蛋白检测系统软件设计说明书

合集下载

GenStarqPCR产品技术手册

GenStar qPCR 产品技术手册更快、更精、更准的qPCR 技术qPCR （Real-time PCR、Real-time quantitative PCR、实时荧光定量）技术，是指在反应体系中加入荧光染料，利用荧光信号积累，实时监测整个PCR 进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。

传统的PCR 方法，是对PCR 反应的终产物进行的分析。

而许多情况下，科研人员所感兴趣的是未经PCR 信号放大之前的起始模板量。

在这种需求下，qPCR 技术应运而生。

qPCR 技术与传统的终点PCR 方法相比有许多非常重要的优点：qPCR 使用的是灵敏度更高的荧光化合物，可以更为快速的获得结果，差异性更小； qPCR 可不开盖测定核酸，闭管化的方法可大大降低实验室污染的风险。

目前qPCR 在基因表达研究和临床疾病检测等领域已得到广泛应用，如转基因动植物检测、RNAi 基因失活率检测、病原微生物或病毒含量检测、癌症检测以及药物反应个体差异的遗传基础检测、基因差异表达、基因分型等。

qPCR 以其特异性强、灵敏度高、重复性好、反应速度快、定量准确、全封闭反应、自动化程度高等特点，成为国际公认的核酸分子定量的标准方法，受到越来越多科研工作者的青睐。

GenStar 多年以来在qPCR 产品的研发和生产上投入了大量的人力物力，为了让昔日价格昂贵的qPCR 系统对每个科学家来说都触手可及，让qPCR 这个生命科学的重要工具，更为广泛的应用于日常的实验中。

*GenStar 产品每种qPCR Mixture 都提供3种剂型，分别为单独提供ROX、已混有ROX 和已混有ROX II。

选择您的检测方法探针法增强型防污染增强型防污染两步法RT-qPCR抗体型防污染抗体型防污染抗体型抗体型增强型增强型染料法GenStar qPCR产品选择指南作为中国自主研发的生命科学品牌，GenStar对于满足中国科研人员的诉求等方面有着根深蒂固的执着。

DNAMAN软件中文说明书

DNAMAN软件中文说明书DNAMAN 是一种常用的核酸序列分析软件。

由于它功能强大，使用方便，已成为一种普遍使用的DNA 序列分析工具。

本文以DNAMAN 5.2.9 Demo version 为例，简单介绍其使用方法。

打开DNAMAN，可以看到如下界面：第一栏为主菜单栏。

除了帮助菜单外，有十个常用主菜单，第二栏为工具栏：第三栏为浏览器栏：在浏览器栏下方的工作区左侧，可见Channel 工具条，DNAMAN 提供20 个Channel，(如左所示：)点击Channel 工具条上相应的数字，即可击活相应的Channel。

每个Channel 可以装入一个序列。

将要分析的序列（DNA 序列或氨基酸序列）放入Channel 中可以节约存取序列时间，加快分析速度。

此版本DNAMAN 提供自动载入功能，用户只需激活某个Channel，然后打开一个序列文件，则打开的序列自动载入被激活的Channel 中。

本文以具体使用DNAMAN 的过程为例来说明如何使用DNAMAN 分析序列。

1．将待分析序列装入Channel（１）通过File Open 命令打开待分析序列文件，则打开的序列自动装入默认Channel。

（初始为channel1）可以通过激活不同的channel (例如：channel5)来改变序列装入的Channel。

（２）通过Sequence/Load Sequence 菜单的子菜单打开文件或将选定的部分序列装入Channel 。

通过Sequence/Current Sequence/Analysis Defination 命令打开一个对话框，通过此对话框可以设定序列的性质（DNA 或蛋白质），名称，要分析的片段等参数。

2．以不同形式显示序列通过Sequence//Display Sequence 命令打开对话框，如下图所示：根据不同的需要，可以选择显示不同的序列转换形式。

对话框选项说明如下：Sequence &Composition 显示序列和成分Reverse Complement Sequence 显示待分析序列的反向互补序列Reverse Sequence 显示待分析序列的反向序列Complement Sequence 显示待分析序列的互补序列Double Stranded Sequence 显示待分析序列的双链序列RNA Sequence 显示待分析序列的对应RNA 序列3．DNA 序列的限制性酶切位点分析将待分析的序列装入Channel，点击要分析的Channel，然后通过Restriction/Analysis 命令打开对话框，如下所示：参数说明如下：Results 分析结果显示其中包括：Show summary（显示概要）Show sites on sequence（在结果中显示酶切位点）Draw restriction map（显示限制性酶切图）Draw restriction pattern（显示限制性酶切模式图）Ignore enzymes with more than（忽略大于某设定值的酶切位点）Ignore enzymes with less than（忽略小于某设定值的酶切位点）Target DNA （目标DNA 特性）circular（环型DNA），dam/dcm methylation（dam/dcm 甲基化）all DNA in Sequence Channel（选择此项，在Sequence Channel 中的所有序列将被分析，如果选择了Draw restriction pattern，那么当所有的channel 中共有两条DNA 时，则只能选择两个酶分析，如果共有三个以上DNA 时，则只能用一个酶分析。

AKTA蛋白纯化系统操作

AKTA蛋白纯化系统操作AKTA蛋白纯化系统是当前蛋白纯化工作经常用到的一组设备，自动化程度很高。

AKTA系统依据不同的配置，可以分为AKTA EXPLORER、 AKTA PILOT、AKTA PURIFIER等多种型号的设备。

以下以AKTA EXPLORER为例简单介绍A KTA蛋白纯化系统的一般操作。

1、认识AKTA。

AKTA explorer 是为方法开拓及研究应用而设计的全自动液相色谱系统。

该色谱系统的分离装置有三个主要组件，在底部平台的左侧整齐堆起（Fig 1）。

它们是：FIG 1、AKTA EXPLORER主机• Pump-900 为双通道高效梯度泵系列。

在AKTAexplorer 100，流速范围0.01-100 ml/min，压力高达10 Mpa（泵名为P-901）。

在AKTA explore10，流速范围0.001-10 ml/min，压力高达25 Mpa（泵名为P-903）。

• Monitor UV-900，同时监控190－700 nm 范围内高达3 个波长的多波长紫外-可见（UV-Vis）监测器。

（针对部分AKTA PURIFIER机型，尚有UPC-900监测器可供选择，光源为汞灯光源，一次可以监控一个波长，安装滤光片后，可以在选择的波长范围内进行切换。

）• Monitor pH/C-900，在线电导和pH 监测的组合监测器。

Fig 2、AKTA EXPLORER硬件模式图AKTA EXPLORER系统的主要组成部件可以用模式图表示（Fig 2）。

组成部件，如混合器、柱及不同的阀安装在右边部分。

打开装阀的门可全部看到。

柱被挂在装阀的门的外侧。

分离装置由UNICORN 软件控制。

软件安装于一独立的电脑主机之中，在电脑与色谱系统之间的通信由数据采集装置CU950进行控制。

2、一般操作2.1 开机按位于底部平台前左侧的ON/OFF 按钮，打开色谱系统，然后打开电脑电源。

待仪器自检完毕（CU950上面的3个指示灯完全点亮并不闪烁）。

qsep400说明书

qsep400说明书Qsep400，Qsep400Advance高通量核酸蛋白分析系统，无需人工制胶、染色、加样、拍照，操作简便，可自动计算片段大小,结果美观易判断,可直接检测分析96孔板整板样本，最快可达1min/4样本,大幅度提高检测效率，显著降低实验成本可替代普通凝胶电泳，且结果更清晰准确。

