PCR方法扩增种属特异性片段检测猪源成分
非洲猪瘟病原学检测方法
非洲猪瘟病原学检测方法介绍非洲猪瘟(African swine fever, ASF)是一种高致病性的猪病,对于猪养殖业来说是一种严重威胁。
为了及时有效地进行疫情监测和病原学分析,科学家们发展了多种非洲猪瘟病原学检测方法。
本文将对这些检测方法进行详细的探讨。
PCR方法传统PCR1.样品收集:从患病猪只的脾脏、淋巴结或血液中收集样品。
2.DNA提取:使用DNA提取试剂盒将样品中的DNA提取出来。
3.PCR反应体系:设置PCR反应体系,其中包括引物、模板DNA、酶和缓冲液。
4.PCR扩增程序:设定PCR扩增程序,包括一系列不同温度的循环反应。
5.结果分析:利用凝胶电泳的方法,观察PCR产物的大小。
实时定量PCR1.样品收集和DNA提取:与传统PCR相同。
2.PCR反应体系:与传统PCR相同,但引入了荧光探针。
3.实时定量PCR程序:设定实时定量PCR程序,包括多个不同温度的循环反应。
4.数据分析:根据荧光信号的强度和阈值周期数,计算出病毒数量。
优点•灵敏度高:PCR方法能够检测到非洲猪瘟病原体的极低浓度。
•特异性强:引物的设计使得PCR方法能够区分非洲猪瘟病原体和其他相关病原体。
•快速性:PCR方法可以在短时间内得到结果。
缺点•对实验操作要求高:PCR方法需要精确计量样品和试剂。
•易受污染:PCR方法容易受到外部环境中目标DNA的污染。
•不适合现场应用:PCR方法的设备和试剂有一定的成本,不适合一些资源有限的地区。
ELISA方法直接ELISA1.样品准备:从患病猪只的血液中收集样品。
2.酶标板涂层:将非洲猪瘟病毒的抗原涂在酶标板上。
3.样品加入:将已稀释的血清样品加入到酶标板中。
4.洗涤步骤:用洗涤缓冲液洗涤酶标板,去除未结合的抗体。
5.反应步骤:加入与非洲猪瘟病毒抗体标记的酶联二抗。
6.洗涤步骤:洗涤酶标板,去除未结合的酶联二抗。
7.显示步骤:加入底物,使酶与底物反应产生可见的颜色。
8.终止反应:加入终止液停止酶的反应。
非洲猪瘟检测试剂操作方法
非洲猪瘟检测试剂操作方法非洲猪瘟(African Swine Fever,简称ASF)是一种高度传染性疾病,对猪群健康和养殖业都造成了巨大损失。
为了迅速检测和诊断非洲猪瘟,科学家们开发了多种检测试剂。
下面将详细介绍非洲猪瘟检测试剂(包括PCR、ELISA和纸条快速检测试纸)的操作方法。
1. PCR检测方法:PCR(聚合酶链反应)是一种通过扩增病原体的特定基因片段来检测病原体的方法。
下面是非洲猪瘟PCR检测方法的步骤:a. 实验准备:- 准备PCR试剂盒,包括DNA提取试剂、PCR引物和酶。
- 准备PCR工作站和仪器(如PCR仪)。
- 防止污染,使用无菌器材和顶级实验室规范的操作。
b. 样本提取:- 取非洲猪瘟病畜体、组织或血液样本。
- 使用合适的试剂盒进行DNA提取,按照操作手册中的指示进行。
- 将提取的DNA储存到低温条件下,避免降解。
c. PCR扩增:- 准备PCR反应液,包括DNA模板、引物、dNTPs、酶和缓冲液。
- 按照PCR反应液体积的要求逐一加入反应管中。
- 定量PCR反应溶液,确保所有反应中的成分配比准确。
- 放入PCR仪中,按照所使用的引物设计好的程序运行PCR反应。
d. 结果分析:- 运行PCR反应后,获取PCR反应管。
- 将PCR产物经电泳分离,依据目标基因片段大小来判断是否存在非洲猪瘟病毒。
- 使用显色剂或转印装置对PCR产物进行直接检测。
- 分析PCR结果并记录,确认样本是否为非洲猪瘟阳性。
2. ELISA检测方法:ELISA(酶联免疫吸附试验)是一种常用的免疫学检测方法,用于检测非洲猪瘟病毒的抗体或抗原。
下面是非洲猪瘟ELISA检测方法的步骤:a. 实验准备:- 准备ELISA试剂盒,包括抗体/抗原、酶标记物、底物等。
- 准备ELISA板(包括微孔板或膜)和读板机。
- 防止交叉污染,使用不同的器材和操作台进行样本分析。
b. 样本处理:- 取非洲猪瘟血清样本,通过离心等操作去除杂质。
猪的检测项目
实验室对猪病的检测可以采用多种方法和技术。
以下是一些常见的猪病检测方法:
1.血清学检测:通过采集猪的血液样本,进行血清学检测,包括血清抗体检测和血清学指
标检测。
这些检测可以用于确定猪是否感染了特定的病原体,或者是否已经产生了免疫应答。
2.分子生物学检测:分子生物学技术,如聚合酶链反应(PCR)、逆转录聚合酶链反应
(RT-PCR)和核酸杂交等,可以用于检测病原体的核酸序列,从而确定猪是否感染了特定的病原体。
这些方法通常能提供快速、准确的结果。
3.细菌学和真菌学检测:通过细菌培养、细菌鉴定和真菌培养等方法,可以检测猪体内是
否存在细菌或真菌感染。
这些检测方法可以确定病原体的种类和敏感性,以便选择合适的治疗方法。
4.组织学检测:通过取得猪的组织样本,进行组织学检测,如病理学检查、免疫组织化学
染色和组织培养等,可以确定病变的组织学特征,辅助诊断和病因分析。
5.免疫学检测:包括免疫荧光、免疫酶联免疫吸附试验(ELISA)、免疫电泳等方法,可
以检测猪体内特定抗体或抗原的存在,用于诊断感染性疾病。
4种肉类成分多重PCR的鉴定方法
4种肉类成分多重PCR的鉴定方法淑辉1,蔡军1,王忠才1,李舟1,王建昌2,王素华1(1.温州海关综合服务中心,浙州325027;2-庄海中心,河北庄050051)摘要:为建立4种肉类(牛肉、猪肉、鸡肉和马肉)成分的鉴别方法,本试验基于动物线粒体细胞色素b基因,设计1条通用正向引物CF,以牛、猪、鸡和马的特定DNA序列设计4条特异性反向引物R,优化反应条件,建立了多重PCR检测方法。
该方法对牛、猪、鸡和马肉的检测灵敏度为10x10Tng/$L,具有良好的特异性。
对80份市售肉制品样本进行检测,检出掺本31份,与本实验的荧PCR试剂盒结果一致$本试验建立的多重PCR方法能效地对牛、猪、鸡和马源性成分进行$关键词:多重PCR;&牛肉;猪肉;鸡肉&马肉中图分类号:TS251.5+5文献标志码:A文章编号:0529—6005(2020)11—0065—04A Multiplex PCR MetUod for tie Identification of Four Meat IngredientsYUAN Shu-hul1,CAI Jun1,WANG Zhong-cal1,LI Zhou1,WANG Jian-chang2,WANG Su-hua1(1.Synthesis Technique Service Center of Wenzhou Customs,Wenzhou325027,China;2.Technology Center of Shijiazhuang Customs,Shijiazhuang050051,China)Abstract:In order to establish a method to identiR4kinds of meat ingredient(beef,pork,chicken,horse),a multiplex PCR was established by designing a common fosvard pSmef(CF)based on the miRchond/ai cytochrome b gene and4species-specific reverse primers(R)based on specific DNA sequences of cattle,pig,chicken and horse.The sensitivity of beef,pork,chicken,horse was10x 10_3ng/$L,with good specificity.Eighty food samples were tested,of which31were adulterated samples.The test results were consistent with the qPCR kit used in our laboratory.The multiplex PCR can electively detect the ingredRnts of beef,pork,chicken and horse.Key words:multiplex PCR;identification;beef;pork;chicken;homeCorreseonding auttor:WANG Su-hua,E-mail:29801719@qq..om肉类食 范围内面临的问题, 2014年欧洲暴发的“马肉风波”揭露了多国肉的掺假现象。
