转录组STEM分析作图

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基本概念
表达趋势分析（Series Test of Cluster）：将变化特征模式相似的基因归类到一种变化趋势中，从而找到实验变化过程中最具有代表性的基因。

STEM趋势分析简介
STEM（Short Time-series Expression Miner）是一款专门针对梯度排序的表达量数据进行趋势分析的软件。

STEM趋势分析的意义
趋势分析将表达模式相似的基因进行归类，便于寻找目标表达模式，简化分析难度。

优势：将大量的基因归类为几个或十几个趋势中，简化分析难度；有相似趋势的基因更有可能行使相同的功能，便于数据挖掘。

软件原理
属于一种监督算法，将基因聚类归入认为形成的趋势内。

（预先生成趋势，再将基因归纳进这些趋势。

STEM趋势分析实操步骤
数据准，STEM运行，提交表达量数据，参数选择，提交任务，结果分析。