现代月季6个表型性状和SSR标记的关联分析
SSR分子标记ppt
• SSR标记因为具有共显性、高度重复性、高度丰富的多态 性等优点,成为构建遗传连锁图谱、研究群体遗传学、进 行分子标记辅助育种、系谱分析、品种指纹图谱绘制、品
种纯度检测、目标性状分子标记筛选和法医鉴定的理想工
具。目前在植物基因组中SSR标记研究非常活跃。SSR标记 技术已经应用于拟南芥、大豆、棉花、花生、葡萄、小麦 、水稻、番茄、甜菜和油菜等多种植物上。
3.SSR标记的操作步骤
第一步:DNA 提取:
提取DNA并用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量。
第二步:PCR :
PCR体系: 模板DNA 引物 氯化镁 4种dNTP混合物 PCR缓冲液 TaqDNA 聚合酶
PCR反应程序 : 变性94 ℃ → 复性(或退 火)50-62℃ → 延伸72 ℃,一般30-35个循环
SSR分子标记
王丹
目录
1.SSR标记技术的概念和原理 2.SSR标记技术的特点 3.SSR标记的操作步骤 4.SSR标记的应用
1.SSR标记技术的概念和原理
简单重复序列(Simple Sequence Repeat ,SSR ),指的是基因组中由1-6个核苷酸组成的基本单 位重复多次构成的一段DNA,广泛分布于基因组 的不同位置,长度一般在100bp以内。
SSR标记的难点
利用SSR标记技术进行研究时,由于创建新的标记时需要知道重复序
列信息,如不能直接从DNA数据库存查询,则首先必须对其进行测
序。因此其开发有一定的难度,费用也较高。必须根据微卫星侧翼 序列设计引物,减少了其应用范围。虽然开始筛选重复序列和引物
设计过程较慢,但只要引物确定,使用便极为方便,结果极为可靠。
第三步:
琼脂糖电泳检测扩增质量(1%-2%琼脂糖凝 胶);扩增产物电泳分离:一般用8%变性聚丙 烯凝胶电泳检测扩增产物
菜心重要农艺性状与SSR分子标记的关联分析
中国果菜China Fruit &Vegetable质量控制Quality Control第41卷,第2期2021年2月菜心重要农艺性状与SSR 分子标记的关联分析严少杰(广州大学生命科学学院,广东广州510006)摘要:菜心是华南地区的主要蔬菜,利用分子标记辅助育种发掘出与重要农艺性状相关的分子,不仅可以加速优良品种的选育进程,还可以定向地优化目标性状,培育出高产优质的菜心品种。
本研究选用148份来自宁夏银川和广东南沙田间种植的菜心种质材料,采集株高、株质量、薹高、薹质量和薹粗5个重要农艺性状的数据;利用SSR 标记对其进行基因分型,开展农艺性状及SSR 标记的关联性分析。
结果表明,在供试的菜心材料中,147个SSR 标记共检测到252个变异位点,引物多态信息含量(PIC )为0.0526~0.5222,平均值为0.3793;群体结构分析将供试的菜心品种分为2个类群;银川和南沙两地菜心品种在农艺性状和SSR 标记的关联分析中发现,有6个位点与相同性状存在仍显著关联(<0.01)。
这些标记能为菜心的分子辅助选择育种提供参考。
关键词:菜心;农艺性状;分子标记;群体结构;关联分析中图分类号:S634.5文献标志码:A文章编号:1008-1038(2021)02-0034-11DOI:10.19590/ki.1008-1038.2021.02.007Association Analysis of Agronomic Traits with SSR Molecular MarkersinL.YAN Shao-jie(School of Life Sciences,Guangzhou University,Guangzhou 510006,China)Abstract:is one of the main vegetables in South ing molecular marker assistedbreeding to find out the molecular markers related to important agronomic traits can not only accelerate the breeding process of excellent varieties,but also optimize the target traits directionally,which is conducive to the cultivation of high-quality and high-yield varieties of.In this study,148materials grownin Yinchuan of Ningxia and Nansha of Guangdong were selected,and 5important traits including plant height,plant mass,stalk height,stalk mass and stalk diameter during the harvest time were measured.SSR markers were used for genotyping and correlation analysis of agronomic traits and SSR markers.The results showed that using 147SSR收稿日期:2020-08-11基金项目:广州市科技项目(202002020007)第一作者简介:严少杰(1993—),男,在读硕士,研究方向为生物化学与分子生物学菜心(L.ssp.var. Tsen et Lee)有“蔬菜之冠”的美誉[1],是华南地区的标志性蔬菜,栽培历史超过百年;菜心风味独特,营养价值高,深受消费者喜爱。
月季品种的园艺学分类法
月季品种的园艺学分类法(1979年世界月季协会联合会批准)月季分类表月季品种特征鉴别月季花品种多,国内种植的有新、老品种,自有、引进品种数以千计,可以说没有人能全部辩别、鉴定,但有经验的实践家可以辩别鉴定常用优秀品种二三百种或更多些。
一般来说,先从株形认出对象属于现代月季的HT型(大花单朵)、FL型(中花多朵)、GR(大花多朵)、CL型(藤蔓)、MIN型(微小)、SH型(灌木)的哪一类,再从以下四个方面辩别细微特征:花:花径、花色、花形、瓣数、瓣形、香味、萼形等。
叶:嫩叶色、成叶色、叶形、光泽、缺刻等。
枝:长短、壮弱、皮色、直生或扩张、叶柄疏密等。
刺:刺密、刺形、嫩刺色、钩度等。
这四个方面的具体形态无须全部无遗地一一核对,对照文字,实践多了,稍当心辩别就会找到对象植株与众不同之处。
比如“双喜”花色独特乳黄晒红自不必说,它叶浅绿、嫩叶柔软褐红、枝不很壮、刺较直强但并不密等是它的特点,尤其嫩枝头的嫩叶软蹋蹋的特点,不开花也认得出。
具体例子不必赘举,对照文字多看多比,出真功夫。
“切花月季”,是从用途角度提出的专用词汇,它以HT型茶香月季为主,也用FL型丰花月季和MIN型微小月季。
HT型月季强调花朵初开放苞高耸,花瓣小翻动,花茎颀长壮实,叶片浓绿健全,整枝挺拔优美。
根据1979年世界月季协会联合会批准的园艺分类法,将现代月季作如下的分类。