产品特点系统类型:4通道全自动上样:可分析单个样本不浪费试剂，100个样本高通量上样，检测速度快，还可升级多板位模块，满足更高通量需求上样形式:直接兼容0.2mL离心管、8联管、12联管、96孔板等通量灵活:可单次分析单个样品，也可96个样品整板上样，无浪费抛弃式卡夹:无需制胶、灌胶，每套卡夹可分析400-1200个样品(DNA、RNA和Protein) 快速分析:可达1分钟内/4样品高灵敏度:1pg/uL高分辨率:最佳可达1-4bp(500bp以内)定量范围:DNA<50ng/uL，RNA<500ng/ul分离范围:15bp-50kb，可检测大于50kb的片段，最大可达165kb结果呈现:数字数据，凝胶成像图，毛细管电泳图软件分析:同时进行定性及定量分析，界面友好，操作人性化样品需求和消耗:最低样品需求体积1uL，上样体积小于0.1pL低成本:市场上极为经济的仪器与耗材Qsep400系列规格荧光检测连接方式:USBLED激发光源电源:100-240V便携式空气压缩机重量:26KG电压:1-15kv 尺寸:54x40x36cm传统凝胶电泳的实验流程Qsep400系列检测一步到位(PCR产物直接上样)Qsep400系列相对传统凝胶的优势全自动完成多步工作:无需配胶、倒胶、点样、跑胶、拍照;无需定时观测，安全无毒自动分析记录:无需人工计算浓度大小快速分析:1-5分钟完成原先近1小时的工作灵敏度和分辨率:1pg/uL,1-4bp(500bp以内)节约样本:仅消耗0.1L样本节约耗材用量:无需每次实验添加DNAladder,并节省大量手套、枪头和PCR管结果美观直接:多种结果呈现形式，美观直接，不会出现“边缘效应"应用小结应用领域应用实验遗传学研究蛋白分析STR/SSR微卫星分型DNA指纹图谱分析核酸蛋白互作AFLP/RFLP病原微生物检测或分型常规PCR产物检测高分辨率基因分型转基因动植物检测Genomic DNA质控高分辨率多重PCR分析食品安全分析NGS建库质控质粒DNA酶切，构造及纯度分析农渔业养殖ct/cf DNA质控合成引物（primer）分析各种疾病筛查，分子诊断总RNA、mRNA、片段化RNA、micro-RNA质控Qsep 400系列高分辨率结果1.8%琼指糖凝胶高分辨率:清楚分辨4碱基差异的238bp和242bp条带pBR322-Mspl digestQsep400系列的分辨率可高达1%。

XBridge BEH C4蛋白专用色谱柱说明书

XBridge BEH C 4, 300Å, 3.5, 5和10 µm 蛋白专用色谱柱能为生物大分子提供出色的峰形、极高的效率和良好的回收率，而这类生物大分子对于较小孔径或较长链键合相的色谱柱来说太大或疏水性太强而无法实现分离。

对填料基质和键合相的选择是为了在高pH 和低pH ，以及高温下均能提供出色的稳定性。

XBridge BEH C 4, 300Å蛋白专用填料在通过cGMP 和ISO9002认证的工厂采用超纯试剂制造而成。

每批XBridge BEH C 4反相蛋白专用色谱柱填料均已使用蛋白测试混合物进行鉴定，采用窄范围的技术指标进行质量控制，确保色谱柱的重现性能。

每一根色谱柱的柱效都进行了单独测试，并且每根色谱柱随附有性能测试色谱图以及合格证书。

II. 入门指南 a. 色谱柱安装b. 色谱柱平衡c. 初始柱效测定d. 对新色谱柱进行基准检查的实用性功能测试III. 色谱柱使用 a. 样品制备b. pH 操作限值c. 溶剂d. 压力e. 温度IV. 缩放分离V. 故障排除VI. 色谱柱清洗、再生和储存a. 清洗与再生b. 储存 VII. 将色谱柱连接到HPLCa. 色谱柱接头和系统管路注意事项b. 测量系统谱带展宽体积 VIII. 测量梯度系统体积(或驻留体积)[ 维护和使用手册 ]II. 入门指南每根XBridge BEH C4蛋白专用色谱柱均具有合格证书和性能测试色谱图。

合格证书为每批填料所特有，包括批号、未键合颗粒和键合颗粒的分析，以及色谱结果和检测条件。

性能测试色谱图为每根色谱柱特有，其中包含以下信息：批号、色谱柱序列号、USP理论塔板数、USP拖尾因子、保留因子和色谱条件。

这些数据应当保存以备将来参考。

a. 色谱柱安装注：下述步骤给出的流速用于4.6 mm内径色谱柱的典型3.5 ìm填料。

请根据将要安装的色谱柱内经，相应地按比例升高或降低流速。

Quantity One说明

功能强大的操作、分析软件“Quantity One”简介“Quantity One”是Bio-Rad公司图像系列产品的操作和分析软件。

主要用来定量和分析荧光、化学发光、放射性同位素、化学染色物标记的各种单向电泳、杂交点和条带、TCL 板、酶标板、培养皿的克隆斑等。

“Quantity One”能在Windows 98、Windows 95、Windows NT 4.0、Macintosh 9500（或更高）环境下运行。

窗口设计有下拉式菜单、图像工具栏、菜单操作提示栏等，界面设计十分友好、非常简单易学。

“Quantity One”的图像文件以Tiff文本格式输出，可以方便的进入其它的图像处理软件进行更深一步的图像处理和编辑。

同时，分析数据可以直接转入到Micro Excel,以报告形式排版、打印。

每套“Quantity One”软件都有相对应的进入密码(Unique Password)和软件狗(Hardware Protection keys)，并附有详尽的软件操作说明书。

1.“Quantity One”的运行程序打开操作界面输入操作指令，进行图像采集图像初步优化图像处理各种功能分析文字注解和打印格式2.“Quantity One”的主要功能和优势2.1“Quantity One”的图像采集功能步骤一：自动选择仪器的配置根据您的标记信号类型，“Quantity One”能自动选择激光波长和滤波片，使整个光路调整到适当的工作状态。

步骤二：选择扫描范围GelDoc2000提供的最大扫描面积为25cm×26cm，您可以根据样品放置的位置和大小，任意选择所需的扫描范围。

步骤三：扫描、采集图像GelDoc2000的扫描、采集图像和计算机成像同步进行，您可以随时从屏幕上观察到扫描的结果。

2.2“Quantity One”的分析功能及优势1．“Quantity One”的图像优化处理工具栏“Quantity One”的图像处理功能主要移植于Photoshop “Quantity One”可以进行背景噪音过滤，梯度背景扣除，背景灰度调节，图像的放大和缩小，图像旋转，图像修饰等图像优化和处理工作。

AKTA_Purifier中文操作手册

GE Healthcare实施您ÄKTApurifier的首次运行重要用户信息所有用户必须阅读整本手册以充分理解ÄKTApurifier的使用安全。

WARNING（警告）警告标识强调必须严格遵循指令以避免人身伤害。

在说明书完全弄懂和所有规定条件都具备后才能开始动手操作。

Caution（小心）小心标识用于引起注意以避免人身伤害，必须遵循指令和条件以避免毁坏产品和其它设备。

在说明书完全弄懂和所有规定条件都具备后才能开始动手操作。

Note（注意）注意标识用于指出对产品的无故障及最佳使用的重要信息。

CE证书产品符合适用于CE规定的所有要求。

相应合格证的复印件函索即寄。

CE标志和相应合格证对该仪器是有效的。

当仪器– 连接到其它标有CE标志的 GE Healthcare 仪器上，或，– 连接到本手册中推荐或所述的其它仪器上, 和，– 除了在本手册中提到的变更外，按 GE Healthcare 所提供的说明使用。

警告本产品为A类产品。

在局部环境下，本产品可能引起无线电干扰，在此情况下用户可能需要进行适当的测量。

销售条款和规定除非另有书面协议，在 GE Healthcare 集团供应范围内，所有售出货物和服务都服从公司的销售条款和规定。

这些销售条款和规定的复印件函索即寄。

如果您对本产品有任何意见，我们将乐意接受。

请寄往：GE HealthcareSE-751 84 UppsalaSweden商标水滴图样, ÄKTA, ÄKTApurifier, UNICORN and Superloop 均为 GE Healthcare 的商标。

