麻竹磷酸乙醇胺N-甲基转移酶基因的结构预测及分析
毛竹硝酸还原酶基因的结构预测及分析
毛竹硝酸还原酶基因的结构预测及分析齐兵生科111 201101220238摘要：应用电子克隆技术，以麻竹其中一条EST序列为种子序列，获得了麻竹纤维合成酶基因的一条CDNA序列。
采用生物信息学方法，对该基因的核苷酸序列分析，包括核酸序列组分分析，限制性核酸内切酶分析，ORF阅读框识别并进行可靠性验证；并且对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜区、疏水性、信号肽、Coil区、空间结构及结构域等方面进行预测和分析；同时,利用siDESIGN™设计了siRNA，并利用ClustalX与其他物种同源序列比对，利用MEGA5软件通过NJ法构建系统发育进化树，并对该CDNA进行了引物设计，以便于为今后麻竹纤维素合成酶基因的实验克隆和功能验证奠定基础。
结果表明：麻竹纤维合成酶基因的CDNA序列全长为822bp,氨基酸数为290个，分子量约为33320.0，等电点为8.01，分子式为C1480H2273N407O425S21Se1，在组成20种氨基酸中，ILe 和Gly所占比例最高，均为7.9%，而Trp所占的比例最低，为1.7%.纤维素合成酶的不稳定系数为47.53，脂肪指数75.69，根据Guruprasad方法表明麻竹纤维素合成酶不稳定。
麻竹纤维素合成酶蛋白大约在250-280位氨基酸之间含有一个典型的疏水性区域，没有预测出明显的信号肽，利用Coils Server在线分析麻竹纤维素酶蛋白Coils区，均检测到麻竹纤维酶蛋白含有两个典型的卷曲螺旋结构，其中在140-190为氨基酸的置信值非常高，并且利用SMART服务器搜索麻竹蛋白结构功能域，发现该蛋白在第128-271位之间有个保守的结构功能域----Cellulose-synt，该Cellulose-synt家族成员共有的典型的结构域，该结构功能域由植物纤维素合酶的CesA 蛋白，有高度的保守性残基，具有结构分子活性。
同时也对麻竹纤维素酶基因RNA的二级结构进行预测，其结构在最小自由能为-226.68千卡/摩时能量最低最稳定图。
麻竹DISCL6基因amiRNA前体合成及表达载体构建
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｗｅｂ ＭｉｃｒｏＲＮＡ Ｄｅｓｉｇｎｅｒ ( ＷＭＤ３) ｉｓ ａ ｐｒｏｆｅｓｓｉｏｎａｌ ｗｅｂｓｉｔｅ ｓｐｅｃｉａｌｌｙ ｕｓｅｄ ｆｏｒ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ ｐｌａｎｔ
麻竹 ＤｌＳＣＬ６ 基因 ａｍｉＲＮＡ 前体合成及表达载体构建
陈东亮１ꎬ２ 孙化雨２ 李利超２ 赵韩生２ 高志民２
(１ 北京市农林科学研究院 北京农业生物技术研究中心 北京 １０００９７
２ 国际竹藤中心 国家林业局竹藤科学与技术重点实验室 北京 １００１０２)
摘 要: Ｗｅｂ ＭｉｃｒｏＲＮＡ Ｄｅｓｉｇｎｅｒ ( ＷＭＤ３) 是一个专门应用于植物人工 ｍｉＲＮＡ 设计和前体序列设计的专业
十个基因中得到验证[４ － ７] ꎮ
２００９ 年ꎬ Ｗｅｉｇｅｌ 等 发 布 了 ＷＭＤ３ 软 件 平 台
ꎮ 人 工 ｍｉＲＮＡ ( ａｒｔｉｆｉｃｉａｌ ｍｉＲＮＡꎬ
(ｈｔｔｐ: / / ｗｍｄ３ ｗｅｉｇｅｌｗｏｒｌｄ ｏｒｇ / ｃｇｉ￣ｂｉｎ / ｗｅｂａｐｐ ｃｇｉ )ꎬ
机制ꎬ 设计出一段与目标基因高度匹配的序列ꎬ 利
２ 结果与分析
２ １ ＤｌＳＣＬ６ 基因 ａｍｉＲＮＡ 前体序列设计
利用 ＷＭＤ３ 设计 ＤｌＳＣＬ６ 基因的 ａｍｉＲＮＡꎬ 共得
酶切ꎬ 回收线性化的表达载体和 ｐｒｅ￣ａｍｉＲ￣ｓｃｌ６ 片段ꎬ
到 ５７ 条候选的 ｍｉＲＮＡ 序 列ꎮ 选 择 最 优 的 ａｍｉＲＮＡ
ＤＨ５αꎮ 获得 的 阳 性 克 隆 提 取 质 粒ꎬ 用 ＢａｍＨ Ⅰ 和
图 ３ꎮ
用 ＴＡＫＡＲＡ 高保真酶ꎬ 进行重叠 ＰＣＲ 扩增ꎮ 首先摸
一种新的大肠杆菌分裂功能相关的甲基转移酶[发明专利]
![一种新的大肠杆菌分裂功能相关的甲基转移酶[发明专利]](https://img.taocdn.com/s3/m/f37fc5f6650e52ea5418982d.png)
专利名称：一种新的大肠杆菌分裂功能相关的甲基转移酶专利类型：发明专利
发明人：谷劲松,叶春江
申请号：CN201010197806.6
申请日：20100611
公开号：CN101880653A
公开日：
20101110
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明公开了一种新的大肠杆菌分裂功能相关的甲基转移酶。
本发明通过生物信息学序列比对和结构预测的方法推测位于大肠杆菌染色体2分钟区域的与细胞分裂密切相关的活跃表达基因簇-dcw cluster上的yabC基因表达的蛋白YabC是调节细胞分裂过程的甲基转移酶，并采用基于重组S-腺苷-L-高半胱氨酸核苷酶和重组S-核糖基高半胱氨酸酶的酶偶联分析检测技术，通过YabC蛋白与大肠杆菌分裂异常的丝状菌体细胞裂解液以及甲基供体S-腺苷甲硫氨酸孵育，成功地检测到了甲基转移后生成的共同产物S-腺苷-L-高半胱氨酸，从而证明了YabC蛋白催化甲基转移的功能以及细胞分裂的关联特性。
申请人：济南大学
