个体育种值的估计与选种指数的制订

牛号
本身
平均 记录 乳量 次数
母亲
平均 记录 乳量 次数
半姐妹
平均 乳量
头数
001 4500
3
4800
6
5520 23
002 5520
5
5000
8
5020 37
003 6000
1
4700
4
5300 33
004 4900
2
4900
5
5300 33
005 5000
3
4800
6
5820
5
006 3750
1
综合育种值
• 按各性状的育种学重要性和经济学重要性制订加 权值，对个体不同性状的育种值进行加权，得到 综合育种值，作为选种的依据
综合选择指数是对综合育种值的一种估计！
简化的综合选择指数制订
• 常用的简化选择指数公式：
• •
n
P 2 i
3. I W h 为第i个性状的经济加权值； i i
P 为第i个性状的遗传加权i值1（遗传率）； i
1 (n 1)rA*h2 rAnh2
1 (n 1)rp
•混合家 系的平均 亲源相关 系数：
d并r为A产配仔d种的1 母畜数4d
利用单一来源资料估计育种值
• 根据资料来源的不同，计算出bAP,然后代入公
式
，可得被估个体的估计育种值
• 由于亲属间亲缘相关的差异，不同来源的资料的重要性程度不同，
开产日龄（天） 179 202 176 187 192 177 176 178 178 179 189 176 176 205 199 192 193 177 180 170 181.1
产蛋数（个/年） 261 222 250 234 227 220 258 231 241 200 240 250 230 240 290 260 220 229 267 277 242.4
后裔
同胞
全同胞 半同胞
种用价值
系谱
自身性能
祖父 父
祖母
外祖父 母
外祖母
育种值估计方法的分类
• 单性状的育种值估计(个体育种值)
• 根据单一信息来源进行估计
• 本身、同胞、后裔、系谱
• 根据多种信息来源进行估计
• 复合育种值估计 • 单性状的BLUP
• 多性状的育种值估计(综合育种值)
• 综合选择指数 • 多性状的BLUP
；
• 当信息来源是n个同类个体单次度量均值时， 等于同类个体间的亲缘系数与性状遗传力
的乘积(
)。
• 表示提供信息的个体之间的亲缘系数
资料来源 本身一次记录 本身 n 次记录 父母 n 次记录 全同胞记录 半同胞记录 混合家系资料 子女记录（全同胞） 子女记录（半同胞） 子女记录（全－半同胞）
通用
bAP H2 H(n)2 H(pn)2 H(Fs)2 H(Hs)2 H(F-H)2 H(O1)2 H(O2)2 H(O3)2 \
•将出0.各各1(P个个1 体体P)不的h12估同0来计.2源育(P2的种值表P)h型22AA值3x0、.(30P(.3群1P3A1P体)Ph0均3)2.2h3A2值P2;代00.4A.入3(4AP3，4(P0计4P.4)算hAP442)h42PP
• 根据估计育种值大小进行排序0.1，(P1选出P)h具12 有0.2最(P高2 估P)h计22 0.3( 育种值的个体留种。
头数
1 2 0 0 0 0 2 4 1 2
二、选种指数的制订
• 顺序选择法 • 独立淘汰法 • 指数选择法 • 多的育种学重要性和经济学重要性制订加权 值，对个体不同性状的表型值进行加权，得到一个 选择指数，根据指数的高低留种 • 一般只利用个体本身的性状表型值
利要利用用多不同项的偏来回源归系资数对料各项估资计料进育行加种权值，以求得复合育种值
Ax 0.1A1 0.2 A2 0.3A3 0.4 A4
性状遗传力 h2 ＜0.2 h2 ＜0.6 h2 ≥0.6
A1 亲本 亲本 亲本
A2 自身 同胞 同胞
A3 同胞 自身 后裔
A4 后裔 后裔 自身
A1 (P1 P)h12 P; A2 (P2 P)h22 P; A3 (P3 P)h32 P; A4 (P4 P)h42 P Ax 0.1A1 0.2A2 0.3A3 0.4A4
0.1(P1 P)h12 0.2(P2 P)h22 0.3(P3 P)h32 0.4(P4 P)h42 P
作业二
• 对下表的蛋鸡资料，计算各个体产蛋数、蛋重和开产日龄三个性状的 选择指数，根据选择指数的高低，选留最优秀的5只母鸡留种。
• 设：
• 产蛋数的W1=0.4，h12=0.2 • 蛋重的W2=0.3，h22=0.5 • 开产日龄的W3=0.3，h32=0.3
注意：开产日龄是“向下”选择的性状！
