德尔卑沙门菌PFGE分型探索

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鸡源沙门菌PFGE分型及耐药性研究

１．１．２主要仪器及试剂１２种抗生素药敏纸片，包
严重，耐药菌株不断出现，耐药谱逐年加宽，耐药机制
越来越复杂。ＰＦＧＥ是一种基于分子水平的分型方法，近年来被广泛应用于分子流行病学研究¨ ３］。ＰＦＧＥ有分辨率高、重复性好、结果准确、易于标准化等优点，在细菌基因组较庞大的背景下，能相对准确地反映菌株的
（西北农林科技大学动物医学院，陕西杨凌７１２１００）
摘要：为了解某规模化养鸡场沙门菌的流行情况及耐药现状，对分离于该场的病、死鸡４２株沙门菌进行
血清型鉴定，Ｋ－Ｂ药敏纸片法检测分离茵的药物敏感性，采用脉冲场凝胶电泳（ｐｕｌｓｅｄｆｉｅｌｄｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ，
营养琼脂培养基、脑心浸液琼脂培养基为北京路桥公司产品；沙门菌诊断血清（泰国）由中国兽医药品监察所张纯萍老师提供；蛋白酶Ｋ、限制性内切酶ＸｂａＩ为宝生物工程（大连）有限公司产品；ＰＦＧＥ专用琼脂糖（ＳｅａＫｅｍＧｏｌｄＡｇａｒｏｓｅ）为美国Ｌｏｎｚａ公司产品；细胞悬浮液（ＣＳＢ）和细胞裂解液（ＣＬＢ）均为新鲜
４２株鸡源沙门茵可分为７个ＰＦＧＥ型，各型间相似性较高，部分型菌株间相似性高达９Ｏ以上。结果表明，该

沙门菌的检验技术ppt课件

沙门氏菌前增菌培养基
缓冲蛋白胨水(BPW) 肉汤：是基础增菌培养基，不含任何抑制成
分，有利于受损伤的沙门氏菌复苏。使受损伤的沙门氏菌细胞恢复到稳定的生理状态。2003版本标准仅用于加工食品或冷冻食品的前增菌。
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（二）选择性增菌
范围
• 本标准规定了食品中沙门氏菌（Salmonella ）的检验方法。
• 本标准适用于食品中沙门氏菌的检验。
设备和材料
除微生物实验室常规灭菌及培养设备外，其他还有：
★冰箱：2 ℃～5 ℃。
★无菌培养皿
★恒温培养箱
★无菌吸管
★均质器
★无菌毛细管
★振荡器
★ pH 计或pH 比
★电子天平：感量0.1g
按照显色培养基的说明进行判定。
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沙门氏菌分离培养基
使用BS、XLD、HE、沙门氏菌显色培养基
2003版本国标：BS、DHL（或HE、WS、SS） FDA：BS、XLD、HE AOAC：BS、XLD、HE ISO：phenol red brilliant green琼脂、BS或HE
为了最大可能的检出沙门氏菌，原则上必须使用两种以上选择性分离培养基。
色管或精密pH 试
★无菌锥形瓶:容量500mL，纸
250 mL
★全自动微生物生
★无菌试管
化鉴定系统
培养基和试剂
缓冲蛋白胨水（BPW ）蛋白胨水、靛基质试剂
四硫磺酸钠煌绿（TTB）氰化钾（KCN ）培养
增菌液
尿素琼脂
亚硒酸盐胱氨酸（SC）增菌液
赖氨酸脱羧酶试验培养基
亚硫酸铋（BS ）琼脂 HE 琼脂木糖赖氨酸脱氧胆盐

脉冲场电泳(PFGE)数据分析

细菌分子分型技术服务(PFGE/MLVA/MLST)一、产品描述信息过去20年的实践证明，分子分型方法在细菌的分子流行病学、种群结构分析、基因多态性分析等方面显示了很好的应用能力，在疾控、医药、农业、食品、环境、出入境检验检疫等领域发挥重要作用。

其中脉冲场凝胶电泳（PFGE）、多位点序列分型（MLST）和多位点可变数目串联重复序列分型（MLVA）三种技术是目前应用最广泛的细菌分子分型方法。

PFGE以其重复性好，分辨力强而被誉为细菌分子分型技术的“金标准”。

它可以用于大分子DNA的分离，其分辨范围达到10 Mb。

PFGE选用识别低频率酶切位点的内切酶切割基因组DNA，获得的DNA大片段在外加脉冲电场的低浓度琼脂糖凝胶中分离，产生数量有限的DNA条带，在凝胶上按染色体片段长度的不同而呈现出电泳带型，从而实现对菌株分型以检测菌株的基因多态性。

