SELDI蛋白质芯片技术在肿瘤诊断中的临床应用
最新 肿瘤学中蛋白质芯片技术的运用-精品
肿瘤学中蛋白质芯片技术的运用近年来,肿瘤严重威胁着人类生命并影响人们的生活质量,以下是小编搜集整理的一篇探究蛋白质芯片技术的,欢迎阅读借鉴。
近年来,随着免疫学的飞速发展,生物芯片技术作为一种新的高效的实验手段,也迅速发展起来。
以蛋白质为研究对象的蛋白质组学结合生物芯片技术理念,也迅速发展了以高通量、微型化、自动化和高度并行性为特点的蛋白质组学检测技术---蛋白质芯片(proteinchip)技术。
目前蛋白质芯片的研究和开发已成为热门领域。
UetzP等[1]利用酵母细胞建立了第一个全蛋白质组芯片;Mac-BeathG等[2]在2000年首次报道了利用蛋白质芯片进行蛋白质相互作用及与小分子作用的研究;第四军医大学全军基因诊断技术研究所于1999年研制成功我国第一块医用蛋白质芯片[3];中国科学家研制的肿瘤标志物联合检测(C-12)蛋白质芯片获国家药监局颁发的生物制品一类新药证书。
蛋白质芯片技术的研究为疾病诊断治疗[4-5]、药物筛选、蛋白质组学研究[6]、食品卫生监督[7]、环境监测、司法鉴定[8]等众多领域带来巨大的革新空间。
1蛋白质芯片技术概述蛋白质芯片,也称蛋白质微阵列(proteinmi-croarray),是将位置及序列已知的大量蛋白、多肽分子、酶等以预先设计的方式固定在玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶等载体上组成密集分子排列,通过探针蛋白特异性地捕获样品中的靶蛋白,利用激光扫描系统或电荷偶联照像系统对标记的信号强度进行检测,或利用表面增强激光解析离子化-飞行时间质谱技术直接检测靶蛋白,从而对其进行定性、定量分析。
最早进行蛋白质芯片研究的是德国科学家Lueking.目前,蛋白质芯片技术已成功应用于高通量的药物筛选,并用于药物研究和分析。
此外,蛋白质芯片技术在食品分析,环境保护及卫生检验等领域也显示出良好的发展前景。
2蛋白质芯片技术在肿瘤研究中的应用肿瘤严重威胁着人类生命并影响人们的生活质量,2012年我国新发肿瘤病例约312万,全国肿瘤死亡率为180.54/10万,每年因癌症死亡病例达270万例[9].肿瘤早期诊断和抗肿瘤药物的研究已成为当今科研领域的重大攻关项目。
SELDI-TOF-MS技术在消化道肿瘤早期诊断中的应用
摘 要 蛋 白质组 学技 术的发展 为 发现 新 的 生 物标 记 物 提供 了机 会 。表 面增 强激 光 解 析 电 离 飞行 时 间 质谱 ( u fc n a cdlsrd sr t n inzt nt —f l h s p cr mer )就 是 一种新 兴 的有发 S raee h n e e eo pi /o i i i o- i t a o a o me f g ma sseto t y
e ryda n sso a c r al ig o i fcn e.Th u fc n a c dlsrd s r t n inz t nt -ffih s p cr mer S DITOF MS) es ra ee h n e e eo p i /o iai i o—l t a o o me g ma ss eto ty( EL — -
交 换 ( X) 金 属 离 子 螯 合 ( MAC) 特 异 结 合 WC 、 I 、 ( S 等 ; 生 物 表 面芯 片 : 为抗 体一 原 、 体一 P) ② 分 抗 受 配
体和 D NA一 白质 芯 片 等 , 蛋 可显 示 与 之相 结 合 的抗 原或配 体 的不 同亚 型 。蛋 白 质 芯 片 阅 读 器 即安 装 有 脉 冲式紫外 线/ 氮激光 光 源 的解 析 离 子化 时 间一 飞 行 质谱 仪 。
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・12 ・ 4
国际消化病杂志 20 4 第 2 卷 第 2 07年 月 7 期— 1t i ! nJ g D 垒
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・
综述 ・
S L I F MS技术 在 消化 道肿 瘤 早期 诊 断 中的应用 E D— TO —
Ab t a t R e e v nc si otom is o f r o or u te o r pi y i e iy n w o a k r r p t r fm a ke s f r sr c c ntad a e n pr e c fe pp t niis t a dl d ntf e bim r e s o ate n o r r o
SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应用研究
21 0 0年 第3 3卷 Nhomakorabea第 1 期
5
Ju a fL z o dc lC l g V 1 3 o r l uh uMe ia ol e n o e o. No1 2 1 3 . 0 0
警
S L I 白质芯 片技术在 结直肠癌 ED蛋 临床诊 断 中的应 用研 究
