猪Myf5基因外显子1的多态性分析
高坡猪肌肉生长抑制素基因多态性及其与肉质性状的相关性分析
单核苷酸多态性"#进行研究!运用 N?NN0&'&软件分析 48D? 基因 NQ? 与肉质性状的关联性&结果表明!仅
在高坡猪 48D? 基因第*外显子(*79处检测到%个 J%Z 突变位点!该突变为同义突变!未引起编码 氨 基 酸 的 改 变&基因型分析发现!仅有*个个体在该位点发生突变!JJ 基 因 型 为 优 势 基 因 型!J 为 优 势 等 位 基 因!无 ZZ 纯 合
"%'贵州大学动物科学学院!高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室!贵阳 22&&02( 0'正安县畜牧产业发展办公室!遵义 2(*)&&(*'贵州省安顺市畜牧技术推广站!安顺 2(%&&&#
摘!要为了探讨肌肉生长抑制素"E6#M545$-!HNZQ#基因的 多 态 性 对 高 坡 猪 肉 质 性 状"水 分'粗 脂 肪'粗 蛋 白 质' 粗灰分'眼肌面积'大理石纹'9\'肉色'嫩度'滴水损失'失水率#的 影 响!试 验 以 48D? 基 因 作 为 肉 质 性 状 候 选 基 因!以%&月龄的2&头高坡猪为研究对象!采用 ?JK 扩增产物直接测序的方法对高坡猪 48D? 基因*个外显子的
收 稿 日 期 0&%(!%%!*& 基金项目高坡猪种质资源利用与高效养殖模式研究"黔科合 QC 字)0&%&**&2&号# 作 者 简 介 易 恒 洁 "%1R/!#!女 !重 庆 人 !硕 士 !助 理 畜 牧 师 !研 究 方 向 $品 种 改 良 !I!E4$G$6$F;-8+$;2&0!%(*',#E " 通 信 作 者 李 ! 辉 "%1/R!#!女 !山 东 高 唐 人 !博 士 !教 授 !研 究 方 向 $动 物 遗 传 育 种 与 繁 殖 !I!E4$G$;GG;-G$FY$!M$-4',-
猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的克隆、表达与免疫印迹
新疆农业大学学报 2008,31(4):83~86Journal of Xinj iang Agricultural U niversity文章编号:1007 8614(2008)04 0083 04猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的克隆、表达与免疫印迹刘 焕1,2,冉多良1,王一成2,袁秀芳2,徐丽华2(1.新疆农业大学动物医学学院,乌鲁木齐 830025; 2.浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,杭州 320021)摘 要: 将猪繁殖与呼吸综合征病毒O RF5基因克隆入原核表达载体pET 28a(+)的多克隆位点中,经鉴定后得到重组质粒pET O RF5,将此重组质粒分别转化到受体菌E.coli BL21(DE3)中,并用诱导剂I PT G进行诱导表达, 2h后表达达到高峰。
经15%SDS P AG E电泳检测,表达得到的蛋白大小约为13.75kD。
经W est ern Blott ing分析,表达蛋白能与P RRSV阳性猪血清发生特异性反应,而与阴性血清不反应,具有较好的免疫原性,为研究PRRSV亚单位疫苗奠定了基础。
关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒;OR F5;克隆;表达中图分类号:Q786 文献标识码:ACloning,Expression and Immunity Blot of ORF5of PRRSV LIU H uan1,2,RAN Duo liang1,WAN G Yi cheng2,YU AN Xiu fang2,XU Li hua2(1.Co lleg e of Animal M edicine,Xinjiang Agricultural University,U rumqi830025;2.Zhejiang Academy of Ag ricultural Sciences,H angzho u320021)Abstract: T he ORF5g ene of PRRSV w as amplified by PCR w ith a size of375bp.The amplified DNA frag ment w as cloned into pM D18 T,and sequenced.T he result of sequencing show ed that the consistency w as98%compared w ith that of standard strains.Inserted in pET 28a(+),and transform ed in Escher ichia coli BL21(DE3),the frag ment w as ex pressed after induced w ith IPT G.The results of SDS PA GE and Wester n Blotting show ed that the protein w as13.75kD in size and specifically reacted w ith PRRSV posi tive sera from pigs,not neg ative sera.T hese r esults become the base o f researching and producing no vel vaccine and developing effectiv e diagnostic method.Key words: PRRSV;ORF5;cloning;ex pr ession猪繁殖与呼吸综合征(Por cine r eproductive and respiratory sy ndrome,PRRS)以母猪繁殖障碍、仔猪的呼吸道症状和高死亡率为特征,特别是感染本病后容易导致免疫抑制而继发其他疾病[1,2]。
山羊Myf-5、Pit-1基因多态性与生产性状的关联性分析
北 农 学报 ・ 2 01 3, 2 8 ( 3): 43 — 4 7
山羊 My f - 5 、 P i t — 基 因 多态性 与 , 2种 基 因型 在 这 3个 体 尺 指 标 的 大 小 排 列 顺 序 均 为 A A >A B 。推 测 P i t . 基 因对 山 羊 生 长 性 能
存 在 一定 影 响 , 提示 A A基 因 型 可 作 为 分 子 标 记 用 于 预 测 山羊 生 产 性 状 。 关键词 : 山羊 ; P i t — J ; M y f - 5 ; S S C P ; 生 产 性 状 中图分类号 : ¥ 8 2 6 文献标识码 : A 文章编号 : 1 0 0 0— 7 0 9 1 ( 2 0 1 3 ) 0 3— 0 0 4 3— 0 5
b o d y w e i g h t a n d b o d y m e a s u r e m e n t t r a i t s w e r e a l s o e s t i m a t e d . T h e r e w a s n o p o l y mo r p h i s m i n e x o n 1 o f My f - 5 g e n e i n t h r e e g o a t b r e e d s , a n d o n e S N P( A / G)a n d t w o g e n o t y p e s( A A a n d A B)w e r e d e t e c t e d , t h e A w a s t h e p r e d o mi -
并存 在 A A和 A B 2种 基 因 型 , A等 位 基 因 为优 势 等 位 基 因 。最 小 二 乘 分 析 结 果 表 明 , A A 基 因 型 有 较 高 的 产 绒 量 和 体
猪myostatin基因5‘调控区的酶切多态性分析
S r i等 用 P R—RF P法 发 现 在 该 基 因 tal C L
转 录 起 始 位 点 上 游 3 5 p处 存 在 着 T— A 突 6b
变 。姜 运 良 用 P R—S C C S P方 法 也 检 测 到
p超 家 庭 , 骨 骼 肌 生 长 的 负 调 控 因子 , 是 最
样 品 的 浓 度 和 纯 度 . 其 0D: / 均 在 OD 。 18 . 0左 右 . 可 用 于 P R 反 应 。 C
T A T 一 3’.R :5’ C
表 现 出酶 切 片 段 多 态 性 。 本文 利 用 这 一 酶 切
位 点 的变 化 ,对 民 猪 、大 白 、长 白 、杜 洛 克 、
军 牧 I 进 行 RF P分 析 ,以 揭 示 该 基 因 与 号 L
猪 肌 肉发 育 的关 系 。
1 材 料 与 方 法
1 1 材 料 .