MLST是基于细菌核苷酸序列比对的一种分子分型方法，其原理是通过比较细菌个体7个或者更多管家基因的核苷酸序列的多态性，确定其基因多态性，同时通过划分序列群和构建最小生成树来揭示细菌群体遗传结构。

MLVA是基于细菌基因组中多个位点的数目可变化的串联重复序列核心序列的拷贝数的差异来对不同细菌个体进行分型的一种技术。

MLVA具有快速高通量易于操作等优点，不仅能确定基因多态性，而且能揭示细菌群体遗传结构特征。

使用PFGE、MLST、MLVA中的一种或者综合使用多种分型方法，可以揭示细菌的基因多态性和群体遗传结构，结合细菌的三间分布信息以及其他生物学信息（如耐药特征、特殊表型、毒力基因检测）等可以进行细菌的流行特征、传播机制、变异特征分析，以及特殊意义克隆群的甄别等研究，另外还可以为后续的研究，如全基因组测序、致病机制研究等项目筛选具有基因组代表性的测试菌株。

二、产品详细信息1、技术路线2、技术优势1.技术成熟，本团队具有丰富的实践经验，可为客户提供详细先进的实验方案；2.有多种分型方法组合供不同的实验目的选择；3.性价比高，适合开展大样本量的实验项目；4.快速高效，只需一个月时间可以完成100株细菌的基因多态性和种群结构分析。

鼠伤寒沙门菌PFGE分型及溯源

鼠伤寒沙门菌PFGE分型及溯源用脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型技术，研究四川省2007年鼠伤寒沙门菌分子流行病学,查找沙门菌污染源,为预测疫情和制定防治措施提供依据。

方法选择Xba I酶对12株鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切，用PFGE对菌株进行分子分型，Bionumerisc 统计软件聚类分析。

结果12株鼠伤寒沙门菌用XbaI 限制性酶切后，分成5个PFGE图谱类型，其中1个PFGE图谱类型有7株菌株，其指纹图谱的相似性达到100％，该型别占分析菌株的58.33%。

其余4个PFGE图谱类型分别有2株菌和1株菌。

含7株菌的PFGE图谱型中，源于成都市的菌株4株，攀枝花、自贡、内江市的菌株各1株。

结论PFGE分子分型与流行病学资料紧密结合可增强对鼠伤寒沙门菌食源性疾病的溯源和预警。

沙门菌是重要的食源性病原菌, 鼠伤寒沙门菌(S．typhimurium) 是我国引起食物中毒最常见的沙门菌血清型[1]。

为掌握鼠伤寒沙门菌在四川省的分布及流行状况，分析比较从不同患者分离到的同一血清型的沙门菌在分子生物学水平的异同及菌株的同源性研究，为传染源追踪和分子流行病学研究及制定防治措施提供依据，对2007年收集的鼠伤寒沙门菌进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型研究，并结合流行病学调查进行分析，结果报告如下。

1.材料与方法1.1 菌株来源12株菌株分别分离自成都市、攀枝花市、自贡市、内江市和达州市各哨点医院的沙门菌感染患者（表1），由四川省CDC进行菌株鉴定及血清学分型。

PFGE用分子质量标准参考菌株为：沙门菌Braenderup血清型全球参考菌株H9812，由PulseNet亚太区网络实验室（香港公共卫生署实验室检测中心）分发，中国疾病预防控制中心传染病预防控制所保存。

1.2 PFGE操作由中国CDC传染病所国家重点实验室完成，实验过程按中国CDC传染病所沙门菌PFGE标准操作方法进行。

取平板上的菌落进行菌体的收集及灌制凝胶块，用蛋白酶K消化和采用XbaI 限制性酶切。

不同来源沙门菌的分子分型及耐药性研究

中国病原生物学杂志2020年10月第15卷第10期Journal o f Pathogen Biology Oct. 2020，Vol. 15，No. 10• 1131 •D O I：10. 13350/j. cjpb. 201003 •论著•不同来源沙门菌的分子分型及耐药性研究*徐红红、王艳2,张小荣3,曹永忠3,吴艳涛3,巢国祥(1.扬州大学医学院，江苏扬州225001 ;2.扬州市疾病预防控制中心；3.扬州大学兽医学院）【摘要】______目的对272株不同来源的沙门氏菌进行血清型、M L S T和药敏试验，分析沙门菌的流行和耐药情况，为疾病的预防和临床用药提供科学依据。