副猪嗜血杆菌PCR检测方法的建立及初步应用
副猪嗜血杆菌PCR检测方法的建立及初步应用副猪嗜血杆菌PCR检测方法的建立及初步应用导言:副猪嗜血杆菌(Actinobacillus pleuropneumoniae)是引起猪链球菌病(porcine pleuropneumonia, APP)的主要病原菌之一。
该病在全球范围内广泛分布,对养猪业造成了严重损失。
因此,建立一种可快速、敏感、特异性的PCR检测方法,对副猪嗜血杆菌的定性与定量检测具有重要意义。
一、材料与方法1. 实验材料:(1)猪链球菌脱氧核糖核酸(DNA)样本:通过猪链球菌感染猪体,分离获得猪链球菌细菌株,提取其DNA,作为阳性对照。
(2)副猪嗜血杆菌菌株:鉴定并保存不同型号的副猪嗜血杆菌菌株作为实验材料。
(3)PCR试剂盒:包括PCR扩增酶、引物等。
2. 实验方法:(1)副猪嗜血杆菌菌株培养:将培养基中的副猪嗜血杆菌菌株接种于含有适合生长的培养基中,在37℃条件下培养至其达到合适的生长状态。
(2)DNA提取:采用商用DNA提取试剂盒,按照说明书提取培养基中的副猪嗜血杆菌的DNA。
(3)PCR反应:将提取的副猪嗜血杆菌DNA与PCR试剂盒中的扩增酶和引物混合,进行PCR反应。
反应条件为:酶解前处理(95℃ 5min)、酶解依次处理(95℃ 30s,55℃ 30s,72℃ 1min,重复40次)、终止处理(72℃ 10min)。
(4)PCR产物检测:将反应产物通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,用紫外线照射后观察结果。
根据预设的PCR产物大小,判断是否有副猪嗜血杆菌的特异DNA产物出现。
二、PCR检测方法的优化与调控1. 引物的优选:设计一对特异性引物,确保扩增产物的相对特异性。
通过与相关细菌的DNA进行反应,验证引物的特异性。
通过调整引物浓度,确定最佳扩增效果。
2. PCR条件的优化:调整PCR反应温度、时间和循环次数,通过观察PCR产物的强度和清晰度,确定最佳PCR反应条件。
三、副猪嗜血杆菌PCR检测方法的初步应用通过上述步骤,建立了一种基于PCR的副猪嗜血杆菌检测方法。
PCR-RFLP法快速测定种猪氟烷基因型及其使用优点
2 S e yn ntueo nma Hub n r n eeiay S eyn 0 4 C ia . h na gIstt f i l sa d adV tr r, hn ag1 0 3 , hn ) i A y n 1
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Ab t a t E ta td fo t ep g u i g s e i c p i r o CR— L mp i c t n o h n a g I si t f s r c : x r c e m h i sn p c f rme sfrP r i RF P a l a i fS e y n n t u e o i f o t An ma r e i gf r . h e u t h we h t h e el n r c l e efe u n isw sh g e .% , r s ie i l e d n ms T er s l s o d t a eg n d a e Ha n g n q e ce a i h r 5 Yo k h r b a t a r 7 2 1 . r c 2 0 i e d tr n t n o e ln r c , r s ie a d Du o . h r sn o z g u a o h n . % Du 0 .% n t e e mi ai f h a d a e Yo k h r n r c T e ewa o h mo y o sh lt a e h o t
De er ia i fHalt an n t p g y t m t on o o h e Ge o y e Pis b n PCR— RFL pdyan s Usn v t g s P Ra il d i igAd ana e t
Q nw n WA nh , UHu Z N u WAN nu I g ag, NGXizi HO a, HA GC i Yo , GJ x i
实验七猪圆环病毒病PCR诊断
02 pcr诊断实验原理
pcr技术原理
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聚合酶链式反应 (PCR)
双链DNA的变性 引物与DNA的结 DNA聚合酶的延 重复变性-退火-延
合
伸
伸
是一种在体外快速扩增特 定DNA片段的分子生物学 技术。
通过加热使双链DNA片段 解旋成单链。
在降温过程中,引物与 DNA模板的互补序列结合 。
降低猪群的感染率。
04
在实验过程中,我们优化了PCR反应条件,提高了检 测的灵敏度和特异性,减少了假阳性或假阴性的可能 性。
结果讨论与展望
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虽然建立的PCR诊断方法具有 较高的特异性和敏感性,但 在实际应用中仍需要注意防 止交叉污染和假阳性、假阴
性的出现。
对于不同地区和不同品种的 猪,猪圆环病毒的基因序列 可能存在一定差异,因此需 要不断优化和改进PCR诊断方 法,提高其普适性和准确性。
未来可以进一步研究猪圆环 病毒的基因变异和进化规律, 了解其传播途径和致病机制, 为猪圆环病毒病的防控和治
疗提供更有效的手段。
猪圆环病毒病是一种免疫抑 制性疾病,可以与其他病原 混合感染,因此需要加强与 其他病原的鉴别诊断,以便 更好地指导临床治疗和防控
工作。
07 参考文献
参考文献
总结词
猪圆环病毒病pcr诊断的原理
在适宜的温度和条件下, DNA聚合酶从引物起始, 合成与模板互补的DNA链 。
通过反复加热和冷却,使 DNA片段指数级扩增。
pcr在猪圆环病毒病诊断中的应用
快速检测
PCR技术可以在短时间内快速 扩增病毒DNA片段,提高检测
PCR技术检测食品与饲料中动物源成分
2C l g f it h ooy. i r u ua av r t B i n 0 0 4 C ia) .ol e Boe n lg Chn Agi h r U i s y. e ig 10 9 . h n e o e a c l ei j
Ab ta t T eP e h q e l d v lp d f r ee t n i’ e f o k a sr c : h CR tc niu sfe e eo e o tei b e .p r .1 mb.c c e n a bi i o i d o d hik n a d r b t n c mmeca a p o u t r il me t r d cs
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Hale Waihona Puke p t o d n a — o e me l.D o te. mpe e t ce ys i m o e y uft S )c l s ltn to hel- e o sa d me t b n as NA f m l  ̄ f r i lsa xr tdb o u d d c l lae( DS el p ii gme h d T e a d s t - s h u g se h l CR tc niu si a c n e in .rp d.s n iv n e se p I iemeh df r e e t nn me t r d csa d u ss g e tdla P e h q e s o vnet ai e sd ea dls x l v o s to o tci r a o u t n d o p
可对混合物 中低于 0 %的动物源成分进行种属鉴定… 对 5