地址：250022 山东省济南市济微路106号济南大学医学与生命科学学院
国籍：CN
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烟酰胺N-甲基转移酶的研究进展
·254·· 综述 ·烟酰胺N-甲基转移酶的研究进展徐晚枫，厉平，李玲 （中国医科大学附属盛京医院内分泌科，沈阳 110004）摘要 烟酰胺N-甲基转移酶 （NNMT） 是一种甲基化酶，在体内能使烟酰胺 （NAM） 甲基化，生成N1-甲基烟酰胺 （MNAM） 从体内排出。
近来的研究表明NNMT除了能够清除NAM外，还可以通过消耗甲基供体及生成活性代谢产物参与脂肪及肝脏等组织的多种代谢途径调节。
本文对近年来研究发现的NNMT在生理和病理状态下的作用以及治疗干预新途径进行综述。
关键词 烟酰胺N-甲基转移酶； 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸； 烟酰胺； 甲基化酶中图分类号 R58 文献标志码 A 文章编号 0258-4646 （2021） 03-0254-04网络出版地址 https:///kcms/detail/21.1227.R.20210317.1352.034.htmlDOI：10.12007/j.issn.0258‐4646.2021.03.013Research progress on nicotinamide N-methyltransferaseXU Wanfeng，LI Ping，LI Ling （Department of Endocrinology，Shengjing Hospital of China Medical University，Shenyang 110004，China）Abstract The enzyme，nicotinamide N-methyltransferase （NNMT），methylates nicotinamide （NAM） to form N1-methylated NAM. Recent studies have shown that NNMT not only clears NAM but also participates in the regulation of various metabolic pathways，such as those in adipose and liver tissues，by consuming methyl donors and producing active metabolites. Herein，the roles of NNMT under physiological and pathological conditions and new therapeutic interventions are reviewed.Keywords nicotinamide N-methyltransferase； nicotinamide adenine dinucleotide； nicotinamide； methylase肥胖常并发严重的代谢紊乱如胰岛素抵抗、2型糖尿病和动脉粥样硬化，引起高死亡率和生活质量下降。
苯基乙醇胺甲基转移酶
苯基乙醇胺甲基转移酶
苯基乙醇胺甲基转移酶（Phenylethanolamine N-methyltransferase，简称PNMT）是一种酶，催化肾上腺髓质
细胞内苯基乙醇胺向甲基苯基乙胺或甲基脱氧苯基乙胺的转化，是儿茶酚胺合成途径中的关键酶。
该酶在肾上腺髓质中高表达，在多巴胺能和去甲肾上腺素能神经元和垂体细胞中也有表达，但表达量较低。
PNMT催化的反应需要S-腺苷甲硫氨酸（SAM）作为甲基供体。
PNMT的活性会受到儿茶酚胺水平
的调节，如肾上腺素在高水平时会抑制PNMT的活性，而去
甲肾上腺素则会促进PNMT的活性。
PNMT在生理上扮演着
调节交感神经活性、影响心血管功能等重要作用。
麻竹花药诱导再生植株的染色体倍性分析
植物学报 Chinese Bulletin of Botany 2011, 46 (1): 74–78, doi: 10.3724/SP .J.1259.2011.00074——————————————————收稿日期: 2010-05-25; 接受日期: 2010-09-19 * 通讯作者。
E-mail: zhuory@麻竹花药诱导再生植株的染色体倍性分析李海营, 乔桂荣, 刘明英, 蒋晶, 张玲, 卓仁英*中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 富阳 311400摘要 为阐明麻竹(Dendrocalamus latiflorus )花药培养再生植株的染色体倍性, 利用流式细胞仪和染色体标本制备方法对麻竹再生植株嫩叶DNA 的含量和根尖染色体数目进行了研究。
结果表明: 100株花药培养再生植株中有4株为六倍体, 96株为十二倍体。
该结果进一步验证了麻竹花药培养体系, 对麻竹遗传改良和功能基因组学研究具有重要意义。
关键词 花药培养, 染色体, 麻竹, 流式细胞仪李海营, 乔桂荣, 刘明英, 蒋晶, 张玲, 卓仁英 (2011). 麻竹花药诱导再生植株的染色体倍性分析. 植物学报 46, 74–78.竹子是重要的森林资源, 世界上有竹类植物70余属1 200余种, 主要分布于热带和亚热带地区, 少数种类分布于温带和寒带。
