蛋白质电泳操作步骤
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SDS-PAGE电泳操作步骤:
试剂配制:
(实验中采用均为分析纯)
(1)丙烯酰胺贮液(4℃下棕色瓶中储存,试剂尽量勿存储过久)
丙烯酰胺贮液(T=30%,C=3%)
称取29.1 g丙烯酰胺和0.9 g甲叉双丙烯酰胺,用双蒸水溶解,定容至100 ml,过滤备用。
(试剂有毒,操作中注意防护)
(2)浓缩胶缓冲液(1 mol/L Tris-HCl,pH 6.8)(4℃下棕色瓶中储存,试剂尽量勿存储过久)
6.06 g Tris溶解于35 ml双蒸水中,用浓盐酸调节pH至6.8,再用双蒸水定容至50 ml。
(3)分离胶缓冲液(1.5 mol/L Tris-HCl,pH 8.8)(4℃下棕色瓶中储存,试剂尽量勿存储过久)
18.16 g Tris溶解于75 ml双蒸水中,用浓盐酸调节pH至8.8,再用双蒸水定容至100 ml。
(4)10% SDS
(5)10% 过硫酸铵(APS):使用前新鲜配制,低浓度APS一般当天用当天配制,勿过夜使用。
(6)尿素
(7)TEMED(N,N,N’,N’-四甲基乙二胺)
(8)电极缓冲液(1×) (棕色瓶中4℃储存,一般使用3-4次)
0.025 mol/L Tris,0.192 mol/L甘氨酸,0.1% SDS,pH 8.3
(9)电极缓冲液(2×) (棕色瓶中4℃储存,一般使用3-4次)
0.050 mol/L Tris,0.384 mol/L甘氨酸,0.1% SDS,pH 8.3
(10)样品缓冲液(pH 6.8)(4℃下棕色瓶中储存,试剂尽量勿存储过久)
1.6 ml浓缩胶缓冲液(pH 6.8)+ 4 ml 10% SDS + 0.6 g二硫苏糖醇(DTT) +
2.5 ml 87%甘油+0.1 mg溴酚蓝,用双蒸水稀释到20 ml.
(11)考玛斯亮蓝R-250染色方法:
a.固定液
20%三氯乙酸
b.脱色液
250 ml乙醇,80 ml冰醋酸,加水稀释至1000 ml。
c.染色液
称取0.29 g考玛斯亮蓝R-250溶于250 ml上述脱色液中
样品处理:
处理完样品应尽快使用,若存储,须于-20℃下。
○1.CytC酶解样
每管分别加入8 µl细胞色素C(20 mg/ml),10 ul 50 mM Tris-HCl(pH 8.0),1 µl 胰蛋白酶(细胞色素C:胰蛋白酶=50:1)。
37℃水浴,2 h。
立即放入-20 ℃冰箱冷冻保存备用。
上样前加15μІ上样BUFFER,75℃水浴5-10min
○2.大肠杆菌蛋白
取10μІ工程菌种接入10nml LB液体培养基里,过夜培养12h,取出1ml菌液离心10000g/r,5min。
弃上清,用1ml Tris-Hcl (pH 8.0 50mM)洗涤1-2次,后分别加入20μІ(pH8.0 5mM)、10μІEDTA,-20℃保存。
上样前加入2μІ5%X,再加入50μІ上样BUFFER,75℃水浴5-10min
○3.CytC
15μІCytC加入15μІ上样BUFFER,75℃水浴5-10min
○4.低分子量肽标准
取8-10μІMaker(2mg/ml),加入10μІ上样buffer,再加入5μІddH2O,75℃水浴5-10min
○5.SPI多肽的制备
Ⅰ材料及试剂(试剂均为分析纯)
纯大豆粉
木瓜蛋白酶(sigma P3250 500-2000AU/g)
正己烷
巯基乙醇
Tris-HCl缓冲液(0.03 M、pH 8.0)
0.2 M HCl
叠氮钠
考马斯亮蓝G250
标准牛血蛋白
Ⅱ制备方法
ⅰ.SPI制备:大豆分离蛋白的制备参照Iwabuchi 和Yamauchi [9]的方法, 具体步骤如下: 全脂豆粉加正己烷(1/5)室温下搅拌1 h脱脂,于3 000 g 离心5 min, 取沉淀反复脱脂两次, 于沉淀中加入15~20 倍含10 mM 巯基乙醇0.03 M、pH 8.0 的Tris-HCl 缓冲液, 室温搅拌1~2 h, 于20 ℃ 6 000 g 离心25 min,取
上清液,用0.2 M HCl 调节pH 至4.8, 置于冰箱下层冷沉过夜, 再于4 ℃9
000 g 离心20 min, 取沉淀分散于少量水中, 调节pH 至7.0, 搅拌1 h 充分溶解后于4 ℃下用含0.05 % 叠氮钠的蒸馏水透析2 d, 再用蒸馏水透析两次去叠氮钠, 冷冻干燥即得大豆分离蛋白(SPI)。
(可能透析会损失掉一定量的多肽。
)ⅱ.SPI蛋白含量测定:利用考马斯亮蓝蛋白含量测定法,根据牛血蛋白作出的标准蛋白曲线,测定SPI的蛋白浓度:(具体方法参见《生物化学实验原理和方法》P174)
标准蛋白曲线
1.160
0.2
0.4
0.6
0.8
11.2
1.4
00.010.020.03
0.040.050.06
蛋白浓度吸光度
测得1%(1mg/ml )的SPI 吸光度为0.779,求得即在SPI 质量分数为1%的情况下,其蛋白浓度约为3mg/ml.