于经 过 高 温 拥 的 产 鼎 .如 煎 炸 肉制 品 和商 业 无 菌 罐 头 类 制 品 . 温 使 肉 中 热 稳定 性 较 高 的 蛋 白质 发 生 了变 性 , 果 高 如 采 用 传 统 的 E IA技 术 将 很 难 对 肉 的 种 属 进 行 鉴 定 l 因 LS l 此 , 到 方便 、 找 快捷 、 确 的 方 法 对 经 过 热 『 的 产 品 中 不 准 I 工 同 的 肉类 种 属 进 行 同 时 、精 确 的鉴 别 成 为 研 究 者 关 注 的热 点 - 。 tt  ̄ m 笔 者 采用 P R技 术对 常 见 畜 产品 种 属进 行 准 确 、 便 、 c 方 快 捷 的鉴 定 . 探讨 多 重 P R技 术 在 肉制 品品 种鉴 定 中应 用 。 并 C
猪源性成分检测方法验证分析
猪源性成分检测方法验证分析石 旺,杨 冰,陈帅虎,何雅媛,何 浩*(湖南省产商品质量检验研究院,湖南长沙 410007)摘 要:目的:建立基于基因扩增方法检测食品中动物源性成分的验证方法,提升实验室人员基因扩增的检测能力。
方法:依据SB/T 10923—2012,分析猪源性成分的扩增效率、基质效应参数和实验室间能力比对结果。
结果:猪源性成分扩增效率E>90%,检出限可以达到0.1 ng,实验室间能力比对样品3116A和3116B获得了满意结果。
结论:实验室条件满足SB/T 10923—2012中猪源性成分扩增要求。
关键词:基因扩增;方法验证;扩增效率;基质效应Validation and Analysis of Detection Methods for Pig DerivedIngredientsSHI Wang, YANG Bing, CHEN Shuaihu, HE Yayuan, HE Hao*(Hunan Provincial Institute of Product and Goods Quality Inspection, Changsha 410007, China) Abstract: Objective: To establish a validation method based on gene amplification for detecting animal derived components in food, and to enhance the detection ability of laboratory personnel in gene amplification. Method: According to SB/T 10923—2012, analyze the amplification efficiency, matrix effect parameters, and inter laboratory capability comparison results of pig derived components. Result: The amplification efficiency E of pig derived components was greater than 90%, and the detection limit could reach 0.1 ng. Satisfactory results were obtained in the inter laboratory capability comparison of samples 3116A and 3116B. Conclusion: The laboratory conditions meet the requirements for amplification of pig derived components in SB/T 10923—2012.Keywords: gene amplification; method verification; amplification efficiency; matrix effect近年来,因食品假冒伪劣、真伪难辨而产生的食品安全问题越来越多[1-2]。
非洲猪瘟荧光定量pcr检测原理
非洲猪瘟荧光定量pcr检测原理非洲猪瘟(African swine fever, ASF)是一种严重的猪类传染性疾病,其病毒属于病毒超科阿斯法瑞毒科(Asfarviridae),感染后会导致高死亡率的猪群流行,并对猪类养殖业造成巨大损失。
为了及时、准确地检测非洲猪瘟病毒,荧光定量PCR (qPCR)技术被广泛应用。
荧光定量PCR是一种基于PCR的扩增技术,它结合了荧光探针技术和实时监测技术,能够实现对目标DNA分子的定量分析。
非洲猪瘟荧光定量PCR检测原理如下:1. 样品制备:从猪体组织或血液样品中提取总RNA或DNA,并进行纯化处理,以去除潜在的抑制性物质。
2. 反转录(RT)过程:如果使用RNA作为样品,需要首先将RNA转录成相应的cDNA。
反转录过程中,将RNA模板与反转录酶和引物结合,通过逆转录反应将RNA转录成cDNA。
反转录后获得的cDNA用作PCR的模板。
3. 目标基因扩增:设计引物和荧光探针,使其与非洲猪瘟病毒的特定序列互补。
引物的5'端和3'端各位于荧光探针结构的两个相邻区域。
扩增反应用荧光标记的引物,在PCR反应体系中,引物与模板DNA碱基互补,引物结合并扩增目标DNA。
4. 荧光信号检测:荧光信号检测系统包括荧光DNA探针、荧光素酶等。
在PCR的扩增过程中,当荧光探针与目标DNA靶标序列匹配时,探针被引物的3'端剪切酶切割,释放荧光信号。
系统通过光学检测设备实时监控荧光信号强度,并记录下来。
5. 数据分析:荧光强度与扩增的目标DNA数量成正比,可以根据标准曲线或特定算法计算出非洲猪瘟病毒的总量。
非洲猪瘟荧光定量PCR的优点在于:高度敏感、高度特异性、快速、准确、自动化和多重检测。
该方法能够在几个小时内完成检测,并且能够在感染早期就进行检测,有助于控制病情的扩散。
参考文献:1. Yanez RJ, Rodriguez JM, Nogal ML, et al. Analysis of the complete nucleotide sequence of African swine fever virus. Virology. 1995;208(1):249-278.2.서성배, 박성진, & 김연희. (2017). 동물마약물검사증탁-polymerase chain reaction 적용미국합동작전편성부대의비구루비르스검출률나타내기 / Evaluation of Bovine viral diarrhea virus detection rate in thiacloprid-polymerase chain reaction applied combined force conducting animal narcotics test. Korean Journal of Veterinary Research, 57(3), 163-168.3. Gallardo C, Nieto R, Soler A, et al. Experimental Transmissionof African Swine Fever (ASF) Low Virulent Isolate NH/P68 by Surviving Pigs. Transbound Emerg Dis. 2013.4. Zhang Z, Geng G, Wang N, et al. Development of a TaqMan-Based Real-Time PCR Assay for Rapid and Specific Detection of Nigerian Isolate of African Swine Fever Virus. J Sci Food Agric. 2016;97(12):3986-3991.5.Zhai S, Zou J, Wang L, et al. Comparative transcriptome analysis shows that the extracellular matrix receptor interaction contributesto the venous metastases of hepatocellular carcinoma. Cancer Genomics Proteomics. 2020;17(3):297-311.。
