蛋白质组学及技术介绍
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第十一页，共29页
蛋白质组学的应用
• 疾病研究 • 药物研究
• 遗传病学
植物学 食品科学
微生物学
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在疾病及药物研究中的应用
• 1.发现新的疾病标志物，鉴定疾病相关蛋白质作为 早期临床诊断标志。 例如：Lei等通过2-DE和基质辅助激光解析电离飞 行时间质谱等蛋白质组学相关技术对膀胱癌患者 的尿蛋白进行分离鉴定，获得14个差异表达的蛋 白质，这些差异表达的蛋白可能是诊断和检测膀
蛋白、核蛋白、胞外蛋白。 仪器性能优良：基于高分辨率（大于105）、高质量精度（小于1ppm）质谱平台，可获得更加准确的结果。
iTRAQ技术可检测出低丰度蛋白、强碱性蛋白、小于10KD或大于200KD的蛋白。
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荧光差异凝胶电泳
• 原理
在二维电泳的基础上进行荧光标记 • 特点 DIGE荧光差异蛋白表达分析系统在传统双向电泳技术的基础上，结合了多
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研究 内容
蛋白质的研究内容主要有两方面：
1、结构蛋白质组学：主要是蛋白质表达模型的研究，包括蛋白质氨基酸序列 分析及空间结构的解析种类分析及数量确定; 2、功能蛋白质组学：主要是蛋白质功能模式的研究，包括蛋白质功能及蛋白 质间的相互作用。
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研究 内容
蛋白质组学可分为三个主要领域： 1、蛋白质的微特性以供蛋白质的规模化鉴定和他们的后翻译饰；
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在疾病及药物研究中的应用
• 3.研究膜蛋白及膜相关蛋白
Liu等利用比较膜蛋白组学方法对H5N1病毒分别感染6,12,14h的 人肺腺癌细胞A549进行蛋白分析鉴定，得到24个差异表达的蛋 白质，其中57%为膜蛋白或膜相关蛋白，通过siRNA技术鉴定出 与病毒增殖相关的几种蛋白质。
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蛋白质肽段的鉴定: 1、氨基和羧基末端分析，如：Edman 2、质谱法，包括肽片段的质谱和串联质谱法、
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质谱法：
质谱（mass spectrum）是化合物分子在真空条件下受电子流的轰击或 强电场等其他方法的作用，电离成离子，同时发生某些化学键有规律的断裂， 生成具有不同质量的带电荷的离子，这些离子按质荷比m/z（离子的质量m与 其所带电荷z的比值）的大小被收集并记录程谱的方法。
3
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二维凝胶电泳法： 二维凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚
焦分离，第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离，把复杂蛋白混
合物中的蛋白质在二维平面上分开。
2-DE有较好的分辨率，SDS-PAGE或单相IEF的最好分辨率仅 为100个蛋白，而2-DE大约为3000个蛋白。
重荧光分析的方法，在同一块胶上共同分离多个分别由不同荧光标记的样 品，并第一次引入了内标的概念，极大地提高了结果的准确性，可靠性和 重复性。在DIGE技术中，每个蛋白点都有它自己的内标，并且软件全自 动根据每个蛋白点的内标对其表达量进行校准，保证所检测到的蛋白丰度 变化是真实的。DIGE技术可检测到样品间小于10%的蛋白表达差异，统 计学可信度达到95%以上。
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iTRAQ 试剂结构
iTRAQ 试剂标记原理
4个来源不同的相同蛋白样品在一级质谱上表现相同; Balance group在二级质谱发生中性丢失; Reporter group 在二级质谱产生４个报告离子，分别是114、115、116和117;
通过分析报告离子的峰强度比值就可以分析同一个蛋白在不同样品间的表达量比值.