ⅲ.SPI 多肽制备:本实验采用木瓜蛋白酶水解SPI ,制取SPI 多肽。
标准的酶解体系为溶于0.05 mol/L, pH8.0Tris -HCl 缓冲溶液的SPI 溶液(质量分数为2%),含质量分数为0.05%的叠氮钠,先于38℃下预热5 min,分别添加蛋白酶至750 AU/mL ,然后继续于反应温度下反应,反应时间也很影响SPI 多肽的产率,木瓜蛋白酶持续低温水解16小时也可以产生较多小肽。
反应混合物可定期取样并分别加入X- PAGE 样品缓冲液终止反应(1: 1, v/v)。
实验上样一般采用过夜酶解透析样(2%*5%)。
上样前应将酶解样与样品缓冲液混合物水浴。
操作方法:
所制均为1.0mm 小板所需体积
(1)配制分离胶(16.5%T, 3%C ):
丙烯酰胺贮液—3ml 分离胶缓冲液—1.5ml 尿素—2.16g 10%SDS —72μІ
(2)配制浓缩胶(4%T, 3%C )
丙烯酰胺贮液—0.34ml 浓缩胶缓冲液—0.24ml ddH 2O —1.4ml 10% SDS —24μІ
(3)将上两步配制的分离、浓缩胶真空抽气15min ,同时配制10%过硫酸铵:
准确称量0.1g过硫酸铵固体(因其易氧化,操作尽量快,且尽量从底部取样),溶于1ml双蒸水中,即配即用,低浓度APS只限当天使用。
(4)吸取22µl过硫酸铵及5µlTEMED于分离胶中,轻轻混匀,灌胶,小心的在分离胶的表面加封一层水,封住胶面。
注意分离胶与浓缩胶的比例。
(5)大约40min,待分离胶聚合形成界面后,吸掉水,加11µl过硫酸铵及4µlTEMED于浓缩胶中,轻轻混匀,灌注浓缩胶,慢慢斜插入梳子(以免产生气泡)。
胶配制完成之后可直接放置于室温下,而且切忌即配即用及4℃下冷藏,应使其充分凝固,这样可以在一定程度上提高分辨率。
(6)样品处理【此省略】
(7)上样:将处理好的样品依据其蛋白浓度加入上样buffer,水浴后离心,去适量体积加入上样孔内,切忌样品直接互相污染(上样量一般8-12µg,视样品不同而异)
(8)电泳:将电极缓冲液注入电泳槽中。
恒流情况下,电压一般设为最大值(300V),在分离胶内电流一般为10mA左右,大约30min左右,样品前沿跑过分、浓界面后,电流加大为20-25mA,整体电泳时间约2 h;恒压条件下,浓缩胶内电压取60V,电流一般设最大值,样品跑至分、浓界面后电压加大到120V,整体电泳时间约2.5h。
(9)染色:利用考玛斯亮蓝R-250染色系统固定、染色和脱色:电泳完毕后,将胶置于固定液中固定1 h,然后放置于染色液中染色过夜,转置脱色液中脱色,并多次更换脱色液,直至背景清晰。
(10)观察分析电泳结果。