马铃薯病毒的RT-PCR检测技术评述
马铃薯的茎尖脱毒、复壮及RT-PCR检测
马铃薯的茎尖脱毒、复壮及RT-PCR检测马铃薯病毒一直是困扰其种植的难题,最有效的方法就是进行马铃薯脱毒。
本文就马铃薯脱毒种薯采取了如下列技术措施:首先将带毒薯在室内催芽、消毒处理,然后在无菌条件下,切取茎尖分生组织,移植于试管中培养,大约4个月后,茎尖分生组织长成试管苗;试管苗经过病毒检测,从大量植株中鉴定出不带病毒的脱毒苗;再经过切段快繁,及温室和网棚内繁殖,获得脱毒微型小薯或原原种;再繁殖即可获得原种,原种再繁殖成一级种薯、二级种薯和三级种薯,经过上述途径获得的种薯一般统称为脱毒种薯。
由于马铃薯脱毒苗茎尖分生组织体积较小(约0.5mm),所以在马铃薯茎尖脱毒的过程中经常存在成苗率低、畸形化严重等问题。
基于这些现象,本试验以新疆农科院核生所提供的马铃薯品系A1、A2、D17、F3为研究对象,对形成茎尖脱毒苗所需的各种培养基类型进行了详细研究,结果表明:MS+0.05mg/L 6-BA+0.5 mg/L NAA+0.1 mg/L GA<sub>3</sub>培养基对处理后的茎尖成活率和成苗率有较大的促进作用。
为了检测所获得的茎尖再生苗是否为脱毒苗,本文利用反转录PCR方法对再生苗进行了检测。
首先用Trizol试剂盒提取植株总RNA,通过设计特异性引物进行反转录PCR,检测在马铃薯再生苗中是否存在PVX、PVY、PVS病毒DNA,最终确定是否获得脱毒苗,以建立检测马铃薯病毒的快速简易的方法。
为了使马铃薯脱毒试管苗生长健壮并在需要时能大量结薯,本文在培养基中添加了植物生长延缓剂B9,研究了其对试管苗生长状况和扦插后的马铃薯微型薯结薯数的影响。
实验结果表明:品系A1和A2在测量范围内都出现了最大值,具体表现为当B9浓度分别为60mg/L和80mg/L时出现了最大的马铃薯微型薯数,品系F3却随B9浓度的增加结薯数有所减少,而品系D17的马铃薯微型薯数则在测量范围内一直出现递增趋势。
马铃薯S病毒的RT-PCR检测
3 甘肃农业大学生命科 学技术 学院,甘肃 .
摘
要 :根据马铃 薯 s病毒 (V ) P s 的外壳蛋 白基 因序列 ,设计合成 了一对寡核苷酸 引物。以感染 P S的马铃 V
薯组 织和健康的组 织为材料 ,对提取植物 总 R A的两种方法进行 了比较 ,并对 总 R A的提取 方法进 行改进 。获 N N 得 了纯度 较高 ,完整性较好 的总 R A N 。以此为模板 ,进 行 c N D A合 成及 P R扩增 ,从感病组 织扩增得到 一段 长 C
度 约 6 2b 4 p的特异 P R扩增产物 ,与理论设 计的外壳蛋 白基 因大小一致 ,而健康 组织无此扩增 产物。从 而建立 C 了检测 P S快速 灵敏 简便 的新方法 ,在基 因水平上 为 P S的检测提供了新手段 。 V V 关键词 :马铃薯 s病毒;反转 录一 聚合酶链式反 应 ;病毒检 测
吴 丽萍 I,王 蒂 ,司怀军 , 王 化俊 , 路 平 , 贾笑英 ・ ’ , 一 一 , 2
(. 1 甘肃农业大学农学院,甘肃 兰州 7 0 7 :2 甘肃省作物遗传 改 良与种质创新重点 实验室 ,甘肃 300 . 兰州 7 0 7 3 0 0) 兰州 7 0 7 ; 3 0 0
T IO 试剂法提取 R A的具体方法如下 :称 RZ L N 取 10 g 0 样品 ,迅速在 液氮中研磨成粉末, m 然后加 入 1 LT IO 研磨成匀浆组织 ;倒入 1 L .m RZ L 0 .m 离 5
心管 中 ,室温 放置 5mi, 4c 1 00rmi- n c下 2 0 ・ n ,离
本 文 比较 了 2种 总 R A 提 取 方 法 及 P S的 R — N V T
生产。马铃薯 s 病毒 (V ) P S是影响马铃薯产量和品 质的主要病毒之一 , 分布广泛 ,在世界各 马铃薯种
加工番茄马铃薯Y病毒一步法RT—PCR检测及CP基因的克隆与序列分析
v a r i a t i o n c h a r a c t e r s a mo n g d i f e r e n t P VY s t r a i n s we e r p r o v e d up .Ac c o r d i n g t o t h e s e es r u l t s.P VY w h i c h i l f e c t e d p r o c e s s i n g t o ma t o i n Xi n —
Ab s t r a c t : T h e s t u d y a n a l y z e s p o t a t o v i r u s Y p ev r a l e n c e o f i n f e c t i o n i n p r o c e s s i n g t o ma t o i n X i n j i a n g b y t h e o n e ・ - s t e p ev r e s r e t r a n s c r i p t i o n ・ - p o l ・ ・ y m e as r e c h a i n ea r c t i o n ( R T - P C R) ,t h e es r u l t s h o w e d t h a t 2 5% p r o c e s s i n g t o m a t o c o u l d b e i n f e c t d e w i t h P V Y.T h e C P g e n e i n c l u d e d
RT-PCR技术及其在马铃薯病毒检测中的应用
南
方
Agricultu re
第1卷第6期
V ol.1 N o .6
2007 年11 月
Nov. 2007
S o u th C h in a
专题论述
同时检测多个目 的片段。 多重RT-PCR一次反应即可 以检 测出多个不同的病原物, 效率要比普通PCR 高得多。 但
保守序列, 对于株系间分子变异大的病毒应注意。 如对 同种病毒的不同株系进行检测, 则应选择该株系的特异
专题论述
南
方
农
业
第1 卷第6期
V o l.1 N o .6
2007 年 11 月
Nov . 2007
South China Agriculture
RT-PCR 技术及其在马铃薯病毒检测中的应用
