广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析
人巨细胞病毒UL145及UL13基因转录特点和转录本结构研究的开题报告
人巨细胞病毒UL145及UL13基因转录特点和转录本结构研究的开题报告一、研究背景与意义人巨细胞病毒(HCMV)是致病性强、传播广泛的β-疱疹病毒科病毒,可引起危害婴幼儿健康的先天性感染和免疫缺陷患者的致命性感染。
HCMV基因组由~230 kb的双链DNA构成,编码200余个基因,其中可能有50%以上的基因是具有未知功能的。
因此,对HCMV基因组中未知功能基因的研究,有助于深入理解HCMV的致病机制和生物学特性。
UL145和UL13是HCMV基因组中两个未知功能基因。
UL145编码的蛋白质是一个约22.6 kDa的蛋白质,其缺失型病毒与野生型病毒相比,病毒复制减缓,并且在感染初期病毒产量降低。
UL13编码的蛋白质是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,其缺失型病毒的病毒感染能力也会受到影响。
虽然UL145和UL13参与HCMV感染和复制过程中发挥了重要的生物学功能,但目前对这两个基因的具体转录特点和转录本结构等方面的研究还较少。
因此,开展UL145和UL13基因的转录特点和转录本结构研究,有助于进一步探究HCMV的基因调控机制,揭示HCMV感染的分子机理。
也为相关的抗病毒药物的研发提供科学基础。
二、研究内容及方法1. 研究内容(1)对UL145和UL13基因的转录起始位点(TSS)进行鉴定,并分析转录起始区域的启动子结构。
(2)使用普通PCR和实时PCR等技术,检测UL145和UL13基因的转录量,并分析不同细胞系和病毒株系中的转录水平差异。
(3)开展核糖核酸聚合酶(RNA polymerase)定点扫描分析,鉴定UL145和UL13基因可能的剪接变体。
2. 研究方法(1)应用反转录PCR(RT-PCR)和5’ RACE等技术鉴定UL145和UL13基因TSS及其启动子结构。
(2)利用普通PCR和实时PCR技术对不同类型的HCMV感染细胞中的UL145和UL13基因进行定量检测。
(3)开展RNA polymerase定点扫描分析,筛选UL145和UL13基因的可能剪接变体。
广州地区HCMV临床病毒株UL137基因的结构特征与多态性
20 0 8年 5月
广 州地 区 HC MV临床病 毒株 U 1 7基 因的结构 L3 特征与多态性
王 波 李月琴 胡兢 晶 苏海浩 何震宇 , , , , ,田传军 张纯青 , 叶铁真 , 周天鸿 , , ,
(1 广 东省 妇幼保健院儿科 , 东 F ' 10 0 . . 广 -H5 0 1 ;2 暨南大 学生命科学 院 , 东 广州 5 0 3 :  ̄ 广 16 2 3 广州 呼吸疾病研究 所国家重点实验 室 . 东 广州 5 0 2 ) . 广 11 0
C aa trzt n o ma tmeao i s( MV)U 3 n h rceiai f o Hu nCyo g lvr HC u L17Ge e
i Lo pa s g i i a s l t s i G u ng ho n w・ s a e Cl c lI o a e n a z u n
白的氨基酸序列极 为保守 , 但仍存在一定 多态性 。提示 H M L 3 R C V U 17O F可能是一个具有 重要 功能 的基 因。
关键词 : 人巨细胞病毒 ; 临床病 毒株 :低传代 ;U 17 L 3 ;基 因序 列 ;基因多态性
中图分类号 : 3 R7 文献标识 码 : A 文章编号 :6 2 3 5 (0 8 0 — 2 4 0 17 — 5 4 2 0 )3 0 6 — 6
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第2 9卷
第 3期
中 山 大学 学 报 ( 学科 学版 ) 医
J U N LO U A -E N V R IY( E IA CE C S O R A FS N Y TS N U I E ST M D C LS IN E )
Vo1 9 No. . 2 3 M a 20 v 08
人巨细胞病毒
流行病学和检测
流行病学和检测
HCMV在人群中感染非常普遍,在发达国家成年人HCMV抗体阳性率约为50%,我国则高达60%~80%。10%~15% 儿童在5岁之前初次感染 HCMV,5岁后感染的比例大幅下降。在成年人中感染比率逐年増加1%~2%,可能与带毒人 群密切接触和性接触有关。HCMV可从感染数月至几年患者的唾液、宫颈分泌物、精液、尿液和白细胞等分离获得。 先天性和围产期感染HCMV的婴儿排泄病毒的时间较长,35%感染者排泄病毒的时间可长达5年。研究表明,儿童在 幼儿园感染非常常见,并可传染给血清阴性的父母。
免疫性
对于免疫功能正常者,HCMV感染如果出现临床疾病症状,通常是由病毒原发感染引起,并伴有宫颈分泌物或 精液中存在病毒等表征。对免疫功能低下的患者,初始感染和再激活均可引发病症,而且由于HCMV感染单核细胞 导致细胞活性素乱,大大增加了患者并发真菌和细菌感染。此外,如果将HCMV潜伏感染的单核细胞与活化的T淋 巴细胞进行共培养,前者可被激活并分化成可产生感染性病毒的巨噬细胞。这种单核细胞与T细胞相互作用现象常 出现于输血或器官移植患者,表明在移植受体中,不仅存在HCMV传染的可能性,也存在潜伏病毒被重新激活的可 能性。
HCMV可感染血管内皮细胞和白细胞,并在内皮细胞中诱发典型的包涵体特征。在体外单核细胞感染实验中, 病毒井不能引起相应的细胞病理学现象,表明HCMV在单核细胞中增殖受限制,推测这类细胞可能是HCMV的潜伏感 染场所。HCMV可通过多种不同的机制诱发疾接造 成黏膜上皮细胞损伤可能是HCMV感染引起的肺炎的致病机制,但在动物模型上的实验表明,针对HCMV感染的免疫 应答引起的免疫损伤可能是HCMV引发肺炎的主要机制。与之相应的,肺组织HCMV滴度并不能反映肺炎的严重程 度。