谱。分为训练集( 4 0例患 者 4 例 对照) 0 和验证集(0 患者和 3 3例 3例对照)前者用于 筛选 结直肠癌的差异蛋 白标志物并建 立人 工 ,
神 经 网络 ( NN) 断 模 型 , 者用 于 诊 断 效 度 的 盲 法 验 证 。 结 果 : 直肠 癌 患 者和 对 照 组血 清 蛋 白指 纹 图谱 共 有 18个 明 显 表 A 诊 后 结 4
达差异的蛋白峰 , 筛选质荷比( z为 2 5 、9 4 2 8 、0 6 3 8 、9 8 54 、6 76 6 m/) 9 7 2 7 、9 2 3 1 、22 5 2 、9 86 4 、6 1的 9 蛋白质峰 作为标志蛋 白(< .1 个 P 0o) 建立人工神经 网络诊断模 型 , 利用该模型对结直肠癌进行 盲法预 测 , 结果表明该诊断模型检测结直肠癌 的灵敏度 为 9.%, 4 2 特异 度为 9 . 结论 : 1 %。 3 应用蛋白芯片技 术检 测到 对结直肠癌有鉴别意 义的血 清蛋白标志物 , 可能为结直肠癌的早期诊断 提供了新的
手段 。 关键 词 结 直肠 癌 ; 白组 学 ; 面增 强 激 光 解 吸 离子 化 飞 行 时 间质 谱 (E DITOF M S 技 术 ; 工神 经 网络 蛋 表 SL - - ) 人 中 图分 类 号 R 3 . 7 53 文献标识码 A 文章 编号 10 — 69 2 L )- o 5 0 0 0 2 6 (O O 1o o - 6
SELDI-TOF-MS技术在消化系统肿瘤诊断中的应用
SELDI-TOF-MS技术在消化系统肿瘤诊断中的应用作者:吕连华王开正冯建军来源:《中国实用医药》2008年第16期【摘要】表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术是随着蛋白质组学的兴起而出现的新技术,是一种基于蛋白质芯片和质谱技术的多种疾病标志物的分析平台。
SELDI-TOF-MS技术是一种操作简单、方便快捷、样本用量少、敏感性高、特异性强的高通量的研究蛋白组学的方法。
为此,本文就SELDI-TOF-MS技术的原理、特点及其在消化道肿瘤诊断中的应用作以下综述。
【关键词】蛋白质组学;SELDI-TOF-MS;消化系统肿瘤;蛋白芯片Application of SELDI-TOF-MS in the diagnosis of digestive systemic tumorsLV Lian-hua,WANG Kai-zheng.Fengjian-jun.Department of Labotatory Medicine,Mianyang Hospital,Sichuan Mianyang621000,China【Abstract】 SELDI-TOF-MS(surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectometry)has emerged in recent years with the development of the proteomics.It is a powerful platform based on the technique of proteinchip and spectrometry for the discovery of multiple diseases’biomarkers.SELDI-TOF-MS is high throughput research method in proteomics with superiorities of automation,rapidness,paucity of samples,sensitivity and specificity.This paper reviews its principle,classification and the prospect of application in the digestive systemic tumors.【Key words】Proteomics;SELDI-TOF-MS;Digestive systemic tumors;Proteinchip1 SELDI-TOF-MS 技术及其特点1.1 SELLDI-TOF-MS技术的系统组成及工作原理自2002年被诺贝尔化学奖得主田中耕一发明以来,SELDI-TOF-MS技术已在一些肿瘤生物标志物筛选方面取得突破性进展。
蛋白芯片
SELDI蛋白质芯片技术在肿瘤诊断中的临床应用SELDI蛋白质芯片技术又称为表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface—enhanced laser desorption/ionization —- time of flight —- mass spec-trumpery。
SELDI—TOF —MS).自2002年13本科学家田中耕一因发明该技术而荣获诺贝尔化学奖后.该技术发展十分迅速,目前已经广泛应用于生物技术、药学、基因学、临床诊断、生物信息等诸多领域。