中国是世界上最主要的竹子生产国, 素有“世界竹子看中国”的美誉。
我国有竹类植物48属, 近500种, 主要分布于北纬40°以南的亚热带、热带地区, 尤以长江以南的浙江、福建、江西和湖南4省最为集中, 竹林面积约7.2×106 hm 2(江泽慧, 2002)。
麻竹(Dendrocalamus latiflorus )隶属禾本科竹亚科、牡竹属麻竹亚属, 自然分布于福建、台湾、广东、广西、贵州、四川和云南等省, 是我国热带地区重要的优良、速生、笋材两用的大型丛生竹种之一。
组胺N-甲基转移酶基因与原发性高血压的相关性[发明专利]
![组胺N-甲基转移酶基因与原发性高血压的相关性[发明专利]](https://img.taocdn.com/s3/m/2259e030a58da0116d174965.png)
专利名称：组胺N－甲基转移酶基因与原发性高血压的相关性专利类型：发明专利
发明人：张怡,张奎星,朱鼎良,高平进,王谷亮,黄薇
申请号：CN200510025687.5
申请日：20050509
公开号：CN1861803A
公开日：
20061115
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明公开了一种检测原发性高血压易感性的方法，它包括检测个体的组胺N－甲基转移酶基因HNMT的基因组序列，并与正常对照相比是否存在变异，存在变异就表明该个体患原发性高血压的可能性大于正常人群。
其中，所述的变异是HNMT的单核苷酸多态性(SNP)及其组成的单倍型(haplotype)。
本发明还公开了相应的检测试剂盒。
申请人：上海市高血压研究所,上海人类基因组研究中心
地址：200025 上海市瑞金二路197号
国籍：CN
代理机构：上海专利商标事务所有限公司
代理人：徐迅
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淡竹的等位酶多样性与分子遗传学
淡竹的等位酶多样性与分子遗传学淡竹是一种常见的竹类植物，其等位酶多样性与分子遗传学对其种群结构和遗传研究具有重要意义。
本文将从淡竹的等位酶多样性和分子遗传学两个方面进行探讨。
首先，等位酶多样性是研究物种遗传变异和种群遗传结构的重要方法之一。
等位酶是指同一酶在不同个体中由于遗传变异而呈现出不同电泳带的形式。
通过对淡竹种群内多个等位酶基因的研究，可以揭示其内部的遗传多样性和亲缘关系。
研究发现，淡竹内多个酶基因座存在较高的等位酶多样性。
例如，过氧化物酶(peroxidase)、脯氨酸酶 (proline dehydrogenase)、酸性磷酸酶 (acid phosphatase) 等基因座在淡竹种群内呈现出较多的电泳带型，说明淡竹存在着较高的遗传多样性。
这种遗传多样性对于淡竹的进化和适应环境变化具有重要意义。
此外，淡竹的等位酶多样性还能够反映其种群结构。
通过对不同地理种群和不同生态类型淡竹的等位酶多样性进行比较分析，可以了解其种群间的遗传差异程度。
研究发现，淡竹的种群结构较为复杂，具有较高的基因流和交配系统。
不同生境下的淡竹种群之间存在较高的遗传差异，这可能是由于种群间的遗传漂变和自然选择的影响。
除了等位酶多样性，分子遗传学也为淡竹的遗传研究提供了重要的工具和方法。
分子遗传学主要包括DNA序列分析、基因组分析和分子标记技术等，可以更深入地揭示淡竹的遗传结构和进化历程。
DNA序列分析是目前研究淡竹遗传变异的主要手段之一。
通过对淡竹基因组中特定基因的DNA序列进行测定和比对，可以研究不同种群间的遗传差异和亲缘关系。
研究发现，淡竹不同地理种群的遗传距离与地理距离呈现出一定的相关性，说明地理隔离对淡竹的遗传变异产生了一定影响。
基因组分析可以揭示淡竹基因组结构和基因定位，有助于研究淡竹的基因组进化和基因功能。
近年来，淡竹基因组计划的开展为深入了解其基因组结构和功能提供了重要的数据。
此外，分子标记技术如AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)、RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)等可以在不进行DNA序列测定的情况下，快速检测出淡竹等位基因的变异情况。
龙竹和麻竹FT同源序列的扩增与序列分析
今后 竹子开 花机制 的研究提供重要 基础．
１ 材 料 与方 法
１ １ 实验 材 料 ．
龙竹鲜 叶取 自泉州 师 范学 院校 园 内 ， 竹 鲜 叶取 自永 春县 五 里街 镇． 肠杆 菌 （ ｓｈｒ ｈａｃｌ） 株 麻 大 Ｅ ｃｅｉ ｉ ｉ 菌 ｃ ｏ ＤＨ５ ａ由本实验室保存． １２ 实验方法 ．
第 ３ 卷 第 ２期 Ｏ ２１ 年 ３ ０２ 月
泉州 师 范学 院学 报
Ｊ ｕ ｎ ｌ ｆＱｕ ｎ ｈ ｕ Ｎｏ ｍａ ｉｅ ｓｔ ｏ ｒ ａ ａ ｚ ｏ ｒ ｌＵｎ ｖ ｒ ｉ ｏ ｙ
Ｖ ０ ０ Ｎｏ ２ Ｌ３ ．
Ｍ ａ． ２ ２ ｒ ０１
龙 竹 和 麻 竹 Ｆ丁 同源 序 列 的扩 增 与 序 列 分 析
通过 Ｐ Ｒ扩增 的方法分别从 麻竹和龙竹基 因组 Ｄ Ｃ ＮＡ 中各得到长 为 ３ ４ｂ ３ ｐ的 ＤＮＡ片段． Ｂ ＡＳ 经 Ｌ Ｔ检 索、 基 因结 构分析和编码蛋 白功 能域预测 等分析 ， 步确 定所 得 Ｄ 初 ＮＡ片段可 能是 麻竹 和龙 竹中的 ＦＴ同源基 因的部 分序列． 关键 词 ： 麻竹 ； 龙竹 ； ＦＴ同源基 因 ； Ｃ Ｐ Ｒ扩增 ； 序列分 析 中图分类号 ： ２ ； ７ ８ ４ Ｑ５ ３ ￥ １ ． ６ 文献标识 码 ： Ａ 文章编 号 ：０ ９８ ２ （ ０ ２ ０—０ ７ ５ １０ —２ ４ ２ １） ２０ ６－ ０