东
北
农
业
大
学
学
报
3 3卷
1 2 b ,覆 盖 整 个 5 0 4p ’调 控 区 ,其 序 列 如 下 :
F : 5’ 一 T CT A ( G GC A A T G G ; A C CA T
2 结 果 与 分 析
2 1 基 因组 DNA 的 提 取 及 P . CR 扩 增 用 0 7 的 琼 酯 糖 凝 胶 电 泳 对 所 提 的 .0 DNA 进 行 质 量 检 测 . 紫 外 下 可 见 一致 密 条 带 , 一 降 解 。紫 外 分 光 光 度法 检 测 _ D 无 r NA
测的 4 0头 军 牧 I号 的 等 位 基 因全 部 是 T,民猪 3种 基 因 型 均 有 , 频 率 近 乎 相 等 。 计 分 析 表 明 . 且 统 3种 基 因 型 的 分 布 在 长 白、大 白 、杜 洛 克 、军 牧 I号 间 差 异 不 显 著 , 民 猪 同 这 4个 品 种 问 的 差 异 而 极 显著 。
恩施黑猪PTGFR基因SNP检测及遗传多态性分析开题报告
恩施黑猪PTGFR基因SNP检测及遗传多态性分析开题报告长江大学毕业设计(论文)开题报告题目名称恩施黑猪PTGFR基因SNP检测及遗传多态性分析题目类别毕业论文学院(系)动物科学学院专业班级动科31002班学生姓名毕四海指导教师杨军辅导教师罗家琴开题报告日期2013年12月7日恩施黑猪PTGFR基因SNP检测及遗传多态性分析学生:毕四海长江大学动物科学学院指导教师:杨军长江大学动物科学学院1 题目来源本题目来自于生产实践。
2 研究目的和意义猪肉是我国人民膳食结构中动物蛋白的主要来源,在猪的许多经济性状中,除生长速度、饲料利用率和瘦肉率以外,繁殖性状也是影响养猪生产与经济效益的基本因素。
猪的繁殖性能作为衡量其生产力的重要标准,它由几个主基因或数量性状位点控制,妊娠期是繁殖性状中的一个重要的指标,通过缩减妊娠期可以提高猪的生产性能,但是单纯的通过表型是很难进行选择的,并且利用常规的选择方式所需要的时间周期也是特别长的。
利用分子技术来对猪的妊娠期性状进行选择将会大大提高选择的效率和准确率。
在过去的半个世纪里,通过常规育种技术,猪的许多重要经济性状都在遗传上得到了很好的改良(如瘦肉率,背膘厚等),但对繁殖性状的改良却十分有限,这主要是因为该性状遗传力低,受环境因素影响大。
几十年来,西方猪种在此性状上的改进效果很小,传统的育种方法其育种周期长,遗传进度小,因此开发和利用新的选育标记来提高猪的繁殖性能就倍受重视。
前列腺素F2α(PTGF2α)在哺乳动物繁殖过程中起重要作用,它与排卵、黄体溶解、分娩、子宫平滑肌收缩等生理过程密切相关。
在分娩早期母猪就通过PGF2α调控大脑与子宫的相互作用从而引起产前行为的改变。
本研究拟建立恩施黑猪前列腺素F2α受体基因(PTGFR)多态性检测的PCR-RFLPs方法,对恩施黑猪前列腺素F2α受体基因(PTGFR)多态性进行检测,同时与妊娠期短的清平猪前列腺素F2α受体基因(PTGFR)多态性进行对比,为猪妊娠期的分子遗传调控研究奠定基础。
猪GPX5基因、FUT1阳基因和NCOA1基因的多态性分析
析 相 应 基 因的 遗 传 效 应 。
关 键 词 : ; P 5基 因 ; 基 因 ; C A 猪 GX F " N O 1基 因 ; C F P PRR L
中图 分 类 号 :76 Q 8
文 献 标 识 码 : A
文 章 编 号 :00—79 (0 80 0 6 —0 10 0 120 )4— 0 9 3
ds , P 5 基 因 、 藻 糖 转 移 酶 1 F csha s r e , f ) 因 和核 受 体 辅激 活 蛋 白 1 N c a r et Oat a r , a 5GX ) e 岩 ( uo r f a 1 F, 基 y nes " ( ul r e po C.c v t e c r i o1
维普资讯
^ C 1 ^ I RC tU i I IU l Rl B e B R A ISH C O E L- I IA
华 北 农 学 报 ・ 0 8, 3 4) 6 . 2 0 2 ( : 9 71
猪 G X P 5基 因 、 F 基 因和 NC A1基 因 的 O 多态 性 分 析
.
赵 金凤 张 冬 杰2 谷 溪 谢 雨 彤 刘 娣 1 , , , , , 2
10 3 ; . 龙 江 省 农业 科 学 院 , 龙 江 哈 尔 滨 500 2 黑 黑 108 ) 506
( 北 农 业 大 学 动 物科 学技 术 学 院 , 龙 江 哈 尔 滨 1东 黑
摘要 : 采用 P R R L C . FP法 对 大 白猪 、 洛 克 、 白猪 、 猪 和 野 家 杂 交 猪 的 谷 胱 甘 肽 过 氧 化 物 酶 5 Gua i .eoi 杜 长 民 ( 1th nPr . to x
sri so i r e oy e yPCR—RFL Th tan n ov d wee L n rc r s ie, r c, n p ga d C o s rd tan fpg weeg n tp d b P. e sr isi v le r a d a eYok hr Du o Mi i n r sb e
猪FATP1基因5'调控区多态性及其与脂肪性状的相关分析
8 9
华绪川 , 张立凡 , 蔡兆伟 , 等.猪 F T 1 冈 5调控 区多态性及其 与 肪性状 的相关分析[ ]江 苏农业学报 , 1 , ( )8 -3 AP 基 脂 J. 2 12 1 : 9 0 7 9
Hale Waihona Puke 猪 基 因 5 调 控 区 多 态 性 及 其 与 脂 肪 性 状 的
相 关 分 析
, , 华绪 川 张 立凡 蔡 兆伟 蒋 晓玲 徐 宁迎 张金 枝 一, , ,
( 江 大 学 动 物 科 学 学 院 , 江 杭 州 3 02 ;2 浙 江 省 畜 牧 兽 医 局 , 江 杭 州 30 2 ) 浙 浙 10 9 . 浙 10 0
c e H n zo 10 0, hn ) i , a gh u3 0 2 C ia n
Abtat Ft c aso rtn1(A P )i am m e f A P , h hp y nipr n b l i l o s c: ayai t npr po i r t dr t e F T 1 s e br T s w i l s o at io c l i oF c a a m t o g aren
.