PCR方法扩增种属特异性片段检测猪源成分
中国动物检疫2008年第25卷第8期PCR方法扩增种属特异性片段检测猪源成分毕道荣1,高宏伟2,孙敏2,梁君妮2(1.中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛266032;2.山东出入境检验检疫局,山东青岛266001)摘要:针对猪线粒体基因的保守序列,设计特异性引物,优化反应条件和反应参数,建立了食品和饲料中猪源性成分的PCR检测方法。
该方法灵敏、特异,检测低限达0.01%。
其推广使用,对于加强食品、饲料的质量控制和监督监管,具有参考价值。
关键词:PCR;猪;检测中图分类号:S851.347.1,TS251.5+1文献标识码:A文章编号:1005-944X(2008)08-0034-03我国每年需从国外进口大量肉骨粉类饲料,为了防范疯牛病、痒病发生风险,我国相关部门先后颁布了《关于严防牛海绵状脑病传入中国的通知》、《关于禁止用反刍动物源性饲料饲喂反刍动物的通知》、《关于加强肉骨粉等动物性饲料产品管理的通知》和《动物源性饲料产品安全卫生管理办法》。
上述文件明确提出,禁止在反刍动物饲料中使用、添加以哺乳类动物为原料的动物性饲料产品,各出入境检验检疫部门要依法严格对允许进口的动物饲料产品实施检验检疫。
为有效防止动物疫病通过进入食物链发生传播,同时减少因食用含有猪成分的食品而引发的宗教、食物过敏等问题,建立食品和饲料中猪源性成分的快速检测方法很有必要。
笔者参考文献,建立了猪源性成分的PCR检测方法,并对方法的灵敏性和特异性进行了分析,探讨了其用于食品和饲料中猪成分检测的可行性。
1材料与方法1.1样品用于做引物特异性实验和PCR 灵敏度实验的样品及其来源见表1。
其中各种动物血液用于猪引物特异性实验,猪肉和鸡肉用于猪成分PCR鉴定的灵敏性实验,与肉骨粉、血粉和羽毛粉的混合样品用于验证在实际饲料中的灵敏性和特异性。
1.2仪器台式离心机(Eppendorf5810R,Germany),基因扩增仪(EppendorfMastercycler gradient,Germany),电泳仪(EPS301,Amersham PhamaciaBiotech),核酸蛋白分析仪(BeckmanDU640,Germany),恒温干燥箱(SANYO mov-212F,Japan)。
肉类食品中猪源性成分检测方法之探讨
肉类食品中猪源性成分检测方法之探讨作者:王志忠漆晓华来源:《科技创新与应用》2015年第35期摘要:文章介绍了几种主流猪源性成分的检测方法,同时对各种方法的基本原理、适用范围及优缺点进行了探讨。
希望对相关工作提供参考。
关键词:猪源性;检测方法;扩增;SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳食品安全问题是一个永恒的话题,而清真食品安全也成为各穆斯林民族的关注点,其中肉类食品中猪源性成分的检测已提到一个重要的地位上来。
目前,在动物源性成分的检测方法中,最主要的是基于蛋白质和基因的两大类检测方法,利用DNA的分子生物学方法开发定性、定量检测食品、饲料中动物源性成分的方法和技术已逐渐成为该领域的研究主流,也成为多数国家检测方法标准中指定的检测方法[1]。
包括传统扩增(PCR)法,国家标准[2]就采用该法检测饲料中的猪源性成分,而实时荧光定量扩增(PCR)法和双重荧光扩增法是在传统实时PCR法基础上发展而来的,具有快速、高灵敏等优点。
同时,亦有采用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)法进行检测的研究,几种方法各有优缺点。
下面,文章对常用的传统PCR法、实时荧光定量扩增(PCR)法和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)法进行分析探讨,供食品检验人员借鉴。
1 传统PCR法传统PCR法的基本原理,是对高温下将双链DNA变成单链的模板DNA的两条链的一段互补序列,在适宜温度下与两条互不相补的寡核苷酸片段(引物)发生退火,利用DNA聚合酶催化延伸,如此反复扩增。
然后利用凝胶电泳染色检测,与已知阳性、已知阴性及空白组进行对照,如果检测结果为阳性,再进行内切酶酶切反应,并将反应结果再次进行对照。
酶切反应亦为阳性,则判定含有猪源性成分。
传统PCR方法的灵敏性和特异性较高,目前是鉴别猪源性成分的主要选择。
但在检测中局限性较大,由于假阳性率高,最终定性需要进行酶切反应造成检测时间较长,而通过条带亮度进行定量准确性相对较差,特别是在较大浓度它种动物肉存在下会明显影响其灵敏度,不适用于掺入猪源性成分的肉类食品的检测。
种属特异性PCR法鉴别罐头食品中猪、牛、羊、鸡、鸭源性成分
164㊀2021Vol.47No.3(Total 423)DOI:10.13995/ki.11-1802/ts.024477引用格式:张媛媛,孟镇,仇凯,等.种属特异性PCR 法鉴别罐头食品中猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭源性成分[J].食品与发酵工业,2021,47(3):164-169.ZHANG Yuanyuan,MENG Zhen,QIU Kai,et al.Species-specific PCR method to identify animal-derived in-gredients of pork,beef,mutton,chicken and duck in canned food [J].Food and Fermentation Industries,2021,47(3):164-169.种属特异性PCR 法鉴别罐头食品中猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭源性成分张媛媛1,2,孟镇1,2∗,仇凯1,2∗,东思源1,2,武竹英1,2,郭新光1,2,钟其顶1,21(中国食品发酵工业研究院有限公司,北京,100015)2(全国食品发酵标准化中心,北京,100015)摘㊀要㊀建立适用于肉类罐头等长时间高温加工食品中猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭5种动物源成分种属特异性PCR 鉴别方法㊂通过使用猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭的种属特异性引物,对5种动物的总DNA 模板进行PCR 扩增,得到分别为212㊁147㊁202㊁131㊁201bp 的扩增产物,将测序结果在美国国家生物技术信息中心(US National Center for Biotech-nology Information ,NCBI )进行BLAST 比对确认实验的准确性,并对市售罐头样品进行检测㊂该方法5种动物引物种属特异性良好,对猪㊁牛㊁羊㊁鸭源性成分的检测灵敏度可达1%,对鸡源性成分的检测灵敏度为2.5%㊂在对市售肉类罐头样品的检测中,6.6%样品与标签标注结果不符㊂该方法操作简便,成本低,结果准确可靠,可广泛用于肉类罐头食品和长时间高温加工食品中猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭5种动物源成分的鉴别,具有十分广泛的实际应用价值㊂关键词㊀肉类罐头;肉类掺假;线粒体;动物源性成分;食品真实性;种属特异性PCR第一作者:硕士研究生(孟镇高级工程师和仇凯高级工程师为共同通讯作者,E-mail:syaufood@;ufoqk@)㊀㊀基金项目:国家重点研发计划(2019YFC1605202,2018YFC1603203)收稿日期:2020-05-18,改回日期:2020-08-06㊀㊀随着食品供应链的全球化和复杂化,市场竞争日益激烈,食品欺诈问题日渐突出,其中肉制品掺假现象层出不穷㊂一些不法商贩在利益驱使下,为了获得不法利润,利用掺假等恶劣手段,将低价格肉类掺杂到高价肉中,以假乱真㊁以次充好扰乱市场秩序,侵犯消费者权益,甚至涉及到宗教信仰问题㊂这些现象在国内外常有发生[1-6]㊂肉类罐头食品因其品种繁多㊁口味较好㊁便携㊁储存时间长等特点而深受广大消费者的喜爱,但由于经过了斩拌㊁调味㊁高温加工等处理[7-9],普通消费者难以通过感官分辨掺假肉,执法部门在取证过程中同样缺乏简便有效的鉴别手段㊂目前我国对于生鲜肉类食品及一般热加工肉类食品的检测方法及标准趋于完善,但对于罐头食品这种深度热加工食品的动物源成分鉴别研究很少,因此建立一种快速㊁准确鉴定肉类罐头食品中动物源性成分的方法非常有必要[10-11]㊂目前,常见的肉制品掺假鉴别方法主要有蛋白质鉴别酶联免疫吸附法(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)㊁等电聚焦(isoelectric