鸡号 001 002 003 004 005 006 007 008 009 010 011 012 013 014 015 016 017 018 019 020 平均
• 制订出选种指数公式：
• 将各个体各性状的表型值、各性状的群体均值代入，计算出各个体 的选种指数
• 根据选种指数高低进行留种
制订选择指数的注意事项
1、突出主要经济性状：2－4个为宜 2、所选性状容易度量 3、尽可能是早期性状：早期选种 4、对“向下”选择的性状，加权值为负 5、负相关的性状尽可能合并为一个性状
公式
h2
nh 2
1 (n 1)re 0.5nh 2
1 (n 1)re 0.5nh 2
1 (n 1)0.5h2 0.25nh 2
1 (n 1)0.25h2 rAnh2
1 (n 1)rA*h2 0.5nh 2
1 (n 1)0.5h2 0.5nh 2
1 (n 1)0.25h2 rAnh2
5500
5
4320 72
007 4500
5
6000
8
4740 22
008 5500
8
4400 11 5840
8
009 6500 3 4500 6 5070 46
010 3900
4
5000
7
5090 66
实验教程上列出了计算过程，供参考！
女儿
平均 乳量 5000 5050
— — — — 4800 5500 4700 4500
•如果缺少某项资料，该项以零计！ •h12、 h22、 h32、 h42即不同信息来源时的bAP
简化的复合育种值计算步骤
A1•根种(P资据1 性料P)状来h12 遗源P传; 力A2，确(P2定AP1)、h22 A2P、; A3、A4分别代表那 AA31•根((PP3据1资PP))h料h3212来PP源;; 的AA4差2异((PP4，2分PP))h别h4222计PP算; 出遗传力系数(bAP) AA3x•根(0P.据31A1公P)式h03.22：AP2 ; 0.A34A3 (P04.4AP4)h42 P Ax 00..11(AP110P.2)hA12200..23(AP32 0P.)4hA224A10.3((PP1 3PP)h)12h32 P;0.4A(2P4 (PP2 )hP42)h22PP
• 为第i个性状的个体表型值；
• •
W为 为i 第简i化个选性择状指的数群。体均值；
hi2
Pi
Pi
I
制订方法：
• 为了选种上的方便，把各性状都处于畜群平均数的个体指数值订为100 • 这时指数公式需作进一步变换：
• 怎样才能满足这一条件？
这里：
• 令：
制订步骤：
• 根据各性状的经济加权值和性状遗传力计算出各性状的加权系数ai
可编辑
• 今有下列10头母牛和其亲属的产乳量记录如下表，为了充分利用各 种资料，尽可能准确地进行选种工作，要求通过复合育种值的计算， 选出最优秀的3头母牛留种。
• 已知：
• 该牛群的全群平均产量为4820kg • 产乳量的遗传力为0.3 • 产乳量的重复力为0.4
表1 10头母牛及其亲属的产乳量记录（单位：kg）
育种值估计的基本原理
• 利用表型值估计育种值 • 依据表型值与育种值间的回归关系：
bAP：根据提供信息的个体与估计育种值个体间 亲缘关系不同而给予不同加权的遗传力
bAP计算：
• 式中:
•
表示提供信息的个体与估计育种值个体间的亲缘系数
•
为各测量的表型值间的表型相关
• 当信息来源是一个个体多次度量均值时， 等于多次度量的重复率
• 由于育种值是不能直接度量，只能利用统计学原理和方法，通过表 型值和个体间的亲缘关系进行估计，由此得到的估计值称为估计育 种值。
• 估计传递力(estimated transmitting ability，ETA)
• 个体育种值的一半能够传递给下一代，在遗传评估中将它定义为估 计传递力
育种值估计的信息来源
蛋重（g） 58.38 59.42 60.87 56.90 59.77 60.65 60.53 57.93 58.47 59.05 62.27 57.40 58.87 59.93 53.93 62.85 64.00 59.03 60.1 66.01 59.8
可编辑
家畜育种学实习
实习二 个体育种值的估计与选种指数的制订
一、个体育种值的估计
基本概念
• 个体育种值
• 简称育种值，又称为种用价值，在决定数量性状表型值的遗传效应 中，只有基因的加性效应(A)能稳定遗传给下一代， 个体加性效应 (A)的高低反映了该个体在育种上贡献大小，因而称其为育种值
• 估计育种值(estimated breeding value ，EBV)