冯 众‘ 何 建2 聂振朋3,于莉娟‘ , ,桑有顺’ (‘ 成都市农林科学院作物研究所,成都611130; 2 四 川省农业科学院园艺研究所
黑条矮缩病毒, 结果显示RT-PCR是斑点杂交法灵敏度 的10倍。 陈建军等[3 ]比较RT-PCR, IC-RT-PCR和DAS究进展很快。 吴兴泉[ 1 [ 等利用RT-PCR技术扩增得到了 6
PVX cp基因, 并进行序列测定, 同时采用RT-PCR 方法 ELISA (Double antibody sandwich enzyme-linked 和核酸斑点杂交(NASH)方法对PVX进行了分子检测, immunosorbent assay) 3种 测 萄 叶 毒I 的 检 葡 卷 病 II 方 建立快速、 灵敏、 特异的PVX分子鉴定与检测技术。 俞 法, 显示RT-PCR可用来检测病毒含量极低的或其它两 键[7等对传统的马铃薯病毒RNA苯酚提取法进行改进, 1 种方法无法检测出的病毒, 在灵敏性和可靠性上均为最 同时设计优化单管RT-PCR方法, 依据PVY和PVS的基 佳。 唐科志等(4利用一步法RT-PCR技术检测柑橘裂皮 因组保守序列设计2套特异性引物, 1 对染病的马铃薯叶 病类病毒,经过与生物学鉴定和聚丙烯酞胺凝胶电泳 片组织进行检测, 结果证明这种新型马铃薯病毒诊断方 (PAGE)方法的比较, 表明RT-PCR方法检测周期短、 灵 法具有可靠、 快速、 便等 简 特点。 关翠萍 1 [8运用一步法 敏度高, 有利于对类病毒在春季和冬季浓度低时进行快 RT-PCR对马铃薯和烟草中的PVX, PVY和PLRV进行了 速准确的检测。 检测, 其灵敏度较两步法RT-PCR高100倍左右, 建立了
免疫试纸条结合RT-PCR法快速检测马铃薯Y病毒
免疫试纸条结合RT-PCR法快速检测马铃薯Y病毒摘要:利用马铃薯Y病毒免疫试纸条,对PVY进行了快速检测,结果表明,试纸在2min内,可特异性检出PVY,而健康的叶片无反应。
刮下试纸条上显示的检测带,进行RT-PCR,能扩增到与预期大小相同的DNA条带,是对快速检测试纸条检测结果的验证。
关键词:马铃薯Y病毒;免疫试纸条;RT-PCR中图分类号:S432.4+1;Q503文献标识码:A文章编号:0439-811405-1056-02TheRapidDetectionofPotatoVirusYbyImmunostripAssayandRT-PCRZHUYun-fen1,CHENGQun1,SHENYan-fen1,MAZuo-jiang1,WANGEr-hui1,WEIKai2Abstract:PotatovirusYwasrapidlydetectedbyimmunostripassay,theresultsindicatedthatthePVYcouldbetestedbyimmunostripwithin2minutesandno-specificreactionwasobserverdforhealthyleaves.RT-PCRamplificationcouldproduceaspecificDNAbandwithanexpectedsize,whichwasavalidationoftheresultsofimmunostrip.Keywords:potatovirusY;immunostrip;RT-PCR我国是世界上马铃薯生产第一大国,近年来,马铃薯产业发展迅速,在国民经济增长中占有重要比重,但现阶段马铃薯整体生产水平低于世界平均水平[1],其主要原因是受马铃薯病毒的影响。
马铃薯为营养体繁殖,病毒在寄主体内随继代繁殖而逐渐积累,导致马铃薯种性退化,产量严重降低,块茎大小、形状、口感等原有品质下降,影响马铃薯的商品性。
实时荧光RT—PCR方法检测马铃薯V病毒
R o c h e L i g h t C y c l e r 4 8 0 I 1 型。
人扩散 。马铃薯 V病毒可通过生物学接种 方法进行检测 , 如 接种在番 茄 、 德氏烟( N i c o t i a n a d e b n e y i ) 或 马铃 薯野 生 种 A
1 . 1 . 1 供试材料
马铃薯 V病毒 、 马铃薯 Y病毒 、 马铃薯 A
薯表现轻或较 重的花叶 、 叶背生绿斑或环 , 部分叶脉坏死 , 对
马铃薯的生产构成严重 威胁 , 被我 国政府 列为进境检 疫性 有害生物 。随着马铃薯 产业 的不 断发展 , 我 国已成为 世界上
病毒 、 李痘病毒及马铃薯 x病毒 阳性材料 由中国检验检 疫科
年来 , 出现的实时荧光 R T— P C R( r e l— a i t m e l f u o r e s c e n t P C R)
外壳蛋 白基 因保守序列设计 , 由I n v i t r o g e n公 司合 成 , 扩 增产 物长度约 为 1 6 4 b p , 序列 如下 : 马铃薯 V病 毒 F : 5 一C G G - T A T G G r I T I T r G G 1 A G A A A 邢 c 一3 , 马 铃 薯 V 病 毒 R:
设计引物和 T a q M a n 探针 , 通过 特异性及灵敏度试验建立该病毒 的实 时荧 光 R T — P C R检测方法 。该 方法检测灵敏 度 高, 至少可检测到 3 6 p g / 的总 R N A; 对 马铃薯 V病毒 、 马铃薯 Y病毒 、 马铃薯 A病毒 、 李痘 病毒及马铃薯 x病 毒具 有 良好 的特异性 。该方法快速 、 灵 敏、 无需任何 P C R后处 理且 交叉 污染 风险小 , 可用于马铃薯 V病毒 的快速检测 。
单酶法RT—PCR检测马铃薯纺锤块茎类病毒
水浴 15h 7 . 后 0℃ 1 i终止反应。 0m n ( )c 2 P R体系为缓冲液 2止 ,反转录产物 2止 ,上游引物 1
作者柚介 :叶
 ̄(96 ,男 ,在读博士研 究生 ,主要从事遗传工程研 究。 *为责任作者 、 系人。 t 一) 7 联
维普资讯
华
北
农
学
报
1 7卷
12. 常规 R -C . 3 T P R检 测 P 1 S’ v
() 1 反转录反应体系中含有 5 核酸抽提液 ,2 L引物(0p o)4止 缓冲液 ,1f 2 m 1, L l
1 材 料 和 方法
1 1 材料 .