Amersham 和 Amersham Biosciences 为 GE Healthcare 的商标。

.Windows为Microsoft Corporation 的注册商标。

办事处地址GE HealthcareSE-751 84 UppsalaSwedenGE Healthcare 香港办事处香港九龙望角亚皆老街8号朗豪坊办公大楼12楼电话：（852）2100 6314传真：（852）2100 6338GE Healthcare 北京办事处北京市经济开发区永昌北路1号电话：（010）5806 9689传真：（010）6787 1162邮编： 100176GE Healthcare 上海办事处上海市虹桥开发区兴义路8号万都中心2401室电话：（021）5257 4650－67337传真：（021）5208 1282邮编： 200336GE Healthcare 广州办事处广州市建设六马路33号宜安广场1212室电话：（020）8363 3828－67961，67956 传真：（021）8363 3291邮编： 510060800热线：800－810－9118© GE Healthcare Life Sciences 2003版权- 所有权利受保护目录1关于本指南 (5)1．1 必要条件 (5)1．2 印刷上的规定 (5)2系统和软件 (6)2．1 概论 (6)2．2 UNICORN综述 (9)2．3 帮助 (11)3 建立方法 (12)4准备运行系统 (15)4．1 系统连接 (15)4．2 系统的一般准备 (16)4．2．1充满入口管道 (17)4．2．2 充满样品环 (17)5开始运行 (18)6查看运行 (23)7查看和打印结果 (26)7．1 查看 (26)7．2 打印和生成报告 (29)8缓冲液制备 (32)9探索 (34)10进一步应用 (36)索引（略）简短说明 (38)注意：本手册所涉及内容以英文原版为准1关于本指南本指南是为不熟悉UNICORN™ 软件和ÄKTApurifier™的用户而写的。

综合序列分析软件BioEdit中文说明书

Minimum segment length (actual for each sequence): 15 Maximum average entropy: 0.2 Maximum entropy per position: 0.2 Gaps limited to 2 per segment Contiguous gaps limited to 1 in any segment
• 尤其值得一提是利用BioEdit能够十分方面地根据指定的核酸序列绘制相应的质粒图谱。
2
序列的常规操作：
序列输入：多种序列输入方式；序列分类：按标题、位置、定义、参数、注释等分类；成对排列：两序列的最佳排列及计算同一性和类似性；序列屏蔽：仅采用联配中部分区域进行分析而排除其他。核酸分析：组成、互补、反转、翻译、质粒、限制性内切酶；蛋白质分析：氨基酸成分、疏水性轮廓、疏水力矩平均数翻译或反翻译：把DNA或RNA翻译成蛋白质；切换翻译：在核酸和编码蛋白质序列中切换核苷酸序列；点图[成对比较]：相互比较两序列的矩阵，生成一个点图。
综合序列分析软件综合序列分析软件bioeditbioeditbioeditbioedit?bioedit是一个性能优良的免费的生物序列编辑器可在windows9598nt2000中运行它的基本功能是提供蛋白质核酸序列的编辑排列处理和分析
综合序列分析软件 BioEdit
2003级高芳銮
1
BioEdit简介
13
二、Restriction Maps(限制性内切酶图)
BioEdit提供两种方法产生核苷酸序列的限制性内切酶图。一种内在的限制性内切酶图功能允许产生序列最多为65,536个核苷酸的限制性内切酶图。实际上，只能检测大约35Kb，而且在速度慢的计算机上会要消耗很长的时间。