方法对不同来源沙门菌进行血清型鉴定和M L ST分型，用M EG A5进行溯源分析，对15种常见抗生素进行药物敏感试验。

结果272株沙门菌分为19种血清型、26种S T型和4个同源复合体(CC11、CC64、CC19、CC68)，ST11(肠炎沙门菌）、ST17(印第安纳沙门菌）、ST40(德尔卑沙门菌）、S T19(鼠伤寒沙门菌）和ST34C鼠伤寒沙门菌）为主要克隆。

肠炎、鼠伤寒和德尔卑沙门菌是人和动物中常见血清型，印第安纳沙门菌在鸡中的携带率为33.64%。

每个同源复合体都有其独特的地区分布。

人源与动物源沙门菌耐药情况相关。

多重耐药菌主要包括肠炎、印第安纳、德尔卑、鼠伤寒和汤卜逊沙门菌，并对氨苄西林表现出较高的耐药。

印第安纳沙门菌对9种及以上抗生素耐药。

结论沙门菌血清型和S T型有高度的相关性。

人源和动物源沙门菌的耐药性存在明显的相关性。

耐药表型在血清型上存在差异，由鸡携带的印第安纳沙门菌是一种泛耐药克隆。

沙门菌：血清型；多位点序列分型；多重耐药【关键词】【中图分类号】R378. 22【文献标识码】A【文章编号】1673-5234(2020)10-1131-06\^Journal o f Pathogen Biology.2020 O ct；15(10)：1131 —1136» 1143.]M olecular epidem iology and antibiotic resistance phenotypes o f Salm onellae from different sourcesXU Hong-hong1，WANG Y a r r，ZHANG Xiao-rong、，CAO Yong-zhong%WU Yan-tao3，CHAOG u o-xian g1(1. College o f Medicine ^Yangzhou University ^Yangzhou »Jiangsu-, China225001；2. YangzhouCenter for Disease Control and Prevention \3. College o f Veterinary Medicine，Yangzhou Ufiiversity)【Abstract】Objective In order to provide a scientific basis for the prevention and clinical treatment of salmonellosis, the prevalence and antimicrobial resistance of 272 Salmonella isolates from different sources with serotypes were analyzed and subjected to, MLST and resistance testings. Methods The serotypes and MLST types of Salmonella from different sources were identified, MEGA5 was used for traceability analysis, and their resistance to 15 antibiotics was determined.Results The 272 isolates of Salmonella included 19 serotypes，26 ST types，and 4 homologous complexes (CC.11，CC64, CC19, and CC68). ST11 (S. enteritidis)ST17 (S. indiana) ^ST40 (S. d e r b y)ST19 (S. typhimurium') and ST34 (S. typhimurium) were the predominant clones. S. enteritidis, S. ty p hi m urium，and S. derby were the predominant serotypes in humans and animals. S. indiana was carried by 33. 64% of chickens. Each clonal complex had its own unique regional distribution. There was a correlation between resistance characteristics of human and animal-derived isolates. The multi-drug resistant bacteria mainly included S. enteritidis ^S. indiana , S. derby，S. typhimurium.and S. thornpson, which were highly resistant to ampicillin. S. indiana isolates were resistant to 9 or more antibiotics. Conclusion There was a high correlation between the serotype and ST type. There was a clear correlation between resistance characteristics of human and animal-derived isolates. Obvious differences in resistance profiles were evident between the serotypes. Carried by chickens, S. indiaria isolates were highly drug -resistant, producing a highly resistant clone.【Key words】Salmonella；serotype；multilocus sequence typing；multi-drug resistance沙门菌(Salmonella)是自然界中普遍存在的人畜共患致病微生物，不仅引起家禽的各种疾病，还能通过污染的肉类、禽蛋类、蔬菜等食物经粪口途径传播给人类:1。

O1群霍乱弧菌PFGE分子分型和菌株流行能力关系研究

ＰＦＧＥ簇［Ｇ１（ｉ）一Ｇ２（ｉ）］。各个流行时期的菌株均有优势的ＰＦＧＥ簇，散发的菌株呈现分散的ＰＦＧＥ型，没有集中趋势。结论
福建省３次流行的霍乱菌株有遗传关联性，在流行过程中产生基因变异出现新的优势ＰＦＧＦ簇；各地区间的霍乱流行有传播上的相关性。小川型Ｇ２（ｏ）ＰＦＧＥ簇和稻叶型Ｇ１（ｉ）ＰＦＧＥ簇的菌株有引起霍乱持续流行的能力，后者更有引发大规模病例数的能力。
遗传关联度和基因组的多态性；探讨不同ＰＦＧＥ型（簇）和霍乱菌株流行能力的关系。方法运用脉冲场凝胶电泳分子分型（ＰＦＧＥ）技术，对福建省１９６２ —２００５年代表性霍乱菌株进行分型，结合流行病学背景资料探讨不同ＰＦＧＥ型（簇）和相关霍乱菌株的流行能力。结果７７株霍乱菌株按１００的相似度分为６１个ＰＦＧＥ型，按照９Ｏ的相似度可得到５个主要的ＰＦＧＥ簇，命名为Ｇ１一Ｇ５；５２株小川型霍乱弧菌，按照１００的相似度分为４７个ＰＦＧＥ型，按照９Ｏ的相似度可得到４个主要的ＰＦ — ＧＥ簇［Ｇ１（ｏ）一Ｇ４（ｏ）］；２５株稻叶型霍乱弧菌按照１００的相似度分为１５个ＰＦＧＥ型，按照９Ｏ的相似度，可得到２个主要的