患病番茄植株( 品种 R te) ugr的叶子 ,由天津农科院蔬菜研究所提供;无毒马铃薯试管苗 津引薯 9 号 本实验室保存。
12 方法 .
12 1 P T . . S V抽提
参照文献 [ ]进行。 6
3,下 游 引 物 :5-G- ' C
m / 1 6t ,d TP 1 n L) . L N s(0 mmo/ ) . .,d I2 1 7 * lL 0 4 p L d I 1 .5止 ,T q( "O a 4u L 12 k ) .5
加入 3 L石蜡油,反应条件 :10 2m n 0 0 ℃ i 冰浴 2m n i 之后 7 2℃5mi 9 n 4℃ 1mi 3 n 7℃ 2mi 7 n 2℃ 1mi 1 n 0个循 环 ( 转 录阶段 ) 反
录阶段退火温度在 3 ℃ 、循环数不 少于 l 次的情 况下 , C 扩增能 得到一 条相关特异带 。经 7 0 PR
马铃薯三种主要病毒的ELISA和RT-PCR检测技术的研究
马铃薯三种主要病毒的ELISA和RT-PCR检测技术的研究马铃薯是世界上重要的食物作物之一,也是我国主要的经济作物之一。
然而,马铃薯生产中常常受到病毒的威胁。
病毒感染会导致马铃薯产量下降、品质降低甚至全面减产。
因此,准确快速地检测病毒感染对于指导马铃薯的种植和防控病害具有重要意义,可以提供科学依据、减少经济损失和保证农作物的质量安全。
马铃薯主要受到三种病毒的感染,分别是马铃薯病毒Y (Potato Virus Y, PVY)、马铃薯块茎坏死病毒 (PotatoVirus X, PVX)和马铃薯花叶病毒 (Potato Leafroll Virus, PLRV)。
传统的病毒检测方法包括生物学观察法、传统PCR等。
然而,这些方法存在耗时、复杂、低灵敏度等问题。
因此,研究人员对使用ELISA和RT-PCR等技术进行马铃薯病毒检测进行了深入研究。
ELISA法是一种高效的酶联免疫吸附法,利用抗原与特异抗体结合,通过比色反应检测样品中是否存在目标病毒。
ELISA方法具有高度敏感性和特异性,且结果易于观察和分析。
针对马铃薯病毒检测,研究人员首先制备了目标病毒的抗原,并将其与马铃薯样品中的病毒结合,然后添加酶标记的二抗,形成抗原-抗体-酶标记-底物复合物。
最后,通过添加酶底物,观察是否有颜色反应产生。
ELISA法不仅操作简便、检测速度快,而且可以批量检测多个样品。
但是,ELISA法的敏感性对样品前处理和样品质量要求较高。
与ELISA法相比,RT-PCR法可以在基因水平上对目标病毒进行检测。
RT-PCR法首先需要提取马铃薯样品中的总RNA,然后通过反转录将RNA转化为cDNA,再进行聚合酶链反应扩增。
PCR反应中使用特异引物,使得目标病毒的RNA序列扩增得到特异性产物,经过电泳分析可以确定是否存在目标病毒。
RT-PCR法具有快速、准确、高灵敏度和高特异性等优点,可以在较短的时间内对多个样品进行检测。
但是,RT-PCR法技术门槛较高,操作复杂,需要专业的实验室和设备。
马铃薯病毒RT-PCR检测体系的建立
2 1 年第 2 期 01 1
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
农业 基础 科学
马铃薯病毒 R — C T P R检测体 系的建立
陈 阳婷 桑有 顺
( 川省成都 市农林科学院 , 川成都 6 13 ) 四 四 1 1 0
摘要 依 据 马铃 薯病 毒 P S P X、L V、V 的 C V 、V P R P A P保 守序 列 设计 特 异性 引物 , 马铃 薯 病 叶组 织 中提 取 出病 毒 总 R A, 行 c N 从 N 进 DA 合 成和 P R扩 增 . 到 了与预 期 片段 长度 一致 的 P R特 异扩 增 产物 , 立 了能 够 同步检 测 P S P X、 L V P A的 R — C 多重检 测体 C 得 C 建 V 、V P R 、 V TP R 系。 方 法对 P S P X、 L V、 V 扩 增 出 的靶 带 大 小分 别 为 4 5 6 5 2 2 3 0 p 凝胶 电泳 易辨另 区分 。 究结 果表 明 , 该 V 、V P R P A 3 、 2 、2 、 0 b , 研 该方 法 特 异 性 好、 灵敏 度 高 、 速 简便 。 快 为马铃 薯病 毒 的 高效检 测提 供 了有效 手段 。 关键 词 马铃 薯病毒 ; T P R; 测体 系 ; 立 R C 检 建 中圈分类 号 S 3 .2:41 3 文 献标 识码 A 4 53 ¥ — 0 文章 编 号 10 — 7 9 2 1 ) 1 0 1 — 3 0 7 5 3 (0 1 2 — 0 5 0
s o dt a a e i c s n i v e e t gmeh da dq ik r smpe . r vd da fciemeh do ted t t nfr oaovr s h we tt S s cf ,e s ied tci t o uc e ,i lr t o ie ne e t t o h ee i tt i . h iW a p i t n n Ip f v f c o op u Ke r s p tt i ss RT P R; ee t ns se ;sa l h n y wo d oaovr e ; — C d tci tm e tb i me t u o y s
三重RT-PCR快速检测多种马铃薯病毒的研究