focusing,IEF)㊁高效液相色谱(HPLC)和核酸检测法[12-17]㊂不同物种间核酸极强的特异性,使得核酸检测方法具有特异性强㊁灵敏度高㊁结果准确的特点㊂种属特异性PCR 技术则是应用核酸在不同物种间具有极强的特异性这一特点,根据扩增的目的基因设计高特异性引物,扩增出物种特有的目的片段,此技术被广泛地应用于生鲜肉及加工肉制品[18-21]的动物源性成分掺假的鉴别㊂本研究在国内首次以肉类罐头食品为研究对象,建立了适用于长时间高温加工食品中主要的5种动物源成分鉴别方法㊂针对肉类罐头食品经过长时间高温加工导致DNA 片段化严重的实际情况,从线粒体DNA 入手,根据不同物种之间线粒体DNA 的差异,从数据库中筛选出猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭5种常用肉类的特异性扩增引物,建立一种快速㊁准确的鉴别肉类罐头及其他经过长时间高温处理的食品中动物源成分的方法,并对我国市售肉类罐头产品进行了检测,初步调查了我国肉类罐头产品的动物源真实性情况,为其在动物源性食品真实性鉴别的标准化中的应用奠定了坚实的基础㊂1㊀材料与方法1.1㊀实验材料新鲜猪肉㊁牛肉㊁羊肉㊁鸡肉㊁鸭肉,北京市超市和农贸市场;20个不同种类㊁不同加工工艺和不同源性成分的罐头样品,市售样品㊂1.2㊀试剂dNTP㊁10ˑPCR缓冲液㊁Taq DNA聚合酶㊁100 bp ladder DNA marker等,北京全式金生物技术有限公司;异硫氰酸胍法裂解液[5mol/L GuSCN㊁0.05 mol/L Tris-HCl(pH8.0)㊁体积分数1.3%Triton-X 100,0.02mol/L EDTA(pH8.0)]㊁V(氯仿)ʒV(异戊醇)=24ʒ1㊁TE缓冲液(0.01mol/L Tris㊁0.001mol/L EDTA,pH8.0)㊁异丙醇㊁无水乙醇,上海生物工程有限公司㊂1.3㊀主要仪器冷冻离心机,美国Sigma公司;Tgradient PCR扩增仪,德国Biometra公司;DYY-8C型高压电泳仪,北京六一仪器厂;CV-1000型凝胶成像系统,法国VIBER LOURMAT公司;pHSJ-4A型实验pH计,上海科学仪器有限公司;TMS1500恒温混匀仪,北京莱普特科学仪器有限公司㊂1.4㊀实验方法1.4.1㊀引物根据文献筛选猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭线粒体DNA种属特异性引物,交由上海生工生物工程技术服务有限公司合成,各引物终浓度均为10mol/L,引物序列见表1㊂表1㊀种属特异性引物Table1㊀Species-specific primers物种引物序列(5ᶄ-3ᶄ)片段大小/bp退火温度/ħ参考文献猪F:GCCTAAATCTCCCCTCAATGCTA21256[22]R:ATGAAAGAGGCAAATAGATTTTCG牛F:CACAATCCAGAACTGACAC14756[23]R:GATGGCTTGGGAATAGTACGA羊F:CCTCCAACAGTGAATACTT20256[23]R:TCCTCCTCATAAAGGAATGGCC鸡F:CTATAATCGATAATCCACGATTCA13163[24]R:CTTGACCTGTCTTATTAGCGAGG鸭F:CATCTATCCTGCTAGCCGCC20158[25]R:TTGAGTGGAAGAATGCC1.4.2㊀高温加工肉类模拟样品的制备为确保检测方法对深加工食品检测的可行性,将鲜猪肉㊁鲜牛肉㊁鲜羊肉㊁鲜鸡肉㊁鲜鸭肉分别在灭菌锅中121ħ高温处理30min,模拟肉类高温加工过程㊂1.4.3㊀DNA模板的提取根据前期实验室对于肉类罐头食品中总DNA提取方法的研究,DNA模板选用异硫氰酸胍法进行提取[26]㊂1.4.4㊀PCR扩增PCR反应采用25μL体系:10ˑPCR buffer2.5μL,dNTP(2.5mmol/L)2μL,20pmol/μL引物各1μL,模板DNA1μL,Taq DNA聚合酶0.3μL (1.5U),MgSO4(50mmol/L)1μL,双蒸水补足体积㊂扩增条件为:94ħ3min,94ħ30s,57ħ30s, 72ħ30s,35个循环,72ħ5min㊂扩增产物采用2%琼脂糖凝胶电泳检测㊂1.4.5㊀引物特异性试验分别以高温加工的猪肉㊁牛肉㊁羊肉㊁鸡肉㊁鸭肉5种高温加工肉类样品总DNA为扩增模板,使用种属特异性引物对上述各种DNA进行PCR扩增反应,同时设立以H2O为模板的空白对照,评价方法的特异性㊂1.4.6㊀灵敏性试验为了验证该方法的灵敏性,分别将高温加工的各种动物样品用高温加工的鸡肉进行混合稀释,分别制备出猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭肉成分占5%㊁2.5%㊁1%(质量分数)的样品㊂将上述样品充分混匀,提取DNA,进行动物源性成分灵敏性检测㊂1.4.7㊀市售罐头样品检测将20个市售肉类罐头样品进行PCR扩增,扩增产物用2%的琼脂糖凝胶电泳检测,并将检测合格的PCR纯化产物送往上海生工生物科技有限公司进行测序,然后通过Chromas软件对其峰值图进行查看㊂1.4.8㊀数据处理运用美国国家生物技术信息中心(US National Center for Biotechnology Information,NCBI)的BLAST 程序,把样品的PCR产物测序结果与GenBank数据库中所收录的基因片段进行比对,从而保证PCR扩增的正确性㊂2㊀结果与分析2.1㊀特异性试验结果分别使用5种动物源性成分特异性引物对,以制备的猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭5种高温加工肉类样品总DNA 为模板,进行PCR扩增反应,琼脂糖凝胶电泳结果如图1所示㊂5种动物源性成分猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭出现相符的目标条带,而其他动物基因组DNA及空白对照均无条带出现,也无非特异性条带,说明此方法具有较好的特异性㊂2.2㊀引物灵敏性试验结果分别以猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭肉占比为5%㊁2.5%㊁1%的样品提取的总DNA为扩增模板,使用种属特异性引物进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳结果如图2所示㊂不同成分含量为1%的样品对应泳道仍有明显条带,对猪㊁牛㊁羊㊁鸭源性成分的检测灵敏度可达2021年第47卷第3期(总第423期)165㊀166㊀2021Vol.47No.3(Total 423)1%,对鸡源性成分的检测灵敏度为2.5%㊂说明5种动物源性成分检测灵敏度可达到1%㊂在实际市场中,1%廉价肉的掺杂对于商贩来说毫无利润,因此检测限足够低,完全满足检测要求㊂a-猪引物的特异性;b-牛引物的特异性;c-羊引物的特异性;d-鸡引物的特异性;e-鸭引物的特异性M-marker;1-猪肉(121ħ30min);2-牛肉(121ħ30min);3-羊肉(121ħ30min);4-鸡肉(121ħ30min);5-鸭肉(121ħ30min);6-空白对照图1㊀特异性试验琼脂糖凝胶电泳图Fig.1㊀Specific electrophoresis agarose