原核生物基因表达调控
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• 围绕基因表达过程中发生的各种各样的调节方式 都通称为基因表达调控。
• 在生物体生命活动中并不是所有的基因都同 时表达,在生物体代谢过程中所需要的各种 酶和蛋白质的基因以及构成细胞化学成分的 各种编码基因,在正常情况下是持续表达的, 而与生物发育过程有关的基因则要在特定的 时间和空间才进行表达。
CAP
I
RNPA pol O Z Y A
Primary structure of lac operon regulation region
Catabolite gene
activation protein site
5’ CACTCGATTGAGTGTAATTA
T
C
A
T
T
A G
RNA polymerase binding region or promoter region
(1)Lac阻遏物的作用---负调控
阻遏基因
DNA
I
pPol O Z Y A
mRNA
阻遏蛋白
2020/4/18
没有乳糖存在时
40
有乳糖存在时
DNA
I
mRNA
pPol O Z Y A
启动转录
mRNA
阻遏蛋白
异乳糖
乳糖
• 2020/4/18 乳糖操纵子为一个可诱导的负控制系统 42
(2)CAP的正性调节
与缺乏调控因子时比较,若调控因子使基因的表
达水平下降,甚至关闭,调控因子称阻遏蛋白 (repressor)
• 负调控可分为:
• 可诱导的负调控系统
• 阻遏蛋白与操纵基因结合,可阻止结构基因的转 录,但有诱导物时,它与阻遏蛋白结合从而解除 对结构基因转录的抑制。
• 可阻遏的负调控系统
• 阻遏蛋白不影响结构基因的转录,但它与辅阻遏
结构基因
衰减子区域
3
4
UUUU……
trp 密码子 终止密码子
第141a0a、前1导1密肽码编子码UU为区Ut:Ur包…p密含…U码序U子U列U1……衰减子结构 UUUU……
形成发夹结构能力强弱: 序列1/2>序列2/3>序列3/4
(a) 正常
12
5’ trp mRNA trpL
(b) 高 [Trp]
• 正调控可分为:
• 可诱导的正调控系统
调节因子在诱导物的作用下,能与启动子结合开启 结构基因的转录。
• 可阻遏的正调控系统
调节因子可与启动子结合,促进结构基因的转录。 但当其与辅阻遏物结合后,不能启动结构基因的转 录。
2020/4/18
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2020/4/18
15
• 负调控(negative regulation)
Z基因:与合成β-半乳糖苷酶有关;
I基因:决定细胞对诱导物的反应。
• 1961年, F. Jacob & J.Monod提出乳糖操纵子学 说, 此后不断完善。1965年获诺贝尔生理学和医 学奖。
Jacques Monod
Francis Jacob
2020/4/18
32
一、乳糖操纵子(lac operon)的结构与 组成
Inactive repressor
lacI- gene sythesizes defective repressor that does not bind to DNA
lacI- Operantor
Operon is transcribed and translated
β-半乳糖苷酶 透性酶 乙酰转移酶
1
2
(C) 低[Trp]
34
trpE
寡聚U区
34
转录终止
23
4
1
转录延伸
前导DNA
转录衰减机制
前导mRNA
1 5’
核糖体
RNA聚合酶
UUUU 3’
衰减子结构
就是终止子
4 可使转录 终止
3
2
34
UUUU 3U’UUU……
前导肽
trp 密码子
1.当色氨酸浓度高时
前导DNA 前导mRNA
Trp合成酶系相关 结构基因被转录
RNA聚合酶 结构基因
5’
前导肽
23
核1 糖体
2 43
4
UUUU…U…UUU……
trp 密码子 序列3、4不能形成衰减子结构
2.当色氨酸浓度低时
3 降解物对基因活性的调节
• 葡萄糖效应(降解物抑制作用) 是指当葡萄糖和其它糖类一起作为细菌
的碳源时葡萄糖总是优先被利用,葡萄糖的 存在阻止了其它糖类的利用的现象。
• 阻遏蛋白结构具有对称性,是相同亚基构成 的四聚体。
Active repressor
cannot bind to
O c mutant operantor
lacI O c operantor