b (V ) 3 p V ) 0 p V ) 2 p L V大小 的扩增 片段 。结果表 明, p P X 、 5 ( S 、 0b ( A 、 2b ( R ) 4 bP 3 P 2 P 反转 录反应 中 d T s N P 浓度和 P R反 应中 M 2 C g 对 + 整个反应的影响最大; 其次是退火温度 ; 循环条件对 R — C T P R影响较 小。 化的三重 R — C 优 T P R反应体系为马铃薯病毒 的检测提供 了一种快速 、 灵敏 、 的方法 , 马铃薯病毒 的早期检测和防治提供 了有效手段 。 简便 对 关键词 : 马铃薯 ; T P R 病毒检测 R—C ;
a rvr rncit n s g (T n h t ees t sr i t e R )a d t M c net t n a P R s g a ra ip c o h e c o e a po a e ocnr i t C t e hd aget m at n te dt t n ao a ei
四川 成 都 604 ;3 四川 农 业大 学 , 10 1 . 四川 雅 安 65 1 ) 20 4
摘 要 :依据 马铃薯 X病毒 、 病毒 、 S A病毒及卷叶病毒的基因组 R A保 守序列设计特异性 引物对 ,从 反转 录反应 中 d T s N N P 浓
度、 退火温度 、C P R反应 中 M 浓度 、 循环条件 4方面优化三 重 R — C T P R反应条件 , 可以同步扩增 出上述 4种病 毒 , 分别得到 6 0 2
CHEN Ya g t g , NG n ZHANG i。 n - i ’ NI n Ho g , M n f Isi t o 1 ntu . t e fHot ut a cec, hn d cd m gi l r n o s yS i cs C eg u6 0 2 RC rcl rl ine C eg uA a e yo r ut a adF r t c n e, hn d 10 Z P ; i u S fA c ul er e 2 Sc unPat ur t eS ̄i , h nd 1 0 1 P C 3 Sc unA r utr nvr t Y " 2 04 P C . i a l aa i t o C eg u6 0 4 , R ; . i a gi l a U i sy aa 6 5 1 , R ) h nQ n n n h c ul e i, n
RT
RT PCR技术对宁夏马铃薯脱毒种薯病毒检测的研究作者:聂峰杰 詹红 张丽 宋玉霞巩檑甘晓燕陈虞超石磊张国辉来源:《植物保护》2016年第05期摘要病毒病是影响马铃薯生产的重要病害,为了解宁夏地区马铃薯种薯生产中的病毒发生情况,在银川市、固原市和西吉县不同种植模式的脱毒种薯生产基地,对不同品种的原原种、原种、一级种在不同生育期随机采集样品,利用RTPCR检测技术对4种马铃薯主要病毒PVX、PVY、PVS、PLRV和类病毒PSTVd进行检测。
结果表明:PVX、PVY、PVS、PLRV在3个基地均有不同程度检出,成熟期病毒检出率分别为35%、28%、35%和34%,未检出PSTVd;4种病毒检出率在马铃薯现蕾期以后呈现显著性增长;病毒检出率随着种薯繁育级别增加差异显著;6个马铃薯品种均为感病品种;大田种植种薯的病毒检出率显著高于防虫网室。
关键词马铃薯;病毒检测; RTPCR病毒病是危害马铃薯生产的重要病害,在全世界马铃薯产区均有分布。
目前,已发现的马铃薯病毒、类病毒有近40种[1],我国常见的有8种,包括马铃薯X病毒(PVX)、马铃薯Y 病毒(PVY)、马铃薯S病毒(PVS)、马铃薯卷叶病毒(PLRV)、马铃薯A病毒(PVA)、马铃薯皱缩花叶病毒(PVM)、马铃薯古巴花叶病毒(PAMV)和马铃薯纺锤形块茎类病毒(PSTVd)[23]。
马铃薯受病毒侵染后主要表现为花叶、卷叶、植株矮小、叶片失绿、块茎变小、龟裂、内部网状坏死等,严重时种薯失去发芽能力,病毒逐代积累引起马铃薯品种退化,产量和品质下降,一般引起减产20%~30%,如果多种病毒混合侵染可造成减产80%以上[45]。
目前马铃薯病毒病的防治主要包括生产脱毒种薯、抗病毒品种选育和施用抗病毒药剂,其中生产脱毒种薯是控制马铃薯病毒病最有成效的手段[67]。
但在脱毒种薯生产中,病毒病的发生与马铃薯品种、脱毒种薯级别、种植地区和生产管理等有很大的相关性,病毒的种类和生产环境也密切相关。
马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)的RT—PCR检测
究使用韩 国 I N T R O N生物化 学制药 公司生 产的 P S T V d检测 试剂盒 , 旨在通过试验说明使用该试 剂盒提取植物 mR N A具
有方法简便 、 省 时、 灵敏度高等优点 , 而且 可 以对 不 同 的 马 铃
影响其生长。 试 验 结果 表 明 , 完 全黑 暗 条 件不 利 于 愈 伤 组 织 的形 成 , 适 宜 的光 照 条件 能刺 激 叶 片 细胞 脱 分 化 , 加 快 愈 伤 组织 的形 成 ,