I、非藤本的(一)一季开花的灌木(二)连续开花的l.连续开花的灌木2.连续开花的矮丛1)大花(杂种香水月季,HT.)3.1杂交香水月季(Hydrid Tea Roses)又称芳香月季,这一品系是19世纪中期,用香水月季(T ea Roses)和杂交长春月季(Hybrid Per-petuaf)杂交而成。
它是现代月季发展中的重大成果,明显地优越于老式月季,使当时占统治地位的杂交长春月季让位于它。
它的特点是:(1)色彩丰富。
(2)花形硕大、丰满、多姿。
(3)香味宜人。
(4)生势强健、发枝力强、抗病力强,有许多品种还极耐寒。
SSR标记及形态性状鉴定红刺玫和月季杂交F1后代
I e t c t n o Hy rd r e r m h mb n t n fRo a a d d n i ai fF l b s De v d fo t e Co i ai s o s n i f o i i o M o e s y S R a k r n o p o o i a r i d m Ro eb M r e sa d M r h l g c l at S T s
Ab ta t I i p p r a o xF y r sh t e v df m e o iai s f oamut oaT u b src nt s a e h dg t i l b d a d r e o t mbn t n s l r h n . h we s h i t i r h c o oR l f i 0. ah y ni R h . t 1. n d m s yu igtec n e t n l p r aho r re igpo rm. r cta es e d e sa dmo e r eb s o v n o a apo c f y i be d rga s Wi o n h i h d b n
后代 。本 文利 用形 态 学观察 与 S R分 子标 记相 结合 对 5个 单株 进行 杂种 鉴 定 ,结果确 定 为红 刺玫 和锦 寒 1 S 号 的杂交 后代 , 中杂 5 2 杂 5 4与父 本聚 为 一组 , 5 1杂 5 3 杂 5 6与母 本聚 为一 组 。 其 —和 - 杂 —、 — 和 - 关 键词 红刺 玫, 月季 , S S R分 子标 记, 杂种 鉴定 , 形态 性状
t eg o p o “ o a eCo d 1 . o t u f Br c d l ” h r
Kewo d R s l oaT u bV . ahy ni, d m oe S R Ie t c t n o r , rh lgcl y r s oamu i r n .a ctae s Mo e R s, S ,dni a o f y i Mop oo ia t l f h r s i f i h d b
SSR分子标记剖析
SSR分子标记的优势
üSSR在真核生物基因组中分布广 ü多态性丰富 ü其产物进展测序胶电泳分别时单碱基区分率高、遗 传信 ü 息量大 üSSR通常为显性标记,呈孟德尔式遗传 ü具有很好的稳定性和多态性 üDNA用量少 ü技术要求低,本钱低廉 üPCR扩增的可重复性高
SSR分子标记的劣势
ü 开发和合成新的SSR引物投入高、难度大 ü 现有的SSR标记数量有限,不能标记全部的功能基因 ü SSR多态性的检测和应用很大程度上依靠PCR扩增的效果 ü SSR座位突变率高,对变异反响特殊敏感等等。
常见的二核苷酸重复单位:〔AC)n、〔GA)n、〔AT)n 常见的三核苷酸重复单位: 〔AAG)n、〔AAT)n
SSR分子标记的分子学根底
微卫星中重复单位的数目存在高度变异,这些 变异表现为微卫星数目的整倍性变异或重复单位序 列中的序列有可能不完全一样,因而造成多个位点 的多态性。假设能够将这些变异提示出来,就能觉 察不同的SSR在不同的种甚至不同个体间的多态 性,基于这一想法,人们进展了SSR标记 。
三、试验用品
1. 仪器设备与耗材:PCR扩增仪、电泳仪和电泳槽、 微型移液器、恒温水浴锅、凝胶成像系统等,离心 管、PCR管、移液器枪头等
2. 2. 试剂
3. 提取缓冲液:100mmol/L Tris·Cl,20mmol/L EDTA ,500mmol/L NaCl,1.5% SDS。
4. 氯仿:异戊醇:乙醇〔80:4:16〕。
专业综合力气训练与测试
利用SSR技术 进展玉米杂交种的纯度鉴定
2023.5
一、试验目的
玉米是我国的主要农业作物,利用SSR技 术进展玉米种子纯度鉴定,已经筛选出多 对可利用的引物,综合运用SSR核心引物 和DNA指纹图谱,可以准确地鉴定父本、 母本、混杂品种及真实杂交种,其鉴定结 果与RFLP结果及系谱来源根本全都。
SSR_分子标记在紫薇属植物中的应用研究进展
收稿日期 2022-07-21
发及应用提供理论支撑。
1. 1 SSR 分子标记的基本原理 SSR 分子标记是一种利用
直接分析遗传材料的多态性来识别其核苷酸排法和外部状
态表达法则的技术。 简单重复序列的高度变异表现为 SSR
数目的 整 体 或 部 分 变 异, 同 时 Schlötterer 等[24] 研 究 发 现,
遗传多样性是指种内个体之间或单一群体内不同个体
增。 电泳可检测染色显带、分析微卫星序列多态性。 根据分
的遗传变异总和,遗传多样性为种质资源保护和植物利用工
离片段的大小确定基因排布序列及表型并计算等位基因数
作提供理论依据。 紫薇属植物品种多样,来源复杂,品种鉴
1. 2 SSR 分子标记的特点 SSR 分子标记在植物鉴定中得
具有重复次数多的特点,在同一物种的不同个体基因型间差
异很大,呈现高度多态性,且稳定性好,是用于分析种下居群
遗传多样性的有力工具[17-20] 。 微卫星已被证实在植物中具
有较高的信息量,并且带有位点特异的分子标记[21-22] 。 SSR
标记已广泛应用于群体遗传学、分子育种和亲缘关系鉴定
研究[23] 。
开放科学(资源服务)标识码(OSID):
Advances in the Application of SSR Molecular Markers in Lagerstroemia
HUANG Jian-rui, MIAO Shen-yu ( School of Life Sciences, Guangzhou University, Guangzhou, Guangdong 510006)
薇属新品种较多,难以分析其亲缘关系,而 SSR 分子标记技术凭借稳定性好、多态性高的特点,在紫薇属品种间展现了广阔的应用前景。
晒烟种质资源形态学标记及SSR标记的多样性分析
晒烟种质资源形态学标记及SSR标记的多样性分析摘要:以吉林省常见的23份晒烟和2份烤烟为试材,利用形态学标记和SSR分子标记两种方法进行遗传距离的研究,并将所得的遗传距离进行相关性分析。
结果表明,晒烟材料的形态学欧氏距离在1.11~8.29之间,欧氏距离较小,说明各晒烟品种间遗传基础狭窄。
通过SSR标记法,得到各晒烟材料间的遗传背景较相似,遗传相似系数为0.51~0.98,相似性较大,说明亲缘关系较近。
两种方法的聚类分析结果基本一致。
利用SPSS软件对形态学欧氏距离与SSR遗传相似系数进行了相关性分析,结果呈极显著负相关,相关系数为r=-0.383。
