质粒DNA提取实验
质粒DNA的提取
质粒DNA的提取一、原理采用碱变性发抽提取质粒DNA。
该法是基于染色体DNA与质粒DNA的变性预复性的差异而达到分离目的的。
在PH大于12的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开变性。
质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当以pH5.2的乙酸钠高盐缓冲液调节其pH至中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,保存在溶液中。
而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构。
通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
二、方法1.挑取一环在LB固体培养基平板上生长的含PUC57质粒的大肠杆菌,接在含有100μg/ml氨苄青霉素(Amp)的LB液体培养基(5ml/15ml试管)中,37℃震摇培养过夜。
2.将1.5ml菌液加入微离心管中,14000r/min,离心10秒,其取上清液。
反复数次,收集全部菌体。
3.倾去上清,滤纸吸干。
4.加30μlTE缓冲液(10mmol/L Tris—HCl,1mmol/L EDTA,pH8.0),振荡起菌体。
5.加30μlTENS溶液(10mmol/L Tris—HCl, pH8.0,1mmol/L EDTA,0.1mol/LNaOH,0.5%SDS),震荡10秒至溶液变粘稠。
6.加150μl 3.0mol/LnaAC,震荡3—5S,14000r/min,离心3分钟,沉淀细胞碎片及染色体DNA。
7.上清液转移至另一微离心管中,甲等体积胞和酚,混匀,12000r/min,离心2分钟。
8.上层水相转移至另一位离心管,加2倍量冷水乙醇,14000r/min,离心20分钟。
9.倾去乙醇,加入7o%冷乙醇淋洗。
10.倾去乙醇,滤纸吸于,真空抽吸2~3分钟。
lI.加人50μlTE缓冲液,溶解DNA。
12,加入1μl核糖核酸酶(10mg/m1),14000r/min,离心2s,使核糖核酸酶与管底液体混匀。
质粒DNA的提取
§2 质粒DNA的提取一、实验目的本实验通过质粒快速提取试剂盒的试剂对大肠杆菌中的重组质粒pET22b的抽提,掌握质粒DNA的小量制备方法,了解碱裂解法制备质粒DNA的原理。
二、实验原理载体是基因工程所必需的工具,它用于将目的基因运载到宿主细胞内的克隆与表达。
自然界的质粒经改造以后,常被用作基因工程技术的基因载体。
常用的载体有质粒、λ噬菌体、M13噬菌体、逆转录病毒DNA和昆虫病毒DNA等,而质粒是最常用的载体。
细菌质粒是存在于细菌染色体外,能够独立复制的环状DNA。
质粒DNA小量制备是基因工程操作中的常规技术,提取的质粒DNA可用于酶切、连接与转化等。
从大肠杆菌细胞中分离质粒DNA 的方法众多,其分离可依据并选择利用DNA分子大小不同,碱基组成的差异以及质粒DNA的超螺旋共价闭合环状结构等特点来进行。
常用的有碱变性抽提法,羟基磷灰石柱层析法,质粒DNA释放法,两相法以及溴化乙锭-氯化铯密度梯度离心法。
以上各种方法均有利弊,因此在制备质粒DNA时,要根据以下几个方面进行比较,选择最佳的实验方法:(1)质粒特性:如质粒宿主的菌属,是否需要用溶菌措施。
质粒DNA的大小,分子量大的在制备过程中易受损伤,DNA易产生缺口;拷贝数、构型、复制型是否需要氯霉素扩增等。
(2)提取质粒DNA的用量与用途:如用于初筛比较分子量大小、进行酶切、作探针或测序等。
(3)提取方法的成本、程序、重复性、纯度以及实验室具备的条件等。
目前实验室中最常用、最有效的方法为碱变性抽提法和溴化乙锭-氯化铯密度梯度离心法两种。
碱变性抽提法效果良好,既经济且收得率较高。
提取到的质粒DNA可用于酶切、连接与转化。
但该法如操作不慎,会影响纯度,且步骤复杂,费时较多。
对于分子量较大拷贝较少的质粒DNA,由于DNA片段较大易于损伤断裂,因此选用氯化铯密度梯度超离心法抽提DNA,该法具有纯度高、步骤少、方法稳定且获得的质粒DNA是超螺旋构型等特点。
质粒DNA的提取
质粒DNA的提取方案一常规小量提取(碱裂解法)【实验目的】(1)掌握碱裂解法小量提取质粒DNA的原理及操作过程。
(2)掌握微量加样器的使用方法。
【实验原理】在NaOH存在的碱性环境(pH值12.0~12.6)中,线性的大分子量细菌染色体DNA变性,而共价闭环质粒DNA由于分子量小且缠绕紧密,仍为自然状态。
将pH值调至中性并有高盐浓度存在的条件下,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构,大部分DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA恢复可溶状态的。
通过离心,去除大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质等物质,上清液中的质粒DNA可用酚/氯仿抽提。
【实验试剂】(1)溶液I:50mmol/L葡萄糖25mmol/LTris-HCl(pH值8.0)10mmol/LEDTA(pH值8.0)溶液I可成比配制,每瓶约100ml,在6.9×10°Pa(10lbf/in²)高压下蒸汽灭菌15min,贮存于4℃下。