s d ,p ra a kn e o + 4 一 2 p fteprieF P eew s e un e n eew so esn l n eet e t y at 5 f n igrg n( 6 ~ 73b )o ocn AT 1gn a q e cda dt r a n ige uloi u i l l i h s h d
p l op i ( N ) t 56 b . i m t i a 一 C a d ic u ercg i db s i i n o u l s h .T e o m rh m S P a 一 8 p T s u t n w s ÷ n o l b o z y r t c o e d n e aeH a I h y s h ao T t d e n e e rt n e
猪TYR基因外显子1的克隆测序及序列分析
猪TYR基因外显子1的克隆测序及序列分析白小青 ,王金勇(重庆市养猪重点实验室,重庆市养猪科学研究院,重庆荣昌 402460)[摘要]本研究对荣昌猪和内江猪的TYR基因外显子1进行了克隆测序及序列分析,结果发现3个新的突变位点:319C→T,537C的插入,551A→G。
部分突变序列已被GenBank收录,登录号为 :AY236997。
将突变序列翻译成氨基酸序列后发现,319C→T和551A→G是同义突变。
537C的插入是移码突变,其是否会对猪的毛色造成影响,还有待进一步研究。
[关键词]酪氨酸酶基因;序列分析Cloning , Sequencing and Sequence Analysis of exon1 of Tyrosinase Gene in PigBai Xiaoqing Wang Jinyong(Chongqing Swine Science Academy , Rongchang Chongqing , 402460,China)Abstract In the paper,The sequences of exon1 of tyrosinase gene were cloned and analysed in Rongchang pig and Neijiang pig. As a result, three new point mutations( 319C→T,The insertion of 537C,551A→G) were observed. Part mutated sequence was recepted by GenBank and the accessin number was AY236997. The DNA sequences were translated into amino acid sequences and the result showed the displace mutations (319C→T and 551A→G) beloned synonymous mutations and the insertion mutation was frame mutation. Wether the insertion mutation affect coat color or not ,which needed to be deeply studied.Key words tyrosinase gene ; sequence analysis引言猪的各种毛色表型是由黑色素在毛皮质和髓质中沉积的种类和数量的不同造成的。
猪MyoG基因外显子1的多态性分析
收稿日期:2020 ̄02 ̄26基金项目:山西省 1331 工程重点学科项目(098-091704)ꎻ山西省高等学校科技创新项目(2019L0878)作者简介:孙奴奴(1980 ̄)ꎬ女ꎬ山西临汾人ꎬ运城学院生命科学系讲师ꎬ博士ꎬ研究方向为猪的抗病育种ꎮ猪MyoG基因外显子1的多态性分析孙奴奴ꎬ刘㊀瑾(运城学院生命科学系ꎬ山西运城044000)㊀㊀摘㊀要:MyoG基因对成肌细胞的融合和肌纤维的形成有影响ꎬ因此对肌肉的分化起重要作用ꎮ本实验采用PCR-SSCP技术分析MyoG基因在晋汾白猪和新山西黑猪中的多态性ꎬ并对基因型进行统计分析ꎮ结果显示ꎬMyoG基因在晋汾白猪中有三种基因型:AB㊁BB㊁AAꎬ其中A等位基因为优势等位基因ꎬ新山西黑猪中也存在AB㊁BB㊁AA三种基因型ꎬ且B等位基因为优势等位基因ꎮ群体遗传学分析得出ꎬ晋汾白猪和新山西黑猪中MyoG基因多态性位点均不符合Hardy-Weinberg平衡(p<0.05)ꎻ晋汾白猪的香农指数为0.6928ꎬ新山西黑猪的香农指数为0.6903ꎬ说明晋汾白猪的遗传多态性高于新山西黑猪ꎮ用SAS8.1软件进行基因型分布差异分析ꎬMyoG基因多态位点在晋汾白猪和新山西黑猪中基因型分布差异极显著(χ2=36.2080ꎬp<0.0001)ꎮ通过分析两个猪种MyoG基因的多态性ꎬ为提高猪肉肉质和猪的人工选育提供依据ꎮ关键词:MyoG基因ꎻ晋汾白猪ꎻ新山西黑猪ꎻPCR-SSCP中图分类号:S828.8+9㊀文献标志码:A㊀㊀文章编号:1008 ̄8008(2020)03 ̄0005 ̄04㊀㊀我国畜牧业中养猪业占主导地位ꎬ全国猪肉产量不断地增加ꎬ在我国肉类总生产量中占了很大的比例ꎮ消费者对猪肉肉质的要求提高ꎬ不仅对猪肉的风味㊁嫩度有要求ꎬ对猪肉的营养价值也有更高的要求ꎮ国内外对于如何改善猪肉肉质做过大量研究ꎬ其中发现可以通过对肌肉生长的调节ꎬ改善猪肉品质ꎮ而MyoG基因控制肌细胞的增殖与分化ꎬ可以增加肌肉的生长速度ꎮ肌细胞生成素(MyoG)是生肌调节因子家族中的一员[1]ꎬ在生肌调节因子家族中只有MyoG基因可以在所有骨骼肌细胞系中表达ꎬ它在胚胎发育中控制中胚层干细胞分化定向形成肌细胞ꎬ以促进肌纤维的形成ꎬ从而控制肌肉的形成[2]ꎮMyoG基因不仅能对自身基因的表达进行调节ꎬ还可以与生肌因子家族中MyoD㊁Myf-5㊁Myf-6等基因相互作用ꎬ对彼此基因的表达进行调节ꎬ调节肌肉中肌球蛋白轻链基因㊁肌肉肌酸激酶㊁肌钙蛋白等特异基因的表达ꎮ所以肌肉的形成㊁肉质及产量都受到MyoG基因遗传变异的影响ꎬ该基因的遗传变异直接导致肌肉的变异[3]ꎮ国内外相关研究表明MyoG基因调节肌细胞分化成为肌纤维ꎬ与肉质的生成有一定的联系ꎮ刘梅等用PCR-RFLP技术对申农Ι号猪的MyoG基因的两个多态性位点(3 端和第二内含子内)进行分析ꎬ研究发现AA基因型和MN基因型分别为两个位点的优势基因型[4]ꎮ在滇南小耳猪MyoG基因多态性分析中发现2041ꎬ2047这两个位点的多态性对背膘厚㊁pH24有显著影响ꎬ对瘦肉率有极显著影响ꎻ1655ꎬ1688这两个位点多态性对瘦肉率和pH24有显著影响ꎬ对背膘厚有极显著影响[5]ꎮ程广龙等[6]对长淮猪㊁大淮猪㊁杜淮猪和淮猪的MyoG基因进行研究ꎬ结果显示胴体质量㊁瘦肉率㊁眼肌面积等性状与股二头肌的肌纤直径分别呈显著正相关ꎮ高勤学等[7]对申农I号猪MyoG基因进行多态性分析ꎬ发现具有NN基因型的猪初生重显著高于其他基因型猪ꎬ并且具有不同基因型的猪ꎬ它的半腱肌和半膜肌的肌纤维密度差异显著ꎬ其中NN基因型肌纤维密度高于NM和MM基因型ꎮTePas等[8]用PCR-RFLP技术对MyoG基因的多态性进行了检测ꎬ结果显示有3个突变位点:其中ꎬ一个是在实验中研究的所有猪种共同特有的ꎬ一个是杜洛克猪和长白猪特5有的ꎬ另一个是梅山猪特有的ꎮ实验结果表明猪初生重㊁肌纤维数与这三个变异位点有一定的关联ꎮHuges等人的研究中发现ꎬMyoD和MyoG基因在肌纤维中的表达不同ꎬMyoD基因在快肌纤维中的表达量比较高ꎬ而MyoG基因在慢肌纤维中的表达量比较高ꎮ因此ꎬMyoG基因与肉质的风味和嫩度有关联[9]ꎮ另外在其他物种的MyoG基因也有类似研究ꎬ鸡MyoG基因可以调节肌纤维的形成ꎬ对边鸡的生长有影响[10]ꎮ对牦牛的MyoG基因进行多态性分析ꎬ发现有4个突变位点与牦牛的体高有显著影响[11]ꎮ对6个绵羊群体进行多态性分析ꎬ发现含有三种基因型ꎬMyoG基因对羊肉的水分和色泽有影响ꎬ在水分的表达中BB>AB>AAꎻ在色泽的表达中AB>BB>AA[12]ꎮ本实验选用晋汾白猪和新山西黑猪作为实验动物ꎬ采用PCR-SSCP的方法检测MyoG基因多态性并判定基因型ꎬ利用统计分析软件计算出基因频率和基因型频率ꎬ分析其基因型在两猪种中的分布状况ꎬ为研究MyoG基因对晋汾白猪㊁新山西黑猪肉质影响提供一些材料ꎬ为人工选育优良猪种提供依据ꎬ对如何生产出优质猪肉有重要指导意义ꎮ1.