由此可见,分子标记能反映烟草品种间的遗传变异,通过这种简便快捷的标记方法,能够提高烟草育种效率。
关键词:晒烟;形态学标记;SSR标记;亲缘关系;遗传多样性;相关性分析中图分类号:S572 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2015)23-5943-06DOI:10.14088/ki.issn0439-8114.2015.23.038The Genetic Diversity Analyses on Sun-cured Tobacco Germplasm by Morphological Markers and SSR Markers WANG Hui-ying1,WANG Man1,PIAO Shi-ling1,JINAi-lan2,CHEN Shuang1(1.Agricultural College,Yanbian University,Yanji 133002,Jilin,China;2.Yanbian Academy of Agricultural Sciences,Longjing 133400,Jilin,China)Abstract:Taking 23 common sun-cured tobaccos and 2 flue-cured tobaccosof Jilin province as test materials,combining with morphological markers and SSR markers,the correlation of genetic distance was analyzed. Results showed that,morphology euclidean distance of sun-cured material was 1.11~8.29,which showed genetic base among sun-cured tobacco varieties was relatively narrow. Genetic backgrounds between each sun-cured materials were similar through SSR markers,the genetic similarity coefficient was 0.51~0.98. Cluster analysis results of the two methods were basically the same. The correlation analysis between morphology euclidean distance and SSR genetic similarity coefficient was conducted by SPSS software,a significant negative correlation was obtained with correlation coefficient r=-0.383. It was concluded that molecular markers could reflect the genetic variation among breeds,andimprove the breeding efficiency.Key words:sun-cured tobacco;morphological markers;SSR markers;genetic relationship; genetic diversity;correlationanalysis吉林省晒烟作为中国名晒烟之一,以色泽鲜明、吃味纯净、油分充足、香气优雅浓郁、焦油释放量低等特点在中国享有很高的声誉[1]。
月季新品种测试标准
月季新品种测试标准月季新品种测试标准主要涉及到植物新品种的特异性、一致性和稳定性(DUS测试)。
这些测试标准是为了确保新品种具有独特性、可识别性和稳定性,以保护育种者和生产者的合法权益,并鼓励创新。
以下是一些与月季新品种测试相关的标准:1. 植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南:这是一项农业农村行业标准,用于指导育种者和测试机构在新品种测试过程中的操作。
它包括对植物新品种的形态特征、生物学特性、生理特性等方面的测试方法和技术要求。
2. 水稻实质性派生品种鉴定MNP分子标记法:这是一项农业农村行业标准,用于鉴定水稻新品种是否为实质性派生品种。
通过使用MNP(多位点核苷酸polymorphism)分子标记技术,可以准确地判断新品种与已知品种之间的亲缘关系。
3. 大白菜品种鉴定SSR分子标记法:这是一项农业农村行业标准,用于鉴定大白菜新品种的品种身份。
通过使用SSR(简单序列重复simple sequence repeat)分子标记技术,可以准确地识别不同品种之间的遗传差异。
4. 植物品种特异性、一致性和稳定性测试指南茎用莴苣:这是一项农业农村行业标准,用于指导莴苣新品种的测试工作。
它包括对莴苣新品种的形态特征、生物学特性、品质等方面的测试方法和技术要求。
5. 林业行业标准《植物新品种特异性、一致性、稳定性测试指南梓树属》(修订):这是一项林业行业标准,用于指导梓树属新品种的测试工作。
它包括对梓树属新品种的形态特征、生物学特性、生态适应性等方面的测试方法和技术要求。
总之,上述标准仅作为月季新品种测试的一部分,具体的测试项目和要求可能会因地区、机构等因素而有所不同。
在进行月季新品种测试时,建议查阅相关法规、政策和标准,以确保测试结果的准确性和合法性。
SSR标记技术在观赏植物育种中的研究应用
学生:李斌 学生: 学号: 学号:2009238 指导老师: 指导老师:黄海泉
目
录
1. 绪论 2. 微卫星DNA的概念 3. SSR标记的特点 4. SSR标记方法的优点与不足 5. SSR标记的发展 6. SSR标记的原理及流程 7. SSR标记在高等植物遗传育种上的应用 8. 展望
4. SSR标记方法的优点与不足
4.2 SSR标记方法的不足 标记方法的不足 4.琐的。 4.2.2 引物设计要根据微卫星两端的序列而定,不同物种的微卫星侧翼序 列有所不同,所以在设计引物之前必须搞清楚微卫星侧翼的序列,这些工 作的人力、物力消耗较大。 4.2.3 由于微卫星进化的复杂性,从而可能出现同源异型(微卫星重复序列 相同,但 PCR 产物长度不同) 或者是异源同型(微卫星重复序列不同,但 PCR产物长度相同)。因此,单纯使用PCR产物片段进行研究可能得出错误 结果。 4.2.4 由于“无效基因”的存在,使一些等位基因可能无法被扩增出来。 4.2.5 SSR标记中所使用的引物不同,实验结果差异较大。
4. SSR标记方法的优点与不足
