龙眼胚性愈伤组织中TFL1基因克隆及其表达分析
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因在 多 年生 植物 中与维持 童期 性状 有关 。
条 5 ' - R AC E引 物 ,并 结 合 G e n e R a c e r M T 5 P r i m e r 和
儿J 作 为 重要 的开 花抑 制 基 因 , 在龙 眼 的研 究 G e n e R a c e r M T 5 N e s t e P r i me r 引物 , 以龙 眼 松散 型 胚性 中未 见 报道 。 近 年来 , 福建 农林 大学 园 艺植 物生 物工 愈 伤 组 织 c D N A 为 模 板 ,进 行 巢 式 P C R反 应 扩 增
8 期
陈裕 坤等
龙眼胚性愈伤组织 中 T F L 1 基 因克 隆及其表达分析
1 7
分生组织 , 在 顶 端 开 花 ; 超 量表达 T F L 1基 因 导 致 园艺 植物 生物 工程 研究 所 实验 室 龙 眼转 录组 数据 库 拟南 芥 营养生 长和花序 生长都 延长 , 开花时 间推迟嘲 。 Wi g g e等 同 研究表 明 , m 基 因通 过 营 养 生 长 阶段 中注 释 为 吼 的 U n i g e n e序列 , 经 G e n B a n k数据 库 比对 分 析后 ,采用 D N A MA N 7 . 0分别 设 计 其上 下 游
1 . 2 . 3 生 物 信 息学 分 析 。使 用 D N A MA N 7 . 0进 行 核
龙 眼松 散 型 胚 性 愈 伤 组 织 ( “ 红核 子 ” 品种 L C 2 苷 酸序列 的拼接 以及 氨基 酸序 列 的多 重 比对 ;采 用 细胞系) ,由赖 钟雄 于 1 9 9 4年诱 导 并 由福建 农 林 大 G e n e S t r u c t u r e D i s p l a y S e r v e r 进 行 基 因组 序 列 分 析 ; 学 园 艺植 物生 物工 程研 究所 长期 进行 继代 保 存 [ 1 4 ~ 6 / 。 使用 E x P A S y P r o t p a r a m在线 软件预测 D 1 MF T和 龙 眼胚 性 愈伤组 织 的转 录组 由福 建 农林 大学 园艺植 D 1 T F L 1 的理 化性 质 ;信号 肽 预测 软件 为 S i g n a l P 4 . 0 物生物工程研究所提供 , S R R a c c e s s i o n n u m b e r s : 自莆 田农业 科 学研究 所 。
D I T F L 1的潜 在 m i R N A s , 并研 究 其 在 “ 四季 蜜 ” 龙 眼 引 物序 列及 扩增 用途 见表 1 。 不 同组 织部 位 中 的表 达模 式 , 为 进一 步 研 究 D I T F L 1
依据 。
1 材 料 与方 法 1 . 1 供试 材 料
低水平表达延长植物 的营养生长 ,通过在花序分生 引物 , 以龙 眼 松散 型胚 性 愈伤 组织 e D N A为模 板 扩
组 织 中大量 表达 来 维持 花序 的无 限生长 ,从 而 抑制 增 T F L 1的部 分序 列 。 花 分生 组织 特异 基 因 的表 达 ,最 终 导致 植物 开 花 时
P C R反应 体 系 和扩 增程 序 参 照赖 呈 纯等 『 】 9 1 的方 行 相应 的调 整 。获得 目的 片段后 切 胶 回收 , T A克 隆
后进 行 P C R检测 , 并送 深圳 华 大基 因公 司测序 。
在龙 眼成 花表 达调 控 和开 花 中的作 用 机理 提 供理 论 法 , 根据 扩 增 不 同 的 目的 片段 , 对P C R扩 增 程 序 进
( 2 ) 3 一 R A C E和 5 ~ R A C E 引 物 设 计 采 用
间延 迟 。在多 年 生 的高 山南芥 中 , T F L 1阻止 幼 年植 R AC E法 ,根据 转录组分析所得 的序列分别设计 2条 株 感受 低 温 春 化 罔 ; T F L 1在柑 橘 中调 控 童期 性 状 [ ; 3 - R A C E引 物 , 结 合 G e n e R a c e r M T 3 P r i me r和 促使 将 梨 的 P c T F L 1 一 和 P c T F L 1 — 2基 因经 R N A i 干 G e n e R a c e r M T 3 N e s t e d P r i m e r 引物 , 以龙 眼松 散 型胚 扰后所 获得 的转 基 因植株 开花 提早 _ l 0 ; 将 苹 果 的 性愈伤组织 c D N A为模板 , 进行巢式 P C R反应扩增 T F L 1基说明 T F L 1基 3 末 端序 列 ; 根 据转 录组 分析 所 获得序 列 分别 设计 2
程研究所实验室对龙眼体胚发生过程开展相关的分 5 末 端序 列 。 子生物学研究 ,建立 了龙眼胚性愈伤组织转录组数 ( 3 )拼 接 验证 与 g D N A扩 增 对 转 录组 分 析所 据库 『 l 2 1 , 对 龙 眼体 胚 发 生 过 程 中 的 m i R N A s进 行 了 得 序 列 、 3 末端序列和 5 末 端 序 列 的测 序 结果 进 行 设 计 拼接验 证 引物 , P C R反应 验证 拼 接结 鉴定[ 1 3 ] 。 该研究在这些基础上 , 克隆了龙眼胚性愈伤 全 长拼 接 , 组 中 m 的 c D N A全长和 g D N A序列 , 借助生物信 果。 同时利用拼接验证 的引物 , 以龙眼胚性愈伤组织 息 学 方 法 初 步 推 测 DI T F L 1的 功 能 , 预 测 调 控 D N A为 模板 , P C R扩 增 获得 其 g D N A序 列 。所 有 的
