双向电泳分离水稻叶片蛋白实验教学的改进
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双向电泳分离水稻叶片蛋白实验教学的改进
王琳,杨晓勤,陈云
(扬州大学生物科学与技术学院,江苏扬州225009)
目前,双向电泳技术是研究蛋白组学十分重要的技术手段,特别是以固相pH梯度等电聚焦为第一向的双向电泳技术是当前分辨率最高,信息量最大的电泳技术。
它具有结果直观,分辨率较高,信息量大,技术成熟等优点,因此,此实验也成为本科生生物化学实验中的基础性实验,是生物化学实验教学的重要内容。
在双向电泳中,上样量大小取决于样品中蛋白质的种类、数目、检测方法的灵敏度及胶条的pH梯度范围和长度。
不同样品中蛋白的种类、数目有一定差异,所以在检测方法相同,一向IPG胶条pH梯度范围和长度相同的条件下,不同样品的蛋白上样量有差异。
为了获得一个分辨效果好和重复性好的双向电泳图谱,得到质量高的水稻叶片蛋白电泳分离效果,找出合适的蛋白上样量很重要。
作者在使用双向双向分离水稻叶片蛋白实验的传统方法时发现,根据原来的蛋白上样量分离的蛋白斑点较少且模糊。
为了提高水稻叶片蛋白的电泳分离效果,本文对此进行了探讨。
一、方法
(一)常规实验方法
首先采用三氯乙酸-丙酮法提取水稻叶片蛋白。
将叶片研磨至叶片成粉末状,加入溶液A(10%三氯乙酸(TCA)和0.07%β-巯基乙醇的预冷丙酮溶07%β-巯基乙醇的冰预冷丙酮溶液)悬浮沉淀。
4℃,11000rpm离心15min,弃上清,重复两次,将最终得到的沉淀真空冷冻干燥,然后用Bradford法测定蛋白质含量,最后通过双向聚丙烯酰胺凝胶电泳分离水稻叶片蛋白。
称取一定量的水稻叶片冻干样品,溶于裂解液中(7mol/L尿素,2mol/L硫脲,4%CHAPS,2%IPG buffer4-7,1%DTT),样品超声波处理五次,每次3-5s,间隔3s,于冰水中裂解30min,14000rpm离心20min,取上清,再离心,取上清,以充分去除杂质,获得的蛋白样品除少量用作浓度测定外,其余进行分装,于-80℃保存。
每次用之前,将分装的蛋白样品取出,室温下解冻,根据所需总的蛋白质质量取一定体积的蛋白样品,分别加入相应水化液(7mol/L尿素,2mol/L硫脲,2% CHAPS,0.4%DTT,0.5%IPG buffer pH4-7或pH3-10),终体积为350μL,再加入微量溴酚蓝振荡混匀,2000rpm离心1min,将含样品的水化液均匀地加到水化盘中。
第一向等电聚焦时,取pH4-7L,18cm干胶条,去掉保护膜,准备水化。
把干胶条胶面朝下置于水化盘中水化,加入IPG覆盖液使整个IPG strip被覆盖。
水化时间为10-12小时,温度20℃。
取出水化好的胶条,胶面朝上置于持胶槽中,胶条正负极与持胶槽正负极要一致,并使胶条与持胶槽两端电极充分接触,加适量IPG覆盖液覆盖整个IPG strip。
水化前把样品液加入水化液中。
再根据合适的电泳参数进行等电聚焦。
等电聚焦结束后,取出胶条,加入平衡液A(6mol/L尿素,0.05mol/LTris-HCI,2%SDS,30%甘油,0.1%DTT,0.002%溴酚蓝)振荡平衡15min,再换平衡液B(6 mol/L尿素,0.5mol/L Tris-HCl,2%SDS,30%甘油,0.4%碘乙酰胺,0.002%溴酚蓝)振荡平衡15min,取出胶条轻轻润洗,并去除多余的平衡液,准备第二向电泳。
采用分离胶浓度为12.5%的连续SDS-PAGE垂直平板电泳。
将已平衡好的第一向胶条置于第二向凝胶的上方,排除气泡,使二者紧密接触。
用1%琼脂糖凝胶封固胶条,接通电源,以15℃循环水浴冷却。
15mA/块胶恒流电泳30min,待溴酚蓝前沿移至分离胶中后,再增大电流至30mA/块胶,待溴酚蓝前沿距凝胶板底0.5-1cm 处,终止电泳。
电泳结束后,将凝胶浸泡于固定液(40%无水乙醇,10%冰乙酸)中固定30min或过夜,倒去固定液,以双蒸水洗4次,每次15min,然后在染色液(0.12% CBB G-250,10%ammonium sulfate,10%phosphoric acid and20%methanol)中染色3~4小时,用蒸馏水漂洗数次,再用脱色液脱色30min,然后用蒸馏水漂洗数次直至背景颜色浅淡,蛋白质点清晰即可,扫描仪扫
[摘要]为了改进水稻叶片蛋白的双向电泳分离方法,采用双向电泳法分离水稻叶片蛋白,比较和分析了两种上样量对实验的影响。