人巨细胞病毒UL131A,UL130,UL128基因在先天感染患儿临床株中的变异
人巨细胞病毒UL131A,UL130,UL128基因在先天感染患儿临床株中的变异孙峥嵘;吉耀华;阮强;肖庚富;何蓉;齐莹;马艳萍【期刊名称】《武汉大学学报:理学版》【年(卷),期】2006(52)6【摘要】对18株临床低传代分离株和5株未传代的人巨细胞病毒(HCMV)临床标本分别进行HCMVUL131A,UL130,UL128基因全序列PCR扩增,并进行序列测定及分析.对23株HCMV临床株的UL131A,UL130,UL128基因编码区域进行比较,结果显示此3个基因核苷酸及其编码蛋白是高度保守的,3个基因的核苷酸同源性为96.2%,95.8%,96.0%,编码蛋白的同源性为97.2%,96.6%,96.9%.不同临床症状患儿的HCMVUL131A,UL130,UL128基因及其编码蛋白具有相似的结构.临床株HCMV UL130和UL128基因编码蛋白具有趋化因子的相似结构.所有结果表明临床株中的UL131A,UL130,UL128序列的保守性可能与HCMV在上皮细胞的增殖有关,也与HCMV转移到白细胞和树突状细胞相关.HCMV UL130和UL128基因编码蛋白具有趋化因子的相似结构可能与HCMV的感染相关.【总页数】6页(P783-788)【关键词】人巨细胞病毒;UL131A,UL130,128基因;多态性【作者】孙峥嵘;吉耀华;阮强;肖庚富;何蓉;齐莹;马艳萍【作者单位】中国医科大学附属第二医院病毒研究室;武汉大学生命科学学院【正文语种】中文【中图分类】Q939.4【相关文献】1.人巨细胞病毒UL132基因在先天感染患儿临床株中的变异研究 [J], 孙峥嵘;吉耀华;阮强;何蓉;齐莹;马艳萍;毛志芹;黄郁晶;王岳平2.人巨细胞病毒UL145基因在先天感染患儿临床株中的多态性研究 [J], 孙峥嵘;卢颖;阮强;吉耀华;何蓉;马艳萍;齐莹;毛志芹;黄郁晶3.伴不同gH基因型人巨细胞病毒感染的免疫性血小板减少症患儿临床特征研究[J], 张小同; 陈露燕4.人巨细胞病毒临床分离株感染血管内皮细胞伴肾素基因表达 [J], 程远;李多多;程计林;程新;刘宝玲;王海滨;金壮;张杰林;Crumpacker Clyde5.人巨细胞病毒UL147基因在婴儿巨细胞病毒肝炎临床株中的多态性 [J], 尹晓波;毛志芹;常淑婷;吉耀华;何蓉;齐莹;阮强;孙梅;马艳萍;孙峥嵘因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
人类巨细胞病毒的基因诊断
人类巨细胞病毒的基因诊断
【基本信息】
[简要描述]
·巨细胞病毒(CMV)属人疱疹病毒,直径为180-250nm,具有双链DNA。
人类巨细胞病毒(HCMV)又称人疱疹病毒5型,与人疱疹病毒6型、7型同属β疱疹病毒亚科,人是HCMV 的唯一宿主。
·检测人类巨细胞病毒DNA的意义在于早期诊断及采取治疗措施,评价抗病毒药物的疗效。
[其他名称]
HCMV-DNA
【测定方法及参考值范围】
·核酸杂交技术:阴性。
·PCR:<2×102copies/ml。
【结果及临床意义】
[阳性]
◇疾病因素
·CMV感染
注释:CMV可引起先天性和后天性多种感染,其先天感染的致畸性仅次于风疹病毒。
CMV可通过胎盘感染胎儿,引起早产、胎儿发育迟缓、新生儿畸形、黄疸、肝脾肿大、溶血性贫血、视网膜脉络膜炎等,新生儿死亡率高。
【样本准备与采集】
[样本类型]
核酸杂交技术用唾液、痰、咽拭子、支气管肺泡灌洗液、脑脊髓液、羊水、尿、白细胞;PCR用血液或末梢血白细胞。
【注意事项】
·PCR测定方法敏感,诊断宜慎重。
·HCMV的传播需要人与人的密切接触。
感染者通过尿液、唾液、精液、乳汁和子宫颈分泌物排出病毒。
尤其在孕妇、新生儿、器官移植、艾滋病等免疫力低下者中更易发生感染。
人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位的预测与分析
[ Ab s t r a c t ]
0b : j e e t i v e To i n v e s t i g a t e t h e B - c e l l e p i t o p e i n t h e UL1 4 8 g e n e o f h u ma n e y t o me g a l o v i r u s
Gu a n gz h o u 5 1 0 0 1 0 , Gu a n g d o n g Pr o v i n c e , C h i n a . ( C0 r r e s 0 g a u t h o r : W ANG Bo, Ema i l :
y u a n b i n wu wu @ 1 6 3 . c o m)
G a r n i e r — Os g u t h o r p e — R o b s o n ( G OR ) , 人工神经网络 预测法 ( HNN) 预 测二 级结 构 , 结合跨 膜结 构 、 Ho p p& Wo o d s 亲水性方案 、 E mi n i 可及性 方案 、 J a me s o n - Wo l f 抗原性方 案等参 数综合预 测 U L 1 4 8基 因 B 细 胞 表 位 。结 果 HC MV p UL l 4 8 氨基酸包含 3 1 6个 氨 基 酸 残 基 , 相对 分子质 量为 3 6 k D, 等电点 为 9 . 1 5 ; 应 用
Th e s e c o n d a r y s t r u c t u r e we r e a n a l y z e d b y t h e i mp r o v e d s e l f - o p t i mi z e d p r e d i c t i o n