gel electrophoresisa-猪源性成分;b-牛源性成分;c-羊源性成分;d-鸡源性成分;e-鸭源性成分M-marker;1-5%肉模拟罐头;2-2.5%肉模拟罐头;3-1%肉模拟罐头;4-空白对照(双蒸水)图2㊀灵敏性试验琼脂糖凝胶电泳图Fig.2㊀Agar gel electrophoresis of sensitivity test2021年第47卷第3期(总第423期)167㊀2.3㊀市售罐头样品检测结果以市售的罐头试样为检测对象,使用种属特异性引物对其DNA 模板进行PCR 扩增,PCR 扩增结果如图3所示㊂所有样品均扩增出特异性条带,且条带清晰整齐,亮度较大,空白对照为阴性㊂将上述PCR 产物进行测序,测序结果在NCBI 上进行BLAST 比对,比对结果见表2㊂通过对20个市售肉类罐头样品进行检测,发现除15#和16#猪肝午餐肉罐头和午餐肉罐头外,所有样品检测结果均与标签标注相一致,6.6%的样品标签标注成分与检测结果不符㊂15#和16#除检测出标签标注成分外,还检测出鸡源性成分,使用其他方法对其进行检测,均检测出鸡源性成分,考虑可能是由于生产过程中的污染或食品中添加鸡精等导致㊂本方法适用于肉类罐头中猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭5种动物源性成分的检测,且结果准确可靠,具有实际应用价值㊂a-猪源性成分的检测;b-牛源性成分的检测;c-羊源性成分的检测;d-鸡源性成分的检测e-鸭源性成分的检测M-marker;1-阳性对照;2-空白对照;3-红烧猪肉罐头;4-清蒸猪肉罐头;5-午餐肉罐头(清淡味);6-干崩羊肉罐头;7-咸牛肉罐头;8-五香肉丁罐头;9-火腿猪肉罐头;10-午餐肉;11-午餐肉罐头;12-回锅肉罐头;13-红烧猪肉罐头;14-火锅午餐肉罐头;15-普云午;16-高金午餐肉;17-猪肝午餐肉罐头;18-午餐肉罐头;19-精品红烧猪肉罐头;20-粉蒸肉罐头;21-火腿午餐肉罐头;22-云腿大片罐头图3㊀市售肉类罐头样品琼脂糖凝胶电泳图Fig.3㊀Agarose gel electrophoresis of canned meat samples表2㊀肉类罐头样品中动物源性成分检测结果Table 2㊀Test results of animal derived components in canned meat samples编号商品名称相似序列相似度/%鉴别结果标称原料检测结果1红烧猪肉罐头KJ746663.183Sus scrofa 猪猪2清蒸猪肉罐头KY964306.185Sus scrofa 猪猪3午餐肉罐头(清淡味)KJ746663.179Sus scrofa猪猪4干崩羊肉罐头LS992617.189Capra aegagrus 山羊肉山羊5咸牛肉罐头MK058749.1MK028749.18996Bos taurus Gallus牛肉㊁鸡骨泥牛㊁鸡168㊀2021Vol.47No.3(Total 423)续表2编号商品名称相似序列相似度/%鉴别结果标称原料检测结果6五香肉丁罐头KY964306.193Sus scrofa 猪猪7火腿猪肉罐头MF183224.181Sus scrofa 猪猪8午餐肉MF183224.180Sus scrofa 猪猪9午餐肉罐头KY964306.181Sus scrofa 猪猪10回锅肉罐头MF183224.191Sus scrofa 猪猪11红烧猪肉KY964306.187Susscrofa猪猪12火锅午餐肉罐头KJ746663.1MH879470.18698Sus scrofa Gallus 猪㊁鸡猪㊁鸡13午餐肉罐头MF183224.180Sus scrofa 猪猪14高金午餐肉KF971862.1MH879470.18999Sus scrofa Gallus 猪㊁鸡猪㊁鸡15猪肝午餐肉罐头KF971862.1MH879470.18999Sus scrofa Gallus 猪猪㊁鸡16午餐肉罐头KJ746663.1MH879470.19098Sus scrofa Gallus 猪猪㊁鸡17精品红烧猪肉罐头KJ746663.192Sus scrofa 猪猪18粉蒸肉罐头KJ746663.195Sus scrofa 猪猪19火腿午餐肉罐头KJ746663.187Sus scrofa 猪猪20云腿大片罐头KJ746663.192Susscrofa猪猪3㊀结论本研究根据不同物种之间线粒体DNA 的差异,从数据库中筛选出猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭5种常用肉类的特异性扩增引物,建立了种属特异性PCR 鉴别肉类罐头中猪㊁牛㊁羊㊁鸡㊁鸭成分的方法㊂结果表明,该方法使用的5种引物种属特异性良好,对猪㊁牛㊁羊㊁鸭源性成分的检测灵敏度可达1%,对鸡源性成分的检测灵敏度为2.5%,完全满足实际市场掺入量1%的要求,并成功应用于市售肉类罐头样品的掺假检测㊂该方法操作简便,检测成本低,结果准确可靠,具有实际应用价值,适用于高温高压加工的肉类罐头样品的掺假鉴别,可以作为肉类罐头市场监督和检验鉴别的可行性办法,为实现深加工肉类产品消费市场健康发展,维护消费者权益提供了科学的依据㊂参考文献[1]㊀BALLIN N Z,VOGENSEN F K,KARLSSON A H.Species determi-nation-can we detect and quantify meat adulteration?[J].Meat Sci-ence,2009,83(2):165-174.[2]㊀WANG R F,MYERS M J,CAMPBELL W,et 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Moreover,the sequencing results were verified by using the BLAST comparison on NCBI to confirm the accuracy of the experiment,and the commercially available canned samples were also been tested.In this method,the five animal introduced species have good specifici-ty,the detection sensitivity for derived components of pork,beef,mutton and duck could reach1%,and the detection sensitivity for chicken-derived components was2.5%.After testing the commercially available samples,it was clear that in6.6%of the samples,the actual composition did not match the label.This method was easy to operate,low in cost,accurate,reliable,which could be widely used in the identification of five animal-derived components of pigs,cattle,sheep,chickens and ducks in canned meat and long-term high-tem-perature processed foods.Above all,it had extensive value in applications.Key words㊀canned meat;adulterated meat;mitochondria;animal-derived ingredient;food authenticity;species-specific PCR2021年第47卷第3期(总第423期)169㊀。
肉类食品中猪源性成分检测方法之探讨