收稿 日期 ：０ １ ９２ ２ １－ — ７ ０
作者简介 ： 桑庆亮 （９ ６ ） 男 ， １ ７一 ， 山东莱芜人 ， 讲师 ， 士 ， 博 从事植物分子 生物学研究． 基金项 目： 建省科技厅青 年人才项 目（０ ７ ３８ ） 泉州 市科技 局计划项 目（０ ８ １ ） 福 ２０Ｆ ０７ ； ２ ０ Ｚ ５
麻竹EST序列中GDC-P蛋白基因的预测及其翻译多肽的分析
麻竹EST序列中GDC-P蛋白基因的预测及其翻译多肽的分析丁伟航（生技091，林业与生物技术学院 200901180226）摘要：甘氨酸脱羧酶复合体（GDC）是在光呼吸中起着重要作用的酶体，存在于所有光合作用植物中。
通过对麻竹的EST序列进行拼接，得到了726条contig片段，然后对这726条片段进行blast。
结果发现，其中有一条长为966bp的片段与粳稻中的甘氨酸脱羧酶P蛋白亚基的mRNA序列有93%的相似性。
其ORF的翻译产物与麦类作物的GDC-P亚基有93%的相似性。
通过对这段多肽序列进行分析发现：这段序列是P蛋白靠近3' 端的一段序列，无跨膜结构域，含有GDC-PD的结构域。
关键词：EST；GDC；麻竹Abstract. Glycine decarboxylase complex（GDC）is one of the important enzyme during the photorespiratory cycle, which found in plants processing photosynthesis. De novo assembly of short reads (EST) of Ma bamboo shows, 726 contigs finally formed. And then run BLAST for these contigs in NCBI, the result is that the DNA sequence, which contain 966 base pairs, is similar to the gene of P protein of Glycine decarboxylase complex from Oryza sativa Indica Group (with the identity of 93 percent ). And the protein translated by its ORF is similar to GDC-P protein of x Tritordeum sp. (with the identity of 93 percent). Analyzing the putative protein by means of the method of bioinformatics, we found that protein sequence show high identity with the region of GDC-P near the C-terminal, no transmembrane domain be found, but contain the domain of GDC-P.Key word. EST, GDC, Dendroalamus latiftorus甘氨酸脱羧酶是复合体（GDC）存在于线粒体基质，与SHMT(丝氨酸羟甲基转移酶)通过四氢叶酸盐相联系[1]，是植物光呼吸的C2循环的重要酶体。
麻竹试管诱导开花及开花相关基因DlEMF2的克隆和功能分析的开题报告
麻竹试管诱导开花及开花相关基因DlEMF2的克隆
和功能分析的开题报告
一、研究背景和意义
随着日益严重的环境问题以及人口增长的压力，自然界中许多植物仍然面临生存困境。
麻竹 (Bambusa emeiensis) 属于竹科植物中的一种重要资源，广泛应用于建筑、纸浆生产以及生态修复等领域。
然而，麻竹生长周期长，生育繁殖困难，影响了其资源性能的开发和利用。
为了提高麻竹资源利用效率和生态修复能力，研究麻竹的生长发育、开花和花器官发育等关键基因，具有重要的理论和实际意义。
二、研究内容和思路
本研究重点关注麻竹试管诱导开花及开花相关基因DlEMF2的克隆和功能分析。
应用常规PCR和RT-PCR技术克隆DlEMF2基因，对其进行序列分析和功能预测。
通过对麻竹试管诱导开花样本的采集与处理，观测外部条件对麻竹开花过程的影响，收集相关数据并进行数据分析。
利用RNAi技术对DlEMF2基因进行功能验证试验，评估该基因在麻竹开花过程中的作用。
三、研究预期结果
通过对DlEMF2基因的克隆和功能验证试验，建立麻竹开花相关基因座模型，提供基于分子水平的麻竹开花细胞生理、分子生物学等重要方向的研究基础，为麻竹生长发育的研究及开花时间控制的研究提供理论支持和实践应用价值。
基于分子对接的虚拟筛选发现磷酸乙醇胺甲基转移酶抑制剂
基于分子对接的虚拟筛选发现磷酸乙醇胺甲基转移酶抑制剂唐思;陈双扣;谭小庆;徐曦;杨振宁;任风鸣;王瑞嘉;张亚晴【期刊名称】《药物化学》【年(卷),期】2022(10)4【摘要】目的:运用分子对接从生物碱数据库中筛选具有磷酸乙醇胺甲基转移酶(phosphoethanolamine methyltransferase, PEAMT)抑制活性的成分。