沙门氏菌鉴定和分型方法比对研究

沙门氏菌鉴定和分型方法比对研究沙门氏菌（Salmonella）是一种常见的食源性病原菌，可以引起沙门氏菌感染。

为了对沙门氏菌进行鉴定和分型，通常采用多种方法。

本文将对沙门氏菌鉴定和分型方法进行综述比对。

鉴定方法主要包括传统的微生物学方法和分子生物学方法。

传统的微生物学方法包括形态学观察、生理生化特性检测、血清学方法和耐药性检测。

形态学观察主要通过显微镜观察沙门氏菌细胞的形态特征，如形态、大小、颜色等。

生理生化特性检测包括酶活性检测、发酵反应、气体产生和产物生成等。

血清学方法主要通过血清学试验检测菌株表面的抗原特性，如凝集试验和血清型试验。

耐药性检测主要针对沙门氏菌对抗生素的敏感性进行检测。

分子生物学方法在沙门氏菌的鉴定和分型中起到越来越重要的作用。

常用的分子生物学方法包括PCR（聚合酶链式反应）、PFGE（脉冲场凝胶电泳）、MLST（多位点序列分型）、MLVA（多位点重复序列分析）、SNP （单核苷酸多态性）等。

PCR可以快速筛查并鉴定沙门氏菌的存在，对于流行病学调查起到重要作用。

PFGE是一种高分辨率的分型方法，可以对沙门氏菌进行亚种和菌株水平的分型，并且可以作为流行病学调查的有力手段。

MLST是一种基于菌株基因组序列的分型方法，通过分析多个基因的序列差异度，可以对不同的沙门氏菌菌株进行区分，从而研究它们的起源和传播途径。

MLVA是一种分析菌株重复序列变异的方法，可以对菌株进行快速鉴定和分型，尤其适用于传播链的追踪。

SNP是一种常用的分子标记方法，通过检测位点上的单核苷酸多态性，可以对不同的沙门氏菌进行鉴定和分型。

总结起来，沙门氏菌的鉴定和分型方法包括传统的微生物学方法和分子生物学方法。

传统的微生物学方法包括形态学观察、生理生化特性检测、血清学方法和耐药性检测。

分子生物学方法包括PCR、PFGE、MLST、MLVA和SNP等。

相比之下，传统的微生物学方法简单易行，但存在准确性不高的问题。

而分子生物学方法具有高度特异性和准确性，可以快速鉴定和定义沙门氏菌的不同亚种和菌株。

多重耐药德尔卑沙门菌临床株耐药基因的研究

ｄｅｒｌ，ｙｎｄａｔｏｄｅｔｅｃｔｉｔｓｒｅｓｉｓｔａｎｔｇｅｎｅｓ．ＭｅｔｈｏｄｓＥｉｇｈｔｃｌｉｎｉｃｌａＭＤＲｉｓｏｌａｔｅｓｏｆＳａｌｍｏｎｅｌｌａｄｅｆｂｙｓｔｒａｉｎｓｗｅｒｅｒａｎｄｏｍｌｙ
链反应（ＰＣＲ）检测ＴＥＭ、ＣＴＸ — Ｍ型Ｂ内酰胺酶基因、Ｉ型整合子相关的整合酶ｉｎｔＩ基因和ｑａｃＥＡ１２ｓｕｌ１耐消毒剂和磺胺基因，染色体和质粒介导喹诺酮耐药基因ｇｙｒＡ，ｐａｒＣ，ｑｎｒＡ／ｑｎｒＢＩｑｎｒＣ／ｑｎｒＳ，ａａｅ（６３一Ｉｂ－ｃｒ，ｏｑｘＡＳ等１２种耐药基因。结果
ＴＥＭ编码基因，ｉｎｔＩ和ｑａｃＥＡ１２ｓｕｌｌ、髓ｃ（６３一Ｉｂ－ｅｒ基因。有２株菌携ＣＴＸ — Ｍ一１４型耐药基因。在喹诺酮耐药相关基因中，５株菌的ＧｖｒＡ发生了Ｄ８７Ｓ的氨基酸突变，５株菌的Ｐａｒ（２发生了Ｔ５７Ｓ的氨基酸突变。５株菌携带。Ｂ基因，４株菌携带ｑｎｒＳ基因。所有菌株都未携带ｑｎｒＡ／ｑｎｒＢ／ｑｎｒＣ耐药基因。结论关键词：德尔卑沙门菌；多重耐药；耐药基因
Ｔｈｅ￣－ｌａｃｔａｍａｓｅｇｅｎｅｏｆＴＥＭａｎｄＣＴＸ－Ｍｙｔｐｅ，ｉｎｔｅｇｒｏｎＩ－ｒｅｌａｔｉｖｎｅ，ａｃＥＡ１２ｓｕｌｌｇｅｎｅｓ，ｌｆｕｏｒｏｑｕｉｎｏｌｏｎｅ — ｒｅｓｉｓｔｎｔａｇｅｎｅｓｓｕｃｈｓａｇｙｒＡｎｄａｐａｒＣ，ｑｎｒＡ＼ｑｎｒＢ＼ｑｎｒＣ＼ｑｎｒＳｇｅｎｅ，ａａｃ（６）一Ｉｂ — ｅｒｇｅｎｅ，ａｎｄｏｑｘＡＢｇｅｎｅ