条 5 ' - R AC E引 物 ,并 结 合 G e n e R a c e r M T 5 P r i m e r 和
儿J 作 为 重要 的开 花抑 制 基 因 , 在龙 眼 的研 究 G e n e R a c e r M T 5 N e s t e P r i me r 引物 , 以龙 眼 松散 型 胚性 中未 见 报道 。 近 年来 , 福建 农林 大学 园 艺植 物生 物工 愈 伤 组 织 c D N A 为 模 板 ,进 行 巢 式 P C R反 应 扩 增
8 期
陈裕 坤等
龙眼胚性愈伤组织 中 T F L 1 基 因克 隆及其表达分析
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分生组织 , 在 顶 端 开 花 ; 超 量表达 T F L 1基 因 导 致 园艺 植物 生物 工程 研究 所 实验 室 龙 眼转 录组 数据 库 拟南 芥 营养生 长和花序 生长都 延长 , 开花时 间推迟嘲 。 Wi g g e等 同 研究表 明 , m 基 因通 过 营 养 生 长 阶段 中注 释 为 吼 的 U n i g e n e序列 , 经 G e n B a n k数据 库 比对 分 析后 ,采用 D N A MA N 7 . 0分别 设 计 其上 下 游
1 . 2 . 3 生 物 信 息学 分 析 。使 用 D N A MA N 7 . 0进 行 核
龙 眼松 散 型 胚 性 愈 伤 组 织 ( “ 红核 子 ” 品种 L C 2 苷 酸序列 的拼接 以及 氨基 酸序 列 的多 重 比对 ;采 用 细胞系) ,由赖 钟雄 于 1 9 9 4年诱 导 并 由福建 农 林 大 G e n e S t r u c t u r e D i s p l a y S e r v e r 进 行 基 因组 序 列 分 析 ; 学 园 艺植 物生 物工 程研 究所 长期 进行 继代 保 存 [ 1 4 ~ 6 / 。 使用 E x P A S y P r o t p a r a m在线 软件预测 D 1 MF T和 龙 眼胚 性 愈伤组 织 的转 录组 由福 建 农林 大学 园艺植 D 1 T F L 1 的理 化性 质 ;信号 肽 预测 软件 为 S i g n a l P 4 . 0 物生物工程研究所提供 , S R R a c c e s s i o n n u m b e r s : 自莆 田农业 科 学研究 所 。
D I T F L 1的潜 在 m i R N A s , 并研 究 其 在 “ 四季 蜜 ” 龙 眼 引 物序 列及 扩增 用途 见表 1 。 不 同组 织部 位 中 的表 达模 式 , 为 进一 步 研 究 D I T F L 1
依据 。
1 材 料 与方 法 1 . 1 供试 材 料
低水平表达延长植物 的营养生长 ,通过在花序分生 引物 , 以龙 眼 松散 型胚 性 愈伤 组织 e D N A为模 板 扩
组 织 中大量 表达 来 维持 花序 的无 限生长 ,从 而 抑制 增 T F L 1的部 分序 列 。 花 分生 组织 特异 基 因 的表 达 ,最 终 导致 植物 开 花 时
P C R反应 体 系 和扩 增程 序 参 照赖 呈 纯等 『 】 9 1 的方 行 相应 的调 整 。获得 目的 片段后 切 胶 回收 , T A克 隆
后进 行 P C R检测 , 并送 深圳 华 大基 因公 司测序 。
在龙 眼成 花表 达调 控 和开 花 中的作 用 机理 提 供理 论 法 , 根据 扩 增 不 同 的 目的 片段 , 对P C R扩 增 程 序 进
( 2 ) 3 一 R A C E和 5 ~ R A C E 引 物 设 计 采 用
间延 迟 。在多 年 生 的高 山南芥 中 , T F L 1阻止 幼 年植 R AC E法 ,根据 转录组分析所得 的序列分别设计 2条 株 感受 低 温 春 化 罔 ; T F L 1在柑 橘 中调 控 童期 性 状 [ ; 3 - R A C E引 物 , 结 合 G e n e R a c e r M T 3 P r i me r和 促使 将 梨 的 P c T F L 1 一 和 P c T F L 1 — 2基 因经 R N A i 干 G e n e R a c e r M T 3 N e s t e d P r i m e r 引物 , 以龙 眼松 散 型胚 扰后所 获得 的转 基 因植株 开花 提早 _ l 0 ; 将 苹 果 的 性愈伤组织 c D N A为模板 , 进行巢式 P C R反应扩增 T F L 1基说明 T F L 1基 3 末 端序 列 ; 根 据转 录组 分析 所 获得序 列 分别 设计 2
程研究所实验室对龙眼体胚发生过程开展相关的分 5 末 端序 列 。 子生物学研究 ,建立 了龙眼胚性愈伤组织转录组数 ( 3 )拼 接 验证 与 g D N A扩 增 对 转 录组 分 析所 据库 『 l 2 1 , 对 龙 眼体 胚 发 生 过 程 中 的 m i R N A s进 行 了 得 序 列 、 3 末端序列和 5 末 端 序 列 的测 序 结果 进 行 设 计 拼接验 证 引物 , P C R反应 验证 拼 接结 鉴定[ 1 3 ] 。 该研究在这些基础上 , 克隆了龙眼胚性愈伤 全 长拼 接 , 组 中 m 的 c D N A全长和 g D N A序列 , 借助生物信 果。 同时利用拼接验证 的引物 , 以龙眼胚性愈伤组织 息 学 方 法 初 步 推 测 DI T F L 1的 功 能 , 预 测 调 控 D N A为 模板 , P C R扩 增 获得 其 g D N A序 列 。所 有 的