高通量测序原理篇-Illumina测序原理4

高通量测序原理篇-Illumina测序原理4
那么要读这个Index序列，先用碱把上面这根测完“Read 1”的序列把它上面的那条DNA链给解链掉，再加入中性液。

然后，加入“Read 2”的这个测序引物，“Read 2”结合的位点正好再这个Index序列的旁边。

接下来进行第二轮测序，一般来说读到6～8个碱基，把这6～8个碱基读下来。

我们就可以知道，我们具体的DNA它来自于原始的哪个样本。

5）双端测序
这是Illumina最核心的另外一个技术，就是双端测序。

双端测序就是一根DNA链，除了从正向读一遍，还可以从DNA的负向再读一遍。

这样一下子就把Illumina测序的有效长度加了一倍。

这是非常有实际用途的。

那么这个倒链的过程，是先让DNA先合成，合成出来这跟互补链。

有了这个互补链之后用一个化学试剂再原来这根链的根上切一下，切一下原来这跟链的模板链就掉了，剩下那根互补链。

再接下来就进行第2端的测序。

第二段的测序原理和第一段的测序原理是一样的，加上了“Read 3”的引物，依次往下，一个一个碱基地往下读。

最重要的事情是一个点经过几百个循环就读出了几百个碱基，这个芯片上可以有上亿个点，“cluster”也就是簇，上亿个簇每一个循环都可以读出那么多序列。

这也就是Illumina测序非常强大的原因，
因为是成千上完，准确说是上亿个链都在合成，就得到了一个很大的数据量。