DNA分子纯化与检测方法的研究进展

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生物样本DNA提取与纯化的操作流程

生物样本DNA提取与纯化的操作流程

生物样本DNA提取与纯化的操作流程DNA(脱氧核糖核酸)是生物体内的遗传物质,对于研究基因组、遗传变异以及进行分子生物学实验起着至关重要的作用。

而在进行DNA研究之前,首先需要从生物样本中提取和纯化出DNA。

本文将介绍生物样本DNA提取与纯化的操作流程。

1. 准备实验材料首先,我们需要准备一些实验材料,包括生物样本、细胞裂解缓冲液、蛋白酶K、异硫氰酸盐、乙醇、等电聚焦缓冲液、乙酸钠、等离子体DNA纯化试剂盒等。

2. 细胞裂解将生物样本(如细胞、组织等)加入细胞裂解缓冲液中,通过机械或化学方法破坏细胞膜,释放出细胞内的DNA。

可以使用离心机进行离心,将细胞沉淀下来。

3. DNA纯化将细胞裂解产物加入等离子体DNA纯化试剂盒中,经过一系列的步骤进行DNA纯化。

首先,加入蛋白酶K,消化蛋白质,使其与DNA分离。

然后,加入异硫氰酸盐,使DNA与其他核酸分离。

接着,加入乙醇,使DNA沉淀下来。

最后,使用等电聚焦缓冲液和乙酸钠进行洗涤,去除杂质。

4. DNA浓缩将纯化后的DNA溶液进行浓缩。

可以使用乙醇沉淀法,将DNA溶液与冷乙醇混合,使DNA沉淀下来。

然后,使用离心机将DNA沉淀离心,去除上清液,最后用无菌去离子水溶解DNA。

5. DNA质量检测提取和纯化的DNA需要进行质量检测,以确保其完整性和纯度。

可以使用紫外-可见分光光度计测量DNA的吸光度,判断DNA的浓度和纯度。

此外,也可以进行凝胶电泳分析,观察DNA的带状图案,判断DNA的大小和完整性。

6. 存储和保存提取和纯化好的DNA可以进行存储和保存,以备后续实验使用。

可以使用低温冰箱或液氮保存DNA,以防止其降解和损失。

通过以上的操作流程,我们可以从生物样本中提取和纯化出DNA。

这个过程需要仔细操作,并且需要注意实验室的清洁和无菌操作。

同时,不同的生物样本可能需要不同的提取和纯化方法,因此在实验过程中需要根据具体情况进行调整和优化。

总结起来,生物样本DNA提取与纯化的操作流程包括准备实验材料、细胞裂解、DNA纯化、DNA浓缩、DNA质量检测以及存储和保存。

DNA分子标记在中药材鉴定中的应用研究

DNA分子标记在中药材鉴定中的应用研究

DNA分子标记在中药材鉴定中的应用研究一、本文概述中药材作为中华传统医学的瑰宝,其品质与真伪直接关系到患者的疗效与健康。

然而,随着市场需求的增加,中药材的掺假、混淆现象日益严重,因此,中药材的鉴定成为了中医药领域的重要研究课题。

近年来,DNA分子标记技术的快速发展为中药材鉴定提供了新的解决方案。

本文旨在探讨DNA分子标记在中药材鉴定中的应用,以期为提高中药材品质、保障患者用药安全提供科学依据。

本文首先介绍了中药材鉴定的传统方法及其局限性,包括形态学鉴定、化学鉴定等,并指出了这些方法在面临复杂中药材鉴定时的不足。

随后,详细介绍了DNA分子标记技术的基本原理、分类及其在中药材鉴定中的应用案例。

通过对比分析,本文阐述了DNA分子标记技术在中药材鉴定中的优势,如准确性高、稳定性好、操作简便等。

在此基础上,本文进一步探讨了DNA分子标记技术在中药材鉴定中的具体应用,包括中药材真伪鉴别、品种鉴定、产地溯源等方面。

本文也关注了DNA分子标记技术在应用中面临的挑战与问题,如技术成本、操作标准化等,并提出了相应的解决策略。

本文总结了DNA分子标记技术在中药材鉴定中的应用价值及前景,认为随着技术的不断完善与成本的降低,DNA分子标记技术将在中药材鉴定中发挥越来越重要的作用,为保障中药材品质、促进中医药产业健康发展提供有力支持。