改进的上样量灵敏度高,分离条带多且清晰,表明改进的实验方法可以得到更为灵敏、清晰的图谱,能更好地适应和促进实验教学工作。
[关键词]实验教学;改进;双向电泳;叶片
[作者简介]王琳(1978—),女,江苏徐州人,博士,扬州大学生物科学与技术学院讲师,从事植物逆境生理与分子生物学研究;陈云(通信作者)(1973—),女,江苏盐城人,博士,扬州大学生物科学与技术学院副教授,从事植物逆境生理与分子生物学研究。
[中图分类号]Q503[文献标识码]A[文章编号]1674-9324(2020)41-0383-02[收稿日期]2020-04-02
描胶图。
具体方法参照王[5]等。
(二)实验方法的改进
常规的实验方法中的蛋白质样品上样量为100ug。
改进的实验方法中蛋白质样品上样量为150ug。
二、结果与分析
本实验比较了100μg和150μg两个上样量的双向电泳分离水稻叶片蛋白效果,图1(a)上样量为
100μg,图1(b)上样量为150μg,虽然图1(a)的背景较浅,但蛋白斑点明显少于图1(b),很多低丰度蛋白在图1(a)中无法检测到,而图1(b)中蛋白斑点相对较多,图1(a)中清晰的蛋白斑点在图1(b)中进一步加深,有些图1(a)中检测不到的点在图1(b)中检测到了。
因此150μg的上样量比100μg的上样量更适合水稻叶片蛋白的双向电泳分离。
Improvement of Experiment Teaching of Separating Leaf Proteins in Rice by 2-D Gel Electrophoresis
WANG Lin,YANG Xiao-qin,CHEN Yun
(College of Bioscience and Biotechnology,Yangzhou University,Yangzhou,Jiangsu 225009,China)
Abstract:To improve the method of separating leaf proteins in rice by two-dimensional electrophoresis (2-DE),leaf proteins are separated by 2-DE.The two different methods are used respectively.Results show that the modified method could can get a more sensitive and clear map,which can better adapt to and promote experiment teaching.
Key words:experiment teaching;improvement;2-DE;leaf
(a )上样量100ug 水稻叶片蛋白的电泳图谱(b )上样量150ug 水稻叶片蛋白的电泳图谱
图1
两种方法分离水稻叶片蛋白的电泳图谱
三、讨论
上样量大小对双向电泳总的蛋白质的覆盖率有很大的影响。
控制好上样量,可以得到令人满意的双向电泳图谱,提高重复性,并有利于后续的进一步分析。
上样量太小会造成蛋白点稀少,上样量太大会造成一向等电聚焦时电流太大,使得第一向电泳无法达到最佳分离效果;第二向电泳中出现严重拖尾等现象,对结果分析有很大影响。
改进的上样量更有利于获得蛋白数量多、背景清楚、灵敏度高的凝胶图像,更适合双向电泳分离水稻叶片蛋白的实验教学。
四、结论
本实验方法克服了双向电泳分离水稻叶片蛋白传统方法的一些不足,如用100ug的上样量改进为150ug的上样量,得到了更为灵敏、清晰的实验结果,更好地适应和促进实验教学工作,也有利于其他老师从中得到启发。
参考文献
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[2]张鹏飞,黄愉淋,耿双双,等.水牛睾丸曲精细管蛋白质组双向电泳方法的建立及优化[J ].基因组学与应用生物学,2019,38(4):1474-1479.[3]郭尧君.蛋白质电泳实验技术[M ].第二版.北京:科学出版社,2005.
[4]梁宋平主编.生物化学与分子生物学实验教程[M ].北京:高等教育出版社,2003.
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[6]陈凌艳,赖金莉,张力等.适用于花叶唐竹叶片总蛋白的双向电泳体系的建立[J ].分子植物育种,2019,17(7):2303-2311.。