PUBMED数据库检索方法_吴华彰教案资料
【医学课件】PubMed检索指南
学术评价
PubMed主要针对生物医学领域的文献，而Google Scholar则涵盖了各个学科领域，但并不提供专门的学术评价功能。
与Web of Science的比较
学科范围
Web of Science涵盖了多个学科领域，包括社会科学、自然科学、人文科学等，而PubMed主要针对生物医学领域。
Web of Science提供了引文追踪功能，可以方便地查看文献被引用的情况，而PubMed则主要关注文献的内容而非引用情况。
学术交流
PubMed也是学术交流的重要平台，学者可以通过它发表自己的研究成果，并与其他学者分享和交流。
历史
PubMed是由美国国家医学图书馆（NLM）和国立卫生研究院（NIH）于1996年共同开发的。它已经成为全球使用最广泛的生物医学文献数据库之一。
发展
随着生物医学领域的发展，PubMed也在不断更新和改进，包括增加更多的文献来源和优化检索功能。同时，PubMed还与其他数据库和信息系统合作，提供更全面和准确的信息服务。
时间限定
检索限定
文献类型限定
语言限定
数据库限定
主题词检索
可以使用MeSH词进行主题词检索，以获得更全面和准确的检索结果。
高级检索
布尔运算符
使用AND、OR、NOT等布尔运算符进行更精确的检索。
字段限定
可以限定检索的字段范围，如标题、摘要、关键词等。
引用追踪
可以通过引用追踪功能查找与已发表论文相关的文献。
显示全文
点击摘要下方的“显示全文”链接，可以查看该文章的全文。
01
03
02
筛选与排序
在检索结果页面，可以通过选择特定的条件（如文章类型、发表时间、研究类型等），对结果进行筛选。
pubmed检索技巧
主题检索
主题检索
mad cow disease
主题检索
主题检索
主题检索
期刊检索
检索结果显示与输出
检索结果显示
显示格式 每页显示条数 排序
检索结果输出
通过页面右上方send to实现，包括： Send to File Send to Clipboard Send to Collections Send to Email
逻辑运算符：
逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT
截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后 面加上一个截词符，chem*表示用词根进行 检索。
双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行 检索。
检索字段标识符：[tag]，tag为字段名称。
[ti]，[au]，[ta]， [la]，[pt]。
Pubmed 数据库
主要内容
概况 检索机制 检索途径 检索结果显示与输出 全文获取
PubMed概况
美国国家医学图书馆下设的国家生物技术 信息中心(NCBI)开发，是目前国际上公认 的检索生物医学文献最具权威、利用率最 高、影响最广的数据库
PubMed检索机制
自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)
个人绑定邮箱
全文获取
pubmedfw@ xxmu03m99 xx@
谢谢！
出版类型
PubMed登陆
http://www. 或者 /pubmed/ 或者通过图书馆的外文数据库（pubmed文
献服务系统）进入：
PubMed检索界面
pubmed数据库检索ppt课件
Web of Science
学科覆盖面较广，不仅限于医学 领域，还涵盖了工程技术、物理 、化学、社会科学等众多领域， 提供引文追踪和分析功能；
Google Scholar
搜索引擎性质，可以搜索到各种 类型的文献，包括学术论文、专 利、会议论文等，覆盖面广泛。
06
PubMed数据库检索应用案 例
临床疾病研究检索案例
总结词
临床疾病研究检索案例
详细描述
PubMed数据库在临床疾病研究方面具有广泛的应用，例如检索关于糖尿病、心 血管疾病、癌症等领域的最新研究成果。通过关键词、主题词、作者等检索条件 ，研究人员可以快速获取相关文献，为临床实践和研究提供科学依据。
药物研发检索案例
总结词
药物研发检索案例
详细描述
在药物研发过程中，PubMed数据库也发挥了重要作用。研究人员可以利用PubMed数据库检索新药 研发相关的文献，了解药物的作用机制、药效学和药代动力学等方面的信息。这有助于加速药物研发 进程，提高新药的成功率和效益。
基础医学研究检索案例
总结词
基础医学研究检索案例
详细描述
基础医学研究是医学领域的重要组成部分，而PubMed数据库在基础医学研究检索方面 也有广泛应用。例如，研究人员可以利用PubMed数据库检索基因、蛋白质、细胞等方 面的最新研究成果，了解生命科学领域的最新进展，为进一步的基础医学研究提供思路
和方向。
提供多种检索方式，支持 关键词、作者、标题等字 段的检索，同时支持高级 检索和模糊检索。
数据库发展历程
01
02
03
04
1996年
美国国家医学图书馆（NLM） 建立PubMed数据库，最初只 收录MEDLINE数据库中的文献。
PubMed生物医学数据库检索方法与技巧
人重组三叶因子（human recombinant trefoil factor）
("humans"[MeSH Terms] OR "humans"[All Fields] OR "human"[All Fields]) AND recombinant[All Fields] AND ("trefoil factor"[Supplementary Concept] OR "trefoil factor"[All Fields])
输入：ma dl
Peking university
高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献
5.3 主题检索
点击MeSH Database打开主 题检索界面
根据medline数据主题标引的 规范性，利用主题词进行的研 究，对提高查全率、查准率会 有相当的帮助。
基本检索
高级检索 主题检索
4. PubMed检索运算符
逻辑运算符
逻辑运算符