Operon is transcribed and translated
β-半乳糖苷酶 透性酶 乙酰转移酶 图 16-7 操纵基因发生组成型突变,操纵子组成型表达
G
CACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGAGCGGA
-35 site
-10 site
5’ TATAAT 3’ Pribnow box
T
Operon region A
A
20bp
C
A
A
T
T
T
C
A
C
A
C 3’
(3)协调调节
• 当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能发挥 作用;
二、原核生物基因表达调控的特点与方式
(1)原核生物基因表达调控包括在DNA水平、转 录水平、转录后水平和翻译水平,但转录水平的调 节是最有效、最经济的方式,也是最主要的调节方 式。 (2)原核生物基因的表达调控多以操纵子为单位 进行,即将功能相关的基因组织在一起,同时开启 或关闭基因表达。 (3)基因调控的模式可分成两大类,正调控和负 调控,原核生物以负调控为主。
(1)时间特异性或阶段特异性
(2)空间特异性或组织细胞特异性
1 时间特异性
按功能需要,某一特定基因的表达严格按 特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间 特异性(temporal specificity)。
多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶 段特异性(stage specificity)。
2 空间特异性(spatial specificity)
• 如无CAP存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序列结 合,操纵子仍无转录活性。
• 单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源; • 若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时,细菌首
先利用葡萄糖。
低半乳糖时
葡萄糖低 cAMP浓度高
O
葡萄糖高 cAMP浓度低
O
高半乳糖时
RNA-pol
O
mRNA
O
二、阻遏蛋白的作用机制
结构基因
调节蛋白
mRNA 酶蛋白
负调控(negative control)
• 在没有调节蛋白质存在时基因是表达的,加入这 种调节蛋白质后基因表达活性便被关闭,这样的 调控负转录调控。
调节基因
操纵基因
结构基因
阻遏蛋白
不转录,基因封闭
• 正调控(positive regulation)
• 与缺乏调控因子时比较,若调控因子使靶基因的 表达水平上升。调控因子称激活蛋白(activator)
物结合后,抑制结构基因的转录。
2020/4/18
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2020/4/18
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四、原核生物基因表达调控机制
1 代谢产物对基因活性的调节
一些基因的特殊代谢产物对基因活性的调节具 有诱导或阻遏作用。
一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用下,由 原来关闭的状态转变为工作状态,即在某些物质的 诱导下使基因活化. 如乳糖操纵子,调节分解代谢的操纵子,同时受 cAMP-CAP的活性调节
三、原核生物基因表达调控的几个重要概念
• 结构基因:编码细胞结构和基本代谢活动所必要 的RNA和蛋白质的基因。
• 调节基因:编码合成那些参与基因表达调控的 RNA和蛋白质的特异DNA序列。调节基因编码的 调节物通过与DNA上的特定位点结合控制转录是 调控的关键。
• 顺式作用元件(cis-acting elements):调节基因表 达的DNA序列。
• 反式作用因子(trans-acting factors):调节基因 表达的蛋白质因子,可直接或间接结合顺式作用 元件。
• 正调控和负调控
正调控(positive control)
• 在没有调节蛋白质存在时基因是关闭的,加入某 种调节蛋白后基因活性就被开启,这样的调控为 正转录调控。
调节基因
操纵基因
阻遏基因
DNA
I
mRNA
阻遏蛋白