(2)溶液Ⅱ:0.2mol/LNaOH(临用前用10mol/L贮存液稀释)1%SDS(3)溶液Ⅲ:5mol/L乙酸钾60ml冰乙酸11.5ml水28.5ml(4)酚(pH值7.8~8.0)。
(5)氯仿。
(6)TE缓冲液。
(7)6×DNA上样缓冲液。
(8)0.8%琼脂糖。
(9)无水乙醇。
【实验器材】(1)低温高速离心机。
(2)旋涡振荡器。
(3)Eppendorf管(EP管)。
(4)微量移液器。
(5)移液器头。
(6)电泳仪与电泳槽。
(7)紫外透射仪。
【实验样本】细菌(含某种质粒)。
【实验步骤】(1)将5ml菌液分次装入同一1.5mlEP管中,3000r/min离心5min,以收集菌体。
(2)将细菌沉淀重悬于100μl用冰预冷的溶液I中,剧烈振荡5min。
(3)加200μl新配制的溶液Ⅱ,盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以混合内容物,不可强烈振荡,放置于冰上3min左右。
质粒dna提取实验报告
质粒dna提取实验报告实验目的:本实验旨在通过提取细菌质粒DNA,了解细菌质粒的结构、基因组成和使用纯度较高的质粒DNA的重要性,为后续分子生物学实验打下基础。
实验器材:- 细菌- LB液体培养基- 1.5mL微量离心管- 离心机- 动态温度水浴仪- 恒温振荡器- 超声波清洗器- 洁净平台和无菌技术用品- 始终细切割刀和取样刷- 蒸馏水、2% SDS、醋酸铵、90%乙醇、异丙醇和干燥机实验步骤:1. 制备细菌:在LB液体培养基中培养要提取质粒DNA的细菌,由于质粒DNA在对数生长期达到最高含量,因此在显微镜下观察到对数生长期的细菌时进行取样。
2. 细胞打破和溶解质粒:离心细胞,倒去培养基,加入10mL蒸馏水,用振荡器在4℃下以300rpm摇晃3小时。
然后沉淀细胞,在70℃下干燥30分钟。
随后加入150μL1%SDS和其他化学试剂混合物,使用至少15次的起始细切割刀切成绒毛状的颗粒,浸泡在低盐度醋酸铵中2小时以上。
3. 质粒DNA纯化:将浸泡了细菌绒毛颗粒的混合物离心,抽取上清液,将其加入2x体积的异丙醇与等体积的75%,然后用再生明胶抑制蛋白质在异丙醇中凝聚。
离心,除去异丙醇上清液,加入70%乙醇洗涤。
最后用干燥机吸干。
4. 质量分析:分析提取到的质粒DNA的浓度和纯度,使用分光光度计对其进行光谱分析,以检测质粒DNA的A260/A280比例和A260/A230比例。
通过比较纯度,然后将质粒DNA冻保存至-20℃或-80℃。
实验结论:本实验成功提取了细菌的质粒DNA,并进行了纯化和分析。
质粒DNA的提取和纯化是基于一系列物理和化学方法和技术的,实际操作中需要仔细操作,耐心等待,严格注意洁净操作,才能达到最佳的提取和纯化效果。
通过本实验,我进一步了解了在分子生物学和遗传学中质粒DNA的重要性,它可适用于多种研究项目和应用,例如质粒克隆、基因编辑、基因表达、和质粒蛋白质互作等。
基础生物化学实验实验六 质粒DNA的提取(碱裂解法)及酶切分析)
(2) 挑选单菌落,在无菌条件下放入5 ml LB液体培养基中 (100 g /ml氨苄青霉素),200-300 rpm,37℃过夜培养。 (3) 取1.5 ml菌液(其余菌液加入25%的灭菌甘油,放入对 应编号的1.5 ml离心管中,-70℃ 下作菌种保存),5000 g离心5 min。 (4) 弃上清夜,加入100 l预冷的溶液I,悬浮沉淀,室温 放 置5 min。 (5) 加入200 l 新鲜的溶液II,边加边震荡,但不能剧烈, 冰上放置5 min。 (6) 加入75 l溶液III,震荡混匀,冰上放置5 min。 (7) 12000 g 离心5 min。 (8) 取上清液,加入两倍体积的预冷无水乙醇,12000 g离 心10 min。 (9) 用1 ml 70%的乙醇洗涤沉淀,空气中放置3-5 min。 (10) 用30-50 l TE溶解,用紫外分光光度计进行DNA含量 测定,EB琼脂糖(1.4%)凝胶电泳分析。
实验六 质粒DNA的提取(碱裂解法)及酶分析
(1) 溶液配制: 溶液 I 50 mmol/L 葡萄糖 25 mmol/L Tris-Cl (pH 8.0) 10 mmol/L EDTA (pH 8.0) 溶液 II 0.2 mol/L NaOH 0.5% SDS 溶液 III 3 mol/L KAc (用冰醋酸调 pH值至5.0)
质粒DNA的酶切分析参照相关酶的说明书 操作步骤进行
质粒dna的提取
质粒DNA的提取1. 引言质粒DNA提取是在分子生物学研究中常用的实验操作之一。
质粒是一类圆环状的DNA分子,存在于原核生物中。
质粒DNA提取的目的是为了获取纯度高的DNA样品,以便进行后续的实验操作,如聚合酶链式反应(PCR)、限制性酶切、测序等。
2. 实验材料在进行质粒DNA提取实验前,需要准备以下实验材料:•细菌培养液:含有所需质粒的培养液。
•碱裂解液:用于裂解细胞并释放质粒DNA的实验液。
•高盐含量的溶液:用于提取DNA。
•蛋白酶K:用于消化蛋白质。
•硅胶粉末:用于吸附DNA。
•乙醇:用于沉淀DNA。
•TE缓冲液:用于溶解和储存提取的质粒DNA。
3. 实验步骤3.1 细菌培养与收获首先,需进行细菌培养和收获,以获取含有所需质粒的培养液。