①逻辑“与”运算AND： 检索式写成A and B，表示文献中同时包含检索词A和检索词B 的文献才是命中文献。 AIDS and therapy ②逻辑“或”运算OR： 检索式写成A or B，表示包含检索词A的文献或者包含检索词 B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。 AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndrome ③逻辑“非”运算NOT： 检索式写成A not B，表示包含检索词A同时不包含检索词B 的文献为命中文献。 Hepatitis not Animal
62检索结果的保存62检索结果的保存71检索策略的存储和调用72全文链接73相关文献链接71检索策略的存储和调用使用myncbicubby定期浏览新的检索结果72全文链接摘要格式显示72全文链接打开单篇详细页73相关文献链接73相关文献链接综合检索实例检索课题中包含两个主要概念
PubMed数据库检索教程培训课件
COMPANY LOGO
直接输检索词，查询 结果是与输入词相关
的主题词,共8个
PubMed数据库检索教程
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主题词/副主题词选择
主题词 副主题词
选择主/副主题词 后，送到检索框
COMPANY LOGO
主要主题词 下位词扩展
加权检索，即查重 点论述的主题， 提高文献相关度
PubMed数据库检索教程
29
COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
20
查看邮件
COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
21
邮件保留相关链接
COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
22
期刊网站全文（网页格式)
COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
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PMC原文
COMPANY LOGO
注意限定条件的使用 与修改
PubMed数据库检索教程
11
Summary显示(默认格式）
COMPANY LOGO
题名
作者
出处（刊名、年、卷、期、页）
PMID 相关链接
检索明 细框
PubMed数据库检索教程
12
改变显示格式
COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
13
摘要显示及全文链接
COMPANY LOGO
树状结构表
COMPANY LOGO
款目词（同 义词）
系统自动扩展 检索
❖了解同一概念的同义词、近义词，供自由 词检索参考；
❖根据树形结构调整检索词
缩小：不扩展下位词，或选用某个下位词； 扩大：选用上位词，或选用多个同位词；
PubMed数据库检索系统及相关检索方法
下 ， 定期 查 阅最 新 文献 ， 集 最 新 的 中 医研 究 数 据 和 事 实 ， 要 收
跟 上 医 药科 技 的发 展 步 伐 。 第 三 是可 靠 性 ， 于 中 医科 学 研 由
究 以及 网 络信 息 的特 殊 性 ，因此 我 们 所 收 集 的 网 络 数据 、 事
实 文 献 资 料 必 须 是真 实 的 、 学 的和 客 观 的 ， 科 这样 才 能 有 助
［１张 雅 茹 ， 晓 玲 ， 阿 龙 ．常 用 医 学 搜 索 引 擎 简 介 ．西 北 国 防 医 ２ 郭 赵 学 杂 志 ，０ ７ ２ （ ）８４ ２ ０ ，８ ６ ：６ ．
室 的人 员名 单 ， 再从 中查 找其 个 人 主 页 或 Ｅ ｍａ 地 址脚 — ｉ ｌ 。 中 医文 献 检 索 与其 它 类 型 的 信 息 检索 相 比 。 应遵 循 针 对 性 、 颖性、 新 可靠 性 、 连续 性 的原 则 。 先 ． 对 性 是指 要 紧 紧 首 针
映 出 某一 学 科 和 某一 专 题 的 最新 成 就 和 发 展趋 势 。 过会 议 通 我 们 可 以掌 握 中 医研 究 的 动 态＿ 引 。
究 的 国 内 外 发 展 动 态 ， 已 有 成 果 的 基 础 上 ， 我 国 的 中 医 在 将 药 研 究 提 高 到 更高 层 次 。
Ｐ ｂ ｄ是 美 国 国家 医学 图书 馆 （ Ｌ 所 属 的 国家 生 物 ｕ Ｍｅ Ｎ Ｍ）
技 术 信 息 中心 （ Ｃ Ｉ Ｎ Ｂ ）开 发 的 因特 网生 物 医 学信 息检 索 系
统 ， 于美 国 国立 卫 生 研 究 院 （ Ｉ 的平 台上 。该 系统 通 过 位 Ｎ Ｈ） 网络 途 径 免 费 提 供 包 括 ＭＥ Ｌ Ｎ Ｄ Ｉ Ｅ在 内 的 自 １ ５ ９ ０年 以来 全 世界 ７ ０多 个 国 家 ４３ ０多 种 主 要 生 物 医 学 文 献 的书 目索 引 ０
Pubmed检索方法【可编辑】
二、PubMed的数据范围
MEDLINE OLDMEDLINE(1950-1965)
PreMedline
出版商提供的书目信息
MEDLINE数据库简介
收录范围：来源于美国和世界上70多个国 家和地区、50种语言的7395种(截止到现 在)权威生物医学及相关学科期刊，内容 涉及生物医学各个领域；85%以上原文为 英语，80% 记录有文摘，5%免费全文。 目前记录已达约2200万条，约40万篇/年 。
（4）“ ”，将短语做为不可分割的整体进行检索。
如：“OXYGEN FREE RADICALS ” 注意：AND 必须大写、[ ]和“ ”必须为英文或中文半
角。
Pubmed简单检索实例
例一 查找有关“肝癌和肝炎的关系”的文献，英文 “liver cancer ” 和 “hepatitis”
检索结果显示 显示检索策略
限定检索 索引检索
PubMed高级检索实例
例: 查找关于“锌对于2岁婴儿（即出生 至23个月）成长的作用”（要求时间2000— 2008）的英文文献
步骤一，确定关键词Zinc Infant Growth ，把它们输入检索框。
步骤二，限定时间。点击 。在其中的Publication Date的输入框内输入 FROM"2000 " TO"2008 ".