基于PFGE技术的酸乳中乳酸菌的基因分型

基于PFGE技术的酸乳中乳酸菌的基因分型王营，张晟，孟祥晨*（东北农业大学乳品科学教育部重点实验室，黑龙江哈尔滨150030）摘要：采用选择性培养基分离酸乳中的保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌，并利用生理生化和糖发酵实验结合 16S rDNA 同源性分析对分离所得菌株进行鉴定，获得保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌分离菌株。

利用脉冲场凝胶电泳（pulsed field gel electrophoresis ，PFGE ）分别对保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌分离株进行基因分型。

结果表明：所检测的酸乳样品中均含有保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌；仅有2 种酸乳的嗜热链球菌为同一菌株，其余酸乳中的保加利亚乳杆菌及嗜热链球菌均为不同菌株。

PFGE 可以对保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌菌株进行有效的基因分型。

关键词：酸乳；保加利亚乳杆菌；嗜热链球菌；PFGE 基因分型Genotyping of Lactic Acid Bacteria Isolated from Yogurt by Pulse Field Gel ElectrophoresisWANG Ying, ZHANG Sheng, MENG Xiangchen *(Key Loboratory of Dairy Science, Ministry of Education, Northeast Agricultural University, Harbin150030, China)Abstract: Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus and Streptococcus thermophilus strains were isolated from commercial yogurts using selective media, and physiological and biochemical tests, sugar fermentation experiments and 16S rDNA homology analysis were used to identify the isolated strains. Genotyping of the strains was performed by pulsed field gel electrophoresis (PFGE). It was found that both Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus and Streptococcus thermophilus were detected in all yogurt samples. Streptococcus thermophilus had the same genotyping only in two yogurts, while other Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus and Streptococcus thermophilus strains were different in different yoghurts. The results showed that PFGE was an effective method for genotyping of different strains of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus and Streptococcus thermophilus .Keywords: yogurt; Lactobacillus bulgaricus ; Streptococcus thermophilus ; genotyping by PFGE DOI:10.15922/ki.jdst.2018.01.005中图分类号：TS201.3 文献标志码：A 文章编号：1671-5187（2018）01-0022-04引文格式：王营, 张晟, 孟祥晨. 基于PFGE 技术的酸乳中乳酸菌的基因分型[J]. 乳业科学与技术, 2018, 41(1): 22-25. DOI:10.15922/ki.jdst.2018.01.005. WANG Ying, ZHANG Sheng, MENG Xiangchen. Genotyping of lactic acid bacteria isolated from yogurt by pulse field gel electrophoresis[J]. Journal of Dairy Science and Technology, 2018, 41(1): 22-25. DOI:10.15922/ki.jdst.2018.01.005. 收稿日期：2017-10-19第一作者简介：王营（1986—），女，硕士研究生，研究方向为乳品微生物。

一起沙门菌引起食物中毒的病原检测及溯源分析

一起沙门菌引起食物中毒的病原检测及溯源分析摘要：目的对一起沙门氏菌引起的食物中毒进行病原学检测并运用脉冲场凝胶电泳（Pused-Field Gel Electrophoresis，PFGE）技术做同源性分析。

方法在一起食物中毒事件中采集了病人粪便便（或肛拭子）、可疑食物共26份样本，按照食品安全国家标准《GB4789-2010》进行病原检测，对分离出的菌株进行PFGE分子分型。