材料与方法1.1实验动物本实验选用山西省运城市新龙丰畜牧有限公司提供的40头晋汾白猪和40头新山西黑猪ꎬ分别采集两个猪种的猪耳组织1.0gꎬ放入装有75%无水乙醇的离心管中并标号ꎬ放入冰盒中带回实验室ꎬ在-20ħ冰箱保存ꎮ1.2主要试剂与仪器设备PCRmixꎬ琼脂糖ꎬ溴酚蓝ꎬ冰醋酸ꎬEBꎬ甘油ꎬDNAMarkerꎬ丙烯酰胺ꎬ过硫酸铵ꎬ亚甲叉双丙烯酰胺ꎬ硼酸ꎬTrisbaseTEMED等(购自北京华越洋生物工程有限公司)ꎻ引物合成(上海生物工程技术服务有限公司)ꎻPCT-200PCR仪(BIO-RAD公司)ꎻDYCZ-28D双板夹芯式垂直电泳仪ꎬDYY-6C恒温恒压电泳仪(北京六一生物科技有限公司)ꎻTanon-3500数码凝胶图像分析系统(武汉爱斯佩科学仪器有限公司)ꎻTGL-16M高速台式冷冻离心机(湖南湘仪实验室仪器开发有限公司)ꎮ1.3试验方法1.3.1基因组DNA提取及引物合成使用酚/氯仿/异戊醇/的方法提取猪基因组DNAꎻ根据Genebank发表的猪MyoG基因序列(U14331)并参考郭云雁[13]等人的实验进行设计引物ꎬ并由上海生工生物工程技术服务有限公司合成ꎮ1.3.2PCR及SSCP以DNA为模板进行PCR扩增ꎬ10微升反应体系为:DNA(0.5微升)ꎬ上游引物(0.2微升)ꎬ下游引物(0.2微升)ꎬ2ˑTaqPCRMasterMix(5微升)ꎬ双蒸水(4.1微升)ꎻPCR反应程序为:预变性95ħꎬ5minꎬ94ħ变性30sꎬ50ħ退火30sꎬ72ħ延伸30sꎬ35个循环ꎬ72ħ后延伸5minꎻPCR产物取其中的2微升用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测ꎬ然后将检测成功的PCR产物ꎬ取4微升与6微升6ˑLoadingBuff ̄er混匀ꎬ在98ħ条件下变性10minꎬ迅速冰镇10min后上样ꎬ在12%的聚丙烯酰胺凝胶中400Vꎬ预电泳10minꎬ然后将电压调为200Vꎬ电泳16hꎬ然后银染20minꎬ显影10~20minꎻ最后利用凝胶成像系统拍照并判别基因型ꎮ1.3.3数据的统计处理基因型结果利用PopGen32软件进行群体遗传学分析ꎬ并利用SAS8.1统计软件进行卡方检验ꎮ2.结果与分析2.1PCR产物琼脂糖凝胶电泳结果利用晋汾白猪㊁新山西黑猪的DNA和MyoG引物进行PCR扩增ꎬ然后在1.5%的琼脂糖凝胶上点样ꎬ对PCR产物进行检测ꎬ结果如图1所示ꎮ图1㊀PCR产物检测结果(注:M为DL20000makerꎬ1~10为扩增结果)如图1所示ꎬMyoG基因PCR扩增产物长度为300bpꎬ条带明亮清晰ꎬ没有杂带ꎬ可进行后续实验ꎮ2.2PCR-SSCP结果用12%聚丙烯酰胺凝胶电泳对晋汾白猪和新山西黑猪的PCR产物进行SSCP检测ꎬ结果如图2和图3所示ꎮ如图2所示ꎬ电泳条带比较清晰ꎬMyoG基因在晋汾白猪中存在多态性ꎬ基因型为:1~7和11为AB型ꎬ8㊁10为AA型ꎬ9为BB型ꎮ如图3所示ꎬ电泳条带比较清晰ꎬMyoG基因在新山西黑猪中存在多态性ꎬ基因型为:3㊁4㊁6㊁9㊁11为AB型ꎬ5㊁7㊁10为AA型ꎬ1㊁2㊁8为BB型ꎮ6图2㊀晋汾白猪PCR-SSCP结果(注:1~7㊁11为AB型ꎬ8㊁10为AA型ꎬ9为BB型)图3㊀新山西黑猪PCR-SSCP结果(注:1㊁2㊁8为BB型ꎬ3㊁4㊁6㊁9㊁11为AB型ꎬ5㊁7㊁10为AA型)2.3群体遗传学分析通过PopGen32软件检测ꎬ分别得到晋汾白猪和新山西黑猪的基因频率和基因型频率ꎬ结果如表1和表2所示ꎮ表1MyoG基因在两个猪种的基因频率和基因型频率品种样本数基因频率基因型频率ABABBBAA晋汾白猪400.51250.48750.6750.20.125新山西黑猪400.46250.53750.7750.10.125㊀㊀根据表1结果显示ꎬ晋汾白猪中有三种基因型ꎬ其中AB有31个ꎬBB有4个ꎬAA有5个ꎻ新山西黑猪中有三种基因型ꎬ其中AB有27个ꎬBB有8个ꎬAA有5个ꎻ在晋汾白猪中A等位基因为优势等位基因ꎬAA基因型为优势基因型ꎮ说明AA基因型对于晋汾白猪的进化具有促进作用ꎬ在人工选育中具有AA基因型的猪更具有经济效益ꎮ新山西黑猪中B等位基因为优势等位基因ꎬBB基因型为优势基因型ꎮ说明在新山西黑猪中具有BB基因型的猪种在进化的时候更具有优势ꎬ在人工选育中具有BB基因型的猪更具有经济效益ꎮ表2㊀晋汾白猪、新山西黑猪遗传分析结果品种香农指数纯合度杂合度卡方值p值晋汾白猪0.69280.49400.506011.5933890.000662新山西黑猪0.69030.49650.50354.7625680.029058㊀㊀根据表2结果显示ꎬMyoG基因在晋汾白猪中卡方值为11.593389ꎬp值为0.000662ꎻMyoG基因在新山西黑猪中卡方值为4.762568ꎬp值为0.029058ꎬP值均小于0.05ꎬ所以在晋汾白猪㊁新山西黑猪中MyoG基因的多态性位点均不符合Hardy-Weinberg平衡ꎮ晋汾白猪的香农指数(0.6928)大于新山西黑猪的香农指数(0.6903)ꎬ说明晋汾白猪的遗传多态性高于新山西黑猪ꎮ晋汾白猪的遗传纯合度(0.4940)小于新山西黑猪的遗传纯合度(0.4965)ꎬ说明新山西黑猪更能稳定遗传ꎮ2.4基因型分布差异分析利用SAS8.1分析软件ꎬ对MyoG基因在晋汾白猪㊁新山西黑猪中基因型分布进行检验ꎬ结果如表3所示ꎮ表3㊀两个猪种中MyoG基因型分布差异性检验品种个数基因型ABBBAAχ2值p值晋汾白猪40314536.2080<0.0001新山西黑猪402785㊀㊀根据表3结果显示ꎬχ2值为36.2080ꎬp<0.0001ꎮ说明在晋汾白猪和新山西黑猪中MyoG基因型分布差异极显著ꎮ3.讨论与结论本实验选用了40头晋汾白猪和40头新山西黑猪作为样本ꎬ采用PCR-SSCP的技术对MyoG基因进行多态性分析ꎮ结果显示MyoG基因在晋汾白猪中有三种基因型:AB㊁BB㊁AAꎬA基因为优势等位基因ꎬ在新山西黑猪中有三种基因型:AB㊁BB㊁AAꎬB基因为优势等位基因ꎮMyoG基因在晋汾白猪中和新山西黑猪中的p值均小于0.05ꎬ表明MyoG基因的多态性位点在晋汾白猪㊁新山西黑猪中都不符合Hardy-Weinberg平衡ꎮ对比郭云雁[13]等人的实验ꎬ以180头大白猪和170头北京黑猪作为实验动物ꎬ在北京黑猪与大白猪中A基因均为优势等位基因ꎬ在北京黑猪中基因型AB出现的频率最高ꎬ基因型BB出现的频率最低ꎻ在大白猪种中纯合基因型AA的频率最高ꎬ而BB基因型的频率最低ꎬ并且MyoG基因在这两个猪种中都处于Hardy-Weinberg平衡ꎮ在王立辛[14]等的实验中选用255头大白猪㊁390头长白猪㊁155头杜洛克猪ꎬ三个猪种共800头作为实验动物ꎬ结果显示在这三个猪种中均存在三种基因型:AB㊁BB㊁AAꎬ其中AB出现的频率最高ꎬ并且B基因均为优势等位基因ꎮ群体遗传学分析结果显示MyoG基因多态性位点在大白猪㊁长白猪和杜洛克猪中均处于Hardy-Weinberg平衡ꎮ本实验与郭云雁㊁程笃学和王立辛㊁苏玉虹等的研究结果相比ꎬ基因频率㊁基因型频率以及Hardy-Weinberg平衡不一致ꎬ原因可能有:本实验选用7晋汾白猪和新山西黑猪为样本ꎬ而郭云雁等人选用了大白猪和北京黑猪ꎬ王立辛㊁苏玉虹等的实验中选用大白猪㊁长白猪㊁杜洛克猪作为试验动物ꎬ实验中选用的猪种不同ꎬ生活的环境㊁饲养方式㊁人工选育方法不同ꎬ其遗传性能也会有差异ꎻ选用的猪品种经过人工选育时人为择优选育也有可能会影响基因型频率ꎬ从而影响Hardy-Weinberg平衡ꎮ对比郭云雁等人和王立辛㊁苏玉虹等人的实验ꎬ本实验选取的样品数量太少ꎬ本实验选取晋汾白猪和新山西黑猪样本各40个ꎬ虽符合统计学样本选取的最低要求ꎬ但是误差比较大ꎬ容易出现特异性ꎮ参考文献:[1]NaiduPSꎬLudolphDCꎬToRQꎬetal.MyoGeninandMEF2functionsynergisticallytoactivatetheMRF4promot ̄erduringMyoGenesis[J].MolecularandCellularBiologyꎬ1995(5).