其在临床实验诊断学中的主要工作原理是利用蛋白质芯片(proteinchip)和表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪对体液中各种蛋白质.包括疾病早期最微小基因表达产物如低分子量蛋白质、多肽等。
进行动态、全景的分析。
获得待检标本中各种蛋白的含量及其分子量等信息,绘制成蛋白质指纹图谱。
再通过计算机软件将正常人、亚健康状态人群、良性疾病和癌症病人的指纹图谱库对照。
比较分析差异。
就能快速、敏感和特异地发现和捕获新的与疾病相关的蛋白。
目前发现通过SELDI蛋白质芯片技术所获得的生物标记物.大多是特异性肿瘤微环境所产生的低分子量的蛋白质,通过对多种肿瘤的检测表明。
其敏感性和特异性均优于传统的肿瘤标记物.对某些肿瘤的敏感性已达到100%。
特异性也超过95%。
因而该技术能在肿瘤早期诊断中具有很重要的临床应用价值。
1 SELDI一TOF—MS系统的组成1.1 蛋白质芯片又称蛋白质微阵列(protein microarray)。
把制备好的蛋白质样品固定于经化学修饰的玻片或硅片等载体上。
蛋白质与载体表面结合。
同时仍保留蛋白质的理化性质和生物活性.可以高效地大规模获取生物体中蛋白质的信息。
蛋白质芯片技术主要包括四个基本要点:芯片阵列的构建、样品的制备、芯片上的生物分子反应、芯片信号检测及分析。
制备蛋白质芯片时由于蛋白质分子的活性依赖于不同的折叠方式。
因此对芯片的表面修饰至关重要。
蛋白质芯片技术在医学诊断中的应用
蛋白质芯片技术在医学诊断中的应用蛋白质是生命体活动非常重要的基本分子之一,它们在生物体内执行着各种各样的生化作用,能够分辨性地识别和结合到特定的分子,例如酶和抗体等。
由于蛋白质对人体的重要性,蛋白质相关的技术和研究得到了越来越多的关注。
其中一项技术,就是蛋白质芯片诊断技术。
蛋白质芯片是一种基于微电子学技术,可快速检测蛋白质分子与其他分子之间相互作用的技术。
证明了蛋白质芯片技术是完全适用于医学诊断的,可用于早期诊断、分型和预后的评估,提供精准的治疗方案。
在对某些疾病的早期诊断中,蛋白质芯片被证明是一种十分有用的技术。
举个例子,在乳腺癌的早期检测中,该技术能够快速地将不同状态的肿瘤区分开来,促进早期治疗,从而降低治疗成本和提升治疗效果。
蛋白质芯片可以在疾病早期诊断阶段识别预后指标,因此它可以用来评估患者的风险,并作为治疗方案的参考。
此外,芯片还可以用于对药物的反应进行评估,从而可以更有效和更快地找到合适的治疗方案。
除此之外,蛋白质芯片技术还可以在传染病诊断中发挥重要作用。
例如,乙型肝炎病毒 (HBV) 可引起肝炎,而蛋白质芯片技术可用于检测HBV感染状态下的血清中的肝脏功能、细胞凋亡和炎性因子等模式,在诊断和病毒清除前能够自动检测病人的状态。
同时,蛋白质芯片技术在癌症预测方面的应用也非常广泛。
在普通的生物芯片中,只能检测几个蛋白质,而蛋白质芯片可以检测数千个蛋白质,这使得研究人员可以在癌症治疗之前更早地检测到癌细胞的存在。
这种技术使得肿瘤细胞的分子特征得以在疾病前期识别,从而有利于治疗和预测其浸润和转移的潜力。
蛋白质芯片技术变得越来越重要,因为它可以为许多疾病的早期诊断以及更好的治疗和预测提供重要信息。
在医学领域中,诊断和治疗比预防更加困难,因此采用蛋白质芯片技术是一个有前途的方向。
这种已被证明非常有效的技术,可以在未来为临床研究带来更多的可能,从而改善健康状况和减少疾病的负面影响。
SELDI-TOF-MS 技术在消化系统肿瘤诊断中的应用
SELDI-TOF-MS 技术在消化系统肿瘤诊断中的应用
吕连华;王开正;冯建军
【期刊名称】《中国实用医药》
【年(卷),期】2008(003)016
【摘要】表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术是随着蛋白质组学的兴起而出现的新技术,是一种基于蛋白质芯片和质谱技术的多种疾病标志物的分析平台.SELDI-TOF-MS技术是一种操作简单、方便快捷、样本用量少、敏感性高、特异性强的高通量的研究蛋白组学的方法.为此,本文就SELDI-TOF-MS技术的原理、特点及其在消化道肿瘤诊断中的应用作以下综述.【总页数】3页(P180-182)
【作者】吕连华;王开正;冯建军
【作者单位】621000,四川省绵阳市人民医院检验科;621000,四川省绵阳市人民医院检验科;621000,四川省绵阳市人民医院检验科
【正文语种】中文
【中图分类】R73
【相关文献】
1.SELDI-TOF-MS技术在消化道肿瘤诊断中的应用 [J], 卜淑蕊;钱家鸣
2.浅析血清肿瘤标志物AFP、CEA和CA199联合检测在消化系统恶性肿瘤诊断中的临床应用价值 [J], 彭萍;陈霖;李娟
3.外泌体在消化系统肿瘤诊断中的应用 [J], 崔琮;徐建明;王友亮
4.蛋白质芯片技术在消化系统肿瘤诊断中的应用进展 [J], 袁小媚;邓颖;易光辉
5.血清AFP、CA199、CA125检测在消化系统肿瘤诊断中的应用 [J], 李丽坤;邸雅南;赵可;张波
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SELDI-TOF-MS技术在检测乳腺癌肿瘤标志物中的应用