结果从患者粪便（或肛拭子）中分离出的10株沙门氏菌和可疑食物中分离出的菌株PFGE图谱一致，具有同源性。

结论在病人大便（或肛拭子）和可疑食物中均分离出沙门氏菌且PFGE图谱一致具有同源性，确认是一起沙门氏菌污染食物引起的食物中毒，显示PFGE技术对于食物中毒溯源具有重要意义。

关键词：食物中毒；沙门氏菌；脉冲场凝胶电泳（PFGE）沙门菌是一种寄生于人和动物肠道的革兰氏阴性菌，人感染后可呈无症状带菌状态，是极为常见的食源性致病菌之一（1）。

据统计，国内报道的细菌性食物中毒事件中，由沙门菌引起的占70~80%（2-3），其中引起沙门菌食物中毒的食品中，超过90%的是肉类等动物性产品。

2014年9月20日，邵阳市邵东县发生一起因食用了被污染的面包而引起的食物中毒事件，根据病例临床症状、现场流行病学调查及实验室检测结果，确定为因肠炎沙门氏菌引起的食物中毒。

1 资料与方法1.1一般资料2014年9月20日上午8点，邵阳市邵东县疾病预防控制中心接到某医院报告，该院儿科自9月16日陆续收治25例发热伴有恶心、呕吐、腹疼、腹泻等症状的病例，初步诊断疑似食物中毒。

经调查，患者均食用过某连锁面包店“骨肉相连”面包，发病大多集中在食用面包后4~10小时，主要临床症状为恶心、呕吐、腹疼、腹泻、发热等急性肠胃道中毒症状，经使用抗生素药物及对症治疗后，患者病情全部好转，无死亡病例。

1.2方法1.2.1 样品采集采集患者粪便标本25份，其中未用药患者标本1份，用药后患者标本24份。

遵义市食源性沙门菌分子分型及耐药研究

遵义市食源性沙门菌分子分型及耐药研究
韦德琴;朱琳
【期刊名称】《检验医学与临床》
【年(卷),期】2024(21)6
【摘要】目的了解遵义市食源性沙门菌分型及耐药特征。

方法收集遵义市2020-2022年食源性沙门菌,采用玻片凝集法对沙门菌进行血清分型,利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对沙门菌进行分子分型,采用肉汤稀释法对沙门菌进行耐药监测,应用BioNumerics软件进行数据分析。

结果收集的21株沙门菌分为16种血清型,其中肯塔基沙门菌3株、德尔卑沙门菌2株、肠炎沙门菌2株、希林登沙门菌2株,其余均为1株。

PFGE结果显示带型呈现多态性,同源性最高为62.96%。

药敏试验结果显示食源性沙门菌对氨苄西林耐药率最高,为71.43%,其次对四环素耐药率达61.90%,多重耐药率为76.19%。

结论遵义市食源性沙门菌血清型和遗传性多样,对抗菌药物的耐药率高,多重耐药严重。

【总页数】5页(P789-792)
【作者】韦德琴;朱琳
【作者单位】贵州省遵义市疾病预防控制中心检验科
【正文语种】中文
【中图分类】R446.5
【相关文献】
1.淮安地区食源性沙门氏菌耐药性及分子分型研究
2.2018—2020年湖州市食源性疾病患者感染沙门菌耐药与分子分型研究
3.2019年—2021年衡阳市食源性沙门菌血清型、分子分型及耐药性研究
4.云南省肠炎沙门菌及德尔卑沙门菌脉冲场凝胶电泳分子分型及耐药性研究
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变形杆菌基因分型方法的评价

变形杆菌基因分型方法的评价贾宁;林茂虎;陈世平;索继江;邢玉斌;江朝光【期刊名称】《中华医院感染学杂志》【年(卷),期】2002(12)9【摘要】目的筛选出适用于变形杆菌的最佳分型方法。

方法用脉冲场凝胶电泳 (PFGE)、随机扩增多态 DNA(RAPD)、重复元件序列 PCR(Rep-PCR)和肠杆菌基因间重复共有序列 PCR(ERIC-PCR) 4种方法对 44株变形杆菌进行基因分型。

结果 RAPD可分为 17型 ,分辨率系数为 0 .93 2 ;Rep -PCR可分为 15型 ,分辨率系数为0 .916;ERIC-PCR可分为 2 3型 ,分辨率系数为 0 .941;PFGE可分为 3 6型 ,分辨率系数为 0 .988。

