翘嘴鳜线粒体基因组全序列的克隆与特征分析

Ｓｎｐ ｒａ ｕ ｄ ｌｔｓ 高 体 鳜 Ｓｎｐ ｒａ ｒｂ ｓａ 柳 州 鳜 Ｓ ｎｐ ｒａ ｌ ｚ ｏｅ ｓ 、日本 少 鳞 鳜 Ｃ ｒｏ ｅｃ ｉｉｅｃ ｎ ｕａｕ 、 ｉｉｅｃ ｏｕｔ 、 ｉｉｅｃ ｉ ｈ ｕ ｎｉ ｕ ｓ ｏｅｐ ｒａ ｋ ｗａ ｂ ｒ、 国 少 鳞 鳜 Ｃ ｒｏ ｅｃ ｉ ｈ ａ ｉ 朝 鲜 少 鳞 鳜 Ｃ ｒｏ ｅｃ ｅｚ 、 １目少 鳞 鳜 Ｃ ｒｏ ｅｃ ａ ｍｅａ ｉ 中 ｏｅｐ ｒａ ｗｈｔ ｅ ｄ 、 ｅ ｏｅｐ ｒａ ｈ ｒｉ Ｊ Ｉ ｏｅｐ ｒａ ｋ ｗ ｍｅａ ｉ 漓江 少鳞 鳜 Ｃ ｒｏ ｅｃ ｏｎ 。我 国是 世界 上鳜 类生 物多 样性 最 丰富 的地 区 ， ３个属 ９个 ａ ａ ｂｒ 和 ｏｅｐ ｒａｌ ａ ｏ 有 种 ， 有丰 富 的遗传 多样性 和 独特 的 空间分 布与 格 局 。然而 近年 来 自然界鳜 类 的数 量越 来 越少 口 ， 类 的 具 ］鳜 天 然遗 传性 面 临严 峻威 胁 。 鳜类 的分 类与 进 化地 位学 术界 一直 存在 不 同的见 解 ， 主要有 ２种 ： 鳜属 或 鳜 引、 属 与少 鳞鳜 属 ［ 。因而 开展 对鳜类 遗 传研 究对 于鳜 类物 种 的保护 和分 类地 位 的确定 以及资 源开 发 利用 都 ３ ］
鳜 类 为 东 亚 特 有 的 淡 水 类 群 ， 属 于 鲈 形 目 Ｐ ｒｉ ｒ ｓ真 鲈 科 ， ３个 属 １ 隶 ｅｃｆ ｍｅ ｏ 共 ２个 种 ， 翘 嘴 鳜 即
Ｓｎｐ ｒａ ｃ ｕ ｔ 、 鳜 Ｓｎｐ ｒａ ｓｈ ｒｅｉ 大 眼 鳜 Ｓ ｎｐ ｒａ ｋ ｅｉ 暗 鳜 Ｓｎｐ ｒａ ｏｓｕ ａ 波 纹 鳜 ｉｉｅｃ ｈ ａｓ 斑 ｉ ｉｉｅｃ ｃ ｅｚｒ、 ｉｉｅｃ ｎｒ、 ｉｉｅｃ ｂｃｒ 、
Ｃ Ｈ Ｌ） 翘 嘴鳜 ｒ ＮＡ 的 位 置 和 大 小 与 其 他 鱼类 相 似 ， — ｏｐ区 域 具 有 明显 的 Ａ＋Ｔ 碱 基 偏好 性 。 嘴 鳜 Ｙ、 Ｓ 。 Ｒ ＤＩｏ 翘
线 粒 体 全 序 列 的 克 隆 对 进 一 步 确 定鳜 类分 类 地 位 和 多 样 性 保 护 具 有 重 要 意 义 。 关 键 词 ： 嘴鳜 ； 粒 体 基 因组 ； 码 子 偏 好 性 ； 翘 线 密 多样 性 ； ＮＡ 基 因簇 ｔ Ｒ 中 图 分 类 号 ： ９ ７４ ￥ １ ． 文献标识码 ： Ａ 文章 编 号 ：０ １６ ０ （ ０ １ ０— １ １Ｏ １０ —６ ０ ２ １ ）４０ ｌ 一６
第２ ９卷ห้องสมุดไป่ตู้
第 ４期
广 西师 范大 学学 报 ： 自然 科学 版
Ｊｕ ｎ ｌ ｆ ｕ ｎ ｘ ｏ ｍａ Ｕｎｖｒｉ ： ｔｒｌ ｃ ｎ ｅＥ ｉｏ ｏ ｒ ａ ｏ ａ ｇ ｉ ｒ ｌ ｉｅｓ ｙ Ｎａｕａ ｉ ｃ ｄｔ ｎ Ｇ Ｎ ｔ Ｓｅ ｉ
Ｖｏ ． ９ Ｎｏ ４ １２ ．