Ke r s S L — OF— ; aa tp oec n e;u r r e ywo d E DI T — — MS g lco h r a c rtmo k r ma
1 SE DI 统 的 组 成 、 理 L 系 原
尿液等体液或细胞裂解液) 点到蛋 白芯片的位点上, 蛋白与芯
理获得一张质谱图 。 以显示 出不 同的蛋 白质 以及它 的强度 。 可 整个 检测过程简单 快捷 , 分钟 内完 成 , 几 且样 品消耗量 低 ( 低
至05 L o .L l
・ 一 + + “ “ + + 一 + 一 一+ - + + - -+ - + + - + 一 一 + + + + 一 + 一 一 + + 一 一 + + 一 + 一 一 + + 一 + 一 一 + + * + * * + + * + * 一 + 十 一 +
SL I E D 系统 由蛋 白芯片 , 质谱仪 , 分析软件3 部分构成 。蛋 白芯 片的设计 源 自基因芯片 的设计方法 和生物分子反应 的原 理。 依据芯片表面所结合 的化学物质的不 同分为两大类 , 一类 为化 学类 芯片 , 根据色谱 原理 , 芯片表面 固化不 同类型 的固 在
相物 质例 如疏 水性 化合物 、 性化合物 、 亲水 强阴离子交换化合 物、 阳离子交换化合 物 、 弱 金属鳌 合化合物 。另一类 为生物类 芯片 : 依据生物分子反 应原理 , 芯片表面 固化 的物质 为不同 在 的生物分子例 如抗 原/ 、 体/ 、 N / 白质 。依据检 抗体 受 配体 D A蛋 测的对象不 同可 以选择不 同类型 的芯片 。 S L IT F MS E D — O — 技术 的原理 : 将待 检测的生物样 品( 血液 、
蛋白质芯片在肿瘤研究中的应用
[ 文章编号 ] 17 7 9 ( 00 0 04 6 2— 13 2 1 )4— 7 5—0 3
肿瘤 作为健康的杀手正在严重威胁着人类 的生命 , 尤其 是 恶性 肿瘤 , 一经发现往往 已经是癌症晚期。这就需要 找到一 种
13 功能 .
蛋 白质芯片 已经在蛋 白质组学 的多个研究 领域有
所应 用 , 主要包括 :1 蛋 白质表达谱 的研究 , 于生物标 志物 () 用 的发现 ;2 蛋 白质 一蛋 白质 、 白质 ~D A以及 蛋 白质 一小 () 蛋 N
蛋白质之 间相互作用 的关 系, 由此达到测定各种蛋 白质功 能的
徐 秀梅 , 刘 辉 , 志巍 何
[ 摘要 ] 蛋 白质芯片是继基 因芯 片之后发展起 来的一项快速、 高效 、 灵敏 的蛋 白质分析技术 , 为蛋 白质的功 能研 究提 供 了强 有力的工具 , 在肿瘤研 究方面的应用尤为突 出。 它可 以同时检 测样 本 中多个肿瘤标志物表 达水平 的变化 , 这些与肿 瘤相 关的标 将
12 3 孵育 ..
将芯 片和血清 、 细胞 或组织抽 提液一起孵育 , 样
品中的蛋 白就会结合到相应的抗体上 。
1 蛋 白质 芯 片 的原理 及创 作流 程
1 1 原理 . 蛋 白质芯片技术 的基本原理是 将大量不 同探针 固
124 检 测 芯片经激光扫描仪 、 光成像 仪或质谱仪检 测 , .. 磷 所得 的信号 强度 与该 位点抗 体所 对应 的 蛋 白表达水 平 有关 。
分子之 间相互作 用的鉴定 ;3 对蛋 白质翻译后修饰的检测 , () 进
SELDI蛋白质芯片技术在医学领域中的应用
集蛋 白质样 品处 理 、 化反 应 及检 测 分 析过 程 于一 体 的 新 生
型、 效、 高 快速 、 高通 量的检 测方 法 , 弥补 了二维 电泳对 低峰
肠 一胰腺/ 腺炎 相关蛋 白 I( I/ A 胰 HP P P—I) 。进一 步研
度、 低溶解度 、 极端等 电点 值 、 极大 ( 相对 分子质量 >2000 0 0 )
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67 9
S L I 白质 芯 片技 术在 医学 领 域 中 的 应 用 ED 蛋
MS 技术 , 采用 I C 一C 芯片 , MA 3 u 对胰腺癌患者 以及其他胰腺 疾 病 患 者 为 对 照组 的胰 腺 分 泌物 进 行 研 究 发 现 , 6 % 在 7 (0 1) 1/5 的胰腺癌 患者和 1%(/ ) 7 17 的对照组 中均 发现 1 .7 6 5 k u分子量的蛋 白质 高表 达 , E IA证 实 , 经 LS 该蛋 白质 为肝癌
究中起着十分重 要的 作用 。蛋 白质 芯 片通过 蛋 白质谱 或蛋
白质 差示分析 , 对一 些表达上调或下 凋蛋 白进 行鉴定 和定 量 分析 , 中发现某些 能作为某种代 谢性疾病 、 物反应 、 从 药 肿瘤 以及微生物感染的生物学标 志 , 为研 究疾病 的发生 、 发展 、 诊 断和治疗 提供科学 的依据 。
2 肿 瘤 标 志 物 筛 选
2 1 消 化 系肿 瘤
【 关键词 】 S[ I 蛋 白质芯 片技 术 医学领域 ED
蛋白质芯片技术在肿瘤研究中的应用
近年来 , 随着 人 类 基 因组 计 划 的 顺 利 实 施 , 以蛋