结论 PFGE、RAPD、Rep-PCR和 ERIC-PCR4种基因分型方法对变形杆菌进行分型 ,其分型力和分辨力均很好 (均 DI>0 .90 ) ,其中PFGE分辨力最高 ,重复性好 ,但实验费用高 ,时间长 ,对大规模广泛应用有局限性 ;Rep-PCR和 ER-IC-PCR分辨率虽略底于 RAPD,但重复性好 ,结果稳定 ,可广泛应用于多种菌属 ,不需要重复设计引物 ,易于实现标准化。

【总页数】3页(P652-654)【关键词】变形杆菌;基因分型;PCR【作者】贾宁;林茂虎;陈世平;索继江;邢玉斌;江朝光【作者单位】解放军总医院;解放军第304医院【正文语种】中文【中图分类】R378.2【相关文献】1.3种基因分型方法在鲍曼不动杆菌中的应用评价 [J], 姜飞;邓丽华;康海泉;赵晓杰;马萍;李洪春2.高分辨率熔解曲线方法在指导华法林使用起始剂量基因分型中的应用及临床各种基因分型方法的比较 [J], 崔广林;丁虎;徐宇军;陈琛;汪道文3.乙型肝炎病毒基因分型的临床意义及基因分型方法 [J], 彭锐(综述);张洪(审校)4.三种基因检测分型方法在耐碳青霉烯抗生素肺炎克雷伯菌基因分型中的应用对比观察 [J], 王凤平;朱梓年;张霆;张拔山5.悬浮芯片HPA基因分型方法的建立及评价研究 [J], 安群星;党璇;胡兴斌;易静;尹文因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

一起婴儿沙门氏菌引起的食源性疾病调查及病原分析

一起婴儿沙门氏菌引起的食源性疾病调查及病原分析发表时间：2019-09-08T10:11:29.660Z 来源：《健康世界》2019年8期作者：金武丽1 钱彦东1 蔡丽1 何金艳1 姚颖波2 闫[导读] 也提示各级政府和相关部门要加强对农村广大民众进行防病知识的宣传，普及卫生知识，提高自我保护意识，尽量避免类似事件的发生。

1.玉溪市江川区疾病预防控制中心 652600；2.玉溪市疾病预防控制中心 653100；3.中国疾病预防控制中心传染病预防控制研究所 102206摘要：目的对一起农村家簇聚餐引起的食源性疾病进行调查分析，查明暴露因素，确定致病因子，为采取相应防治措施提供依据。

方法通过流行病学调查并采集患者粪便进行病原分离鉴定；对分离株进行药敏试验及基因鉴定。

结果本次食源性疾病涉及8户34人，发病12例，罹患率为35.29%，潜伏期集中在8－9小时之间，在9例患者肛拭子标本中，分离出婴儿沙门氏菌四株，抗原式属于6，7：?：1，5，标准生化代码均是0017610541166200，PFGE型别一致；四株分离株对氨苄西林、阿莫西林、阿莫西林/棒酸、头孢噻吩、头孢他啶、头孢派酮、头孢噻肟、庆大霉素、亚胺培南、阿米米星、复方新诺明、左氧氟沙星、诺氟沙星、环丙沙星、妥布霉素100%敏感；对利福平、萘啶酸100％耐药；对四环素的敏感率及中介率均是50％。

结论本次事件是由婴儿沙门氏菌引起的食源性疾病，应加强农村食品卫生宣传和管理工作，提高村民的自我防病意识，尽量避免类似事件的发生。

关键词：食源性疾病；婴儿沙门氏菌；抗生素敏感性实验Infants with salmonella foodborne disease investigation and the analysis of pathogenJIN Wu-li*，QIAN Yan-dong，CAI Li，HE Jin-yan，YAO Ying-bo，YAN Mei-ying* Jiangchuan county center for disease control and prevention in yunnan province，652600；Abstract：[Objective] Foodborne diseases caused by the rural home with clustering mealwere investigated，and find out the exposed factors，determine the pathogenic factor，provide the basis for take corresponding prevention measures.[Methods ] Through the epidemiological investigation and collecting feces to identify the pathogen separation；Drug susceptibility test was carried out on the isolates and gene identification.[Results] The foodborne disease involving 8 34 people，12 cases，the cancer rate was 35.29%，the incubation period between 8-9 hours，in 9 patients anal swab specimens，the four strains of salmonella isolated babies，antigen type belong to 6，7：?：1，5，standard biochemical code is 0017610541166200，PFGE type don't agree；Four strains of isolates of ampicillin，amoxicillin，amoxicillin/rods acid，cefalotin，he organism，cephalosporin cefepime send ketone，cefotaxime，gentamicin，imine south，Amy m star，and compound new Ming，levofloxacin，norfloxacin，ciprofloxacin and tobramycin 100% sensitive；To rifampin，nalidixic acid 100% resistant；The sensitive rate of the tetracycline and mediation rate is 50%.[Conclusion] The incident is caused by the infant salmonella foodborne disease，should strengthen the rural food hygiene propaganda and the management work，improve the villagers' self prevention consciousness，try to avoid similar incidents from happening.Key words：Foodborne diseases；Infant salmonella；Antibiotic sensitivity experiments沙门氏菌是世界上引起食源性腹泻最常见的病原菌之一，在多种动物的肠道中带菌率很高，截止2007年我国共发现322个不同的血清型，引起感染最常见的有甲型副伤寒等16个血清型；婴儿沙门菌（S.Infantis）属于引起感染较常见的21种血清型之一[1]，其传染源是动物（禽类为主）、食物和人类带菌者。