4.1 SSR标记方法的优点 标记方法的优点 4.1.1微卫星标记杂合程度高。由于微卫星位点的等位基因数相当多,因 而杂合程度高,多态信息含量大,在区分亲缘关系极近的个体(或群体) 时,效果很好。 4.1.2 微卫星位点可通过 PCR 扩增。由于微卫星序列较短,既使降解的 DNA也有可能包含足够用来扩增的微卫星位点,这一特点使那些保存差的 样品也可能成为有价值的研究材料。 4.1.3 多态性。多数 SSR无功能作用,增加或减少几个重复序列的频率高, 因而在品种间具有广泛位点变异,比RFLP及RAPD分子标记更具有多态性。 4.1.4 通用性与保守性。微卫星DNA所在区域在生物的基因组中是比较保 守的,某一物种的微卫星引物可在相关密切的物种中使用,这使得减少 获取微卫星的工作量和加快比较基因组作图的工作进度成为可能。 4.1.5 共显性遗传。微卫星DNA呈孟德尔共显性遗传模式,可以区别纯合 显性个体和杂合显性个体,这为遗传研究提供了更多的可供分析的信息。
不同花色杂种香水月季的SSR分析
花和粉花遗传关系较近 、 黄 花 和粉 红 遗 传 关 系 较 近 , 并 对 品 种 个 体 进 行 聚类 分 析 , 发 现 在 分 子 水 平 上 论 证 杂
种 香 水 月 季 的亲 缘 关 系 与花 色 无 直 接 关 系 。 关 键 词 :杂种 香水 月季 ; S S R; 花色 ; 遗 传 关 系 中 图分 类 号 :S 7 1 8 . 4 9 ; S 7 1 8 . 4 6 文 献标 志码 : A
第3 O卷第 3期
2 0 1 5年 9月
河
北
林
果研究 源自Vo1 . 3 0 No .3
Se p. 2 0 1 5
HEB EI J OURNAL OF F ORE S TRY AND 0RCHARD RES EARC H
文章 编 号 : 1 0 0 7— 4 9 6 1 ( 2 0 1 5 ) 0 3— 0 2 7 4—0 5
( C o l l e g e o f Fo r e s t r y, Ag r i c u l t u r a l U n i v e r s i t y o f He b e i , B a o d i n g 0 7 1 0 0 0 ,C h i n a )
Ab s t r a c t :1 8 p a i r s o f hi gh po l y mor ph i c SS R pr i me r s o f 4 4 ki nd s of h yb r i d t e a r os e wi t h r e d, ye l l ow ,pi n k,y e l l o wi s h r e d,s o f t r e d,we r e u s e d t o i d e n t i f y t h e i r DNA f i ng e r p r i nt s a nd a n a — l y z e t he i r g e ne t i c r e l a t i on s h i p.6 4 l oc i we r e d e t e c t e d,wi t h 9 6 . 8 o f t ot a l pr o po r t i o n of po l y —
月季花、玫瑰及其近缘种ISSR分析与鉴定
2 . De p a r t me n t o f F o r e s t r y , Wo l o n g Di s t r i c t , Na n y a n g 4 7 3 0 5 6 , Ch i n a
关系 ,为蔷薇属种质资源分子鉴定及育 种提供参考 。方法 软件构建亲缘关系 U P GMA聚类图 。结果
种的 1 5个种 3 3个样品进行分析,利用 P O P GE N 软件 分析 Ne i ’ S 基因遗传多样性指数 ( H)等遗传信息参数 ,应用 NT S YS 6条 引物共检测到 1 1 0 个 位点,其中多态性位 点 1 0 9个 ,多态位点百分率 ( P P B) 为9 9 . 0 9 %。药用植物月季花 、玫瑰及其同属近缘种的种群间 H平均值 为 0 . 3 7 0 5 ,S h a n n o n ’ S 多样性信 息指数 ( )的平均值 为0 . 5 4 6 4 ,种群 问基 因分化系数 ( G s t )的平均值为 0 . 8 8 6 8 ,基因流 ( ^ , m )的平均值为 O . 0 6 3 8 ,遗传 距离 ( D)的变化范 围 为0 . 1 6 9 1 ~0 . 7 3 0 2 ,聚类 分析结果显示蔷薇属 1 5个种 , 在遗传相似系数 ( GS ) 0 . 6 0处分成 6个组 。 结论 药用植物月季花、 玫瑰及其 同属近缘种具有丰富 的遗传多样性 ,聚类分析与基于形态特征的蔷薇属属下的分类学研究结果 相吻合,I S S R 分子
现代月季品种表型性状分析与评价
4633
Abstract:【Objective】The objective of this study was to analyze 11 phenotype indexes of 60 rose cultivars and to illustrate the variation rules and the genetic diversity coefficient of each index and the correlation between them. The principal component analysis was used to select an optimal evaluation and calculation method to provide reference for rational clustering of rose cultivars. 【Method】Taking 11 statistical characters of 60 modern rose cultivars in field as the research object, the variation index and Shannon-wiener genetic diversity index of each character data in rose cultivars were analyzed with SPSS19.0 and Microsoft Excel 2007, and the correlation analysis and principal component analysis of each character were carried out. Based on the composite score of principal components and each principal component score, the clustering of the rose cultivars were done.