pPol O Z Y A
弱启动子控制的 组成型合成
Helix-turn-helix Core domain1 Core domain2
1
51
80
360
DNA binding Hinge
Inducer binding Oligomerization
图 16- 阻遏蛋白单体的结构和功能
调控区
结构基因
DNA
I P OZ YA
控制基因 启动子 阻遏基因
Z: β-半乳糖苷酶 Y: 透酶 A:乙酰基转移酶
Lac操纵子P、O区的重叠
乳糖操纵子模型
• Z、Y、A基因的产物为一条多顺反子mRNA
lacZ:编码β-半乳糖苷酶,它可以将乳糖水解为 半乳糖和葡萄糖; lacY:编码半乳糖苷透性酶,它能将乳糖运送透 过细菌的细胞壁; lacA:编码硫代半乳糖苷乙酰转移酶,进行乳糖 代谢。
第八章 原核生物基因表达调控概述
第一节原核生物基因表达调控概述
• 一、基因表达调控的意义
• 在一定调节机制控制下,基因通过转录和翻译而 产生其蛋白质产物,或转录后直接产生其RNA产 物,如tRNA、rRNA等的过程 。
• 大多数基因的表达产物是蛋白质,部分基因如 tRNA和rRNA基因表达产物是RNA。
乳糖操纵子的结构基因及其表达产物
二、酶的诱导-lac体系受调控的证据
1 实验证据
在不含乳糖及β-半乳糖苷的培养基中,lac+基因型 每个大肠杆菌细胞内大约只有1~2个酶分子。
如果在培养基中加入乳糖,酶的浓度很快达到细 胞总蛋白量的6%或7%,每个细胞中可有超过105 个酶分子。
CH2OH
CAP
RNA聚合酶结合
0
-35
-10
O
[ cAMP
无葡萄糖: cAMP (促进转录) 有葡萄糖: cAMP (不促进转录)
•代谢物阻遏效应
•研究认为葡萄糖的某些降解产物抑制lac mRNA 的合成,这种效应称之为代谢物阻遏效应。
葡 萄 糖 效 应
有葡萄糖,cAMP 浓度低时
CAP
I
RNPA pol O Z Y A
HO
O
H
O
OH H
H
HH
H
OH
H OH
OH H H
H
+ H2O
O OH
CH2OH
CH2OH
HO
O
H
OH H
H
H OH
H HO
OH H H
OH H
H
O OH
O CH2
别乳糖
CH2OH
H
O OH
H
OH H
+
HO
பைடு நூலகம்
H
H
OH
葡萄糖
CH2OH
HO
O OH
H
OH H
H
H
H OH
半乳糖
图 16- 乳糖分解的不同产物
转录水平上的调控 转录后水平上的调控
• 操纵子学说
1961年,法国巴斯德研究院的Francois Jacob (雅各布)与Jacques Monod(莫洛)提出, 获1965年诺贝尔生理学和医学奖。
操纵子(operon)
启动子 (promoter)
结构基因
调节基因
阻抑蛋白
操纵基因 (operator)
第二节 乳糖操纵子
• Discovery of Operon
Jacques Monod
• 1940年, Monod发现:细菌在含葡萄糖和乳糖的培养基 上生长时,细菌先利用葡萄糖,葡萄糖用完后,才利用乳 糖;在糖源转变期,细菌的生长会出现停顿。即产生“二 次生长曲线”。
31
• 1951年,Monod与Jacob合作,发现两基因:
• 降解物对基因活性的调节
• 葡萄糖通过降低cAMP的含量而抑制基因表达
4 细菌的应急反应
• 细菌的应急反应指细菌在恶劣生长环境中关闭 tRNA和核糖体形成的能力。
• 细菌的应急反应的机焦转制磷移酸酶
➢ 应急信号: 鸟苷四磷酸(ppGpp)、 鸟苷五磷酸(pppGpp)
➢ 诱导物:空载tRNA
2 弱化子对基因活性的影响
• 弱化子:在操纵基因与结构基因之间的一段可以终止
转录作用的核苷酸序列。当操纵子被阻遏时,RNA合 成被终止,这段核苷酸序列起终止转录信号作用。
UURUNUA聚…合…酶
•起调节作用的是某种氨酰-tRNA的浓度
• 弱化子作用机制
调节区
trpR
PO
前导序列
前导mRNA
1
2
图 16- lac I 发生突变,操纵子组成型表达
Inactive repressor
lacI- genesythesizes defective repressor that does not bind to DNA
• 在个体生长全过程,某种基因产物在个体 按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的 空间特异性(spatial specificity)。