AKTA蛋白纯化系统操作

AKTA蛋白纯化系统操作AKTA蛋白纯化系统是当前蛋白纯化工作经常用到的一组设备，自动化程度很高。

AKTA系统依据不同的配置，可以分为AKTA EXPLORER、AKTA PILOT、AKTA PURIFIER等多种型号的设备。

以下以AKTA EXPLORER为例简单介绍AKTA蛋白纯化系统的一般操作。

1、认识AKTA。

AKTA explorer 是为方法开拓及研究应用而设计的全自动液相色谱系统。

该色谱系统的分离装置有三个主要组件，在底部平台的左侧整齐堆起（Fig 1）。

它们是：FIG 1、AKTA EXPLORER主机• Pump-900 为双通道高效梯度泵系列。

在AKTAexplorer 100，流速范围0.01-100 ml/min，压力高达10 Mpa（泵名为P-901）。

在AKTA explore10，流速范围0.001-10 ml/min，压力高达25 Mpa（泵名为P-903）。

• Monitor UV-900，同时监控190－700 nm 范围内高达3 个波长的多波长紫外-可见（UV-Vis）监测器。

（针对部分AKTA PURIFIER机型，尚有UPC-900监测器可供选择，光源为汞灯光源，一次可以监控一个波长，安装滤光片后，可以在选择的波长范围内进行切换。

）• Monitor pH/C-900，在线电导和pH 监测的组合监测器。

Fig 2、AKTA EXPLORER硬件模式图AKTA EXPLORER系统的主要组成部件可以用模式图表示（Fig 2）。

组成部件，如混合器、柱及不同的阀安装在右边部分。

打开装阀的门可全部看到。

柱被挂在装阀的门的外侧。

分离装置由UNICORN 软件控制。

软件安装于一独立的电脑主机之中，在电脑与色谱系统之间的通信由数据采集装置CU950进行控制。

2、一般操作2.1 开机按位于底部平台前左侧的ON/OFF 按钮，打开色谱系统，然后打开电脑电源。

待仪器自检完毕（CU950上面的3个指示灯完全点亮并不闪烁）。

Primer Premier使用手册中文版--教你如何使用软件设计引物

PrimerPREMIERVersion 5.0 for Windows and PowerMacintosh使用说明书PREMIERBiosoft International3786 Corina way,Palo Alto, CA 94303-4504电话650 856-2703传真650 843-1250电子邮件************************目录目录 (2)版权声明 (5)简介 (6)新版更新 (6)基础指南 (6)GENETANK 序列编辑 (7)GeneTank Window 序列编辑窗口 (7)查看序列 (7)打开已有序列 (7)创建新序列 (7)保存序列 (8)编辑序列 (8)查找 (8)查看不同链 (8)语音校读 (8)编辑序列比较结果 (9)序列粘贴窗口 (9)参数设置 (9)Rating Parameters 评分参数 (10)序列比较 (10)Alignment Parameters 序列比较参数设置 (10)序列翻译 (12)Edit Codon Table 窗口 (12)PRIMER 引物设计 (14)Primer Premier 引物设计窗口 (14)Direct Select 即点即选框 (14)在序列比较中应用即点即选功能 (14)性状列表 (15)二级结构. . . . . . .. . . . .. . . . . .. . .. . . . . . . .. . . . . . . . .. . . . . . . . . . .. . . . . .. . .. .. . . . . .. . . . . (15)Edit Primer 引物编辑窗口 (16)Search Criteria 搜索标准窗口 (16)Search Parameter 搜索参数窗口 (17)Automatic Search 自动搜索 (17)Manual Search 手动搜索及引物设计原理 (18)Search Results 搜索结果窗口 (20)Multiplex/Nested Primer 复式及巢式PCR反应引物窗口 (21)Database 引物数据库窗口 (21)Reports 分析报告 (22)Synthesis Order Form 合成订单 (22)Optical Activity 比吸光度 (22)Degeneracy 多义性 (23)Graphs 图表 (23)Restriction Enzyme Analysis 限制性内切酶分析 (24)Restriction Enzyme Analysis 限制性内切酶分析窗口 (24)Restriction Sites 酶切位点窗口 (24)Edit Enzyme 限制内切酶编辑窗口 (24)Filter 特征筛选窗口 (25)Motif Analysis 基序分析 (26)Motif Analysis 基序分析窗口 (26)Motif Sites 基序位点窗口 (26)Edit Motif 基序编辑窗口 (26)Menu Commands 菜单命令 (27)GeneTank 主菜单 (27)File (27)Edit (27)View (27)Search (27)Function (27)Translate (28)Window (28)Help (28)Primer 主菜单 (28)File.....................................................................................................Edit .................................………………........................................... Function.......................…………………..................................................... Report.................……………................................................................................ Graph..............………….................................................................................. Window...........……………….....................................................................................Help ...........………….......................................................................................Enzyme Results Menu 主菜单..........………………..................................... File...........................…………........................................................................... Function..............……………................................................................................ Window.........................…………….....................................................................Help ............................…………........................................................................Motif Menu 主菜单.................................................................................. File...........................……………........................................................................... Function..................………………......................................................................... Window.....................……………….........................................................................Help ........................................………………..........................................................附录 (30)附录A 公式法则…………….…………………………………………..........附录B 多义碱基表.………………..…………………………......................附录C 氨基酸缩写代码……….….………………………………..................附录D 软件上限...…………….…………………………….......................附录E 参考文献 (36)附录F 系统要求 (37)务与技术支持.............…………………………….............................................他信息...................…………………….....................................................者后记...................……………………….....................................................版权声明Copyright © 2000 by PREMIER Biosoft International. All rights reserved.Information in this manual may change without notice and does not represent a commitment on the part of PREMIER Biosoft International.The software described in this manual is provided by PREMIER Biosoft International under a License Agreement. The software may be used only in accordance with the terms of the agreement.PREMIER Biosoft International "Premier" claims copyright to this program and documentation as an unpublished work. Claim of copyright does not imply waiver of Premier's other rights.This program and documentation are confidential and the property of Premier. Use, examination, reproduction, copying, decompilation, transfer, and/or disclosure to others are strictly prohibited except by express written agreement with Premier.PREMIER Biosoft International 简称Premier 版权所有本说明书中的内容可以由Premier单方面更改而无需另行通知本说明中涉及的软件由Premier提供并应有书面授权软件的使用必须在授权范围之内该软件及相关文档作为一项未公开发表的工作其版权归Premier所有对版权的声明并非意味放弃其他权利该软件及相关文档是Premier的机密与财产除非有Premier的书面授权任何的使用检查再生产复制分割传递或/和解密行为均被禁止以上版权声明仅是原英文声明的翻译如有歧义应以原英文声明为准译者声明本软件说明书著作权归PREMIER Biosoft International 所有译者则保留中文翻译的相关版权并授权生物软件网共享发布该说明书的中文翻译本中文翻译仅限于软件使用者参考其内容如有歧义应以原英文说明书为准译者及生物软件网不承担由翻译打印网页等错误带来的直接和间接损失译者Wenkelly电子邮件*******************简介PRIMER PREMIER 是一种用来帮助研究人员设计最适合引物的应用软件利用它的高级引物搜索引物数据库巢式引物设计引物编辑和分析等功能可以设计出有高效扩增能力的理想引物也可以设计出用于扩增长达50kb以上的PCR产物的引物序列该软件主要由一下四个主要功能板块组成GeneTank 序列编辑Primer 引物设计Align 序列比较Enzyme 酶切分析Motif 基序分析新版更新种间交叉引物设计利用来自多个物种的序列设计扩增引物病理检测引物设计可用来在高保守区域设计引物等位基因特效引物设计专用于扩增某一类相关序列中特定成员的引物基础指南这段指南并非详细的说明仅为使用者对PRIMER PREMIER的菜单选项有一个直观的了解四个功能板块都有各自的窗口和菜单正在使用中的窗口就是您所见到的窗口以下列出了各功能板块的主要菜单选项GeneTank File, Edit, View, Search, Function, Translate, Window,Help.Primer File, Edit, Function, Report, Graph, Window, Help.Enzyme File, Function, Window, Help.Motif File, Function, Window, Help.使用功能菜单时该菜单所属的窗口就会被激活利用各菜单中的window选项记录的所有打开的窗口可以方便的在各个窗口之间进行切换所有的列表都有复选功能对于windows或Power Mac系统而言在点击同时按住CTRL键即可将当前的选择加入选单按住SHIFT键同时点击可以选择两次点击之间范围内的所有选项GeneTank利用GeneTank您可以打开DNA或者蛋白质序列也可以选择不同的阅读框架共三种将DNA翻译成蛋白质或利用蛋白序列反推出DNA序列为方便使用软件已经提供了普通密码子列表和几种线粒体密码子列表您也可以输入您自己的其他线粒体密码子列表序列编辑器提供了包括多媒体语言校读在内的完整的序列编辑功能这一功能板块包括以下部分GeneTank 打开浏览编辑及翻译序列Translation 将打开的序列翻译或反推成其他序列Edit Codon Table 编辑翻译所依据的密码子列表GeneTank窗口GeneTank的窗口用来显示序列及其文件题头信息序列可以3碱基10碱基一组显示您可以将打开的序列翻译或反推成其他序列您也可以使用通常的拷贝剪切和粘贴命令编辑当前序列GeneTank的窗口上也有启用Primer Align Enzyme Motif功能板块的快捷键查看序列点击相应按钮或从View菜单中选择您可以查看文件题头改变5 末端序列起始位置选择3碱基或10碱基一组的显示方式文件题头是指存在于序列文件中位于序列信息上游的文字内容点击header按钮或从View菜单中选择可以显示文件题头信息改变5 末端序列起始位置默认为1 序列将从您指定的5 位置开始显示序列可选操作View >Show HeaderView >GroupingView > 5’ Seq No 某些版本没有这一项打开已有序列使用菜单File >Open 可以激活文件选择对话框用来打开您希望处理的包含特定序列的文件如果序列文件是GenBank的标准格式PRIMER PREMIER会自动识别打开文件中的序列起始位置或是您曾经使用本软件菜单中File > Save命令以PRIMER PREMIER默认格式保存过该文件序列将自动打开如果打开其他格式的序列文件将出现一个可卷动的Import Sequence 窗口并显示全部序列在序列第一行的起始处双击则双击处以前的所有信息将被认为是文件题头然后PRIMER PREMIER会自动剔除非序列字符并将序列在GeneTank里打开创建新序列该项功能可以让您手动键入一个新的序列您可以键入任何DNA或蛋白序列并存在您指定的文件夹内并可以象其他如GenBank格式的文件一样进行操作Windows用户请注意默认设置的DNA序列文件后缀为SEQ 蛋白序列文件后缀为PRO 