医学数据挖掘第1章.ppt
第1章 《数据挖掘》PPT绪论
Knowledge
Information
Data
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1.1数据挖掘基本概念
第一章 绪论
1.1.1 数据挖掘的概念
数据挖掘、数据库、人工智能
• 数据挖掘是从数据中发掘知识的过程,在这个过程中人工智能和数据库技术可以作 为挖掘工具,数据可以被看作是土壤,云平台可以看作是承载数据和挖掘算法的基 础设施 。在挖掘数据的过程中需要用到一些挖掘工具和方法,如机器学习的方法。 当挖掘完毕后,数据挖掘还需要对知识进行可视化和展现。
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1.3数据挖掘常用工具
第一章 绪论
1.3.2 开源工具
• WEKA WEKA 是一个基于JAVA 环境下免费开源的数据挖掘工作平台,集合了大量能承担数据 挖掘任务的机器学习算法,包括对数据进行预处理,分类,回归、聚类、关联规则以及 在新的交互式界面上的可视化。
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1.3数据挖掘常用工具
•R • Weka • Mahout • RapidMiner • Python • Spark MLlib
第一章 绪论
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1.3数据挖掘常用工具
第一章 绪论
1.3.2 开源工具
•R R是用于统计分析和图形化的计算机语言及分析工具,提供了丰富的统计分析和数据挖 掘功能,其核心模块是用C、C++和Fortran编写的。
为了提高系统的决策支持能力,像ERP、SCM、HR等一些应用系统也逐渐与数据 挖掘集成起来。多种理论与方法的合理整合是大多数研究者采用的有效技术。
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1.2 数据挖掘起源及发展历史
第一章 绪论
3 数据挖掘面临的新挑战
随着物联网、云计算和大数据时代的来临,在大数据背景下数据挖掘要面临的挑 战,主要表现在以下几个方面:
数据挖掘概念与技术第一章PPT课件
数据淹没,但却缺乏知识
信息技术的进化
···
数据挖掘的自动化分析的海量数据集 文件处理->数据库管理系统->高级数据库:系统高级数据分析
2021
3
定义:从大量的数据中提取有趣的(非平凡的,隐 含的,以前未知的和潜在有用的)模式或知识。
“数据中发现知识”(KDD)
2021
4
选择和变换
评估和表示
第一章 引论
2021
1
1.1 为什么进行数据挖掘 1.2 什么是数据挖掘 1.3 可以挖掘什么类型的数据 1.4 可以挖掘什么类型的模式 1.5 使用什么技术 1.6 面向什么类型的应用 1.7 数据挖掘的主要问题 1.8 小结
2021
2
数据爆炸
海量数据,爆炸式增长
来源:网络,电子商务,个人 类型:图像,文本···
设想网上购物的一次交易,其付款过程至少包括以下几步数据库操作:
一、更新客户所购商品的库存信息 二、保存客户付款信息--可能包括与银行系统的交互 三、生成订单并且保存到数据库中 四、更新用户相关信息,例如购物数量等等
2021
9
其他类型的数据
股票交易数据 文本 图像 音频视频 未知的
2021
10
1.4.1 类/概念描述:特征化与区分
类/概念
数据特征化
目标数据的一般特性或特征汇总
数据区分
将目标类数据对象的一般性与一个或多个 对比类对象的一般特性进行比较
特征化和区分
2021
11
1.4.2 挖掘频繁模式、关联和相关性
频繁模式是在数据中频繁出现的模式
1.频繁项集、频繁子序列、频繁子结构 2.挖掘频繁模式可以发现数据中的关联和相关性 例如:单维与多维关联
医学数据挖掘网络分析优质PPT课件
网络的表示方式
列表式
基因1
基因2
边权重
基因1
基因3
边权重
……
基因n-1
矩阵式
0-1矩阵 权重矩阵
基因n 边权重
x1
x2 ... xN1
xN
x1
0 1 ...... 0 1
x2
1
0 ...... 1
0
... ...... ...... ...... ......