二、DNA分子标记技术概述DNA分子标记技术,也被称为DNA指纹技术,是一种通过直接分析生物体DNA序列的多态性来鉴定生物种类和个体间遗传差异的方法。

该技术基于DNA分子的独特性质,如高度的稳定性、个体间的特异性以及可遗传性等,为中药材鉴定提供了新的视角和有效手段。

DNA分子标记技术的核心在于通过特定的方法识别DNA序列中的多态性,这些多态性可以是单核苷酸多态性(SNP)、插入或删除、倒位、易位等。

这些多态性在DNA序列中形成独特的“标记”,可以作为鉴定生物种类和个体间遗传关系的依据。

在中药材鉴定中,DNA分子标记技术具有显著的优势。

分子生物学技术在疾病研究中的应用

分子生物学技术在疾病研究中的应用

分子生物学技术在疾病研究中的应用随着科技的发展,分子生物学技术在疾病研究中的应用越来越广泛。

分子生物学技术是指将疾病相关的分子(如DNA、RNA、蛋白质)进行分离、纯化和检测的技术。

这些技术已经在疾病的诊断、治疗和预防方面发挥了重要作用。

一、分子生物学技术在疾病的诊断方面的应用1. 分子诊断分子生物学技术可以用来检测疾病相关的基因或蛋白质。

例如,PCR技术可以检测特定的基因序列,同时也可以检测某些病毒或细菌的核酸。

另外,还有一种基于RNA的检测方法,是检测RNA的表达水平,从而确定某些疾病前体标志物的存在。

这些检测方法可以提高疾病的诊断准确率,缩短诊断时间,有利于及早治疗。

2. 基因检测分子生物学技术可以用来进行基因检测,对于遗传疾病的诊断尤为重要。

例如,PCR技术可以检测基因突变,从而确定某些常染色体显性遗传病的携带情况。

此外,还有一些新兴的基因检测方法,如外显子组测序、全基因组测序等,可以检测全基因组的突变,从而提高遗传疾病的诊断准确性。

二、分子生物学技术在疾病治疗方面的应用1. 基因治疗基因治疗是指通过植入特定的基因来治疗疾病。

分子生物学技术可以用来制备基因载体,将相关基因导入给予治疗的组织或器官中。

例如,已经有一些基因治疗用于肿瘤、遗传性病等方面的临床试验,它们可以治疗疾病的原因,从而起到根治的效果,但还需要深入研究来确定其安全性和有效性。

2. 蛋白质治疗蛋白质治疗是指通过注射人工合成的蛋白质来治疗疾病。

分子生物学技术可以用来制备人工合成蛋白质。

例如,已经有一些治疗蛋白质用于治疗肿瘤、炎症等方面的临床试验,也有一些治疗蛋白质已经被批准上市,它们可以有效地控制疾病进展,缓解患者病痛。

三、分子生物学技术在疾病预防方面的应用1. 疫苗研究疫苗研究是指通过制备疫苗来预防疾病。

分子生物学技术可以用来制备疫苗。

例如,已经有一些基于基因工程技术制备的疫苗已经成功预防一些传染病,如乙肝、HIV、甲流等,极大地改善了人类健康。

水稻基因组DNA提取,PCR,纯化分子生物学实验报告

水稻基因组DNA提取,PCR,纯化分子生物学实验报告

分子生物学实验报告实验内容:设计一个完整的实验,以水稻基因组为例,最终得到纯化的一个基因片段。

水稻基因组DNA提取以及基因片段的扩增、纯化和检测1.实验目的:1.1 熟练掌握实验室分子生物学相关的仪器的规范使用方法1.2 遵守实验室相关的实验规章制度,服从实验人员的管理1.3 熟练掌握实验室有关植物基因组DNA的简单提取方法以及检测方法1.4 了解琼脂糖凝胶电泳的原理,掌握胶体制备的方法以及电泳仪的操作方法1.5 掌握PCR技术的操作流程,熟练使用PCR仪并了解其工作原理及检测方法1.6 了解柱纯化的原理及使用方法2.实验原理1)水稻叶片基因组DNA提取水稻属于真核生物,其DNA以双链线性高分子形式存在于细胞核中,一般以染色质形式在。

由于植物组细胞破裂之后,DNA酶会水解DNA因此在提取过程总要加入EDTA螯合剂从而抑制DNA酶活性。

水稻叶片基因组DNA的提取主要是通过破碎组织和细胞从而通过对细胞内其他杂质的去处来达到基因组DNA的提纯。

提纯的产物通过1%的琼脂糖凝胶电泳进行检验。

本实验是通过CTAB法来进行提取的,它是一种阳离子表面活性剂,能溶解细胞膜和和核膜蛋白,使核蛋白解聚从而使DNA游离出来,已达到分离的目的。

2)特定基因片段的PCR扩增PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链反应)是一种选择性体外扩增DNA或RNA的方法。

它包括三个基本步骤: (1) 变性(Denature):目的双链DNA片段在95℃下解链;(2)退火(Anneal):两种寡核苷酸引物在适当温度(55℃左右)下与模板上的目的序列通过氢键配对;(3) 延伸(Extension):在TaqDNA 聚合酶合成DNA 的最适温度下,以目的DNA 为模板进行合成.由这三个基本步骤组成一轮循环,理论上每一轮循环将使目的DNA 扩增一倍,这些经合成产生的DNA 又可作为下一轮循环的模板,所以经30轮循环就可使DNA扩增上百倍。

质粒dna的鉴定实验报告

质粒dna的鉴定实验报告

质粒dna的鉴定实验报告质粒DNA的鉴定实验报告引言:质粒DNA是一种环状的DNA分子,常见于细菌等原核生物中,并广泛应用于基因工程、遗传学研究以及生物技术领域。

本实验旨在通过一系列实验操作,对质粒DNA进行鉴定,以确保其纯度和完整性。

实验材料与方法:1. 实验材料:- 质粒DNA样本- 纯化试剂盒(如酚/氯仿)- 乙醇(绝对醇)- 离心管- PCR仪2. 实验方法:1) DNA纯化:将质粒DNA样本加入纯化试剂盒中,按照盒内说明进行离心分离,以去除杂质和蛋白质。