方法:以PEAMT为药物靶标,利用相似性筛选、分子对接技术、类药性评估等多轮筛选策略,从生物碱化合物数据库中挖掘命中分子,并运用AutoDock Vina、PyMOL及LigPlus软件探索命中分子与靶点蛋白的结合方式和亲和力。
结果:通过相似性虚拟筛选,共获得100个小分子,进行分子对接保留了结合能低于阈值的5个分子,其中4个分子符合Lipinski’s Rule,分别为匹格列酮、5’-腺苷酸、异鸟苷和腺苷,其中吡格列酮和5’-腺苷酸与PEAMT具有较高的结合亲和力,且作用方式与原晶体复合物相似,为最佳命中分子。
结论:相似性筛选和分子对接的虚拟筛选策略可为松材线虫PEAMT抑制剂的开发提供研究方向。
【总页数】10页(P318-327)【作者】唐思;陈双扣;谭小庆;徐曦;杨振宁;任风鸣;王瑞嘉;张亚晴【作者单位】重庆科技学院化学化工学院;重庆长风化学工业有限公司;重庆市药物种植研究所【正文语种】中文【中图分类】R28【相关文献】1.采用药效团模型和分子对接方法筛选新型的组蛋白甲基转移酶 G9a抑制剂2.基于生物信息学稻米半胱氨酸蛋白酶抑制剂来源生物活性肽的虚拟筛选及分子对接研究3.基于分子对接的新型复合物Ⅲ抑制剂的虚拟筛选4.基于TCMSP数据库的分子对接虚拟筛选JAK3特异性抑制剂5.基于虚拟筛选方法从化合物数据库中筛选SARS-COV-2的2’-O-甲基转移酶抑制剂因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
植物磷酸乙醇胺甲基转移酶基因（peamt）表达特性分析
植物磷酸乙醇胺甲基转移酶基因(PEAMT)表达特性分析摘要：摘要：PEAT即磷酸乙醇胺甲基转移酶，是合成磷酸胆碱的关键酶，磷酸胆碱脱磷酸后形成胆碱，胆碱经两步连续反应合成甜菜碱。
甜菜碱是一种无毒的小分子渗透调节剂，可以在植物体受到外界胁迫条件下起保护作用。
就近年来植物PEAT基因的表达特性研究进展作了概述，该基因的表达受多种胁迫的诱导。
关键词：关键词：磷酸乙醇胺甲基转移酶；盐胁迫；甜菜碱PEAT（phsphethanlaine N-ethyltransferase，phsphethanlaine ethyltransferase）是甲基转移酶的一种，它的主要功能是催化磷酸乙醇胺(P-EA)甲基化，最终合成磷酸胆碱（P-h），是合成磷酸胆碱的关键酶，磷酸胆碱脱磷酸后形成胆碱，在植物叶绿体中，胆碱经两步连续反应形成甜菜碱（GlyBet）。
甜菜碱是一种渗透调节物质，存在于多种生物体中，包括细菌和高等植物，可以提高细胞质渗透压，维持蛋白质结构稳定性，在植物受到胁迫时，保护细胞膜结构。
Suers和eretilnyk（1993年）通过实验研究发现，用不同浓度的氯化钠处理菠菜时，其PEAT 酶活性呈现显著升高[1]。
eretilnyk（1995年）发现，在盐胁迫下，菠菜的PEAT活性升高，菠菜叶中的PEAT增加量和酶活性的增加量与其抵抗胁迫环境所需要的甘氨酸甜菜碱的量成正比[2]。
Nui等(2000年）的观察也发现，盐胁迫条件下，菠菜的PEAT的RNA水平有10倍升高[3]。
Ye等（2005年）发现，油菜的叶片在盐胁迫下，其PEAT的RNA水平有显著上升[4]。
2002年，牟忠林和王晓群研究发现PEAT基因的沉默导致拟南芥温度敏感型雄性不育及盐敏感。
T365是拟南芥突变体，其PEAT基因沉默，导致一系列表型变化，包括叶片白化，早衰，温度敏感型雄性不育等。
T365突变体中胆碱的生物合成量急剧减少并且表现出高度盐敏感。
天然产物四氢大麻酚的骨架构筑以及Sanjoseolide的全合成研究
摘要本文的研究内容分为天然产物四氢大麻酚的骨架构筑以及天然产物sanjoseolide的全合成研究两个部分，具体内容如下：第一部分天然产物四氢大麻酚的骨架构筑的方法研究四氢大麻酚类化合物是从桑科(Moraceae)大麻属(Cannabis)植物中的大麻(Cannabis Sativa L.)分离得到的一类具有三环两手性中心的大麻素类化合物。
该类化合物具有良好的神经抑制作用，可作用于中枢神经系统(CNS)及孤立束核(NTS)，起到止痛、镇静、抗痉挛、抗呕吐、治疗青光眼以及抗高血压等多种药理作用。
首先，通过对此类化合物的结构分析，我们设计先构筑出基本的大麻酚三环骨架，通过不对称催化加氢、官能团转换和分子内区域选择性脱水，分别获得目标化合物Δ9-四氢大麻酚与Δ8-四氢大麻酚。
之后进行四氢大麻酚的全合成：以olivetol作为初始的原料，经过傅-克酰化反应、Michael-Aldol串联反应等操作，总共经过7步反应分别以24.6%和29.6%的收率，最终获得目标化合物Δ9-四氢大麻酚( Δ9-THC )与Δ8-四氢大麻酚( Δ8-THC )。
第二部分天然产物Sanjoseolide的全合成研究Sanjoseolide是从Dalea frutescens植物中分离得到的异戊烯化的查尔酮类化合物，其含有独特的异戊烯基二羟基侧链。
该类化合物具有良好的肿瘤细胞毒活性，而且对肿瘤细胞具有明显的抗增殖活性。
首先，通过对该化合物进行结构分析，我们设计首先引入侧链基团，然后对侧链基团进行修饰，最后构筑查尔酮基本骨架。