【Result】The statistical results of phenotypic traits showed that, the majority of the tested roses were erect and expanded shrubs, which accounted for 53% and 35% of the total cultivars respectively. The number of leaflets of mature leaves was 5, accounting for 68% of total cultivars. The average whole leaf length, top leaflet width, internode length and average flower diameter of 60 rose cultivars were 11.6, 3.2, 3.6 and 7.6 cm, respectively. The variation coefficient of each quantitative index ranged from 21% to 25%, which was not large. The main color of rose was pure color, accounting for 82% of the total. Among them, purple and yellow flowers were the most. The cultivars with successive flower heads accounted for 65% of the total number, and the flower shapes were mainly ball-shaped and cup-shaped, accounting for 33% and 32% of the total cultivars, respectively. The main senescence modes of rose flowers were petal abscission and flower withering, accounting for 47% and 43% of the total cultivars, respectively. The variation range of the genetic diversity coefficient of each index was between 0.62 and 3.73, among which the diversity index of 8 traits was above 1, the highest was the whole leaf length, and the lowest was the leaflet number. The genetic diversity coefficient of flower color among qualitative traits was the highest. There was an extremely significant positive correlation between whole leaf length and the top leaflet width, the internode length and the whole leaf length, the internode length and the top leaflet width. The flower head number was very significantly negatively correlated with the internode length. There was a significantly positive correlation between the senescence type and the growth habit, the number of flower heads was significantly positive correlated with the number of leaflets and the flower type, but significantly negative correlated with the flower diameter. The results of principal component analysis showed that the 11 phenotype indexes could be simplified into 4 principal component factors, and the variance contribution rate of the 4 principal components was up to 63.28%, among which the variance contribution rate of the first principal component was up to 21.1%. Each principal component factor mainly represented the index variables, such as leaf shape, flower shape, number of flower heads, number of petals and flower aging mode. Based on the composite score of principal components and each principal component score, the 60 cultivars of roses were clustered, and the distribution range of the composite score of principal components of each cultivar was from -1.878 to 1.522. The rose cultivars could be divided into 4 clusters according to the scores, and each cluster was represented by 8, 36, 15 and 1 cultivars, respectively. The classification of each cluster reflected the comprehensive performance of roses in the field. 【Conclusion】Modern rose had a rich diversity of flower color and leaf shape indexes, and some flower shape indexes were significantly related to leaf shape or growth habit. The conclusions would contribute to rose breeding and selecting. The four principal component indexes and the clustering of cultivars selected in the study provided theoretical basis for the preservation and application of the existing rose cultivars.
月季的花程式及其解读
月季的花程式及其解读
