宏基因组测序技术
合集下载
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
宏基因组测序技术
宏基因组测序技术(MGST)是指对环境或生态系统样品中所有微生物的基因组进行混
合测序。
与传统微生物组学研究方法不同,该技术不需要分离和培养微生物,可以将整个
生态系统中全部微生物的基因组信息同时得到,包括细菌、真菌、古菌以及病毒等。
MGST可以广泛应用于环境、农业、医学、食品安全等领域的研究。
在环境领域,可以通过MGST研究不同环境系统的微生物多样性、生态功能和生态系统变化等。
在农业领域,该技术可用于评估土壤微生物群落结构和功能,为农业生产提供参考。
在医学领域,MGST
可用于研究人和动物体内微生物群落的变化、病原微生物的筛选及预防与治疗。
MGST的技术流程包括:
1. DNA提取:将样本中微生物的总DNA提取出来。
2.文库构建:基于高通量测序技术对DNA样本进行文库构建,其中包括搭建文库、分
离目标DNA片段、连接DNA适配体、PCR扩增等步骤。
3. 测序:对文库样品进行测序,可以使用Illumina、PacBio、Oxford Nanopore等
先进测序平台。
4. 数据处理与分析:通过对测序数据进行质量控制、序列拼接、聚类分析、物种注
释等处理与分析,得到微生物群落多样性和功能的分布情况。
随着技术的发展,MGST的应用范围将进一步扩大,为自然界和人类社会带来更多的福利。