通过酚羟基的烷基化反应、Claisen重排反应在侧链引入基团；环氧化反应、不对称双羟化反应进行侧链基团修饰；通过Aldol反应构筑查尔酮基本骨架，最终获得目标化合物sanjoseolide。
之后进行sanjoseolide的全合成：以2,4-二羟基苯乙酮作为初始的原料，经过Claisen重排反应、Aldol反应等9步反应获得目标化合物sanjoseolide。
磷脂酰乙醇胺n-甲基转移酶
磷脂酰乙醇胺n-甲基转移酶
磷脂酰乙醇胺n-甲基转移酶是一种重要的酶类，其主要作用是将磷脂酰乙醇胺（PE）转化为磷脂酰乙醇胺甲基化产物（MPE），从而调节细胞膜的组成和功能。
磷脂酰乙醇胺是组成细胞膜的一类重要磷脂，其含量在细胞膜中占据重要地位。
PE含量的变化会影响细胞膜的物理化学性质，从而影响细胞的生物学功能。
MPE的产生可以调
节细胞膜的磷脂组成，从而影响细胞的生物学功能。
因此，磷脂酰乙醇胺n-甲基转移酶在细胞生物学和生理学中发挥了重要的作用。
磷脂酰乙醇胺n-甲基转移酶是一类负责催化磷脂酰乙醇胺甲基化反应的酶，以其对磷脂代谢的调节作用而备受关注。
该酶由两个亚基组成，分别称为PMTA和PMTB，分别负责
催化磷脂酰乙醇胺C-3位和C-5位的甲基化反应。
磷脂酰乙醇胺n-甲基转移酶的活性主要通过其对受体蛋白的磷酸化状态的调节来实现。
在细胞内，该酶活性的调节与细胞周期和细胞死亡等多种生物学过程有关。
研究表明，该
酶的活性调节与多种信号途径相关，如供能途径、凋亡途径和信号传导途径等。
在基因水平上，磷脂酰乙醇胺n-甲基转移酶的表达与细胞周期的调节和细胞凋亡等生物学过程密切相关。
因此，对该酶的调节机制的深入研究可以帮助我们更好地了解细胞代
谢过程和生命活动的调节机制，为探索新的治疗方法提供理论基础。
解淀粉芽孢杆菌BamHI甲基转移酶基因克隆、功能鉴定与序列分析
解淀粉芽孢杆菌BamHI甲基转移酶基因克隆、功能鉴定与序列分析刘洋;沈微;石贵阳;王正祥【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2009(000)011【摘要】从解淀粉芽孢杆菌Baillus amyloliquefaciens CICIM B2125中克隆了BamHI甲基转移酶基因(bamHIM),并在大肠杆菌JM109中得到了成功表达.该基因含有1 271 bp的开放阅读框(ORF),编码423个氨基酸,成熟蛋白分子量为49 kD.该基因在自身启动子引导下,表达了具有活性的BamHI甲基转移酶(M.BamHI).该酶可以将BamHI位点的碱基甲基化.氨基酸序列分析表明该酶存在有NADB_Rossmann结构域.%A gene encoding for BamHI methyltransferase(bamHIM )was cloned from Baillus amyloliquefaciens CICIM B2125. The bamHIM was expressed under its own promoter in E. coli JM109. The gene contained an opening reading frame ( ORF) of 1 271 bp, which coded for 423 amino acid residues. The molecular weight of mature protein was 49 kD. The BamHl site could be methylased by the enzyme M.BamHI. The amino acid sequence analysis revealed that the enzyme contained a domain of Rossmann-fold NAD(P) ( + ) -binding proteins.【总页数】4页(P65-68)【作者】刘洋;沈微;石贵阳;王正祥【作者单位】江南大学生物工程学院,工业生物技术教育部重点实验室,无锡,214122;江南大学生物工程学院生物资源与生物能源研究中心,无锡,214122;江南大学生物工程学院,工业生物技术教育部重点实验室,无锡,214122;江南大学生物工程学院生物资源与生物能源研究中心,无锡,214122;江南大学生物工程学院,工业生物技术教育部重点实验室,无锡,214122;江南大学生物工程学院生物资源与生物能源研究中心,无锡,214122;江南大学生物工程学院,工业生物技术教育部重点实验室,无锡,214122;江南大学生物工程学院生物资源与生物能源研究中心,无锡,214122【正文语种】中文【中图分类】Q5【相关文献】1.天然无咖啡碱茶叶N-甲基转移酶基因克隆与序列分析 [J], 陈丽萍;陈忠正;李斌;周英;黎秋华;杨飞芸2.地衣芽孢杆菌α-淀粉酶基因的克隆和及其启动子功能鉴定 [J], 牛丹丹;徐敏;马骏双;王正祥3.地衣芽孢杆菌α-淀粉酶基因的克隆和及其启动子功能鉴定 [J], 牛丹丹;徐敏;马骏双;王正祥4.解淀粉芽孢杆菌淀粉酶催化活力改良及其在枯草芽孢杆菌中的高效表达 [J], 邱锦; 黄火清; 姚斌; 罗会颖5.一株乳源蜡样芽孢杆菌肠毒素基因克隆与序列分析 [J], 陈玉娟;赵瑶;马鲜平;高丽旭;姚婷;刘倩如;谢远兵;易华山因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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麻竹磷酸乙醇胺N-甲基转移酶基因的结构预测及分析摘要：为探讨麻竹磷酸乙醇胺N-甲基转移酶蛋白的结构，通过对麻竹EST序列分析，运用生物信息学所学知识，研究麻竹磷酸乙醇胺N-甲基转移酶基因的性质。