三、蛋白质互作网络
三、蛋白质互作网络
(一) 蛋白质互作检测技术
1. 免疫共沉淀技术(co-immunoprecipitation)
2. 酵母双杂交(yeast two hybrid,Y2H)
Node: proteins, Edge: interaction relationships, Un-directed
出的边的数目称为节点v的出度,指向节点v的边数 则称为节点v的入度。
节点A的连通度为3
节点A的入度为1,出度为2
连通度的应用
Barabási et al
Hub nodes
(二) 聚类系数(clustering coefficient )
无向网络中
Cv C C n k 2k(k 2n 1 )
节点代表生物分子,边代表他们之间在生命过 程中的某种关系
网络的基本概念
网络的定义 以图G= (V, E)表示网络,其中:
V 是网络的节点集合,每个节点代表一个要分析 的对象;
E 是边的集合,每条边代表节点之间的相互关系。
无向网络
有向网络
二加分权网网络络与等权网络
· 2012年8月 中国 哈尔滨
医用数据挖掘案例与实践 第1章 数据预处理
图1.2 数据的箱式图
6
此外,对于多变量统计数据的异常值识别,常用的 检验思路是观察各样本点到样本中心的距离。如果某些 样本点到样本中心的距离太大,就可以判断为异常值。 这里距离的度量一般使用马氏距离(Mahalanobis Distance)。因为马氏距离不受量纲的影响,而且在多 元条件下,马氏距离还考虑了变量之间的相关性,这使 得它优于欧氏距离。
考虑到由于个别异常值会导致均值向量和协方差矩 阵出现巨大偏差,这样计算出来的马氏距离起不了检测 异常值的作用,从而导致传统的马氏距离检测方法不稳 定,因此需要利用迭代的思想构造一个稳健的均值和协 方差矩阵估计量,然后计算稳健马氏距离(Robust Mahalanobis Distance),从而使得异常值能够正确地 被识别出来。
此时软件会自动加载mvoutlier所需要的软件包,说明mvoutlier软件 包已经安装完成(图1.6)。
图1.6 mvoutlier软件安装完成界面
12
此外,也可以通过在R窗口中输入安装语句来完 成mvoutlier软件包的安装。输入的语句如下:
install.packages(pkgs="mvoutlier") (安装mvoutlier软件包。此括号内容为语句说明)
说明:为了便于理解语句,本书在命令后用括号括起来的内容,为对 该语句的注释,并不在命令行中输入(下同)。
13
软件包安装完成后,就可以使用软件包中的函数对数据进行分析了。 这里构造一个二维变量数据集,变量名为s1和s2,总样本数为90,数 据集存为.csv格式并命名为mvout.csv,存于c盘中,便于从R中调取。 图1.7列出了数据集中的30个样本。
92.00 100.00 192.00 120.0000 125.0000 132.0000
大数据高职系列教材之数据挖掘基础PPT课件:第1章 数据挖掘概念
1.1 数据挖掘概述
1.1.2 数据挖掘常用算法概述
第一章 数据挖掘概念
(3) 支持向量机 支持向量机(Support Vector Machine,SVM)是建立在统计学理论的VC维理论和
结构风险最小原理基础上的,它在解决小样本、非线性及高维模式识别中表现出许 多特有的优势,并能够推广应用到函数拟合等其他机器学习问题中。支持向量机算 法将在后面章节做详细介绍。
第一章 数据挖掘概念
1. 什么是测量误差和数据收集误差 测量误差是测量中测量结果与实际值之间的差值叫误差。 数据收集误差是指收集数据时遗漏数据对象或属性值,或包含了其他数据对象等情况。
2. 什么是噪声 噪声是从物理角度而言,噪声是波形不规则的声音。
1.2 数据探索
1.2.2 数据质量
第一章 数据挖掘概念
第一章 数据挖掘概念
1.3 数据挖掘的应用