培养液中的细菌应为含有目标质粒的菌株,如大肠杆菌。
3.2 细胞破碎与质粒DNA释放将收获的细菌培养液进行离心,去除培养液并沉淀细胞。
然后将细胞重悬于碱裂解液中,用震荡器在适当的温度和时间条件下裂解细胞,释放质粒DNA。
3.3 蛋白质消化为了去除细胞中的蛋白质,加入适量的蛋白酶K,进行蛋白消化。
消化的时间和温度应根据实验要求进行调整。
蛋白消化完成后,通过离心将蛋白质沉淀分离。
3.4 DNA提取将消化液中的DNA溶液转移到其它离心管中,并加入高盐含量的溶液。
通过离心将DNA与其他杂质分离。
此步骤中,DNA会被溶液中的硅胶粉末吸附,以去除杂质。
3.5 DNA沉淀将去除杂质的DNA溶液转移到新的离心管中,加入冰冷的乙醇。
通过离心,将沉淀的DNA分离出来。
注意,在沉淀过程中,应避免DNA的过度离心,以免损坏DNA分子。
3.6 DNA溶解和储存将DNA沉淀后,溶解在适量的TE缓冲液中。
TE缓冲液具有适当的pH值和离子浓度,能够稳定DNA分子,并提供良好的保存条件。
4. 实验注意事项在质粒DNA提取实验中,需要注意以下几点:•操作过程应严格遵守无菌操作,避免外源性DNA的污染。
质粒dna提取步骤
质粒dna提取步骤
质粒 DNA 提取是分子生物学实验中的一项基本技术,用于从细菌细胞中分离出质粒DNA。
以下是一般的质粒 DNA 提取步骤:
1. 收集细菌培养物:将含有质粒的细菌培养在适当的培养基上,直到培养物达到合适的密度。
可以使用离心或过滤的方法收集细菌细胞。
2. 细胞裂解:将收集的细菌细胞加入裂解缓冲液中,通过物理方法(如搅拌、超声处理等)或化学方法(如加入裂解酶等)使细胞破裂,释放出质粒 DNA 和其他细胞成分。
3. 去除细胞碎片:将裂解后的混合液通过离心或过滤的方法去除细胞碎片和其他杂质。
4. 沉淀 DNA:向裂解液中加入乙醇或异丙醇等沉淀剂,使质粒 DNA 沉淀。
通过离心将沉淀收集。
5. 洗涤沉淀:用 70%的乙醇洗涤沉淀,以去除残留的盐分和杂质。
6. 干燥沉淀:将洗涤后的沉淀离心,并去除上清液。
然后将沉淀在室温下干燥,以去除残留的乙醇。
7. 溶解 DNA:将干燥的沉淀加入适当的缓冲液中,使质粒 DNA 溶解。
可以在缓冲液中加入 RNA 酶以去除 RNA 杂质。
8. 纯化和浓缩 DNA:可以使用柱层析、电泳或其他方法对提取的质粒 DNA 进行进一步的纯化和浓缩。
9. 质量检测:使用琼脂糖凝胶电泳或其他适当的方法检测提取的质粒 DNA 的质量和完整性。
需要注意的是,具体的质粒 DNA 提取步骤可能因使用的试剂盒或实验条件而有所不同。
在进行质粒 DNA 提取之前,应仔细阅读所使用的试剂盒说明书或相关实验方案,并根据实际情况进行适当的调整和优化。
质粒DNA的提取实验
实验六质粒DNA的提取一、实验目的通过本实验学习和掌握碱裂解法提取质粒二、实验原理质粒(Plasmid)是独立于染色体外的,能自主复制且稳定遗传的遗传因子。
它是一种环状的双链DNA分子,存在于细菌、放线菌、真菌以及一些动植物细胞中,在细菌细胞中最多。
本实验利用SDS碱裂解法提取质粒DNA。
将细菌悬浮液暴露于高pH值的强阴离子洗涤剂中,会使细胞壁破裂,染色体DNA和蛋白质变性,将质粒DNA释放到上清中。
在裂解过程中,细菌蛋白质、破裂的细胞壁和变性的染色体DNA会相互缠绕成大型复合物,后者被SDS (十二烷基硫酸钠)包盖。
当用K+取代Na+时,这些复合物会从溶液中有效地沉淀下来。
离心除去变性剂后,就可以从上清中回收复性的质粒DNA。
三、实验材料与试剂1、实验材料大肠杆菌(含有携带插入片段的质粒PMD-18T)2、实验试剂(1) 溶液Ⅰ:Tris·HCl(pH8.0)25mmol/L,EDTA(pH8.0)10mmol/L,葡萄糖50mmol/L;(2) 溶液Ⅱ(新鲜配制) :NaOH 0.2mol/L,SDS 1%(W/V);(3) 溶液Ⅲ(100ml):5mol/L乙酸钾60ml,冰乙酸11.5ml(pH4.8),水28.5ml;(4) 氯仿-异戊醇(24:1);(5) 异丙醇、70%乙醇;四、实验步骤(一)提取质粒1. 挑转化后的单菌落(含PMD-18T质粒),接种到20ml含有适当抗生素(Amp)的丰富培养基中(LB培养液),于37℃剧烈振摇下培养过夜。
(由老师完成)2. 将1.5ml的培养物倒入1.5ml的EP管中,于4 ℃以12000rpm离心1min。
3. 离心结束, 弃去上层培养液,再向离心管中加入1.5ml的培养物,于4 ℃以12000rpm 离心1min。
4. 弃去上层培养液,使细菌沉淀尽可能干燥。
5. 将细菌沉淀重悬于100μl冰预冷的溶液Ⅰ中,用Tip吸头吹打沉淀至完全混匀(无块状悬浮)。
质粒DNA的提取实验报告
质粒DNA的提取一、实验方法碱裂解法抽提质粒DNA二、实验原理基于质粒DNA与染色体DNA变性与复性的差异。
三、实验步骤1)质粒提取1. 10,000g,1min离心收集1.5-5ml菌液沉淀于1.5ml离心管中。
2. 加入100μl溶液1,振荡至彻底悬浮。
3. 加入200μl溶液2,立即轻柔颠倒离心管6次,使菌体充分裂解,随后将离心管冰上放置3分钟4. 加入150μl溶液3,立即温和颠倒离心管数次,冰上放置3分钟,10,000g离心10min。
5. 将步骤4的上清转移至新的离心管(尽量去除杂质),加入等体积的苯酚/氯仿/异戊醇混合均匀10,000g离心5min。