质点 样 , 究作 用物 对 酶 活性 的影 响 [ 及 蛋 白质 与 药 研 1 物或 效应 因 子之 间 的相 互 作 用 [ 反 相 蛋 白芯 片 则 2 ; 。 是将 组织 、 细胞 溶 菌产 物 等 点 样 在 芯 片表 面 , 现 大 实 规模 、 高通 量 的蛋 白质 筛 选 。蛋 白质芯 片 技术 是 伴 随 着基 因组研 究迅 速发 展起 来 的一 项 高 新技 术 , 它提 供 了在 同一 时相分 析整个 蛋 白质组 的可 能 , 多科 学 家 许 认 为蛋 白质 芯 片 将 会 缩 小 存 在 于 基 因组 与 蛋 白质 组
ry ) 是将 位置 及序 列 已知 的 大量 蛋 白 、 等 以 点样 as , 酶 的方 式 固定 在 玻 片 、 片 等 载体 上组 成 密 集 分 子 排 硅 列, 通过探 针 蛋 白特 异性 捕 获 靶 蛋 白 , 利用 表 面增 强 激光 解 吸 电 离 飞行 时 间 质 谱 (u fc-n a cd lsr s r ee h n e ae a
巨大 的革 新甚 至革命 。 蛋 白质 芯片技 术概 论 蛋 白质芯 片也 称蛋 白质 微 阵列 ( rti mira— p oen co r
之 间 的信号 鸿沟 。
近几年 , 白质 芯 片 在 蛋 白质 功 能 研 究 、 测 及 蛋 检
医疗诊 断等 方 面有着广 阔 的应 用前 景 。如 : 用 蛋 白 利 质 芯 片发现新 的蛋 白并 阐明其 功 能 ; 找 与疾 病 相关 寻 的蛋 白和生物 标记 物 ; 在蛋 白质 芯 片上 筛 选新 药 和发 现新 的药物靶 标 。这些 都 成 为 当前 研究 的重 点课 题 。 此 外 , 白质 芯 片技 术 在 食 品 分 析 、 境 监 测及 卫 生 蛋 环 检 验等 领域也 有 良好 的发 展前 景 , 多 研制 工 作 正在 许 进行 中 。随着 该技 术 的不 断完 善 , 将 在 生命 科 学研 它 究 中发挥 越来 越 重要 的作用 。
SELDI技术在预测肿瘤化疗药物疗效中的应用
SELDI技术在预测肿瘤化疗药物疗效中的应用一直以来恶性肿瘤严重威胁着人类健康,尤其对于低收入和中等收入国家影响更甚。
Ahmedin等[1]最新发布的全球肿瘤统计数据表明,2008年,全球有1270万人患癌,死亡人数高达760万。
因其对人类如此严重的危害性,多年来,人们不断探索肿瘤的治疗方法,目前发展最快的是化学药物治疗,它已成为当今临床治疗肿瘤的重要手段之一。
随着医学飞速发展,化疗药物种类日益增多。
然而,很多化疗药物的疗效并不尽如人意。
导致肿瘤化疗疗效差的主要原因是肿瘤细胞对化疗药物耐药,而肿瘤细胞耐药与某些蛋白高表达有关[2]。
因而,筛选耐药蛋白并检测患者对某种药物耐药蛋白的表达水平,是预测该化疗方案是否敏感的关键所在。
SELDI-TOF-MS技术(表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术),是近年发展起来的蛋白质组学研究前沿技术[3]。
自1993年首次发布此技术和1999年首次报道其在肿瘤领域的应用以来,国内外大量文献[4-8]报道介绍了用SELDI-TOF-MS技术分析血浆/血清等人体液中的差异表达蛋白质图谱。
现对近年来应用SELDI-TOF-MS技术预测肿瘤化疗药物疗效的研究进展综述如下。
1 肺癌肺癌是死亡率最高的恶性肿瘤,肺癌的化疗敏感性也是近年来很多临床医师关注的焦点[9]。
Li等[2]应用CM10弱阳离子芯片结合表面增强飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测9例晚期肺癌患者口服吉非替尼前血清样本的蛋白质谱,口服吉非替尼1个月后,根据实体瘤近期疗效标准[10]分为服药有效组(CR+PR)4例和无效组(SD+PD)5例,利用Biomarker Wizard软件比较各组间的血清蛋白质指纹图谱。
结果:有效组与无效组相比有4个蛋白质峰有显著差异性,M/Z分别为4889、1576、1762和8693,与无效组相比,有效组上调的峰为2个,其M/Z为1576和1762,下调的峰为2个,其M/Z为4889和8693。
SELDI蛋白质芯片平台及其在结直肠癌蛋白质组学中的应用
SELDI蛋白质芯片平台及其在结直肠癌蛋白质组学中的应用范乃军;盛新华;高春芳
【期刊名称】《医学信息(中旬刊)》
【年(卷),期】2007(020)010
【摘要】结直肠癌是威胁人类健康的常见肿瘤之一,目前缺乏敏感度、特异度高的早期诊断方法.蛋白质组学为结直肠癌的许多研究领域开拓了新的视野,表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(surface enhanced la-ser desorption ionization-time of flight-mass spectroscopy,SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片平台是蛋白质组学的主要技术平台之一,本文综述了SELDI蛋白质芯片平台的基本原理、技术特点及其在结直肠癌蛋白质组学研究中的应用和展望.