[2]杨又兵.猪MyoG基因和CAST基因多态性研究及部分DNA片段的测序[D].武汉:华中农业大学ꎬ2003. [3]吴常信ꎬ李宁.分子生物技术在中国动物育种中的应用[J].中国家禽ꎬ2002(13).[4]刘梅ꎬ高勤学ꎬ王林云等.申农Ⅰ号猪MyoG基因多态性位点的PCR-RFLP检测[J].上海农业学报ꎬ2003(1). [5]王伟ꎬ魏雪锋ꎬ赵雪等.滇南小耳猪细胞生成素(MyoG)基因多态性的研究[J].云南农业大学学报ꎬ2013(4). [6]程广龙ꎬ张伟力ꎬ陶立等.不同基因型肥育猪肌纤维直径的分析[J].安徽农业科学ꎬ2000(4).[7]高勤学ꎬ刘梅ꎬ杨月琴等.猪MyoG基因的PCR-SSCP分型及其与生长性能和肌纤维数目的相关性分析[J].中国兽医学报ꎬ2005(3).[8]TepasMFWꎬSoumillionAꎬRettenbergerGꎬetal.Charac ̄terizationoftheporiceMyoGeningenelocusandassocia ̄tionbetweenpolymorphismandgrowthtraits[J].AnimalGeneticsꎬ1996(2).[9]HughesSMꎬTaylorJMꎬTapscottSJꎬetal.Selectiveaccu ̄mulationofMyoDandMyoGeninmRNAsinfastandslowadultskeletalmuscleiscontrolledbyinnervationandhor ̄mones[J].DevelopmentBiologyꎬ1993ꎬ118.[10]魏岳ꎬ张跟喜ꎬ王金玉等.边鸡MyoG基因与生长和屠体性状的关联分析[J].中国畜牧杂志ꎬ2014(19). [11]柴志欣ꎬ信金伟ꎬ王会等.MyoG基因多态性与牦牛生长性能的关联分析[J].华北农学报ꎬ2018(6). [12]白俊艳ꎬ杨又兵ꎬ王玉琴等.绵羊MyoG基因外显子1的多态性及其与肉质性状的关联分析[J]ꎬ2017(6). [13]郭云雁ꎬ程笃学ꎬ张龙超等.MyoG和c-fos基因多态性及其合并基因型与猪肌纤维性状的关联分析[J].畜牧兽医学报ꎬ2013(2).[14]王立辛ꎬ苏玉虹ꎬ刘海东等.猪肌肉生长抑制素基因和肌细胞生成素基因多态性对早期生长性状的影响[J].畜牧兽医学报ꎬ2014(7).ʌ责任编辑㊀荆㊀瑶ɔPolymorphismAnalysisofExon1ofPorcineMyoGGeneSunNu-nuꎬLiuJin(DepartmentofLifeScienceꎬYunchengUniversityꎬYuncheng044000ꎬChina)Abstract:MyoGgeneplaysanimportantroleinmuscledifferentiationbecauseofitshasinfluenceonmyo ̄blastfusionandmusclefiberformation.InthisstudyꎬthepolymorphismofMyoGgeneinJinfenwhitepigsandnewShanxiblackpigswasanalyzedbyPCR-SSCPtechniqueꎬandthegenotypicanalysiswascarriedout.TheresultsshowedthatthreekindsofgenotypeswerefoundinJinfenwhitepigs:ABꎬBBandAAꎬinwhichAwasdominantalleleꎬandalsoinnewShanxiblackpigsꎬinwhichBwasdominantallele.Thepopulationgenetica ̄nalysisindicatedthatthepolymorphismofMyoGgenedidnotaccordwiththeHardy-WeinbergequilibriuminJinfenwhitepigsandnewShanxiblackpigs(p<0.05).TheShannonindexofJinfenwhitepigwas0.6928ꎬandtheShannonindexofnewShanxiblackpigwas0.6903ꎬwhichshowedthatthegeneticpolymorphismofJin ̄fenwhitepigwashigherthanthatofnewShanxiblackpig.ThegenotypicdistributiondifferenceofMyoGgenepolymorphismwasanalyzedbySAS8.1softwareꎬtherewassignificantdifferenceingenotypicdistributionbe ̄tweenJinfenwhitepigandnewShanxiblackpig(χ2=36.2080ꎬp<0.0001).ThepolymorphismofMyoGgeneintwopigsbreedswasanalyzedꎬwhichprovidethebasisforimprovingporkqualityandartificialbreeding.KeyWords:MyoGgeneꎻJinfenwhitepigsꎻnewShanxiblackpigsꎻPCR-SSCP8。
猪基因多态性及其与母猪繁殖性状关联性的测定方法[发明专利]
专利名称:猪基因多态性及其与母猪繁殖性状关联性的测定方法
专利类型:发明专利
发明人:殷宗俊,丁月云,张晓东,朱鹏,张威,张梦琦,付坤,王源朗,朱树娇,张德磊
申请号:CN201510539399.5
申请日:20150827
公开号:CN105368926A
公开日:
20160302
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明公开了一种猪基因多态性及其与母猪繁殖性状关联性的测定方法,包括如下步骤:(1)采集猪耳组织样品;(2)耳组织DNA提取;(3)PCR扩增RBP4、BMP7基因目的片段;(4)SSCP分析;(5)PCR扩增产物双向测序;(6)群体遗传学特性分析;(7)测定繁殖性能;(8)采用数学模型分析所检测到的RBP4、BMP7基因遗传变异与母猪繁殖性状指标的关联性。
本发明猪基因多态性及其与母猪繁殖性状关联性的测定方法具有检测效率高,结果可靠的优点。
申请人:安徽农业大学
地址:230036 安徽省合肥市长江西路130号
国籍:CN
代理机构:北京双收知识产权代理有限公司
代理人:王菊珍
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猪MYOG基因遗传多态性与胴体及肉质性状的相关性