6. 将步骤5的上清转移至新的离心管,加入2倍体积的无水乙醇,室温放置5-10min,沉降DNA7. 10,000g离心10分钟,弃乙醇,保留沉淀,加入1ml 70%的乙醇洗涤沉淀,10,000g离心5分钟8. 倒掉乙醇溶液,用吸水纸吸净管壁上的水珠,室温蒸发痕量乙醇9. 加入适量含RNase的TE或灭菌双蒸水溶解质粒DNA2)质粒鉴定→琼脂糖凝胶电泳灌胶:胶中加入荧光染料(SYBR Green I)加样:质粒+上样缓冲液→混匀电泳结果观察:UV灯下四、实验结果五、实验分析裂解细胞中除含有质粒DNA外,还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂类等物质,因此用碱裂解法除去杂质1、防止DNA裂解:Solution 11)、所含糖增加溶液黏度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切作用降解2)、所含EDTA抑制酶活性2、溶解与变性:Solution21)强碱使质粒DNA和染色体DNA变性2)离子型表面活性剂SDS可溶解膜蛋白3、沉降与复性:Solution31)质粒DNA复性2)在钾盐中,染色体DNA形成缠连的不溶性网状结构,和不稳定的大分子RNA以及变性的蛋白质和细菌碎片等一起沉淀预期结果为剩余质粒DNA4、琼脂糖凝胶电泳1)荧光染色染料分子可嵌入双链DNA分子配对碱基之间2)琼脂糖可起到电泳和分子筛的作用,因所带电荷、分子量大小和构型不同,泳动速度不同六、误差分析实验失败,本组实验出现4条带,3明1暗,明亮处应为DNA分子数最多的,为质粒DNA,质粒DNA前有较暗的两条带,推测其中一条为未复性质粒DNA,可能Solution2处变性过长,不易复性,或Solution3处时间过短,复性不充分。
生物学实验 质粒DNA的提取
实验8 质粒DNA的提取(碱裂解法)一、实验目的了解碱裂解法提取质粒的基本原理和主要应用,掌握碱裂解法提取质粒的实验方法和各种试剂在提取过程中的作用。
二、实验原理碱裂解法是利用细菌染色体DNA与质粒DNA结构的大小差异来分离质粒DNA的。
碱性(pH 12.0~12.5)条件可以破坏碱基配对,宿主和质粒DNA的碱基之间的氢键被破坏。
当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),共价闭合环状的质粒DNA会迅速准确地恢复配对,重新形成完全天然的超螺旋分子;而较大的细菌染色体DNA分子则难以复性,会交联形成不溶于水的线团结构,缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来,而质粒DNA则留在上清液中,用异丙醇沉淀、70 %乙醇洗涤即可获得质粒DNA。
三、仪器设备微量取液器(2 μL;20 μL;200 μL;1 000 μL),tip头,手掌型离心机,1.5 mL离心管, 恒温水浴,制冰机,超净工作台,恒温培养箱。
振荡器,离心机,金属浴,电泳仪,凝胶成像仪。
四、实验试剂(1)溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖;20 mmol/L Tris·HCl(pH = 8.0);10 mmol/L EDTA(pH=8.0),高压蒸汽灭菌(121 ℃,0.105 Mpa)20 min。
4 ℃贮存。
(2)溶液Ⅱ(现用现配):0.2 mol/L NaOH;1 g / L SDS。
(3)溶液Ⅲ(pH 4.8):每100 mL溶液中含5 mol/L乙酸钾60 mL;冰乙酸11.5 mL;H2O 28.5 mL。
(4)RNase(10 mg / mL),LB液体培养基,氨苄青霉素,异丙醇,70 %(V / V)乙醇,无菌水。
五、实验方法(1)分装3 mL LB液体培养基和3 μL氨苄青霉素(50 mg/mL)于15 mL玻璃试管中。
(2)用灭菌牙签挑取一白色单克隆,放入玻璃管内,置37 ℃恒温摇床中以200转/min培养,至OD600=2.0。
质粒dna提取实验报告
质粒dna提取实验报告引言DNA的提取是生物学实验中非常重要的一步,它可以用于后续的分子生物学研究,比如克隆、PCR、基因测序等。
而本次实验的目的是从细菌中提取质粒DNA,并对提取的结果进行分析,评估提取效果。
材料与方法1. 实验材料- 大肠杆菌菌液- 细胞裂解液- RNase A- 莱文斯坦缓冲液- 高盐裂解液- 乙酰盐- 氯仿- 异丙醇- TE液- 离心管等实验仪器和耗材。
2. 实验步骤- 调制莱文斯坦缓冲液,用于细胞裂解和质粒DNA的稳定。
- 预处理大肠杆菌菌液,用高盐裂解液处理使其细胞壁破裂,释放出质粒DNA。
- 添加异丙醇与氯仿,用于分离DNA和其他细胞组分。
- 加入乙酸盐处理DNA上的蛋白质,使其沉淀。
- 用异丙醇洗涤DNA沉淀,去除杂质。
- 用TE液溶解提取得到的DNA。
结果与讨论经实验,我们成功地从大肠杆菌中提取到了质粒DNA。
通过紫外光照射,我们观察到了明亮的DNA带,证明提取得到的DNA具有较高的纯度。
另外,我们还使用琼脂糖凝胶电泳对提取的DNA进行了分析。
从琼脂糖凝胶电泳的结果中,我们观察到细长而连续的DNA 条带,说明提取得到的质粒DNA具有较好的完整性。