第一章 数据挖掘概念
1. 算法延展性
算法延展性即为算法弹性,随着数据产生、采集技术的快速进步,以GB、TB、PB(1GB=1024MB, 1TB=1024GB,1PB=1024TB)为单位的数据集越来越普遍。
2. 高维性
在以前的数据库构成中只有少量属性的数据集,现在大数据集群构成中是具有成百上千属性的数据集。
1.2 数据探索
1.2.1 数据概述
1. 属性 (1)区分属性可通过属性可能取值的个数来判断。 (2)非对称的属性 2. 数据集的一般特性
数据集一般具有三个特性,分别是维度、稀疏性、 分辨率三个,它们对数据挖掘有重要影响。 3. 较常见的数据类型
第一章 数据挖掘概念
1.2 数据探索
1.2.2 数据质量
1.3 数据挖掘的应用
1.3.3 数据挖掘的应用场景
医学数据挖掘第1章.ppt
数据挖掘与知识发现
原有的决策支持系统(DSS)和领导执行系统(EIS) 已不能满足需要。数据挖掘概念的提出,使人们有能力 克服这些困难,去发掘出蕴藏在数据中的信息和知识。 数据挖掘是目前国际上数据库和信息决策领域的最前沿 研究方向之一。
1.4 数据挖掘工具——SQL Server 2005
1.5数据挖掘技术在医学领域中的应用特点、现状及展望
1.医学数据的特点以及医学数据挖掘的独特性
医学信息蕴含了医疗过程和医患活动的全部数据资源,既有有关临床的医 疗信息又有医院管理的信息,尤其是前者反映了医学的独特性。这些信息具 有模式的多态性(纯数据、图像、信号、文字记录等)、不完整性(疾病信息的 客观不完整和描述疾病的主观不完整)、较强时间性、复杂性和冗余性。加之 其低数学特征、非规范化形式以及医患信息的不对称和医学资料涉及较多的 伦理、法律问题,从而决定了医学数据挖掘的独特性。
数据挖掘技术在医学领域中的应用越来越广泛(2)
数据挖掘在医学上的应用有其自身的优势,医学系统收集 到的数据大多是实际诊断和运作数据真实可靠、不受其他 因素影响的,这对于不断提高挖掘的质量是有利的条件。
随着电子病历的推广,用计算机存储病案在医院已经比较 普遍。如果各医院将收集的数据进一步汇总,从些数据中 发现各种疾病之间的相互关系、各种疾病的发展规律,分 析各种治疗方案的治疗效果,对疾病的诊断、治疗和医学 研究都非常有价值。
数据挖掘技术在医学领域中的应用越来越广泛2数据挖掘在医学上的应用有其自身的优势医学系统收集到的数据大多是实际诊断和运作数据真实可靠不受其他因素影响的这对于不断提高挖掘的质量是有利的条件
医学科研数据挖掘概述ppt课件
数据的预处理主要包括数据描述、数据清理 、数据 集成和变换、数据归约 四个步骤。 数据描述:对于获得数据的总体印象至关重要。描 述性数据汇总技术可以用来识别数据的典型性质, 突显哪些数据值应当视为噪声或离群点。度量数据 的中心趋势和度量数据的离散程度。 数据清理:是指填充缺失值,光滑噪声并识别离群 点,纠正数据中的不一致。 数据集成:是指合并来自多个数据存储的数据和可 能需要转换成适于挖掘的形式。 数据归约:数据归约技术可以用来得到数据集的归 约表示,它接近于保持数据的完整性,但数据量比 原数据小得多。与非归约数据相比,在归约的数据 上进行挖掘,所需的时间和内存资源更少,挖掘更 有效,并产生相同或几乎相同的分析结果。
四、数据挖掘基本过程
数据的选择:搜索所有与业务对象有关的内部和 外部数据信息,并从中选择出适用于数据挖掘应 用的数据。 数据的预处理:研究数据的质量,为进一步分析 作准备。并确定将要进行的挖掘操作的类型。 数据的转换:将数据转换成一个分析模型。这个 分析模型是针对挖掘算法建立的。建立一个真正 适合挖掘算法的分析模型是数据挖掘成功的关键。 数据挖掘:对所得到的经过转换的数据进行挖掘。 结果分析:解释并评估结果。其使用的分析方法 一般应作数据挖掘操作而定。 知识的同化:将分析所得到的知识集成到业务信 息系统的组织结构中去。
1.