产单核细胞李斯特菌流行现状调查及PFGE分子亚分型分析的开题报告

产单核细胞李斯特菌流行现状调查及PFGE分子亚分型分析的开题报告一、题目产单核细胞李斯特菌流行现状调查及PFGE分子亚分型分析二、研究背景产单核细胞李斯特菌是一种常见的食源性细菌病原体，它可以引起人类、动物和鸟类的感染，病情轻重不一，严重的情况下会导致流产、败血症和中枢神经系统疾病等。

该细菌广泛存在于土壤、水源、植物和动物肠道中，在食品生产、加工和储存过程中容易被传播，因此控制其传播对保障食品安全至关重要。

目前，国内外对于产单核细胞李斯特菌感染的研究主要集中在其生物学特性、毒力因子、快速检测方法、药敏性等方面，对其流行现状和分子流行病学的研究相对较少。

因此，对于分离于食品和环境中的产单核细胞李斯特菌进行分子亚分型分析，可以更加深入了解其在不同来源和不同地区的分布状况和流行趋势，为食品安全管理提供参考。

三、研究目的1. 调查产单核细胞李斯特菌在不同来源和不同地区的分布情况，了解其流行现状和病原菌种类、菌群构成等基本情况。

2. 利用PFGE技术对分离到的产单核细胞李斯特菌菌株进行分子亚分型分析，探讨其分子流行病学特征和菌群间的遗传关系。

3. 分析分析产单核细胞李斯特菌线型PFGE分型与疫情监测的应用前景。

四、研究内容1. 采集不同来源（包括禽畜肉类、生鲜蔬果、水产品等）和不同地区（包括市内的超市、菜市场、餐饮店等）的样品，分离产单核细胞李斯特菌菌株，确定其菌群构成和病原菌类型。

2. 采用PFGE技术对分离到的产单核细胞李斯特菌菌株进行分子亚分型分析，并进行比较分析，揭示其分子流行病学特征，绘制亲缘树和矩阵图等。

3. 通过对PFGE分型结果与疫情监测相结合，在流行病学调查和食品安全监管中探讨其应用前景。

五、研究方法1. 采集样品并进行菌落计数，选取产单核细胞李斯特菌单克隆菌株。

2. 提取DNA，采用PFGE技术对菌株进行分型，分析其PFGE图谱特点，绘制亲缘树和矩阵图。

3. 对数据进行统计分析，并结合疫情监测等实际情况，探讨其实际应用价值。

食源性副溶血弧菌耐药性及PFGE分子分型研究的开题报告

食源性副溶血弧菌耐药性及PFGE分子分型研究的
开题报告
在全球范围内，食源性疾病一直是公共卫生和食品安全领域的热点问题。

副溶血弧菌是一种常见的食源性病原菌，常见于海鲜中，主要引起副溶血弧菌感染性腹泻等消化道疾病。

近年来，副溶血弧菌的耐药性不断加强，已经成为公共卫生领域一个新的挑战。

本研究旨在通过对食源性副溶血弧菌的耐药性及分子分型的研究，探究其流行病学特征及防控措施。

具体研究内容包括以下几个方面：
1. 食源性副溶血弧菌的采集和分离：采用食品中副溶血弧菌的培养和分离技术，从海鲜中采集副溶血弧菌菌株。

2. 副溶血弧菌菌株的鉴定及药敏试验：经过鉴定后，对副溶血弧菌菌株进行药敏试验，测定其对多种抗生素的敏感性。

3. PFGE分子分型：采用PFGE技术对副溶血弧菌进行分型，研究其分子流行病学特征。

4. 与临床分离菌株比较：将分离的副溶血弧菌菌株与在临床上分离的菌株进行比较，研究食源性副溶血弧菌菌株的来源和传播途径。

通过本研究，可以探究食源性副溶血弧菌的耐药性和分型特征，寻找其传播途径，为进一步制定副溶血弧菌的防控措施提供科学依据。