2 0 %~ 3 5 %, 常常因此造成较 大的经济损失 。马铃薯类病 毒是马铃薯种薯检疫规程 中的主要检疫对象 , 具有广泛 的传 播途径 , 是唯一不能通过茎尖剥离 、 组 织培养而汰除的病毒 , 必须通过严格的检测而将其汰除。据报道 , 控制 P S T V d传染 的有效方法仅有依赖 于 P S T V d的早期 鉴定 。 目前主要 采 用指示植物 、 聚丙烯酰胺凝胶 电泳技术 、 核酸斑点杂交技术等 方法进行检测。随着 P C R技 术 的产 生 , R T—P C R技 术 已经 被越来越广泛地应用 在 R N A病 原的鉴定上 , 应用 R T—P C R 技术检测植物病原具有快速 、 灵敏 、 简便 、 特异性强等优点 , 而 且可 以检 测 出 植 物 组 织 中含 量 极 低 的 病 毒 R N A - 4 ] 。 本 研
1 材 料 与 方 法
1 . 1 试 验 材 料
感染 P S T V d的马铃薯试管苗 、 块茎 由俄罗斯 哈巴农业科 学研究院马铃薯研究所提供 ; 健康 的马铃薯试管苗 、 块茎 由延
边 农 业科 学研 究 院 提 供 。
应用三重RT-PCR技术检测三种马铃薯病毒
对 田间 1 5 0 份马铃薯毒源样品进 行检 测 ,两种 方法检 测结果 吻合 ,三 重R T — P C R体 系的灵敏度 更高、特 异性 更强 ,
可 以用 于 马铃 薯 田 间样 品检 测 。 关键 词 :三 重 R T — P C R;马铃 薯 ;P V X;P V M;P V A;检 测
o f Mg , d N T P s a n d T a q DN A p o l y me r a s e a n d t h e e x p e  ̄e d f r a g me n t s o f 7 1 1 b p( P V X) , 5 2 0 b p( P VM) a n d 2 7 3 b p( P V A) we e r
( 1 . I n s t i t u t e o f V i r u s — f r e eSe e d l i n g R e s e a r c h , H e i l o n g j i a n gA c a d e myo f A g r i c u l t u r a l Sc i e n c e s , Ha r b i n , He i l o n g j i a n g 1 5 0 0 8 6 , Ch i n a ; 2 . i n s t i t u t e o f Cr o p Br e e d i n g , H e i l o n g j i a n g Ac a d e my o f A g r i c u l t u r a l Sc i e n c e s , Ha r b i n , He i l o n g j i a n g 1 5 0 0 8 6 , C h i n a)
Ab s t r a c t :P o t a t o v i r u s X( P V X) , p o t a t o v i r u s M( P VM) a n d p o t a t o v i r u s A( P V A) a r e i mp o r t a n t v i r u s e s w h i c h c a n c a u s e
马铃薯病毒PVY,PVS和PLRV多重RT-PCR检测
马铃薯病毒PVY,PVS和PLRV多重RT-PCR检测黄丹;余琨;陈建斌;蔡红;朱有勇【摘要】病毒是马铃薯生产过程中危害较大的一类病原,为快速检测出云南省马铃薯主要病毒种类,依据病毒外壳蛋白基因序列设计合成了马铃薯Y病毒(PVY)、马铃薯S病毒(PVS)、马铃薯卷叶病毒(PLRV)的特异性引物,从退火温度、最低检测浓度、热反应循环条件、病毒间的模板及引物间的最佳组合浓度进行优化,建立了三重RT-PCR反应体系.结果表明:该优化体系可同步扩增出上述3种病毒,分别得到480 bp (PVY)、187 bp (PVS)、336 bp (PLRV)大小的扩增片段.优化的三重RT-PCR反应体系可快速、灵敏、简便的检测到单一或复合侵染的马铃薯病毒,有利于马铃薯病毒病的早期检测和防治,将为云南省马铃薯种苗脱毒、继代、田间植株的高产栽培等有重要实践作用.【期刊名称】《云南农业大学学报》【年(卷),期】2015(030)004【总页数】6页(P535-540)【关键词】马铃薯;病毒;多重RT-PCR检测【作者】黄丹;余琨;陈建斌;蔡红;朱有勇【作者单位】云南农业大学植物病理重点实验室,云南昆明650201;云南省建水县农业技术推广所,云南建水654399;云南农业大学植物病理重点实验室,云南昆明650201;云南农业大学植物病理重点实验室,云南昆明650201;云南农业大学植物病理重点实验室,云南昆明650201【正文语种】中文【中图分类】S435.32马铃薯病毒病是马铃薯非常重要的一类病害,病毒的侵染可引起马铃薯种质退化,导致产量急剧下降[1]。
我国各马铃薯主产区均有马铃薯病毒病发生[2]。
主要的马铃薯病毒种类有马铃薯X病毒(Potato virus X,PVX)、马铃薯卷叶病毒(Potato leaf roll virus,PLRV)、马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)、马铃薯A病毒(Potato virus A,PVA)和马铃薯S病毒(Potato virus S,PVS)[3-4]。
马铃薯S病毒RT-PCR检测技术的研究
面积超 过 80 80万 亩 , 占世 界 总 面积 的 14 / 。但 单产
分 j存 在着 假 阳性 或假 阴性 现象 , 且 只 是 检 测 , 而 了病毒 的外壳 蛋 白( P , C )其遗 传信 息量 只 占整个 病
12 主要 试 剂 与 耗 材 .