此外,我们还注意到,在琼脂糖凝胶中,质粒DNA的迁移速率要快于细菌染色体DNA,这是因为质粒DNA的分子量较小。
在实验的过程中,我们注意到了一些实验技巧和注意事项。
首先,在进行细胞裂解和DNA提取过程中,必须保持材料的无菌状态,以免外源性DNA的污染。
其次,避免在提取过程中显著提高DNA样本的温度,以防止DNA的降解。
最后,注意避免DNA溶液与金属物质接触,因为金属离子可能对DNA具有毒性。
结论通过本次实验,我们成功地从大肠杆菌中提取到了高质量的质粒DNA,并在琼脂糖凝胶上观察到清晰的DNA带。
实验过程中,我们掌握了DNA提取的基本操作技巧和注意事项,这对我们今后的分子生物学研究将产生积极的影响。
然而,本次实验还有一些改进的空间。
质粒dna的提取方法
质粒dna的提取方法质粒DNA提取是分子生物学实验中非常常见的操作,用于从细菌中提取质粒DNA进行后续的实验分析。
下面我将介绍一种常用的质粒DNA提取方法——碱裂解法(alkaline lysis method),该方法简单、快速、成本低且适用于大规模提取。
实验原理:碱裂解法是利用碱性溶液来破坏细菌细胞壁和细胞膜,释放出其中的质粒DNA。
在碱性条件下,细菌细胞壁和细胞膜会被溶解,质粒DNA则在此过程中被保护在碱性溶液中。
接着,通过中和和沉淀步骤,可从碱性溶液中纯化出质粒DNA。
实验步骤:1. 首先,从含有目标质粒的细菌培养物中制备菌液。
将培养物转移到离心管中,以12000 rpm离心10分钟。
2. 弃去上清液,将菌体沉淀重悬于缓冲液中。
缓冲液的配制:用10 mM Tris-HCl缓冲溶液溶解10 mM EDTA(pH 8.0),并加入0.1 mg/mL的蛋白酶K。
3. 加入缓冲液至菌体重悬菌液中,混匀。
4. 加入等量的0.2 M NaOH-1% SDS(含SDS版本)或0.2 M NaOH-0.5% SDS (不含SDS版本),轻轻翻转混匀。
5. 在室温下孵育5-10分钟,将混合物中的碱裂解酶活化。
6. 加入等体积的3 M醋酸钠(pH 5.5)以中和混合物。
7. 在室温下孵育5-10分钟,使沉淀物凝结。
8. 离心上述混合物,12000 rpm,10分钟。
9. 弃去上清液,加入适量的75%乙醇洗涤沉淀。
10. 再次离心,弃去上清液。
11. 干燥质粒DNA沉淀,通常可以在室温下自然干燥,不要使用高温或吹风机等加热工具。
12. 使用适量的Tris-EDTA缓冲液(pH 8.0)溶解质粒DNA沉淀,以得到浓度适宜的质粒DNA溶液。
实验注意事项:1. 在实验操作过程中,尽量避免使用手部直接接触NaOH和SDS,以免引起刺激。
2. 防止质粒DNA受到外源DNA(例如基因组DNA)的污染,可在处理前使用DNase酶或RNase酶处理样品。
质粒dna提取实验报告
质粒dna提取实验报告质粒DNA提取实验报告引言:质粒DNA提取是分子生物学研究中常用的技术手段之一。
通过提取质粒DNA,我们可以获得特定的基因片段,进一步进行基因克隆、转染、PCR扩增等实验。
本实验旨在探究质粒DNA提取的方法和步骤,并验证提取的质粒DNA是否纯度高、浓度适宜。
材料与方法:1. 细菌培养:选择含有目标质粒的细菌菌株,如大肠杆菌。
2. 培养基制备:制备含有适当抗生素的LB培养基。
3. 菌液培养:在培养基中接种细菌菌液,培养至适当的生长期。
4. 细菌收获:离心细菌培养液,收集菌体沉淀。
5. 细胞裂解:使用裂解液将细菌细胞壁破裂,释放细胞内的DNA。
6. 蛋白质沉淀:通过加入盐溶液,将蛋白质沉淀下来。
7. DNA沉淀:加入酒精,使DNA沉淀出来。
8. 洗涤:使用乙醇洗涤沉淀的DNA,去除杂质。
9. 干燥:将洗涤后的DNA干燥至无水状。
结果与讨论:经过以上步骤,我们成功提取到了质粒DNA。
下面将对实验结果进行分析和讨论。
首先,我们需要评估提取的质粒DNA的纯度。
常用的方法是使用比色法或分光光度法测量DNA溶液的吸光度比值(A260/A280)。
纯度较高的DNA溶液其吸光度比值通常在1.8-2.0之间。
如果比值低于1.8,说明可能存在蛋白质、RNA 或其他杂质的污染,需要进一步纯化处理。
其次,我们需要评估提取的质粒DNA的浓度。
常用的方法是使用比色法或分光光度法测量DNA溶液的吸光度(A260)。
通过测量吸光度并使用标准曲线,我们可以计算出DNA的浓度。
在实验中,我们可以根据需要调整DNA的浓度,以适应后续实验的要求。
此外,我们还可以通过琼脂糖凝胶电泳来评估提取的质粒DNA的完整性。
将DNA样品与DNA标准品一同加载到琼脂糖凝胶上,经电泳分离后,通过比较DNA带的大小和形态,我们可以初步判断提取的质粒DNA是否完整。
在实验过程中,需要注意的是避免DNA的降解。
DNA在裂解液中容易受到核酸酶的降解,因此在裂解过程中应尽量避免长时间的暴露。
质粒dna的提取与鉴定实验报告
质粒DNA的提取与鉴定实验报告1. 实验目的本实验的目的是通过提取和鉴定质粒DNA,掌握质粒DNA的提取方法并验证提取的质粒DNA的纯度和完整性。
2. 实验原理质粒DNA提取是将质粒DNA从细菌细胞中分离出来的过程。
常用的提取方法包括碱裂解法和商业试剂盒法。
本实验使用商业试剂盒法进行质粒DNA的提取。
步骤如下: 1. 培养目标细菌,并收集细菌培养物。
2. 细菌培养物离心,收集细菌沉淀。
3. 加入细胞裂解缓冲液裂解细胞膜。
4. 加入溶解剂,使细胞溶解。
