规模化猪场大肠杆菌、沙门氏菌耐药性检测与分析
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
中国农业大学硕士学位论文结果与分析
结果与分析
1大肠杆菌、沙门氏菌分离鉴定
1.1生化鉴定
从冬季、春季和夏季的326份猪粪便中分离鉴定出大肠杆菌136株,沙门氏菌62株(表1)。
其中冬季大肠杆菌19株,沙门氏菌6株,分离率分别为2113%和8%。
春季大肠杆菌75株。
沙门氏菌16株.分离率分别为56.8%和12.1%。
夏季大肠杆菌42株、沙门氏菌加株。
分离率分别为35.3%和33.6%。
表1冬、毒、夏三季大脯杆菌、涉门氏菌分离
TablelIsolationofE,collandSa/moneHainwinter,神gandⅫmmcr
墨壁堕婴墨登熊墼盔堕堑堕墼盐圈垦堇塑
2004.1275196
2005.41327516
2005.71194240
总计32613662
1.2大肠杆菌、沙门氏菌血清型鉴定
囤1丈脑杆酶血清型分布
FigurelDistrilmtloaofsemtypes吐最∞“isolates商n9140·antlsera用14种大肠杆菌O单价抗血清08、09、093、0131、0149、0101、0139、0157、018、064、0107、020、0141和060对136株大肠杆菌进行血请型鉴定。
结果(表2、表3和表4)表明定型大肠杆菌76株,分属12种血清型,占分离菌株的55.9%。
其中0141、018、0107、020,90131为优势血清型(图1),占定型株的76.3%;14株有自凝现象,占10.3%;未定型分离株46株,占33.8%。
冬季鉴定出4种大肠杆菌血清型,优势血清型是0141,占该季定型株的60%。
春季鉴定出9种血清型,DA018和020为优势血清型,占该季定型株的38.9%和22.2%;08和0157Y,j该季独有的血清型。
图2大肠杆菌肠毒素基因琼脂糖凝胶电泳
M:l舶bpmarker,肠毒索基因:J舻,训和st2;N:阴性对照
Figum2Ageresegelelectrnphoresisofcntcrotoxingeneproducts
M:100bpmarker;enterotoxingenes:细,st/andst2;N:negativecomrol
3大肠杆菌、沙门氏菌耐药性分析
3.1大肠杆菌耐药性分析
采用微量肉汤稀释法分析不同季节136株大肠杆菌分离株的耐药性。
药敏试验结果(图3、图4-1、图4-2)表明大肠杆菌分离株最少的同时耐4种抗生素,最多的同时耐18种抗生素,分别占大肠杆菌分离株的2.2%和0.7%,同时耐10种以上(包括10种)抗生素的大肠杆菌占51.3%。
不同季节耐药谱组成不同。
冬季人肠杆菌19株共有9种耐药谱,最少的同时耐7种抗生素,最多的可同时耐16种抗生素,分别占冬季分离株的5.2%和15.8%;同时耐10种以上抗生素的分离株14株,占73.7%。
春季人肠杆菌75株共有15种耐药谱,最少的同时耐4种抗生素,最多同时耐18种抗生素,均占春季分离株的1.3%;有26株同时耐10种以上抗生素,占34.7%。
夏季大肠杆菌42株,共有14种耐药谱,最少同时耐4种药,最多同时耐17种药,分别占2.4%和4.8%;33株为10耐以上菌株,占78.6%。
图3大肠杆菌分离株对20种抗生素的耐药谱
R表示耐药
3Antimicrobialresistancepatterninl36E.co//isolates
Figure
R:Resistance
图4-1不同季节大肠杆菌分离株对20种抗生素的耐药谱
R袭示耐药
sP.asom
Figme4·lAntimicrobialresistancepatternin136E.coliisolatesofdiffereat
R:Resistance
图4.2不同季节大肠杆菌分离株对20种抗生素的耐药谱
R表示耐药
Figure4·2Anfimicrobialresistancepatterninl36E.coliisolatesofdifferentsf,asons
R:ResistIuflge
大肠杆菌分离株对土霉素、四环素、磺胺嘧啶、金霉素、强力霉素和阿莫西林耐药率依次为99.O%,99.O%,98%,92.4%,89.4%和87.9%(图6)。
所有大肠杆菌分离株都对头孢曲松敏感。
其他抗生素的耐药率在从4.4%N64.7%左右(图6)。