般 不作为 最 终 鉴定 。在 血 清 学 鉴 定 中 以 E IA应 LS
收 稿 日期 :0 0— 9— 4 21 0 0
T IO R Z L提 取 试 剂 盒 , —ML ees rn M V R vr Ta . e
sr t e Oi d pi e ci a , lo( T) r r购 自 Po ea 公 司 ; ps g m rm g Tq N a D A聚合 酶 , N P Mi ue 1 0 p D A l d r d T x r, 0 b N a e , t d
~
定 同源 性 的病 毒 类 型 。随着 分 子 生 物 学 的 发
展 ,聚合酶链 式反应 ( C 得 到 了迅 速 而广 泛 的应 P R)
用 。应用此 项技术 检测 植物病 毒具有 快速 、 敏 、 灵 简
便、 特异性 强等 优点 , 且可检测 出植 物组织 中含量 而
5 0% _J 严 重 时达 2
,
8 % 以上 , 重 制 约 了 马铃 薯 0 严
的生产 。
极低 的病 毒 R A_ ,能检 测 到 休 眠种 薯 或 含 量 极 N 5 』
少 的韧 皮部病 毒 , 灵敏 度是 E IA的 l 其 LS 0 倍 J适 ,
马铃 薯 s病毒是 马铃 薯重 要病 毒 之 一 ,9 8首 14 次发现 和报道 于荷 兰 , 在许 多 种植 马铃 薯 的地 区皆
马铃薯病毒RTPCR检测体系的建立______
马铃薯是世界上第四大粮食作物,具有广适性好、薯块产量高、淀粉含量丰富、种植经济效益较高等特点。
随着农业产业结构的调整和国内外马铃薯加工业的不断发展扩大,市场对马铃薯的需求也逐渐增多[1]。
马铃薯也是许多病虫害的广普寄主,许多病虫害均可引起马铃薯品质和产量的降低甚至绝收以及种薯的退化[2]。
马铃薯是无性繁殖作物,马铃薯病毒病是马铃薯退化的主要原因,如果连年种植无毒的种薯,借助蚜虫在田间传播病毒,也会感染马铃薯病毒病;连续种植带毒的马铃薯,由于马铃薯病毒的累积效应,该病会使马铃薯严重退化,最终造成了马铃薯产量迅速下降[3]。
为了使马铃薯产业安全高效,持续健康地发展,应当繁育和推广优质脱毒种薯。
因此,保证马铃薯病毒检测技术体系的灵敏、快速、准确,可以有利于确保脱毒种薯生产质量。
分子生物学检测法是目前发展最快、最有发展前景的病毒检测技术。
该方法特异性强、灵敏度高,从核酸水平检测病毒,可以进行大批量的样本检测,且克服血清学及其他检测方法中的一些缺点。
目前,我国常采用单重RT-PCR 检测病毒,如需检测复合感染样品,操作步骤繁琐,因为其局限是在1个反应管中只能检测1种病毒,已不能满足现代生产的需求。
复合感染样品检测需要进行数次RT-PCR 反应,耗时长、成本高、易造成交叉污染。
针对侵染马铃薯的主要病原病毒PVS 、PVX 、PLRV 和PVA ,本研究建立了高效RT-PCR 检测体系,应用于检测四川省发生的马铃薯病毒病。
该体系可以在同一反应管中同步检测4种病毒,提高了检测的准确性和检测效率,为培育和筛选马铃薯无病毒原种材料、种薯调运的检疫检验、实施病毒病害有效的防治措施提供一定的理论指导。
1材料与方法1.1试验材料供试材料为来四川省主要马铃薯生产区的试管苗、种薯、田间及网室植株共134个样品,从成都市各区、市、县和彭山、洪雅、雅安、简阳等共24个采样点,大田随机采集明显有花叶、皱缩、矮化等症状的马铃薯植株,通过DAS-ELISA 检测后,筛选出单独或复合感染PVX 、PVS 、PVA 和PLRV 的植株叶片作为供试材料。
马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)的RT-PCR检测
马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)的RT-PCR检测李永俊;赵希子;郭相和;全英姬;李平;金松爱【摘要】以马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)检测试剂盒提取的2种不同材料的mRNA为模板,进行cDNA合成及PCR扩增,从感病组织中扩增得到一段长360 bp的特异PCR扩增产物,而健康的试管苗中则无此扩增产物.以感染PSTVd的马铃薯试管苗、块茎和健康的马铃薯试管苗、块茎为材料,用韩国INTRON生物化学制药公司生产的PSTVd检测试剂盒提取试管苗、块茎这2种不同材料中的mRNA.结果表明,试剂法可对马铃薯不同材料进行PSTVd检测,60 min内即可分离出mRNA,整个诊断时间为4h,方法简便、快捷、灵敏度高,因此可以作为马铃薯种薯生产早期PSTVd诊断及品种引进的快速、有效的检测手段.【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2013(041)009【总页数】2页(P26-27)【关键词】马铃薯纺锤块茎类病毒;RT-PCR;mRNA【作者】李永俊;赵希子;郭相和;全英姬;李平;金松爱【作者单位】延边职业技术学院,吉林廷吉133001;延边职业技术学院,吉林廷吉133001;延边职业技术学院,吉林廷吉133001;延边职业技术学院,吉林廷吉133001;延边职业技术学院,吉林廷吉133001;吉林省敦化市农业技术推广中心,吉林敦化133700【正文语种】中文【中图分类】S435.32马铃薯纺锤块茎病害是由类病毒引起的,是危害我国北方马铃薯生产和实生种子品质的重大病害。
据报道,马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)强系减产可达60%,弱系减产约20%~35%,常常因此造成较大的经济损失[1]。
马铃薯类病毒是马铃薯种薯检疫规程中的主要检疫对象,具有广泛的传播途径,是唯一不能通过茎尖剥离、组织培养而汰除的病毒,必须通过严格的检测而将其汰除。
据报道,控制PSTVd传染的有效方法仅有依赖于PSTVd的早期鉴定[2]。
陕北地区马铃薯Y病毒的RT-PCR检测及其序列分析