• 基因表达伴随时间顺序所表现出的这种分 布差异,实际上是由细胞在器官的分布决定的, 所以空间特异性又称细胞或组织特异性(cell or tissue specificity)。
• 在生物体生命活动中并不是所有的基因都同 时表达,在生物体代谢过程中所需要的各种 酶和蛋白质的基因以及构成细胞化学成分的 各种编码基因,在正常情况下是持续表达的, 而与生物发育过程有关的基因则要在特定的 时间和空间才进行表达。
CAP
I
RNPA pol O Z Y A
Primary structure of lac operon regulation region
Catabolite gene
activation protein site
5’ CACTCGATTGAGTGTAATTA
T
C
A
T
T
A G
RNA polymerase binding region or promoter region
(1)Lac阻遏物的作用---负调控
阻遏基因
DNA
I
pPol O Z Y A
mRNA
阻遏蛋白
2020/4/18
没有乳糖存在时
40
有乳糖存在时
DNA
I
mRNA
pPol O Z Y A
启动转录
mRNA
阻遏蛋白
异乳糖
乳糖
• 2020/4/18 乳糖操纵子为一个可诱导的负控制系统 42
(2)CAP的正性调节
与缺乏调控因子时比较,若调控因子使基因的表
达水平下降,甚至关闭,调控因子称阻遏蛋白 (repressor)
• 负调控可分为:
• 可诱导的负调控系统
• 阻遏蛋白与操纵基因结合,可阻止结构基因的转 录,但有诱导物时,它与阻遏蛋白结合从而解除 对结构基因转录的抑制。
• 可阻遏的负调控系统
• 阻遏蛋白不影响结构基因的转录,但它与辅阻遏
结构基因
衰减子区域
3
4
UUUU……
trp 密码子 终止密码子
第141a0a、前1导1密肽码编子码UU为区Ut:Ur包…p密含…U码序U子U列U1……衰减子结构 UUUU……
形成发夹结构能力强弱: 序列1/2>序列2/3>序列3/4
(a) 正常
12
5’ trp mRNA trpL
(b) 高 [Trp]
• 正调控可分为:
• 可诱导的正调控系统
调节因子在诱导物的作用下,能与启动子结合开启 结构基因的转录。
• 可阻遏的正调控系统
调节因子可与启动子结合,促进结构基因的转录。 但当其与辅阻遏物结合后,不能启动结构基因的转 录。
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• 负调控(negative regulation)
Z基因:与合成β-半乳糖苷酶有关;
I基因:决定细胞对诱导物的反应。
• 1961年, F. Jacob & J.Monod提出乳糖操纵子学 说, 此后不断完善。1965年获诺贝尔生理学和医 学奖。
Jacques Monod
Francis Jacob
2020/4/18
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一、乳糖操纵子(lac operon)的结构与 组成
Inactive repressor
lacI- gene sythesizes defective repressor that does not bind to DNA
lacI- Operantor
Operon is transcribed and translated
β-半乳糖苷酶 透性酶 乙酰转移酶
1
2
(C) 低[Trp]
34
trpE
寡聚U区
34
转录终止
23
4
1
转录延伸
前导DNA
转录衰减机制
前导mRNA
1 5’
核糖体
RNA聚合酶
UUUU 3’
衰减子结构
就是终止子
4 可使转录 终止
3
2
34
UUUU 3U’UUU……
前导肽
trp 密码子
1.当色氨酸浓度高时
前导DNA 前导mRNA
Trp合成酶系相关 结构基因被转录
RNA聚合酶 结构基因
5’
前导肽
23
核1 糖体
2 43
4
UUUU…U…UUU……
trp 密码子 序列3、4不能形成衰减子结构
2.当色氨酸浓度低时
3 降解物对基因活性的调节
• 葡萄糖效应(降解物抑制作用) 是指当葡萄糖和其它糖类一起作为细菌
的碳源时葡萄糖总是优先被利用,葡萄糖的 存在阻止了其它糖类的利用的现象。
• 阻遏蛋白结构具有对称性,是相同亚基构成 的四聚体。
Active repressor
cannot bind to
O c mutant operantor
lacI O c operantor