2.
二、数据挖掘应用领域
Banking (金融方面) Bioinformatics/Biotech (生物信息) Direct Marketing/Fundraising (直销市场) eCommerce/Web (电子商务) Entertainment/News (零售业/市场营销) Fraud Detection (过程控制/质量监督) Insurance (保险) 13%(1) 10%(2) 10%(2) 5% 1% 9%(3) 8%(4)
数据挖掘导论--第1章绪论
数据挖掘导论--第1章绪论数据挖掘导论-第⼀章-绪论为什么会出现数据挖掘?1. 因为随着社会不断快速发展,信息量在不断增加,由于**信息量太⼤** ,⽽⽆法使⽤传统的数据分析⼯具和技术处理它们;2. 即使数据集相对较⼩,但由于数据本⾝有⼀些**⾮传统特点**,也不能使⽤传统的⽅法进⾏处理。
什么是数据挖掘?数据挖掘是⼀种技术,它将传统的数据分析⽅法与处理⼤量数据的复杂算法相结合。
数据挖掘是在⼤型数据存储库中,⾃动地发现有⽤信息的过程。
数据挖掘是数据库中知识发现(knowledge discovery in database,KDD)不可缺少的⼀部分。
数据挖掘要解决的问题可伸缩⾼维性异种数据和复杂数据数据的所有权与分布⾮传统的分析数据挖掘任务通常,数据挖掘任务分为下⾯两⼤类预测任务:这些任务的⽬标是根据其他属性的值,预测特定属性的值。
被预测的属性⼀般称为⽬标变量或因变量⽤来做预测的属性称说明变量或⾃变量描述任务:其⽬标是导出概括数据中潜在联系的模式(相关、趋势、聚类、轨迹和异常)。
本质上,描述性数据挖掘任务通常是探查性的,并且常常需要后处理技术验证和解释结果下图展⽰了其余部分讲述的四种主要数据挖掘任务预测建模:以说明变量函数的⽅式为⽬标变量建⽴模型。
有两类预测建模任务:分类(classification):⽤于预测离散的⽬标变量回归(regression):⽤于预测连续的⽬标变量关联分析:⽤来发现描述数据中强关联特征的模式。
所发现的模式通常⽤蕴涵规则或特征⼦集的形式表⽰聚类分析:旨在发现紧密相关的观测值组群,使得与属于不同簇的观测值相⽐,属于同⼀簇的观测值相互之间尽可能类似异常检测:任务是识别其特征显著不同于其他数据的观测值。
这样的观测值称为异常点或离群点## 参考⽂献: 1. 数据挖掘导论(完整版)。
数据挖掘在医学研究中的应用培训ppt课件
通过逐层搜索的迭代方法找出事 务数据库中的频繁项集,以形成 关联规则。
疾病诊断关联规则发现
疾病与症状关联
挖掘疾病与症状之间的关联规则,辅助医生进行疾病 诊断。
疾病并发症关联
分析疾病之间的关联规则,揭示可能的并发症风险。
疾病与危险因素关联
探索疾病与危险因素(如生活习惯、环境因素等)之 间的关联,为预防提供指导。
医学数据可视化特点
需要处理多维数据、关注数据间的关联性和 趋势变化等。
挖掘结果解读方法论述
假设检验
通过统计学方法对数据结果进行假设检验,判断结果是否具有显 著性。
效应量分析
计算效应量指标,如相关系数、回归系数等,评估变量间的关联 强度。
结果解释与讨论
结合医学背景和专业知识,对挖掘结果进行解释和讨论,提出可 能的解释和推论。
数据挖掘在医学研究中 的应用培训ppt课件
汇报人: 2023-12-31
目录
• 数据挖掘概述 • 医学数据特点及预处理 • 关联规则挖掘在医学中应用 • 分类与预测模型在医学中应用 • 聚类分析在医学中应用 • 时序模式挖掘在医学中应用 • 数据可视化与结果解读
数据挖掘概述
01
定义与发展历程
数据挖掘定义
常见分类算法
包括决策树、支持向量机、朴素贝叶斯、K近邻等 。
选择依据
在选择分类算法时,需要考虑数据的特征、 样本量、类别分布等因素,以及算法的准确 性、稳定性和可解释性。
疾病风险预测模型构建
数据准备
收集与疾病相关的数据,包括人口统计学信 息、生活习惯、既往病史等。
特征选择
从收集的数据中选择与疾病风险相关的特征 ,构建特征向量。
药物相互作用关联规则挖掘
