多样性研究中的应用，可以对不同西葫芦种质资源的遗传多样性和亲缘关系进行准确、科学的鉴定。

同时，也可以为西葫芦品种改良和资源利用提供参考，促进西葫芦产业的发展和蔬菜的优质化、高效化、可持续发展。

基于RAPD和EST-SSR标记的秀珍菇菌株聚类分析

基于ＲＡＰＤ和ＥＳＴ－ＳＳＲ标记的秀珍菇菌株聚类分析摘要：本研究利用RAPD标记和EST-SSR标记对10个不同来源的秀珍菇菌株进行聚类分析。

200条RAPD引物中127条有扩增产物，引物可用率为63.5%。

从NCBI数据库中下载秀珍菇及相近侧耳属食用菌EST序列2167条，聚类比对后得到全长为713.541 kb的非冗余EST 1442条,搜寻后得到的29个EST-SSR全部设计引物，其中26对引物(89.7%)显示多态性。

根据l7条RAPD核心引物和10对EST-SSR核心引物的扩增结果，对10个秀珍菇菌株进行了RAPD标记、EST-SSR标记及二者相结合的聚类分析。

3种分析结果相近，且与菌丝、子实体生长特性分析结果相统一10个供试菌株区分为5组：1～4号菌株为一组，6号和7号菌株为一组，8号和9号菌株为一组，5号和10号菌株各自为一组。

关键词：秀珍菇;RAPD标记;EST-SSR标记;聚类分析文献标识码：S646.1A秀珍菇(Pleurotus geesteranus)隶属于真菌门(Eumycota), 担子菌纲(Basidiomycetes), 伞菌目(Agaricales),侧耳科(Pleurotaceae), 侧耳属(Pleurotus)，是近年来栽培面积最广的珍稀食用菌之一。

该菌味道鲜美，营养丰富，深受广大消费者的青睐。

菌种作为食用菌最重要的基础生产资料，其收集、保存、遗传多样性评价以及利用，已成为遗传育种领域中一个重要的研究方向。

但目前，国内秀珍菇经常出现异种同名或同种异名现象，造成菌种混乱，严重影响了产业发展。

近年来分子标记的发展及应用大大推动了种质资源材料间的遗传学关系分析和资源利用研究,通过分子标记揭示出的不同物种DNA分子水平上的多态性可反映出生物物种间甚至种内的遗传多样性。

目前国内外文献中，已有大量关于分子标记在香菇、双孢蘑菇等真菌上进行遗传多样性和亲缘关系分析的报道，主要应用的标记类型有RAPD、RFLP、IGS和ISSR［1］，也有用SCAR标记的报道［2］。

几种中国栽培灵芝品种的RAPD及rDNA分子标记鉴定

几种中国栽培灵芝品种的RAPD及rDNA分子标记鉴定黄浩;许国权;周世力【摘要】以常见几种中国栽培灵芝菌株为研究材料,运用RAPD、18SrDNA和ITS 3种分子标记来分析各灵芝菌株之间的亲缘关系,同时比较3种分析结果,探索适于灵芝属研究的技术方法.RAPD分析结果表明,6种菌株在相似性系数为0.584的水平上聚为3类:Ganodermaluidun、GanodermaluidumHG、Ganodermasinenses和Ganodermaatrum为一类；Xuezhi和Coriolusversicolor各单归为一类.ITS分析结果显示,灵芝菌株间相似性较低(43.8％～88.0％),其中Ganodermasinenses和Xuezhi的相似性为43.8％,在较低相似性水平上,Ganodermaluidun和Ganodermasinenses归为一类,Coriolusversicolor和Xuezhi各单归为一类,这与RAPD分析结果一致,也与传统分类结果基本一致.18SrDNA分子标记显示的结果与前两种分析结果有很大差异,说明18SrDNA分子标记并不适合灵芝属的分类研究.【期刊名称】《江汉大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2013(041)002【总页数】5页(P70-74)【关键词】灵芝;亲缘关系;随机扩增多态性DNA;ITS;18SrDNA【作者】黄浩;许国权;周世力【作者单位】江汉大学生命科学学院,湖北武汉430056;江汉大学生命科学学院,湖北武汉430056;江汉大学生命科学学院,湖北武汉430056【正文语种】中文【中图分类】R931.5;S567.31灵芝（Ganodermalucidum）是一种著名的药用真菌，对其生物学功能的研究推动了灵芝产业的发展，我国真菌登记分类还未成体系，因为菌种问题而造成了管理混乱、产品质量不稳定等问题［1］。

传统的分类鉴定主要依据子实体的形态学特征来进行，但是由于生长条件的不同导致子实体的形态学特征发生变化，一些鉴别性特征在不同种属间的差异较小，这是传统分类学的一个弊端［2］。