高 , 极 有 可 能 是 B细胞 表位 。
人巨细胞病毒UL136编码蛋白相互作用蛋白的筛选和功能研究的开题报告
人巨细胞病毒UL136编码蛋白相互作用蛋白的筛选
和功能研究的开题报告
研究背景和意义:
人巨细胞病毒(HCMV)是一种广泛存在于全球人群中的病毒。
HCMV感染可以导致一系列疾病,包括先天性病毒感染、免疫抑制病毒感染等。
HCMV的复制和感染过程涉及到多个启动子、转录因子、蛋白质等分子的参与,这些分子相互作用复杂,除HCMV的主要调节蛋白质
UL138和UL136之外,许多HCMV蛋白质的功能和相互作用数量仍不清楚。
因此,对HCMV蛋白相互作用的深入研究有助于揭示HCMV复制和感染的分子机制。
研究方法:
本研究将采用酵母双杂交技术筛选和分析HCMV UL136编码蛋白相互作用的蛋白质,并通过多种技术手段验证其相互作用关系,并探究它们在HCMV复制和感染过程中的功能和机制。
预期结果:
本研究将可以从分子水平揭示HCMV UL136编码蛋白与其他蛋白的相互作用关系并阐明其在HCMV复制和感染过程中的作用和机制。
这对于深入了解HCMV的感染机制,为研究HCMV的治疗和免疫防御提供了新的参考和思路。
人巨细胞病毒UL135基因在临床低传代分离株中的
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·18·
中 国 医 科 大 学 学 报
第 35卷
1 材料与方法
1. 1 标本来源 29株 HCMV 临床分离株均来自 1988 - 1993年
(V irus Laboratory, The Second Affiliated Hosp ital, China Medical University, Shenyang 110004, China)
[ Abstract] O bjective: To investigate the polymorphism of human cytomegalovirus (HCMV ) UL135 gene in the low passage clinical isolates and to study the relationship between the polymorphism and diseases caused by congenital HCMV infection. M ethods: The en2 tire HCMV UL135 gene regions of 29 clinical isolates in which positive HCMV 2DNA was detected by using fluorescence quantitative pol2 ymerase chain reaction ( FQ 2PCR ) were amp lified by polymerase chain reaction ( PCR ). Amp lified PCR p roducts were sequenced, and the sequence were analyzed. Results: Of 29 isolates, 25 were amp lified successfully. The length of UL135 open reading frame (ORF) in these 25 clinical isolates was sim ilar to that of Toledo sequence. The nucleotide mutation rate of UL135 p rotein was 0. 1% to 2. 6%. Additional or deleted sites of posttranslational modification ofUL135 p rotein were found in all clinical isolates. Conclusion: A ll DNA and deduced am ino acid sequences of UL135 gene shared great sim ilarity among HCMV clinical isolates regardless of their polymor2 phism. No correlation was found between the polymorphism ofUL135 gene and the diseases caused by congenital HCMV infection. [ Key words] cytomegalovirus; UL135 gene; polymorphism
广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析
广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL136基因B细胞表位的多参数
·基础论著· 广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL136基因B细胞表位的多参数预测分析晏翠芳1 胡兢晶2 伍苑宾2 郭梦杰2 潘丽雯1 苏海浩2 戴津1 谭琪琪2 王波2【摘要】 目的 多参数预测广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL136基因B细胞表位。
方法应用改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR),人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构;应用隐马尔可夫模型(TMHMM)预测跨膜结构;应用Hopp&Woods亲水性方案、Emini可及性方案、Jameson-Wolf抗原性方案等参数综合预测UL136基因B细胞表位。
