在Ubuntu上安装最新版R的四种方法

在Ubuntu上安装最新版R的四种方法
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在Ubuntu上是不能直接通过 sudo apt-getinstall r-base的方式安装最新版本的R，直接运行的结果是安装R-3.4版本。

这是因为官方说这是比较稳定的版本，所以除非它的维护期结束，否则求稳R 3.4 packages for Ubuntu on i386 and amd64 are available for all stable Desktop releases of Ubuntu prior to Bionic Beaver (18.04) until their official end of life date. However, only the latest Long Term Support (LTS) release is fully supported. As of November 18, 2018 the supported releases are Xenial Xerus (16.04; LTS), and Trusty Tahr (14.04; LTS).
那么问题来了，如何在Ubuntu上安装比较新版本的R呢？这里推荐三种方法，给不同级别的人使用。

方法一: 首先介绍最简单的方法，也就是使用conda进行安装。

使用 conda search r-base在conda的频道中检索，
1....
2.r-base
3.5.1 hfb2a302_1009 anaconda/cloud/conda-forge
3.r-base 3.5.1 hfb2a302_1010 anaconda/cloud/conda-forge
4.r-base 3.6.0 hce969dd_0 pkgs/r
5.r-base 3.
6.1 h6e652e1_3 anaconda/cloud/conda-forge
6.r-base 3.6.1 h8900bf8_0 anaconda/cloud/conda-forge
7.r-base 3.6.1 h8900bf8_1 anaconda/cloud/conda-forge
8.r-base 3.6.1 h8900bf8_2 anaconda/cloud/conda-forge
9.r-base 3.6.1 hba50c9b_4 anaconda/cloud/conda-forge
10.r-base 3.6.1 hce969dd_0 pkgs/r
然后新建一个R运行环境安装
1.conda create -n r r-base
之后用 conda activate r调用R的环境即可。

这个方法的优点是不需要root权限，安装方便，不过听过在使用的时候或许会出现一些bug，我还没有遇到。

方法二: 第二个方法需要用到root权限，会稍微的复杂些。

第一步，确认你的Ubuntu版本，是Xenial Xerus(16.04; LTS), Trusty Tahr (14.04; LTS), Bionic Beaver (18.04;LTS), Cosmic Cuttlefish (18.10), Disco Dingo (19.04)的哪一种。

第二步，使用 sudo vim/etc/apt/sources.list增加新的R安装源。

你需要根据你的服务器Ubuntu版本，按照需求复制下面的其中一行代码（一定要注意，是一行，不是全部复制）
1.deb /bin/linux/ubuntu disco-cran35/
2.deb /bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/
3.deb /bin/linux/ubuntu bionic-cran35/
4.deb /bin/linux/ubuntu xenial-cran35/
5.deb /bin/linux/ubuntu trusty-cran35/
我的服务器是 xenial，所以增加的是
1.deb /bin/linux/ubuntu xenial-cran35/
之后，用下面的命令就可以安装最新的R
1.sudo apt-get update
2.sudo apt-get install r-base
3.sudo apt-get install r-base-dev
这个方法稍微麻烦些，据说通过这样子安装的R存在一些bug，不过我没有遇到。

方法三: 在root权限下，下载源代码进行编译安装。

这个方法稍
微会麻烦一些，因为有很多依赖环境要安装，通常是一边看到报错，一边解决报错。

根据我的经验，你至少先得用下面这些命令安装R的依赖环境（可能还不够）
1.# 设置环境变量
2.export CFLAGS=' -fPIC' CXXFLAGS=' -fPIC'
3.## build-essential
4.sudo apt-get install -y build-essential
5.## java
6.sudo apt install -y openjdk-9-jdk
7.## 各种包
8.sudo apt install -y autoconf libz-dev libbz2-dev liblzma-dev libssl-dev
9.# solve libcurl problem
10.#sudo apt install -y libcurl4-openssl-dev # not works for Ubuntu 16.04
11.sudo apt install -y libcurl4-gnutls-dev
12.### curses
13.sudo apt-get install -y libncurses5-dev
14.### solve X11 problem
15.sudo apt-get install -y xorg-dev
16.### zlib2
17.wget /zlib-1.2.11.tar.gz
18.tar -zxvf zlib-1.2.11.tar.gz && cd zlib-1.2.11 && ./configure && make && sudo make install && cd .. && rm -rf zlib-1.2.11
19.### bzip2
20.wget /linux/misc/bzip2-1.0.8.tar.gz
21.tar -zxvf bzip2-1.0.8.tar.gz && cd bzip2-1.0.8
22.# add -fPIC
23.sed -i 's/CFLAGS=/CFLAGS=-fPIC /' Makefile
24.make && sudo make install && cd .. && rm -rf bzip2-1.0.8
假如你使用的是conda用户，那么安装之前，你需要用先退出conda环境，不然libcurl
下载R的源代码，进行编译安装
1.wget /CRAN/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gz
2.tar -zxvf R-
3.6.1.tar.gz
3.cd R-3.6.1
4.# --enable-R-shlib for Rstudio server
5../configure --enable-R-shlib
6.make -j 8
7.make install
额外加餐：假如你不想使用conda，也没有root权限，想从源码安装最新的R语言，那么你需要看下这篇无root权限解决编译时的依赖问题, 这里就不再额外展开了，我觉得有Root和conda在，一般不会用到这招。

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