秀珍菇诱变菌株的RAPD鉴定

秀珍菇诱变菌株的RAPD鉴定摘要：秀珍菇营养丰富、味道鲜美，目前已在福建、浙江及上海等地广泛栽培。

目前秀珍菇主栽品种仍是多年前从台湾引进的秀珍菇系列品种，有的品种经多年组织扩繁后出现退化和老化现象。

前期，福建农林大学国家菌草工程技术研究中心同福建省农科院专家合作开展了60Co辐射诱变选育秀珍菇新品种的研究，筛选到部分疑似突变菌株。

本文利用RAPD技术对新菌株进行了分子生物学鉴定。

结果表明，RAPD引物S36、S66、S78、S1200、S1208扩增效果好，F69、F43、F5669与原始菌株台秀57和福建省认定的秀珍菇品种秀迪1号在DNA水平存在差异，是3个新的菌株。

关键词：秀珍菇；诱变；育种；RAPD；食用菌引言：秀珍菇，学名为肺形侧耳（Pleurotus pulmonarius），隶属担子菌纲，伞菌目，侧耳科，侧耳属。

秀珍菇不仅营养丰富，而且味道鲜美，蛋白质含量比双孢蘑菇、香菇、草菇更高，质地细嫩，纤维含量少，口感脆嫩。

秀珍菇由中国台湾命名、开发并商业栽培，目前已在福建、浙江及上海等地广泛栽培[1]。

目前秀珍菇主栽品种仍是多年前从台湾引进的秀珍菇系列品种，有的品种经多年组织扩繁后出现退化和老化现象[2]。

前期，福建农林大学国家菌草工程技术研究中心课题组同福建省农科院专家合作开展了60Co辐射诱变选育秀珍菇新品种的研究，筛选到部分疑似突变菌株。

与传统的形态学相比，分子标记具有遗传稳定、不受环境因素影响等特点，常用的DNA标记技术有RAPD、AFLP、SSR、SNP 等多种。

其中，RAPD 是发展历史长，应用最早最为简易方便的DNA 标记技术。

本研究利用RAPD技术对新菌株进行了分子生物学鉴定。

1 材料与方法1.1菌株台秀57（对照菌株）、秀迪1号(福建省认定的秀珍菇新品种)和突变菌株F69、F43、F5669。

1.2菌丝培养PDA斜面培养基：200 g马铃薯、20 g葡萄糖、20 g琼脂、1000 ml水，pH自然；PDA液体培养基：200 g马铃薯、20 g葡萄糖、1000ml水，pH自然。