【总页数】4页(P908-911)
【作者】范乃军;盛新华;高春芳
【作者单位】解放军第二军医大学,上海,200433;解放军第二军医大学,上
海,200433;解放军150中心医院全军肛肠外科研究所
【正文语种】中文
【中图分类】R735.3
【相关文献】
1.SELDI蛋白质芯片技术在蛋白质组学中的应用 [J], 何大澄;肖雪媛
2.SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应用研究 [J], 张巍;邓明明;王开正
3.SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应用及发展前景 [J], 张巍;邓明明
4.SELDI蛋白质芯片技术在肿瘤蛋白质组学研究中的应用 [J], 伍健;黄培林
5.SELDI蛋白质芯片平台在结直肠癌蛋白质组学研究中的应用 [J], 范乃军;盛新华;高春芳
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SELDI蛋白芯片技术在肿瘤早期诊断中的应用
SELDI蛋白芯片技术在肿瘤早期诊断中的应用作者:李宗英张丽珍常会忠来源:《健康必读·下旬刊》2011年第08期【中图分类号】R28【文献标识码】B【文章编号】1672-3783(2011)08-0296-01SELDI蛋白芯片技术全称为表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术,是近年用来研究蛋白质组学的一项新的技术平台,具有高通量、高效率、高灵敏度等特点,可以快速地分析各种生物样品中蛋白质组的组成。
利用SELDI技术分析比较正常人血清、体液、组织蛋白质与异常者间的表达差异,筛选出与肿瘤相关的蛋白标记并进行确认,用于疾病的早期诊断以提高生存率。
目前这一技术已运用于多种肿瘤的早期诊断研究中,并已显示出美好的应用前景。
1 肝癌Poon等[1]利用SELDI技术对原发性肝癌早期诊断、分型及HBV相关慢性肝病(肝纤维化、肝硬化)进行研究,通过人工神经网络模型分析,结果显示对肝癌的诊断当特异性为90%时,灵敏度为92%,对肝癌的分型和肝纤维化与肝硬化的正确区分有很好的辅助作用,而且研究指出利用SELDI蛋白芯片技术发现的标志物与血清AFP浓度无关。
另外Schwegler 等、Paradis等也在这方面进行了研究,取得了相似的结果。
以上研究说明SELDI技术应用于肝癌早期诊断其灵敏度和特异性远比传统的单一的血清AFP高,并且对AFP阴性肝癌患者的早期诊断可能有很好的辅助作用。
2 肺癌Zhukov等[2]研究认为通过该技术发现的蛋白质标记物可以早期发现肺癌和癌前病变,并可以对肺癌的高危人群进行监测及对肺癌化疗后疗效的评估。
杨拴盈等研究显示蛋白质芯片SELDI技术能较准确地区分NSCLC患者与健康对照者,该技术为NSCLC的筛查提供了新的有效工具。
此外,SELDI技术还被应用于卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌,结肠癌、头頸部肿瘤、胰腺癌、胃癌等的研究中,均显示该技术有助于肿瘤的早期辅助诊断。
3 前景及展望蛋白芯片SELDI技术除应用于肿瘤早期诊断中外,在其他疾病的研究(如艾滋病、老年性痴呆)、疗效检测、发病机制探讨、新药研发和基础理论研究等方面亦具有广泛应用。
SELDI技术应用于肿瘤疗效监测的初步研究
[ 摘要 ] 目的 应用表面增强的激光解 吸电离 飞行 时间质谱 ( E D—O — S 技术对卵巢癌及喉 癌患者治疗 S L I FM ) T
前后血清进行疗效相关标志分子的筛选 , 评价 此技 术在 肿瘤疗效 监测方 面的可行性 。方法 应用 S L I O — E D — FMS T 技术分别对 2 O例卵巢癌患者化疗前后及 5 例喉癌患者手术前后血清蛋 白质指纹 图谱进行 分析 , Bo akr z 1 用 im re Wi — a r d软件对结果进行统计学分析 。 结果 卵巢癌患者化疗后血 清 中质荷 比( / ) 7 m z 44 5的蛋 白峰 ( 4 2 ) 1/ 0 较化疗前 SLI O — E D — FMS技术能灵 T 表达增 高 ; 喉癌患者术前血清高表达 m z1 4 蛋 白峰 , / 37 1 术后 2 1例患者该蛋 白表 达降低 , 中 1 ( 12 ) 后 其 1例 1/ 1 术 m/ 37 1 m z 9 z 4 、 / 12和 m z 510的蛋 白峰表达均较术前显著下降 ( 0 O ) 1 5 / 0 1 P< . 1 。结论 测及肿瘤的个体化治 疗研 究中具有 较好 的应 用前景 。