当然您可以使用其它的任何序列文件类型使用提醒如果您选错文件发现并没有您所希望的序列只需要关闭Import Sequence 窗口重来一次即可保存序列使用本软件保存的序列可以被软件自动识别而无需让您指出序列起始位置建议您在诸如以下情况保存序列您需要经常使用同样的序列您已经编辑完一段序列并希望保存结果您已经输入一段新序列编辑序列只需在GeneTank窗口内您就可以方便的编辑DNA或蛋白质序列而编辑翻译或原始序列十分方便在任一序列上的改变将会正确的反应到与之相关的其他序列例如如果你在一段蛋白序列上无论该序列是被翻译的或是用来反推DNA的原始序列删除一个氨基酸残基在相应DNA上的对应三位密码子将同时被删除但如果您改变一段翻译出的序列这一改变将仅仅在另一段由此翻译出的序列而不会出现在原始序列上编辑序列可以使用直接键入或利用剪贴板通常的剪切拷贝粘贴同样可以方便的在此使用其快捷键分别是CTRL-X, CTRL-C和CTRL-V软件提供三碱基一组的显示方式以利于蛋白相关的工作在键入DNA序列时可以使用A C G T或者附录B所列出的多义碱基在键入蛋白序列时可以使用附录C中所列出的氨基酸单字母记号可以从任何文本编辑器如记事本中的剪贴板中拷贝一段序列并将其粘贴进来当您完成编辑后请注意保存序列查找利用GeneTank窗口上的Find 按钮您可以从指针起始位置开始查找序列中一段特定字符查找到第一个后您也可以使用Find Next 按钮在余下的序列中继续查找使用Search 菜单选择Go To Position可以将指针移到您指定的位点可选操作某些版本在Edit菜单下Search >FindSearch >Find NextSearch >Go To Position查看不同链要查看该序列的互补链您只需要点击GeneTank窗口上的A按钮就会显示该序列的互补链此时互补而点击S按钮就能恢复成原来的序列您亦可点击dsDNA按钮以双链形式显示可选操作View > Sense StrandView > Anti-sense StrandView > ds DNA语音校读在GeneTank打开一段序列后您可以按下语言按钮启用语音校读功能序列将从指针所在的位置开始被依次朗读序列再次按下语音按钮将停止朗读按下键入朗读键将在键入的同时朗读输入的序列再次按下该按钮可以停止键入朗读可选操作Function > Speaker编辑序列比较结果当一项多序列比较完成后比较结果可以通过编辑来获得更准确的配对通常ClustalW法则能够给出一个准确的比较结果因而手工编辑并非必要但对于个别情况或出于特殊要求可能有这种需要所以本软件也提供这一功能将点击指针指向的碱基可以实施改动按下空格键可以插入一个空隙按下Delete键则可以删除一个空隙一旦比较结果被改动最大和最小同源性参数也会自动改变粘贴序列窗口这一窗口使得一段核酸序列通过选择以四种不同的方式粘贴上去9分别为正向As is 反向reversed 互补complemented 以及反向互补reverse complemented 这样便于从其他程序中粘贴序列而无需考虑其序列保存的方向参数设置Preferences 参数设置窗口可以改变本软件所使用的多种默认参数也可以允许您查看及更改引物评分参数设定二级结构在引物评分中所占的权重系数默认引物长度默认值为25默认引物长度在Primer Premier窗口使用即点即选功能时得到的引物长度该项参数也是Primer Premier窗口启动时的初始默认值这项数值可以设定为1到70个碱基引物对搜索最大值默认值为100在自动搜索引物时得到的结果数量可以很多由于该软件按照引物评分来衡量引物效率有些引物虽然合乎标准但评分较低可能没有全部列出的必要尽管我们设置了100对引物这一较大的数值您仍然可以改变该项参数为10到1000之间的任意值核酸浓度默认值为250 pM根据文献7 Freier等提供的计算公式这是没有自身配对时退火的寡聚核苷酸的总浓度它即不是引物浓度也不是起始模板浓度而是PCR产物的浓度由于在PCR过程模板的浓度变化很大很难确定具体数值根据文献11的建议Rychlik等一般经验公式在普通PCR 反应中将其当作250 pM 这项数值被用来计算引物的退火温度10单价离子浓度默认值为50 mM这项数值是指反应混合液中所有单价离子的总浓度游离Mg2+离子浓度默认值为1.5 mM这项数值是指反应混合液中充当辅基的Mg2+离子浓度总Na+当量这项数值是根据单价离子浓度和游离Mg2+离子浓度计算得来计算公式如下Sprt即取平方根总Na+当量单价离子浓度4 Sqrt 游离Mg2+离子浓度1000这项数值用来计算引物的退火温度自由能计算设置温度默认值为25 °C这项数值用来计算自由能G 自由能计算公式为G= H T S.评分参数Rating parameters 评分参数窗口是用来设定二级结构在引物评分中的权重系数二级结构越稳定引物评分就会越低相对于在引物中间形成的二级结构来说3 末端的二级结构对PCR扩增的影响会更大为了将这一效应计算在内软件将3 末端的二级结构的自由能数值G减去1 这一修正会使3 末端的二级结构显得更加稳定这一修正值是根据未公开实验结果制定的您可以根据自己的需要来更改软件只标注是引物二级结构中最稳定的一个自由能数值G 如果没有检测到二级结构则该数值为0序列比较这一部分仅在Primer Premier的Windows版本中使用对于Macintosh系统序列比较是提交到网上完成并下载比较结果在Primer的教程中有关于这方面的完整信息Align 序列比较窗口让您将已经打开的序列进行比较序列选择框显示所有将要比较的序列使用Add 和Delete 按钮可以增加一个序列或移除一个序列使用Options 按钮可以打开序列比较的参数设置窗口序列比较参数设置您可以利用Alignment Parameters 序列比较参数设置窗口来修正ClustalW法则用来优化比较结果的各项参数序列比较可以用两种模式完成一种准确但较慢slow/accurate一种快速但较粗略fast/approximate 选择不同的模式将会得到不同的结果SLOW/ACCURATE模式的序列比较参数这些参数无法改变序列比较的运行速度它们被用来对序列比较评分然后换算为百分比数值即最后显示的百分数并转化为进化树上的进化距离1 Gap Open Penalty 比较结果中一个空隙的罚分2 Gap extension penalty 比较结果中一个空隙每延长一碱基的罚分3 Protein weight matrix 这是描述氨基酸之间的相似性的评分标准4 DNA weight matrix 为核酸配对制定的评分标准包括IUB多义密码子11FAST/APPROXIMATE模式的序列比较参数这种同源性评分是由一种快速粗略的通用比较方法计算得来的它包括4项参数有两种方法用以快速获得序列比较结果1 只计算准确配对的部分k-tuples2 只计算最佳配对的情况K-TUPLE SIZE 这是默认的准确配对的片段长度增加这一数值可以提高运行速度对于蛋白序列最大值为2 对于DNA最大值为4 减少这一数值则可以增加灵敏度对于较长的序列例如大于1000字符您可能需要增加默认值GAP PENALTY 这是快速比较种每个空隙的罚分若非设定成很大的值对比较的速度影响不大TOP DIAGONALS 在一个虚拟的点划分分析法中需要计算的在每个对角线上使用的ktuple 配对数量在比较中只有最佳配对的情况才会被使用由这项参数指定其数量增加这一数值可以提高运行速度减少这一数值则可以增加灵敏度多序列比较参数这些参数控制最终的多序列比较每个多序列比较包括多个双序列比较的过程按照预定顺序依次进行相应的基本控制参数有两种空隙罚分gap penalty 以及位置同源或替代的权重系数scores for various identical/nonidentical residues1 和2 GAP PENALTY由菜单选项1和2控制它们设定空隙以及空隙长度造成的罚分增加空隙罚分可以减少比较结果中空隙的数量增加空隙长度的罚分可以使空隙更短末端的空隙不会被罚分3 DELAY DIVERGENT SEQUENCES 打开这一选项将会先比较同源性高的序列后比较同源性较低的序列该项数值即将特定同源性百分数设定为阀值低于该同源性的序列将会推迟比较4 The TRANSITION WEIGHT 为碱基转换A< >G或C < >T即嘌呤之间和嘧啶之间的替换设定从0到1的权重系数系数0意味将碱基转换看作一个完全的错配系数1意味将其看作一个完全的配对对于远源序列建议将其设置为0 而对于同源性较高的序列将这一系数适当增加会有好处5 PROTEIN WEIGHT MATRIX 该选项可以打开一个让你选择权重矩阵weightmatrices 的菜单对于蛋白质分析默认的矩阵是由Jorja和Steven Henikoff 创建的BLOSUM 系列矩阵请注意是使用一系列矩阵因为到底使用哪一个矩阵取决于序列之间的同源程度进化差异不同所使用的矩阵也不同6 DNA WEIGHT MATRIX 该选项打开一个菜单选择一个而不像蛋白分析那样是一系列核酸权重矩阵默认的一个是BESTFIT用来比较核酸序列的矩阵7 在权重矩阵中如果您愿意可以使用正值也可以使用负值如果不使用NEGATIVE MATRIX 负值权重矩阵选项系统将默认使用正值8 PROTEIN GAP PARAMETERS 蛋白序列空隙参数选项可以打开一个菜单让您可以设置蛋白序列比较结果的空隙罚分参数该选项仅在蛋白序列比较中可用更多信息如果您想得到关于设置参数和ClustalW法则的更多信息请从以下网址获取由原作者提供的完整文件www-igbmc.u-strasbg.fr/BioInfo/ClustalW/clustalw.html序列翻译激活序列在GeneTank窗口的一个列表框内显示了原始序列以及由它翻译出的其他序列12产生翻译序列的机制如下Translated DNA 从原始的蛋白序列推导DNA序列或由原始DNA翻译出蛋白序列再由蛋白序列反推出的DNA序列Translated Protein 从原始DNA翻译而成蛋白序列或原始蛋白序列翻译出DNA序列再由DNA序列反推出蛋白序列推导DNA按钮当前序列为原始或推导DNA时该按钮不可用当前序列为蛋白序列时点击该按钮将会激活一个Codon Table Selection窗口您可以选择密码子列表和阅读框架翻译结果中的多义碱基请参照说明书的附录可选操作Translate > To DNA翻译蛋白质按钮当前序列为原始或推导蛋白序列时该按钮不可用当前序列为DNA序列时点击该按钮同样将会激活Codon Table Selection窗口您可以选择密码子列表和阅读框架如果原序列中存在的多义碱基使密码子无法翻译成为蛋白残基该残基位点会用*号代替可选操作Translate > To ProteinEdit Codon Table窗口使用这一窗口您可以创造新的密码子列表删除或编辑已有的密码子列表但PRIMER PREMIER 提供的标准密码子列表是不能编辑的使用ADD 按钮创建新的密码子列表会使用标准列表并初始命名为<New Organism 某一数字> 使用Edit Codon Table Name对注意如果您多次翻译一段序列只有最后一次的翻译结果才能被保留而以前的翻译结果将被忽略13话框可以编辑列表名称使用DELETE 按钮则删除当前列表要改变某一密码子对应的氨基酸只需要用鼠标将其拖放到相应位置就可以点击密码子时鼠标指针会发生变化提示您正对其操作任何拖放操作会改变两行内容一行即某种氨基酸得到一个密码子的同时另一行失去这个密码子14Primer 引物设计Primer功能板块包括了设计引物的搜索引擎软件包含了强大的自动搜索法则只需要简单的操作就可以得到合适的引物PRIMER PREMIER也提供了人工控制搜索引擎的方法便于根据您的特殊要求制定标准输出的引物通过全面的即时分析工具计算出引物的多种参数和二级结构关键参数如T m值GC含量和自由能G还能以图形显示还有另一个窗口来显示引物的比吸光度activity 单位nmoles/OD和ug/OD 及引物的分子量还可以将当前引物输入数据库打印或填写引物合成定购单为设计用于定点突变的引物该项功能板块也提供包括即使分析和限制性酶切位点分析的引物编辑工具您可以通过输入碱基或氨基酸残基来手动修改引物为分析多对反应引物如在复式及巢式PCR中使用function菜单下Multiplex/Nested选项您可以分析所有想用到的引物可以选择事先搜索的引物或手动添加引物软件提供将引物储存到数据库的功能也提供填写引物合成定购单的功能定购单上会自动填入引物序列和其他重要信息该项功能板块由以下部分组成Preferences 参数设置窗口Primer Premier 引物设计窗口Edit Primer 引物编辑窗口Search Criteria 搜索标准窗口Search Parameter 搜索参数窗口Search Results 搜索结果窗口Multiplex/Nested Primer 复式及巢式PCR引物设计窗口Database 引物数据库窗口Synthesis Order Form 生成引物合成订单Reports 结果报告Graphs 图表Primer Premier 引物设计窗口Primer Premier 引物设计窗口是分析引物的关键该窗口包括以下功能即点即选Direct Select 引物性状列表和二级结构显示具体介绍如下Direct Select 即点即选框当您将鼠标指针移至该框中指针将变为铅笔型点击框中任何一处会产生一条起始位置最接近点选位置并与原序列互补的引物所有引物性状将即时更新引物5 和3 末端也会标记上以区分引物的扩增方向如果点选一组序列比较结果引物序列将依据保守序列来确定这使得您很容易知道引物与某一特定序列有哪些错配位点在序列比较中应用即点即选功能在利用高保守序列区域设计引物时Primer Premier会在引物窗口显示序列比较这样您很容易知道引物与每一特定序列有哪些错配位点点击序列任一地方将根据保守序列产生一条引物并加以分析引物也可以被编辑以便同某一特定序列匹配这些可以用来设计针对等位基因的引物通过View 菜单选项可以切换显示多数倾向和少数分歧碱基Majority or Minority Consensus 切换到显示少数分歧碱基可以看出哪些核苷酸不能很好的与所有序列匹配性状列表这一列表显示了当前引物对的各种性状您可以通过以下三种方式选择一对引物作为当前引物对Direct Select框根据上述使用Direct Select的方法选择一条引物切换到另一条互补链选择反向引物得到一对引物对在Search Results 搜索结果窗口里选择一对引物对使用输出命令在数据库窗口里选择一对引物对.性状列表能自动更新正反引物的长度起始位置融链温度T m GC含量GC% 多义性比吸光度Optical Activity 单位ug/OD 对于引物对来说长度条显示了PCR产物的长度而T a Opt项显示了PCR反应适宜的退火温度各种引物性状计算公式请参阅附录A二级结构PRIMER PREMIER能即时分析引物二级结构在左下的两排按钮可以想您显示发现了哪些二级结构而按下的按钮表明相邻的图框里显示的是何种二级结构除了二级结构图框里也显示二级结构的自由能数值G 单位kcal/mol在PRIMER PREMIER窗口内的图框里显示的是最稳定的二级结构连续碱基配对用实线显示而不连续碱基配对用虚线显示按下按钮All 就会给出当前二级结构的报告您选择正向引物的发卡结构并点击All 就会显示以下内容注意如果您想使用上述方法选择一条例如如正向引物而不是一对引物您需要手动回复原来的反向引物来和新引物配对注意如果有至少连续三个碱基配对就会被认为能形成发卡二聚体或错配之类的二级结构15可能出现的二级结构按照稳定性大小自动排序最稳定的一种排在最前使用卷动条可以看到未显示的部分除了上述功能这一板块还具有激活以下功能的快捷按钮Search Criteria 搜索参数窗口Search Results 搜索结果如果已经实施过搜索窗口以及Edit Primer 引物编辑窗口点击按钮可以使相应部分伴随引物对以图形显示16Edit Primer 引物编辑窗口Edit Primer 引物编辑窗口可以用来设计用于定点突变的引物或分析一条已有引物序列在windows系统或Power Mac的Command-X Command-C 及Command-V系统中您可以使用CTRL-X CTRL-C和CTRL-V快捷键来实施剪切拷贝和粘贴删除当前引物序列并从剪贴板上粘贴是分析一条已有引物的好方法进行粘贴时Paste 粘贴窗口会激活用以将引物序列转化为反向互补或反向互补形式您也可以手工键入引物序列一旦引物被编辑发生变化Analyze 按钮就可以使用点击Analyze 按钮即可分析编辑后的引物您可以修改实际序列或是翻译后的氨基酸残基如果您修改氨基酸残基相应位置可能出现多义密码子除了上述的引物性状和二级结构资料具体参阅PRIMER PREMIER窗口的章节该窗口也提供了限制性酶分析功能您可以通过点击Enzyme 按钮通过手动或软件提供的筛选方案来选择一组限制性酶您可以使用Prime 按钮来将引物移动到更合适的结合位点通常这项功能可以让您确认是否有其它比当前位点更稳定更适合的结合位点存在其他信息如果您希望改变阅读框或使用其它密码子列表请关闭本窗口从主菜单上选择Function >GeneTank激活GeneTank窗口再选择Translate > Change Parameters打开Select Codon Table窗口来改变阅读框或选择其它密码子列表然后重新打开本窗口可选操作Function > Edit PrimerSearch Criteria 搜索标准窗口以下是基本搜索标准的详细信息根据PCR引物测序引物或杂交探针的不同要求选择不同的搜索标准是很有必要的。