湖南农业大学学报(自然科学版) 2024,50(1):52–57.DOI :10.13331/ki.jhau.2024.01.008 Journal of Hunan Agricultural University(Natural Sciences)引用格式:杨又兵,钱凯凤,刘永建,任旭鸽,周臣,游祥宾.猪MYOG 基因遗传多态性与胴体及肉质性状的相关性[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2024,50(1):52–57. YANG Y B ,QIAN K F ,LIU Y J ,REN X G ,ZHOU C ,YOU X B .Correlation of genetic polymorphisms of MYOG gene with carcass and meat quality traits in pigs[J].Journal of Hunan Agricultural University(Natural Sciences),2024,50(1):52–57.投稿网址:猪MYOG 基因遗传多态性与胴体及肉质性状的相关性杨又兵,钱凯凤,刘永建,任旭鸽,周臣,游祥宾(河南科技大学动物科技学院,河南 洛阳 471023)摘 要:通过测定约180日龄的8个群体(梅山、大白、长白、大白×梅山F 1代、梅山×大白F 1代、长白×大白F 1代、大白×长白F 1代以及大白×梅山F 2代)459头猪胴体性状、肉质性状以及肌细胞生成素基因(MYOG )多态性,分析MYOG 在猪群体中的遗传效应。
结果表明:MYOG 在猪群体中呈现3种基因型,即AA 、AB 、BB ;群体瘦肉率的提高与BB 基因型显著相关,相较于AA 与AB 基因型,其提高幅度分别为3.57%和3.28%;在大白×梅山F 2代群体中,MYOG 的基因型与背最长肌pH 值、股二头肌pH 值呈显著相关;在大白×梅山F 1代群体中,MYOG 基因型与股二头肌大理石纹MM2呈显著相关。
不同遗传背景猪群体黏病毒耐药蛋白1基因多态性分析
表 #! 引 物 序 列 信 息
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猪myostatin基因5'调控区的酶切多态性分析
猪myostatin基因5'调控区的酶切多态性分析杨秀芹;刘娣;李景芬;孙继权【期刊名称】《东北农业大学学报》【年(卷),期】2002(033)003【摘要】用PCR-RFLPs分析方法,对长白、大白、杜洛克、军牧Ⅰ号、民猪5个猪种的myostatm基因5'调控区进行了酶切多态性分析.结果表明,长白、大白、杜洛克以等位基因T为主,检测的40头军牧Ⅰ号的等位基因全部是T,民猪3种基因型均有,且频率近乎相等.统计分析表明,3种基因型的分布在长白、大白、杜洛克、军牧Ⅰ号间差异不显著,而民猪同这4个品种间的差异极显著.【总页数】4页(P247-250)【作者】杨秀芹;刘娣;李景芬;孙继权【作者单位】东北农业大学动物科技学院,黑龙江,哈尔滨,150030;东北农业大学动物科技学院,黑龙江,哈尔滨,150030;东北农业大学动物科技学院,黑龙江,哈尔滨,150030;齐齐哈尔市畜牧技术服务中心,齐齐哈尔,16100【正文语种】中文【中图分类】S828;S813【相关文献】1.猪生长激素基因ApaⅠ酶切位点多态性分析 [J], 邢晋祎;帅素容;李学伟;乔绍权2.绵羊Myostatin基因5′调控区的生物信息学分析及孕激素对调控区活性的影响[J], 秦健;杜娟;杨亚群;杜荣3.西藏小型猪MSTN基因5'调控区的酶切多态性分析 [J], 岳敏;顾冬生;李洪涛;张建明;李金泽;王玉珏;顾为望4.Myostatin基因打靶载体的构建及猪胎儿成纤维细胞Myostatin基因的敲除 [J], 李鸿辉;冯冲;王宁;闫军;哈福;陈红星;樊宝良;潘登科5.Myostatin基因5'调控区的多态与猪生长性能的关系 [J], 吴俊红;武艳群;赵晓枫;吴旧生;徐宁迎因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
滇南小耳猪肌源性因子5(MYF5)基因多态性研究
滇南小耳猪肌源性因子5(MYF5)基因多态性研究张晓燕;朱莉;唐琳;展亚楠;李昕鹏;孔小艳【期刊名称】《家畜生态学报》【年(卷),期】2024(45)6【摘要】肌源性因子5(myogenic factor 5,MYF5)被认为是猪肌肉生长发育的重要基因,为探究MYF5基因的遗传变异对滇南小耳猪生长性状的影响,以期为优质滇南小耳猪肉新品种(系)培育提供有效的分子遗传标记,本试验以MYF5为候选基因,杜洛克猪(n=40)为对照组,筛选滇南小耳猪(n=18)的优势SNP位点,并对筛选的优势SNP与其主要胴体及肉质性状进行关联分析。
结果显示,在滇南小耳猪MYF5基因检出的16个SNP位点中,1个位于编码区,为同义突变,并筛选到4个优势SNP。
关联分析结果表明,滇南小耳猪MYF5基因1486、1574、1629以及1701位点间突变频率一致且有相近的遗传图距,连锁紧密。
A1486G位点分别为GG、AG、AA 基因型;G1574A位点分别为AA、GA、GG基因型;C1629T位点分别为TT、CT、CC基因型;T1701C位点分别为CC、TC、TT基因型。
就肌内脂肪含量而言,MM基因型极显著高于MN基因型(P<0.01),MM基因型显著高于NN基因型(P<0.05),NN基因型显著高于MN基因型(P<0.05)。
就大理石纹评分而言,MM基因型极显著高于NN基因型(P<0.01),MM基因型极显著高于MN基因型(P<0.01),MN基因型极显著高于NN基因型(P<0.01)。
因此,本研究可基本推断在有关作用于滇南小耳猪种肉质性状的基因中,MYF5基因较为关键。
该试验结论可为滇南小耳猪育种中改善肉品质等性状给予分子标记支撑。
【总页数】6页(P14-19)【作者】张晓燕;朱莉;唐琳;展亚楠;李昕鹏;孔小艳【作者单位】云南农业大学动物科学技术学院【正文语种】中文【中图分类】S828.2【相关文献】1.滇南小耳猪细胞生成素(MyoG)基因多态性的研究2.滇南小耳猪生长激素基因多态性研究3.滇南小耳猪与云南野猪SLA-DQA基因的多态性比较4.滇南小耳猪与巴马小型猪SLA-DQA基因多态分析因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
猪IFN_基因多态及功能分析
农业生物技术学报JournalofAgriculturalBiotechnology2008,16(2):221 ̄224*基金项目:国家自然科学基金-广东省联合基金(No.U0631005)及广东温氏食品集团博士后科研基金项目资助。
**通讯作者。
Authorforcorrespondence.讲师,主要从事动物分子生物学研究。
E-mail:<chenhy5000@126.com>,<chenhy5000@163.com>.收稿日期:2007-06-06接受日期:2007-06-16・研究论文・猪IFN-γ基因多态及功能分析*陈慧勇1,2**,吴珍芳1,2,毕英佐1,2,赵书红3,曾海玉2,周秀2(1.华南农业大学动物科技系,广州510640;2.广东温氏食品集团,新兴县527400;3.华中农业大学动物科技学院,武汉430070)摘要:γ-干扰素(interferon-gamma,IFN-γ)在机体免疫应答调节及抵抗病毒感染方面具有重要的作用。
为了探测猪IFN-γ基因作为猪抗病育种中一种分子标记的可能性,首先对其进行了不同猪品种间的基因组测序,以揭示核苷酸水平的变化,结果在IFN-γ基因中发现了3个单核苷酸多态(SNP)。
其中2个SNP为中国地方猪种二花脸所特有。
另一SNP则在杜洛克、长白、皮特兰、圣特西及大白中具有广泛的多态分布,群体杂合度为0.4820。
此多态位点经PCR-SSCP检测发现3种基因型:II基因型(A碱基插入纯合型)、DD型(A碱基缺失纯合型)和DI杂合型。
该标记基因型与表型间的卡方独立性检验尚没有发现IFN-γ基因与猪健康状况的现场记录直接相关,但多重比较分析却发现该基因与猪的繁殖性能有关。