2) 乙醇沉淀:将离心分离后的上清液转移至新的离心管中,加入等体积的绝对醇,轻轻颠倒离心管,使DNA沉淀于管底。

3) 洗涤与干燥:用70%的乙醇洗涤DNA沉淀,然后将离心管倒置于洁净的工作台上,待DNA沉淀干燥。

4) 溶解与保存:用适量的无菌纯水或缓冲液溶解DNA沉淀,保存于-20摄氏度。

实验结果与讨论:通过本实验,我们成功获得了质粒DNA样本,并对其进行了鉴定。

以下是我们的实验结果与相应的讨论。

1. DNA纯化效果:通过酚/氯仿法进行DNA纯化后,我们观察到离心分离后的上清液呈现明显的透明状,而底部的沉淀则呈现白色或乳白色。

这说明纯化试剂盒能够有效去除杂质和蛋白质,使得质粒DNA得以分离和纯化。

2. DNA沉淀效果:在乙醇沉淀过程中,我们观察到DNA沉淀于离心管底部,形成白色或乳白色的沉淀物。

这表明DNA能够与乙醇发生相互作用,并沉淀于管底。

3. DNA溶解效果:在用无菌纯水或缓冲液溶解DNA沉淀后,我们观察到沉淀物完全溶解,并呈现透明的溶液。

这说明DNA能够充分溶解于溶剂中,并保持其完整性。

4. DNA保存效果:将溶解后的DNA样本保存于-20摄氏度,可以有效地保护DNA的完整性和稳定性。

这是因为低温能够减缓DNA降解的速度,延长其保存时间。

结论:通过本实验,我们成功地鉴定了质粒DNA样本,并确认其纯度和完整性。

实验结果表明,我们的实验操作能够有效地纯化、沉淀、溶解和保存质粒DNA。

组织DNA的提取与纯化

组织DNA的提取与纯化

在某些情况下,需要更高的灵敏度和特异 性来检测和纯化特定的DNA片段,这是当 前技术所面临的挑战。
随着生物信息学和基因组学的发展,对 DNA提取与纯化的自动化和高通量需求越 来越高,这也是未来需要解决的问题。
未来发展方向与前景
新技术应用
随着生物技术的不断发展,新的技术和方 法将被应用于组织DNA的提取与纯化,以
通过对组织DNA进行病原微生物检测,有助于快速准确地诊断感 染性疾病。
个体化医疗与精准医学
个体化用药
根据组织DNA中的基因变异信息,为患者选择最合适的药物和剂 量,实现个体化用药。
预测性医学
通过分析个体的基因组信息,预测其在特定疾病上的风险,从而采 取针对性的预防措施。
定制化疗法
基于组织DNA的个体差异,开发定制化的疗法或细胞疗法,提高 治疗效果和安全性。
02
03
细胞破碎
通过物理或化学方法破碎 细胞,释放出细胞内的 DNA。
DNA的分离
利用离心、沉淀等方法将 DNA从细胞碎片和其他物 质中分离出来。
DNA的提取
通过吸附、洗脱等步骤将 DNA从细胞裂解液中提取 出来。
DNA的初步纯化
去除杂质
01
通过离心、过滤等方法去除提取出的DNA中的蛋白质、RNA等
去除其他杂质
如多糖、脂类等,可以通过离心或沉淀的方法去 除。
进一步纯化
乙醇沉淀
将DNA从溶液中沉淀下 来,以去除剩余的杂质。
漂洗
使用漂洗液进一步去除 DNA上的杂质。
切向电泳
通过切向电泳技术,将 DNA片段根据大小进行 分离。
纯度检测与鉴定
紫外吸收法
通过测量DNA在260nm和280nm处的紫外吸收值,判断DNA 的纯度。

质粒DNA的提取纯化与电泳检测

质粒DNA的提取纯化与电泳检测
法、煮沸法、去污剂 (如Triton或SDS)裂解
法、羧基磷灰石柱层析法、质粒DNA释放
法、酸酚法等。
1 .碱裂解法提取质粒DNA
1.1原理


共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓
扑学上的差异来分离它们。
在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线
性的DNA双螺旋结构解开而被变性,共价闭合
接种含pUC-mT质粒的大肠杆菌到1.5ml含有60μg/ml Amp抗生素
的LB 液体培养基
37℃摇培过夜(10~12h)12000rpm,
3min
弃去上清液,倒立于滤纸之上,尽量去净上清。
加100μl Ⅰ液,涡旋震荡,充分混匀
配制适量的Ⅱ液
加200μl Ⅱ液,迅速轻轻混匀(以颠倒EP管5-10次为宜),
电泳介质相同(电泳液和凝胶):
• 分子在电场中迁移的速度主要取决于
分子本身的大小和形状。
• 形状相似的分子的迁移速度主要与分
子量相关: 分子量越大,移动越慢。
凝胶板
(二)琼脂糖凝胶电泳介绍
琼脂糖:
是一种线性多糖聚合物,从红色海藻产物
琼脂中提取而来。
琼脂糖凝胶:
琼脂糖在水里(或电泳液)中加热到沸点
电泳缓冲液的组成。

5.溴化乙锭染料
Biblioteka EB:溴化乙锭( 3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶溴盐
Ethidium Bromide,EB),EB能插入DNA分子碱基
对之间,导致EB与DNA结合。DNA吸收的260nm的紫
外光传递给EB,或者结合的EB本身在300和360吸收的
射线,均可在可见光区以590波长发射出来,呈橙红色。
离子交换层析法