医学大数据分析策略与数据挖掘PPT课件
26
1. 投票法:选取多数类结果(例如:2个或者2个以上预测模 型结果为恶性)作为最后病例的预测结果;
2. 并联法:只要有一个预测模型结果判断为恶性,此病人最 终判断为恶性结果,否则为良性;
3. 串联法:只有3个预测模型同时判断为恶性,此病人最终判 断为恶性结果,否则为良性;
4. 综合法:合并轴状位、冠状位、矢状位数据集,建立一个 预测模型,其结果作为最终结果。
b
i1
25
SVM中不同的内积核函数将形成不同的算法。
➢ Gaussian 核函数: ➢ Polynom核函数 ➢ Vanilladot线性核函数 ➢ 双曲切线核函数 ➢ Laplacian 核函数 ➢ Bessel核函数
kx.y (axTy c)d
kx.y xTy cd
kx .y tanh(axTy c)
支持向量机 决策树 随机森林最近邻分类神经网络 Gradient Lasso回归 boosting
19 19
✓ 各纹理产生30,40,50,60个子代(即纹理分别 为420,560,700,840个)。每个纹理子代分布 为正态分布,均值和标准差与轴位CT图像均值 相近;
✓ 设定每个纹理内部子代之间的相关系数为r=0.1, 0.2,0.3,0.4;
主成分分析
因子分析
广义线性模型
......
正态性
线性、齐性
条
独立性
件
足够大的样本量
变量的20倍
......
➢ 传统的多元统计方法难以处理和分析医学大数据 ➢ 高维、非线性、非高斯等数据,采用数据挖掘方法,可以
提供更高的预测精度。
12
数据挖掘方法简介及其应用
13
数据挖掘:是在从大量的数据中提取隐含的、 事先未知的,但又是潜在有用的信息和知识的过程。
医学科研数据挖掘方法--数据预处理PPT共71页
•
6、黄金时代是在我们的前面,而不在 我们的 后面。
•
7、心急吃不了热汤圆。
•
8、你可以很有个性,但某些时候请收 敛。
•
9、只为成功找方法,不为失败找借口 (蹩脚 的工人 总是说 工具不 好)。
•
10、只要下定决心克服恐惧,便几乎 能克服 任何恐 惧。因 为,请 记住, 除了在 脑海中 ,恐惧 无处藏 身。-- 戴尔. 卡耐基 。
31、只有永远躺在泥坑里的人,才不会再掉进坑里。——黑格尔 32、希望的灯一旦熄灭,生活刹那间变成了一片黑暗。——普列姆昌德 33、希望是人生的乳母。——科策布 34、形成天才的决定因素应该是勤奋。——郭沫若 35、学到很多东西的诀窍,就是一下子不要学很多。——洛克
数据挖掘第一章
CS512 Coverage (Chapters 11, 12, 13 + More Advanced Topics)
Cluster Analysis: Advanced Methods (Chapter 11) Outlier Analysis (Chapter 12) Mining data streams, time-series, and sequence data Mining graph data Mining social and information networks Mining object, spatial, multimedia, text and Web data Mining complex data objects Spatial and spatiotemporal data mining Multimedia data mining Text and Web mining Additional (often current) themes if time permits
Database Systems:
Text information systems
Bioinformatics
Yahoo!-DAIS seminar (CS591DAIS—Fall and Spring. 1 credit unit)
2
CS412 Coverage (Chapters 1-10, 3rd Ed.)
Summary
7
Why Data Mining?