题录格式内容（几个字段？）
作者限定字段检索
例在二西文例文:献著里者，“著H者en的ry署H名em一il般a”名应在转前换姓成在后， 查“找H作em者ila hH”,e后m加il著a者h字著段作限的定来文检献索，
注意：姓在前，名在后 姓全称，名缩写
四、PubMed的检索途径和方法
基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索
Pubmed数据库检索与利用
PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
PubMed元数据利用
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数据库检索与利用
从图书馆网站下载NoteExpress
66
数据库检索与利用
检索结果保存为Medline格式文件
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数据库检索与利用
从NoteExpress导入题录及在文章中引用
数据库检索与利用
输入检索词
作者姓名[字段标识] Woods[au]
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
刊名[字段标识] Science[ta]
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
数据库检索与利用
添加到检 索框检索
勾选加权检索、 不扩展检索选项
数据库检索与利用
检索结果
数据库检索与利用
题录检索
数据库检索与利用
数据库检索与利用
输入检索信息
点击“Search”
例：检索《病毒杂志》（archives of virology）2009年发表的《基因稳定性与连 续性分析》（genetic stability and linkage analysis）这篇文献
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数据库检索与利用
主要内容
PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
PubMed元数据利用
69
数据库检索与利用
结果存为XML文件
70
数据库检索与利用
将XML文件数据d检索PubMed数据库
pubmed检索方法与技巧
pubmed检索方法与技巧Pubmed是生命科学领域最重要的文献检索工具之一、它提供了广泛的生命科学文献库，包括医学、生物学、药学和健康科学等领域的文献。
Pubmed的检索方法和技巧对于有效地和获取相关文献非常重要。
以下是一些常用的Pubmed检索方法和技巧：1. 关键词检索：使用关键词是Pubmed检索的基本方法。
关键词应该准确描述你所感兴趣的主题。
你可以使用与主题相关的单词、短语和术语进行检索。
同时注意使用同义词和近义词来扩大检索范围。
2. 语法：Pubmed支持使用逻辑运算符来组合多个词和短语。
常用的逻辑运算符包括AND（交集）、OR（并集）和NOT（排除）。
例如，使用"lung cancer AND smoking"将会检索到包含这两个关键词的文章。
3. MeSH主题词检索：MeSH（Medical Subject Headings）是Pubmed特有的主题词索引系统。
使用MeSH主题词可以更精确地检索相关文献。
你可以在Pubmed网站上找到MeSH数据库，然后主题词并将其添加到检索中。
4. 过滤结果：在Pubmed中，你可以使用多种筛选器来缩小结果范围。
例如，你可以使用年份范围、文章类型（如临床试验、回顾性研究等）、出版物类型（如期刊文章、综述等）和语言等来过滤结果。
5. 设置提醒：Pubmed提供设置提醒的功能，这样你可以根据自己的兴趣和需求定期获取最新的相关文献。
你可以创建保存结果或使用特定的词或主题来设置提醒。
6. 利用专业数据库：除了Pubmed之外，还有其他一些专业数据库也可以用于文献检索。
例如，Scopus、Embase和Web of Science等都是重要的文献检索工具，可以在组合使用它们与Pubmed一起使用以获取更全面和准确的文献信息。
8.限制范围：如果你想获取特定类型的文献，可以使用限制器来缩小范围。
例如，你可以限制文章类型为临床试验、人类研究或动物研究等来获取特定类型的文献。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录（篇1）I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文（篇1）I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一，提供了大量的生物医学文献资源。
对于研究人员、医学专业人士和学生来说，了解和掌握PubMed的检索方法，可以帮助他们快速找到所需的文献。
II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站，输入网址：https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮，进入检索页面。
3.在检索页面中，可以选择不同的检索方式，如关键词、作者、出版日期等。
4.输入检索词后，点击“Search”按钮，即可得到相关的检索结果。
III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序，用户可以选择不同的排序方式。
2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。
3.对于需要进一步阅读的文献，可以点击“Open”按钮，查看全文。
4.可以通过筛选条件，如主题、关键词、学科领域等，缩小检索范围。
IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词，以免得到过多的无关结果。
2.对于复杂的检索需求，可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。