粒 体 基 因 起 始 密 码 子 以 ＡＴＧ 为 主 ， 终 止 密 码 子 却 呈 现 多 样 性 。翘 嘴 鳜 ２ 但 ２个 ｔ ＲＮＡ 基 因 只 有 ｔ ＮＡ— ｕ Ｒ ｌ ｅ （ ＵＵＲ、 ＵＮ） ｔ ＮＡ—ｅ （ Ｎ、 Ｙ） ２个 密 码 子 ， ２个 ｔ Ｃ 和 Ｒ Ｓ ｔＵＣ ＡＧ 有 ２ ＲＮＡ 按 位 置 可 分 为 ３ 基 因 簇 （Ｑ 、 ＡＮ— 个 ＩＭ ｗ
Ｄｅ ． ｃ ２０１ １
２１年 １ ０１ ２月
翘 嘴鳜 线 粒 体 基 因组 全 序 列 的克 隆与 特 征 分 析
陈 敦学 ， 玉 珑 宾 石玉 农小 献 ， 希 良 ， 。李 ， ， 。刘 。成 嘉。张建 社。褚武 英。 ， ，
（． １ 广西师范大学 生命 科学学 院， 广西 桂林 ５ １ ０ ，． ４ ０ ４ ２ 长沙大学 生物工程与环境科学系 ， 湖南 长沙 ４ ０ ０ ） １ ０ ３
阐述 ＿ 。近 年来 ， 着测 序成 本 的大幅 下 降 ， ４ ｊ 随 国内外 应用 分子 生物 学手段 开 展属 的 系统进 化 的研 究 也越来
越 多 ， 来 越多 物种 的 ｍｔ ＮＡ 全 序列 被测 定 出来 。截 止 到 ２ １ 越 Ｄ ０ １年 ５月 ， ｎ ａ ｋ收录 仅鲈形 目的 ｍｔ — Ｇｅ Ｂ ｎ Ｄ ＮＡ 全序 列就 有 ３ ７条记 录 。 于鳜 类 的进化 分析 也有 人利 用 １ Ｓ １ Ｓ Ｃ ６ 对 ２ 、 ６ 、 ＹＴＢ、 Ｌ ＯＰ片段 的部分 或全 Ｄ— Ｏ
摘
要 ： 过直接测 序的方法获得翘嘴鳜线粒体 Ｄ 通 ＮＡ 基 因 组 全 序 列 （ ｅ Ｂ ｎ ：Ｆ ７ ５ ８ 。翘 嘴 鳜 线 粒 体 基 Ｇ ｎ ａ ｋ Ｊ ９ ２６ ）
因 组 全 长 为 １ ９ ｐ 其 包 含 １ 个 编 码 蛋 白基 因 、 ２ ｔ ＮＡ 基 因 、 个 ｒ ＮＡ 基 因和 １个 Ｃ ｎｒｌ ｅ ｉｎ ６４ ６ｂ ， ３ ２个 Ｒ ２ Ｒ ｏ ｔｏ ｒｇｏ 区 域 。 个 翘 嘴鳜 线 粒 体 Ｄ 整 ＮＡ 利 用 率 非 常 高 ， 仅仅 只 有 ３ ｐ的基 因 间 隔和 ３ ｐ的 基 因重 叠 。翘 嘴 鳜 线 粒 ２ｂ ５ｂ 体 的 编 码 蛋 白基 因 具 有 明显 的 Ａ＋Ｔ 偏 好 性 ， 时 整 个 基 因 组 中 Ｇ 碱 基 含 量 非 常 低 ， 有 １ ． 。翘 嘴 鳜 线 同 仅 ６２
序 列做 过分 析 ［ ， ５ 现在 研 究者 普遍 认 可利 用更 长 的线 粒体 ＤＮＡ 序 列可 以获 得更 精 确 、 可 靠 的系统 发 生 ］ 更
具 有重 要意 义 。
线 粒体 Ｄ ＮＡ 缺 乏 组 蛋 白保 护和 完 善 的 自我 修复 系 统 ， 靠近 内膜 呼吸链 ， 易受 环境 影 响 ， 化速 又 极 进
率快 ， 研 究物种 起 源与进 化 的有 力工 具 。早 在 １ ９ 年 ， ｉ 是 ９ ４ Ａｖｓ 对 ｒｔ ＮＡ 在 进化分 析 优点方 面进 行过 ｅ便 ｎＤ