陕北地区马铃薯Y病毒的RT-PCR检测及其序列分析冯光惠;杜虎平;李夏隆;亢福仁【期刊名称】《山西农业科学》【年(卷),期】2014(042)009【摘要】以陕北地区8个县(区)种植2~3代疑似带毒的马铃薯叶片为材料,Trizol 法提取马铃薯叶片总RNA,以已公布的马铃薯Y病毒外壳蛋白(coat protein,CP)基因序列设计1对特异引物,反转录合成cDNA,RT-PCR扩增目的DNA片段,1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物.回收纯化CP基因片段并进行克隆和测序,采用DNAstar软件分析序列一致性.结果显示,所有马铃薯叶片中均扩增到与预期大小一致的、长度为400 bp的目的片段,表明这些马铃薯均感染了Y病毒;陕北8个县(区)马铃薯Y病毒CP基因与国内外其他地区12个样品之间的序列一致性为88.4%~99.8%,表明马铃薯Y病毒的CP基因序列比较保守,不易发生变异.RT-PCR方法可快速、准确地检测马铃薯Y病毒,从而为马铃薯茎尖剥离脱毒生产脱毒种苗(薯)提供依据.【总页数】5页(P941-944,967)【作者】冯光惠;杜虎平;李夏隆;亢福仁【作者单位】榆林学院生命科学学院,陕西榆林719000;榆林学院生命科学学院,陕西榆林719000;榆林学院生命科学学院,陕西榆林719000;榆林学院生命科学学院,陕西榆林719000【正文语种】中文【中图分类】S435.32【相关文献】1.陕北地区马铃薯X病毒CP基因的RT-PCR检测及其序列分析 [J], 冯光惠;杜虎平;李夏隆;亢福仁2.加工番茄马铃薯Y病毒一步法RT-PCR检测及CP基因的克隆与序列分析 [J], 梁学超;向本春;程朝玲;苏海娣;郑银英3.陕北地区马铃薯卷叶病毒的RT-PCR检测与序列分析 [J], 冯光惠;杜虎平;李夏隆;亢福仁4.榆林地区马铃薯纺锤块茎类病毒的RT-PCR检测与序列分析 [J], 冯光惠;杜虎平;李夏隆;亢福仁5.2007-2010年江苏地区猪繁殖与呼吸综合征病毒RT-PCR检测及部分Nsp2基因序列分析 [J], 钱琨;顾丙泉;王明珍;金文杰;秦爱建因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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马铃薯病毒病 是马铃薯 上非常重要 的一类病 害 ,
马 铃 薯 病 毒 检 测 的 方 法 主 要 是 酶 联 免 疫 吸 附 法 ( LS ,虽 然 E IA 比传 统 的生 物学 检测 方 法灵 E IA) LS
分布于世界各马铃薯种植区,病毒的侵染除直接引 起 马铃 薯病 毒病外 ,更 重要 的是 导致种 质退 化 ,引 起产量的急剧下降。在我国各 马铃薯主产区均有马 铃薯病 毒病 的发生 ,成 为制 约 马铃薯 生产 的主要 因 素之一 。目前 已报道的感染 马铃薯 的病毒多达 3 5 种,类病毒 1 ,以马铃薯命名 的病毒就有 1 种。 种 5
关键 词:马铃薯病毒 ;R - C ; T P R 检测 ;问题与对策
RT— PCR t c in Te h o o yf r t t r s s De e t c n lg o a o Vi e o Po u
W U Xig a 仙, n qu n SHI n, Ya ’YANG n d n L i g Qig o g , I Gul ’ i n
( .o ̄ eo itc n lg , e a nv ri f e h oo y Z e g h u H n n4 0 0 , ia 2 Gra otenWi en s oao 1C l f oe h oo y H n nU i s yo c n lg , h n z o . e a 5 0 1 Chn ; . e t r r l re sP tt B e t T N h d
率 ,而且降低检测成本 ,因此 H R - C 卜 T P R技术将是 R -C T P R检测技术真正投入实际应用 的发展方 向。
铃薯样本带毒 ,反之 ,为健康样本 , 从而完成对待 测样本 带毒情况 的判 断 。 马铃 薯病毒 的常规 R — C T P R检测一 般包括 :待 测 马铃薯样本 中病 毒 R A的提取 、反转 录合成 N c N 、P R扩 增靶 c N D A C D A片段 和 P R产 物 的电泳 C
1 马铃 薯 病毒 R - C T P R检 测技 术 的原 理及 其
病毒进行 了检 测 。
在病毒检测中的应用
1 常规 R - C . 1 T P R检测技术 P R技 术 可 以从一 个 复杂 的 D A混合 物 中大 C N
由于 马铃 薯 病 毒 在 田 间经 常 出 现 复 合 侵 染 , 同 一个 马铃 薯 样本 可 能 同 时携 带 多 种 病 毒 ,因此
R -C 方法来说不是最佳的 ̄ 4F TP R : 完成检测任务。 - 1 免疫捕 捉一 T P R检 测技术 . 4 R —C 免疫 捕 捉 一 T P R(C R — C 是 免 疫 学 技 R — C I— T P R)
术 与 R —C T P R技 术 相 结 合பைடு நூலகம்建 立 起 来 的 检 测方 法 。 N lc oa o等[ s 9 1 该 方 法对 马 铃薯病 毒 进 行 了检测 。 利用 I— T P R操 作 流程 :病 毒 粒 体经 特 异性 抗 体 免 C R —C 疫 捕 捉后 ,进 行 热变 性 ,然 后 进行 R — C T P R扩增
其 中分布广 泛 、危害 严重 的马 铃薯病 毒 有 马铃薯 x
病毒 ( V ) P X 、马铃 薯 Y病毒 ( V ) P Y 、马铃 薯 S病 毒
敏度提高了许多 ,但仍然存在不易检测含量极少的 韧皮部病毒等缺陷。因此 ,人们在马铃薯病毒的分 子 检测 技术 方面进 行 了大量 的研 究工 作 ,其 中 以反
吴兴泉p ,时 妍・ ,杨庆 东 ,李桂玲,
(1 河 南 工 业 大 学生 物工 程 学院 ,河 南 . 郑州 40 0 ;2 北 大荒 薯 业 集 团 公 司 九 三 分 公 司 , 黑 龙 江 50 1 . 嫩江 1 14 6 4 1)