生物质谱技术是蛋白质组学研究中最重要的鉴定技术，其基本原理是样品分子
离子化后，根据不同离子之间的荷质比（M/E）的差异来分离并确定分子量。 对于经过双向电泳分离的目标蛋白质用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的 -C端形成的肽键）成肽段，对这些肽段用质谱进行鉴定与分析。目前 常用的质谱包括两种：基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱（MALDITOF-MS）和电喷雾质谱（ESI- MS）。
• 蛋白质分离技术：双向凝胶电泳（2DE），双向荧光差异电泳（2D-
DIGE），等电聚焦电泳（IEF）,液相色谱。
多维色谱（MDC），多维液相色谱（MDLC）． • 蛋白质鉴定技术 一级质谱：根据离子源的不同，分为基质辅助激光解吸电离-飞
行时间质谱（MALDI-TOF-MS）和电喷雾质谱（ESI- MS）。二 级质谱： 肽质量指纹图谱（PMF）。
0.05 M Tris-HCl , pH 8.8，6 M 尿素, 30% (w/v) 甘油和 2% (w/v) SDS：180 g 尿素, 150 g 甘油, 10 g SDS 和 16.7 ml 分 离胶缓冲液溶于去离子水中， 最终将 体积补足到 500ml。 此种缓冲液可于室温下保存两周。
平衡缓冲液包括 6 M 尿素和 30% 甘油，会减少电内渗，有 利于蛋白从第一向到第二向的 转移。第一步平衡在平衡液中 加入 DTT，使变性的非烷基化 的蛋白处于还原状态；第二步 平衡步骤中加入碘乙酰胺，使 蛋白质巯烷基化，防止它们在 电泳过程中重新氧化，碘乙酰 胺并且能使残留的 DTT 烷基 化(银染过程中，DTT 会导致
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在疾病及药物研究中的应用
• 4、为快速，特异，高通量的药物研究提供了技术支 持。 Lin等应用蛋白质组学技术对阿霉素处理的人子宫癌 细胞的蛋白表达变化进行研究发现，有 37 种差异表 达的蛋白质，为阿霉素抗性的子宫癌细胞的治疗提供 了诊断和治疗标志物。
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蛋白质组学的研究技术
该方法所研究的蛋白均是在体内经过翻译后修饰的，并且是可 分离的天然状态的相互作用蛋白复合物，能够反映正常生理条件下的 蛋白质间相互作用
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蛋白质相互作用
2、酵母双杂交系统：
该系统利用真核细胞调控转录起始过程中，DN A结合结构域(binding domain,BD)
识别DNA上的特异序列并使转录激活结构域(activation domain, AD)启动所调节的基
因的转录这一原理，将己知蛋白X和待研究蛋白Y的基因分别与编码AD和BD的序 列结合，通过载体质粒转入同一酵母细胞中表达，生成两个融合蛋白。若 蛋白X和Y可以相互作用，则AD和BD在空间上接近就能形成完整的有活性的转录 因子，进而启动转录，表达相应的报告基因;反之，如果X和Y之间不存在相互作 用，报告基因就不会表达。这样，通过报告基因的表达与否，便可确定是 否发生了蛋白质的相互作用。
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蛋白质相互作用
1、免疫共沉淀技术： 该技术以抗体和抗原之间的特异性结合为基础，不仅能够确定生
理条件下细胞或组织内2种目标蛋白质是否存在相互作用，还可以探 究与己知相互作用的蛋白。
它的基本原理是在非变性条件下裂解细胞，保留细胞内相互作用的蛋白质， 将目的蛋白的抗体加入细胞裂解液中，使目的蛋白在体内的相互作用蛋白成电下 来。经过洗脱，收集沉淀物并进行分离，最后对分离所获得蛋白进行鉴定。
成分 尿素 CHAPS DTT
IPG
终浓度 8M 2% 15 mM buffer 0.5%
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4x 分离胶缓 冲液
平衡缓冲液
1.5M Tris-HCl, pH8.8 和 0.4%（w/v）SDS：45.5g Tris 和 1g SDS 溶于 200ml 去离子水中，用 6N HCl 调节 pH 到 8.8， 最后用去 离子水将体积补足到 250ml，加入 25mg 叠氮 钠并过滤。此溶液可于 4°C 储存两周。
2、“差异显示”蛋白质组学供蛋白质水平与疾病在广泛范围的有力应用比较； 3、应用特定的分析技术如质谱法（包括串联质谱法、生物质谱法）或酵母 双杂交系统
以及其他蛋白质组学研究新技术研究蛋白质-蛋白质相互作用。
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研究技术
蛋白质分离策略：