dna的质量分析实验报告

dna的质量分析实验报告

dna的质量分析实验报告实验目的:通过DNA的质量分析,了解DNA样本的纯度和浓度,为后续的实验设计和操作提供参考。

实验原理:DNA的质量分析主要包括纯度分析和浓度分析两个方面。

1. 纯度分析:纯度是指DNA样本中所含的杂质和污染物的含量。

常用的纯度检测方法有比色法和光谱法。

比色法:通过检测DNA溶液的吸光度,判断其中蛋白质、RNA和其他杂质的含量。

DNA纯度范围一般在1.8-2.0之间。

2. 浓度分析:DNA的浓度是指单位体积内所含的DNA量。

常用的浓度检测方法有比色法和荧光法。

比色法:根据DNA与染料之间的比色反应,根据反应产物的吸光度来确定DNA浓度。

荧光法:在荧光素染料的作用下,测定DNA溶液中的荧光强度,从而确定DNA浓度。

实验步骤:1. 取DNA样本,使用比色法进行纯度分析。

根据比色反应的结果,判断DNA样本中是否存在杂质和污染物。

2. 使用比色法或荧光法进行DNA浓度分析。

根据比色或荧光反应产物的吸光度或荧光强度,计算出DNA的浓度。

实验结果及分析:1. 纯度分析:通过比色法检测,得到DNA溶液的吸光度为1.9,说明DNA样本中较少含有蛋白质、RNA和其他杂质,纯度较高。

2. 浓度分析:通过比色法或荧光法检测,得到DNA溶液的浓度为50 ng/μL,说明该DNA样本中单位体积内含有50 ng的DNA。

结论:通过DNA的质量分析,我们得知该DNA样本的纯度较高,且浓度为50 ng/μL。

这为后续的实验设计和操作提供了参考。

在实际操作中,我们应该注意保护DNA样本的纯度,避免杂质和污染物的污染。

同时,根据所需的实验要求,调整DNA的浓度,以保证实验的准确性和可重复性。

实验中可能存在的误差:1. 实验操作不规范或仪器故障导致的数据偏差。

2. DNA样本的提取和处理过程中可能存在污染,影响纯度和浓度的测定结果。

3. 不同测定方法的差异性,可能导致不同的浓度结果。

改进方案:1. 注意实验操作的规范性,尽量减少人为因素对实验结果的影响。

实验报告DNA提取与纯化

实验报告DNA提取与纯化

实验报告DNA提取与纯化一、实验目的本次实验的主要目的是掌握从生物样本中提取和纯化DNA 的方法,并了解 DNA 的性质和特点。

通过实验操作,熟悉相关实验技术和仪器设备的使用,为后续的分子生物学研究和应用奠定基础。

二、实验原理DNA 是生物体内携带遗传信息的大分子物质。

在细胞中,DNA 与蛋白质等成分结合在一起。

提取 DNA 的基本原理是利用化学和物理方法破坏细胞结构,使 DNA 从细胞中释放出来,然后通过去除蛋白质、RNA 等杂质,达到纯化 DNA 的目的。

常用的方法包括:1、细胞裂解:使用裂解液破坏细胞膜和核膜,使细胞内容物释放。

2、去除蛋白质:加入蛋白酶或酚/氯仿等试剂,使蛋白质变性沉淀。

3、沉淀 DNA:通常使用乙醇或异丙醇等有机溶剂,使 DNA 沉淀出来。

三、实验材料与设备(一)实验材料1、新鲜的动物肝脏组织或植物叶片。

2、生理盐水。

3、裂解液(包含去污剂、盐等成分)。

4、蛋白酶 K。

5、酚/氯仿混合液。

6、无水乙醇、异丙醇。

7、 70%乙醇。

8、 TE 缓冲液(TrisEDTA 缓冲液)。

(二)实验设备1、离心机。

2、移液器。

3、恒温水浴锅。

4、涡旋振荡器。

5、冰箱。

6、微量紫外分光光度计。

四、实验步骤1、样本处理称取适量的动物肝脏组织或植物叶片,用生理盐水清洗干净,剪碎或研磨成匀浆。

2、细胞裂解将处理好的样本转移至离心管中,加入适量的裂解液,充分混匀,置于恒温水浴锅中孵育一段时间,使细胞充分裂解。

3、去除蛋白质加入蛋白酶 K,混匀后在适当温度下孵育,以降解蛋白质。

加入酚/氯仿混合液,涡旋振荡混匀,然后离心,使水相和有机相分离。

此时,蛋白质等杂质主要存在于有机相中,而 DNA 则在水相中。

4、 DNA 沉淀将上清液转移至新的离心管中,加入适量的无水乙醇或异丙醇,轻轻颠倒混匀,可见白色的 DNA 沉淀出现。

5、洗涤 DNA离心收集 DNA 沉淀,弃去上清液。

加入适量的 70%乙醇,轻轻洗涤沉淀,再次离心,去除乙醇。

第2章 DNA的纯化、浓度的测定及质量鉴定

第2章 DNA的纯化、浓度的测定及质量鉴定

第二章DNA的纯化、浓度的测定及质量鉴定实验一 DNA(或RNA)的核酸酶处理纯化一、原理和用途在基因工程中,DNA与RNA的提取与纯化是最基本的实验方法。

在DNA提取时,有时会有RNA的污染,在RNA提取时,有时会有DNA的污染,为了消除它们对后续实验的影响,通常我们要对所提取的DNA或RNA用相应的核酸酶进行纯化。

核糖核酸酶A(又叫RNA酶A,RNase A)来源于牛胰脏,是一种内切核糖核酸酶,可特异性攻击RNA上嘧啶残基的3′端,切割与相邻核苷酸形成的磷酸二酯键,从而除去RNA,其反应终产物为嘧啶3′磷酸及末端带嘧啶3′磷酸的寡核苷酸。

脱氧核糖核酸酶I(又叫DNA酶I,DNase I)来源于牛胰脏,是一种内切脱氧核糖核酸酶,它能水解双链或单链DNA,产生带5′端磷酸基团的单核苷酸及寡核苷酸的混合物。

当Mg2+存在时,DNA酶I可独立地作用于每条DNA链,且切割位点随机分布。

而当Mn2+存在时,DNA酶I可在两条链大致同一位置上切割DNA链,产生平齐末端或具有1~2个核苷酸突起的DNA片段。

二、实验材料粗提的DNA(或RNA)溶液。

三、溶液与缓冲液1.核糖核酸酶A2.10×RNase A悬浮液3.DNase I4.10×DNase I液(含MgCl2)或10×DNase I缓冲液(含MnCl2)5.灭菌纯水6.无水乙醇7.70%乙醇8.TE缓冲液四、仪器设备及耗材制冰机,冰箱,冷冻低温超速离心机,干燥培养恒温器,恒温水浴箱,旋涡振荡器,真空干燥器,离心管架,吸头盒, 2 μL、10 μL、100 μL、200 μL、1000 μL移液器,10 μL、200 μL、1000 μL吸头,1.5 mL离心管等。

五、实验方法1. 有些商业用固体RNase A干粉(或DNase I)可能含有微量的DNase(或RNase)活性,故在使用前应去除其活性,去除的方法可按照商家的使用说明书进行。

DNA纯化技术及其在分子生物学领域中的应用

DNA纯化技术及其在分子生物学领域中的应用

DNA纯化技术及其在分子生物学领域中的应用DNA是生命机体的基础,分子生物学研究的核心之一便是对DNA的研究。

DNA分子的提取及纯化是DNA研究的基础,只有得到足够高质量的DNA 样品,才能进行后续的实验。

本文将简要介绍DNA纯化技术的相关内容及其在分子生物学领域中的应用。

1.DNA纯化技术1.1DNA提取DNA提取是纯化DNA的第一步。

DNA提取最常用的方法是酚/ 氯仿法,该方法基于三种物质的化学性质不同来分离它们,分别是DNA、蛋白质和RNA。

酚和氯仿可以破坏蛋白质和RNA的特定化学键并将它们溶解到有机层中,从而将DNA分离出来。

1.2DNA纯化在DNA提取后,我们还需要进行一系列步骤进行纯化,以满足后续实验的需要。

DNA纯化技术有许多种,其中最常用的方法是凝胶电泳分离法和琼脂糖柱层析法。

1.2.1凝胶电泳分离法凝胶电泳分离法基于DNA分子在电场中的不同迁移率,将不同大小的DNA分子分离开来。

通常会使用琼脂糖凝胶,将样品加载到凝胶上,然后施加电场。

DNA纯化后可以通过凝胶电泳分离形成DNA条带。

1.2.2琼脂糖柱层析法琼脂糖柱层析法基于分子大小分离原理,将DNA分子从其他杂质中分离出来。

琼脂糖提供的凝胶材料可以形成孔隙状的微观结构,根据DNA分子的大小特性,在琼脂糖柱中实现纯化步骤。

2.DNA纯化技术在分子生物学领域的应用2.1PCR技术PCR是分子生物学领域最重要的技术之一,它利用DNA复制的原理进行DNA扩增。

在PCR试验中,对DNA纯化高纯度的DNA样品带来了生动的提高,能够有效避免样品受到自然生物体中DNA快速分解的影响,确保进行PCR扩增的过程高度可重复。

2.2基因测序在基因测序领域中,DNA纯化是获取高质量基因组数据的基础。

DNA纯化的质量对其他下游实验步骤的抗干扰性、可重复性等多个方面均有显著的影响。

DNA纯化技术让研究人员能够更好地获得准确的测序结果,用以解决现代医学许多疾病的研究。

质粒DNA的提取、纯化及验证

质粒DNA的提取、纯化及验证

质粒DNA的提取、纯化及验证姓名:肖风学号:2 2010级生物工程一、【实验目的】1、掌握碱变性提取法的原理及各种试剂的作用,掌握碱变性法提取质粒DNA 的方法。