冬季分离株对土霉素、四环素和磺胺嘧啶完全耐药,春季分离株对士霉素和四环素完全耐药(图5-1、图5.2)。
冬季分离株对安普霉素、环丙沙星、多粘菌素E、恩诺沙星、新霉素、诺氟沙星、氧氟沙星、沙拉沙星和链霉素比春季和夏季分离株耐药率高。
田5-t不同季节大肠杆菌分离株对20种抗生素的耐药率
^MO;阿莫西林APR:安瞢霉素cEn头孢曲松CHL金霉素c口t环丙沙星DⅡ:二氟抄星COLI多牯菌素DOX,强力霉紊ENRt
愚诺沙星FLO,氟苯尼考
Figure5—1AntimicrobialresistanceofEcoliisolatesofdifferentscasoP,st020drags
AMO'.Ar加■oilth,,A]PR:^一Ⅱ岫,c卧:o师抽m~cm二ffah:xtetmcydinc,(邛:ci即Ⅱ嵋-m,DIF:Di/lonci-,COL:Colisli“DOx:
Doxycyefine.日蛆:Emofloxacin.FLO:FIorfenicol
图5_2不同季节大肠杆菌分离株对20种抗生素的耐药率
0BNt庆太霉素K^Nt卡郅霉素NEO:斯I翥NOR:诺氟抄星OFL:氧氟涉星OXY:土霉素
s^鼬涉拉涉星sTR一链霉素SULz磺胺嘧嚏m四环素
Fi邸"5·2AntimicrobialresistanceofEcoilisolatesofdifferentscssonst020drugs
GEN:C-entamycin,l£^N:K“lamycin,NBO:Neomycin.NOR:Norfloxacin。
0FL:Ofloxacin,O)ftOxWetracycfine,SAR:Sarafloxacin,弧:StzeptomyciA,SOL:Sulfadiazine.唧:ntracycline
中国农业大学硕士学位论文结果与分析
图6大肠杆菌分离株对20种抗生素的耐药率
AMO;阿真西林APR:安普霉素四:头孢曲梧CHL,盘霉素CIP;环丙沙星DIF:二氟沙星COLz多牯菌素DOx:强力霉素ENm恩诺沙星FLO:氟雀佗考0ENt庆人罐寨KAN;卡那辫素NEOi新撵臻NOR:嘴氟沙蚺OFL·轼氟涉蛀OXY:上霉素SAR:沙批沙址sTR:链蝣崇
SULt磺胺嘧嚏1t丌;四环素
Figurc6AntimicTobjal他sist粕∞ofEcoliisolarcsto20drugs
AMO:Amoxicifli,.APR:Apramycin,(】三F:ccmia柚n‘CHL:Clflotletracyclinte,Cm:Cipmfloxacin.DIF:Difloxac:in,COL:Colisdn,DOX:Doxycycli吐.
ENR:Enrofloxlcin.FLO;norfenkolGEN:Gentamycln,KAY:Kanmycia.NE0:Neomycin,NOR::Nmfloxaeln.OFL:Ofloxacin,OXY:Oxytetracycllne,SAR:Sarafloxacin,STR:Slreptomycin,SUL:Sulfadiazine,珊Tetracycline
3.2沙门氏菌耐药性分析
62株沙门氏菌药敏试验结果(图7、图8-1、图8-2)表明沙门氏菌分离株最少同时耐2种抗生素,最多同时耐18种抗生素,分别11i沙rJ氏苗分离株的1.6%和3+2%,同时耐10种以上(包括加种)抗生素的占61.3%。
不同季节分离株的耐药谱组成不同。
冬季6株沙门氏菌有5种耐药谱.最少的同时耐8种抗生素,最多的可同时耐16种抗生素,分别占冬季分离株的1.7%和33.3%;同时耐10种以上抗生素的分离株4株,占66.7%。
春季沙门氏菌16株共有9种耐药谱,最少的同时耐2种抗生素,最多同时耐16种抗生素,分别占春季分离株的6.3%和18.8%;有9株同时耐10种以上抗生素,占56.3%。
夏季沙门氏菌加株,共有u种耐药谱,最少同时耐5种药,
最多同时耐18种药,分别占2.5%和5%;25株为10耐以上菌株,占62.5%。
图7沙门氏菌分离株对20种抗生素的耐药谱
R表示耐药
Figll∞7Antlmicrobialresistancepatternin62Salmonellaisolates
R:Resistanee
图8—1不同季节沙门氏菌分离株对20种抗生素的耐药谱
R表示耐药
8-1Antimicrobialresistancepatternin62SalmonellaisolatesofdifferentseasonsFigure