Operon is transcribed and translated
β-半乳糖苷酶 透性酶 乙酰转移酶 图 16-7 操纵基因发生组成型突变,操纵子组成型表达
G
CACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGAGCGGA
-35 site
-10 site
5’ TATAAT 3’ Pribnow box
T
Operon region A
A
20bp
C
A
A
T
T
T
C
A
C
A
C 3’
(3)协调调节
• 当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能发挥 作用;
二、原核生物基因表达调控的特点与方式
(1)原核生物基因表达调控包括在DNA水平、转 录水平、转录后水平和翻译水平,但转录水平的调 节是最有效、最经济的方式,也是最主要的调节方 式。 (2)原核生物基因的表达调控多以操纵子为单位 进行,即将功能相关的基因组织在一起,同时开启 或关闭基因表达。 (3)基因调控的模式可分成两大类,正调控和负 调控,原核生物以负调控为主。
(1)时间特异性或阶段特异性
(2)空间特异性或组织细胞特异性
1 时间特异性
按功能需要,某一特定基因的表达严格按 特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间 特异性(temporal specificity)。
多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶 段特异性(stage specificity)。
2 空间特异性(spatial specificity)
• 如无CAP存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序列结 合,操纵子仍无转录活性。
• 单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源; • 若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时,细菌首
先利用葡萄糖。
低半乳糖时
葡萄糖低 cAMP浓度高
O
葡萄糖高 cAMP浓度低
O
高半乳糖时
RNA-pol
O
mRNA
O
二、阻遏蛋白的作用机制
结构基因
调节蛋白
mRNA 酶蛋白
负调控(negative control)
• 在没有调节蛋白质存在时基因是表达的,加入这 种调节蛋白质后基因表达活性便被关闭,这样的 调控负转录调控。
调节基因
操纵基因
结构基因
阻遏蛋白
不转录,基因封闭
• 正调控(positive regulation)
• 与缺乏调控因子时比较,若调控因子使靶基因的 表达水平上升。调控因子称激活蛋白(activator)
物结合后,抑制结构基因的转录。
2020/4/18
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四、原核生物基因表达调控机制
1 代谢产物对基因活性的调节
一些基因的特殊代谢产物对基因活性的调节具 有诱导或阻遏作用。
一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用下,由 原来关闭的状态转变为工作状态,即在某些物质的 诱导下使基因活化. 如乳糖操纵子,调节分解代谢的操纵子,同时受 cAMP-CAP的活性调节
三、原核生物基因表达调控的几个重要概念
• 结构基因:编码细胞结构和基本代谢活动所必要 的RNA和蛋白质的基因。
• 调节基因:编码合成那些参与基因表达调控的 RNA和蛋白质的特异DNA序列。调节基因编码的 调节物通过与DNA上的特定位点结合控制转录是 调控的关键。
• 顺式作用元件(cis-acting elements):调节基因表 达的DNA序列。
• 反式作用因子(trans-acting factors):调节基因 表达的蛋白质因子,可直接或间接结合顺式作用 元件。
• 正调控和负调控
正调控(positive control)
• 在没有调节蛋白质存在时基因是关闭的,加入某 种调节蛋白后基因活性就被开启,这样的调控为 正转录调控。
调节基因
操纵基因
阻遏基因
DNA
I
mRNA
阻遏蛋白
pPol O Z Y A
弱启动子控制的 组成型合成
Helix-turn-helix Core domain1 Core domain2
1