2、掌握质粒DNA的纯化方法,即用酚、氯仿抽提法除去质粒中的蛋白质。

3、学习并掌握凝胶电泳进行DNA的分离纯化的实验原理,凝胶的制备及电泳方法及凝胶中DNA的分离纯化方法。

二、【实验原理】1、碱变性提取法提取和纯化质粒DNA的方法很多,目前常用的有:碱变性提取法、煮沸法、羟基磷灰石柱层析法、EB一氯化铯密度梯度离心法和Wizard法等。

其中,碱变性提取法最为经典和常用,适于不同量质粒DNA的提取。

该方法操作简单,易于操作,一般实验室均可进行。

提取的质粒DNA纯度高,可直接用于酶切、序列测定及分析。

碱变性提取质粒DNA一般包括三个基本步骤:培养细菌细胞以扩增质粒;收集和裂解细胞;分离和纯化质粒DNA。

在细菌细胞中,染色体DNA以双螺旋结构存在,质粒DNA以共价闭合环状形式存在。

细胞破碎后,染色体DNA和质粒DNA均被释放出来,但是两者变性与复性所依赖的溶液pH值不同。

在pH值高达12.0的碱性溶液中,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开而变性;共价闭合环状质粒DNA的大部分氢键断裂,但两条互补链不完全分离。

当用pH值4.6的KAc(或NaAc)高盐溶液调节碱性溶液至中性时,变性的质粒DNA可恢复原来的共价闭合环状超螺旋结构而溶解于溶液中;但染色体DNA不能复性,而是与不稳定的大分子RNA、蛋白质一SDS复合物等一起形成缠连的、可见的白色絮状沉淀。

这种沉淀通过离心,与复性的溶于溶液的质粒DNA分离。

溶于上清液的质粒DNA,可用无水乙醇和盐溶液,使之凝聚而形成沉淀。

由于DNA与RNA性质类似,乙醇沉淀DNA的同时,也伴随着RNA沉淀,可利用RNase A将RNA降解。

质粒DNA溶液中的RNase A以及一些可溶性蛋白,可通过酚/氯仿抽提除去,最后获得纯度较高的质粒DNA。

生物大分子的纯化与鉴定技术

生物大分子的纯化与鉴定技术

生物大分子的纯化与鉴定技术生物大分子是生命体内最基本的组成元素之一,包括蛋白质、核酸、多糖和脂质等。

它们的结构和功能对于生物体的发育、代谢、传递遗传信息等方方面面都有着非常重要的作用。

因此,对它们进行纯化和鉴定是生物学和生命科学研究中不可或缺的重要步骤。

一、蛋白质的纯化与鉴定技术1. 活性层析技术活性层析是从混合样品中纯化蛋白质的一种常用技术。

它基于蛋白质与特定配体之间的互相作用,利用这种相互作用把想要纯化的蛋白质从混合物中分离出来。

这种方法不仅可以分离出单一种类的蛋白质,还可以根据蛋白质与配体的亲和性进行分层次纯化。

同时,利用不同的配体也能够分离出不同功能的酶,从而进一步扩大了对蛋白质的纯化范围。

2. 离子交换层析技术离子交换层析是一种基于蛋白质电荷的分离方法。

它利用固定在树脂表面上的离子,通过与蛋白质表面的离子相互作用,将蛋白质从混合物中分离出来。

这种方法常常用于分离带有不同电荷的蛋白质,以及酸性和碱性细胞因子等物质。

3. 尺寸排除层析技术尺寸排除层析技术是一种基于蛋白质大小的分离方法。

它通过让大分子在固定相中的孔隙中滞留时间长,从而将大分子和小分子分离出来。

这种方法通常用于分离相对分子质量较大的蛋白质,如重组蛋白、抗体等。

4. 逆相高效液相色谱技术逆相高效液相色谱是一种基于蛋白质亲水性的分离方法。

它利用逆相柱的反相作用,将亲水性较小的蛋白质从混合物中分离出来。

这种方法常常被用于提纯高表达体系中的蛋白质。

5. SDS-PAGE和Western Blotting技术SDS-PAGE是一种基于蛋白质质量和电荷的分离技术,通过在凝胶中加入SDS(十二烷基硫酸钠)和还原剂,可以使不同电荷和大小的蛋白质变得相同,从而进行准确的大小分离。

Western Blotting是一种检测蛋白质表达的方法,它利用特异性抗体将蛋白质分子分离出来,并将其转移到膜上,然后通过特异性抗体进一步检测目标蛋白质的表达量。

二、核酸的纯化与鉴定技术1. 常规离心技术常规离心技术是一种对复杂混合物进行分离和预纯化的方法,通过调整离心速度和离心时间,将不同大小和形状的细胞组分分离出来。

质粒DNA的提取、纯化和电泳检测

质粒DNA的提取、纯化和电泳检测

质粒DNA的提取、纯化和电泳检测摘要本实验通过碱变性法提取E.coli DH5α(pUC19)的质粒DNA,并且通过一系列的分离纯化技术将其质粒DNA与染色体DNA、RNA、蛋白质等杂质分开从而得到纯化的质粒DNA分子。

通过琼脂糖凝胶电泳可以通过DNA条带的位置来大致判断其分子大小,也可以将实际电泳的结果和理论结果相对比,分析差异产生原因,从而完善实验方法,严谨实验步骤。

关键词碱变性法分离纯化技术琼脂糖凝胶电泳引言质粒是细菌细胞中与主染色体共存、可自主复制的一段大多数呈环形的DNA。

细菌质粒的相对分子质量大小从1kb至200kb以上不等。

一些质粒永远独立于染色体之外,另外一些质粒在一定条件下会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。

质粒在基因工程中质粒常被用做基因的载体。

目前,已发现有质粒的细菌有几百种,已知的绝大多数的细菌质粒都是闭合环状DNA分子(简称cccDNA)。

质粒在基因工程中是一类重要的载体,其作用主要是携带一些基因片段(可以是编码基因,也可以是调控区等),在细胞内环境中进行表达或参与通路的相互作用,通过将质粒转化到宿主细胞可以探究基因相互作用关系,取得蛋白产物,实现特定基因片段的克隆等。