月季的花程式有许多种,以下是其中一些常见的花程式及其解读:
1. 单瓣:花瓣只有一个轮廓,通常为五瓣花。
这种花型代表着简单、自然和纯真。
2. 全重瓣:花瓣分明,密集,整个花朵看上去比较圆润。
这种花型代表着浪漫、温馨和纯洁。
3. 半重瓣:花瓣较全重瓣少,但仍然密集。
这种花型代表着谦逊、实用和友爱。
4. 薔薇形:花瓣渐递晕染,从中央逐渐变浅,外围较深。
这种花型代表着浪漫、柔和和温馨。
5. 绰号形:花瓣不规则地卷曲,形成自然的流线形。
这种花型代表着自由、个性和浪漫。
6. 酒杯形:花瓣朝上卷曲,像一个小酒杯。
这种花型代表着富足、欢乐和庆祝。
7. 华丽型:花瓣众多,有许多层,看起来相当华丽。
这种花型代表着独特、复杂和高贵。
月季的花程式多种多样,每一种都有独特的魅力和意义。
选择不同的花程式可以传达不同的情感和心情。
现代月季品种综合评价体系的初步研究
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基于形态学性状和SSR标记的花生品种遗传多样性分析和特异性鉴定
摘 要: 以 101 份南方花生区试品种为材料, 利用形态学性状和 SSR 标记进行品种遗传多样性分析和特异性鉴定。 结果表明, 29 个形态学性状中有 7 个无多样性, 其余 22 个的多样性指数为 0.23~0.77, 平均为 0.43。在相似系数为 0.76 处, 将供试品种划分为七大类群, 同一育种单位的品种倾向于聚在一起。用 40 个 SSR 标记共检测出 167 个等位基因, 单个标记检测的等位基因数 2~6 个, 平均为 4.18 个。标记的多态性信息量(PIC)差异较大, 最大为 0.79, 最小为 0.26, 平均为 0.55。在相似系数为 0.70 处, 供试品种可被划分为六大类群, 同一省份育成的品种多聚为一类。Mantel 检验 发现品种间的形态学性状和 SSR 标记的相似系数矩阵相关性弱(r = 0.36), SSR 标记无法取代形态学性状单独用于花 生品种特异性鉴定, 但两者相结合能有效提高花生品种特异性鉴定的准确性。 关键词: 花生; 形态学; SSR; 遗传多样性; DUS
SSR标记技术在植物基因组研究上的应用
SSR标记技术在植物基因组研究上的应用陆丹;牛楠;李玥莹【摘要】SSR也称作微卫星DNA,是一种广泛应用的分子标记技术.SSR具有丰富的多态性,基于这种多态性,可以对植物基因组进行分析筛选;SSR的检测方法快速、技术简便.目前,这项技术已用于多种植物的基因组研究,如基因定位及遗传图谱的建立、数量性状标记、杂种优势的利用等.在一些重要的农作物中,已定为了丰富的SSR位点.随着技术的发展,基于SSR技术的新的标记方法不断出现,如:ISSR、RAMP、REMAP.概述了SSR标记技术的原理和特点;介绍了与实验相关的技术和方法;着重整理了近年来在SSR技术上发展起来的新的标记方法;探讨了SSR在植物基因组研究中的应用.【期刊名称】《沈阳师范大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2010(028)001【总页数】3页(P83-85)【关键词】SSR;基因组研究;植物【作者】陆丹;牛楠;李玥莹【作者单位】沈阳师范大学,化学与生命科学学院,辽宁,沈阳,110034;沈阳师范大学,化学与生命科学学院,辽宁,沈阳,110034;沈阳师范大学,化学与生命科学学院,辽宁,沈阳,110034【正文语种】中文【中图分类】S514简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)也被称为微卫星DNA。
这是一种以一个或几个碱基可变次数的串联重复序列。
这些序列广泛存在于真核细胞的基因组内,被认为是一种理想的分子标记。
当今世界上四大标记系统综合效应大小是AFLP>SSR>PAPD>PFLP。
SSR克服了PAPD和PFLP的不足,还兼具它们的优点,在植物基因组研究中具有广阔的应用前景[1]。
Levinson(1987)等研究认为SSR的来源是由于DNA复制时两条链退火分子滑移(molecular slippage),导致后来在DNA复制、修复及重组时产生错误,插入或删除了一个或几个重复单元,使得SSR序列变长或缩短。
月季的检索表
月季的检索表
【实用版】
目录
1.月季的概述
2.月季的检索表的作用
3.月季的检索表的结构
4.如何使用月季的检索表
5.月季的检索表的优点和局限性
正文
月季,被誉为“花中皇后”,是蔷薇科、蔷薇属的植物,被称为“花中皇后”的原因是其花朵美丽、色彩丰富、花期较长,并且有着浓郁的香气。
月季在世界范围内广泛种植,其种类繁多,达到了近万种,因此,对于月季的检索表的研究就显得尤为重要。
月季的检索表,是帮助我们快速准确识别月季的一种工具,它可以帮助我们了解月季的种类、特性、生长环境等信息,对于月季的研究、繁殖、栽培都有着重要的作用。
月季的检索表的结构通常包括以下几个部分:一是月季的学名,这是月季的唯一标识,可以帮助我们准确识别月季的种类;二是月季的别名,这是月季的俗称,可以帮助我们更好地了解月季的特性;三是月季的科属信息,这是月季的基本信息,可以帮助我们了解月季的基本特征;四是月季的产地,这是月季的生长地,可以帮助我们了解月季的生长环境;五是月季的形态特征,这是月季的外在特征,可以帮助我们准确识别月季的种类。
使用月季的检索表,首先需要了解月季的基本信息,然后根据月季的形态特征进行比对,从而找到对应的月季种类。
在使用过程中,我们需要
注意,月季的检索表只是一种工具,并不能完全代替专业人士的鉴定,因此在使用过程中,我们需要结合实际情况,进行综合判断。
月季的检索表的优点是方便快捷,可以帮助我们快速准确识别月季的种类;局限性是它只能提供月季的基本信息,对于月季的深度研究还需要依靠专业人士的鉴定。
月季的检索表
月季的检索表
【最新版】
目录
1.月季的基本信息
2.月季的检索表概述
3.月季检索表的分类方法
4.月季检索表的应用实例
5.月季检索表的优点与局限性
正文
月季,被誉为“花中皇后”,是蔷薇科、蔷薇属的植物。
它种类繁多,花色丰富,香气四溢,具有极高的观赏价值。
为了方便人们对月季进行分类和研究,人们制作了月季的检索表。
月季的检索表,是一种将月季按照一定的特征进行分类的工具。
它通常以月季的形态特征、生长习性、花色、花香等为依据,将月季分为不同的种类。
这种分类方法可以帮助人们快速准确地识别月季,同时也为月季的研究和栽培提供了便利。
在月季检索表中,月季被分为多个分类,例如按花色分类,可以分为红色系、粉色系、白色系等;按花香分类,可以分为浓香型、清香型等。
这些分类方法可以帮助人们根据不同的喜好,选择适合自己的月季品种。
月季检索表的应用实例非常广泛。
例如,在园艺市场上,商家可以通过月季检索表,快速向消费者推荐适合其需求的月季品种;在月季栽培研究中,研究人员可以通过月季检索表,了解不同品种之间的亲缘关系,从而为培育新品种提供依据。
尽管月季检索表具有很多优点,但是它也存在一些局限性。
首先,月季检索表的制作需要耗费大量的时间和精力,对于一些非专业的人来说,
可能难以完成。
其次,月季检索表的分类方法可能存在一定的主观性,不同的人可能会有不同的分类结果。