1、多维色谱法，包括大小排阻色谱法、离子交换色谱法、反相高效色谱法、疏水 性相互作用色谱法等； 2、多维电泳技术，包括二维凝胶电泳法、自由流动电泳法、毛细管区带电 泳法等； 3、亲合法，包括免疫印迹法、亲和捕获； 4、细胞器，膜的复合体分离。
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蛋白质相互作用
3、蛋白质芯片技术 蛋白质芯片是一种新型的生物芯片，能够进行高通量的蛋白功能
分析。该技术实现的基础是蛋白探针在固相支持物(载体)表而的大规模集
成，利用样品中标记或未经标记的靶蛋白分子与探针进行反
应，然后通过荧光法、放射性同位素法或无标记检测法等相应的方法进行检 测，最后由计算机分析结果，获得高丰度表达蛋白。
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操作流程
第二十一页，共29页
仪器
TripleTOFTM5600+系统是快速评估药物代谢稳定性、 药物在体内特征和最终代谢产物鉴定的理想平台。在 最快采集速度条件下，用高分辨和准确质量质谱数据， 完成无与伦比的蛋白质定性鉴定工作。
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技术特点
定量精确：每组平行比较多达8个样本，标记效率高达97%，可减少样本处理、以及不同组上机造成 的实验误差。 高效率样品分离：进行SCX-HPLC分离，实现自动化操作。 高鉴定率：系统全面地研究组织或细胞中尽可能多的蛋白质，可鉴定多达6000种蛋白。 适用范围广：无物种特异性限制，理论上可用于所有物种。iTRAQ技术不仅可发现胞浆蛋白，还有膜
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实验流程
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• 仪器
荧光差异凝胶电泳系统Ettan DIGE 2D
• 试剂 1.样品标记
（1）染料
Cy2,Cy3,Cy5
与蛋白的赖氨酸的epsilon-氨基反应，产生三种带正电荷的荧光基团，在不同波长光激 发下产生荧光。
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2.一相等点聚焦 （IPG胶条水化液 （3）分离胶缓冲液 （4）平衡缓冲液 （5） 溴酚蓝溶液
新技术：稳定同位素特征标签生物质谱(SIAMS)
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iTRAQ
• 定义：同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation， iTRAQ) 技术由AB SCIEX公司研发的一种体外同种同位素标记的相对与绝对定量技术。该技术利用多种同位素试剂标 记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团，经高精度质谱仪串联分析，可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量，是近年
蛋白质组学及技术介绍
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概念
蛋白质组是在一个细胞的整个生命过程中由基因组表达的以及表达后修饰 的全部蛋白质。
蛋白质组学是蛋白质组概念的延伸。是蛋白质的规模化研究，从蛋白质水平和生 命本质层次上研究和发现生命活动的规律和重要生理、病理现象的本质，揭示基因活 动的动态表达。
蛋白质水平的分析不仅为生物分子体系提供最有效的实时分析模型而且 也获得了DNA和RNA水平上不易获得的信息。
胱癌的潜在尿标志物。
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在疾病及药物研究中的应用
• 2.探索疾病的发病机制和治疗途径。 例：Polprasert等应用蛋白质组学方法对遗传性球形红细胞增
多症的红细胞膜蛋白变化进行研究，分离鉴定出56个差异表 达的蛋白质，通过蛋白质网络分析出包括细胞死亡、细胞循 环及遗传性和血液性紊乱3个HS相关的重要网络，为进一步研 究和了解HS相关的发病机制提供了参考。
来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。
• 原理：iTRAQ 技术采用4种或8种同位素编码的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，而后进行串联 质谱分析，可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量或绝对含量。
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iTRAQ试剂