rapd分子标记及其在寄生虫学研究中的应用

rapd分子标记及其在寄生虫学研究中的应用
rapd分子标记是一种生物技术，主要用来检测和识别生物的遗传多样性。

在近几十年里，随着科学技术的发展，rapd分子标记在寄生虫学研究中得到了广泛应用。

Rapd分子标记通过用一系列短片段对基因组进行多次扩增，
从而获得特定基因型的杂合体细胞。

这种技术可以快速检测和识别生物的遗传多样性。

这不仅大大提高了研究成果的可靠性，而且可以将研究中用到的技术和结果更好地与其他研究融合起来，使研究更加系统化。

在寄生虫学中，rapd分子标记的应用可以帮助研究人员更准确地研究寄生虫的种群遗传结构和进化史，以及它们在有害因素下的变异。

这一技术也可以用来探究其他领域中寄生虫形态、发育、生理等方面的研究。

比如，研究人员可以使用RAPD
来识别特定种群中的基因座，以研究其在有害环境和其他环
境中的特殊行为。

此外，rapd分子标记技术还可以用来研究植物寄生虫的形态学特征，从而有助于辨认和识别新虫种。

RAPD可以提供一种定
性的指纹，可以较为准确地判断样品是否存在多个虫种，从而有助于植物害虫的监测和防治。

综上所述，rapd分子标记技术在寄生虫学研究中有着非常重要的作用。

它不仅可以提高研究的准确度和完整性，而且可以帮助研究者准确地识别和辨认寄生虫的特征，加深对其特征的了解，从而有助于植物保护。

真姬菇子实体ITS序列和RAPD分析

真姬菇子实体ITS序列和RAPD分析李挺;宋斌;叶运寿;王晓亮【摘要】为真姬菇种质资源的评价和遗传育种提供分子水平的依据和基础,采用内转录间隔区(ITS)序列和RAPD技术分析了真姬菇不同子实体的遗传差异.结果表明:供试的5个白玉菇子实体和1个蟹味菇子实体ITS序列长度均为594bp,与已报道的真姬菇菌株ITS序列相似度为99％以上;供试的6个子实体间的遗传相似度变化范围为0.4123～0.6354;采用ITS方法能在物种水平上稳定地识别真姬菇,但不能有效区分白色白玉菇和褐色蟹味菇等不同真姬菇品系之间的差别.建议,对存在争议的真姬菇生产品种进行鉴定时,ITS分析可以先在种的水平上进行鉴定,种内不同品种(或品系)的鉴定需采用其他分子标记技术.%The genetic difference between different H. Marmoreus fruit bodies was determined by using ITS sequence and RAPD analysis method to evaluate its germplasm resources and to provide the molecular level basis for its genetics and breeding. The results showed that the ITS sequence length of five white H. Marmoreus and one H. Marmoreus was all 594bp and its sequence similarity to reported H. Marmoreus ITS sequence was above 99%. The genetic distance among six tested samples ranged from 0. 412 3 to 0. 635 4. ITS analysis could identify H. Marmoreus at the species level, but could not identify difference in different H. Marmoreus lines. Therefore, difference between different H. Marmoreus varieties (lines) should be identified by other molecular marker techniques.【期刊名称】《贵州农业科学》【年(卷),期】2011(039)012【总页数】4页(P5-8)【关键词】真姬菇;内转录间隔区(ITS);随机扩增多态性DNA(RAPD)【作者】李挺;宋斌;叶运寿;王晓亮【作者单位】广东省微生物研究所,广东省菌种保藏与应用重点实验室,广东省微生物应用新技术公共实验室,广东省华南应用微生物重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地,广东广州510070;广东省微生物研究所,广东省菌种保藏与应用重点实验室,广东省微生物应用新技术公共实验室,广东省华南应用微生物重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地,广东广州510070;韶关市星河生物科技有限公司,广东韶关512136;中国科学院微生物研究所,真菌学国家重点实验室,北京100101【正文语种】中文【中图分类】S759.81真姬菇〔Hypsizygus marmoreus(Peck)H.E.Bigelow〕在分类上属于真菌界(Fungi)、担子菌门(Basidiomycota)、伞菌纲(Agaricomycetes)、伞菌目(Agaricales)、离褶伞科(Lyophyllaceae)、玉蕈属(Hypsizygus)，自然分布于中国、日本、欧洲、北美洲等地[1-2]，其外形美观，质地脆嫩，味道鲜美，因具有海蟹味又称为海鲜菇或蟹味菇，是中国食用菌工厂化生产的重要品种之一，也是具有多种保健功效的珍稀食用菌。

用ITS和ISSR分子标记技术鉴别香菇生产用种

用ITS和ISSR分子标记技术鉴别香菇生产用种秦莲花;宋春艳;谭琦;陈明杰;潘迎捷【期刊名称】《菌物学报》【年(卷),期】2006(25)1【摘要】通过选用香菇生产中存在名称争议或者名称相近或者同一名称但长期在不同地区栽培的12株香菇生产菌株,以及用于种水平对比的豹皮香菇Lentinuslepideus和虎皮香菇Lentinustigrinus的4个菌株,共16个菌株作为供试材料,进行ITS和ISSR遗传分析,并用RAPD技术验证试验结果.结果证明,不同种的ITS长度存在差异,再次证明ITS可以有效区别种之间的菌株;在ISSR的菌株水平分析中,香菇种内材料拥有两个共同的条带,与其他两种菌株的带型图谱有着明显差异,其中5对材料的带型图谱极为相近.RAPD验证结果与上述结果相近.由此可见,结合ITS与ISSR技术是可以用作香菇生产菌株鉴别的,这为ITS和ISSR分子标记技术推广应用于香菇生产菌株的快速准确鉴别提供了技术依据.【总页数】7页(P94-100)【作者】秦莲花;宋春艳;谭琦;陈明杰;潘迎捷【作者单位】南京农业大学生命科学学院,南京,210095;上海市农业遗传育种重点开放实验室,上海市农业科学院食用菌研究所,上海,201106;南京农业大学生命科学学院,南京,210095;上海市农业遗传育种重点开放实验室,上海市农业科学院食用菌研究所,上海,201106;上海市农业遗传育种重点开放实验室,上海市农业科学院食用菌研究所,上海,201106;上海市农业遗传育种重点开放实验室,上海市农业科学院食用菌研究所,上海,201106;上海市农业遗传育种重点开放实验室,上海市农业科学院食用菌研究所,上海,201106【正文语种】中文【中图分类】Q939.96【相关文献】1.SRAP、ISSR和RAPD分子标记技术在银耳菌株鉴别上的应用 [J], 曲绍轩;高山;黄晨阳2.ISSR分子标记技术在植物中的应用及其研究进展 [J], 邱国俊; 程敏; 郭计华3.ISSR分子标记技术在植物中的应用及其研究进展 [J], 邱国俊; 程敏; 郭计华4.ISSR分子标记技术在作物遗传育种中的应用 [J], 牛姣姣5.ISSR分子标记技术在金针菇菌株鉴别中的应用 [J], 宿红艳;王磊;明永飞;刘林德因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。