Tfrom terabytes to petabytes
大数据本科系列教材PPT课件之《数据挖掘》:第1章 绪论
1.3.1 商用工具
• SAS Enterprise Miner Enterprise Miner是一种通用的数据挖掘工具,按照“抽样-探索-修改-建模-评价”的方 法进行数据挖掘,它把统计分析系统和图形用户界面(GUI)集成起来,为用户提供了用 于建模的图形化流程处理环境。
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1.3数据挖掘常用工具
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1.1数据挖掘基本概念
第一章 绪论
1.1.1 数据挖掘的概念
数据挖掘的定义
• 数据挖掘(Data Mining,DM),是从大量的、有噪声的、不完全的、模糊和随机 的数据中,提取出隐含在其中的、人们事先不知道的、具有潜在利用价值的信息和 知识的过程。
• 这个定义包含以下几层含义: ✓ 数据源必须是真实的、大量的、含噪声的; ✓ 发现的是用户感兴趣的知识; ✓ 发现的知识要可接受、可理解、可运用; ✓ 不要求发现放之四海皆准的知识,仅支持特定的问题
•R • Weka • Mahout • RapidMiner • Python • Spark MLlib
第一章 绪论
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1.3数据挖掘常用工具
第一章 绪论
1.3.2 开源工具
•R R是用于统计分析和图形化的计算机语言及分析工具,提供了丰富的统计分析和数据挖 掘功能,其核心模块是用C、C++和Fortran编写的。
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1.1数据挖掘基本概念
第一章 绪论
1.1.3 大数据挖掘的特性
• 在大数据时代,数据的产生和收集是基础,数据挖掘是关键,即数据挖掘是大数据 中最关键、最有价值的工作。
大数据挖掘的特性:
• 应用性 • 工程性 • 集合性
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医学数据挖掘计算机辅助医学概论 ppt课件
2020/12/12
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计算机辅助医学实例-自然语言处理
❖ 将自然语言处理模块整合到科研病历系统中
2020/12/12
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计算机辅助医学—医学知识库
❖医学知识种类繁多 ❖医学知识更新速度快
➢ 医学文献 ➢ 临床实践指南 ➢ 临床路径 ➢ 用药指南 ➢ 转化医学知识 ➢ 数字人体模型
信息化手段
医学知识库
计算机辅助医学 概论(下)
2020/12/12
1
提纲
1 2 3 4
关于课程 背景知识 基本概念 应用实例
2020/12/12
2
精品资料
• 你怎么称呼老师? • 如果老师最后没有总结一节课的重点的难点,你
是否会认为老师的教学方法需要改进? • 你所经历的课堂,是讲座式还是讨论式? • 教师的教鞭 • “不怕太阳晒,也不怕那风雨狂,只怕先生骂我
2020/12/12
12
转化医学
❖转化医学(Translational Medicine)的概念是在 2003年由美国EA. Zerhouni在NIH路线图计划(NIH Roadmap)中提出的
❖它试图在基础研究与临床医疗之间建立更直接的联 系
❖它的核心是要将医学生物学基础研究成果迅速有效 的转化为可在临床实际应用的理论、技术、方法和药 物,它要在实验室到病房(Bench To Bedside, 简称 B2B)之间架起一条快速通道。
❖临床决策支持系统发展
2020/12/12
Wright A et al, 2008 35
计算机辅助医学实例-临床决策支持系统
❖Real Q HIV CDSS
2020/12/12
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计算机辅助医学实例-个性化医疗
医学数据挖掘01
数据访问 (80年代)
Oracle、 在记录级提供历 Sybase、 史性的、动态数 Informix、IBM、 据信息 Microsoft
“在新英格兰的分 数据仓库; 部去年三月的销售 联机分析处理 决策支持 额是多少?波士顿 (OLAP)、多维数 (90年代) 据此可得出什么结 据库、数据仓库 论?”