总之,质粒在生物科学研究方面具有广泛的作用。

提取和纯化质粒DNA的方法很多,目前常用的有:碱裂解/碱变性法、煮沸法、羟基磷灰石柱层析法、EB-氯化铯密度梯度离心法和Wizard法等。

其中,碱变性提取法最为经典和常用。

碱裂解/碱变性法是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离目的的分离方法。

在pH12.6的碱性条件下,染色体DNA 的氢键断裂,双螺旋结构解开而变性;质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链不会完全分离。

当以pH4.8的KAc高盐缓冲液调节其pH 值至中性时,变性的质粒DNA恢复原来的构型,保存在溶液中;染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构,与不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来,通过离心被除去。

质粒DNA的提取和纯化实验报告

质粒DNA的提取和纯化实验报告

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2、初步了解DNA纯化的原理。

二、实验原理1、细菌质粒是一类双链、闭环的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。

各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份,通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态,但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。

2、质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子,重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。

目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取,本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。

3、碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。

4、纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。

例如,氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法,但这些方法相对昂贵或费时。

对于小量制备的质粒DNA,经过苯酚、氯仿抽提,RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA,所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求,故在分子生物学实验室中常用。

三、实验步骤1、挑取单菌落接种到含Amp的LB液体培养基试管内(3.5ml/管)2、将试管放入恒温震荡培养箱中,37℃,200r/min培养12-16h。

基于化学发光测定仪的DNA检测方法研究

基于化学发光测定仪的DNA检测方法研究

基于化学发光测定仪的DNA检测方法研究DNA检测在现代生物学、医学和法医学等领域中具有重要的应用价值。

随着科技的不断发展,各种新的DNA检测方法应运而生,其中基于化学发光测定仪的DNA检测方法,由于其高灵敏度、高精确性和高通量性等优势,成为了研究人员广泛关注的领域。

化学发光测定仪是一种基于酶促化学发光原理的仪器,通常用于测定各种生物学分子的含量与活性。

在DNA检测中,化学发光测定仪可以通过检测DNA的特定序列,实现对目标DNA的快速准确测定。

基于化学发光测定仪的DNA检测方法主要包括以下几个步骤:DNA样本提取、DNA纯化、DNA扩增、DNA探针标记和化学发光测定。

首先,DNA样本提取是基于化学发光测定仪的DNA检测的第一步,其关键在于将目标DNA从细胞或组织中提取出来。

常用的DNA提取方法包括酚氯仿法、盐酸酚类似物法和商用DNA提取试剂盒法等。

这些方法可以有效地提取出高质量的DNA样本,为后续的DNA检测步骤提供良好的基础。

其次,DNA纯化是为了去除DNA样本中的潜在污染物,如RNA、蛋白质和酶等,以确保准确的测定结果。

常用的DNA纯化方法包括醇沉法、离心管法和硅胶柱法等。

这些方法可以有效地净化DNA样本,提高其纯度和质量。

第三,DNA扩增是在基于化学发光测定仪的DNA检测中常用的技术手段之一。

通过PCR扩增反应,可以在较短的时间内快速扩增出目标DNA的数量,增加其检测的灵敏度。

PCR反应的关键是选取合适的引物和PCR条件,以确保扩增反应的特异性和高效性。

接下来,DNA探针标记是基于化学发光测定仪的DNA检测的核心步骤之一。

DNA探针通常是一种具有特定序列的短链DNA分子,通过荧光标记或辣根过氧化物酶(HRP)标记等方法,可以与目标DNA序列特异性结合。

当目标DNA存在时,荧光信号或化学发光信号将得到检测,从而实现对目标DNA的定量或定性分析。

最后,化学发光测定是基于化学发光测定仪的DNA检测的关键步骤。

dna产物纯化原理

dna产物纯化原理

dna产物纯化原理DNA是构成遗传信息的核心分子,其产物指的是在DNA的复制、转录及翻译等过程中,所产生的相关分子物质。

DNA产物纯化是科学研究中的一个重要过程,它可以通过分离纯化DNA产物,进一步研究其结构和功能,有利于探究遗传信息的传递和表达机制。

一、DNA产物的分离DNA产物的分离是指根据分子量、电荷、结构等物理化学性质,将DNA产物从其它无关物质中分离出来的过程。

分离的方法有多种,如离心、层析、电泳等。

其中,层析和电泳方法比较常用。

1.层析方法层析运用不同物质在某种条件下对DNA产物产生的拖拽作用,将原液中的大颗粒物质与小颗粒物质相分离。

常用的层析方法有:凝胶层析、离子交换层析、亲和层析等。

其中,凝胶层析应用最为广泛。

凝胶层析是将样品通过各种大小不等且具有一定的孔隙度的凝胶,使分子依据大小分别渗入凝胶孔隙内,进而实现产物的分离净化。

凝胶的孔隙大小主要取决于凝胶中交联浓度和聚合物量,聚合物所形成的结晶体系具有三维网络结构,可以用来分离大分子和小分子。

2.电泳方法电泳利用DNA分子在电场中受力向对立端移动的特性进行分离。

在电场中,分子的移动速度与分子电荷量、大小及电场强度、环境温度等因素除息息相关。

电泳分离DNA产物的方法有:聚丙烯酰胺凝胶电泳、超声波电泳、矩阵电泳等。

其中,聚丙烯酰胺凝胶电泳是应用最广泛的电泳方法。

在这一方法中,DNA样品以负电荷向电极移动,由于不同的DNA分子长度不同,因此可以利用不同长度DNA分子的迁移速率进行分离和纯化。

二、DNA产物的提纯DNA产物的提纯是指在检测和研究中,将不同来源、性质的DNA 混合物中的目标DNA纯化出来的过程。

提纯的方法有多种,如柱式吸附、盐析、氯仿萃取等。

其中,柱式吸附是提纯DNA产物最常用的方法之一。

1.柱式吸附柱式吸附是根据DNA产物与特定物质之间的亲和力,将杂质分离出来,从而纯化目标DNA产物的过程。

这种方法主要应用于小规模DNA 产物纯化,通常使用硅胶颗粒、离子交换介质等进行分离。

DNA浓度与纯度的紫外分光光度计法分析

DNA浓度与纯度的紫外分光光度计法分析

DNA浓度与纯度的紫外分光光度计法分析项⽬三:DNA浓度与纯度的紫外分光光度计法分析⼀、实验⽬的学习利⽤紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度,掌握浓度和纯度的计算⽅法和实验操作技术。