结果HCMV UL136氨基酸包含240个氨基酸残基,相对分子质量约为27.3 kD,等电点为8.26。
TMHMM预测UL136存在一个跨膜区域,为65~87aa区域,胞外区域为88~240aa区域。
多参数预测显示:亲水性位于18~29、46~61、94~100、110~144、152~169、171~186、190~202、229~236aa区域;表面可及性位于19~26、49~61、89~97、110~127、161~167、173~182、196~202、229~234aa区域;极性位于18~29、31~36、51~59、94~102、111~130、155~163、178~182aa区域;柔韧性位于18~28、46~60、115~142、148~156、160~205、226~236aa区域;抗原性位于4~9、16~32、45~62、92~101、106~144、150~157、160~206、228~240aa区域。
二级结构预测显示:以α-螺旋为主,无规则卷及β-转角区域主要位于5~10、45~61、108~113、129~139、163~182、187~192、195~204、229~234aa区域。
PRRSV广东变异株分离及NSP2部分序列分析
P RS 广东株 , 名为 B 2 本实 验 R V 命 L,
室从 广东某 猪场分离 。
1 .2 细 胞 与 茵 株 Ma k 4 细 胞 和 E. . .1 r15
自治 区, 成了巨大 的经济 损失[ ] 造 3 。我 国学 者研究
证实 ,0 6 以来 的高致病 性 P R V是 引起 “ 高 20 年 R S 猪 与 20 0 5年 以前 我 国流 行 的 P R V 经 典株 有 很 大 R S 区别 。致病性强 , 不仅使仔 猪发病 , 而且 使成 年猪发
为妊娠母 猪的繁殖 障碍 以及 各种年 龄猪 的呼吸 系统 毒 株 , 与经 典毒株相 比, 该毒株在 NS 2位点存在 2 P 4
全世界广泛 流行 , 国于 1 9 我 9 6年 由郭 宝清[ 首次 分 2 离到该 病 病 原 。 自从 2 0世 纪 8 O年 代 以来 , R S P R 几 乎 已经传播 到世 界上 所 有 养 猪 的 国家 , 成 持续 造 性 的经济损失 , 重危害世 界养猪 业的发展 。 严
DH5 a由本实 验室保存 。 1 1 3 试验 用动物 约 5周龄 三元 杂交猪 2头 , . . 试
热综合 征” 主要 病原 。此 高致 病 性 P R V 毒 株 验前 检测 P R V抗 体为阴性 。 的 R S R S
1 14 试 剂 R .. NA 纯化 试 剂 T z l eg ns为 RIo R a e t
动 物 医 学 进 展 -0 1 3 ( ) 2 —l 2 1 , 2 3 : 6 3
Pr g e s i e e i r e cn o r s n V t rna y M dii e
P RS 广 东 变 异 株 分 离 及 NS 2部 分 序 列 分 析 R V P
环介导等温扩增检测人巨细胞病毒的方法、检测用试剂盒和引物组[
专利名称:环介导等温扩增检测人巨细胞病毒的方法、检测用试剂盒和引物组
专利类型:发明专利
发明人:杨劲,吕杭军,孟忠华
申请号:CN201010183784.8
申请日:20100526
公开号:CN102260748A
公开日:
20111130
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:可快速、灵敏检测人巨细胞病毒的LAMP扩增用特异核酸引物组,包含扩增人巨细胞病毒基因UL122和US14特异碱基序列的正向内引物FIP、正向外引物F3、反向内引物BIP、反向外引物B3,以及第一环引物LF和/或第二环引物LB。
一种人巨细胞病毒的检测方法,以人巨细胞病毒的
UL122和US14基因核酸序列的一部分或其互补链为靶,通过LAMP法用所述的引物选择性扩增靶区域,确认是否存在扩增产物。
一种HCMV基因检测用试剂盒,包含所述正向内引物、反向内引物、正向外引物、反向外引物、第一环引物、第二环引物。
本发明适合检测人巨细胞病毒的UL122和US14基因。
申请人:浙江省血液中心
地址:310006 浙江省杭州市下城区武林路345号
国籍:CN
代理机构:浙江杭州金通专利事务所有限公司
代理人:梁寅春
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巨细胞病毒UL144对SD幼鼠肝细胞损害的分子机制
国 际 流 行 病 学 传 染 病 学 杂 志 2 0 2 1 年 6 月 第 4 8 卷 第 3 期 Inter J Epidemiol Infect Dis, June 2021,Vo病毒UL144对 SD幼鼠肝细胞损害的 好机制
温正旺1 陈益平1 任迪索2 胡玲珑2 石海矾1 陈洁1 ’温 州 医 科 大 学 附 属 第 二 医 院 育 英 儿 童 医 院 儿 童 感 染 科 ,浙 江 温 州 3 2 5 0 0 0 ; 2 温州医科大学仁 济 学 院 ,浙 江 温 州 325000 通 信 作 者 :陈 洁 ,Email :henryxyf@
【关 键 词 】 巨 细 胞 病 毒 ;T o ll样 受 体 4 ; 肝 细 胞 ;凋亡 基 金 项 目 :温 州 市 科 技 局 课 题 (Y20180002、Y20180003、Y20190213) DOI: 10.3760/331340-20200701-00214