紫外检测仪、核酸蛋白检测仪使用说明书

四、记录仪
根据用户签订合同而定，目前我公司配备有 XWT-1044S 型台式记录仪、3057-11 型日本进口记录仪。使用时仔细参阅随机说明书。
配我公司仪器记录仪有以下几个要求： ⑴、量程一定用 10mV。 ⑵、走纸速度为每小时 3cm、6cm 或 12cm（可自选）
五、使用说明和操作步骤
⑴、在仪器使用前，首先检查检测器，电源和记录仪三部分电连接是否正确，按说明书上要求将各类插头座接妥后，就把电源箱电源插头和记录仪电源插头插入 220V 电源插座上。
0-0.02A、0-0.01A.
⑶．记录仪输出：10mV
⑷．积分仪输出：0.1A/mV
⑸．流式样品池：容积 100 微升、光程 3 毫米
微量样品池：容积70 微升、光程 3 毫米
⑹．数显模式：固定 A 量程读数（0-2.0A）：可变 A 量程读数（0-2.0A、0-1.0A、
0-0.5A、0-0.2A、0-0.1A、0-0.05A、0-0.02A、HD-21C-B 型）
核酸蛋白检测仪
紫外检测仪
使用说明书
上海骥辉科学分析仪器有限公司
核酸蛋白、紫外检测仪仪器各部件示图
（正面）
⑴
⑵
⑶
⑷ ⑸⑹
⑺
⑻⑼
⑽
⑾
⑴、产品名称 ⑵、数字显示 ⑶、出样管 ⑷、光量旋钮 ⑸、仪器型号
⑹、波长旋钮 ⑺、电源开关 ⑻、量程转换器 ⑼、进样管 ⑽、A 调零
⑾、指示灯 ⑿、记录仪信号输出 ⒀、T 调零 ⒁、保险丝插座
⒂、电源插座
（背面）
⑿
⒀
⒁⒂
一．简介
核酸蛋白检测仪、紫外检测仪是液相色谱仪的一1、HD–21C–A、HD–21C–B 型核酸蛋白检测仪、紫外检测仪是根

