PubMed-中文使用手册

P u b M e d使用手冊
PubMed 使用手冊
PubMed為National Library of Medicine (NLM) 之National Center for Biotechnology Information (NCBI) 所研發製作之醫學相關文獻資料庫，免費提供外界查詢使用。

◆Coverage:
1.MEDLINE:
mid-1960’s
15 million citations, 4,800 biomedical journals
70+ countries
English-language sources or abstract in English
2.OLDMEDLINE
1950-1965
2million citations
no MeSH index and abstract
3.In Process Citations
在收錄MEDLINE資料庫前的基本書目資料，為日更新(Tuesday through Saturday) 而且顯
示註記[PubMed - in process]. 新增資料加上MeSH terms, publication types, GenBank
Accession numbers等相關資料後顯示註記[PubMed - indexed for MEDLINE].
4.Publisher-Supplied Citations
出版社提供PubMed電子書目資料註記[PubMed - as supplied by publisher]，新出版社提供資
料更新從星期二至星期六，多數資料處理過程從"in-process" 到後來的"indexed for
MEDLINE"。

然而沒有做索引的書目資料將維持註記[PubMed - as supplied by publisher] or
[PubMed]。

◆PubMed檢索功能
1.關鍵字：可使用AND, OR, NOT (需大寫)
2.作者：
∙Enter the author’s name in the format of last name followed by initials. Omit punctuation. 如Simth ja
∙如要停止系統做自動作切截查詢，可輸入雙引號和作者欄位名稱，e.g., "smith j"
[au]
3.期刊名：有下列方式
∙full journal title (e.g., molecular biology of the cell)
∙title abbreviation (e.g., mol biol cell)
∙ISSN number, a standardized international code (e.g., 1059-1524)
4.片語：PubMed自動將檢索詞對照MESH主題表，如需直接以phrase查詢，用雙引
號註明。

∙Enclose the phrase in double quotes: “kidney allograft”
∙Use a search tag: kidney allograft[tw]
∙Use a hyphen: SARS-CoV
∙Truncate: kidney allograft*
5.切截Truncate：在字根後輸入星號，eg. Flavor*。

如結果超過六百個變化字，系統將
出現警示語。

Search Result
∙Display 有Summary, Brief, Abstract, MEDLINE….等格式，如批次轉入DDS，需為Summary格式。

如要轉入EndNote/RM，需為MEDLINE格式。

∙Show螢幕顯示筆數可設定5, 10, 20, 100, 200, 500筆
∙Sort by可以Author, Journal, Publication Date作排序
∙Send to 可選擇Text, File, Clipboard, E-mail, RSS Feed, Order。

以RSS為例，勾選檢索結果的紀錄後，選擇Send to RSS Feed，再按下Create Feed：
點選XML之後產生新視窗，將其URL加入RSS閱讀器內，便可隨時由RSS
Reader (如: Mxie) 收到最新資料。

另一種方式為設定My NCBI，將以e-mail寄送最新資料。

其設定方式在最後一個章節介紹。

∙Citation Filter, 檢索結果自動產生All和Review文章兩種結果。

除了Review文章外，可由My NCBI自訂filters，亦將在My NCBI介紹設定方式。

∙每篇紀錄之圖示
無摘要/有摘要，如本院有訂購此電子期刊，在IP範圍內可閱讀全文。

本院電子期刊清單詳圖書館網頁。

(橘色) PubMed Central, is a free digital archive of full-text journal articles maintained by NIH
(綠色) Free from publisher
∙Related Articles依據該筆記錄Title, Abstract, MESH欄位搜尋相關文獻。

∙Links依據該筆記錄連結至其他資源，如：
Cited Articles 參考文獻
Cited in PMC
Free in PMC
Books 電子書
LinkOut: publishers, aggregators, libraries, biological databases, sequence centers等。

Feature Bar工具列介紹
1.Limitation
可作欄位、資料類型、年齡、語言、人類或動物、子類目Subset、性別及日期的限
制查詢。

2.Preview/Index
輸入檢索詞後按Preview顯示檢索筆數，可用來調整檢索策略進行AND, OR, NOT
查詢。

或者按Index 顯示索引典和資料筆數，可term按住CTRL選擇多個，再點選
AND, OR, NOT作查詢。

在此只顯示最近三筆檢索策略。

3.History
顯示檢索歷史，但只保存八小時，可再用布林邏輯作檢索策略整合查詢。

e.g., #2 AND #6
4.Clipboard
從PubMed檢索結果勾選需要的紀錄，在Send to欄位選擇Clipboard存放在暫存區，所選擇的筆數將轉為綠色號碼，最多可存500筆記錄，可保留八個小時。

