2008-2009基因组与蛋白质组学试卷A答案

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河南农业大学2008—2009学年第1学期
《基因组与蛋白质组学》试卷(A卷)参考答案及评分标准
一、填空(每空1分,共22分)
1、1994年,澳大利亚
2、转换、颠换
3、DNA方阵的构建、探针制备、分子杂交、杂交图谱的分析和检测
4、基因倍增、重排、水平迁移
5、表达谱蛋白质组学、细胞谱蛋白质组学、功能蛋白质组学
6、荷质比(m/z)
7、NCBI, EBI(EMBL), DDBJ
8、原位合成,点样法
9、古细菌、真细菌
二、名词解释(每小题3分,共18分)
1、双脱氧测序:依靠DNA双链互补的原理,在含有放射性同位素标记的dNTP 和ddNTP的条件下互补链在特定的核苷酸位置终止,经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,获得DNA序列的方法。

(3分)
2、YAC:酵母人工染色体,能够在酵母中复制, 可以携带150kb-1.5Mb的DNA 片段的载体。

(3分)
3、印迹现象:在哺乳动物中通过标记某些基因使得仅有父体或母体的基因得到表达, 而另外一个基因则保持沉默, 这种情况叫做印迹现象。

(3分)
4、单核苷酸多态性:在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。

(3分)
5、蛋白质组:由一个细胞,一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质,是一个整体概念。

(3分)
6、表达序列标签(EST): 一个cDNA的5’端或3’端为起点的短片段。

(3分)
四、简答题(每题6分,共30分)
1、简述微卫星DNA的特点。

(6分)
短的,简单的串联重复序列;(1分)
基元是1-6个碱基(有的定义为1-5个碱基);(1分)
广泛存在于真核细胞整个基因组的不同位置上;(1分)
高度多态性(微卫星DNA长度的多态性) ;(1分)
微卫星DNA两端多是高度保守的单拷贝序列;(2分)
2、简述基因芯片技术原理。

(6分)
核酸分子杂交,即依据DNA双链碱基互补配对、变性和复性的原理(2分)
大量寡核苷酸分子固定于支持物上后与标记的样品分子进行杂交(2分),通过检测杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息。

(2分)
3、简述基因组与蛋白质组的关系。

(6分)
相同点: 都属于整体概念,(1分)
蛋白质组是基因组的反映,但不是一个基因组的直接产物(1分)。

不同点: 基因组:均一性和完整性(1分)
非常稳定,不易发生改变(1分)
蛋白质组:特殊性和多样性(1分)
可变性,高度动态的(1分)
4、简述双向电泳技术的操作过程(6分)。

样品制备(1分);等电聚焦电泳(1分);平衡(1分);SDS-PAGE电泳;
(1分);染色(1分);图像分析(1分)
5、简述基因组与蛋白质组学研究中常用的技术(6分)
基因组学研究:
PCR扩增技术(1分)、基因芯片技术(1分)
蛋白质组学研究:
双向电泳技术(1分)、质谱技术(1分)、酵母双杂交技术(1分)
生物信息学技术(1分)
五、论述题(30分)
任选某一物种(如细菌、酵母、植物……),根据所学的《基因组与蛋白质组学》的内容,设计一种高通量的实验,分析该物种在某一环境胁迫因子(如缺氧、高温、水分缺失等)下基因组表达的变化。

答:1.选取某一物种,分为实验组和对照组进行培养,对照组为正常条件,实验组为某一环境胁迫因子进行处理实验。

(6分)
2.利用基因芯片进行该实验。

将该物种基因组中的一些基因特异性片段
变性后,固定在基因芯片上,制成微阵列。

(7分)
3.提取对照组及实验组的mRNA,分别进行逆转录,合成cDNA。

并分别
标记为不同颜色,等量混合作为探针。

(7分)
4.杂交。

(3分)
5.检测信号。

根据颜色深浅以及电脑软件处理结果,既能看出该物种在
某一环境因子胁迫下的基因组表达情况。

(7分)
如果利用双向电泳技术进行分析,比较对照和实验组的材料蛋白质组水平变化的也应当对应上述分值,适当给分。

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