目录（篇2）I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文（篇2）pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具，可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。
PUBMED数据库检索方法 吴华彰
出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码
字段检索之题名检索
字段检索之刊名检索
字段检索之著者检索
学期刊上发表的文献
内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、 职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社 会医学等领域。
NCBI
NLM
National Library of Medicine ( 美国国立 医学图书 馆） National Center for Biotechnology Information (美国国家生物 技术信息中心）
作者全名检索
在作者全名后加上字段标识符[fau]即可，有两种形式： zou quanming[fau]或quanming zou[fau]
第一作者检索
在作者姓名后加上字段标识符[1au]即可。检索彭曦以第 一作者发表的文章。
复合检索式检索(AND、OR、NOT)
如要检索肿瘤的诊断和治疗方面的文献，可以在基本检索输入框中 输入：cancer AND (diagnosis OR therapy)，点击“Go”进行检索。
1965— 上个月
Medline 1949—本周 PubMed
Medline (IM、IDL、 INI）
Medline、 Premedline、 Publisher …
专业性 要求高
部分有全 文链接
部分有电 子期刊全 文链接
简化
检索词输入框
使 用 指 南
使 用 工 具
辅 助 检 索
PubMed中文使用手册 (PDF)
PubMed中文使用手册Jeffrey Wu（一）PubMed简介：PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
（二）页面介绍:（更新很快，但其内容变化一般不大）在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后，你将进入Pubmed的主页面。
如图：1. 主页面左侧框的介绍（注：Cubby和tutorial为最新加入的）MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务，可以使用户在当地得到文献的全文拷贝（费用与发送方式各不相同）。
Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med也提供MEDLINE的接入，并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
pubmed检索教程
三、PubMed 基本检索规则
著者检索：姓全称在前，名首字母在后，[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
思考题：中国学者的名字该如何转换呢？ 如： 闻玉梅 卢正宏
17 大家好
三、PubMed 基本检索规则
刊名检索：全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如：Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
11 大家好
（三） PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
1966 to prensent 的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和 摘要，每条记录标有： [PubMed-indexed for MEDLINE]
OldMEDLINE
1949-1965年间的MEDLINE数据，无MeSH字段和摘要，每 条记录标有： [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]
促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。
促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
8
大家好
NCBI网站
9
大家好
NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列； 获 取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等 蛋 白 质 序 列 ，
13 大家好
二、PubMed的检索功能
高级检索 检索指南
基本检索输入框
检索工具： 特定文献检索
临床查询 专题查询
个人空间
其他资源： 规范词数据库
期刊数据库 临床试验等
14 大家好
三、PubMed 基本检索规则
pubmed检索方法与技巧(干货)
pubmed检索方法与技巧（干货）
主要内容
PubMed概况 PubMed数据来源 PubMed检索机制 PubMed检索运算符 PubMed检索方法 结果的显示、打印、保存 其他辅助功能
1. PubMed概况
创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国 生物技术信息中心(NCBI)
③逻辑“非”运算NOT： 检索式写成A not B，表示包含检索词A同时不包含检索词B
的文献为命中文献。 Hepatitis not Animal
PubMed 网址
IP地址：
基本检索 临床咨询
主题检索
高级检索
临床实验
5. PubMed检索方法
5.1 基本检索 5.2 高级检索 5.3 主题检索 5.4 临床咨询
5.1 基本检索
默认检索字段 为主题、作者、 期刊
5.1 基本检索