2012-5-10
重庆医科大学现教中心
王体春
10
解决方法和DM的基础
解决方法: 解决方法:数据仓库和数据挖掘
数据仓库(Data Warehouse)和在线分析 处理(OLAP) 在大量的数据中挖掘感兴趣的知识(规则、 规律、模式、约束)
支持数据挖掘技术的基础 - - 海量数据搜集 - - 强大的多处理器计算机 - - 数据挖掘算法
2012-5-10
重庆医科大学现教中心
王体春
11
从商业数据到商业信息的进化 数据挖掘逐渐演变的过程
进化阶段 数据搜集 (60年代) 商业问题 支持技术 产品厂家 IBM,CDC 产品特点 提供历史性的、 静态的数据信息 “过去五年中我的 计算机、磁带和磁 总收入是多少?” 盘 关系数据库 (RDBMS),结构 “在新英格兰的分 化查询语言 部去年三月的销售 (SQL),ODBC 额是多少?” Oracle、Sybase、 Informix、IBM、 Microsoft
类 身高 矮 高 高 矮 高 矮 高 高 矮
重庆医科大学现教中心
头发颜色 金色 红色 金色 金色 金色 黑色 黑色 黑色 金色
王体春
眼睛颜色 蓝色 蓝色 蓝色 灰色 黑色 蓝色 蓝色 灰色 黑色
16
第一类人
第二类人
2012-5-10
数据挖掘的知识表示: (1)规则(续) 规则(
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数据挖掘与知识发现
原有的决策支持系统(DSS)和领导执行系统(EIS) 已不能满足需要。数据挖掘概念的提出,使人们有能力 克服这些困难,去发掘出蕴藏在数据中的信息和知识。 数据挖掘是目前国际上数据库和信息决策领域的最前沿 研究方向之一。
数据挖掘技术在医学领域中的应用越来越广泛(2)
数据挖掘在医学上的应用有其自身的优势,医学系统收集 到的数据大多是实际诊断和运作数据真实可靠、不受其他 因素影响的,这对于不断提高挖掘的质量是有利的条件。
随着电子病历的推广,用计算机存储病案在医院已经比较 普遍。如果各医院将收集的数据进一步汇总,从些数据中 发现各种疾病之间的相互关系、各种疾病的发展规律,分 析各种治疗方案的治疗效果,对疾病的诊断、治疗和医学 研究都非常有价值。
1.4 数据挖掘工具——SQL Server 2005
1.5数据挖掘技术在医学领域中的应用特点、现状及展望
1.医学数据的特点以及医学数据挖掘的独特性
医学信息蕴含了医疗过程和医患活动的全部数据资源,既有有关临床的医 疗信息又有医院管理的信息,尤其是前者反映了医学的独特性。这些信息具 有模式的多态性(纯数据、图像、信号、文字记录等)、不完整性(疾病信息的 客观不完整和描述疾病的主观不完整)、较强时间性、复杂性和冗余性。加之 其低数学特征、非规范化形式以及医患信息的不对称和医学资料涉及较多的 伦理、法律问题,从而决定了医学数据挖掘的独特性。
在美国,一些年轻的父亲下班后经常要到超市去
买婴儿尿布,而他们中有30%~40%的人同时
也为自己买一些啤酒。
产生这一现象的原因是:美国的太太们常叮
嘱她们的丈夫下班后为小孩买尿布,而丈夫们在
买尿布后又随手带回了他们喜欢的啤酒。
4. 回归
回归任务类似于分类任务,最大的区 别是在回归任务中可预测属性是连续的。 回归技术在统计学领域已经广泛研究了 几个世纪。线性回归和逻辑回归是最常 用的回归分析方法。其它的回归分析技 术包括回归树和神经网络。
* 挖掘算法是数据挖掘重要的组成部分。为解决特定的 问题,一种或多种算法需要被选择、编译,在适于挖掘的 数据环境下实施挖掘任务。
1.1数据挖掘概念 ❖ 1.1.1数据挖掘的产生
如何使人们能够快速有效地获取自己所需的知识,成为广大信 息工作者的重要研究课题。正是这种需求催生了一门目前在信息领 域里最为活跃、最令人激动的领域——数据挖掘和知识发现。