DeepDigest肽段酶切概率预测软件使用说明书

肽段酶切概率预测软件使用说明书Version 1.7.0Last revised February 13, 2023杨婧涵1,3||，高志强1,3||，任修涵4，盛捷2，徐平2，常乘2*，付岩1,3*1CEMS, NCMIS, RCSDS, Academy of Mathematics and Systems Science, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China.2State Key Laboratory of Proteomics, Beijing Proteome Research Center, National Center for Protein Sciences (Beijing), Beijing Institute of Lifeomics, Beijing 102206, China.3School of Mathematical Sciences, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China.4School of Sciences, China University of Mining & Technology, Beijing 100083, China.||共同第一作者*通讯作者:付岩，邮箱：***********.cn常乘，邮箱：*********************1软件介绍如今，基于高通量生物质谱技术的蛋白质组学已经成为生物学、医学领域研究的一种前沿方法。

在主流的鸟枪法蛋白质组学分析流程中，蛋白质水解产生的肽段将经由质谱仪进行检测，再通过对肽段质谱数据的分析完成对蛋白质的定性和定量。

1通常，不同的水解酶可能会在相应的特异性氨基酸位点处发生酶切，但是漏切的现象普遍存在，从而影响了部分肽段的生成，导致其不能被质谱检测到，最终会阻碍了人们对质谱数据进行高精度、大规模地解析。

软件功能需求说明书(完整版)

迅瘦师功能需求说明书最后一次修改时间：2016-3-1用户确认修订记录目录1......................................................................................................................................... 引言61.1目的和范围 (6)1.2方法 (6)1.3参考材料 (6)1.4术语、缩略语 (6)2 ...................................................................................................................... 工作范围细节72.1总体需求描述 (7)2.2大概功能介绍 (8)2.2.1手机APP (8)2.2.2顾客信息管理 (8)2.2.3生成餐单 (8)2.2.4提交体检报告 (8)2.2.5跟踪记录 (9)3 ............................................................................................................................... 功能规范93.1首页 (10)3.1.1今日贵宾健康指标查看 (10)3.1.2贵宾健康指标趋势图 (11)3.1.3健康指标异常贵宾预警通知 (12)3.1.4指标异常贵宾餐单修改（高级教练角色） (13)3.2贵宾管理 (14)3.2.1贵宾信息查询浏览 (15)3.2.2贵宾信息新增 (16)3.2.3贵宾信息修改 (17)3.2.4贵宾信息记录跟踪 (18)3.2.5贵宾基本信息查看 (20)3.2.6 协议管理 (21)3.2.6.1 协议查询 (21)3.2.6.2 协议新增 (22)3.2.6.3 协议查看 (26)3.2.6.4 协议修改 (27)3.2.7餐单管理 (28)3.2.7.1.......................................................................................... 餐单查看浏览293.2.7.2 ................................................................................................ 餐单修改303.3方案管理 (32)3.3.1首页栏目 (32)3.3.2方案查询 (32)3.3.3方案查看 (33)3.3.4方案新增 (33)3.3.5方案修改 (34)3.3.6方案删除 (35)3.4统计分析 (35)3.4.1教练分析 (35)353.4.1.2...................................................................................教练统计分析查询353.4.2贵宾分析 (36)3.4.2.1...................................................................................今日贵宾健康指标363.4.2.2 ......................................................................................... 贵宾分析查询363.4.2.3 .................................................................................................... 趋势图373.4.2.4....................................................................................................... 提醒373.5系统管理 (38)3.5.1用户管理 (38)3.5.1.1 .......................................................................................... 用户信息查询383.5.1.2................................................................................................. 用户新增393.5.1.3.......................................................................................... 用户信息修改403.5.1.4 ......................................................................................... 用户信息查看413.5.1.5.......................................................................................... 用户信息删除423.5.2角色管理 (43)3.5.2.1................................................................................................. 角色查询433.5.2.2 ................................................................................................ 角色新增443.5.2.3 ................................................................................................ 角色修改453.5.2.4 ................................................................................................ 角色查看463.5.2.5 ................................................................................................ 角色删除473.5.3班级管理 (48)3.5.3.1................................................................................................. 首页栏目483.5.3.2 ................................................................................................ 查询班级483.5.3.3 ................................................................................................ 查看班级493.5.3.4 ................................................................................................ 新增班级493.5.3.5 ................................................................................................ 修改班级503.5.3.6................................................................................................ 删除班级503.5.4食物管理 (50)3.5.4.1 ................................................................................................ 首页栏目513.5.4.2 ................................................................................................ 食物查询51513.5.4.4................................................................................................ 食物新增523.5.4.5 ................................................................................................ 食物修改533.5.5营养品管理 (54)3.5.5.1................................................................................................. 首页栏目543.5.5.2 ............................................................................................ 营养品查询543.5.5.3 ............................................................................................ 营养品查看553.5.5.4 ............................................................................................ 营养品新增553.5.5.5 ............................................................................................ 营养品修改563.5.5.6............................................................................................ 营养品删除561引言1.1目的和范围本文档是《迅瘦师》的系统需求说明，用于阐述迅瘦师的需求和功能结构。

Expi293操作手册-中文-2023版 (1)

Expi293操作手册-中文-2023版 (1)介绍本操作手册为Expi293细胞培养和瞬时转染系统的使用指南。

Expi293是一种高效的哺乳动物细胞表达系统，广泛应用于蛋白质表达和病毒产生领域。

本手册介绍了Expi293细胞的培养条件、瞬时转染步骤以及常见问题的解决方法，旨在帮助用户更好地使用该系统。

Expi293细胞的培养条件Expi293细胞是从HEK 293细胞中选育出的一种高效表达细胞系，其培养条件与传统的293细胞类似。

以下是Expi293细胞的培养条件：1.培养基：使用Expi293细胞培养基，添加适量的追加物（如GlutaMAX和Penicillin-Streptomycin）。

2.温度：在37℃的无二氧化碳孵育箱中培养。

3.CO2浓度：无需二氧化碳供应。

4.培养容器：使用无菌的培养皿或培养瓶，根据实验需求选择适当的大小。

5.细胞密度：最佳的细胞密度可在1-2×10^6细胞/ml之间。

注意事项：•细胞需要定期传代，以确保细胞的健康生长。

•培养过程中应避免细菌和真菌的污染。

•严格按照实验室的无菌操作规范进行培养。

Expi293瞬时转染步骤瞬时转染是Expi293系统中用于将目标DNA导入细胞的关键步骤。

下面是一般的Expi293瞬时转染步骤：1.除去旧的培养基：在转染前，用无菌的PBS缓冲液或培养基去除细胞的旧培养基。

2.制备转染复合物：将目标DNA与转染试剂（如聚乙烯醇）混合，形成转染复合物。

3.添加转染复合物：将转染复合物缓慢地滴加到细胞上，确保转染复合物均匀分布。

4.孵育细胞：将转染后的细胞放回培养箱中，继续在37℃下孵育。

5.收获表达产物：根据实验的要求，在适当的时间点收获细胞，检测目标蛋白的表达水平。

注意事项：•转染复合物的制备应按照厂家提供的说明书进行。

•孵育时间和表达产物的收获时间应根据实验设计来确定。

常见问题解决方法1.细胞生长缓慢：可能是由于细胞密度过高或培养条件不适当所致。

基因编辑技术CRISPRCas9的操作指南

基因编辑技术CRISPRCas9的操作指南引言：基因编辑技术CRISPR-Cas9（Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats–CRISPR associated protein 9）是目前最常用且最强大的基因编辑工具之一。