iTRAQ试剂是一种小分子同重元素化学物质，包括三部分： 1.一端是报告部分 reporter group 2.另一端是肽反应部分 peptide reactive group 3.中间部分是平衡部分 balance group • reporter group：质量为114Da、115 Da、116 Da、117Da，因此iTRAQ试剂共四种； • peptide reactive group：将reporter group与肽N端及赖氨酸侧链连接，几乎可以标记样本中所有蛋白质； • balance group：质量为31 Da、30 Da、29 Da、28 Da，使得四种iTRAQ试剂分子量均为145 Da，保证 iTRAQ标记的同一肽段m/z相同。
蛋白质组学的应用
• 疾病研究 • 药物研究
• 遗传病学
植物学 食品科学
微生物学
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在疾病及药物研究中的应用
• 1.发现新的疾病标志物，鉴定疾病相关蛋白质作为 早期临床诊断标志。 例如：Lei等通过2-DE和基质辅助激光解析电离飞 行时间质谱等蛋白质组学相关技术对膀胱癌患者 的尿蛋白进行分离鉴定，获得14个差异表达的蛋 白质，这些差异表达的蛋白可能是诊断和检测膀
蛋白、核蛋白、胞外蛋白。 仪器性能优良：基于高分辨率（大于105）、高质量精度（小于1ppm）质谱平台，可获得更加准确的结果。
iTRAQ技术可检测出低丰度蛋白、强碱性蛋白、小于10KD或大于200KD的蛋白。
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荧光差异凝胶电泳
• 原理
在二维电泳的基础上进行荧光标记 • 特点 DIGE荧光差异蛋白表达分析系统在传统双向电泳技术的基础上，结合了多
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研究 内容
蛋白质的研究内容主要有两方面：
1、结构蛋白质组学：主要是蛋白质表达模型的研究，包括蛋白质氨基酸序列 分析及空间结构的解析种类分析及数量确定; 2、功能蛋白质组学：主要是蛋白质功能模式的研究，包括蛋白质功能及蛋白 质间的相互作用。
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研究 内容
蛋白质组学可分为三个主要领域： 1、蛋白质的微特性以供蛋白质的规模化鉴定和他们的后翻译饰；
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在疾病及药物研究中的应用
• 3.研究膜蛋白及膜相关蛋白
Liu等利用比较膜蛋白组学方法对H5N1病毒分别感染6,12,14h的 人肺腺癌细胞A549进行蛋白分析鉴定，得到24个差异表达的蛋 白质，其中57%为膜蛋白或膜相关蛋白，通过siRNA技术鉴定出 与病毒增殖相关的几种蛋白质。
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蛋白质肽段的鉴定: 1、氨基和羧基末端分析，如：Edman 2、质谱法，包括肽片段的质谱和串联质谱法、
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质谱法：
质谱（mass spectrum）是化合物分子在真空条件下受电子流的轰击或 强电场等其他方法的作用，电离成离子，同时发生某些化学键有规律的断裂， 生成具有不同质量的带电荷的离子，这些离子按质荷比m/z（离子的质量m与 其所带电荷z的比值）的大小被收集并记录程谱的方法。
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二维凝胶电泳法： 二维凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚
焦分离，第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离，把复杂蛋白混
合物中的蛋白质在二维平面上分开。
2-DE有较好的分辨率，SDS-PAGE或单相IEF的最好分辨率仅 为100个蛋白，而2-DE大约为3000个蛋白。
重荧光分析的方法，在同一块胶上共同分离多个分别由不同荧光标记的样 品，并第一次引入了内标的概念，极大地提高了结果的准确性，可靠性和 重复性。在DIGE技术中，每个蛋白点都有它自己的内标，并且软件全自 动根据每个蛋白点的内标对其表达量进行校准，保证所检测到的蛋白丰度 变化是真实的。DIGE技术可检测到样品间小于10%的蛋白表达差异，统 计学可信度达到95%以上。
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iTRAQ 试剂结构
iTRAQ 试剂标记原理
4个来源不同的相同蛋白样品在一级质谱上表现相同; Balance group在二级质谱发生中性丢失; Reporter group 在二级质谱产生４个报告离子，分别是114、115、116和117;
通过分析报告离子的峰强度比值就可以分析同一个蛋白在不同样品间的表达量比值.