另外，Clipboard的書目編號訂為#0, 可再和其他檢索策略作布林邏輯查詢
5.Detail要查驗檢索詞的執行情況，可選擇“Details”鍵。

可進行編輯檢索策略或按URL
產生網頁加入「我的最愛」。

備註：如果用History功能#1 AND #2執行檢索者，無法產生URL。

◆PubMed Services
⏹Journal Database，查詢該期刊的資訊：全名、簡稱、ISSN。

⏹MESH (Medical Subject Headings)是MEDLINE的控制詞彙索引典，提供詞彙的層級
關係，做更有效的檢索。

如以AIDS查看MESH，其Display格式中的PubMed Link 可連至PubMed以該term檢索，如勾選多個標題彼此以OR關係做查詢。

每個標題右側的Links 包括下列連結：
∙PubMed –連至PubMed查詢MeSH term
∙Clinical Queries –連至the Clinical Queries query box
∙NLM MeSH Browser –連至
在Send to 欄位中，Search Box功能提供標題的布林邏輯檢索
1.選擇Full Display，勾選MeSH 標題及其副標題
2.使用Send to pull-down menu選擇Search Box with AND, OR, NOT 作查詢
3.可再查詢其他MeSH term, 加入Search Box
4.完成後點選Search PubMed
Single Citation Matcher單筆引文查詢: 可利用journal 、date、volume、issue …來查
該篇文章的資料
點選Go之後出現該篇文章
Batch Citation Matcher批次引文查詢，輸入100筆之記錄以取得該文獻之PMID號
碼。

資料輸入特定格式的順序依次為:
|Journal_Title|year|volume|first_page|Author_Name|Your_key|
再以PMID號碼輸入PubMed檢索欄內，獲得該筆記錄資料。

如果該篇紀錄無法找到，將顯示下列三種情況：
∙INV ALID_JOURNAL 期刊縮寫不正確
∙NOT_FOUND 有效的期刊名，但其他資訊錯誤
∙AMBIGUOUS 所提供資訊查到超過一篇紀錄
Clinical Queries包括三類
(1)Search by Clinical Study Category: 限制在特殊方法上的臨床文獻，可設定查詢
範圍較廣或較小。

如查詢囊胞性纖維症診斷的研究research on diagnosing
cystic fibrosis
(2)Finding Systematic Reviews: 查詢系統化評論文獻，包括下列主題之生醫文獻：o systematic reviews
o meta-analyses
o reviews of clinical trials
o evidence-based medicine
o consensus development conferences
o guidelines
o citations from journals specializing in clinical review studies
如查詢Systematic Reviews on inhalation therapy for pneumonia 肺炎吸入療法
(3)Medical Genetics Searches, developed in conjunction with the staff of
GeneReviews: Genetic Disease Online Reviews at GeneTests, University of
Washington, Seattle.作遺傳基因學方面不同主題查詢，如查詢genetic counseling
for sickle cell anemia鐮狀細胞性貧血的相關資料
⏹Special Queries 提供PubMed各種特殊主題限制查詢
⏹LinkOut is a feature of Entrez that is designed to provide users with links from PubMed
and other Entrez databases to a wide variety of relevant web-accessible online resources, including full-text publications, biological databases, consumer health information,
research tools, and more.
⏹My NCBI 可執行下列功能：
(1)Save searches
(2)Set up e-mail alerts for new content
(3)Display links to Web resources (LinkOut)
(4)Choose filters that group search results
必須先註冊User Name (3-10 alpha-numeric characters) and a Password (6-8
alpha-numeric characters).
Save searches
註冊進入My NCBI後執行檢索，在欄位右邊點選Save Search，將詢問是否要收
到email update
Filter
先選擇資料庫PubMed:
(1)Quick Pick list of commonly-requested filters
(2)Browse to browse filters and LinkOut providers by category.
(3)Search to search the filter and LinkOut provider names and descriptions. 例如查詢
台灣所提供的連結
(4)My Selections to see a list of your current filter and LinkOut provider icon settings
設定完成後檢索PubMed便可看到所設定的filter頁籤。

Outside Tool
Outside Tool allows institutions to display an icon link back to their institution on the Abstract and Citation format for all PubMed citations. The icon link is the base URL provided by the institution and the PMID of the citation. 機構的SFX連結可再檢索結果詳細紀錄內顯示
Outside Tool
User Preference
∙更改檢索結果格式
∙更改e-mail address 設定
∙Highlight PubMed search words in your retrieval 必須設定才能從檢索結果看到所查詢的字。