R:Resistance
中国农业大学硕士学位论文结果与分析
图8-2不同季节沙门氏菌分离株对20种抗生素的耐药谱
R表示耐药
Figu"8-2Anthnicrobia]resistancepaMemin62Salmonellaiso]atcsofdifferentseasons
R:Resistance
沙门氏菌分离株对土霉素、四环素和磺胺嘧啶的耐药率为98.4%,对金霉素、强力霉素和阿莫西林依次为88.7%,82.3%和91.9%。
所有沙门氏菌分离株都对头孢曲松敏感。
其他抗生索的耐药率从1l_3%到80%左右(图9)。
冬季分离株对阿莫西林、金霉素、环丙沙星、强力霉素、恩诺沙星、土霉素、四环素和磺胺嘧啶完全耐药。
春季分离株阿莫西林完全耐药。
夏季分离株对强力霉素、土霉素、磺胺嘧啶和四环素完全耐药。
沙门氏菌冬季分离株对安普霉素、环丙沙星、多粘菌素E、恩诺沙星、庆大霉素、诺氟沙星、氧氟沙星、沙拉沙星和链霉素的耐药率比春季和/或夏季的高(图10.1、图10-2)。
图9沙门氏蓠分离株对20种抗生素的耐药率
AMO:阿甍西林APR;安普霉翥CEF:头孢曲{j}CIfl.金毒素c口:环丙涉星DIF:二氟沙星COLt多粘茼紊DOXI强力稚索ENR:恩诺沙星FLO·氟苯尼考GEN;庆大霉素KAN;p那毒素眦0:新霉隶NOR;诺氟涉星OFL:氧氟沙星OXY:土霉索SAR:沙拉沙胜STR:链霉索
SUL一黛歧嘧啶TETt四环煮
Figure9Antimicfobialresistanceof&抽oneUaisola啪t020drags
AMO:Amoxidoin,APR:Aptamydn,CEF:&hdmxone.∞Chlortctrtcycline.口:Cipmflox“in,DIF:Oifloxacin,COL:Colistin,DOX:Daxycycline,ENR:Eamflo..ut血FI.OIFlorfenicelOEN:G曲tamycin,KAN:Kanamycin,NE0:Neomycin,NOR:Norfloxacln.OFL:Ofloxacin,OXY:Oxytetracycline.SAR:Sanafloxaci玛STR:Streptomycin,SUkSulfadlazinc,TELTc[tacycline
图10-1不同季节沙n氏菌分离株对20种抗生素的耐药率
AMO:阿莫西林APR:安普霉素CEF:头孢曲梧CHL:金霉素cIP!环丙沙星DIF:二二氟沙星
㈣1.:多粘菌素DOX:强力霉素E帅:恩诺沙星FLO:氟苯尼考
Figurel0.1Antimlc∞biallesistanceofSalmonellajsolatesofdifierentseasonst020drags
Note:AMO:Amoxicillln,APR:舢nm咖CEF:Ccftriaxone,∞Chlortetracycfine,c口:Cipmfloxacia,DIF:Difloxacin.COLCo.tin.DOX:Doxycycline,ENR:Enroflox∞in,FLO:Florfenicol
围10-2不同季节沙门氏菌分离株对20种抗生素的耐药率
GEN:庆大霉粜ION}卡那霉素NEO:新霉素NOR:诺氟沙星OFLz氧氟沙星OXY:土霉素
SAR:沙拉沙星STR:链霉素suL:磺胺嘧啶TET:四环素
Figurel0.2Antimictobialrcslstanceof&拥onellaisolatesofdifferentseasonsto20drugs
N№:GEN:Genlwycin。
KAN:KanmydⅡ。
NEO:Nmycin,NOR:Nortlox血,OFL:Ofloxacin,0nOxytctmc3,cline,SAR:Sarafloxacin。
STR:SSreptomycin,SUkSulfadiazine,骶Tetracycline
中国农业大学硕士学位论文结果与分析
囤”大肠杆菌、沙门氏菌对6种瞳诺酮类药物的耐药谱
R:耐药
differentquinolonesFigure11AnRmicrobialresistancepatternofE.coliandSalmonellaisolatestosix
R:Resistaace
对于6种喹诺酮类抗生素,药敏试验结果(图11)表明:火肠杆菌敏感株有39株,r与所有分离株的28.7%;60株2耐以上菌株。