5. 加入酒精,沉淀出质粒DNA。
6. 分离质粒DNA,去除其他杂质。
7. 测定质粒DNA的纯度和完整性。
3. 实验步骤3.1 培养目标细菌1.取出目标细菌的冻存管,从-80°C的冷冻库中快速解冻。
2.取出琼脂平板,用无菌技术将细菌转接到琼脂平板上,利用无菌鹤嘴锄均匀涂抹。
3.将琼脂平板倒置放置在37°C恒温培养箱中,培养一夜。
3.2 收集细菌培养物1.取出含有细菌的琼脂平板,加入适量的无菌LB培养基。
2.用无菌移液管将培养基中的细菌转移到无菌离心管中。
3.将离心管放入低速离心机中,离心5分钟,将细菌沉淀收集。
3.3 细胞裂解1.向细菌沉淀中加入适量的细胞裂解缓冲液。
2.充分混合后,放置在冰上浸泡20分钟,使细菌细胞膜裂解。
3.4 细胞溶解1.加入等体积的溶解剂,充分混合。
2.将含有细胞裂解物的离心管放入冰上浸泡5分钟。
3.5 DNA沉淀1.向离心管中加入等体积的冷酒精。
2.轻轻倾斜离心管,使酒精与溶液充分混合。
3.放置在-20°C冷冻库中沉淀20分钟。
3.6 分离质粒DNA1.将离心管放入高速离心机中,离心10分钟。
2.将上清液倒出,保留下沉淀。
3.7 测定质粒DNA的纯度和完整性1.使用纳米比色计测定质粒DNA的浓度和纯度。
2.利用琼脂糖凝胶电泳检测质粒DNA的完整性。
4. 结果与讨论根据实验结果,我们成功提取到了质粒DNA,并验证了其纯度和完整性。
质粒dna的提取实验报告
质粒dna的提取实验报告质粒DNA的提取实验报告。
实验目的,通过实验,掌握质粒DNA的提取方法,了解质粒DNA的结构和特点。
实验原理,质粒DNA是细菌细胞内的一种环状双链DNA,具有自主复制的能力。
提取质粒DNA的方法一般包括细胞破裂、蛋白质和RNA的去除、质粒DNA的纯化等步骤。
实验材料,细菌培养物、质粒DNA提取试剂盒、离心管、离心机、PCR仪等。
实验步骤:1. 取细菌培养物1ml,进行细菌离心,将菌体沉淀。
2. 加入细菌破裂液,使菌体破裂释放质粒DNA。
3. 加入蛋白酶和RNase,去除蛋白质和RNA。
4. 用离心机离心,将沉淀物中的DNA纯化。
5. 用PCR仪进行PCR扩增,验证提取的质粒DNA。
实验结果:经过实验,成功提取到了质粒DNA。
通过PCR扩增,验证了提取的质粒DNA 的完整性和纯度。
实验结论:通过本次实验,我们成功掌握了质粒DNA的提取方法,了解了质粒DNA的结构和特点。
质粒DNA的提取是分子生物学研究中的重要步骤,掌握了这一技术,将为我们今后的科研工作提供有力支持。
实验注意事项:1. 在实验过程中要注意细菌培养物的处理和离心操作的安全性。
2. 实验中使用的试剂盒要按照说明书操作,注意避光和保存条件。
3. 实验过程中要注意保持实验环境的清洁和整洁,避免外源DNA的污染。
4. 实验结束后要及时清理实验台和设备,保持实验室的整洁。
通过本次实验,我们不仅掌握了质粒DNA的提取方法,还培养了实验操作的技能和实验室的安全意识。
这对我们今后的科研工作具有重要的指导意义。
质粒dna的提取实验报告
质粒dna的提取实验报告引言:DNA是生命的基本遗传物质,研究DNA的结构和功能对于理解生命的本质具有重要意义。
在分子生物学实验中,质粒DNA的提取是一项关键步骤,它能够帮助我们获得足够纯度和数量的DNA样本,以便进行后续的实验分析。
本实验旨在提取质粒DNA,并验证提取效果和纯度。
材料和方法:1. 细菌培养:选择含有目标质粒的菌落进行预培养,接种至100ml含有适当抗生素的LB培养基中,37℃摇床培养过夜。
2. 提取质粒DNA:使用质粒DNA提取试剂盒,按照说明书进行操作。
主要步骤包括细菌离心、细菌裂解、质粒DNA与蛋白质分离、质粒DNA沉淀和洗涤等。
3. DNA质量和浓度检测:使用紫外分光光度计检测提取得到的DNA样品的260nm吸光度值,计算DNA浓度。
结果和讨论:量和浓度的检测。
质检测结果显示,提取得到的质粒DNA纯度较高,吸光度比值(A260/A280)在1.8-2.0之间,说明DNA中没有明显的蛋白污染。
这对于后续实验如聚合酶链式反应(PCR)等有着重要的影响。
同时,我们还测定了DNA的浓度,得到了大致的目标值,为1μg/μl左右。
在实验过程中,我们需要注意一些关键点,例如细菌的培养条件、细菌离心和裂解的时间和速度、蛋白质分离的温度等。
这些因素都会对质粒DNA的提取效果产生影响,需要精确控制,保证实验结果的准确性。
质粒DNA的提取是分子生物学实验的常见步骤之一,其应用广泛。
例如,可以将提取得到的DNA用于质粒转染、DNA测序、基因克隆等研究中。
同时,提取得到的质粒DNA也可以用于分子诊断、疾病基因检测等临床应用。
结论:提取效果和纯度。
提取得到的DNA可以广泛应用于分子生物学及医学研究领域,为后续的实验工作提供了坚实的基础。
总结:质粒DNA的提取是分子生物学实验中不可或缺的一环。
本实验通过严谨的操作步骤和质量检测,成功地提取了高纯度、适量的质粒DNA。
在今后的实验工作中,我们将继续基于这些DNA 样本,进一步开展相关研究,推动科学的发展和创新。
质粒DNA提取实验
质粒DNA提取实验质粒DNA提取可以:(1)快速纯化质粒;(2)用于测序、体外转录与翻译、限制性内切酶消化、细菌转化等分子生物学实验。
质粒多为一些双链、环状的DNA分子,是独立于细菌染色体之外进行复制和遗传的辅助性遗传单位。