➢ 关键词、词(词组)或短语： ⑴ 输入任意关键词：liver cancer、Lung cancer； ⑵ 带有双引号” ”作为短语检索：”cancer therapy”； ⑶ 带 有 连 接 号 ” -” 作 为 一 个 词 组 检 索 （ 英 文 可 以 ， 中 文 不 行 ） ： interleukin-6。
高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献
输入：ma dl 输入：peking university
高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献
5.3 主题检索
点击MeSH Database打开 主题检索界面
根据medline数据主题标引的 规范性，利用主题词进行的研 究，对提高查全率、查准率会 有相当的帮助。
liver cancer AND alcohol
掌握利用PubMed数据库检索相关信息的方法（一）
掌握利用PubMed数据库检索相关信息的方法（一）一、查找同时符合下列条件的文献，写出检索步骤及结果：（1）题目中含有cancer；（2）有免费全文；（3）综述性文献；（4）原文是英文；（5）2011.1.1-2011.4.1间发表的文献；（6）研究对象是人类;（7）输出最近一条检索结果摘要（Abstract)格式解答：检索步骤：进去PubMed主页，选择Limits检索，在详细查找页面中分别选择符合题目的条件进行搜索。
搜索完成后，在Display Settings 中选择Pub Date 排序，并将最近一条按Abstract 格式输出。
检索结果：检索摘要：1. J Endocrinol. 2012 Jan;212(1):13-25. Epub 2011 Mar 7.The diversity of sex steroid action: the role of micro-RNAs and FOXOtranscription factors in cycling endometrium and cancer.Lam EW, Shah K, Brosens JJ.Cancer Research-UK Laboratories, Division of Cancer, Imperial College London, HammersmithHospitalCampus,LondonW120NN,***********************.ukComment inJ Endocrinol. 2012 Jan;212(1):1-2.The rise and fall in ovarian oestrogen and progesterone production orchestrates a series of events that are indispensable for reproduction, including ovulation, implantation, decidualisation and menstruation. In the uterus, these events involve extensive tissue remodelling, characterised by waves of endometrial cell proliferation, differentiation, recruitment of inflammatory cells, apoptosis,tissue breakdown, menstruation and regeneration. The ability of ovarian hormones to trigger such diverse physiological responses is foremost dependent upon interaction of activated steroid receptors with specific transcription factors,such as Forkhead box class O (FOXO) proteins, involved in cell fate decisions. Furthermore, micro-RNAs (miRNAs), small non-coding RNAs that function as posttranscriptional regulators of gene expression, have emerged as a major regulator system of steroid hormone responses in the female reproductive tract. Consequently, increasing evidence shows that deregulated uterine miRNA expression underpins a spectrum of common reproductive disorders, ranging from implantationfailure to endometriosis. Furthermore, by targeting FOXO transcription factorsand other key regulators of tissue homeostasis, oncogenic endometrial miRNAspromote tumourigenesis and cancer progression.PMID: 21382987 [PubMed - indexed for MEDLINE]二、查找北京工业大学的曾毅院士（1）过去一年中发表的所有文献，检索结果输出简要（Summary)格式；（2）将2011年发表的文献以摘要(Abstract)格式输出。
pubmed检索方法与技巧
6.1 结果的显示
（3）MEDLINE：以MEDLINE数据库的记录格 式来显示检索结果。字段内容主要包括PMID、 题目、摘要、作者、作者地址、语种、出版 类型、出处、MeSH、文献ID、出版状态等。
6.1 结果的显示
6.1 结果的显示
6.2 检索结果的保存