⼆、实验原理组成核酸的碱基(G, A, T, C)在260 nm处具有强吸收峰,所以通过测定260 nm的吸收峰即可对DNA进⾏定量。

但有时也会因为所处溶液的pH值不同⽽导致吸光系数的不同,因此,⼀般在中性pH值左右的环境中进⾏测定。

这种⽅法常⽤于测定⽐较纯的样品。

核酸样品中最常有的其它吸光物质为蛋⽩质,由于蛋⽩质在280 nm处具有强吸收峰,因此测定A260/A280⽐率,可以判断DNA的纯度。

纯化的DNA及RNA的A260/A280 ⽐值应分别接近1.8 及2.0,当溶液中含有蛋⽩质时,会造成A260/A280 ⽐值降低。

计算原溶液的浓度(A):A260×转换因⼦×稀释因⼦= 原溶液DNA浓度(µg/ml) 每吸光单位转换因⼦:双股DNA为50 µg/ml;单股DNA或RNA为40 µg/ml计算原溶液的摩尔数(以500 bp⼤⼩的DNA⽚段为例):每个脱氧核苷酸的平均分⼦量近似为324.5,因此分⼦量=500×324.5=162250摩尔浓度(mol/L)=A/162250×1000三、实验仪器1、紫外-可见分光光度计2、移液器16套(每2⼈1套)四、实验材料1、⽆菌枪头20 µL各2⽀;2、离⼼管五、实验试剂1、⽆菌⽔2、待测DNA溶液五、实验步骤1、取标准λDNA,稀释,待⽤。

2、制作标准曲线(教师完成!)3、取实验⼀提取的基因组DNA,稀释50倍后待⽤。

4、测定A260和A2805、计算DNA浓度、纯度紫外吸收检测DNA浓度与纯度2007年11⽉13⽇星期⼆11:40⽬的:了解紫外吸收检测DNA浓度与纯度的原理,掌握测定⽅法。

原理:核酸的最⼤吸收波长为260nm,蛋⽩质为280nm,在波长260nm时,1OD值相当于双链DNA浓度为50µg/ml,单链寡核苷酸的含量为30µg/ml,可以据此来计算核酸样品的浓度,还可通过测定在260nm和280nm的OD值的⽐值(OD260/OD280),估计核酸的纯度。

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DNA分子纯化与检测方法的研究进展陈伟刚常秀莲*(烟台大学生命科学学院烟台264000)摘要:系统介绍了各种DNA(Deoxyribonucleic acid 脱氧核糖核酸)纯化除杂和检测不同的依据、方法、原理、过程及其特点DNA具有非常重要的生物功能,主要是贮存遗传信息和传递遗传信息。

随着生物技术的发展和对DNA结构和功能研究的深入,对其分离检测研究也有了迅速发展。

由于DNA与人类生活密切相关,所以对其质量和纯度要求也越来越高。

而快速得到纯度较高,结构完整的DNA分子成为其研究进展的关键。

关键词:DNA;纯化;检测;研究进展中图分类号:Q52 文献标识码:AThe Study Development in purification and detectionmethods of DNACHEN Wei-gang CHANG Xiu-lian(Department of Life Science, Yantai University Yantai 264000,China)Abstract The different basis,methods,principles,procedures and characteristic of thevarious DNA purification and detection were introduced systematically. DNA has very important biological functions,which mainly keeps genetic information and transmission of genetic information in storage. With the development of biotechnology and the In-depth study of DNA structure and function, the separation and detection of research has developed rapidly.Because DNA is closely to human life, so its quality and purity requirements are getting higher and higher .And quickly obtain the high purity, integrated structure of the DNA molecule has becomed the key to the progress of the study.Key words DNA ; Purification; Detection; The Progress of the Study.核酸是现代生物学、医学研究中的重要课题。

作为遗传信息的携带者,DNA是基因表达的物质基础,在生物体正常生长、发育和繁殖等生命活动中起重要作用。

生物工程以基因工程为核心,且作为现代生物化学、分子生物学重要研究领域里的DNA,成为基因工程研究的核心分子。

DNA不仅是基本的遗传物质,而且在蛋白质的生物合成上也占重要位置,因而在生长、遗传、变异等一系列重大生命现象中起决定性的作用。

DNA在实践应用方面有极重要的作用,现已发现近2000种遗传性疾病都与其结构有关,如肿瘤的发生、遗传疾病等。

70年代以来兴起的遗传工程,使人们可用人工方法改组DNA,从而有可能创造出新型的生物品种。

如应用遗传工程方法已能使大肠杆菌产生胰岛素、干扰素等珍贵的生化药物。

正是由于DNA与人类生活密切相关,所以对其质量和纯度要求也越来越高。

DNA的分离主要是指将其与蛋白质、多糖、脂肪等生物大分子分开。

在分离时应遵循两个原则:一是保证DNA的一级结构的完整性,因为完整的一级结构是其结构和功能研究的最基本的要求;二是尽量排除其它分子的污染,保证DNA样品的纯度。

随着生物技术的发展和对DNA结构和功能研究的深入,对其分离检测研究也有了迅速发展。

文章针对这些方法的基本原理及在DNA分离纯化,检测方面的应用研究进行了综述。

1 DNA纯化方法1.1 苯酚/氯仿抽提法其原理是:在酚氯仿的共同作用下,蛋白质会被变性,形成不溶解的物质。

由于蛋白质的密度小于酚而大于水,所以离心后,会在酚相和水相于之间,形成蛋白质中间层,从而有效地将蛋白质和DNA分离开来。

细胞裂解后离心分离含DNA 的水相,加入等体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25:24:1 体积)混合液,两相经振荡混匀后离心分离。

疏水性的蛋白质被分配至有机相,DNA则被留于上层水相。

氯仿可去除脂肪,使蛋白质变性,从而提高提取效率。

异戊醇可减少操作过程中产生的气泡。

之后,将DNA进行有机溶剂沉淀,在含DNA的水相中加入醋酸钾和醋酸钠,形成核酸盐,核酸盐可被一些有机溶剂沉淀,离心得到的DNA可以用70%乙醇洗涤以除去多余的盐分,即可获得一定纯度的DNA,最后将DNA溶解于水相。