质粒是进行分子生物学实验操作,进行遗传工程改良物种等工作时最主要的DNA 载体。
提取质粒的基本步骤分为三步:①细菌的培养和质粒的扩增②细菌菌体的裂解③质粒DNA的纯化一、材料与试剂准备1.材料:大肠杆菌。
2.仪器:超净工作台,培养箱,摇床,恒温水浴锅,台式离心机,取液器一套,低温冰箱,冷冻真空干燥机,电泳仪,水平电泳槽,紫外观测仪。
3.试剂:(1)Solution I : 25 mM Tris-Hcl(pH7.4), 10 mM EDTA(pH8.0)» 50 mM 匍萄糖,髙压灭菌,4°C 保存。
(2)Solution II : 0.2MNaOH, 1%SDS 现配现用。
(3)Solution III : 5 N KAc pH4.8.高压灭菌,4°C保存。
(4) 3 M NaAc pH5.2,高压灭菌,4°C保存。
(5)异丙醇,溶菌酶(8mg/ml),酚/氯仿,无水乙醇,70%乙醇,LB培养基,电泳试剂。
二、实验步骤1•摇菌培养1)将鉴定测序正确的克隆菌液涂在LB固体平板。
2)宜于37°C恒温培养箱,培养12-17h,待长出菌落。
3)火菌15ml离心管内加入5ml含抗生素的LB液体培养基,编号标记。
4)挑取单克隆菌团放巻液体培养基,每个培养基放苣1个菌落。
5)37°C, 180rpm,振荡培养过夜。
2.收获细菌并裂解1)离心扩增好的菌液,按说明书将菌液重悬,转入2.5ml离心管中。
2)用质粒小量抽提试剂盒,按说明书要求提取质粒。
3)细菌高速离心lmin,彻底去除上淸。
4)加入250UIRB溶液,振荡器充分悬浮细菌。
质粒dna的提取实验报告
质粒dna的提取实验报告实验目的:通过质粒DNA的提取实验,掌握质粒DNA的提取方法,了解质粒DNA提取的原理和步骤,并评估提取质量和纯度。
实验材料:- 大肠杆菌菌落- 磷酸盐缓冲液- 10% SDS溶液- 去离子水- 超纯酒精(乙醇或异丙醇)- 氯仿- 石英研钵- 离心管和离心机- 显微镜和比色皿- 分子生物实验器材- DNA评估工具(如凝胶电泳仪)实验步骤:1. 随机挑选一颗大肠杆菌菌落,接种至含有磷酸盐缓冲液的离心管中,用显微镜观察菌落的情况,确保菌落无杂质。
2. 加入500 μL含有磷酸盐缓冲液的离心管中,用微量移液管捞取菌落,将其完全悬浮在磷酸盐缓冲液中。
3. 加入10 μL 10% SDS溶液,翻转离心管轻轻摇匀。
4. 加入200 μL NaOH和150 μL氯仿,离心1分钟。
此时,质粒DNA会被氯仿等重物分离到有机相中,而大部分细胞膜和核酸会留在水相中。
5. 转移上清液至新的离心管中,避光加入等量的超纯酒精,轻轻摇匀。
DNA会在酒精中沉淀。
6. 离心10分钟,取出上清液。
7. 加入70%乙醇或异丙醇定居洗涤一次,离心2分钟,取出上清液。
8. 反复使用去离子水洗涤,使残留的乙醇或异丙醇彻底除去。
9. 用去离子水稀释DNA,摇匀。
10. 用凝胶电泳仪评估提取的质粒DNA的质量和纯度。
实验结果:通过凝胶电泳仪评估质粒DNA的质量和纯度,得到如下结果:- DNA带有明显的质粒带,且带的位置与预期一致。
- DNA带的强度较均匀,并且没有明显的附带杂带。
- 带的强度与浓度成正比,说明提取的质粒DNA具有较高的质量。
讨论和结论:通过本实验,成功提取到了质粒DNA,并评估了其质量和纯度。
本实验中所使用的提取方法简单快速,并且获得了满意的结果。
然而,有时由于实验步骤的疏忽或操作技巧不当,可能会导致质粒DNA提取的效果不佳,如DNA带弱、杂带多等。
因此,未来可以进一步优化实验步骤和控制实验条件,提高质粒DNA提取的效率和质量。
质粒dna提取方法
质粒dna提取方法质粒DNA提取是一种常见的实验操作,主要目的是从细菌中提取质粒DNA,以进行后续实验操作,比如质粒转化、质粒测序等。
下面将详细介绍质粒DNA 提取的步骤及方法。
质粒DNA提取的步骤:1. 细菌培养:选择适当的培养基,将所需的细菌接种培养。
培养时间可以根据需要而定,一般为12-18小时。
2. 细菌收获:培养至合适的细菌株数量后,通过离心将菌体沉淀下来。
取出超上清液,保留细菌沉淀。
3. 打断细菌细胞:将细菌沉淀用适当的缓冲液悬浮均匀,加入裂解酶及改性蛋白酶K等酶,使细菌细胞壁及细胞膜打断。
4. 裂解细胞膜:加入裂解液,如碱性SDS溶液或绝对醇等,使细胞膜破裂。
5. 分离细胞核酸:通过盐析法或有机溶剂法,将细胞核酸与其他杂质分离开来。
6. 质粒DNA纯化:使用离心管柱或硅胶膜柱等纯化方法,将纯化后的质粒DNA 获取。
7. DNA沉淀:用乙醇沉淀纯化后的质粒DNA,并通过离心去除沉淀液。
8. 质粒DNA溶解:用适当的缓冲液溶解提取的质粒DNA,并进行质量分析和浓度测试。
以上是一般常用的质粒DNA提取步骤,下面将介绍几种常见的质粒DNA提取方法:1. 碱裂解法(Alkaline lysis):使用碱性溶液裂解细菌细胞,破坏细胞壁以释放质粒DNA。
该方法简单快速,适用于提取小规模的质粒DNA。
缺点是提取的质粒DNA纯度较低。
2. 硅胶膜柱法(Silica membrane column):将裂解后的细胞溶液加载到硅胶膜柱上,通过离心和洗涤步骤去除杂质,然后将纯化的质粒DNA洗脱。
该方法纯化效果好,适用于提取高品质的质粒DNA。
3. 盐析法(Salt precipitation):通过加入高盐溶液使丙酮沉淀蛋白质,并用乙醇沉淀质粒DNA。