保存记录 在“send to”下拉菜单中选择“File”，可完 成将记录保存为文件。 选择“E-mail”，则可将结果发送至邮箱。 在检索结果显示页面可将某一次检索的全部 记录或标记记录保存；而“Clipboard”页面 可用于保存一次或多次检索的结果记录。
In Process Citations：每天收录，尚 未经规范处理的数据。[pubmed-in process]
Publisher-Supplied Citations：由出 版商提供的电子文献，每条记录标有 [PubMed-as supplied by Publisher]。
3. PubMed检索机制
("humans"[MeSH Terms] OR "humans"[All Fields] OR "human"[All Fields]) AND recombinant[All Fields] AND ("trefoil factor"[Supplementary Concept] OR "trefoil factor"[All Fields])
第2步：检索白血病/药物疗法
主题检索举例： 长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献
5.4 临床咨询和系统评价
可以使用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献，如临 床疾病的诊断、治疗、病因和预后等；
Pubmed检索-讲稿
PubMed检索内容：PubMed及NCBI相关数据库PubMed数据范围认识PubMedPubMed检索方法PubMed RSS学科跟踪PubMed及相关数据库NCBI(National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心)NCBI是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一，其成立的原因是为已故的参议院议员Claude Pepper发现计算信息处理方法对生物医学研究的重要性，因此，在1988年11月4日成立NCBI。
NCBI是National Institutes of Health （NIH）底下的National Library of Medicine（NLM）的部门之一。
由于NLM具有建立与维护生物医学数据库经验，且因它是NIH的单位，因此可执行计算分子生物计划。
NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。
NCBI成立的主要任务为：（1）提供生物医学的分析与计算工具，协助研究人员了解生物的语言--DNA 在健康与疾病中所扮演的角色（1）发展新技术协助了解调控健康与疾病的基本分子与遗传过程，包括建立储存与分析分子生物、生化与遗传学知识的自动系统；促进研究与医学社群使用数据库与软件；协调生物技术信息的传递与管理；执行以计算机为基础的进阶信息分析过程，用以分析生物重要分子的结构与功能。
NCBI组织架构：Computational Biology Branch （CBB）Information Engineering Branch（IEB）Information Resources Branch（IRB）Computational Biology Branch（CBB）处理运算、数学及分子生物、生物与遗传学理论问题的基础与应用研究，包括基因体分析、序列比对、序列搜寻方法、巨分子结构、动力学与交互作用、结构/功能预测等。
建立NIH实验室、政府机构、学术单位与产业界之生物学家、化学家、数学家与计算机科学家间的计算分子生物合作研究计划。
pubmed检索攻略
第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。
尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。
"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。
从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。
我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。
尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。
还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。
无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。
俗话说，喝水不忘掘井人。
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。
有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。
其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。
当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。
而最新的文献几乎就在此时此刻。
与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。
所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。
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遗传学教研室 吴华彰
PubMed是个什么样的数据库? PubMed如何使用? 检索技巧与操作
PubMed数据库简介
➢ 我们检索的PubMed是学校购买的吗？ ➢ PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息
书 目数据库MEDLINE的免费网络版 ➢ PubMed包含多少种期刊，能覆盖全部的医学领域吗？ ➢ 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的5,500余种生物医