基因组DNA的分离纯化时,用以含EDTA(Ethylene Diamine Tetraacetic Acid 二价金属螯合剂)、SDS(sodium dodecyl sulfate,十二烷基硫酸钠)及无DNA酶的RNA酶裂解缓冲液裂解细胞,经蛋白酶K处理后,用pH8.0的Tris(Tris(Hydroxymethyl)aminomethane, 三羟甲基氨基甲烷)饱和酚抽提DNA,重复抽提至一定纯度后,根据不同需要进行透析或沉淀处理,获得DNA样品样品。

1.2 层析法层析法是利用不同物质理化性质差异而建立的分离分析方法。

包括吸附层析、亲和层析、离子交换层析、柱层析等。

因分离和纯化同步进行,并且有商品试剂盒供应,而被广泛应用于DNA的纯化。

目前常用的试剂盒大多采用纯化柱离心法纯化DNA,该方法的关键技术在于核酸吸附材料的选择,主要有树脂和硅胶膜,还有些填料为玻璃纤维。

树脂和硅胶膜需在高盐缓冲液中才能有效吸附核酸。

在一定的离子环境下,DNA可被选择性地吸附到硅土、硅胶或玻璃表面而与其他生、硅胶或物分子分离。

用柱层析法纯化质粒DNA,采用硅基质作为填充材料。

在多盐条件下,依靠DNA与硅基质的可逆性结合来进行纯化。

通过暴露的磷酸盐残基,DNA吸附到硅基质上,以50%的乙醇溶液洗去RNA和糖类等生物大分子,然后加入TE或水溶液使DNA分子重新水合,并通过离心洗脱出来。

PVPP(化学名称:聚乙烯吡咯烷酮)柱层析纯化土壤DNA粗提液时,土壤中的腐植酸、金属离子等杂质吸附于PVPP,纯化的DNA流穿。

DNA损失较低,回收效率高,简便易操作,省时,成本低。

1.3 密度梯度离心法密度梯度离心法又称为区带离心法,可以同时使样品中几个或全部组分分离,具有良好的分辨率。

离心时先将样品溶液置于一个由梯度材料形成的密度梯度液体柱中,离心后被分离组分以区带层分布于梯度柱中。

双链DNA、单链DNA、RNA 和蛋白质具有不同的密度,因而可经密度梯度离心的方法形成不同密度的纯样品区带,该法适用于大量DNA样本的制备。

其中氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心法是纯化大量质粒DNA 的首选方法。

氯化铯是DNA密度梯度离心的标准介质,梯度液中的溴化乙锭与DNA结合,离心后形成的DNA区带经紫外灯照射产生荧光而被检测。

用注射针头穿刺回收后,通过透析或乙醇沉淀除去氯化铯而获得纯化的DNA。

1.4 醇沉淀法质粒DNA的粗制品首先用LiCl沉淀大分子RNA,并用RNase消化小分子RNA;然后在高盐条件下,用PEG选择性地沉淀大的质粒DNA;沉淀的质粒DNA进一步用酚酚/氯仿抽提,乙醇沉淀。

醇沉淀使用异丙醇还是乙醇,异丙醇沉淀的DNA比较紧凑,帖壁紧,颜色不是很白;乙醇沉淀的DNA比较蓬松,容易从壁上移动,颜色比较白。

异丙醇沉淀的DNA不容易丢掉,但比较难洗涤。

因此,少量DNA用异丙醇沉淀,大量的用乙醇沉淀。

通过SDS和蛋白酶K消化与DNA结合的蛋白质,并失活DNA酶,酚氯仿抽提去除蛋白质,用2倍容积的异丙醇来沉淀含0.1mol/L NaCl的DNA溶液,DNA沉淀是丝状,而RNA在异丙醇溶液中仍为可溶状态,利用这一物理特性从DNA 中去处RNA,省去了加RNA酶消化酶的步骤。

如果DNA抽提的起始样品是杂质比较多时,原则上不要使用低温沉淀。

低温沉淀能提高沉淀效率:当DNA浓度很低时,效果明显;当DNA浓度比较高时,效果不明显,但却会导致杂质的大大增加。

1.5 CsCl-EB法此方法为沉降平衡离心法,经超速离心,离心介质CsCl形成一连续的密度梯度,在过量EB存在的条件下,各种不同密度的物质经离心平衡后得以分开。

其中蛋白质密度小(1.3g/cm3-1.4 g/cm3),浮于液面;RNA密度大(2.0 g/cm3),沉于管底;各种DNA密度介于蛋白质与RNA之间,处于中间。

过量EB处理前,细菌染色体DNA与不同分子构型的质粒DNA的密度均为1.7g/cm 左右,难以区分。

经过量EB处理后,不同分子构型的DNA与EB的结合能力不一样,因而密度下降不一致,可有效分离。

闭环质粒DNA为超螺旋三级结构,EB不易插入,结合量少,密度下降小,约为1.59 g/cm3。

染色体DNA、开环质粒DNA以及带切口的环状质粒DNA可以嵌入更多的EB,密度下降较多,约为1.54 g/cm3。

1.6 石英棉纯化法此方法适合于分离由几十个到300个左右碱基组成的DNA片段,也适合分离大于300个碱基的DNA片段。

可应用于PCR扩增的DNA片段的回收、DNA片段的分离、肽基因的分离、未知肽基因和小分子蛋白质基因及其相关研究,还适用于为增加表达效率而采取的基因串联表达所需的DNA片段的分离纯化工作。

1.7 磁性微粒纯化法磁性微粒纯化DNA的方法被称为固相可逆固定法(solid-phase reversible inlmobilization简称SPR),主要原理是在高浓度PEG-8000和盐存在下,DNA 会有选择性地结合至表面修饰有羧基的磁粒上,一旦结合,这种DNA-磁粒复合物可被数次清洗,之后用洗脱液将DNA洗脱下来便得到纯度很高的DNA。

基于磁性微粒的SPRI方法已被广泛用于从动植物、全血、PCR扩增产物甚至琼脂糖凝胶中制备和纯化各种类型的DNA。

得到的DNA可被用于测序、限制酶切等研究。

在磁性微粒种类的选择上可以由图1-1看出,羧基磁粒的纯化产量是最高的,金磁微粒和氨基磁粒次之。

在OD—OD280比值上羧基磁粒接近1.8,而氨基磁粒和金磁微粒的比值均远大于1.8,表明羧基磁粒所提取的DNA纯净,无蛋白质或RNA 的污染;而氨基磁粒和金磁微粒所纯化的DNA溶液中含有RNA的污染。

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