因此,在使用月季检索表时,需要综合考虑多种因素,避免片面理解。
总的来说,月季检索表是一种重要的园艺工具,它帮助人们更好地了解和利用月季这种美丽的植物。
50个月季品种表型多样性分析及综合评价
50个月季品种表型多样性分析及综合评价
源朝政;郑明燕;鞠乐;阴志刚;高小峰;王虹
【期刊名称】《天津农业科学》
【年(卷),期】2022(28)10
【摘要】为了完善月季评价体系,探究不同月季品种表型性状的遗传多样性,为后期选育和高效利用月季种质资源提供参考依据。
调查和分析了50个不同月季品种的14个表型性状,统计和计算调查数据,并进行相关性分析和评价。
结果表明:供试月季品种间表型性状有着不同程度的变异,7个表型性状的遗传多样性指数变化范围在1.54~4.34,变异系数变化范围在18.35%~65.93%,其中花类型变异系数最小,品种类型的变异系数最大。
8个表型性状相关性分析中,花香和花类型呈显著正相关,花类型和叶形呈极显著正相关,嫩茎颜色和叶色呈显著负相关。
主成分分析表明,前6个主成分的特征值均大于1,累计贡献率为71.09%。
综上所述,红色系依然是主流色彩,浓香型品种是主要育种方向之一,50个供试月季品种中‘香槟酒’观赏性最高,‘白珍珠’观赏性最低。
【总页数】5页(P19-23)
【作者】源朝政;郑明燕;鞠乐;阴志刚;高小峰;王虹
【作者单位】南阳市农业科学院
【正文语种】中文
【中图分类】S682.39
【相关文献】
1.基于表型性状的番茄品种评价和遗传多样性分析
2.现代月季品种表型性状分析与评价
3.47份月季品种表型多样性分析及综合评价
4.梁王山大花香水月季居群表型多样性分析
5.油莎豆种质资源表型性状遗传多样性分析及综合评价
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辽宁农业科学2017(3) :9~ 14Liaoning Agricultural Sciences文章编号:1002 - 1728(2017)03 -0009 -06 doi:10. 3969/j.issn. 1002 - 1728. 2017. 03. 002现代月季6个表型性状和S S R标记的关联分析*周俐宏1王金刚2王志刚1张兴3龚束芳2樊金萍2车代弟2(1.辽宁省农业科学院花卉研究所,辽宁沈阳110161;2东北农业大学园艺学院,黑龙江哈尔滨150030;3.黑龙江省科学院,黑龙江哈尔滨163000)摘要:对80个现代月季品种进行标记和复杂数量性状之间的关联分析,分析的6个表型性状包括香味、叶绒 光、叶质、叶长、叶宽和花径。
利用SPSS软件统计分析了每对性状间的相关性,其中,叶质和叶宽(R = -0.370, P<0.01)、叶长和叶宽(R= 0.917, P<0.01)、叶宽和花径(R= 0.561,P<0.01)、叶长和花径(R =0.558, P<0.01)成极显著相关;现代月季24个微卫星位点的平均等位基因数量和PIC值分别为11.42(2〜31)和0.0,异质性为0〜0.98,说明所选群体的遗传变异较大;用Powemarker软件分析现代月季表型性状和标记间的关联,成功的找到了与现代月季6个表型性状相关联的SSR标记。
关键词:现代月季;表型性状;SR;关联分析中图分类号:S685. 12 文献标识码:A现代月季(没0北)隶属于著薇科(Roace- ae)蔷薇属(R o a)多年生木本花卉,是世界上应用最普遍的观赏植物之一。
月季的生产和应用主要包括切花月季、庭院月季和盆栽月季(Honrand-Saint Oyant L.扣‘,2007)。
尽管月季具有巨大的经济价值,但对于月季属植物的表型性状遗传研究却知之甚少。
解决性状的遗传是探索许多问题的前提,其中一个重要的步骤是找到控制表型性状的基因在基因组所处的位置,而分子标记正是一个有效的工具。
找到基因附近的标记,就可以进行标记的辅助选择育种(Kraakman A. T.W.,2005;苏成付,2014)。
SSRs标记稳定性好,重复 性高,共显性并广泛存在和分布于高等植物的整个基因组中(Morgante and Olivieri,1993;李桂东,2015)。
SSRs 位点广泛存在于月季基因组中,基因组SSR标记在月季上已经得到了应用(Esselink et al.,2003 ;Yan et a l.,2005;Zhang ,2006;周青,2014;邱彤,2015),月季基因组中大约每1K b就有一个微卫星位点(Zhang e al.,2006),应用SSRs标记去解释标记性状关系的问题比其他类型的标记更能解决问题。
文中主要研究了现代月季6个性状(香气、叶绒光、叶质、叶长、叶宽和花径)间及6个性状和SSR标记间的 关联性,找到与6个现代月季表型性状相关联的SSR标记位点,为现代月季的标记辅助选择育种提供基础。
1材料与方法1. 1植物材料和田间试验为了获得最大可能的遗传多样性和最小的群体样本,最终选择80个现代月季品种作为试验材料。
2015年 调查现代月季香气、叶绒光、叶质、叶长、叶宽和花径性状,每个品种不少于5株至少3次重复。
在性状的数量化 上,采用等级数量编码方法,具体参照贾元义(2005)《月季品种资源的收集、分类和评价》。
1.2表型性状的统计分析用SPSS软件分析现代月季6个表型性状的遗传参数 和相关系数。
1.3 S S R分析应用改良的C T A B法提取现代月季基因组DNA (Torres A M et a,1993)。
共筛选 102 对 SSR 引物,其中 71对引物(引物命名参照原文献)参考S.Rajapake (2001),Z.Yan(2005),另外,本研究根据EST数据库开发了 31对EST-SSR引物(引物命名为NEA1-31)。
本试 验所用24对引物情况见表1。
反应体系(总体积20 p l)包括3pmol引物,0.2 m M dNTPs,0. 5U Taq 酶,1X 缓冲液,3 m M MgCl2和 30 ng收稿日期:017-04-11基金项目:东北农业大学创新项目(C X Z004);黑龙江省教育厅海外学人科研资助项目(115h04)作者筒介:周俐宏(1984 -),女,辽宁盖州人,助理研究员,博士,主要从事花卉资源与育种研究。
E-mail: V c k y l h@ 1663.c o m 通讯作者:车代弟(1964 -),女,黑龙江哈尔滨,教授,博士,主要从事花卉育种与栽培研究。
E-mail:898462546@ qq. c o m•10 •辽宁农业科学2017 年DNA。
PCR反应程序为94丈2min;94丈45 s,退火(温 度见表1)30 s,72丈45 s(35个循环)和72丈延伸10 min。
PCR产物在6%的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳上检测,银染法染色(曹立成,2006),照相。
1.4 数据处理Powermarker软件(Liu K and Muse S.,2005)计算每 个SSR标记的基因多样性、等位基因频率、PIC值以及性状与标记的关联分析。
