龙眼胚性愈伤组织DlHOS1基因克隆与表达分析

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LIN Yuling , LAI Zhongxiong
1 Institute of Horticultural Biotechnology,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou,Fujian 350002,China 2 Fruit Research Institute,rujian Academy of Agricultural Sciences,Fuzhou,Fujian 350013,China
迫 诱 导 。总 体 上 低 温 下 其 表 达 水 平 上 升 。研 究 结 果 认 为 ,DIHOS1参 与 龙 眼抗 寒 和 低 温 胁 迫 过 程克 隆 ;密 码 子 使 用 偏 爱性 ;qPCR
中 图分 类号 ¥667.2
文 献 标 识 码 A
Abstract To study the function of H0S1 in cold stress of Dimocarpus longan Lour— the embryogenic callus of D.
1ongan Lour were used to clone HOS1 gene (DIHOS1),and codon bias,bioinformatics and expression patter n of
Cloning and Expression Analysis of D IH OS1 in Em bryogenic Callus of Dim ocarpus longan Lour.
XIAO Xiaoe ,XU Xiaoping ,LI Jiami ,ZHANG Zihao ,LAI Ruilian ,
热 带作 物 学 报 2018,39(2):293—299 Chinese Journal of Tropical Crops
龙 眼胚性愈伤 组织 DIHOS1基 因克隆与表达分 析
肖小 娥 ,徐 小 萍 ,李佳 蜜 ,张梓 浩 ,赖 瑞 联 ,一,林 玉玲 ,赖 钟 雄 件
1 福 建农 林 大学 园 艺植 物 生物 工程研 究所 ,福建福 州 350002 2 福 建省 农业 科 学 院果树研 究所 .福 建福 州 350013
JD坍 DJsJ基 因 序 列 全 长 3 577 bp,包 含 ORF 3 000 bp,编 码 999个 氨 基 酸 ,5’UTR 和 3’UTR 分 别 162 bp和
415 bp(GenBank登 录号 :KY990404);密 码 子 使 用 偏 爱 性 分 析 表 明 ,D埘 OS1密 码 子 的 选 择 偏 爱 性 较 弱 ,偏 爱
D |oS1 were analyzed.The results showed that the fu11 1ength sequence of DtHosl was 3 577 bp.containing an 0RF 3 0oo bp,encoding 999 amino acids,and the 5’ UTR and 3’ UTR was 162 bp and 415 bp respectively f GenBank accession number:KY990404).T h e codon bias level of D坍 0SJ was lOW.and it biased toward the synonymous codons with A and T at the third codon position.Bioinformatics analysis indicated that D坍 DS1 was an unstable and hydrophobic transmembrane protein,had no signal peptide and muhilocated in cytoplasm and nucleus.T h e secondary structure was mainly composed of alpha helix and strand.Besides.D珏iOsl shared a ver y close relationship with citrus. qPCR analysis showed that D埘 OS1 was response to the induction of low temperature and uD—regulated at lOW temperature.The research suggested that DlttOS1 should be involved in cold resistance and low temperature stress in longan. Key words Dimocarpus longan Lour— DIHOS1;gene cloning;codon bias;Real-time f luorescent quantitative PCR doi 10.3969/i.issn.1000—2561.2018.02.013
摘 要 以 龙 眼 胚 性 愈 伤 组 织 为 材 料 , 采 用 RT—PCR 和 RACE—PCR 技 术 对 植 物 抗 寒 重 要 调 控 因 子 HOS1
(DIHOS1)进 行 克 隆 ,并 进 行 密 码 子 使 用 偏 爱 性 、生 物 信 息 学 和 低 温 胁 迫 下 表 达 等 方 面 的 分 析 。 结 果 表 明 :
以 A/T结 尾 ;生 物 信 息学 分 析 结 果 表 明 ,D册 OS1编 码 的 蛋 白属 于 不 稳 定 的 疏 水 性 跨 膜 蛋 白 ,不 含 信 号 肽 ,定 位
于 细胞 质 和 细 胞 核 ,二 级 结 构 富 含 螺 旋 ,与 柑 橘 的 亲 缘 关 系 较 近 ;qPCR结 果 发 现 ,DIHOS1能 够 响 应 低 温 胁
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