1.1.2 数据挖掘的定义
数据挖掘,在人工智能领域, 习惯上又称为数据库中知识发 现(Knowledge Discovery in Database, KDD), 也有人把 数据挖掘视为数据库中知识发 现过程的一个基本步骤。知识 发现过程以下三个阶段组成: (1)数据准备, (2)数据挖掘, (3)结果表达和解释。数据挖 掘可以与用户或知识库交互。
3.关联规则
起源:超市购物篮
在原始交易数据的基础上,沃尔玛利用数据
形式: X⇒Y (啤酒=>尿布) 挖掘方法对这些数据进行分析和挖掘。一个意外
基本测度:
的发现是:"跟尿布一起购买最多的商品竟是啤
支持度(Dsupp) 置信度(Dconf)
酒!经过大量实际调查和分析,揭示了一个隐藏 在"尿布与啤酒"背后的美国人的一种行为模式:
分类是最常见的数 据挖掘任务之一。疾病 的诊断过程实际上就是 一个疾病分类的过程, 患者根据症状特征及不 适部位定位到具体疾病 类的具体疾病,这一过 程与现实中的分类过程 十分相似。
2.聚类
❖ “物以类聚”,它基于一组属性对事例进行分组。在同一个聚类中的 事例或多或少有相同的属性值。
例如 ,通过对医 药市场的聚类分析, 构成多因素投资组合 矩阵。依据市场吸引 力的大、中、小,竞 争能力的强、小、弱, 分为9个区域,组成三 种战略地带。
数据挖掘技术在医学领域中的应用越来越广泛(1)
❖ 在疾病诊断、治疗、器官移植、基因研究、图像分析、康 复、药物开发、科学研究等方面获得可喜成果。
❖ 南加州大学脊椎病医院利用Information Discovery 进行 数据挖掘,该技术已应用到肿瘤学、肝脏病理学、肝炎的 生存几率预测、泌尿学、甲状腺病例诊断、风湿病学、皮 肤病诊断、心脏病学、神经心理学、妇科学、产科学等领 域。
回归任务能解决很多医学问题。例如, 医生可以通过身高、体重、肺活量、胸 围、肩宽、盆肩宽、脉搏、收缩压、舒 张压等各项指标预测病人的健康情况。
1.3数据挖掘技术
数据挖掘任务的完成需要相应的数据挖掘技术。目前的数据挖 掘算法主要来自3个领域:统计学、机器学习(人工智能)和数 据库。
数据挖掘的焦点是自动或半自动的挖掘模式。有些机器算法应 用于数据挖掘,比如神经网络、遗传算法等。
第1章 医学数据挖掘概述
(Medical 题的提出
随着医院数字化仪器的增加、医院信息系统、电 子病历和电子健康档案的使用,医院的计算机中逐渐 积累了大量的数据,其量与日俱增。这些数据中蕴藏 着的丰富的二次信息和业务知识,如何将它们有效的 分析和挖掘出来,用以提高医院的服务质量和医疗水 平,是医院的管理者和医生越来越关心的问题。
可以从几个方面来了解数据挖掘。 ❖1. 商业企业角度 ❖2. 技术实现角度 ❖3. 数据挖掘与传统分析方法的区别 ❖4. 数据挖掘和数据仓库 ❖5. 数据挖掘和OLAP ❖6. 数据挖掘,机器学习和统计
1.2 数据挖掘的任务
❖ 数据挖掘可以解决大量的医学研究问题。基于这些医学 问题的性质,把这些问题分成下面几种数据挖掘任务。 1.分类
数据挖掘与知识发现是存在交叉的两个概念。
数据挖掘是知识发现的一个阶段,而且是核心阶段。 知识发现,就是从大型数据库中的数据中提取人们感兴 趣的知识。这些知识是隐含的、事先未知的、潜在有用 的信息。
如果把知识发现理解为一个过程或系统,数据挖 掘是这一过程或系统的一个可自动执行的工具。
从下图看出,知识发现是需要人工参与的多环节的过程。
数据库技术是数据挖掘的第三种技术来源。因为数据挖掘需要 处理大量数据,如何对大量数据进行处理,需要数据库技术。
本书着重介绍决策树算法、时序与回归算法、神经网络、关联 规则和聚类分析,并结合数据挖掘工具——SQL Server Business Intelligence Development Studio进行介绍。