检索途径与方法
▪ 基本检索 - Basic Search ▪ 高级检索 - Advanced Search ▪ 限定检索 - Limits Search ▪ 主题词检索 - MeSH Browser ▪ 特定文献查找- Citation Matcher ▪ 临床查询 – Clinical Queries
学期刊上发表的文献
➢ 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、 职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社 会医学等领域。
NLM
National
Library of
Medicine ( 美国国立 医学图书 馆）
NCBI
National Center for Biotechnology Information
最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘 版权拥有者 题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录 其他关键词 提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号
作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
检索出文章总篇数 可免费获得全文数 综述类文章总篇数
词组检索/短语检索
特定字段检索 常用检索字段
检索格式：检索词[字段标识]
电子出版日期 文献出版日期 数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称 文献相关注释 基金编号 基因符号 期编号 资助调研者 资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称
ENTREZ Nucleotide
Structure
Protein
Genome
PUBMED
(美国国家生物 技术信息中心）
Popset OMIM
Entrez系统包含的数据库
▪ PubMed—生物医学文献 ▪ Nucleotide—核苷酸序列数据库 ▪ Protein—蛋白质序列数据库 ▪ Structure—大分子三维蛋白质结构 ▪ Genome—完整的基因组汇编 ▪ Popset—以DNA和Pro.分析生物间的进化关系 ▪ Taxonomy—分类学数据库 ▪ OMIM—孟德尔人类遗传学数据库 ▪ Books—生物医学网络版图书 ▪ Probeset—基因表达选集 ▪ 3D Domain—特定功能域三维结构
bacter*[TI]
截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。
检索特点
▪ 强制检索：双引号 “ ” 或限定字段 ▪ “endocrine disruption ”
▪
endocrine disruption
▪ 注意：所有的 “ ”、*、 ( )、- 都必须是英文状态 下输入。
单词检索
cancer
等基本书目信息。
赋予MeSH、PT等字段并被index。
PubMed - indexed for MEDLINE
PubMed文献包括三部分:
▪ Medline文献 占据绝大部分 ▪ OldMedline 1966年以前的Medline文献 ▪ 非Medline文献 Medline收录期刊的非生物医学
PubMed数据库简介
PubMed和Medline的区别？
PubMed - as supplied by publisher
PubMed
属于Medline收录范围，建立ti、 au、ab等基本书目信息。
PubMed - in process
（暂）不属于Medline收录 范围，但也建立ti、au、ab
Last name（姓）。 ▪ Frank为Middle name，比较少看到，多看到 John F.
检索特点
▪ 检索运算符AND、NOT、OR必须大写。 (vitamin c OR zinc) AND common cold
▪ 支持截词检索（*），但对词组无效。 ▪ 如bacter*, 可以检出以bacter为词干的单词bacteria、 bacterium等最多600个单词。 ▪ 截词检索时，系统的自动词语匹配功能和MeSH自动扩 展功能将不再被执行，如：heart attack＊ 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction。
文献及最新文献。
PubMed与Medline
指标 检索系统 Medline
PubMed
检索年限 1965— 上个月
1949—本周
收录范围 检索方法 检索结果
Medline (IM、IDL、
INI）
Medline、 Premedline、 Publisher …
专业性 要求高
简化
部分有全 文链接
部分有电 子期刊全
正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码
字段检索之题名检索
字段检索之刊名检索
字段检索之著者检索
自由词检索：检索某一作者发表的文献
作者姓名书写格式
西方人姓名书写格式：First name、Middle Name、Last name。 ▪ 美国肯尼迪总统名为： John Frank Kenedy，Kenedy为
文链接
检索词输入框
使 用 指 南
使
辅
用
助
工
检
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
具
索
▪ Nucleotide(DNA序列)数据库 ▪ Protein[氨基酸（蛋白质）序列]数据库 ▪ Genome(基因组序列)数据库，提供所有基因与染色体纪录与图
片的查询服务，这个库中数以百万的基因序列是由庞大的基因 排序工作得来的。 ▪ Structure（分子结构模型）数据库，这个数据库保存的是由X线 晶体成像、NMR分光光度法建立的三维分子结构。 ▪ OMIM(人类孟德尔遗传学)在线数据库。 ▪ PMC可链接到NCBI 提供的免费全文期刊。