The damage of cytomegalovirus UL144 to mouse hepatocytes and its molecular mechanism Wen Zhengu^ang1, Chen Yiping1, Ren Disuo2, HuLinglong2, ShiHaifan1, Chenjie1 'Department o f Infectious Diseases, the Second Affiliated Hospital o f Wenzhou Medical University, Wenzhou 325000, Zhejiang, China;2Renji College of Wenzhou Medical University, Wenzhou 325000, Zhejiang, China Corresponding author: Chen Jie, Email :henryxyf@
多参数预测人巨细胞病毒临床病毒株UL145基因B细胞表位
多参数预测人巨细胞病毒临床病毒株UL145基因B细胞表位作者:伍苑宾胡兢晶王波苏海浩谭琪琪来源:《中国现代医生》2020年第35期[摘要] 目的应用多参数预测及分析人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)临床病毒株UL145基因B细胞表位。
方法根据人巨细胞病毒UL145基因氨基酸序列预测其二级结构,结合跨膜结构、亲水性、可及性及抗原性方案等参数综合预测UL145基因B细胞表位。
结果 HCMV pUL145氨基酸等电点为6.64,二级结构以无规则卷为主,1~130位氨基酸均为膜外区域,结合多种预测方法分析提示,88~99位氨基酸序列内可作为HCMV UL145基因的B细胞候选表位。
结论多参数预测提示88~99位氨基酸序列为HCMV UL145基因B细胞表位预测序列,为进一步制备相应的抗体提供了重要依据。
[关键词] 人巨细胞病毒;UL145;B细胞表位;生物信息学分析[中图分类号] R39;R71 [文献标识码] A [文章编号] 1673-9701(2020)35-0027-04[Abstract] Objective To predict and analyze B cell epitope of UL145 gene of human cytomegalovirus (HCMV) clinical strain by using multi-parameter method. Methods According to the amino acid sequence of HCMV UL145 gene, the secondary structure was predicted. Combined with transmembrane structure, hydrophilicity, accessibility, antigenicity scheme and other parameters, the B cell epitope of UL145 gene was predicted comprehensively. Results The amino acid isoelectric point of HCMV pUL145 was 6.64, the secondary structure was dominated by random curling, and amino acids 1-130 were all extra-membranous regions. Combined with various prediction methods, it was suggested that amino acid sequences at positions 88-99 could be used as B cell candidate epitopes of HCMV UL145 gene. Conclusion Multi-parameter prediction indicates that the amino acid sequences at positions 88-99 are predicted sequences of B cell epitopes of HCMV UL145 gene, which provide an important basis for further preparation of corresponding antibodies.[Key words] Human cytomegalovirus; UL145; B cell epitope; Bioinformatics analysis人巨細胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)属疱疹病毒β亚科,为双链DNA病毒,在多数人群中为隐性感染或潜伏感染,但在新生婴儿、免疫低下或抑制的人群中可引起症状性感染,可导致较高的死亡率[1]。
巨细胞病毒感染的细胞微丝骨架重组异常
巨细胞病毒感染的细胞微丝骨架重组异常【摘要】本研究探讨巨细胞病毒(CMV)感染对人胚成纤维细胞(HF)微丝骨架影响及与病毒复制状态的可能关系。
用显微镜观察细胞形态,采用RT-PCR检测β-actin 表达,Western-blot检测胞内肌动蛋白质含量,间接免疫荧光标记病毒即刻早期抗原(IE)与微丝骨架探针观察HF细胞内感染状况及微丝骨架变化。
结果表明: CMV 感染率大于95%,IE抗原主要位于胞核。
受染细胞变粗、变圆,甚至脱壁,呈时间依赖性。
感染后72、96小时,受染细胞内β-actin表达呈渐进性下调,差异显著(P<0.05);96小时后胞内β-actin 含量则为未感染组的(74.2±13.4)%,差异显著(P<0.05)。
受染细胞内微丝排列紊乱,极性消失;细胞融合,荧光强度明显减弱。
结论: CMV引起细胞内肌动蛋白质、微丝骨架形态及重组异常可能有助于其侵袭宿主细胞并进一步活化及复制。