生物质谱技术是蛋白质组学研究中最重要的鉴定技术，其基本原理是样品分子
离子化后，根据不同离子之间的荷质比（M/E）的差异来分离并确定分子量。 对于经过双向电泳分离的目标蛋白质用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的 -C端形成的肽键）成肽段，对这些肽段用质谱进行鉴定与分析。目前 常用的质谱包括两种：基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱（MALDITOF-MS）和电喷雾质谱（ESI- MS）。
• 蛋白质分离技术：双向凝胶电泳（2DE），双向荧光差异电泳（2D-
DIGE），等电聚焦电泳（IEF）,液相色谱。
多维色谱（MDC），多维液相色谱（MDLC）． • 蛋白质鉴定技术 一级质谱：根据离子源的不同，分为基质辅助激光解吸电离-飞
行时间质谱（MALDI-TOF-MS）和电喷雾质谱（ESI- MS）。二 级质谱： 肽质量指纹图谱（PMF）。
0.05 M Tris-HCl , pH 8.8，6 M 尿素, 30% (w/v) 甘油和 2% (w/v) SDS：180 g 尿素, 150 g 甘油, 10 g SDS 和 16.7 ml 分 离胶缓冲液溶于去离子水中， 最终将 体积补足到 500ml。 此种缓冲液可于室温下保存两周。
平衡缓冲液包括 6 M 尿素和 30% 甘油，会减少电内渗，有 利于蛋白从第一向到第二向的 转移。第一步平衡在平衡液中 加入 DTT，使变性的非烷基化 的蛋白处于还原状态；第二步 平衡步骤中加入碘乙酰胺，使 蛋白质巯烷基化，防止它们在 电泳过程中重新氧化，碘乙酰 胺并且能使残留的 DTT 烷基 化(银染过程中，DTT 会导致
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在疾病及药物研究中的应用
• 4、为快速，特异，高通量的药物研究提供了技术支 持。 Lin等应用蛋白质组学技术对阿霉素处理的人子宫癌 细胞的蛋白表达变化进行研究发现，有 37 种差异表 达的蛋白质，为阿霉素抗性的子宫癌细胞的治疗提供 了诊断和治疗标志物。
第十六页，共29页
蛋白质组学的研究技术
该方法所研究的蛋白均是在体内经过翻译后修饰的，并且是可 分离的天然状态的相互作用蛋白复合物，能够反映正常生理条件下的 蛋白质间相互作用
第九页，共29页
蛋白质相互作用
2、酵母双杂交系统：
该系统利用真核细胞调控转录起始过程中，DN A结合结构域(binding domain,BD)
识别DNA上的特异序列并使转录激活结构域(activation domain, AD)启动所调节的基
因的转录这一原理，将己知蛋白X和待研究蛋白Y的基因分别与编码AD和BD的序 列结合，通过载体质粒转入同一酵母细胞中表达，生成两个融合蛋白。若 蛋白X和Y可以相互作用，则AD和BD在空间上接近就能形成完整的有活性的转录 因子，进而启动转录，表达相应的报告基因;反之，如果X和Y之间不存在相互作 用，报告基因就不会表达。这样，通过报告基因的表达与否，便可确定是 否发生了蛋白质的相互作用。
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蛋白质相互作用
1、免疫共沉淀技术： 该技术以抗体和抗原之间的特异性结合为基础，不仅能够确定生
理条件下细胞或组织内2种目标蛋白质是否存在相互作用，还可以探 究与己知相互作用的蛋白。
它的基本原理是在非变性条件下裂解细胞，保留细胞内相互作用的蛋白质， 将目的蛋白的抗体加入细胞裂解液中，使目的蛋白在体内的相互作用蛋白成电下 来。经过洗脱，收集沉淀物并进行分离，最后对分离所获得蛋白进行鉴定。
成分 尿素 CHAPS DTT
IPG
终浓度 8M 2% 15 mM buffer 0.5%
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4x 分离胶缓 冲液
平衡缓冲液
1.5M Tris-HCl, pH8.8 和 0.4%（w/v）SDS：45.5g Tris 和 1g SDS 溶于 200ml 去离子水中，用 6N HCl 调节 pH 到 8.8， 最后用去 离子水将体积补足到 250ml，加入 25mg 叠氮 钠并过滤。此溶液可于 4°C 储存两周。
2、“差异显示”蛋白质组学供蛋白质水平与疾病在广泛范围的有力应用比较； 3、应用特定的分析技术如质谱法（包括串联质谱法、生物质谱法）或酵母 双杂交系统
以及其他蛋白质组学研究新技术研究蛋白质-蛋白质相互作用。
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研究技术
蛋白质分离策略：
1、多维色谱法，包括大小排阻色谱法、离子交换色谱法、反相高效色谱法、疏水 性相互作用色谱法等； 2、多维电泳技术，包括二维凝胶电泳法、自由流动电泳法、毛细管区带电 泳法等； 3、亲合法，包括免疫印迹法、亲和捕获； 4、细胞器，膜的复合体分离。