D N i i Z A u , l i, H N i—in K NGB i u , uX n E GB - n p g, H NGH i JALn Z A GX uq g, O e h a Q u a —
蛋白质芯片技术在肿瘤检测中的应用
万方数据 [ 作者简介]秦学亮 ( #$*( ) ) , 男, 实习医师"
:3LKMHWSX 分析了大肠癌患者与正常对照之间的血清蛋白 图谱之间的差异, 其中大肠癌患者高表达 <6 *$OO 蛋白, 而
[ 收稿日期]%OO’HO$H#$ [ 作者单位]#" 蚌埠医学院 检验系 %OO# 级, 安徽 蚌埠 %IIOIO ; %" 上海市浦东新区杨思医院 检验科, %OO#*%
[#] 要特征之一, 有研究表明 , ’OT 的乳腺癌, ’+T 的前列腺
癌, I’T 的结肠癌在转移之前, 用常用的检测方法难以检测, 而在肿瘤早期就在蛋白水平发生微小的变化。因此用高灵 敏度的蛋白芯片技术寻找新的肿瘤标志物用于早期诊断和
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SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应用研究的开题报告
SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应
用研究的开题报告
一、研究背景
结直肠癌是常见的恶性肿瘤,是全球第三大癌症,其发病率不断上升。
早期诊断是预后改善的关键,但常规诊断方法如病理检查、影像学检查等存在一定的局限性。
因此,开发一种新的、高可靠性的诊断方法对于结直肠癌的早期发现和治疗具有重要的临床意义。
SELDI(Surface Enhanced Laser Desorption/Ionization)蛋白质芯片技术是一种新型的高通量蛋白质体系,具有高灵敏度、高分辨率和高自动化等特点,已经被广泛应用于癌症的临床诊断中。
二、研究目的
本研究旨在探讨SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应用,评估其在结直肠癌早期诊断中的优势和局限性,并为临床医生提供有价值的诊断信息。
三、研究内容
1. 收集结直肠癌患者的临床样本和对照组样本,进行样本处理和蛋白质芯片制备,同时检测和比较两组样本中的蛋白质表达情况。
2. 分析比较结果,筛选出与结直肠癌相关的蛋白质,建立结直肠癌诊断模型,评价其诊断准确性和可行性。
3. 对比SELDI蛋白质芯片技术与传统诊断方法的优劣,探讨其在结直肠癌早期诊断中的应用前景。
四、研究意义
本研究可为结直肠癌的早期诊断提供新的、高效的诊断方法,为临床医生提供更准确的诊断和治疗方案。
同时,该研究对于深入理解结直肠癌的发病机制和蛋白质变化的研究具有重要的理论意义。
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把制 备好 的蛋 白质经过 亲和 作用结 合 到芯 片的 化学 或生 物 位点 上 . 再洗 去 非特 异 结合 的蛋 白质 和缓 冲 液 中的杂质 以消 除干扰 。 待芯 片 干燥后 。 每个 位 点上 加能量 吸收 分子 (n rya sr oeue E M) 使 eeg bobm lc l, A , 之与蛋 白质 结合 为混合 晶体 . 以促 进蛋 白质 在 S L E- D 一 ’F M I — S检测 中解 吸附 和离子 化圆 I o 。根据 定 位于 芯 片表 面 的物质 性 质不 同 . 片分 为化 学 型 和生 物 芯 型两类 : 学型芯 片是基 于经 典 的层析 原理 , 过疏 化 通
时间 质谱 仪 对 体液 中各种 蛋 白质 . 包括 疾 病早期 最 微 小基 因表达 产物 如低 分子量 蛋 白质 、 肽等 。 行 多 进 动态 、 全景 的分 析 。 获得待 检标 本 中各种蛋 白的含 量 及 其 分子量 等信 息 , 制 成蛋 白质指 纹 图谱 。 绘 再通 过