【关键词】巨细胞病毒;人胚成纤维细胞;β肌动蛋白;微丝Impaired Microfilament Cytoskeletal Rearrangement in Cytome-galovirus Infected CellsAbstract The objective of this study was to investigate the effect of cytomegalovirus (CMV) infection on actin and microfilament in human embryo fibroblast cells(HF) and toexplore the possible relationship with CMV replication. The cell shape was observed by microscopy after the infection of CMV,RT-PCR assay was used to detect the mRNA expression of β-actin gene,while Westen-blot was used to measure the level of β-actin protein. CMV immediately early antigen (IE) in HF cells was analyzed by indirect immunofluorescence assay. Microfilament alteration was determined by cytoskeleton fluorescence probe. The results showed that CMV IE was observed in more than 95% of HF cells after infection,primarily located in nucleus. HF cells infected by CMV changed from thin shuttle shape to round and thick ball shape,even detached from wall.β-actin got a significant and gradual decreasing of mRNA level in time-dependent manner (P<0.05). Compared with uninfected group,the expression of β-actin protein decreased to (74.2±13.4)% at 96 hours after infection (P<0.05). In infected HF cells,microfilaments were ruptured,arranged turbulently,as well as cells merged and fluorescence density of microfilament obviously reduced. It is concluded that cytomegalovirus can induce alteration of actin and microfilament,which may be helpful for CMV to infect,replicate and reactivate in host cells.Key words cytomegalovirus; human embryo fibroblast cell; β-actin; microfilament人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,CMV)属于疱疹病毒家族成员之一,是机会性致病原体。
HMA-SSCP方法研究人类巨细胞病毒UL144基因在临床低传代分离株中的多态性
HMA-SSCP方法研究人类巨细胞病毒UL144基因在临床低传代分离株中的多态性何蓉;阮强;刘兰青;吕绳敏;吉耀华;刘庆;陈淑荣;赵丽华【期刊名称】《中华实验和临床病毒学杂志》【年(卷),期】2006(020)001【摘要】目的探讨人类巨细胞病毒(HCMV)UL144序列在临床患儿低传代分离株中的多态性及与临床疾病的关系.方法对65株HCMV临床低传代分离株及7例同年龄组HCMV-DNA定量PCR方法检测阳性无症状感染儿尿液进行HCMV-UL144 PCR扩增及HMA-SSCP分析,并对其中32份阳性标本进行测序.结果65株分离株中有55株UL144全序列引物PCR扩增阳性,7份QPCR检测HCMV-DNA阳性无症状感染儿尿液中5份UL144全序列引物PCR扩增阳性.60份UL144扩增阳性标本HMA-SSCP(异源双链泳动及单链构象多态分析)呈现3种典型带形,巨结肠患儿分离株序列、小头畸形患儿的序列分布以1型为主,巨结肠患儿分离株序列没有2型,黄疸患儿以3型为主.结论HCMV-UL144广泛存在于临床低传代分离株中,用HMA-SSCP检测HCMV-UL144基因在临床低传代分离株中的多态性是一种可行的方法.HCMV不同疾病类型的HCMV-UL144序列不同,提示UL144基因可能对HCMV致病性起一定作用.【总页数】3页(P20-22)【作者】何蓉;阮强;刘兰青;吕绳敏;吉耀华;刘庆;陈淑荣;赵丽华【作者单位】110004,辽宁省沈阳,中国医科大学附属第二临床医院病毒研究室;110004,辽宁省沈阳,中国医科大学附属第二临床医院病毒研究室;110004,辽宁省沈阳,中国医科大学附属第二临床医院病毒研究室;110004,辽宁省沈阳,中国医科大学附属第二临床医院病毒研究室;110004,辽宁省沈阳,中国医科大学附属第二临床医院病毒研究室;110004,辽宁省沈阳,中国医科大学附属第二临床医院病毒研究室;110004,辽宁省沈阳,中国医科大学附属第二临床医院病毒研究室;110004,辽宁省沈阳,中国医科大学附属第二临床医院病毒研究室【正文语种】中文【中图分类】R3【相关文献】1.人巨细胞病毒UL140基因在临床低传代分离株中的多态性研究2.人巨细胞病毒UL135基因在临床低传代分离株中的多态性研究3.人巨细胞病毒UL137基因在临床低传代分离株中的多态性研究4.人巨细胞病毒UL138基因在临床低传代分离株中的多态性研究5.人类巨细胞病毒UL147基因在临床低传代分离株中的多态性因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