关键词:猪;IFN-γ;单核苷酸多态(SNP);关联分析中图分类号:S188文献标识码:A文章编号:1006-1304(2008)02-0221-04SearchingandCharacterizingSingleNucleotidePolymorphismsinPorcineIFN-γGeneCHENHui-yong1,2**,WUZhen-fang1,2,BIYing-zuo1,2,ZHAOShu-hong3,ZENGHai-yu2,ZHOUXiu2(1.DepartmentofAnimalScience,SouthChinaAgriculturalUniversity,Guangzhou510640,China;2.GuangdongWen’sGroup,Xinxing527400,China;3.CollegeofAnimalScienceandTechnology,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China)Abstract:Interferon-gamma(IFN-γ)playsanimportantroleintheinnatehostdefenseagainstviralinfection.InordertoanalyzethevalueoftheIFN-γgenetobeageneticmarkerornotinporcinediseaseresistance,genomicsequencingwasemployedindifferentbreeds.Andthreesinglenucleotidepolymorphisms(SNPs)wereidentified.TwoofthemwerefoundonlyinErhualian,andtheotheronewaspolymorphicwithheterozygositybeing0.4820indifferentbreeds,whichareDuroc,Landrace,PietrainandSynthethic.ThreegenotypesweredetectedbyPCR-SSCPfortheSNP,whichwereII(homozygoteforinsertionofA),DD(homozygotefordeletionofA)andheterozygoteDI.Associationwasnotdetectedbetweenmarkersandhealthlevelsrecordedinherdbychi-squaredistributiontest,butbetweenmakersandporcinereproductiontraitsbyDuncan'smultiplerangetest.Keywords:pig;IFN-γ;singlenucleotidepolymorphisms(SNP);associationanalysis近几年猪疾病基因表达方面的研究积累了越来越多的可能候选基因(Niewoldetal.,2005;Petryetal.,2005;Suradhatetal.,2003;Zhaoetal.,2006),其中干扰素-γ基因(interferon-gamma,IFN-γ)基因即是一例。
赤水乌骨鸡Myf5基因SNPs与周龄体重的关联性分析
赤水乌骨鸡Myf5基因SNPs与周龄体重的关联性分析王文涛;胡健;张福平【期刊名称】《贵州畜牧兽医》【年(卷),期】2024(48)2【摘要】为了探究Myf5基因的多态性及对赤水乌骨鸡周龄体重的影响,试验通过PCR扩增、基因测序分析Myf5基因SNPs,使用SPSS 21.0分析SNPs基因型与赤水乌骨鸡周龄体重的关联性。
结果:赤水乌骨鸡Myf5基因存在3个SNP位点,均位于第一外显子,其中G.40098586 T>C、G.40098595 T>C 2个位点突变导致终止子(TGA)突变为精氨酸(CGA),G.40098901A>G突变导致赖氨酸(AAG)突变为谷氨酸(GAG)。
G.40098595 T>C位点CC基因型2、8周龄体重极显著高于TT 型(P<0.01),6、12周龄体重显著高于TT型(P<0.05),CT基因型4、10周龄体重显著高于TT型(P<0.05);G.40098901 A>G位点AG基因型4周龄体重极显著高于GG型(P<0.01)。
结论:Myf5基因的3个SNP位点突变可显著影响赤水乌骨鸡的周龄体重,G.40098595 T>C、G.40098901 A>G位点可作为赤水乌骨鸡体重选育的候选分子标记。
【总页数】4页(P15-18)【作者】王文涛;胡健;张福平【作者单位】清镇市农业农村局;贵州大学动物科学学院【正文语种】中文【中图分类】S831.8;Q78【相关文献】1.鸡12周龄体重的主基因+多基因混合遗传分析2.鸡18周龄体重的主基因+多基因混合遗传模型分析3.赤水乌骨鸡SLCO1B3基因SNPs鉴定及与蛋品质的关联性分析4.乌蒙乌骨鸡Myf5基因多态性与生长体重的关联分析5.威宁鸡Myf5基因多态性与周龄体重的相关性研究因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
三个猪品种Myf5基因的克隆及序列分析
三个猪品种Myf5基因的克隆及序列分析袁恬;冉雪琴;王芳;陈颖;王嘉福;张兆强【期刊名称】《山地农业生物学报》【年(卷),期】2013(032)002【摘要】为明确猪Myf5基因的蛋白结构及功能位点,从香猪、大白猪和大白×长白杂交猪背最长肌提取总RNA,采用RT-PCR技术克隆Myf5基因,其cDNA长893 bp,包括完整的开放阅读框768 bp,编码255个氨基酸.将所测序列与GenBank上已知猪种序列进行相似性比较,结果表明:香猪Myf5基因中有3个碱基变异,其中2个突变不改变编码的氨基酸为无义突变,1个突变使其编码的氨基酸由甲硫氨酸(M)变为亮氨酸(L).大白猪没有碱基变化;大白×长白杂交猪Myf5基因中的1个突变,使其编码氨基酸由甘氨酸(E)变为谷氨酸(G).将香猪与其他物种进行核苷酸和氨基酸编码区序列的相似性分析及生物信息学分析.相似性分析表明,香猪Myf5基因氨基酸编码区序列与绵羊、牛、马、兔、黑猩猩、非洲象和小鼠的相似性较高,均在88%以上,推测Myf5基因在哺乳动物具有一定的保守性;Myf5蛋白二级结构以无规则卷曲为主,其次为α螺旋,偶有β转角.预测Myf5蛋白不舍信号肽序列,有29个磷酸化位点.【总页数】5页(P114-118)【作者】袁恬;冉雪琴;王芳;陈颖;王嘉福;张兆强【作者单位】贵州大学生命科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学农业工程省重点实验室,贵州贵阳550025;贵州大学生命科学学院,贵州贵阳550025【正文语种】中文【中图分类】Q781【相关文献】1.三个小麦防御素基因的克隆及序列分析 [J], 史灵敏;张斌;丁汉凤;李娜娜;高文伟;彭振英2.中缅树鼩三个多潜能基因cDNA片段的克隆和序列分析 [J], 王彩云;马云瀚;何大健;杨世华3.三个花生二酰甘油酰基转移酶基因的克隆与序列分析 [J], 迟晓元;雷永;陈娜;王通;王冕;陈明娜;潘丽娟;杨珍;禹山林4.三个花生溶血磷脂酸酰基转移酶基因的克隆与序列分析 [J], 董芳;迟晓元;杨庆利;陈娜;潘丽娟;陈明娜;和亚男;杨珍;王通5.三个烟草防御素基因的克隆及序列分析 [J], 林世锋;任学良;王轶;王仁刚因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
藏猪肌肉生长抑制素基因外显子1的PCR-SSCP分析