该方法适用于大规模质粒DNA提取,但质量稍逊于硅胶膜柱法。
4. 酚-氯仿法(Phenol-chloroform extraction):将细菌溶解液加入含酚和氯仿的混合溶液中,破坏细菌细胞膜,并使DNA降解酶失去活性。
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质粒DNA提取实验
质粒DNA提取可以:(1)快速纯化质粒;(2)用于测序、体外转录与翻译、限制性内切酶消化、细菌转化等分子生物学实验。
质粒多为一些双链、环状的DNA分子,是独立于细菌染色体之外进行复制和遗传的辅助性遗传单位。
质粒是进行分子生物学实验操作,进行遗传工程改良物种等工作时最主要的DNA 载体。
提取质粒的基本步骤分为三步:
①细菌的培养和质粒的扩增
②细菌菌体的裂解
③质粒DNA的纯化
一、材料与试剂准备
1. 材料:大肠杆菌。
2. 仪器:超净工作台,培养箱,摇床,恒温水浴锅,台式离心机,取液器一套,低温冰箱,冷冻真空干燥机,电泳仪,水平电泳槽,紫外观测仪。
3. 试剂:
(1)Solution I :25 mM Tris-Hcl(pH7.4),10 mM EDTA(pH8.0),50 mM葡萄糖,高压灭菌,4℃保存。
(2)Solution II :0.2 M NaOH, 1%SDS 现配现用。
(3)Solution III :5 N KAc pH4.8,高压灭菌,4℃保存。
(4)3 M NaAc pH5.2,高压灭菌,4℃保存。
(5)异丙醇,溶菌酶(8 mg/ml),酚/氯仿,无水乙醇,70%乙醇,LB培养基,电泳试剂。
二、实验步骤
1.摇菌培养
1)将鉴定测序正确的克隆菌液涂在LB固体平板。
2)置于37℃恒温培养箱,培养12-17h,待长出菌落。
3)灭菌15ml离心管内加入5ml含抗生素的LB液体培养基,编号标记。
4)挑取单克隆菌团放置液体培养基,每个培养基放置1个菌落。
5)37℃,180rpm,振荡培养过夜。
2.收获细菌并裂解
1)离心扩增好的菌液,按说明书将菌液重悬,转入1.5ml离心管中。
2)用质粒小量抽提试剂盒,按说明书要求提取质粒。
3)细菌高速离心1min,彻底去除上清。
4)加入250ulRB溶液,振荡器充分悬浮细菌。
5)加入250ulLB溶液。
立即上下颠倒10次,使细菌裂解,室温,放置2min。
6)加入250ulNB溶液。
立即上下颠倒10次,使之充分中和,室温,放置2min。
7)室温,1500rpm,高速离心15min。
8)将吸附柱放入收集管内,离心得到的上清转移至吸附柱,室温,15000rpm,高速离心30s。
9)弃废液,将吸附柱放入收集管,加入700ul WB溶液到吸附柱中,15000rpm,高速离心30s。
10)重复上一操作。
11)将吸附柱放入干净的1.5ml 离心管中,加30-50ul预热的Elution Buffer,室温,放置2min,高速离心1min。
12)样品进行电泳检测:1%琼脂糖凝胶电泳,上样量为2ul,紫外灯下观察,最明亮的带为超螺旋形式,可以在一定程度上表明提取质粒的纯度。
3.质粒的纯化
1)将之前提取好的质粒放入1.5ml离心管中,加入1/10体积的3mol/L 无菌乙酸钠溶液。
2)加入2倍体积的无水乙醇,放置于-20℃沉淀4-6h或过夜。
3)4℃,高速离心机14000rpm,离心20min.
4)弃去上清,70%乙醇洗2次。
5)空气干燥,可置超净工作台干燥。
6)加200ul无菌水溶液干燥后所得沉淀,即为质粒溶液。
7)紫外分光光度计测量质粒浓度和产量。
测量OD260和OD280的值:质粒DNA浓度=OD260×50×稀释倍数(μg/mL)。
三、10个常见问题
1.时间控制问题
裂解时间太长,加入溶液P2后裂解时间不应超过5 分钟;吸附时间不够;溶解时间不够都会导致质粒DNA提取实验失败。
2.大肠杆菌老化
建议涂布平板培养后,重新挑选新菌落进行液体培养。
3.质粒拷贝数低
由于使用低拷贝数载体引起的质粒DNA 提取量低,可更换具体相同功能的高拷贝数载体。
4.溶液使用不当
溶液P2、P3 在温度较低时可能出现浑浊,应置于37℃保温片刻直至溶解为清亮的溶液,才能使用。
5.吸附柱过载
不同产品中吸附柱吸附能力不同,如果需要提取的质粒量很大,请分多次提取。
若用富集培养基,例如TB 或者×YT 菌液体积必须减少;若质粒或宿主菌是非常高的拷贝数或生长率,则需调整LB 培养液体积。
6.质粒未全部溶解
洗脱溶解质粒时,可适当加温或延长溶解时间。
7.乙醇残留
漂洗液洗涤后应离心尽量去除残留液体,树脂型试剂盒漂洗后应晾干树脂,再加入洗脱缓冲液。
8.洗脱液加入位置不正确
洗脱液应加在硅胶膜中心部位以确保洗脱液会完全覆盖硅胶膜的表面达到最大洗脱效率。
9.洗脱液不合适
DNA 只在低盐溶液中才能被洗脱。
洗脱效率取决于pH 值。
最大洗脱效率在pH7.0~ 8.5 间。
当用水洗脱时确保其 pH 值在此范围内,如果pH 过低可能性导致洗脱量低。
洗脱时将灭菌蒸馏水或洗脱缓冲液加暖至60 ℃后使用有利于提高洗脱效率。
10.洗脱体积太小
洗脱体积对来回收率有一定影响。
随着洗脱体积的增大回收率增高,但产品浓度降低。
为了得到较高的回收率可以增大洗脱体积。
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