人巨细胞病毒US31基因序列特征分析及B细胞表位预测
人巨细胞病毒US31基因序列特征分析及B细胞表位预测郭刚强;谢尙丹;叶思思;孙祥威;张良;张丽芳;薛向阳【期刊名称】《温州医学院学报》【年(卷),期】2016(046)011【摘要】Objective: To analyze the sequence of human cytomegalovirus US31 gene and predict the B cell epitopes of US31 protein.Methods: The hydrophilicity, accessibility, antigenicity and lfexibility index were used to predict the potential B cell epitopes of protein based on the US31 amino acid sequence.Results: Most amino acid sequence of US31 was highly conserved while only a few strains had variation, and most of them were sense mutation. HCMV pUS31 contained 162 amino acid residues, the relative molecular mass was 20 kD and the isoelectric point was 7.66. It’s a soluble protein and its secondary structure occurred more frequently as random coil region. The predicted B-cell epitopes of the pUS31 might exist at N-terminal of amino acid se-quence: 5~19, 32~47, 58~68,110~124.Conclusion: The B-epitopes of pUS31 are predicted successfully, which provides a theoretic basis for the further study of protein characteristics, development of epitopes based vaccine, and preparation of monoclonal antibody against fusion protein.%目的:分析人巨细胞病毒(HCMV)US31基因序列,预测US31基因编码蛋白的B细胞优势表位。
人腱细胞Smad2、Smad4基因MH2结构域的克隆和序列鉴定
人腱细胞Smad2、Smad4基因MH2结构域的克隆和序列鉴定王尉;朴英杰;娄莉;鲍永耀【期刊名称】《南方医科大学学报》【年(卷),期】2001(021)003【摘要】目的从人腱细胞内克隆转化生长因子-β特异的细胞内信号转导基因Smad2、4的功能性结构域-MH2结构域.方法原代培养人腱细胞,从培养的细胞中提取总RNA,逆转录合成单链cDNA;设计引物进行PCR,扩增Smad2、4基因MH2结构域的基因片段,将其定向插入pGEM-T载体,转化大肠杆菌DH5α.挑选阳性克隆并进行核苷酸序列测定分析.结果测序结果与Genebank中克隆的基因序列完全一致.结论从人腱细胞中克隆成功Smad2、4基因的MH2结构域,证实了Smad2、4基因在人腱细胞中的表达;提示人腱细胞内存在SMAD2、4信号转导途径,TGF-β对人腱细胞分化的调节可能是通过SMAD2、4信号转导途径实现的.【总页数】4页(P161-164)【作者】王尉;朴英杰;娄莉;鲍永耀【作者单位】第一军医大学;第一军医大学;第一军医大学;第一军医大学【正文语种】中文【中图分类】R394-33【相关文献】1.人淋巴细胞免疫反应性生长激素基因调控序列的克隆与鉴定 [J], 王辉;邓洁英;郑德先;史轶蘩2.异基因造血干细胞移植后人巨细胞病毒感染临床毒株UL54基因的克隆及序列分析 [J], 田传军;李月琴;王波;叶铁真;张纯青;苏运贞;何华坤;周天鸿3.人牙乳头细胞Smad1基因MH2结构域的cDNA的分子克隆 [J], 何文喜;牛忠英;赵守亮;陈健4.人牙髓细胞Smad2基因MH2结构域的cDNA 克隆和序列测定 [J], 陈健;牛忠英;药立波5.淡色库蚊细胞色素P450基因的克隆、序列分析及表达差异的鉴定 [J], 公茂庆;顾燕;胡小邦;孙艳;李秀兰;马磊;孙立新;孙静;钱瑾;朱昌亮因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
巨细胞病毒感染患儿异型淋巴细胞的临床检验分析
巨细胞病毒感染患儿异型淋巴细胞的临床检验分析摘要】目的:分析巨细胞病毒感染患者异型淋巴细胞的临床检验效果。
方法:随机从2017年3月-2019年2月收治的巨细胞病毒感染患儿中抽取27例纳入到研究组,另选取同时期到我院体检健康者27例纳入对照组,均接受异型淋巴细胞检查,分析比较检验结果。
结果:研究组异型淋巴细胞显著高于对照组(P<0.05),高滴度巨细胞病毒异型淋巴细胞比低滴度巨细胞病毒异型淋巴细胞,差异不显著(P>0.05)。