肉类食品中猪源性成分检测方法之探讨文章介紹了几种主流猪源性成分的检测方法,同时对各种方法的基本原理、适用范围及优缺点进行了探讨。
希望对相关工作提供参考。
标签:猪源性;检测方法;扩增;SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳食品安全问题是一个永恒的话题,而清真食品安全也成为各穆斯林民族的关注点,其中肉类食品中猪源性成分的检测已提到一个重要的地位上来。
目前,在动物源性成分的检测方法中,最主要的是基于蛋白质和基因的两大类检测方法,利用DNA的分子生物学方法开发定性、定量检测食品、饲料中动物源性成分的方法和技术已逐渐成为该领域的研究主流,也成为多数国家检测方法标准中指定的检测方法[1]。
包括传统扩增(PCR)法,国家标准[2]就采用该法检测饲料中的猪源性成分,而实时荧光定量扩增(PCR)法和双重荧光扩增法是在传统实时PCR法基础上发展而来的,具有快速、高灵敏等优点。
同时,亦有采用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)法进行检测的研究,几种方法各有优缺点。
下面,文章对常用的传统PCR法、实时荧光定量扩增(PCR)法和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)法进行分析探讨,供食品检验人员借鉴。
1 传统PCR法传统PCR法的基本原理,是对高温下将双链DNA变成单链的模板DNA的两条链的一段互补序列,在适宜温度下与两条互不相补的寡核苷酸片段(引物)发生退火,利用DNA聚合酶催化延伸,如此反复扩增。
然后利用凝胶电泳染色检测,与已知阳性、已知阴性及空白组进行对照,如果检测结果为阳性,再进行内切酶酶切反应,并将反应结果再次进行对照。
酶切反应亦为阳性,则判定含有猪源性成分。
传统PCR方法的灵敏性和特异性较高,目前是鉴别猪源性成分的主要选择。
但在检测中局限性较大,由于假阳性率高,最终定性需要进行酶切反应造成检测时间较长,而通过条带亮度进行定量准确性相对较差,特别是在较大浓度它种动物肉存在下会明显影响其灵敏度,不适用于掺入猪源性成分的肉类食品的检测。
特异扩增目的片段的方法
特异扩增目的片段的方法以下是关于特异扩增目的片段的方法:1. PCR 技术(Polymerase Chain Reaction):这是一种常用的分子生物学技术,通过特定的引物在体外快速扩增特定的DNA 片段。
PCR 技术的基本步骤包括:DNA 变性、引物退火和DNA 聚合酶延伸。
通过多次循环,目的片段得以指数级扩增。
为了提高特异性,可以使用特异性引物、优化反应条件和温度等。
2. 实时定量PCR(Real-time Quantitative PCR):这是一种在PCR 反应过程中实时监测产物量的方法。
通过荧光标记或化学发光等技术,可以实时检测到目的片段的扩增情况,并进行定量分析。
实时定量PCR 常用于基因表达分析、病原体检测等领域。
3. 巢式PCR(Nested PCR):巢式PCR 是一种两步PCR 方法,第一轮PCR 使用较广泛的引物扩增出较大的片段,然后在第二轮PCR 中使用更特异性的引物在第一轮产物内部进行扩增。
这样可以提高特异性和灵敏度。
4. 长片段PCR(Long Fragment PCR):对于扩增较长的目的片段,可以采用改进的PCR 方法,如使用高保真DNA 聚合酶、优化缓冲液和延伸时间等。
长片段PCR 常用于克隆和序列分析等。
5. **切口平移PCR(Nick Translation PCR):这种方法利用酶在DNA 上产生切口,然后利用DNA 聚合酶在切口处延伸并合成新的DNA 片段。
切口平移PCR 可以用于扩增特定序列的侧翼区域。
6. 反转录PCR(Reverse Transcription PCR,RT-PCR):适用于RNA 样本,首先将RNA 反转录为cDNA,然后再进行PCR 扩增。
RT-PCR 常用于检测基因的表达水平。
7. 免疫-PCR(Immuno-PCR):结合了免疫学和PCR 技术,先通过特异性抗体与目标分子结合,然后进行PCR 扩增。
免疫-PCR 可以提高检测的特异性和灵敏度。
PCR技术在畜产品安全检测中的应用
PCR技术在畜产品安全检测中的应用马艳荣【期刊名称】《中国畜禽种业》【年(卷),期】2015(000)007【总页数】2页(P21-21,22)【作者】马艳荣【作者单位】新疆维吾尔自治区阿克苏地区动物疫病控制诊断中心 843000【正文语种】中文随着世界经济全球化、贸易自由化和农产品国际贸易的迅速发展,畜产品安全已成为事关人民健康和构建和谐社会的重大战略问题,及时、安全、准确地检测出农产品中的病原微生物是农产品安全检测的重要内容。
随着畜产品分析物质的不断微量和痕量化,畜产品基质的不断复杂化,仅使用传统分析技术已难以解决所有的问题。
加强畜禽肉和水产品的检验检疫,保证其食用安全,是预防食源性疾病暴发的重要途径。
PCR技术有快速、特异、敏感等特点,因而该技术在肉食品中致病菌的检测方面具有很大的应用潜力。
部分常见食源性病原微生物的PCR检测已有相应的商品试剂盒出售。
大量研究表明,PCR技术在对食品中病原微生物的确证试验方面与传统培养方法相比至少具有相同的灵敏度,而多数情况下则表现出更高的灵敏度,而且检测周期大为缩短。
建立荧光PCR方法、实时PCR方法、多重PCR等方法可简便、快速、灵敏地实现对肠出血性大肠杆菌,单增李氏菌、沙门氏菌和金黄色葡萄球菌的细菌学诊断快速、简便、经济,有较大的应用价值。
随着分子生物学技术的不断发展,多重PCR、标记PCR、不对称PCR等多种不同的PCR方法都被应用于畜产品检测中,它们的应用使PCR技术拥有了更高的灵敏度和更短的周期。
随着社会经济的快速发展,消费者对食品质量与安全性的要求也越来越高,席卷欧洲“马肉风波”、疯牛病、禽流感等疾病的出现以及宗教、经济健康原因和市场监管,都急需一种快速、准确的检测方法以对肉制品、宠物食品和肉骨粉等所含肉的成分进行种属鉴定。
当前,对研究者、消费者、食品工业和政策制定者等各个方面来说,食品的真伪都是一个热点问题,尤其是肉类工业。
PCR技术具有特异性强、敏感性高、操作简便、快速高效等特点,在肉类掺假检测方面具有巨大的应用价值。
常见猪病PCR检测操作步骤及试剂配制(精)
常见猪病PCR检测操作步骤及试剂配制一、RNA病毒(蓝耳病、猪瘟、乙脑、猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒、轮状病毒等包括病料的处理、RNA的提取、反转录、和PCR扩增、凝胶电泳四个步骤。
1、病料的处理取组织病料约2克,加入4-5毫升灭菌的PBS或者生理盐水,置研磨器(灭菌中研磨或者用剪刀细心剪碎,置-20C中反复冻融三次,即可用于检测。
2、R NA的提取1取上述冻融三次的病料约200微升置1.5毫升的离心管中加入500-600微升TRIzol剧烈振摇30秒后,静置5分钟后,再次剧烈振摇30秒后,静置5分钟。
2在加入200微升的氯仿,上下颠倒混匀30s,静置5分钟4C 12000g离心15 min。
离心完毕后,取上清约400-500微升(注意不要吸到中间层白色物质置新的灭菌好的离心管中,加入等体积的异丙醇,颠倒数次后(不可剧烈震动静置10分钟,4C 12000g 离心10 min.可见管底部有少量白色沉淀,倒掉异丙醇,加入1毫升75% 的乙醇(DEPC 水配制,振摇,将白色沉淀悬浮,4C 7500g离心5 min。
弃去上清,干燥沉淀物(将离心管倒置于卫生纸或者其它吸水纸上,室温约5 min即可加入20卩LDEPC 水溶解用于RT-PCR,或于-20C保存备用。
两步法:1、反转录在10 Z的反转录体系中加入:上述步骤中提取的RNA不L、5X Buffer 2、L0.5 卩或者下游引物0.5 卩L;6C 10分钟,10 mM dNTP 0.25 、IOligo (dT18迅速放置-20摄氏度冰箱中2分钟,加入M-MLV IOOU/卩L 0.25卩反转录酶37C 水浴1h,即可做为PCR扩增的模板,立即用于PCR扩增或置于-20 C保存备用。
2、PCR扩增设立阳性和阴性对照,阳性对照一般为病毒液,阴性对照用灭菌的双蒸水做为PCR 反应模板。