其结果显示，该蛋白质的CDs长度为993bp，等电点（PI）为6.35，相对分子质量为38033.3，利用DNAMAN 等软件，对其二级结构、三级结构进行了预测和分析。
除此，还利用CLC对麻竹及其它物种的磷酸乙醇胺N-甲基转移酶对应的蛋白序列进行对比分析，并利用CLC构建系统发育树。
关键词：磷酸乙醇胺N-甲基转移酶麻竹结构分析Abstract:To describe the secondary structure and the tertiary structure of tiflorus Munro Phosphoric acid amine N-ethanol phenol-o-methyl shift enzyme. Through the use of the knowledge of bioinformatics,the properties of this protein such as isoelectric point and relative molecular mass have been explored. In addition, the phylogenetic tree based on Phosphoric acid amine N-ethanol phenol-o-methyl shift enzyme has been built.Key word: Phosphoric acid amine N-ethanol phenol-o-methyl shift enzyme tiflorus Munro structural analysis磷酸乙醇胺N-甲基转移酶(phosphoethanolamine N-methyltransferase，phosphoethanolamine methyltransferase, PEAMT, EC 2.1.1.103)系统名为S 一腺普甲硫氨酸:磷酸乙醇胺甲基转移酶(S-adenosyl-L-methionine: ethanolamine-phosphate N-methyltransferase)，是一种甲基转移酶，其主要功能是催化磷酸乙醇胺(P-EA)甲基化，最终合成磷酸胆碱(P-Cho)，是合成磷酸胆碱的关键酶[1-7]磷酸胆碱在动物体内参与合成磷脂，具有保肝强肝、促进脂质代谢和抗脂肪肝的作用；还能加速甲基转移，供给活性甲基，促进肝细胞再生。
而在植物中是合成磷脂酞胆碱和甜菜碱的前体。
磷脂酞胆碱植物的抗寒性相关[8]，对植物的结构和生化功能有作用。
甜菜碱是一类小分子渗透调节剂，对细胞的透调节、生物大分子结构和功能的稳定有一定的作用，也能影响细胞内离子的分布。
由于PEAMT 在磷酸胆碱合成中的主要调控作用以及磷脂酞胆碱和甜菜碱在植物体内的作用，近年来此酶的研究越来越多。
此次研究是针对目前的现状，通过已有的EST序列，希望了解磷酸乙醇胺甲基转移酶在麻竹中的蛋白质序列的结构并对此序列进行分析。
1．材料和方法1．1 材料登陆美国国立生物技术信息中心（/），以“tiflorus Munro”为关键词搜索麻竹EST数据，从而得到研究所用的EST 数据。
1．2 方法对得到9574条EST数据，并用CLC genomics Workbench3.6.1进行序列拼接得到726条contig。
本预测选择的是contig426，对contig426进行比对并预测其ORF。
再利用在线资源（/sms/）对所需的ORF进行翻译得到蛋白质一级结构。
接着，利用DNAMAN对蛋白质序列进行亲水性质进行预测。
之后，利用在线资源（/cgi-bin/protparam/protparam）对蛋白质分子量、分子式、等电点（PI）、半衰期等相关理化数据进行分析。
利用在线资源利用在线资源（http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/ ）对该蛋白是否为跨膜蛋白进行预测。
利用在线资源（http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP-1.1/output.php）对该蛋白进行亚细胞定位。
利用在线资源(/search/sequence)预测该蛋白的结构域与motify 搜索。
利用在线资源(http://distill.ucd.ie/porter/)预测蛋白质二级结构。
利用在线资源（/）对蛋白质三级结构进行预测。
利用在线资源（http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/）对信号肽进行预测。
利用在线资源（http://www.genome.jp/kegg/）对蛋白质功能分析。
接着，利用DNAMAN进行了RNA二级结构预测和siRNA的搜索。
最后,利用CLC对麻竹及其它生物的磷酸乙醇胺甲基转移酶蛋白氨基酸序列进行对比分析，并构建系统发育树。
2．结果和分析2．1获得基因的DNA序列分析通过ORF FINDER对拼接好的contig1进行ORF查找分析（图1），可得其长度为993bp（2bp-994bp），对应有331个氨基酸。