结论:巨细胞病毒患儿发病后,异型淋巴细胞指标增高,但与巨细胞病毒滴度无关系。
【关键词】巨细胞病毒;异型;淋巴细胞;检验【中图分类号】R446 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752(2019)28-0112-01巨细胞病毒感染为性传播疾病,医学将巨细胞病毒也称为DNA病毒。
人体感染巨细胞病毒后,主要病变表现为感染细胞体积显著增大,细胞质内、细胞核内发生嗜碱性、嗜酸性包涵体[1]。
世界范围中均存在巨细胞病毒感染,人体为此类疾病的唯一宿主。
不同经济状况的地区,其感染率也存在差异。
成年人感染巨细胞病毒与机体自身免疫功能存在密切关系。
近年来,有研究报告指出,机体异型淋巴细胞水平与巨细胞病毒负载量存在密切关系。
做常规血片观察时,感染巨细胞病毒者,其体内异型淋巴细胞指标明显增高。
为此,本研究共纳入27例巨细胞病毒患儿和27例健康者对比讨论此点。
1.资料及方法1.1 一般资料27例巨细胞病毒患儿(研究组)和27例健康者(对照组),均为2017年3月-2019年2月到院诊治。
研究组:男性15例,女性12例,年龄2~10岁,平均为(6.3±0.2)岁;对照组:男性16例,女性11例,年龄3~10岁,平均为(6.5±0.5)岁。
患儿一般资料差异不显著(P>0.05)。
1.2 方法两组研讨对象均接受异型淋巴细胞检测。
抽取其静脉血液5mL,并将其制备为血片,用瑞姫氏进行染色处理,用显微镜做分类,由我院检验科2名专业的医生负责检验异型淋巴细胞。
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infection using m ultiple polym erase chain reaction (PCR).and the w hole sequence of ULj 42 gene w as cloned into pM D 1 8一T vector and am plified, the sequencing results were subm itted to G enBank, and U I ,142 gene of the other 10 HCM V isolates in the GenBank were compared and analyzed together. Results TW0 HCM V clinicalisolates were successfully isolated from the urine sample of children with symptomatic HCM V infection in Guangzhou,named for HCM V D3 and D2. The GenBank included them after cloning and were DQ180370 and DQ180384. H om ology com parison analysis showed UL1 42 gene sequences w ere m ore conservative,there w ere 6 9 base m utations.and all these 6 9 base m utations w ere base substitutions ,and no insertion and deletion
[Abstract] Objective To detect ULj 42 gene sequence characteristics of the clinical low passage hum an cytomegalovirus (H CM V) isolates in Guangzhou. Methods From M arch 20 1 4 to December 2015 at the Guangzhou M edical University Affiliated pediatric clinic of Guangdong women and children S Hospital of 1 0 cases of symptomatic HCM V infection in children with urine samples as the research object. Identify virus strains isolated from urine samples of children with symptomatic H CM V
Chin J Obstet Gyneeol Pediatr(Electron Ed),December 2016,Vot.12,No.6
论 著 ·
广 州 地 区人 巨细胞 病 毒 临床 低 传 代 病 毒株 UL1 42基 因 的序 列 特 征 分 析
郭 梦杰 胡兢 晶 王 波 苏 海浩 伍 苑宾 蔡 丽君 谭琪 琪
【关 键 词 】 巨 细 胞 病 毒 ; 临 床低 传 代 病 毒 株 ; UL142; 序 列 分 析
Sequence analysis of ULI42 gene of human cytomegalovirus virus strain in Guangzhou Guo M engjie, H“ J gJing, Wang Bo, Su Haihao, V Yuanbin, Cai Lijun, T Qiqi. Department of Pediatrics, Guangdong M aternal and Child H ealth H ospital, Guangzhou 5 1 1442, Guangdong Province, China Corresponding author:W ang Bo,Email:dr.wangbo@ 163.corn