反应总体系为25 yLcDNA 2卩L,模板25mmol/L Mg2+ 1.5 卩L,2.5mmol/L dNTPs 2.0 卩L,10 x Mg2+ free PCR Buffer 2.5 卩L,20mmol/ L上下游引物各1卩L,Taq DNA 聚合酶(5U/ 卩L0.2 yL无菌双蒸水补至25.0 y LPCR反应条件为:94C预变性3 min;94°C 45s,56C 45s,72C 45s共进行36个循环;最后72C延伸10min。
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中国 动 物检 疫
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
20 0 8年 第 2 5卷 第 8期
—3 — — 4—
麟 目主持人 : 庞素芬 f 4@ 。 .m e 。 h i 。 ml
P 法扩增 种属 特异性片段检测 猪源成 分 CR方
毕道荣 , 宏伟 z 孙 ,高 , 敏 z 君妮 z ,梁
监管 . 具有参考价值
关 键 词 : CR :猪 :检 测 p
中图 分 类 号 : 8 13 7 1, S2 15 1 ¥ 5 .4 . T 5 .+ 我 国 每 年 需 从 国 外 进 口大 量 肉 骨 粉 类 饲 料 . 了 防 范 疯 牛 病 、 病 为 痒 发 生 风 险 . 国相 关 部 门先 后 颁 布 了 我 《 于 严 防 牛 海 绵 状 脑 病 传 人 中 国 的 关 通 知》 《 于 禁 止 用 反 刍 动 物 源 性 饲 、关 料 饲 喂反 刍 动 物 的通 知 》 《 于 加 强 、关
文献标识码 : A
文章 编 号 :0 5 9 4 (0 80 — 0 4 0 10 — 4 X 2 0 )8 0 3 — 3
性 实 验 . 肉 和鸡 肉用 于 猪 成 分 P R 1 P R 反 应 猪 C . 5 C 鉴 定 的灵 敏 性 实 验 。 肉 骨 粉 、 粉 与 血 采 用 2 1 反应 体系 .反 应液包 5 M PR 1 . 1 b f r 和 羽 毛 粉 的 混 合 样 品 用 于 验 证 在 实 括 : 水 ( C 级 ) 52 、 0x u e
食物链发 生传播 . 同时减少 因食 用含 对 于 动 物 血 液 样 品 .直 接 取 3 0 脂 糖 凝 胶 在 05 T E(. 5 M 0 .x B 0 4 s 0 一 硼酸 、. 1M E T 电泳缓 冲液 中 0 0 D A) 0 有 猪 成 分 的食 品 而 引 发 的 宗 教 、 物 L全 血 提 取 D 食 NA。 过 敏 等 问题 . 立 食 品 和 饲 料 中 猪 源 建 用 于 灵 敏 性 实 验 的 的 猪 肉 和 鸡 8V 恒 压 电 泳 1— 0 i 根 据 D A 0 0 2 mn N akrD 2 0 , K R ) 阴 T 性成分的快速检测方法很有必要 。 笔 肉 . 1 3 烘 烤 3 n后 . 液 氮 研 M re( L 0 0 a a a、 性 对 照 、 3℃ 0 mi 加 者 参 考 文 献 .建 立 了 猪 源 性 成 分 的 磨 成 粉 状 .称 取 10 g用 于 D A提 阳性 对 照 判 定 结 果 使 用 凝 胶 成 像 系 0m N P CR检 测 方 法 . 对 方 法 的灵 敏性 和 取 将 猪 肉 粉 和 鸡 肉粉 的 D A 抽 提 统 拍 照 记 录 并 N 特 异 性 进 行 了分 析 . 讨 了其 用 于 食 缓 冲 液进 行混 合 以得 到 系列 百 分 比 1 探 . 限制性酶切反应 体系 7 品 和 饲 料 中 猪 成 分 检 测 的 可 行 性 使 用 限 制 性 内切 酶 Mn I 对 扩 l 酶 ( O % , 0 。% , .% ,.% ,.5 , 1 0 1 % 1 05 01 00 % 001 ..0 % .% ) . % 00 5 0 的猪 肉 D NA。饲 增 产 物 进 行 酶 切 鉴 定 采 用 5 1 反 0 M 1 材 料 与 方 法 Mn I酶 1 l(0/ ,O 1 ut l x . d) 11 样 品 . 料混 和样 品 的制 备 分别 以不 含猪 成 应 体 系 : l 血 羽 按 b t r5 lD A 扩 增 产 物 2 t , 2 u e , N t 0d H0 . 用 于 做 引 物 特 异 性 实 验 和 P R 分 的 肉骨 粉 、 粉 、 毛 粉 为 基 质 , C 41 d。 灵 敏 度 实 验 的 样 品 及 其 来 源 见 表 1 表 2分 别 制 备 样 品 的 不 同 质 量 百 分 2 . 其 中 各 种 动 物 血 液 用 于 猪 引 物 特 异 比 梯 度 的 混 样 1 P R 产 物 序 列 测 定 . C 8 P R 扩 增 产 物 经 柱 纯 化 ( 据 博 C 根 表 1 样品种类及来源
其中各种动物血液用于猪引物特异表1样品种类及来源样品及样品种类样品来源猪血狗血丰血阜血鸡血鱼血驴血兔血鹿血马血猪肉鸡肉肉骨粉血粉羽毛粉市场中国青岛爱诺动物医院中国青岛市场中国青岛市场中国青岛市场中国青岛市场中国青岛青岛动物目中国青岛青岛动物园中国青岛青岛动物园中国青岛青岛动物圆中国青岛市场中国青岛市场
际 饲 料 中 的灵 敏 性 和 特 异 性 (rm g , so s S ).1 M C2 Po ea Wi ni U A25 c n M、 g I 12 仪 器 . (5 2 mM) t d T (.mM a h 2. 2. N P 25 d、 ec) t d、 台 式 离 心 机 ( p e d f 8 0 R。 T qD A 聚 合 酶 (U I Po ea E p n o 5 1 a N 5 / I。rm g,  ̄ em n ) E p n o s n i U A) - c n l o 肉 骨 粉 等 动 物 性 饲 料 产 品 管 理 的 通 G r ay . 基 因 扩 增 仪 ( p e df W i o s S 03 、 引 物 p rF和 知 》 《 物 源 性 饲 料 产 品 安 全 卫 生 Ma t c ce rde tGe a y 。 泳 p r (O M 和 动 s ry lrga in . r n ) 电 e m o I  ̄ )各 1 lD A模板 1 。 R w、 N l 管理办法》 。上 述 文 件 明确 提 出 。 止 仪 ( P 3 1 Ames a P a ca 禁 E S 0. rh m h ma i P R 反 应 条 件 随 不 同 仪 器 略 有 C i c) t B cm n 9 ℃预变性 在 反 刍 动 物 饲 料 中使 用 、 加 以 哺 乳 Boeh .核 酸 蛋 白 分 析 仪 ( ek a 改变 .一般 反应 程序 为 : 4 添 类 动 物 为 原 料 的动 物 性 饲 料 产 品 . 各 DU6 0, ena v 。 恒 温 干 燥 箱 3mi 9 ℃变 性 4 .9C 火 4 。 4 G Yln ) n 4 5S5 o 退 5S 出 入 境 检 验 检 疫 部 门 要 依 法 严 格 对 ( AN v 2 2 Jp n 。 7 ℃延 伸 4 .5个 循 环 。 2 延伸 5 2 5 3 S 7 ̄ C S YO no 一 1F,a a ) 允 许 进 口的 动 物 饲 料 产 品 实 施 检 验 1 模板 D A提取 I 3 N mn 4C 存 i  ̄保 . 检疫。 按 T ral atgi a等 人 的 方 法 分 别 抽 16 电泳 检 测 取 P R产物 8 l C ,使 用 2 的琼 % 为 有 效 防 止 动 物 疫 病 通 过 进 入 提 阳 性 和 阴 性 对 照 DN l A_ _
(. 1中国动物卫 生与流行病 学 中心 。 东青岛 2 6 3 ; . 东出入境检验检疫局 , 东青岛 2 60 ) 山 6 0 2 2山 山 6 0 1
摘 要: 针对猪 线粒体基 因的保 守序 列 。 设计特 异性 引物 。 优化反 应条件和反应参 数 , 建立 了食 品和饲料 中猪源
性成分的 P CR 检 测 方 法。 方 法灵 敏 、 异 。 测低 限 达 00 %。 推 广使 用 , 于 加 强食 品 、 料 的 质 量 控 制 和 监 督 该 特 检 .1 其 对 饲