2结果与分析2.1表型性状的评定对现代月季的6个主要表型性状进行相关性分析的结果见表2,其中相关系数极显著的有:叶质与叶宽(R = -0.370, P<0.01)、叶长与叶宽(R=0.917, P<0.01)、叶宽与花径(R =0. 561,P<0. 01)、叶长与花径(R = 0.558, P<0.01)。
表1现代月季多态性S S R引物对性质(F,正向;R,反向)Table 1 Properties of rose polymorphic SSR primer pairs (F,forward;R,reverse)名称N a m e 重复单元数S S R motif退火温度Annealing temperaturem正义序列Sequence F(一3。
反义序列S e q u e n c e R(一3,)N E A02(C T)150A C T G G C A G G T G G C A A C A C G C C G A G A T A G G A A A T GN E A06(C T)150C T A C T G G C A G G T G G C A A C A C G C C G A G A T A G G A A A T G G TN E A07(C T)150C T A C T G G C A G A T G G C A A C A C G C C G A G A T A G G A A A T GN E A10(C T)550C T T T G C G A T T C C T C T G C G A T C T C C T T G G C G T T G C T GN E A14(T C)1250C C C C T G A C C C A A C A A C C A G A G C C A A G A G C A AN E A15(T C)1250C C C C T G A C C C A A C A A A C G C T T T C G G C T T C TN E A16(T C)1250C C C C T G A C C C A A C A A G C A A A C T C C G C C A T CN E A17(T C)1250C C C C T G A C C C A A C A A C A G A G C C A A G A G C A A G TN E A19(c g t)750A G A C T G A G A A T G G C T A G T T C C C T T T G T T G A GN E A20(C T)1050T T C A G A A A C G G C A T A A A C C C A A A C C A G C A A G A G T A GN E A21(C T)1050C A G A A A C G G C A T A A A C A A G C A G C A C C A T T A G A A A G A GN E A22(C T)1050T C G T G T T C T C C G T C C T G T C A T C A G G C A A A G CN E A23(C T)1550C T T T G C G A T T C C T C T G T C T C C T T G G C G T T G CN E A25(C T C)750T C A C A G A G C C G A A A A C T T G A T G A C G A T G T A G C CN E A26(C T A G)550A A G G C A A G A A C A G C A G A T T G A A A A G T A A C G A T GN E A27(C T A G)550A T C A A C A A A G C A A A G G G A A A A G T A A C G A T G A A A T A GN E A28(C T A G)550A G A A G G C A A G A A C A G C G A T T G A A A A G T A A C G A T GN E A29(C T A G)550A A G G C A A G A A C A G C A G A A A A G T A A C G A T G A A A T A GN E A30(C T A G)550A A C A A A G C A A A G G T C T G A A T G A A A A G T A A C G A T GN E A31(T T G T T)450G C A G T G T A T C A A C G C A G A G A C C A T C G C C G T C C T TR w5G14(c t)7(c)855T G G T T T G G G G T T T T G T G T C T G C A C A G T C T C C A C C T G A C A AR w l2J12(C T)1155C A G T G T C C A T G C T G A C G A G T T G C T C C T G T T T T C T C T T T G C TR w15D15(C T)1155C G G C T A G C A A T C A G T G A C A A G G T C T T C C C T A A T G C C C A A TC T G356(G G A)1555G T C A T C A A G G A G G A C C A G G A G A T C A G C G A C C A C C A T G T C表2现代月季9个性状的相关性Table2 Correlations between nine traits in modern rose性状香气叶绒光叶质叶长叶宽花径Phonotype(Fr(V e(L C)(L L(L W(F D 香气(Fr)1叶绒光(Ve)0.1301叶质(L C)-0. 1710.1181叶长(L L)-0.0320.037-0.330 *1叶宽(L W0.084-0.005-0.370 * *0.917* *1花径(F D)-0.014-0.159-0.0860.558 * *0.561 **1注:F r为香气,V e为叶绒光,L C为叶质,L L为叶长,L W为叶宽,F D为花径;*表示差异显著(P<0.05) ,表示差异极显著 (P <0.01)N o t e:Fr as Fragrance ,V e as Velour ,L C a s Leaf character ,L L as Leaf length ,L W as Leaf width ,F D as Flower diameter;“ * ”nean significant difference (P <0.05 ) ,“ * * ”m e a n the most significant difference (P <0.01 )第3期周俐宏等:现代月季6个表型性状和S SR 标记的关联分析• 11 •2. 2 S S R s 多态性102个SSRs 标记共有59个SSR 位点扩增出多态性, 其中36个SSRs 引物来自于基因组DNA ,23个SSRs 引物 来自于现代月季EST 数据库自行设计获得。