CRISPR-Cas9可以精确地修改细胞或生物体的基因组，并且具有广泛的应用前景，涵盖了从基础生物学研究到基因治疗的众多领域。

本文将为您提供一份操作指南，帮助您了解和掌握CRISPR-Cas9的基本操作步骤。

一、准备工作在使用CRISPR-Cas9之前，您需要做一些准备工作。

1.设计sgRNA（single guide RNA）序列：sgRNA可以指导Cas9蛋白靶向到目标基因的特定位点。

设计合适的sgRNA序列是成功编辑基因的关键。

您可以使用在线的sgRNA设计工具或参考已有的文献来选择合适的sgRNA序列。

2.制备合适浓度的Cas9蛋白：Cas9蛋白是CRISPR系统中负责切割DNA的关键因子。

您可以购买商业化的Cas9蛋白，也可以通过表达和纯化Cas9蛋白的方法进行制备。

确保蛋白质的浓度和纯度是进行CRISPR-Cas9实验的必要条件。

二、转染CRISPR-Cas9系统1.选择合适的细胞类型和培养条件：不同的细胞类型在转染CRISPR-Cas9系统时可能有不同的效率。

因此，选择合适的细胞类型和培养条件对于实现高效的基因编辑是至关重要的。

2.转染CRISPR-Cas9组分：将设计好的sgRNA序列和Cas9蛋白转染到目标细胞中。

您可以使用合适的转染试剂或方法进行转染。

确保转染试剂或方法的选择是适合您的细胞类型的，并根据试剂或方法的说明书进行操作。

三、基因编辑1.筛选和扩增转染细胞：在转染完CRISPR-Cas9系统后，您需要筛选和扩增成功转染CRISPR-Cas9系统的细胞。

您可以使用选择性培养基或标记基因来识别成功转染的细胞群体。

中文说明书

中文说明书适用产品目录号：E1910 和E19602020版 CTM040原英文技术手册TM040Dual-Luciferase®Reporter Assay System普洛麦格(北京)生物技术有限公司Promega (Beijing) Biotech Co., Ltd 地址：北京市东城区北三环东路36号环球贸易中心B座907-909电话：************网址：技术支持电话：800 810 8133(座机拨打)，400 810 8133(手机拨打)技术支持邮箱：*************************CTM0402020制作1Dual-Luciferase® Reporter Assay System所有技术文献的英文原版均可在/ protocols获得。

请访问该网址以确定您使用的说明书是否为最新版本。

如果您在使用该试剂盒时有任何问题，请与Promega 北京技术服务部联系。

电子邮箱：*************************1.产品描述 (2)1.A. Dual-Luciferase® Reporter Assay化学反应过程 (3)1.B. Dual-Luciferase® Reporter Assay检测模式 (6)1.C. Passive Lysis Buffer (7)2.产品组分和储存条件 (8)3.pGL4 萤光素酶报告基因载体 (9)3.A. pGL4 载体介绍 (9)3.B. 共转染实验的重要注意事项 (9)4.仪器注意事项 (10)4.A. 单样品发光检测仪 (10)4.B. 多样品读板发光检测仪 (10)4.C. 闪烁计数器 (10)5.使用Passive Lysis Buffer制备细胞裂解物 (11)5.A. 制备Passive Lysis Buffer (11)5.B. 培养于多孔板中细胞的被动裂解 (12)5.C. 通过刮取主动裂解细胞 (13)6.Dual-Luciferase® Reporter Assay操作步骤 (14)6.A. 制备 Luciferase Assay Reagent II (14)6.B. 制备Stop & Glo®试剂 (14)6.C. 标准检测步骤 (15)6.D. 清洗试剂进样器的重要注意事项 (17)6.E. 检测本底的测定 (18)7.参考文献 (20)8.附录 (21)8.A. 缓冲液和溶液的组成 (21)8.B. 相关产品 (21)9.内容变更总结 (24)普洛麦格(北京)生物技术有限公司Promega (Beijing) Biotech Co., Ltd 地址：北京市东城区北三环东路36号环球贸易中心B座907-909电话：************网址：技术支持电话：800 810 8133(座机拨打)，400 810 8133(手机拨打)技术支持邮箱：*************************CTM0402020制作21. 产品描述遗传报告基因系统目前广泛用于真核基因表达和细胞生理学的研究。

GeneQuant pro 说明书

功能键（Utility Keys）
Setup
设置仪器各种功能参数（见 Set up），在按相应的读数键后再按设置键，将转至相应测定方法的设置。
启动仪器用专门的滤光片检查吸收精确度，波长精确度和杂散光（见性能鉴定 cal check 检测）。
select
用来查看参数设置中的选项或显示碱基序列或核酸模式的结果（如果扫描模式开启的话）。
友好的用户测定系统易于使用并保证灯的使用寿命更长，能将产品使用成本降到最低。
仪器介绍
显示屏由 128×64 背光图形液晶组成，键盘有 28 个按键并分成三个区：数字键盘、功能键和读数键，包括参数设置键。打开仪器开关，经启动和校准程序后，仪器处于待用状态 (显示“Instrument Ready”等信息)。请注意下述几点：
print 输出数据到打印机,或通过多用途接口输出到 PC 机.
用来输入引物或寡核苷酸的碱基序列，计算理论吸光度、分子量和转换因子 base Seq. （见碱基序列输入）。
Tm 用来确定 Tm（用 Abs260）以及显示对所输入序列计算出的 Tm 值（见 Tm）。
stop 相当于一个“退出（escape）”键，使用户返回仪器待用状态。
• 它可检测经 PCR 扩增的、供杂交研究和小量制备定量用的核酸(DNA、RNA 和寡核苷酸) 的纯度和浓度(以µg/ml , ng/µl, µg/µl, pmole/µl 或皮摩尔磷酸盐表示)。260nm 波长用于定量，其和 230 及 280nm 一起用于纯度检查计算（通过 260/230 和 260/280 比值），320nm 波长用于背景校正，我们提供包括一次性 UV 透射的、各种规格的比色杯，可根据样品浓度、稀释因子和可得到的体积进行选择以便于取样测定，核酸扫描功能使我们可以得到样品的光谱吸收信息。

HisTrap_FF_crude中文说明书

GE Healthcare操作指南11-0012-38 AD HiTrap亲和柱———————————————————————————————————————HisTrap FF crude 1 ml and 5 mlHisTrap TM FF crude是一种预带电荷的Ni Sephrose TM 6 Fast Flow即用的预装柱。

该预装柱的目的是采用固定化金属配体亲和层析 (IMAC) 来纯化带有组氨酸标记的重组蛋白质。

在细胞完全破碎后，样品无需预离心及过滤就可将未澄清的细胞裂解液上到柱上。

为确保裂解完全，我们建议延长样品的机械处理时间。

Ni Sephrose 6 Fast Flow具有低 (Ni2+) 离子脱落并与用于蛋白质纯化的许多添加剂相兼容。

柱与介质的相结合的特殊设计提供了快速、简单、及方便的纯化。

纯化时间的缩短通常使有害影响减到最少，例如，敏感的目标蛋白的降解和氧化，因此, 纯化时间的缩短极其重要。

HisTrap FF crude可用注射器、恒流泵，或液相层析系统，如 ÄKTAdesign TM 层析系统或FPLC TM系统的操作。

小心：含鎳。

可能引起过敏反应。

货号名称供货数量*可提供指定的包装大小。

接头配件盒提供的接头用途供货数量1/16”阳/路厄氏阴将注射器连接到HiTrap柱的顶端 1无法兰/M6阴管道接头将管道（如，恒流泵P1）连接到HiTrap柱的底部* 1无法兰/M6阳管道接头将管道（如，恒流泵P1）连接到HiTrap柱的顶部** 1活接头1/16” 阴/M6阳通过HiTrap柱的底部连接到固有的FPLC系统 1 活接头M6阴/ 1/16” 阳通过HiTrap柱的顶部连接到固有的FPLC系统 1 堵头阴，1/16” 封住HiTrap柱的底部2、5或7* 也需要活接头1/16” 阴/M6阳** 也需要活接头M6阴/ 1/16” 阳目录1.说明 42.一般事项73.样品制备114.纯化操作125.纯化效率的优化146.按比例放大157.柱的清洗及保存158.保存169.故障排除1610.定购信息20 附录A 221说明介质的性质HisTRap FF crude 1-ml和 5-ml柱是用亲和介质Ni Sepharose 6 Fast Flow的预装柱，由具有固定鳌合基团的高度交联的球状琼脂糖组成。