计 算机 软件 将 正常人 、 亚健 康状 态人 群 、 良性疾病 和
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江西医学检验
2o 0 7年 2月 第 2 卷 5
第 1 期
・
综 述・
S L I 白质芯片技术在肿瘤诊 断 中的临床应用 E D蛋
吕赛平综述 邹学森 审校 ’
*1 ̄类号 R 3 3 7 04 t I 7 - , 3 .3 R
文 献标识码 C
芯 片 ( rtic i) 表 面增 强 激 光解 吸 离子 化 飞 行 poen hp 和
水力 、 电力 、 价键 等 结合 样 本 中 的蛋 白质 ; 物 静 共 生
型 芯片 则是 把 生物 活性 分 子结 合 到芯 片表 面 . 用 利 抗 原和抗 体 、 受体 和配 体 、 酶和 底物 、 白质 和 D A 蛋 N 之 间 的相互 作用 捕 获样 本 中 的蛋 白质 . 以研 究 这 用 些蛋 白质分 子 之间 的相互作 用囹 。
文章编号 10 - 0 32 0)1 04 -4 0 8 0 2 ( 70 — 0 10 0
S L I 白质 芯 片技术 .又称 为表 面增强 激 光 ED 蛋 解 吸 离 子 化 飞 行 时 间 质 谱 (ufc — n a cdl e sr e eh n e sr a a
de o p in in z to — t o iht — ma s p c- s r to /o ia i n - i me f f g l - s s e ・
飞行 时间【 4 】 。 1 软件 控 制 分 析 系统 . 3 ’ 主要 有 Cp eg nsf ih re o - t
eora ) rary 。把 制备 好 的蛋 白质样 品 固定 于 经化 学修 饰 的玻 片或硅 片等 载体 上 。 白质 与载 体表 面结合 。 蛋 同时仍 保 留蛋 白质 的理 化 性 质和 生物 活 性 . 以高 可
1 S L I ’F MS系统 的组成 E D 一I — o 11 蛋 白质 芯 片 又 称蛋 白质 微 阵列 (rti i . poe m . n
的质量越 大 。 对所 带 电荷越 少 , 相 质荷 比( /) 大 , m z越 飞 行 时间越 长 , 被后 检 测 到 。测 到 的信 号 由高 速 则
( /) m z 越小 , 飞行 时 间越 短 , 被最 先检 测 到 , 反之 粒子
分子 量 的蛋 白质 , 通过对 多种 肿瘤 的检测 表 明 。 其敏 感 性 和 特异 性 均 优 于传统 的肿 瘤标 记 物 . 某些 肿 对 瘤 的敏感 性 已达 到 1 0 。 0 % 特异 性也 超 过 9 %。 5 因而 该技 术 能在肿 瘤早期 诊 断 中具 有很 重要 的临床 应用 价值。
模 拟数 字 转化 器 转换并 记 录 . 测 蛋式 呈 现 . 这些 特 异性 波 峰 构 成 了该 疾 病 特 有 的指纹 图谱 。指纹 图谱 的横 轴表 示 蛋 白类 型 , 纵 轴 为 蛋 白的丰 度 . 单个 蛋 白在 图谱 上 的 置 取 决 于 位
白 。目前 发现 通过 S L I 白质芯 片技术 所获 得 的 ED蛋 生物 标 记物 . 大多 是 特异 性 肿瘤 微 环境 所 产 生 的低
解 离 。 电粒子 通过 电场 时被加 速 。 测仪 记 录飞行 带 检 时间 , 粒子 的质 量越 小 , 对所 带 电荷越 多 , 相 质荷 比
t m t 。E D — O — ) 自 2 0 r er S L IT F MS . o y 0 2年 1 科 学 家 3本 田中耕 一 因发 明该 技术 而 荣 获诺 贝 尔化 学 奖后 . 该
技术 发 展十 分迅 速 , 目前 已经广 泛应用 于 生物技术 、
药 学 、 因学 、 基 临床诊 断 、 生物信 息等诸 多 领域【 l 】 。其 在 临床 实验诊 断学 中的主 要工作 原理 是利 用蛋 白质
1 表 面增 强激 光 解 吸 离子 化 飞行 时 间 质谱 仪 . 2
即 s L I — S系统 的芯 片 阅读器 . E D 一 DF M I 芯片 上 蛋 白 与 E M 形 成 的 晶体 。 特异 激光 照 射 下 , A 在 品体 发 生
癌 症 病人 的指 纹 图谱 库 对照 。 比较 分析差 异 。 就能快 速、 敏感 和 特异 地 发 现和 捕 获新 的与疾 病 相关 的蛋