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蛋白质相互作用
3、蛋白质芯片技术 蛋白质芯片是一种新型的生物芯片，能够进行高通量的蛋白功能
分析。该技术实现的基础是蛋白探针在固相支持物(载体)表而的大规模集
成，利用样品中标记或未经标记的靶蛋白分子与探针进行反
应，然后通过荧光法、放射性同位素法或无标记检测法等相应的方法进行检 测，最后由计算机分析结果，获得高丰度表达蛋白。
第二十页，共29页
操作流程
第二十一页，共29页
仪器
TripleTOFTM5600+系统是快速评估药物代谢稳定性、 药物在体内特征和最终代谢产物鉴定的理想平台。在 最快采集速度条件下，用高分辨和准确质量质谱数据， 完成无与伦比的蛋白质定性鉴定工作。
第二十二页，共29页
技术特点
定量精确：每组平行比较多达8个样本，标记效率高达97%，可减少样本处理、以及不同组上机造成 的实验误差。 高效率样品分离：进行SCX-HPLC分离，实现自动化操作。 高鉴定率：系统全面地研究组织或细胞中尽可能多的蛋白质，可鉴定多达6000种蛋白。 适用范围广：无物种特异性限制，理论上可用于所有物种。iTRAQ技术不仅可发现胞浆蛋白，还有膜
第二十四页，共29页
实验流程
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• 仪器
荧光差异凝胶电泳系统Ettan DIGE 2D
• 试剂 1.样品标记
（1）染料
Cy2,Cy3,Cy5
与蛋白的赖氨酸的epsilon-氨基反应，产生三种带正电荷的荧光基团，在不同波长光激 发下产生荧光。
第二十六页，共29页
2.一相等点聚焦 （IPG胶条水化液 （3）分离胶缓冲液 （4）平衡缓冲液 （5） 溴酚蓝溶液
新技术：稳定同位素特征标签生物质谱(SIAMS)
第十七页，共29页
iTRAQ
• 定义：同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation， iTRAQ) 技术由AB SCIEX公司研发的一种体外同种同位素标记的相对与绝对定量技术。该技术利用多种同位素试剂标 记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团，经高精度质谱仪串联分析，可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量，是近年
蛋白质组学及技术介绍
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概念
蛋白质组是在一个细胞的整个生命过程中由基因组表达的以及表达后修饰 的全部蛋白质。
蛋白质组学是蛋白质组概念的延伸。是蛋白质的规模化研究，从蛋白质水平和生 命本质层次上研究和发现生命活动的规律和重要生理、病理现象的本质，揭示基因活 动的动态表达。
蛋白质水平的分析不仅为生物分子体系提供最有效的实时分析模型而且 也获得了DNA和RNA水平上不易获得的信息。
胱癌的潜在尿标志物。
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在疾病及药物研究中的应用
• 2.探索疾病的发病机制和治疗途径。 例：Polprasert等应用蛋白质组学方法对遗传性球形红细胞增
多症的红细胞膜蛋白变化进行研究，分离鉴定出56个差异表 达的蛋白质，通过蛋白质网络分析出包括细胞死亡、细胞循 环及遗传性和血液性紊乱3个HS相关的重要网络，为进一步研 究和了解HS相关的发病机制提供了参考。
来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。
• 原理：iTRAQ 技术采用4种或8种同位素编码的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，而后进行串联 质谱分析，可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量或绝对含量。
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iTRAQ试剂
iTRAQ试剂是一种小分子同重元素化学物质，包括三部分： 1.一端是报告部分 reporter group 2.另一端是肽反应部分 peptide reactive group 3.中间部分是平衡部分 balance group • reporter group：质量为114Da、115 Da、116 Da、117Da，因此iTRAQ试剂共四种； • peptide reactive group：将reporter group与肽N端及赖氨酸侧链连接，几乎可以标记样本中所有蛋白质； • balance group：质量为31 Da、30 Da、29 Da、28 Da，使得四种iTRAQ试剂分子量均为145 Da，保证 iTRAQ标记的同一肽段m/z相同。