51
80
360
DNA binding Hinge
Inducer binding Oligomerization
图 16- 阻遏蛋白单体的结构和功能
调控区
结构基因
DNA
I P OZ YA
控制基因 启动子 阻遏基因
Z: β-半乳糖苷酶 Y: 透酶 A:乙酰基转移酶
Lac操纵子P、O区的重叠
乳糖操纵子模型
• Z、Y、A基因的产物为一条多顺反子mRNA
lacZ:编码β-半乳糖苷酶,它可以将乳糖水解为 半乳糖和葡萄糖; lacY:编码半乳糖苷透性酶,它能将乳糖运送透 过细菌的细胞壁; lacA:编码硫代半乳糖苷乙酰转移酶,进行乳糖 代谢。
第八章 原核生物基因表达调控概述
第一节原核生物基因表达调控概述
• 一、基因表达调控的意义
• 在一定调节机制控制下,基因通过转录和翻译而 产生其蛋白质产物,或转录后直接产生其RNA产 物,如tRNA、rRNA等的过程 。
• 大多数基因的表达产物是蛋白质,部分基因如 tRNA和rRNA基因表达产物是RNA。
乳糖操纵子的结构基因及其表达产物
二、酶的诱导-lac体系受调控的证据
1 实验证据
在不含乳糖及β-半乳糖苷的培养基中,lac+基因型 每个大肠杆菌细胞内大约只有1~2个酶分子。
如果在培养基中加入乳糖,酶的浓度很快达到细 胞总蛋白量的6%或7%,每个细胞中可有超过105 个酶分子。
CH2OH
CAP
RNA聚合酶结合
0
-35
-10
O
[ cAMP
无葡萄糖: cAMP (促进转录) 有葡萄糖: cAMP (不促进转录)
•代谢物阻遏效应
•研究认为葡萄糖的某些降解产物抑制lac mRNA 的合成,这种效应称之为代谢物阻遏效应。
葡 萄 糖 效 应
有葡萄糖,cAMP 浓度低时
CAP
I
RNPA pol O Z Y A
HO
O
H
O
OH H
H
HH
H
OH
H OH
OH H H
H
+ H2O
O OH
CH2OH
CH2OH
HO
O
H
OH H
H
H OH
H HO
OH H H
OH H
H
O OH
O CH2
别乳糖
CH2OH
H
O OH
H
OH H
+
HO
பைடு நூலகம்
H
H
OH
葡萄糖
CH2OH
HO
O OH
H
OH H
H
H
H OH
半乳糖
图 16- 乳糖分解的不同产物
转录水平上的调控 转录后水平上的调控
• 操纵子学说
1961年,法国巴斯德研究院的Francois Jacob (雅各布)与Jacques Monod(莫洛)提出, 获1965年诺贝尔生理学和医学奖。
操纵子(operon)
启动子 (promoter)
结构基因
调节基因
阻抑蛋白
操纵基因 (operator)
第二节 乳糖操纵子
• Discovery of Operon
Jacques Monod
• 1940年, Monod发现:细菌在含葡萄糖和乳糖的培养基 上生长时,细菌先利用葡萄糖,葡萄糖用完后,才利用乳 糖;在糖源转变期,细菌的生长会出现停顿。即产生“二 次生长曲线”。
31
• 1951年,Monod与Jacob合作,发现两基因:
• 降解物对基因活性的调节
• 葡萄糖通过降低cAMP的含量而抑制基因表达
4 细菌的应急反应
• 细菌的应急反应指细菌在恶劣生长环境中关闭 tRNA和核糖体形成的能力。
• 细菌的应急反应的机焦转制磷移酸酶
➢ 应急信号: 鸟苷四磷酸(ppGpp)、 鸟苷五磷酸(pppGpp)
➢ 诱导物:空载tRNA
2 弱化子对基因活性的影响
• 弱化子:在操纵基因与结构基因之间的一段可以终止
转录作用的核苷酸序列。当操纵子被阻遏时,RNA合 成被终止,这段核苷酸序列起终止转录信号作用。
UURUNUA聚…合…酶
•起调节作用的是某种氨酰-tRNA的浓度
• 弱化子作用机制
调节区
trpR
PO
前导序列
前导mRNA
1
2
图 16- lac I 发生突变,操纵子组成型表达
Inactive repressor
lacI- genesythesizes defective repressor that does not bind to DNA
• 在个体生长全过程,某种基因产物在个体 按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的 空间特异性(spatial specificity)。
• 基因表达伴随时间顺序所表现出的这种分 布差异,实际上是由细胞在器官的分布决定的, 所以空间特异性又称细胞或组织特异性(cell or tissue specificity)。