藏猪肌肉生长抑制素基因外显子1的PCR-SSCP分析任磊;帅素容;杨显彬;尹公鹏;余先琼;黄河;李诗兵【期刊名称】《湖北农业科学》【年(卷),期】2007(46)4【摘要】采用PCR-SSCP技术分析了藏猪肌肉生长抑制素(MSTN)基因的单核苷酸多态性.根据GeneBank上猪MSTN基因全序列设计的两对引物,扩增了MSTN 基因完整的外显子1,经SSCP分析,只有P1扩增产物存在多态性,表现为3种基因型(AA、AC和CC),A和C两种等位基因的频率分别为46.88%和53.12%.测序分析发现,CC型与AA型相比在MSTN基因编码区的第71bp处有一个A→C的单碱基突变,该突变导致编码的第24位氨基酸由天冬酰胺改变为苏氨酸.【总页数】3页(P517-519)【作者】任磊;帅素容;杨显彬;尹公鹏;余先琼;黄河;李诗兵【作者单位】四川农业大学动物科技学院,四川,雅安,625014;四川农业大学动物科技学院,四川,雅安,625014;四川省稻城县农牧局,四川,稻城,627750;四川省稻城县农牧局,四川,稻城,627750;四川省稻城县农牧局,四川,稻城,627750;四川农业大学动物科技学院,四川,雅安,625014;四川省泸县畜牧局,四川,泸县,646100【正文语种】中文【中图分类】S828.8+9;Q503【相关文献】1.绵羊肌肉生长抑制素基因外显子Ⅰ单核苷酸多态性分析 [J], 张慧玲;史洪才;罗淑萍;牛志刚;唐森;武坚;刘明军2.藏猪IGF I基因外显子4和IGF II基因内含子7 PCR-RFLP分析 [J], 强巴央宗;彭俊飞;辜雪冬;杨涛;张浩3.大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子Ⅱ遗传多态性分析 [J], 杨斌;薛良义;叶秀丽;董小敬4.肌肉生长抑制素基因(MSTN)外显子1的多态性及其与边鸡生长性状的关联分析[J], 张跟喜;丁馥香;是燕萍;王金玉;张李俊;张丽;施会强5.大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子I遗传多态性分析 [J], 薛良义;李婷;孙升;肖章奎;沈秋静;童丽娟因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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a d sa d r z t n o wi e e / a s g a i g i B a i -p stv s n t adiai f s n a ̄ s r d n n r zl— o iie a - n o -
基金项 目: 江省科技攻关项 目( 黑龙 编号 :B 1 I 。 G 0 Bl M) 作者简介 : 丁国杰 (94 ) 女 , 17一 , 在读 硕 士生 , 动物 遗传 育种 专业 。 E— a :d guj 17 @ sh.tm。 通 讯 作 者 :刘 m i igoe94 l n i ou o 娣
个进化保守区:Ar T A盒 、 8碱基组成的 O S 6b L 、 p的
富含 c区。牛和禽 的肌 和非肌组织 中有特异识别 O S的核因子。外源 M f L y 5侧翼序列控制下的报 5 告基因在成肌细胞 中的表达 比在成纤维 细胞 中高 1 倍 ,A A盒和 O S 于这两种 细胞 的基 因表达 2 TT L对 都很重要 。猪 的该基 因于 19 J 9 9年 由 Tps ea 定位
肌纤维是构成骨骼肌的基本单位 , 其生成仅 限 于胚胎期 , 猪在胚胎期 7 0d左右 即已形成 , 出生后 数量不再增加¨ 。 J 是在胚胎 发育时肌细胞 中 最早被诱导表达 的因子 , 其缺失所引起 的肌形成 障 碍可被随后表达的 M o yD代偿 , 反之 , yD缺失在 Mo 大体上也不影响肌分化 , 明两者功能重叠。当两 说
态, 发现在 1 8 p 8b 处有一个点突变 G 。经计算各基因型频率 、 2 —c 基因频率和试验统计表明: 随民猪、 三江白猪 、
大 白猪 、 长白猪 、 军牧 1 杜洛克和双肌臀大 白猪瘦 肉率 的升高 , 号、 等位基 因 M 的基 因频率 也大 致按此 顺序 旱上
升趋势 。 关键词 :猪品种 ; 尬 ; N s P R—S C ;瘦 肉率 ; S P; C SP 遗传多态性 中图分类号 :¥2 . 8 82 文献标识码 : A 文章编号 :0 2—10 (0 6 0 0 2 0 10 3 2 20 )3— 15— 3
t 2 0 [ ] Ju a o C n a E r e ch r , 0 , ( ) o 0 4 J . or f et u pa A u ue 2 4 5 4 : n r l l o n 0
[] a e — ok ,o M,av Sv i p ic i 7芒 n k poaM Kv d tr a Ml r . 1ea e ee en 0 h o n n x rn
pi a e  ̄ ls i c to c o d n o S g c r s sc a sf a in a c r i g t EUROP d r g t e y a s 1 96 s i u n e r 9 i h
zt atⅡ,9 6 1 0 1 5 et P r e 1 8 , 2 : 6 7—1 6 . 67
蛋及其制品卷[ ] 2 北京 : M . 版. 中国标 准出版社 , 0 :8 9 . 2 38 — 3 0
[] 6 国家标准化管 理委员 会.中国 强制性 国 家标 准汇 编 : 食品卷 1 [ . M] 北京 : 中国标准 出版社 , 0 : 8 . 2 37 0 9— 3
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江 苏农业科 学 20 0 6年第 3期
一 l5 一 2
猪
基 因外显子 1的多态性分析
丁国杰 , 娣 , 刘 李景芬
( 东北农业大学动物科学技术学院 , 黑龙江哈尔滨 10 3 ) 50 0
摘要 : 利用 P R— S P技术 , C SC 以民猪 、 三江 白猪 、 白猪 、 白猪 、 大 长 军牧 1 、 号 杜洛克 和双 肌臀大 白猪共 7个猪 种为研究对象 , 根据 G n a k上猪的 My5基 因外显子 1序列设计 了 4对 引物 , eBn y 进行 了 S P 检测 , Ns 并检 测到 了多
简单, 费用低 , 易被屠宰场接受。但在操作过程中需
要对分级人员进行正规的培训 , 以减少人为误差 。
参考文献 :
[ ] a t u aaa o r s gai gl i [ ] C nd a 1 G z t d nd .H g a a r n r uao J . a aa — ee C c c s d g e tn G
(93 16 一), , 女 博士 , 教授 , 博士生导师 。E—ma :u i 6 @sh . l i 9 r l d1 3 ou
0238 R > . , E< . )分级时只需测定 .5 O8 R M( MS 2 5 , 6 7 — 肋膘厚 、 、 F M 3个指标 即可。应用此模 型操作
收稿 日期 : 0 — 1 1 2 5 1—1 0
者都缺失则成肌细胞 和分化 的骨骼肌细胞都 不 出 现 。位于 J 基因启动子上游 5 b以上调控 Ok 元件 , 分别 调控 尬 在肢体 肌 肉和在体 节中的表 达。不 同的增强子或 位点控制 区调节 尬 在不 同 的胚胎形成 区的正确 时空表达 , 比较 牛、 鼠、 小 鸡的 尬 基因 5侧翼区发现在靠 近转 录起 始点处有 3
o t a s a t ] Scn t n tn iu o e c o p e dr t i s R . eodI e a oa Vr a C n rne n s n e rn [ n r i l tl f e
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[] 5 中国标准出版社第一编辑室编,中国食品工业标准汇编 : 禽 、 肉、