占“.1%;同时耐6种喹诺酮类抗生素的大肠杆菌有41株,占30.1%。
敏感沙门氏菌株13株,占分离株的21.0%:2耐以上菌株30株,占48.4%;同时耐6种喹诺酮类抗生索的有15株,占24.2%。
围12大肠杆菌、沙门氏菌对6种瞳诺酮类药物耐药率
CIP:环丙沙星DIF;二氟沙星ENR:思诺沙星NOR:诺氟沙星OFL:氧氟沙星sAR:涉拉沙星
Figurel2AnfimierobialresistanceofE.coilsadSalmonellat06differentquinolones
CIP:Ciptofloxacin,D巧:Difloxaein,EⅡ哝:Eurofloxacln。
NOR:Norfloxacin,OFL:Ofloxacin,SAR:Sarafloxacin喹诺酮类抗生素耐药率结果(图12)表明136株大肠杆菌的二氟沙星、沙拉沙星、环丙沙星、
诺氟沙星、恩诺沙星和氧氟沙星的耐药率分别为67.6%。
42.6%,38.2%,35.3%,33.8%和33.8%。
62株沙门氏菌的二氟沙星、沙拉沙星、环丙沙星、诺氟沙星、恩诺沙星和氧氟沙星的耐药率分别为72.6%。
45.2%,37.1%,24.2%,37.1%和30.6%。
3.3耐喹诺酮菌株GyrA基因QRDR和1型整合子检测与分析
应用PCR法扩增了36株不同喹诺酮类抗生素耐药水平的大肠杆菌和沙门氏菌的∥叫QRDR。
每个被检菌株都得到单一的目的片段(图13和图14),片段长191bp。
扩增序列用DNAMAN分析软什推导氨基酸序列(图15和图16)。
以大肠杆菌ATCC25922QRDR序列为参考序列。
图13大肠杆菌jyrA口舳R琼脂糖凝胶电泳
z分离株PCR扩增产物,17:阴性对照
1:100bpmarker,2-16
Figure13Agaros。
gelclectrophoresisofQRDRofgyrAfaomE,coli
Lanel:100bpmarker,lane2-16:pmdectsofE,coliisolates,lⅫc17:ncs-tiveecmrol
围14沙门氏菌gyrA0RDR琼脂糖凝腔电泳
1:1∞bpmukeI.12:阴性对照,其余为分离株扩增产物
Figure14Agaro∞geleleetrophorcsisofQRDRof∥一fromSa/mone//a
I.∞e1:100bpmzrker,Inel2:negativecontr01.others:productsofSa/monel/aisolates
氨基酸序列分析结果表明(图15,表6),敏感大肠杆菌无氨基酸变异。
耐1种、2种和3种喹诺酮类药物的人肠杆菌第83位发生氨基酸突变,突变方式是丝氨酸(s)被亮氨酸(L)取代,87位氨基酸未发生改变。
同时耐4种、5种和6种喹诺酮类抗生素的大肠杆菌同时发tt83、87位氨基酸突变,突变方式是Ser83Leu,1株4耐菌株87位由天冬氨酸(D)变为甘氨酸(G)外,其余菌株变为天冬酰胺(N)。
中国农业大学硕士学位论文结果与分析
AB
图”大肠杆菌、沙门氏蕾1型整合于产物琼脂糖凝胶电泳
^:大脯杆菌T型整合子璩脯糖凝腔电泳;B:沙门氏菌1型整台予璩精糖凝腔电泳
‰100bpmrker.N:阻性对照i1可:分离株1型整合子产栩
Fibre17Agam%铲lelectropho础ofda鹊1蛐cg∞ns矗omEc0矗鲫d舶蛔叫曲i∞l拙
A:icsultsofE∞H:B:螂mb0fSa/monel如.
袭7大肠杆菌、沙门氏菌1型整合子检测
nblc7Detectiondass1劬c鲫nilIcoli∞d血抽删j口jsolates
根据1型整合子两端保守序列,设计引物,应用PCR法检测136株大肠杆菌和62株沙门氏菌的1型接合子。
结果(表7)表明42株大肠杆菌和32株沙门氏菌含有1型整合子,分别占各自分离株的30.9%和51.6%。
PCR产物琼脂糖凝胶电泳(图17)显示大肠杆菌分离株中有2种1型整合子,片段长度分别为1.2妨和1.7kb。
沙门氏菌有3种1型整合子,片段长度分别为1kb、1.7kb和2曲。
1型整合子核苷酸序列测定和基因分析结果(表8)表明大肠杆菌1.2kb的1型整合子中包含一个∞dA2基因盒,1.7kb的1型整合子中包含ahM2、口口dd基因盒。
沙门氏菌1kb的1型整合子中有∞谢基因盒,1.7kb整合子中有dhpl2,2协的1型整合子中也包含一个口口谢基因盒。
所有整合子中都没有喹诺酮耐药基因qnr。