摘
要:对应用于马铃薯病毒检测中 9种不同形式的 R - C T P R检测技术进行评述 ,重点讨论常规 R - C 、多重 TPR
法相 同的特异性 和灵 敏度 ,但 该方法 可 以在对常规
检测等 4 个步骤。在一个 P R反应 中只加入一对针 C 对某种病毒的特异性引物 , 完成一种病毒的检测 。 随 着 分子 生 物 学 实 验技 术 的提 高 ,常 规 R — T
P R检测 技 术 也 在 不 断 的得 到 改进 ,主 要 集 中在 C R — C 的 反应 程 序 和反 应 体 系 、病 毒 R A 的 提 TPR N 取 、P R产 物 的 检测 、P R检测 特异 性 的 提 高等 C C
和 电泳 检 测 。此 方 法 检 测 灵 敏 度 与 常 规 R — C TPR
方面 ,形成了如下一系列的新方法。 1 一步 R — C . 2 T P R检测技 术
一
’
步 R P R检测 技术将 常规 R - C 1 C T P R反 应程
收稿 日期 : 2 1— 4 0 0 lo—6
近 年 来 在 马铃 薯 病 毒 检 测 中应 用 的 R — C T P R技 术
及 以其为基 础 衍生 出来 的一些 分 子生物技术 进行评 述 ,以期 为进一 步的深入研究提供参考 。
基金项 目:河南省教育厅 自然科学基础研究项 目(0 6 10 3 ; 2 0 2 0 0 ) 河南工业大学校科研基金项 目 0 X C 0 ) ( 7 JO 8 。
渐 发展 成为 一类具 有 多种功 能 的检验 技术 。本 文对
(V )、马 铃 薯 A病 毒 (V )、马 铃 薯 卷 叶 病 毒 PS PA (L V 、马铃薯 M病毒 (v 等 。 PR ) P M)
当前 马铃薯病毒病 的防治 主要 是利用脱毒种 薯 ,在 脱 毒 种 薯 生 产 过 程 中 ,对 病 毒 进 行 快 速 、 准确 地 检 测 是 保 证 种 薯 质 量 的关 键 。 目前应 用 于
在进行病 毒检 测时 ,对 同一个 马铃 薯样本必 须进行
多种病 毒的检测 才能 确定其 是否带 毒 。在 马铃薯脱 毒 种薯 生产 中 ,依照 国家标 准的要求 必须确保 种薯 不 含P Y、P X、P R V V L V、P S S V V 、PT d等 4种病 毒 和1 种类 病毒 ,因此对一 个 马铃薯待测 样本需要 进 行 5次 P R C 检测 才能确定 其是 否合 格 ,如果有 大量
时 ,必 须 采用 R — C T P R技术 。 以马铃 薯 块 茎 或 叶 片等 组织 的 总 R A为模板 ,进行 反转 录后 ,利用 N 针 对病 毒 的特 异性 引 物 进 行 P R,扩 增 病 毒 的某 C 段基 因 ,如果 能够扩增 获得病 毒 的基 因 ,说 明该 马
待测样本就需要很大的工作量和试剂耗费。如果采 用 m— T P R则可 通过 一个 P R反 应完 成 对一个 R —C C 待测 样本 的多种病 毒 的同时检测 ,不但提 高检测效
Id sr o pCo Ld, is nB a c , e j n , eln j n 6 4 1 Chn n u t Gru . t.Ju a rn h N ni g H i gi g1 1 4 , ia) y a o a
Ah由_c:Nie kn so o ao vr s - l n id fp tt i e RT PCR ee t n meh d u d tci to swer e iwe , d te c n e t n l o e rve d an h o v n i a o RT —PCR,h te m ut l - lpe RT PCR n a-m e R PCR r s u s di eal. h e t c t ne e t f i a dr l e t T- i we edic s e d t i T e i n i a i f c n s d i f o o RT- CR ndf r t tan f P o ieen r iso s o evr sa d po lmso e p yo en t e o sr cinwe ea ay e . ep o lm si oaovr sRT PCR d tcin n i n rbe f h h lg e i t e c n tu t r n lz d Th r be p t t i - u t c r o n u ee t o tc n lg r loa ay e , n o o ne me s rsf rmp o igwe u r r c od n l. e h oo ywe eas n lz d a ds mec u tr a u e r vn r p towada c rigy o i e f K o d : t t i ; - eyW r s p aovr RT PCR; ee t n p o lm n o ne me s r o us d t ci ; r be a dc u t r a u e o
R - C 、R a t e T P R等方法。分析了 R - C T P R el i R - C -m T P R在 同种病毒不同株 系鉴定 中的应用效果及建立 系统进化树时应注 意的问题。对 R . C 1 P R技 术在马铃薯病毒检测中可能 出现的问题也进行 了分析 ,并提 出了应对策略。 -
作者简介:吴兴泉(9 0 ) 17 - ,男 ,教授 ,博士,研究方 向为植物病毒学与分子生物学。
通信 作 者 ( ors o dn uh r : 吴 兴 泉 ,E m i w x T @16tm。 C r p n iga to ) e — al u q O 2 . : o
中国马铃薯 ,第 2 卷 ,第 4 ,2 1 5 期 01
量 复制某段 特定 的 D A片段 ,在 扩增 目标 D A片 N N 段 时必 须 以 D A 为模 板 。如 果 利 用 该 技 术 扩 增 N R A基 因 ,则 须 先 将 R A反 转 录 ( T 为 c N N N R ) D A