接着，利用DNAMAN可找出其PCR所需的扩增引物，上游引物为 GGCATCACAAGAACATTACA 下游引物为TTTCCCAGCACTCCTACA图1 contig426的ORF2.2获得基因的蛋白质翻译蛋白质翻译从2个碱基开始，从而得到翻译后的蛋白序列。
HVLALDFIESVIKKNENINGHHKNITFLCADVTSPELKIEDNSIDLIFSNWLLMYLSDEEVEKLLGRMV KWLKVGGHIFFRESCFHRSGDSKRKVNPTHYREPRFYTKVFKECHSYDQDGNSFELSLVTCKCVGAYVK NKKNQNQICWLWEKVQSTKDRGFQIFLDNVQYKTSGILRYERIFGEGFVSTGGLETTKEFVDMLDLKPG QKVLDVGCGIGGGDFYMAENYDVHVLGIDLSINMISFAIERAIGRNCSVEFEVADCTTKEYPENTFDAIYSRDTILHIQDKPALFRSFFKWLKPGGKVLISDYCRSAGKPSEEFAAYIKNRGYD2.3转移酶蛋白的二级结构通过DNAMN ，得到的图2，表示了β-折叠、α-螺旋、无规卷曲在不同此序列上的可能性。
其预测准确度为70.38%。
而利用在线资源进行分析，见图3，其中C 表示coil(无规卷曲),H 表示Helix(a-螺旋)，E 表示extended.从预测结果可知，β-折叠有56处折叠率为16.9%，α-螺旋率为36.3%，无规卷曲率为46.8%。
ORF.seq可能位置图2 DNAMAN 预测二级结构图3 二级结构中的组成方式2.4转移酶蛋白的三级结构利用在线资源对麻竹磷酸乙醇胺N-甲基转移酶蛋白的三级结构进行了预测，得到图2，从图中可以观察到该蛋白质中的各种二级结构的组合。
图？为此蛋白的球棍模型。
图4 磷酸乙醇胺N-甲基转移酶蛋白三级结构图5磷酸乙醇胺N-甲基转移酶蛋白三级结构球棍模型2.5转移酶蛋白的性质 2.5.1转移酶蛋白的理化性质磷酸乙醇胺N-甲基转移酶蛋白序列共有331个氨基酸，相对分子质量为38033.3，理论等电点6.35，可得到其分子式C 1714H 2630N 452O 499S 15，总原子数为5310。
此蛋白序列的不稳定系数为42.44，在不同的生物体内的半衰期不同。
例如：在哺乳动物网状细胞内可存在3.5小时左右，最短的是在酵母菌体内只能存在10分钟，较长的是在大肠杆菌体内可存在至少10小时。
此蛋白的脂肪指数为80.63，是属于疏水性的蛋白。
2.5.2转移酶蛋白的跨膜片段通过软件预测这一蛋白不具有跨膜片段，见图6。
推测此蛋白仅在细胞内参与甲基化反应，与生物膜没有直接关系。
图6转移酶蛋白的跨膜片段分析2.5.3亲水性轮廓通过亲水性轮廓分析，图7，此蛋白大部分处在负值区域，其疏水性大于亲水性，可知此蛋白是疏水性蛋白。
与蛋白质理化性质分析结构一致。
PRO.seq亲水性位置图7亲水性轮廓分析2.6转移酶蛋白的亚细胞定位、信号肽预测及结构域分析通过在线软件的亚细胞定位,可知此蛋白不在叶绿体、线粒体内，同时此蛋白在分泌通路上的可能为0.188，但在其他位置的可能为0.915，见图8。
所以此蛋白可以简单的推测是处在细胞质中。
利用在线工具对其进行信号肽预测，得到其上不具有任何信号肽序列，见图9。
而结构域分析得出此蛋白属于Methyltransf 11蛋白家族，即甲基转移酶类。
图8 亚细胞定位图9信号肽预测2.7 RNA二级结构的预测和siRNA的搜索通过DNAMAN软件推测其RNA二级结构，如图10,可以了解其结构最小自由能为-264.87千卡/摩的时候能量最低最稳定。
siRNA搜索的到2条评分为10的序列：目标序列 147-AAACTGGCTACTAATGTACCTTT正链 5'-ACUGGCUACUAAUGUACCUdTdT负链 5'-AGGUACAUUAGUAGCCAGUdTdT目标序列 862-AAACCTGCTTTGTTCAGAAGCTT正链 5'-ACCUGCUUUGUUCAGAAGCdTdT负链 5'-GCUUCUGAACAAAGCAGGUdTdT结构最小自由能= -264.87 千卡/摩图10 RNA二级结构2.8多序列比对及系统发育树建立以麻竹磷酸乙醇胺N-甲基转移酶为主，通过NCBI寻找不同生物体内的磷酸乙醇胺N-甲基转移酶的蛋白序列。
一共搜索到19个生物的蛋白序列，包括：拟南芥（Arabidopsis thaliana）、海紫菀（Aster tripolium）、甜菜（Beta vulgaris）、短柄草（Brachypodium distachyon）、甘蓝型油菜（Brassica napus）、蒺藜苜蓿（Medicago truncatula）、罗非鱼（Oreochromis niloticus）、水稻（Oryza sativa）、疫病菌（Phytophthora infestans）、毛果杨（Populus trichocarpa）、杜梨（Pyrus betulifolia）、蓖麻（Ricinus communis）、盐角草（Salicornia europaea）、肠道沙门氏菌（Salmonella enterica subsp）、西红柿（Solanum lycopersicum）、菠菜（Spinacia oleracea）、山茶（Suaeda japonica）、小麦（Triticum monococcum）、玉米（Zea mays）。